Restriction Fragments for YPRWTy1-3



Send questions or suggestions to SGD

BLAST search | Genome Restriction Map | Design Primers for this sequence


The currently selected gene/sequence is :

YPRWTy1-3 on chromosome XVI from coordinates 844412 to 850340.

seqfile=/share/crumb/www-data/html/tmp/gcgseq.tmp.25399.2

Start End Strand Enzyme_name Restriction_site 5prime 3prime 5primerev 3primerev 65 69 + Tsp4CI* ACNGT 67 66 . . 71 74 + MseI TTAA 71 73 . . 97 100 + SetI ASST 100 96 . . 97 100 + CviJI RGCY 98 98 . . 97 100 + AluI AGCT 98 98 . . 93 103 - Hin4I GAYNNNNNVTC 116 111 84 79 104 109 + ClaI ATCGAT 105 107 . . 105 108 + TaqI TCGA 105 107 . . 114 117 - MnlI CCTC 107 106 . . 119 122 + SetI ASST 122 118 . . 119 122 + CviJI RGCY 120 120 . . 119 122 + AluI AGCT 120 120 . . 149 153 + BinI* GGATC 157 158 . . 150 153 + DpnI GATC 151 151 . . 150 153 + BstKTI GATC 152 150 . . 150 153 + MboI GATC 149 153 . . 155 159 + TspDTI ATGAA 170 168 . . 174 178 + TspGWI ACGGA 189 187 . . 181 184 - MnlI CCTC 174 173 . . 181 191 - Hin4I GAYNNNNNVTC 204 199 172 167 194 199 + SspI AATATT 196 196 . . 216 220 + TfiI GAWTC 216 219 . . 216 220 + HinfI GANTC 216 219 . . 220 230 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 226 223 . . 230 234 + TfiI GAWTC 230 233 . . 227 230 - MnlI CCTC 220 219 . . 230 234 + HinfI GANTC 230 233 . . 241 248 + PspXI VCTCGAGB 242 246 . . 241 244 + MnlI CCTC 251 250 . . 241 248 + AbsI CCTCGAGG 242 246 . . 242 247 + SmlI CTYRAG 242 246 . . 242 247 + XhoI CTCGAG 242 246 . . 242 247 + BmeT110I CYCGRG 243 245 . . 242 247 + AvaI CYCGRG 242 246 . . 243 246 + TaqI TCGA 243 245 . . 245 250 + BseRI GAGGAG 260 258 . . 245 248 - MnlI CCTC 238 237 . . 256 259 + MaeI CTAG 256 258 . . 268 273 + Hpy166II GTNNAC 270 270 . . 268 273 + BssNAI GTATAC 270 270 . . 268 273 + AccI GTMKAC 269 271 . . 272 275 + SetI ASST 275 271 . . 276 281 + SspI AATATT 278 278 . . 284 287 + CviJI RGCY 285 285 . . 301 305 + TfiI GAWTC 301 304 . . 301 305 + HinfI GANTC 301 304 . . 311 314 + TspEI AATT 310 314 . . 319 322 + TspEI AATT 318 322 . . 337 340 + FatI CATG 336 340 . . 337 340 + NlaIII CATG 340 336 . . 337 340 + CviAII CATG 337 339 . . 343 348 + HaeII RGCGCY 347 343 . . 344 347 + Hin6I GCGC 344 346 . . 344 347 + GlaI GCGC 345 345 . . 344 347 + HhaI GCGC 346 344 . . 358 362 + MaeIII GTNAC 357 362 . . 365 369 + DdeI CTNAG 365 368 . . 373 378 + Hpy166II GTNNAC 375 375 . . 384 389 + Hpy178III* TCNNGA 385 387 . . 387 392 + XhoII RGATCY 387 391 . . 388 391 + DpnI GATC 389 389 . . 388 391 + BstKTI GATC 390 388 . . 388 391 + MboI GATC 387 391 . . 388 392 - BinI* GGATC 382 383 . . 390 394 - TspGWI ACGGA 380 378 . . 398 401 + TaiI ACGT 401 397 . . 398 401 + SetI ASST 401 397 . . 398 401 + MaeII ACGT 398 400 . . 405 408 + SetI ASST 408 404 . . 405 408 + CviJI RGCY 406 406 . . 405 408 + AluI AGCT 406 406 . . 413 418 + ApoI RAATTY 413 417 . . 414 417 + TspEI AATT 413 417 . . 417 422 + Hpy178III* TCNNGA 418 420 . . 432 435 + CviJI RGCY 433 433 . . 440 444 + DdeI CTNAG 440 443 . . 444 447 + CviJI RGCY 445 445 . . 467 473 + AarI CACCTGC 477 481 . . 468 471 + SetI ASST 471 467 . . 468 473 + BspMI ACCTGC 477 481 . . 472 482 + MwoI GCNNNNNNNGC 478 475 . . 474 478 - TspDTI ATGAA 464 462 . . 479 484 + PvuII CAGCTG 481 481 . . 479 484 + NspBII* CMGCKG 481 481 . . 480 483 + SetI ASST 483 479 . . 480 483 + CviJI RGCY 481 481 . . 480 483 + AluI AGCT 481 481 . . 486 491 + Hpy178III* TCNNGA 487 489 . . 498 502 + BccI CCATC 506 507 . . 502 505 + FatI CATG 501 505 . . 502 505 + NlaIII CATG 505 501 . . 502 505 + CviAII CATG 502 504 . . 506 509 + MnlI CCTC 516 515 . . 511 514 + MnlI CCTC 521 520 . . 509 514 - BseRI GAGGAG 500 498 . . 516 519 + SetI ASST 519 515 . . 516 521 + BspMI ACCTGC 525 529 . . 521 526 - Eco57MI CTGRAG 506 504 . . 526 529 + Csp6I GTAC 526 528 . . 526 529 + RsaI GTAC 527 527 . . 521 526 - Eco57I CTGAAG 506 504 . . 531 534 + SetI ASST 534 530 . . 532 535 + MnlI CCTC 542 541 . . 535 545 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 541 538 . . 535 545 + PflMI CCANNNNNTGG 541 538 . . 544 548 + BmgT120I GGNCC 545 546 . . 544 548 + AsuI* GGNCC 544 547 . . 545 548 + CviJI RGCY 546 546 . . 545 548 + HaeIII GGCC 546 546 . . 549 552 + Csp6I GTAC 549 551 . . 549 552 + RsaI GTAC 550 550 . . 546 550 - BceAI ACGGC 531 533 . . 554 563 + MslI CAYNNNNRTG 558 558 . . 554 563 + OliI CACNNNNGTG 558 558 . . 556 561 + EcoP15I CAGCAG 586 588 . . 558 563 + BtsI GCAGTG 565 563 . . 559 565 + TspRI CASTGNN 565 556 . . 562 565 + CviRI* TGCA 563 563 . . 564 567 + FatI CATG 563 567 . . 564 567 + NlaIII CATG 567 563 . . 564 567 + CviAII CATG 564 566 . . 582 585 + CviJI RGCY 583 583 . . 589 600 + BstXI CCANNNNNNTGG 596 592 . . 589 593 + BccI CCATC 597 598 . . 608 612 + TspGWI ACGGA 623 621 . . 613 618 + TaqII CACCCA 629 627 . . 616 620 + BccI CCATC 624 625 . . 624 628 + TfiI GAWTC 624 627 . . 624 628 + HinfI GANTC 624 627 . . 630 635 + Hpy166II GTNNAC 632 632 . . 630 635 + BssNAI GTATAC 632 632 . . 630 635 + AccI GTMKAC 631 633 . . 627 631 - TspGWI ACGGA 617 615 . . 636 639 + SetI ASST 639 635 . . 656 661 + TatI WGTACW 656 660 . . 657 660 + Csp6I GTAC 657 659 . . 657 660 + RsaI GTAC 658 658 . . 666 669 + SetI ASST 669 665 . . 667 671 + BssKI CCNGG 666 671 . . 667 671 + BseBI CCWGG 668 669 . . 667 672 + SecI* CCNNGG 667 671 . . 667 671 + ScrFI CCNGG 668 669 . . 667 671 + EcoRII CCWGG 666 671 . . 670 674 + BmgT120I GGNCC 671 672 . . 670 674 + AsuI* GGNCC 670 673 . . 671 674 + CviJI RGCY 672 672 . . 671 674 + HaeIII GGCC 672 672 . . 681 685 + Tsp4CI* ACNGT 683 682 . . 688 691 + AciI CCGC 688 690 . . 693 698 + BciVI GTATCC 704 703 . . 697 701 + BccI CCATC 705 706 . . 706 711 - MmeI TCCRAC 687 685 . . 715 718 + MnlI CCTC 725 724 . . 717 721 + Hpy188I TCNGA 719 718 . . 718 722 + DdeI CTNAG 718 721 . . 720 725 + SduI GDGCHC 724 720 . . 720 725 + HgiAI* GWGCWC 724 720 . . 718 722 - BspCNI CTCAG 710 708 . . 718 722 - BseMII CTCAG 709 707 . . 727 731 + BccI CCATC 735 736 . . 732 735 + SetI ASST 735 731 . . 733 743 + EcoNI CCTNNNNNAGG 737 738 . . 733 743 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 739 736 . . 734 738 + DdeI CTNAG 734 737 . . 730 734 - HphI GGTGA 722 721 . . 736 740 + PleI GAGTC 744 745 . . 736 740 + MlyI GAGTC 745 745 . . 736 740 + HinfI GANTC 736 739 . . 734 738 - BspCNI CTCAG 726 724 . . 734 738 - BseMII CTCAG 725 723 . . 741 744 + SetI ASST 744 740 . . 757 761 + TfiI GAWTC 757 760 . . 757 761 + HinfI GANTC 757 760 . . 757 767 + Hin4I GAYNNNNNVTC 748 743 780 775 759 763 - TspDTI ATGAA 749 747 . . 764 767 + MnlI CCTC 774 773 . . 764 770 + Bpu10I CCTNAGC 765 768 . . 764 770 + BbvCI CCTCAGC 765 768 . . 761 765 - FokI GGATG 747 751 . . 765 769 + DdeI CTNAG 765 768 . . 765 769 + BspCNI CTCAG 778 776 . . 765 769 + BseMII CTCAG 779 777 . . 761 765 - BseGI GGATG 760 758 . . 767 772 + NspBII* CMGCKG 769 769 . . 772 776 + HinfI GANTC 772 775 . . 769 772 - AciI CCGC 769 771 . . 775 779 + Hpy188I TCNGA 777 776 . . 772 776 - PleI GAGTC 766 767 . . 772 776 - MlyI GAGTC 766 766 . . 778 788 + Hin4I GAYNNNNNVTC 769 764 801 796 778 788 - Hin4I GAYNNNNNVTC 801 796 769 764 785 789 - FokI GGATG 771 775 . . 785 789 - BseGI GGATG 784 782 . . 803 807 + Hpy188I TCNGA 805 804 . . 819 824 + Hpy166II GTNNAC 821 821 . . 819 824 + HpaI GTTAAC 821 821 . . 819 824 + HindII GTYRAC 821 821 . . 820 823 + MseI TTAA 820 822 . . 823 826 + SetI ASST 826 822 . . 824 827 + MnlI CCTC 834 833 . . 828 831 + SetI ASST 831 827 . . 826 830 - HphI GGTGA 818 817 . . 844 847 + TspEI AATT 843 847 . . 851 854 + MseI TTAA 851 853 . . 865 870 + ApoI RAATTY 865 869 . . 866 869 + TspEI AATT 865 869 . . 880 883 + TaqI TCGA 880 882 . . 