Restriction Fragments for YPLWTy1-1



Send questions or suggestions to SGD

BLAST search | Genome Restriction Map | Design Primers for this sequence


The currently selected gene/sequence is :

YPLWTy1-1 on chromosome XVI from coordinates 56452 to 62375.

seqfile=/share/crumb/www-data/html/tmp/gcgseq.tmp.12466.2

Start End Strand Enzyme_name Restriction_site 5prime 3prime 5primerev 3primerev 32 37 + SpeI ACTAGT 32 36 . . 33 36 + MaeI CTAG 33 35 . . 47 52 + SpeI ACTAGT 47 51 . . 48 51 + MaeI CTAG 48 50 . . 65 69 + Tsp4CI* ACNGT 67 66 . . 74 78 + MboII GAAGA 86 85 . . 80 84 + HgaI GACGC 89 94 . . 92 102 - Hin4I GAYNNNNNVTC 115 110 83 78 108 111 + TspEI AATT 107 111 . . 118 121 + SetI ASST 121 117 . . 118 121 + CviJI RGCY 119 119 . . 118 121 + AluI AGCT 119 119 . . 148 152 + BinI* GGATC 156 157 . . 149 152 + DpnI GATC 150 150 . . 149 152 + BstKTI GATC 151 149 . . 149 152 + MboI GATC 148 152 . . 154 158 + TspDTI ATGAA 169 167 . . 173 177 + TspGWI ACGGA 188 186 . . 180 183 - MnlI CCTC 173 172 . . 180 190 - Hin4I GAYNNNNNVTC 203 198 171 166 193 198 + SspI AATATT 195 195 . . 215 219 + TfiI GAWTC 215 218 . . 215 219 + HinfI GANTC 215 218 . . 219 229 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 225 222 . . 229 233 + TfiI GAWTC 229 232 . . 226 229 - MnlI CCTC 219 218 . . 229 233 + HinfI GANTC 229 232 . . 240 247 + PspXI VCTCGAGB 241 245 . . 240 243 + MnlI CCTC 250 249 . . 240 247 + AbsI CCTCGAGG 241 245 . . 241 246 + SmlI CTYRAG 241 245 . . 241 246 + XhoI CTCGAG 241 245 . . 241 246 + BmeT110I CYCGRG 242 244 . . 241 246 + AvaI CYCGRG 241 245 . . 242 245 + TaqI TCGA 242 244 . . 244 249 + BseRI GAGGAG 259 257 . . 244 247 - MnlI CCTC 237 236 . . 255 258 + MaeI CTAG 255 257 . . 267 272 + Hpy166II GTNNAC 269 269 . . 267 272 + BssNAI GTATAC 269 269 . . 267 272 + AccI GTMKAC 268 270 . . 271 274 + SetI ASST 274 270 . . 275 280 + SspI AATATT 277 277 . . 283 286 + CviJI RGCY 284 284 . . 300 304 + TfiI GAWTC 300 303 . . 300 304 + HinfI GANTC 300 303 . . 310 313 + TspEI AATT 309 313 . . 325 330 + TaqII CACCCA 341 339 . . 324 328 - HphI GGTGA 316 315 . . 336 339 + FatI CATG 335 339 . . 336 339 + NlaIII CATG 339 335 . . 336 339 + CviAII CATG 336 338 . . 342 347 + HaeII RGCGCY 346 342 . . 343 346 + Hin6I GCGC 343 345 . . 343 346 + GlaI GCGC 344 344 . . 343 346 + HhaI GCGC 345 343 . . 357 361 + MaeIII GTNAC 356 361 . . 364 368 + DdeI CTNAG 364 367 . . 372 377 + Hpy166II GTNNAC 374 374 . . 383 388 + Hpy178III* TCNNGA 384 386 . . 386 391 + XhoII RGATCY 386 390 . . 387 390 + DpnI GATC 388 388 . . 387 390 + BstKTI GATC 389 387 . . 387 390 + MboI GATC 386 390 . . 387 391 - BinI* GGATC 381 382