882 886 + TfiI GAWTC 882 885 . . 882 886 + HinfI GANTC 882 885 . . 900 905 + MmeI TCCRAC 925 923 . . 900 904 + Hpy188I TCNGA 902 901 . . 904 908 + Tsp4CI* ACNGT 906 905 . . 907 912 + Hpy166II GTNNAC 909 909 . . 911 915 + TspGWI ACGGA 926 924 . . 921 926 + SplI* CGTACG 921 925 . . 922 925 + Csp6I GTAC 922 924 . . 922 925 + RsaI GTAC 923 923 . . 924 927 + TaiI ACGT 927 923 . . 924 927 + SetI ASST 927 923 . . 924 927 + MaeII ACGT 924 926 . . 927 931 + Hpy188I TCNGA 929 928 . . 930 933 + DpnI GATC 931 931 . . 930 933 + BstKTI GATC 932 930 . . 930 933 + MboI GATC 929 933 . . 933 939 + TspRI CASTGNN 939 930 . . 941 945 + TspDTI ATGAA 956 954 . . 949 952 + SetI ASST 952 948 . . 950 954 + Hin4II* CCTTC 960 959 . . 947 951 - HphI GGTGA 939 938 . . 972 977 + SspI AATATT 974 974 . . 983 986 + MnlI CCTC 993 992 . . 989 992 + TspEI AATT 988 992 . . 996 999 + SetI ASST 999 995 . . 1000 1003 + SetI ASST 1003 999 . . 1001 1005 + BssKI CCNGG 1000 1005 . . 1001 1005 + BseBI CCWGG 1002 1003 . . 1001 1006 + SecI* CCNNGG 1001 1005 . . 1001 1005 + ScrFI CCNGG 1002 1003 . . 1001 1005 + EcoRII CCWGG 1000 1005 . . 1012 1022 + Hin4I GAYNNNNNVTC 1003 998 1035 1030 1014 1018 - FokI GGATG 1000 1004 . . 1014 1018 - BseGI GGATG 1013 1011 . . 1012 1022 - Hin4I GAYNNNNNVTC 1035 1030 1003 998 1021 1025 - TspGWI ACGGA 1011 1009 . . 1033 1037 + TspGWI ACGGA 1048 1046 . . 1036 1041 + EcoRV GATATC 1038 1038 . . 1040 1045 + Hpy178III* TCNNGA 1041 1043 . . 1040 1045 + BspHI TCATGA 1040 1044 . . 1041 1044 + FatI CATG 1040 1044 . . 1041 1044 + NlaIII CATG 1044 1040 . . 1041 1044 + CviAII CATG 1041 1043 . . 1042 1046 + TspDTI ATGAA 1057 1055 . . 1046 1051 + ApoI RAATTY 1046 1050 . . 1047 1050 + TspEI AATT 1046 1050 . . 1073 1076 + CviRI* TGCA 1074 1074 . . 1078 1082 + Hpy188I TCNGA 1080 1079 . . 1090 1093 - MnlI CCTC 1083 1082 . . 1105 1109 + Tsp45I GTSAC 1104 1109 . . 1105 1109 + MaeIII GTNAC 1104 1109 . . 1109 1114 + SecI* CCNNGG 1109 1113 . . 1110 1114 + BssKI CCNGG 1109 1114 . . 1110 1114 + BseBI CCWGG 1111 1112 . . 1110 1114 + ScrFI CCNGG 1111 1112 . . 1110 1114 + EcoRII CCWGG 1109 1114 . . 1116 1121 + ApoI RAATTY 1116 1120 . . 1117 1120 + TspEI AATT 1116 1120 . . 1121 1124 + CviRI* TGCA 1122 1122 . . 1135 1140 + TatI WGTACW 1135 1139 . . 1136 1141 + Hpy166II GTNNAC 1138 1138 . . 1136 1139 + Csp6I GTAC 1136 1138 . . 1136 1139 + RsaI GTAC 1137 1137 . . 1139 1145 + AarI CACCTGC 1149 1153 . . 1140 1143 + SetI ASST 1143 1139 . . 1140 1145 + BspMI ACCTGC 1149 1153 . . 1142 1147 + PstI CTGCAG 1146 1142 . . 1142 1147 + SfeI* CTRYAG 1142 1146 . . 1143 1146 + CviRI* TGCA 1144 1144 . . 1148 1153 + EcoT22I ATGCAT 1152 1148 . . 1149 1152 + CviRI* TGCA 1150 1150 . . 1147 1151 - SfaNI GCATC 1137 1141 . . 1165 1169 + Tsp45I GTSAC 1164 1169 . . 1165 1169 + MaeIII GTNAC 1164 1169 . . 1178 1181 + TaqI TCGA 1178 1180 . . 1199 1204 - BsmI GAATGC 1199 1197 . . 1202 1206 - TspDTI ATGAA 1192 1190 . . 1217 1220 + SetI ASST 1220 1216 . . 1222 1227 + NspI RCATGY 1226 1222 . . 1223 1226 + FatI CATG 1222 1226 . . 1223 1226 + NlaIII CATG 1226 1222 . . 1223 1226 + CviAII CATG 1223 1225 . . 1229 1232 + TspEI AATT 1228 1232 . . 1230 1235 + VspI ATTAAT 1231 1233 . . 1231 1234 + MseI TTAA 1231 1233 . . 1233 1236 + TspEI AATT 1232 1236 . . 1242 1245 + SetI ASST 1245 1241 . . 1241 1244 - MnlI CCTC 1234 1233 . . 1261 1266 + ApoI RAATTY 1261 1265 . . 1262 1265 + TspEI AATT 1261 1265 . . 1276 1281 + AflIII ACRYGT 1276 1280 . . 1277 1282 + BtrI CACGTC 1279 1279 . . 1278 1281 + TaiI ACGT 1281 1277 . . 1278 1281 + SetI ASST 1281 1277 . . 1278 1281 + MaeII ACGT 1278 1280 . . 1284 1287 + TaqI TCGA 1284 1286 . . 1300 1304 + Tsp4CI* ACNGT 1302 1301 . . 1301 1309 + AlwNI CAGNNNCTG 1306 1303 . . 1311 1315 + Tsp4CI* ACNGT 1313 1312 . . 1317 1321 + DdeI CTNAG 1317 1320 . . 1321 1326 + EcoRV GATATC 1323 1323 . . 1327 1330 + FatI CATG 1326 1330 . . 1327 1330 + NlaIII CATG 1330 1326 . . 1327 1330 + CviAII CATG 1327 1329 . . 1337 1341 + TspDTI ATGAA 1352 1350 . . 1339 1343 + MboII GAAGA 1351 1350 . . 1351 1355 + BinI* GGATC 1359 1360 . . 1352 1355 + DpnI GATC 1353 1353 . . 1352 1355 + BstKTI GATC 1354 1352 . . 1352 1355 + MboI GATC 1351 1355 . . 1354 1357 + TaqI TCGA 1354 1356 . . 1354 1359 + Hpy178III* TCNNGA 1355 1357 . . 1368 1371 + SetI ASST 1371 1367 . . 1372 1375 + TspEI AATT 1371 1375 . . 1386 1390 + Hpy188I TCNGA 1388 1387 . . 1398 1402 + MboII GAAGA 1410 1409 . . 1405 1409 + TfiI GAWTC 1405 1408 . . 1405 1409 + HinfI GANTC 1405 1408 . . 1412 1416 + BlsI GCNGC 1414 1413 . . 1412 1416 + BisI GCNGC 1413 1414 . . 1412 1416 + BbvI GCAGC 1424 1428 . . 1412 1416 + TseI GCWGC 1412 1415 . . 1414 1417 + SetI ASST 1417 1413 . . 1414 1417 + CviJI RGCY 1415 1415 . . 1414 1417 + AluI AGCT 1415 1415 . . 1446 1449 + SetI ASST 1449 1445 . . 1446 1449 + CviJI RGCY 1447 1447 . . 1446 1449 + AluI AGCT 1447 1447 . . 1449 1453 + Hpy188I TCNGA 1451 1450 . . 1452 1456 + TfiI GAWTC 1452 1455 . . 1452 1456 + HinfI GANTC 1452 1455 . . 1456 1459 + MnlI CCTC 1466 1465 . . 1471 1474 + TspEI AATT 1470 1474 . . 1473 1478 + AsuII TTCGAA 1474 1476 . . 1474 1477 + TaqI TCGA 1474 1476 . . 1480 1483 + TaqI TCGA 1480 1482 . . 1488 1491 + CviJI RGCY 1489 1489 . . 1490 1494 + BssKI CCNGG 1489 1494 . . 1490 1494 + BseBI CCWGG 1491 1492 . . 1490 1495 + SecI* CCNNGG 1490 1494 . . 1490 1494 + ScrFI CCNGG 1491 1492 . . 1490 1494 + EcoRII CCWGG 1489 1494 . . 1493 1498 + SduI GDGCHC 1497 1493 . . 1493 1498 + HgiJII* GRGCYC 1497 1493 . . 1494 1497 + CviJI RGCY 1495 1495 . . 1498 1509 + TstI CACNNNNNNTCC 1489 1484 1521 1516 1504 1509 + BciVI GTATCC 1515 1514 . . 1525 1530 + GsaI CCCAGC 1529 1525 . . 1525 1530 + BseYI CCCAGC 1525 1529 . . 1531 1535 + TspGWI ACGGA 1546 1544 . . 1540 1544 + TfiI GAWTC 1540 1543 . . 1540 1544 + HinfI GANTC 1540 1543 . . 1544 1548 + BccI CCATC 1552 1553 . . 1563 1574 + BdaI TGANNNNNNTCA 1552 1550 1586 1584 1564 1573 + XmnI GAANNNNTTC 1568 1568 . . 1569 1573 + TfiI GAWTC 1569 1572 . . 1569 1573 + HinfI GANTC 1569 1572 . . 1573 1578 + MfeI CAATTG 1573 1577 . . 1574 1577 + TspEI AATT 1573 1577 . . 1563 1574 - BdaI TGANNNNNNTCA 1586 1584 1552 1550 1592 1595 + SetI ASST 1595 1591 . . 1593 1597 + Hin4II* CCTTC 1603 1602 . . 1595 1599 - TspDTI ATGAA 1585 1583 . . 1600 1604 + DdeI CTNAG 1600 1603 . . 1604 1607 + CviJI RGCY 1605 1605 . . 1604 1607 + HaeIII GGCC 1605 1605 . . 1619 1623 + TfiI GAWTC 1619 1622 . . 1619 1623 + HinfI GANTC 1619 1622 . . 1623 1628 + SfeI* CTRYAG 1623 1627 . . 1625 1629 + Tsp4CI* ACNGT 1627 1626 . . 1643 1652 + MslI CAYNNNNRTG 1647 1647 . . 1646 1650 + Hpy188I TCNGA 1648 1647 . . 1653 1657 + TspDTI ATGAA 1668 1666 . . 1660 1665 + SecI* CCNNGG 1660 1664 . . 1661 1665 + BssKI CCNGG 1660 1665 . . 1661 1665 + BseBI CCWGG 1662 1663 . . 1661 1665 + ScrFI CCNGG 1662 1663 . . 1661 1665 + EcoRII CCWGG 1660 1665 . . 1668 1671 + SetI ASST 1671 1667 . . 1669 1672 + MnlI CCTC 1679 1678 . . 1672 1676 + Hin4II* CCTTC 1682 1681 . . 1675 1680 + Hpy178III* TCNNGA 1676 1678 . . 1677 1680 + TaqI TCGA 1677 1679 . . 1679 1683 + TfiI GAWTC 1679 1682 . . 1679 1683 + HinfI GANTC 1679 1682 . . 1682 1687 + Hpy178III* TCNNGA 1683 1685 . . 1688 1692 + SfaNI GCATC 1697 1701 . . 1691 1696 + Hpy178III* TCNNGA 1692 1694 . . 1701 1706 + PsiI TTATAA 1703 1703 . . 1706 1711 + XhoII RGATCY 1706 1710 . . 1706 1711 + BglII AGATCT 1706 1710 . . 1707 1710 + DpnI GATC 1708 1708 . . 1707 1710 + BstKTI GATC 1709 1707 . . 1707 1710 + MboI GATC 1706 1710 . . 1726 1730 + DdeI CTNAG 1726 1729 . . 1726 1730 + BspCNI CTCAG 1739 1737 . . 1726 1730 + BseMII CTCAG 1740 1738 . . 1730 1734 + SfaNI GCATC 1739 1743 . . 1741 1746 + Hpy178III* TCNNGA 1742 1744 . . 1752 1755 + TaiI ACGT 1755 1751 . . 1752 1755 + SetI ASST 1755 1751 . . 1752 1755 + MaeII ACGT 1752 1754 . . 1760 1764 - SfaNI GCATC 1750 1754 . . 1783 1786 + TspEI AATT 1782 1786 . . 1785 1788 + MseI TTAA 1785 1787 . . 1796 1802 + BstEII GGTNACC 1796 1801 . . 1796 1800 + HphI GGTGA 1808 1807 . . 1797 1801 + Tsp45I GTSAC 1796 1801 . . 1797 1801 + MaeIII GTNAC 1796 1801 . . 1800 1803 + SetI ASST 1803 1799 . . 1806 1809 + TspEI AATT 1805 1809 . . 1815 1821 + PfoI TCCNGGA 1815 1820 . . 1816 1820 + BssKI CCNGG 1815 1820 . . 1816 1820 + BseBI CCWGG 1817 1818 . . 1816 1820 + ScrFI CCNGG 1817 1818 . . 1816 1820 + EcoRII CCWGG 1815 1820 . . 1842 1845 + SetI ASST 1845 1841 . . 1848 1851 + CviRI* TGCA 1849 1849 . . 1864 1867 + CviJI RGCY 1865 1865 . . 1877 1881 + DdeI CTNAG 1877 1880 . . 1877 1881 + BspCNI CTCAG 1890 1888 . . 1877 1881 + BseMII CTCAG 1891 1889 . . 1887 1891 + TspDTI ATGAA 1902 1900 . . 1890 1893 + TspEI AATT 1889 1893 . . 1894 1897 + CviJI RGCY 1895 1895 . . 1895 1899 + BlsI GCNGC 1897 1896 . . 1895 1899 + BisI GCNGC 1896 1897 . . 1895 1899 + TseI GCWGC 1895 1898 . . 1896 1901 + PstI CTGCAG 1900 1896 . . 1896 1901 + SfeI* CTRYAG 1896 1900 . . 1897 1900 + CviRI* TGCA 1898 1898 . . 1895 1899 - BbvI GCAGC 1882 1886 . . 1904 1909 + EcoRV GATATC 1906 1906 . . 1913 1918 + NspI RCATGY 1917 1913 . . 1913 1918 + Cac8I GCNNGC 1915 1915 . . 1913 1918 + SphI GCATGC 1917 1913 . . 1914 1917 + FatI CATG 1913 1917 . . 1914 1917 + NlaIII CATG 1917 1913 . . 1914 1917 + CviAII CATG 1914 1916 . . 1929 1932 + TaiI ACGT 1932 1928 . . 1929 1932 + SetI ASST 1932 1928 . . 1929 1932 + MaeII ACGT 1929 1931 . . 1933 1937 + DdeI CTNAG 1933 1936 . . 1939 1943 + Tsp4CI* ACNGT 1941 1940 . . 1943 1947 + Hpy188I TCNGA 1945 1944 . . 1947 1951 + BceAI ACGGC 1963 1965 . . 1951 1957 + TspRI CASTGNN 1957 1948 . . 1952 1956 + Tsp4CI* ACNGT 1954 1953 . . 1954 1959 + TatI WGTACW 1954 1958 . . 1955 1958 + Csp6I GTAC 1955 1957 . . 1955 1958 + RsaI GTAC 1956 1956 . . 1960 1963 + CviRI* TGCA 1961 1961 . . 1963 1966 + SetI ASST 1966 1962 . . 1980 1984 - BsmAI GTCTC 1974 1978 . . 1989 1993 + BsrI ACTGG 1994 1992 . . 1989 1994 + BfiI ACTGGG 1999 1998 . . 2004 2009 + TatI WGTACW 2004 2008 . . 2004 2009 + ScaI AGTACT 2006 2006 . . 2005 2008 + Csp6I GTAC 2005 2007 . . 2005 2008 + RsaI GTAC 2006 2006 . . 2015 2019 + BccI CCATC 2023 2024 . . 2030 2033 + Csp6I GTAC 2030 2032 . . 2030 2033 + RsaI GTAC 2031 2031 . . 2027 2031 - TspGWI ACGGA 2017 2015 . . 2037 2041 + BccI CCATC 2045 2046 . . 2051 2060 + MslI CAYNNNNRTG 2055 2055 . . 2063 2068 + TatI WGTACW 2063 2067 . . 2064 2069 + Hpy166II GTNNAC 2066 2066 . . 2064 2067 + Csp6I GTAC 2064 2066 . . 2064 2067 + RsaI GTAC 2065 2065 . . 2087 2091 - TspDTI ATGAA 2077 2075 . . 2091 2095 - TspDTI ATGAA 2081 2079 . . 2095 2098 + TaqI TCGA 2095 2097 . . 2097 2102 + BsmI GAATGC 2103 2101 . . 2101 2106 + Cac8I GCNNGC 2103 2103 . . 2104 2109 + MstI* TGCGCA 2106 2106 . . 2105 2108 + Hin6I GCGC 2105 2107 . . 2105 2108 + GlaI GCGC 2106 2106 . . 2105 2108 + HhaI GCGC 2107 2105 . . 2107 2112 + NspI RCATGY 2111 2107 . . 2107 2112 + Cac8I GCNNGC 2109 2109 . . 2107 2112 + SphI GCATGC 2111 2107 . . 2107 2118 + AlfI GCANNNNNNTGC 2096 2094 2130 2128 2108 2117 + MslI CAYNNNNRTG 2112 2112 . . 2108 2111 + FatI CATG 2107 2111 . . 2108 2111 + NlaIII CATG 2111 2107 . . 2108 2111 + CviAII CATG 2108 2110 . . 2116 2119 + CviRI* TGCA 2117 2117 . . 2107 2118 - AlfI GCANNNNNNTGC 2130 2128 2096 2094 2125 2128 + TspEI AATT 2124 2128 . . 2128 2131 + TaqI TCGA 2128 2130 . . 2139 2142 + MseI TTAA 2139 2141 . . 2151 2155 + BccI CCATC 2159 2160 . . 2155 2160 + BsaAI YACGTR 2157 2157 . . 2156 2159 + TaiI ACGT 2159 2155 . . 2156 2159 + SetI ASST 2159 2155 . . 2156 2159 + MaeII ACGT 2156 2158 . . 2163 2166 + MseI TTAA 2163 2165 . . 2168 2172 + TfiI GAWTC 2168 2171 . . 2168 2172 + HinfI GANTC 2168 2171 . . 2171 2175 + Hpy188I TCNGA 2173 2172 . . 2177 2182 + SalI GTCGAC 2177 2181 . . 2177 2182 + Hpy166II GTNNAC 2179 2179 . . 2177 2182 + HindII GTYRAC 2179 2179 . . 2177 2182 + AccI GTMKAC 2178 2180 . . 2178 2181 + TaqI TCGA 2178 2180 . . 2181 2185 + BsrI ACTGG 2186 2184 . . 2187 2190 + MaeI CTAG 2187 2189 . . 2209 2214 + Hpy178III* TCNNGA 2210 2212 . . 2219 2222 + MseI TTAA 2219 2221 . . 2254 2257 + SetI ASST 2257 2253 . . 2256 2261 + Hpy166II GTNNAC 2258 2258 . . 2258 2263 + Hpy178III* TCNNGA 2259 2261 . . 2275 2280 + ApoI RAATTY 2275 2279 . . 2276 2279 + TspEI AATT 2275 2279 . . 2278 2282 - TspDTI ATGAA 2268 2266 . . 2285 2294 + XmnI GAANNNNTTC 2289 2289 . . 2298 2301 + SetI ASST 2301 2297 . . 2318 2322 + BmgT120I GGNCC 2319 2320 . . 2318 2322 + AvaII GGWCC 2318 2321 . . 2318 2322 + AsuI* GGNCC 2318 2321 . . 2324 2329 + Hpy166II GTNNAC 2326 2326 . . 2321 2325 - BsrI ACTGG 2321 2319 . . 2331 2334 + SetI ASST 2334 2330 . . 2343 2348 + Hpy166II GTNNAC 2345 2345 . . 2343 2348 + SduI GDGCHC 2347 2343 . . 2343 2348 + BseSI GKGCMC 2347 2343 . . 2343 2348 + ApaLI GTGCAC 2343 2347 . . 2343 2348 + HgiAI* GWGCWC 2347 2343 . . 2344 2347 + CviRI* TGCA 2345 2345 . . 2348 2352 + BccI CCATC 2356 2357 . . 2349 2353 - FokI GGATG 2335 2339 . . 2349 2353 - BseGI GGATG 2348 2346 . . 2357 2361 - TspDTI ATGAA 2347 2345 . . 2375 2379 - BsmAI GTCTC 2369 2373 . . 2384 2389 + ApoI RAATTY 2384 2388 . . 2385 2388 + TspEI AATT 2384 2388 . . 2388 2392 - TspGWI ACGGA 2378 2376 . . 2410 2415 + McrI* CGRYCG 2413 2411 . . 2412 2416 + Tsp4CI* ACNGT 2414 2413 . . 2413 2423 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2419 2416 . . 2414 2418 + Hpy99I CGWCG 2418 2413 . . 2416 2421 + Hpy178III* TCNNGA 2417 2419 . . 2416 2421 + NruI TCGCGA 2418 2418 . . 2417 2420 + FnuDII* CGCG 2418 2418 . . 2420 2423 - MnlI CCTC 2413 2412 . . 2423 2427 + HinfI GANTC 2423 2426 . . 2423 2427 - PleI GAGTC 2417 2418 . . 2423 2427 - MlyI GAGTC 2417 2417 . . 2431 2434 + MnlI CCTC 2441 2440 . . 2433 2436 + TaqI TCGA 2433 2435 . . 2453 2456 + MaeI CTAG 2453 2455 . . 2455 2458 + SetI ASST 2458 2454 . . 2455 2458 + CviJI RGCY 2456 2456 . . 2455 2458 + AluI AGCT 2456 2456 . . 2463 2466 + MseI TTAA 2463 2465 . . 2470 2480 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2476 2473 . . 2470 2474 - BsrI ACTGG 2470 2468 . . 2479 2482 + CviJI RGCY 2480 2480 . . 2479 2482 + HaeIII GGCC 2480 2480 . . 2481 2492 + BstXI CCANNNNNNTGG 2488 2484 . . 2482 2488 + TspRI CASTGNN 2488 2479 . . 2481 2485 - BsrI ACTGG 2481 2479 . . 2490 2495 - TsoI TARCCA 2480 2478 . . 2503 2507 + BmgT120I GGNCC 2504 2505 . . 2503 2507 + AvaII GGWCC 2503 2506 . . 2503 2507 + AsuI* GGNCC 2503 2506 . . 2505 2509 + Tsp4CI* ACNGT 2507 2506 . . 2506 2511 + DsaI* CCRYGG 2506 2510 . . 2506 2511 + SecI* CCNNGG 2506 2510 . . 2513 2517 + Hpy188I TCNGA 2515 2514 . . 2514 2518 + DdeI CTNAG 2514 2517 . . 2518 2523 + Hpy166II GTNNAC 2520 2520 . . 2518 2523 + BssNAI GTATAC 2520 2520 . . 2514 2518 - BspCNI CTCAG 2506 2504 . . 2514 2518 - BseMII CTCAG 2505 2503 . . 2518 2523 + AccI GTMKAC 2519 2521 . . 2540 2545 + ApoI RAATTY 2540 2544 . . 2541 2544 + TspEI AATT 2540 2544 . . 2571 2574 + FatI CATG 2570 2574 . . 2571 2574 + NlaIII CATG 2574 2570 . . 2571 2574 + CviAII CATG 2571 2573 . . 2586 2591 + NspBII* CMGCKG 2588 2588 . . 2591 2595 + TfiI GAWTC 2591 2594 . . 2591 2595 + HinfI GANTC 2591 2594 . . 2588 2591 - AciI CCGC 2588 2590 . . 2594 2599 + Hpy178III* TCNNGA 2595 2597 . . 2595 2600 + BmeT110I CYCGRG 2596 2598 . . 2595 2600 + AvaI CYCGRG 2595 2599 . . 2598 2603 + SduI GDGCHC 2602 2598 . . 2598 2603 + HgiAI* GWGCWC 2602 2598 . . 2603 2606 + FatI CATG 2602 2606 . . 2603 2606 + NlaIII CATG 2606 2602 . . 2603 2606 + CviAII CATG 2603 2605 . . 2607 2611 + PleI GAGTC 2615 2616 . . 2607 2611 + MlyI GAGTC 2616 2616 . . 2607 2611 + HinfI GANTC 2607 2610 . . 2617 2621 + BceAI ACGGC 2633 2635 . . 2619 2622 + CviJI RGCY 2620 2620 . . 2625 2629 + Tsp4CI* ACNGT 2627 2626 . . 2628 2631 + Csp6I GTAC 2628 2630 . . 2628 2631 + RsaI GTAC 2629 2629 . . 2630 2633 + SetI ASST 2633 2629 . . 2649 2652 + Csp6I GTAC 2649 2651 . . 2649 2652 + RsaI GTAC 2650 2650 . . 2646 2650 - BceAI ACGGC 2631 2633 . . 2658 2661 + CviRI* TGCA 2659 2659 . . 2659 2664 + BsrDI GCAATG 2666 2664 . . 2670 2675 + Hpy166II GTNNAC 2672 2672 . . 2695 2698 + CviRI* TGCA 2696 2696 . . 2700 2703 + TaqI TCGA 2700 2702 . . 2702 2707 + ApoI RAATTY 2702 2706 . . 2703 2706 + TspEI AATT 2702 2706 . . 2722 2727 + ApoI RAATTY 2722 2726 . . 2723 2726 + TspEI AATT 2722 2726 . . 2729 2732 + MaeI CTAG 2729 2731 . . 2731 2734 + SetI ASST 2734 2730 . . 2731 2734 + CviJI RGCY 2732 2732 . . 2731 2734 + AluI AGCT 2732 2732 . . 2737 2740 + SetI ASST 2740 2736 . . 2735 2739 - HphI GGTGA 2727 2726 . . 2755 2758 + CviRI* TGCA 2756 2756 . . 2764 2769 + NspI RCATGY 2768 2764 . . 2765 2768 + FatI CATG 2764 2768 . . 2765 2768 + NlaIII CATG 2768 2764 . . 2765 2768 + CviAII CATG 2765 2767 . . 2768 2778 + MwoI GCNNNNNNNGC 2774 2771 . . 2768 2773 + Cac8I GCNNGC 2770 2770 . . 2771 2774 + CviJI RGCY 2772 2772 . . 2781 2791 + Hin4I GAYNNNNNVTC 2772 2767 2804 2799 2786 2791 + EcoRV GATATC 2788 2788 . . 2781 2791 - Hin4I GAYNNNNNVTC 2804 2799 2772 2767 2792 2797 + TatI WGTACW 2792 2796 . . 2792 2797 + ScaI AGTACT 2794 2794 . . 2793 2796 + Csp6I GTAC 2793 2795 . . 2793 2796 + RsaI GTAC 2794 2794 . . 2800 2804 + MaeIII GTNAC 2799 2804 . . 2803 2806 + SetI ASST 2806 2802 . . 2811 2816 + Hpy166II GTNNAC 2813 2813 . . 2811 2816 + HindII GTYRAC 2813 2813 . . 2808 2813 - TaqII GACCGA 2798 2796 . . 2815 2818 + SetI ASST 2818 2814 . . 2830 2835 + BclI TGATCA 2830 2834 . . 2831 2834 + DpnI GATC 2832 2832 . . 2831 2834 + BstKTI GATC 2833 2831 . . 2831 2834 + MboI GATC 2830 2834 . . 2838 2848 + BsaXI ACNNNNNCTCC 2828 2825 2858 2855 2855 2864 + MslI CAYNNNNRTG 2859 2859 . . 2858 2861 + MnlI CCTC 2868 2867 . . 2855 2859 - FokI GGATG 2841 2845 . . 2855 2859 - BseGI GGATG 2854 2852 . . 2859 2864 - BsiI* CACGAG 2859 2863 . . 2865 2869 + SfaNI GCATC 2874 2878 . . 2865 2875 + MwoI GCNNNNNNNGC 2871 2868 . . 2869 2874 + SecI* CCNNGG 2869 2873 . . 2866 2870 - FokI GGATG 2852 2856 . . 2870 2874 + BssKI CCNGG 2869 2874 . . 2866 2870 - BseGI GGATG 2865 2863 . . 2870 2874 + BseBI CCWGG 2871 2872 . . 2870 2874 + ScrFI CCNGG 2871 2872 . . 2870 2874 + EcoRII CCWGG 2869 2874 . . 2873 2876 + CviJI RGCY 2874 2874 . . 2885 2889 - FokI GGATG 2871 2875 . . 2889 2894 + Esp3I CGTCTC 2895 2899 . . 2885 2889 - BseGI GGATG 2884 2882 . . 2890 2894 + BsmAI GTCTC 2895 2899 . . 2887 2891 - TspGWI ACGGA 2877 2875 . . 2891 2896 + Hpy178III* TCNNGA 2892 2894 . . 2893 2896 + TaqI TCGA 2893 2895 . . 2907 2917 + Hin4I GAYNNNNNVTC 2898 2893 2930 2925 2907 2917 - Hin4I GAYNNNNNVTC 2930 2925 2898 2893 2920 2924 - MboII GAAGA 2912 2911 . . 2924 2928 + BccI CCATC 2932 2933 . . 2925 2929 - FokI GGATG 2911 2915 . . 2925 2929 - BseGI GGATG 2924 2922 . . 2930 2933 + MseI TTAA 2930 2932 . . 2935 2939 + MboII GAAGA 2947 2946 . . 2935 2940 + BbvII* GAAGAC 2942 2946 . . 2939 2943 + Tsp4CI* ACNGT 2941 2940 . . 2965 2969 - MboII GAAGA 2957 2956 . . 2966 2971 - Eco57MI CTGRAG 2951 2949 . . 2966 2971 - Eco57I CTGAAG 2951 2949 . . 2978 2982 + TfiI GAWTC 2978 2981 . . 2978 2982 + HinfI GANTC 2978 2981 . . 2981 2986 + Hpy178III* TCNNGA 2982 2984 . . 2990 2993 + DpnI GATC 2991 2991 . . 2990 2993 + BstKTI GATC 2992 2990 . . 2990 2993 + MboI GATC 2989 2993 . . 2994 2997 + TspEI AATT 2993 2997 . . 2999 3002 + TspEI AATT 2998 3002 . . 3004 3008 + Hpy99I CGWCG 3008 3003 . . 3005 3009 + HgaI GACGC 3014 3019 . . 3018 3021 + TaqI TCGA 3018 3020 . . 3021 3025 + TspDTI ATGAA 3036 3034 . . 3023 3027 + MboII GAAGA 3035 3034 . . 3023 3028 + BbvII* GAAGAC 3030 3034 . . 3029 3032 + MseI TTAA 3029 3031 . . 3033 3037 + Tsp4CI* ACNGT 3035 3034 . . 3038 3041 + MseI TTAA 3038 3040 . . 3059 3063 - TspDTI ATGAA 3049 3047 . . 3061 3066 - BsrDI GCAATG 3060 3058 . . 3065 3069 - HgaI GACGC 3054 3059 . . 3075 3080 + XhoII RGATCY 3075 3079 . . 3076 3079 + DpnI GATC 3077 3077 . . 3076 3079 + BstKTI GATC 3078 3076 . . 3076 3079 + MboI GATC 3075 3079 . . 3076 3080 - BinI* GGATC 3070 3071 . . 3083 3087 + TfiI GAWTC 3083 3086 . . 3083 3087 + HinfI GANTC 3083 3086 . . 3092 3095 + DpnI GATC 3093 3093 . . 3092 3095 + BstKTI GATC 3094 3092 . . 3092 3095 + MboI GATC 3091 3095 . . 3096 3099 + MseI TTAA 3096 3098 . . 3104 3108 + TfiI GAWTC 3104 3107 . . 3104 3108 + HinfI GANTC 3104 3107 . . 3107 3111 + Hpy188I TCNGA 3109 3108 . . 3113 3116 + FatI CATG 3112 3116 . . 3113 3116 + NlaIII CATG 3116 3112 . . 3113 3116 + CviAII CATG 3113 3115 . . 3116 3126 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3107 3102 3139 3134 3125 3130 + MmeI TCCRAC 3150 3148 . . 3125 3129 + Hpy188I TCNGA 3127 3126 . . 3116 3126 - Hin4I GAYNNNNNVTC 3139 3134 3107 3102 3142 3147 + Hpy178III* TCNNGA 3143 3145 . . 3143 3149 + Bpu10I CCTNAGC 3144 3147 . . 3140 3144 - FokI GGATG 3126 3130 . . 3144 3148 + DdeI CTNAG 3144 3147 . . 3140 3144 - BseGI GGATG 3139 3137 . . 3144 3148 - BspCNI CTCAG 3136 3134 . . 3144 3148 - BseMII CTCAG 3135 3133 . . 3172 3175 + SetI ASST 3175 3171 . . 3172 3175 + CviJI RGCY 3173 3173 . . 3172 3175 + AluI AGCT 3173 3173 . . 3178 3182 + PleI GAGTC 3186 3187 . . 3178 3182 + MlyI GAGTC 3187 3187 . . 3178 3182 + HinfI GANTC 3178 3181 . . 3181 3186 + MmeI TCCRAC 3206 3204 . . 3188 3192 + TfiI GAWTC 3188 3191 . . 3188 3192 + HinfI GANTC 3188 3191 . . 3196 3199 + SetI ASST 3199 3195 . . 3197 3200 + MnlI CCTC 3207 3206 . . 3202 3207 + Hpy166II GTNNAC 3204 3204 . . 3202 3207 + HindII GTYRAC 3204 3204 . . 3199 3203 - TspGWI ACGGA 3189 3187 . . 3213 3218 + Eco57MI CTGRAG 3234 3232 . . 3213 3218 + Eco57I CTGAAG 3234 3232 . . 3215 3219 + MboII GAAGA 3227 3226 . . 3218 3222 + TfiI GAWTC 3218 3221 . . 3218 3222 + HinfI GANTC 3218 3221 . . 3220 3225 + AsuII TTCGAA 3221 3223 . . 3221 3224 + TaqI TCGA 3221 3223 . . 3226 3229 + TaiI ACGT 3229 3225 . . 3226 3229 + SetI ASST 3229 3225 . . 3226 3229 + MaeII ACGT 3226 3228 . . 3226 3231 + AflIII ACRYGT 3226 3230 . . 3242 3247 + SspI AATATT 3244 3244 . . 3248 3251 + FnuDII* CGCG 3249 3249 . . 3249 3252 + Hin6I GCGC 3249 3251 . . 3249 3252 + GlaI GCGC 3250 3250 . . 3249 3252 + HhaI GCGC 3251 3249 . . 3252 3257 + TaqII CACCCA 3268 3266 . . 3263 3268 + Hpy166II GTNNAC 3265 3265 . . 3263 3268 + HindII GTYRAC 3265 3265 . . 3278 3282 + Hpy188I TCNGA 3280 3279 . . 3281 3285 + TfiI GAWTC 3281 3284 . . 3281 3285 + HinfI GANTC 3281 3284 . . 3287 3292 + SspI AATATT 3289 3289 . . 3292 3296 - MboII GAAGA 3284 3283 . . 3296 3300 + BccI CCATC 3304 3305 . . 3304 3308 + MboII GAAGA 3316 3315 . . 3308 3313 + XhoII RGATCY 3308 3312 . . 3308 3313 + BglII AGATCT 3308 3312 . . 3309 3312 + DpnI GATC 3310 3310 . . 3309 3312 + BstKTI GATC 3311 3309 . . 3304 3309 - Ksp632I* CTCTTC 3299 3302 . . 3309 3312 + MboI GATC 3308 3312 . . 3312 3315 + MaeI CTAG 3312 3314 . . 3324 3329 + ApoI RAATTY 3324 3328 . . 3325 3328 + TspEI AATT 3324 3328 . . 3336 3339 + TaqI TCGA 3336 3338 . . 3336 3341 + Hpy178III* TCNNGA 3337 3339 . . 3342 3345 + Csp6I GTAC 3342 3344 . . 3342 3345 + RsaI GTAC 3343 3343 . . 3344 3349 + Cfr10I RCCGGY 3344 3348 . . 3344 3349 + BetI* WCCGGW 3344 3348 . . 3344 3349 + AgeI ACCGGT 3344 3348 . . 3345 3348 + HpaII CCGG 3345 3347 . . 3340 3351 - PpiI GAACNNNNNCTC 3363 3358 3331 3326 3359 3364 + EcoT22I ATGCAT 3363 3359 . . 3360 3363 + CviRI* TGCA 3361 3361 . . 3366 3369 + TspEI AATT 3365 3369 . . 3368 3371 + MseI TTAA 3368 3370 . . 3391 3394 + FatI CATG 3390 3394 . . 3391 3394 + NlaIII CATG 3394 3390 . . 3391 3394 + CviAII CATG 3391 3393 . . 3394 3398 - BslFI GGGAC 3379 3383 . . 3410 3413 + FatI CATG 3409 3413 . . 3410 3413 + NlaIII CATG 3413 3409 . . 3410 3413 + CviAII CATG 3410 3412 . . 3413 3417 + PleI GAGTC 3421 3422 . . 3413 3417 + MlyI GAGTC 3422 3422 . . 3413 3417 + HinfI GANTC 3413 3416 . . 3417 3421 + Hpy99I CGWCG 3421 3416 . . 3421 3426 + Cac8I GCNNGC 3423 3423 . . 3426 3430 - BsrI ACTGG 3426 3424 . . 3444 3448 + Hpy188I TCNGA 3446 3445 . . 3451 3455 + DdeI CTNAG 3451 3454 . . 3451 3455 + BspCNI CTCAG 3464 3462 . . 3451 3455 + BseMII CTCAG 3465 3463 . . 3452 3456 + Hpy188I TCNGA 3454 3453 . . 3455 3459 + HinfI GANTC 3455 3458 . . 3455 3459 - PleI GAGTC 3449 3450 . . 3455 3459 - MlyI GAGTC 3449 3449 . . 3460 3463 + Csp6I GTAC 3460 3462 . . 3460 3463 + RsaI GTAC 3461 3461 . . 3462 3466 + Tsp4CI* ACNGT 3464 3463 . . 3463 3469 + TspRI CASTGNN 3469 3460 . . 3472 3483 + BdaI TGANNNNNNTCA 3461 3459 3495 3493 3473 3477 - BsmAI GTCTC 3467 3471 . . 3472 3483 - BdaI TGANNNNNNTCA 3495 3493 3461 3459 3485 3495 + BaeI ACNNNNGTAYC 3474 3469 3507 3502 3489 3492 + TaiI ACGT 3492 3488 . . 3489 3492 + SetI ASST 3492 3488 . . 3489 3492 + MaeII ACGT 3489 3491 . . 3491 3494 + Csp6I GTAC 3491 3493 . . 3491 3494 + RsaI GTAC 3492 3492 . . 3504 3507 + Csp6I GTAC 3504 3506 . . 3504 3507 + RsaI GTAC 3505 3505 . . 3501 3505 - BsrI ACTGG 3501 3499 . . 3512 3517 + KpnI GGTACC 3516 3512 . . 3512 3517 + NlaIV GGNNCC 3514 3514 . . 3512 3517 + HgiCI* GGYRCC 3512 3516 . . 3512 3517 + Acc65I GGTACC 3512 3516 . . 3513 3516 + Csp6I GTAC 3513 3515 . . 3513 3516 + RsaI GTAC 3514 3514 . . 3527 3531 + Tsp4CI* ACNGT 3529 3528 . . 3533 3536 + AciI CCGC 3533 3535 . . 3543 3547 + Tsp45I GTSAC 3542 3547 . . 3543 3547 + MaeIII GTNAC 3542 3547 . . 3555 3559 + DdeI CTNAG 3555 3558 . . 3551 3555 - BsmAI GTCTC 3545 3549 . . 3555 3559 - BspCNI CTCAG 3547 3545 . . 3555 3559 - BseMII CTCAG 3546 3544 . . 3573 3577 + Tsp4CI* ACNGT 3575 3574 . . 3576 3581 + Hpy166II GTNNAC 3578 3578 . . 3580 3583 + SetI ASST 3583 3579 . . 3581 3585 + Hin4II* CCTTC 3591 3590 . . 3578 3582 - HphI GGTGA 3570 3569 . . 3587 3592 + ClaI ATCGAT 3588 3590 . . 3588 3591 + TaqI TCGA 3588 3590 . . 3590 3594 - SfaNI GCATC 3580 3584 . . 3601 3606 + BetI* WCCGGW 3601 3605 . . 3602 3605 + HpaII CCGG 3602 3604 . . 3611 3614 + TspEI AATT 3610 3614 . . 3613 3617 - TspDTI ATGAA 3603 3601 . . 3615 3620 - BtgZI GCGATG 3600 3604 . . 3623 3628 + SspI AATATT 3625 3625 . . 3650 3654 + Tsp4CI* ACNGT 3652 3651 . . 3656 3660 + Hpy188I TCNGA 3658 3657 . . 3644 3657 - AjuI GAANNNNNNNTTGG 3669 3664 3637 3632 3669 3674 + SecI* CCNNGG 3669 3673 . . 3674 3678 + TfiI GAWTC 3674 3677 . . 3671 3674 - MnlI CCTC 3664 3663 . . 3674 3678 + HinfI GANTC 3674 3677 . . 3682 3687 - BtgZI GCGATG 3667 3671 . . 3689 3692 + DpnI GATC 3690 3690 . . 3689 3692 + BstKTI GATC 3691 3689 . . 3689 3692 + MboI GATC 3688 3692 . . 3704 3707 + DpnI GATC 3705 3705 . . 3704 3707 + BstKTI GATC 3706 3704 . . 3704 3707 + MboI GATC 3703 3707 . . 3709 3712 + SetI ASST 3712 3708 . . 3710 3713 + MnlI CCTC 3720 3719 . . 3712 3717 + Hpy178III* TCNNGA 3713 3715 . . 3716 3720 + TfiI GAWTC 3716 3719 . . 3716 3720 + HinfI GANTC 3716 3719 . . 3711 3716 - Eco57MI CTGRAG 3696 3694 . . 3711 3716 - GsuI CTGGAG 3696 3694 . . 3728 3733 + EcoRI GAATTC 3728 3732 . . 3728 3733 + ApoI RAATTY 3728 3732 . . 3729 3732 + TspEI AATT 3728 3732 . . 3743 3748 + AhaIII* TTTAAA 3745 3745 . . 3744 3747 + MseI TTAA 3744 3746 . . 3760 3770 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3751 3746 3783 3778 3763 3768 + ApoI RAATTY 3763 3767 . . 3764 3767 + TspEI AATT 3763 3767 . . 3779 3782 + TspEI AATT 3778 3782 . . 3783 3787 - BsrI ACTGG 3783 3781 . . 3789 3794 - TaqII CACCCA 3779 3777 . . 3800 3804 + HphI GGTGA 3812 3811 . . 3801 3805 + Tsp45I GTSAC 3800 3805 . . 3801 3805 + MaeIII GTNAC 3800 3805 . . 3803 3807 + HinfI GANTC 3803 3806 . . 3803 3807 - PleI GAGTC 3797 3798 . . 3803 3807 - MlyI GAGTC 3797 3797 . . 3828 3832 + Tsp4CI* ACNGT 3830 3829 . . 3840 3843 + DpnI GATC 3841 3841 . . 3840 3843 + BstKTI GATC 3842 3840 . . 3840 3843 + MboI GATC 3839 3843 . . 3848 3852 + MboII GAAGA 3860 3859 . . 3855 3859 + TspDTI ATGAA 3870 3868 . . 3865 3868 + TspEI AATT 3864 3868 . . 3867 3870 + MseI TTAA 3867 3869 . . 3870 3873 + SetI ASST 3873 3869 . . 3875 3880 + Hpy178III* TCNNGA 3876 3878 . . 3876 3881 + BsiI* CACGAG 3876 3880 . . 3879 3883 - BsmAI GTCTC 3873 3877 . . 3885 3888 + FatI CATG 3884 3888 . . 3885 3888 + NlaIII CATG 3888 3884 . . 3885 3888 + CviAII CATG 3885 3887 . . 3894 3898 + DdeI CTNAG 3894 3897 . . 3916 3919 + SetI ASST 3919 3915 . . 3917 3920 + MnlI CCTC 3927 3926 . . 3919 3923 + Hpy188I TCNGA 3921 3920 . . 3924 3927 + DpnI GATC 3925 3925 . . 3924 3927 + BstKTI GATC 3926 3924 . . 3924 3927 + MboI GATC 3923 3927 . . 3926 3929 + TaqI TCGA 3926 3928 . . 3928 3932 + MboII GAAGA 3940 3939 . . 3936 3941 + EcoRI GAATTC 3936 3940 . . 3936 3941 + ApoI RAATTY 3936 3940 . . 3937 3940 + TspEI AATT 3936 3940 . . 3942 3945 + SetI ASST 3945 3941 . . 3940 3944 - HphI GGTGA 3932 3931 . . 3949 3952 + CviRI* TGCA 3950 3950 . . 3950 3954 + BlsI GCNGC 3952 3951 . . 3950 3954 + BisI GCNGC 3951 3952 . . 3950 3954 + BbvI GCAGC 3962 3966 . . 3950 3954 + TseI GCWGC 3950 3953 . . 3951 3956 + PvuII CAGCTG 3953 3953 . . 3951 3956 + NspBII* CMGCKG 3953 3953 . . 3952 3955 + SetI ASST 3955 3951 . . 3952 3955 + CviJI RGCY 3953 3953 . . 3952 3955 + AluI AGCT 3953 3953 . . 3953 3963 + MwoI GCNNNNNNNGC 3959 3956 . . 3985 3989 + TspGWI ACGGA 4000 3998 . . 3992 3995 + SetI ASST 3995 3991 . . 3994 3999 + SmlI CTYRAG 3994 3998 . . 3994 3999 + AflII CTTAAG 3994 3998 . . 3995 3998 + MseI TTAA 3995 3997 . . 4007 4010 - MnlI CCTC 4000 3999 . . 4016 4019 + SetI ASST 4019 4015 . . 4014 4018 - HphI GGTGA 4006 4005 . . 4032 4035 + MseI TTAA 4032 4034 . . 4053 4056 + TaqI TCGA 4053 4055 . . 4073 4078 + Hpy166II GTNNAC 4075 4075 . . 4073 4078 + HindII GTYRAC 4075 4075 . . 4091 4095 + TspDTI ATGAA 4106 4104 . . 4101 4105 + BslFI GGGAC 4115 4119 . . 4105 4111 + TspRI CASTGNN 4111 4102 . . 4113 4118 + SspI AATATT 4115 4115 . . 4153 4158 + ApoI RAATTY 4153 4157 . . 4154 4157 + TspEI AATT 4153 4157 . . 4167 4171 - MboII GAAGA 4159 4158 . . 4180 4183 + TaiI ACGT 4183 4179 . . 4180 4183 + SetI ASST 4183 4179 . . 4180 4183 + MaeII ACGT 4180 4182 . . 4182 4186 + Tsp45I GTSAC 4181 4186 . . 4182 4186 + MaeIII GTNAC 4181 4186 . . 4183 4194 + BdaI TGANNNNNNTCA 4172 4170 4206 4204 4185 4189 + Tsp4CI* ACNGT 4187 4186 . . 4188 4191 + Csp6I GTAC 4188 4190 . . 4188 4191 + RsaI GTAC 4189 4189 . . 4183 4194 - BdaI TGANNNNNNTCA 4206 4204 4172 4170 4198 4201 + SetI ASST 4201 4197 . . 4198 4201 + CviJI RGCY 4199 4199 . . 4198 4201 + AluI AGCT 4199 4199 . . 4200 4203 + MaeI CTAG 4200 4202 . . 4210 4213 + CviRI* TGCA 4211 4211 . . 4216 4219 + SetI ASST 4219 4215 . . 4217 4221 + HphI GGTGA 4229 4228 . . 4215 4218 - MnlI CCTC 4208 4207 . . 4228 4232 + SfaNI GCATC 4237 4241 . . 4231 4236 + Hpy178III* TCNNGA 4232 4234 . . 4229 4233 - FokI GGATG 4215 4219 . . 4229 4233 - BseGI GGATG 4228 4226 . . 4244 4248 + HinfI GANTC 4244 4247 . . 4246 4250 + DdeI CTNAG 4246 4249 . . 4246 4250 + BspCNI CTCAG 4259 4257 . . 4246 4250 + BseMII CTCAG 4260 4258 . . 4244 4248 - PleI GAGTC 4238 4239 . . 4244 4248 - MlyI GAGTC 4238 4238 . . 4251 4256 + NspI RCATGY 4255 4251 . . 4251 4256 + Cac8I GCNNGC 4253 4253 . . 4251 4256 + SphI GCATGC 4255 4251 . . 4252 4255 + FatI CATG 4251 4255 . . 4252 4255 + NlaIII CATG 4255 4251 . . 4252 4255 + CviAII CATG 4252 4254 . . 4254 4257 + CviRI* TGCA 4255 4255 . . 4265 4269 + Tsp4CI* ACNGT 4267 4266 . . 4268 4271 + Csp6I GTAC 4268 4270 . . 4268 4271 + RsaI GTAC 4269 4269 . . 4271 4280 + MslI CAYNNNNRTG 4275 4275 . . 4278 4283 + EcoT22I ATGCAT 4282 4278 . . 4279 4282 + CviRI* TGCA 4280 4280 . . 4282 4287 + VspI ATTAAT 4283 4285 . . 4283 4286 + MseI TTAA 4283 4285 . . 4288 4299 + DrdI GACNNNNNNGTC 4294 4292 . . 4290 4294 - FokI GGATG 4276 4280 . . 4290 4294 - BseGI GGATG 4289 4287 . . 4297 4301 + Tsp45I GTSAC 4296 4301 . . 4297 4301 + MaeIII GTNAC 4296 4301 . . 4303 4306 + CviRI* TGCA 4304 4304 . . 4332 4335 + TspEI AATT 4331 4335 . . 4343 4347 - MboII GAAGA 4335 4334 . . 4360 4363 + CviRI* TGCA 4361 4361 . . 4373 4377 + MboII GAAGA 4385 4384 . . 4377 4380 + TspEI AATT 4376 4380 . . 4390 4393 + SetI ASST 4393 4389 . . 4391 4394 + MnlI CCTC 4401 4400 . . 4397 4407 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 4403 4400 . . 4409 4413 + TspDTI ATGAA 4424 4422 . . 4426 4429 + TaiI ACGT 4429 4425 . . 4426 4429 + SetI ASST 4429 4425 . . 4426 4429 + MaeII ACGT 4426 4428 . . 4432 4436 + MboII GAAGA 4444 4443 . . 4470 4474 + BsrI ACTGG 4475 4473 . . 4474 4477 + Csp6I GTAC 4474 4476 . . 4474 4477 + RsaI GTAC 4475 4475 . . 4494 4497 + SetI ASST 4497 4493 . . 4504 4508 + Tsp4CI* ACNGT 4506 4505 . . 4505 4511 + TspRI CASTGNN 4511 4502 . . 4517 4521 + MboII GAAGA 4529 4528 . . 4517 4526 + XmnI GAANNNNTTC 4521 4521 . . 4529 4533 + FokI GGATG 4542 4546 . . 4529 4533 + BseGI GGATG 4535 4533 . . 4530 4534 - BccI CCATC 4524 4525 . . 4536 4539 + FatI CATG 4535 4539 . . 4536 4539 + NlaIII CATG 4539 4535 . . 4536 4539 + CviAII CATG 4536 4538 . . 4545 4548 + MseI TTAA 4545 4547 . . 4559 4563 + MaeIII GTNAC 4558 4563 . . 4564 4567 + TspEI AATT 4563 4567 . . 4587 4598 + BdaI TGANNNNNNTCA 4576 4574 4610 4608 4587 4598 - BdaI TGANNNNNNTCA 4610 4608 4576 4574 4607 4610 + MseI TTAA 4607 4609 . . 4612 4615 + CviRI* TGCA 4613 4613 . . 4637 4642 + SmlI CTYRAG 4637 4641 . . 4638 4643 + Hpy178III* TCNNGA 4639 4641 . . 4637 4642 - Bce83I* CTTGAG 4622 4620 . . 4660 4670 + Hin4I GAYNNNNNVTC 4651 4646 4683 4678 4660 4670 - Hin4I GAYNNNNNVTC 4683 4678 4651 4646 4673 4677 + HphI GGTGA 4685 4684 . . 4671 4676 - TaqII CACCCA 4661 4659 . . 4689 4694 + ApoI RAATTY 4689 4693 . . 4690 4693 + TspEI AATT 4689 4693 . . 4696 4699 + Csp6I GTAC 4696 4698 . . 4696 4699 + RsaI GTAC 4697 4697 . . 4709 4712 + CviJI RGCY 4710 4710 . . 4711 4715 + DdeI CTNAG 4711 4714 . . 4732 4735 + SetI ASST 4735 4731 . . 4731 4734 - MnlI CCTC 4724 4723 . . 4741 4744 + FatI CATG 4740 4744 . . 4741 4744 + NlaIII CATG 4744 4740 . . 4741 4744 + CviAII CATG 4741 4743 . . 4742 4746 + TspDTI ATGAA 4757 4755 . . 4746 4749 + TspEI AATT 4745 4749 . . 4750 4753 + SetI ASST 4753 4749 . . 4766 4769 + MseI TTAA 4766 4768 . . 4770 4774 + DdeI CTNAG 4770 4773 . . 4770 4774 - BspCNI CTCAG 4762 4760 . . 4770 4774 - BseMII CTCAG 4761 4759 . . 4785 4788 + TspEI AATT 4784 4788 . . 4787 4790 + MseI TTAA 4787 4789 . . 4791 4794 + TaiI ACGT 4794 4790 . . 4791 4794 + SetI ASST 4794 4790 . . 4791 4794 + MaeII ACGT 4791 4793 . . 4793 4796 + Csp6I GTAC 4793 4795 . . 4793 4796 + RsaI GTAC 4794 4794 . . 4795 4798 + SetI ASST 4798 4794 . . 4801 4805 + TfiI GAWTC 4801 4804 . . 4801 4805 + HinfI GANTC 4801 4804 . . 4812 4816 + MboII GAAGA 4824 4823 . . 4820 4824 + DdeI CTNAG 4820 4823 . . 4823 4828 + HaeII RGCGCY 4827 4823 . . 4823 4828 + Eco47III AGCGCT 4825 4825 . . 4824 4827 + Hin6I GCGC 4824 4826 . . 4824 4827 + GlaI GCGC 4825 4825 . . 4824 4827 + HhaI GCGC 4826 4824 . . 4829 4833 + BssKI CCNGG 4828 4833 . . 4829 4833 + BseBI CCWGG 4830 4831 . . 4829 4833 + ScrFI CCNGG 4830 4831 . . 4829 4833 + EcoRII CCWGG 4828 4833 . . 4831 4834 + SetI ASST 4834 4830 . . 4827 4832 - Eco57MI CTGRAG 4812 4810 . . 4827 4832 - GsuI CTGGAG 4812 4810 . . 4833 4838 + Hpy166II GTNNAC 4835 4835 . . 4833 4838 + HindII GTYRAC 4835 4835 . . 4837 4843 + SexAI ACCWGGT 4837 4842 . . 4838 4842 + BssKI CCNGG 4837 4842 . . 4838 4842 + BseBI CCWGG 4839 4840 . . 4838 4842 + ScrFI CCNGG 4839 4840 . . 4838 4842 + EcoRII CCWGG 4837 4842 . . 4840 4843 + SetI ASST 4843 4839 . . 4855 4859 + BssKI CCNGG 4854 4859 . . 4855 4859 + BseBI CCWGG 4856 4857 . . 4855 4859 + ScrFI CCNGG 4856 4857 . . 4855 4859 + EcoRII CCWGG 4854 4859 . . 4858 4862 + FokI GGATG 4871 4875 . . 4858 4862 + BseGI GGATG 4864 4862 . . 4860 4864 + TspDTI ATGAA 4875 4873 . . 4865 4868 + MaeI CTAG 4865 4867 . . 4875 4879 + TspDTI ATGAA 4890 4888 . . 4877 4881 + MboII GAAGA 4889 4888 . . 4881 4885 + TspDTI ATGAA 4896 4894 . . 4896 4899 + SetI ASST 4899 4895 . . 4894 4898 - Hin4II* CCTTC 4888 4887 . . 4898 4901 + Csp6I GTAC 4898 4900 . . 4898 4901 + RsaI GTAC 4899 4899 . . 4901 4904 + FatI CATG 4900 4904 . . 4901 4904 + NlaIII CATG 4904 4900 . . 4901 4904 + CviAII CATG 4901 4903 . . 4902 4906 + TspDTI ATGAA 4917 4915 . . 4908 4911 + CviRI* TGCA 4909 4909 . . 4925 4928 + MaeI CTAG 4925 4927 . . 4927 4930 + SetI ASST 4930 4926 . . 4927 4930 + CviJI RGCY 4928 4928 . . 4927 4930 + AluI AGCT 4928 4928 . . 4932 4937 + NdeI CATATG 4933 4935 . . 4930 4934 - TspDTI ATGAA 4920 4918 . . 4937 4942 - MmeI TCCRAC 4918 4916 . . 4946 4951 + ApoI RAATTY 4946 4950 . . 4947 4950 + TspEI AATT 4946 4950 . . 5004 5007 + MnlI CCTC 5014 5013 . . 5007 5010 + MaeI CTAG 5007 5009 . . 5023 5026 + FatI CATG 5022 5026 . . 5023 5026 + NlaIII CATG 5026 5022 . . 5023 5026 + CviAII CATG 5023 5025 . . 5028 5033 + NdeI CATATG 5029 5031 . . 5036 5039 + MseI TTAA 5036 5038 . . 5042 5053 + CspCI CAANNNNNGTGG 5030 5028 5065 5063 5043 5046 + TspEI AATT 5042 5046 . . 5047 5050 + FatI CATG 5046 5050 . . 5047 5050 + NlaIII CATG 5050 5046 . . 5047 5050 + CviAII CATG 5047 5049 . . 5045 5049 - TspDTI ATGAA 5035 5033 . . 5052 5056 + BslFI GGGAC 5066 5070 . . 5058 5061 + MaeI CTAG 5058 5060 . . 5092 5095 + SetI ASST 5095 5091 . . 5100 5103 + CviJI RGCY 5101 5101 . . 5113 5118 + SpeI ACTAGT 5113 5117 . . 5114 5117 + MaeI CTAG 5114 5116 . . 5125 5135 + FalI AAGNNNNNCTT 5116 5111 5148 5143 5129 5133 - SfaNI GCATC 5119 5123 . . 5125 5135 - FalI AAGNNNNNCTT 5148 5143 5116 5111 5136 5141 + NdeI CATATG 5137 5139 . . 5134 5138 - TspDTI ATGAA 5124 5122 . . 5141 5147 + BstEII GGTNACC 5141 5146 . . 5142 5146 + MaeIII GTNAC 5141 5146 . . 5143 5148 + TsoI TARCCA 5159 5157 . . 5161 5165 + Tsp45I GTSAC 5160 5165 . . 5161 5165 + MaeIII GTNAC 5160 5165 . . 5167 5170 + TspEI AATT 5166 5170 . . 5187 5190 + MseI TTAA 5187 5189 . . 5196 5199 + SetI ASST 5199 5195 . . 5200 5203 + TspEI AATT 5199 5203 . . 5205 5208 - MnlI CCTC 5198 5197 . . 5212 5217 + Hpy166II GTNNAC 5214 5214 . . 5217 5222 + StyI CCWWGG 5217 5221 . . 5217 5222 + SecI* CCNNGG 5217 5221 . . 5221 5224 + CviJI RGCY 5222 5222 . . 5226 5235 + MslI CAYNNNNRTG 5230 5230 . . 5224 5228 - TspDTI ATGAA 5214 5212 . . 5228 5231 + MseI TTAA 5228 5230 . . 5231 5236 + BspLU11I* ACATGT 5231 5235 . . 5231 5236 + NspI RCATGY 5235 5231 . . 5231 5236 + AflIII ACRYGT 5231 5235 . . 5232 5235 + FatI CATG 5231 5235 . . 5232 5235 + NlaIII CATG 5235 5231 . . 5232 5235 + CviAII CATG 5232 5234 . . 5234 5239 + TatI WGTACW 5234 5238 . . 5235 5238 + Csp6I GTAC 5235 5237 . . 5235 5238 + RsaI GTAC 5236 5236 . . 5246 5250 + TspGWI ACGGA 5261 5259 . . 5249 5261 + BarI GAAGNNNNNNTAC 5241 5236 5273 5268 5263 5266 + FnuDII* CGCG 5264 5264 . . 5273 5277 + TfiI GAWTC 5273 5276 . . 5273 5277 + HinfI GANTC 5273 5276 . . 5279 5283 - BslFI GGGAC 5264 5268 . . 5288 5291 + MseI TTAA 5288 5290 . . 5295 5298 + SetI ASST 5298 5294 . . 5296 5299 + MnlI CCTC 5306 5305 . . 5297 5301 + DdeI CTNAG 5297 5300 . . 5297 5301 + BspCNI CTCAG 5310 5308 . . 5297 5301 + BseMII CTCAG 5311 5309 . . 5301 5305 + Tsp45I GTSAC 5300 5305 . . 5301 5305 + MaeIII GTNAC 5300 5305 . . 5303 5311 + DraIII CACNNNGTG 5308 5305 . . 5304 5307 + SetI ASST 5307 5303 . . 5302 5306 - HphI GGTGA 5294 5293 . . 5310 5313 + CviRI* TGCA 5311 5311 . . 5319 5322 + MseI TTAA 5319 5321 . . 5332 5335 + TspEI AATT 5331 5335 . . 5354 5364 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5345 5340 5377 5372 5355 5359 + Tsp4CI* ACNGT 5357 5356 . . 5354 5364 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5377 5372 5345 5340 5377 5380 + TspEI AATT 5376 5380 . . 5391 5395 + TspDTI ATGAA 5406 5404 . . 5393 5397 + MboII GAAGA 5405 5404 . . 5393 5398 - Ksp632I* CTCTTC 5388 5391 . . 5399 5404 + ApoI RAATTY 5399 5403 . . 5400 5403 + TspEI AATT 5399 5403 . . 5421 5424 + Csp6I GTAC 5421 5423 . . 5421 5424 + RsaI GTAC 5422 5422 . . 5429 5434 + BsrDI GCAATG 5436 5434 . . 5438 5442 + DdeI CTNAG 5438 5441 . . 5434 5438 - BsmAI GTCTC 5428 5432 . . 5444 5454 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5435 5430 5467 5462 5445 5449 + TspDTI ATGAA 5460 5458 . . 5453 5458 + Hpy178III* TCNNGA 5454 5456 . . 5444 5454 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5467 5462 5435 5430 5466 5469 + CviRI* TGCA 5467 5467 . . 5468 5473 + BsaAI YACGTR 5470 5470 . . 5469 5472 + TaiI ACGT 5472 5468 . . 5469 5472 + SetI ASST 5472 5468 . . 5469 5472 + MaeII ACGT 5469 5471 . . 5465 5470 - BsgI GTGCAG 5450 5448 . . 5481 5484 + TaqI TCGA 5481 5483 . . 5495 5500 + SspI AATATT 5497 5497 . . 5500 5503 + CviRI* TGCA 5501 5501 . . 5505 5508 + TaiI ACGT 5508 5504 . . 5505 5508 + SetI ASST 5508 5504 . . 5505 5508 + MaeII ACGT 5505 5507 . . 5512 5522 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5503 5498 5535 5530 5518 5521 + SetI ASST 5521 5517 . . 5519 5522 + MnlI CCTC 5529 5528 . . 5520 5525 + Ksp632I* CTCTTC 5526 5529 . . 5524 5528 + Hpy188I TCNGA 5526 5525 . . 5521 5525 - MboII GAAGA 5513 5512 . . 5546 5549 + MseI TTAA 5546 5548 . . 5560 5564 + TfiI GAWTC 5560 5563 . . 5560 5564 + HinfI GANTC 5560 5563 . . 5562 5566 - TspDTI ATGAA 5552 5550 . . 5568 5573 + XhoII RGATCY 5568 5572 . . 5568 5573 + BglII AGATCT 5568 5572 . . 5569 5572 + DpnI GATC 5570 5570 . . 5569 5572 + BstKTI GATC 5571 5569 . . 5569 5572 + MboI GATC 5568 5572 . . 5583 5588 - TaqII CACCCA 5573 5571 . . 5593 5598 - MmeI TCCRAC 5574 5572 . . 5656 5660 + Tsp4CI* ACNGT 5658 5657 . . 5662 5665 + MseI TTAA 5662 5664 . . 5688 5691 + SetI ASST 5691 5687 . . 5688 5691 + CviJI RGCY 5689 5689 . . 5688 5691 + AluI AGCT 5689 5689 . . 5684 5694 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5707 5702 5675 5670 5695 5700 + ClaI ATCGAT 5696 5698 . . 5696 5699 + TaqI TCGA 5696 5698 . . 5705 5708 - MnlI CCTC 5698 5697 . . 5710 5713 + SetI ASST 5713 5709 . . 5710 5713 + CviJI RGCY 5711 5711 . . 5710 5713 + AluI AGCT 5711 5711 . . 5740 5744 + BinI* GGATC 5748 5749 . . 5741 5744 + DpnI GATC 5742 5742 . . 5741 5744 + BstKTI GATC 5743 5741 . . 5741 5744 + MboI GATC 5740 5744 . . 5746 5750 + TspDTI ATGAA 5761 5759 . . 5765 5769 + TspGWI ACGGA 5780 5778 . . 5772 5775 - MnlI CCTC 5765 5764 . . 5772 5782 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5795 5790 5763 5758 5785 5790 + SspI AATATT 5787 5787 . . 5807 5811 + TfiI GAWTC 5807 5810 . . 5807 5811 + HinfI GANTC 5807 5810 . . 5811 5821 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 5817 5814 . . 5821 5825 + TfiI GAWTC 5821 5824 . . 5818 5821 - MnlI CCTC 5811 5810 . . 5821 5825 + HinfI GANTC 5821 5824 . . 5832 5839 + PspXI VCTCGAGB 5833 5837 . . 5832 5835 + MnlI CCTC 5842 5841 . . 5832 5839 + AbsI CCTCGAGG 5833 5837 . . 5833 5838 + SmlI CTYRAG 5833 5837 . . 5833 5838 + XhoI CTCGAG 5833 5837 . . 5833 5838 + BmeT110I CYCGRG 5834 5836 . . 5833 5838 + AvaI CYCGRG 5833 5837 . . 5834 5837 + TaqI TCGA 5834 5836 . . 5836 5841 + BseRI GAGGAG 5851 5849 . . 5836 5839 - MnlI CCTC 5829 5828 . . 5847 5850 + MaeI CTAG 5847 5849 . . 5859 5864 + Hpy166II GTNNAC 5861 5861 . . 5859 5864 + BssNAI GTATAC 5861 5861 . . 5859 5864 + AccI GTMKAC 5860 5862 . . 5863 5866 + SetI ASST 5866 5862 . . 5867 5872 + SspI AATATT 5869 5869 . . 5875 5878 + CviJI RGCY 5876 5876 . . 5892 5896 + TfiI GAWTC 5892 5895 . . 5892 5896 + HinfI GANTC 5892 5895 . . 5902 5905 + TspEI AATT 5901 5905 . . 5910 5913 + TspEI AATT 5909 5913 . . #--------------------------------------- # # # AarI: # [CACCTGC] # 477 672 4780 # # AbsI: # [CCTCGAGG] # 96 242 5591 # # Acc65I: # [GGTACC] # 2417 3512 # # AccI: # [GTMKAC] # 69 269 341 362 1547 3341 # # AciI: # [CCGC] # 81 688 945 1819 2396 # # AflII: # [CTTAAG] # 1935 3994 # # AflIII: # [ACRYGT] # 698 1276 1950 2005 # # AgeI: # [ACCGGT] # 2585 3344 # # AhaIII*: # [TTTAAA] # 2184 3745 # # AjuI: # [GAANNNNNNNTTGG] # 32 2260 3637 # # AlfI: # [GCANNNNNNTGC] # 0 0 34 2096 3799 # # AluI: # [AGCT] # 22 22 32 75 98 218 # 246 276 286 441 729 761 # 780 934 1009 # # AlwNI: # [CAGNNNCTG] # 1306 4623 # # ApaLI: # [GTGCAC] # 2343 3586 # # ApoI: # [RAATTY] # 20 35 70 109 145 156 # 162 173 181 217 257 404 # 413 452 453 530 536 602 # 1014 # # AsuI*: # [GGNCC] # 126 185 544 1648 3426 # # AsuII: # [TTCGAA] # 1474 1747 2708 # # AvaI: # [CYCGRG] # 96 242 2353 3238 # # AvaII: # [GGWCC] # 185 2318 3426 # # BaeI: # [ACNNNNGTAYC] # 33 2422 3474 # # BarI: # [GAAGNNNNNNTAC] # 32 656 5241 # # BbvCI: # [CCTCAGC] # 765 5164 # # BbvI: # [GCAGC] # 458 1424 1967 2080 # # BbvII*: # [GAAGAC] # 88 2899 2942 # # BccI: # [CCATC] # 22 27 30 81 91 114 # 197 372 471 506 576 817 # 1220 1405 # # Bce83I*: # [CTTGAG] # 1307 4622 # # BceAI: # [ACGGC] # 2 531 668 1432 3296 # # BciVI: # [GTATCC] # 704 811 4414 # # BclI: # [TGATCA] # 2830 3099 # # BdaI: # [TGANNNNNNTCA] # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 34 34 34 34 # 370 677 1319 1552 1875 # # BetI*: # [WCCGGW] # 257 2328 3344 # # BfiI: # [ACTGGG] # 1999 3930 # # BglII: # [AGATCT] # 361 1602 1706 2260 # # BinI*: # [GGATC] # 157 181 225 977 1711 2678 # # BisI: # [GCNGC] # 483 1413 1978 2055 # # BlsI: # [GCNGC] # 483 1414 1977 2055 # # BmeT110I: # [CYCGRG] # 95 243 2353 3238 # # BmgT120I: # [GGNCC] # 126 185 545 1648 3425 # # Bpu10I: # [CCTNAGC] # 765 2379 2785 # # BsaAI: # [YACGTR] # 459 2157 3313 # # BsaXI: # [ACNNNNNCTCC] # 30 2828 3071 # # BseBI: # [CCWGG] # 9 17 109 155 171 334 # 380 668 1054 1073 1959 # # BseGI: # [GGATG] # 11 19 24 40 61 215 # 229 246 329 506 760 1065 # 1089 1335 # # BseMII: # [CTCAG] # 16 54 81 151 330 501 # 550 614 618 630 709 714 # 961 # # BseRI: # [GAGGAG] # 78 240 260 5351 # # BseSI: # [GKGCMC] # 2347 3582 # # BseYI: # [CCCAGC] # 1525 4404 # # BsgI: # [GTGCAG] # 479 5450 # # BsiI*: # [CACGAG] # 1017 2053 2859 # # BsiYI*: # [CCNNNNNNNGG] # 57 112 198 226 315 1414 # 1680 1927 # # BslFI: # [GGGAC] # 198 665 736 951 3379 # # BsmAI: # [GTCTC] # 78 328 395 501 526 572 # 1555 1974 # # BsmI: # [GAATGC] # 904 1199 3826 # # BspCNI: # [CTCAG] # 16 52 83 151 328 503 # 548 616 619 630 710 712 # 961 # # BspHI: # [TCATGA] # 1040 4889 # # BspLU11I*: # [ACATGT] # 698 5231 # # BspMI: # [ACCTGC] # 48 477 624 4780 # # BsrDI: # [GCAATG] # 394 493 2376 2666 # # BsrI: # [ACTGG] # 11 75 135 149 192 282 # 692 945 1454 1994 # # BssKI: # [CCNGG] # 9 17 109 155 171 334 # 380 666 1054 1075 1959 # # BssNAI: # [GTATAC] # 68 270 362 1888 3341 # # BstEII: # [GGTNACC] # 788 1796 3345 # # BstKTI: # [GATC] # 15 16 84 86 136 152 # 159 172 186 217 238 355 # 380 422 542 1124 1645 # # BstXI: # [CCANNNNNNTGG] # 596 1892 3441 # # BtgZI: # [GCGATG] # 67 2262 3600 # # BtrI: # [CACGTC] # 1279 4650 # # BtsI: # [GCAGTG] # 565 5364 # # Cac8I: # [GCNNGC] # 6 188 653 661 830 1676 # 1915 # # Cfr10I: # [RCCGGY] # 2585 3344 # # ClaI: # [ATCGAT] # 105 233 2108 3483 # # Csp6I: # [GTAC] # 9 13 21 23 25 31 # 34 50 80 97 105 108 # 118 144 186 206 214 222 # 265 337 508 526 549 564 # 675 819 # # CspCI: # [CAANNNNNGTGG] # 35 864 5030 # # CviAII: # [CATG] # 19 24 32 62 104 122 # 160 162 165 182 185 194 # 205 278 284 337 348 367 # 463 475 477 587 697 # # CviJI: # [RGCY] # 6 12 22 22 24 27 # 30 32 36 37 40 42 # 53 65 89 98 102 110 # 112 121 121 140 165 165 # 173 218 246 260 299 467 # 511 561 743 780 # # CviRI*: # [TGCA] # 6 22 24 25 34 37 # 44 48 49 57 60 63 # 156 156 228 252 261 296 # 314 402 428 511 563 589 # 605 699 # # DdeI: # [CTNAG] # 16 31 50 56 59 75 # 104 126 141 151 278 283 # 307 339 352 365 465 477 # 491 552 581 630 # # DpnI: # [GATC] # 15 16 84 86 136 151 # 159 172 187 217 238 355 # 380 422 542 1124 1645 # # DraIII: # [CACNNNGTG] # 621 5308 # # DrdI: # [GACNNNNNNGTC] # 1635 4294 # # DsaI*: # [CCRYGG] # 2506 3423 # # Eco47III: # [AGCGCT] # 1104 4825 # # Eco57I: # [CTGAAG] # 283 506 2445 2695 # # Eco57MI: # [CTGRAG] # 283 462 506 1116 1117 2445 # # EcoNI: # [CCTNNNNNAGG] # 737 5192 # # EcoP15I: # [CAGCAG] # 586 5343 # # EcoRI: # [GAATTC] # 208 1993 3728 # # EcoRII: # [CCWGG] # 9 17 109 155 171 334 # 380 666 1054 1075 1959 # # EcoRV: # [GATATC] # 285 583 882 1038 3141 # # EcoT22I: # [ATGCAT] # 919 1152 1647 2211 # # Esp3I: # [CGTCTC] # 2895 3034 # # FalI: # [AAGNNNNNCTT] # 0 0 32 781 5116 # # FatI: # [CATG] # 19 24 32 62 104 122 # 160 162 165 182 185 194 # 205 278 284 336 348 367 # 463 475 477 587 698 # # FnuDII*: # [CGCG] # 665 831 2015 2418 # # FokI: # [GGATG] # 11 19 24 40 61 215 # 229 266 329 506 747 1058 # 1089 1335 # # GlaI: # [GCGC] # 345 1104 1144 1575 1761 # # GsaI: # [CCCAGC] # 1529 4400 # # GsuI: # [CTGGAG] # 1116 1117 3696 # # HaeII: # [RGCGCY] # 347 1102 4480 # # HaeIII: # [GGCC] # 126 546 875 933 3449 # # HgaI: # [GACGC] # 40 2875 3014 # # HgiAI*: # [GWGCWC] # 255 724 1623 3327 # # HgiCI*: # [GGYRCC] # 2417 3512 # # HgiJII*: # [GRGCYC] # 1497 4432 # # HhaI: # [GCGC] # 346 1103 1144 1575 1761 # # Hin4I: # [GAYNNNNNVTC] # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 11 21 # 21 32 32 32 32 32 # 32 32 32 32 32 32 # 32 32 36 56 56 58 # 84 94 134 140 177 202 # 544 612 662 868 1737 # # Hin4II*: # [CCTTC] # 79 643 960 1041 1297 1909 # # Hin6I: # [GCGC] # 344 1105 1144 1575 1761 # # HindII: # [GTYRAC] # 61 391 634 760 810 821 # 1094 1358 # # HinfI: # [GANTC] # 10 14 14 15 16 21 # 21 29 30 37 42 42 # 47 50 60 63 71 71 # 74 87 88 105 110 112 # 132 168 216 219 247 255 # 287 323 371 441 472 489 # 523 557 # # HpaI: # [GTTAAC] # 821 5108 # # HpaII: # [CCGG] # 257 2327 3345 # # HphI: # [GGTGA] # 74 96 120 121 223 242 # 456 609 635 722 843 869 # 919 # # Hpy166II: # [GTNNAC] # 19 61 68 68 79 88 # 105 113 141 152 175 189 # 229 257 270 313 379 391 # 497 647 760 928 # # Hpy178III*: # [TCNNGA] # 7 9 33 49 50 69 # 90 158 161 163 178 194 # 297 314 321 356 376 385 # 407 468 475 554 815 # # Hpy188I: # [TCNGA] # 8 18 27 28 58 63 # 97 151 153 166 197 204 # 228 263 297 308 342 403 # 594 719 1605 # # Hpy99I: # [CGWCG] # 413 590 2418 2508 # # KpnI: # [GGTACC] # 2413 3516 # # Ksp632I*: # [CTCTTC] # 138 403 2089 3299 # # MaeI: # [CTAG] # 51 56 60 82 82 256 # 266 276 583 665 733 888 # 1931 # # MaeII: # [ACGT] # 36 177 227 246 263 354 # 365 398 424 474 526 678 # 691 1070 # # MaeIII: # [GTNAC] # 19 60 115 140 258 262 # 357 381 583 629 632 743 # 747 1003 # # MboI: # [GATC] # 15 16 84 86 136 149 # 159 172 189 217 238 355 # 380 422 542 1124 1645 # # MboII: # [GAAGA] # 10 32 35 50 57 59 # 59 65 78 80 85 108 # 176 192 219 295 416 516 # 544 1351 1502 # # McrI*: # [CGRYCG] # 2413 3516 # # MfeI: # [CAATTG] # 1573 4356 # # MlyI: # [GAGTC] # 21 27 199 235 348 441 # 571 745 1651 1691 # # MmeI: # [TCCRAC] # 56 238 355 656 687 1712 # 2225 # # MnlI: # [CCTC] # 5 13 13 18 18 21 # 28 46 46 49 56 60 # 67 67 73 87 90 107 # 108 151 159 169 183 184 # 193 207 208 213 223 232 # 265 290 323 339 427 457 # 734 # # MseI: # [TTAA] # 9 21 24 31 31 37 # 41 56 58 60 62 71 # 99 116 123 128 151 159 # 227 244 249 251 262 267 # 272 354 376 380 467 554 # 749 # # MslI: # [CAYNNNNRTG] # 57 408 558 699 747 955 # 1089 1416 # # MstI*: # [TGCGCA] # 2106 3823 # # MwoI: # [GCNNNNNNNGC] # 97 478 1088 1970 2296 # # NdeI: # [CATATG] # 96 108 792 4933 # # NlaIII: # [CATG] # 19 24 32 62 104 122 # 160 162 165 182 185 194 # 205 278 284 340 348 367 # 463 475 477 587 694 # # NlaIV: # [GGNNCC] # 2415 3514 # # NruI: # [TCGCGA] # 2418 3511 # # NspBII*: # [CMGCKG] # 288 481 1365 1819 1976 # # NspI: # [RCATGY] # 194 657 691 694 980 1226 # 1487 # # OliI: # [CACNNNNGTG] # 558 5371 # # PflMI: # [CCANNNNNTGG] # 541 5388 # # PfoI: # [TCCNGGA] # 1815 4114 # # PleI: # [GAGTC] # 22 28 198 235 348 441 # 571 744 1651 1691 # # PpiI: # [GAACNNNNNCTC] # 32 2566 3331 # # PsiI: # [TTATAA] # 1703 4226 # # PspXI: # [VCTCGAGB] # 96 242 5591 # # PstI: # [CTGCAG] # 754 1146 4029 # # PvuII: # [CAGCTG] # 481 1976 3472 # # RsaI: # [GTAC] # 9 13 21 23 25 31 # 34 50 80 97 105 108 # 118 144 186 206 214 222 # 265 337 507 527 549 564 # 675 819 # # SalI: # [GTCGAC] # 2177 3752 # # ScaI: # [AGTACT] # 788 2006 3135 # # ScrFI: # [CCNGG] # 9 17 109 155 171 334 # 380 668 1054 1073 1959 # # SduI: # [GDGCHC] # 255 724 773 850 3327 # # SecI*: # [CCNNGG] # 108 170 334 363 381 667 # 712 800 846 1548 # # SetI: # [ASST] # 4 4 5 6 7 9 # 9 9 10 12 12 13 # 15 18 18 18 22 22 # 24 24 25 25 26 30 # 30 31 32 33 34 36 # 36 36 36 36 40 41 # 42 44 46 46 47 48 # 56 63 63 66 66 68 # 76 77 82 84 87 90 # 91 96 98 99 100 101 # 104 105 124 126 129 140 # 146 153 153 161 164 165 # 165 170 174 175 193 238 # 263 357 # # SexAI: # [ACCWGGT] # 1092 4837 # # SfaNI: # [GCATC] # 11 42 560 657 706 810 # 882 1124 1137 # # SfeI*: # [CTRYAG] # 273 481 1142 4033 # # SmlI: # [CTYRAG] # 96 242 643 1196 3752 # # SpeI: # [ACTAGT] # 816 5113 # # SphI: # [GCATGC] # 194 1674 1917 2144 # # SplI*: # [CGTACG] # 921 5008 # # SspI: # [AATATT] # 45 60 82 82 196 290 # 336 490 696 1382 2270 # # StyI: # [CCWWGG] # 712 5217 # # TaiI: # [ACGT] # 36 177 227 246 263 354 # 365 401 421 474 526 678 # 691 1070 # # TaqI: # [TCGA] # 6 33 50 70 95 105 # 106 115 120 125 127 138 # 138 193 197 203 215 252 # 255 267 298 338 418 637 # 1428 # # TaqII: # [CACCCA] # 356 470 511 629 882 912 # 2169 # # TatI: # [WGTACW] # 50 59 479 656 695 729 # 819 2442 # # TfiI: # [GAWTC] # 14 14 21 29 30 37 # 42 47 50 60 63 71 # 71 84 88 105 125 133 # 216 247 287 323 387 393 # 423 472 489 523 1085 # # TseI: # [GCWGC] # 483 1412 1979 2055 # # TsoI: # [TARCCA] # 770 2480 2679 # # Tsp45I: # [GTSAC] # 60 115 140 258 381 629 # 632 864 1104 1746 # # Tsp4CI*: # [ACNGT] # 11 13 46 65 67 77 # 80 93 94 120 178 223 # 239 271 301 314 314 314 # 357 396 429 460 616 851 # # TspDTI: # [ATGAA] # 3 4 6 13 15 21 # 54 79 83 89 90 92 # 101 115 118 135 160 168 # 170 175 187 192 207 209 # 233 234 236 267 285 294 # 318 333 554 689 # # TspEI: # [AATT] # 4 5 8 8 15 20 # 20 22 23 23 29 33 # 35 39 41 45 45 56 # 58 70 72 84 86 95 # 96 99 103 109 110 112 # 118 123 124 126 132 151 # 156 162 162 178 187 209 # 217 235 245 271 310 326 # 430 502 # # TspGWI: # [ACGGA] # 6 37 85 149 189 191 # 237 303 312 361 471 498 # 499 519 811 1261 # # TspRI: # [CASTGNN] # 374 400 531 565 642 981 # 1018 1418 # # TstI: # [CACNNNNNNTCC] # 32 1489 4408 # # VspI: # [ATTAAT] # 1231 1646 3052 # # XhoI: # [CTCGAG] # 96 242 5591 # # XhoII: # [RGATCY] # 233 361 387 1319 1369 2260 # # XmnI: # [GAANNNNTTC] # 721 1408 1568 2232 # #--------------------------------------- #--------------------------------------- # Total_sequences: 1 # Total_length: 5929 # Reported_sequences: 1 # Reported_hitcount: 1296 #---------------------------------------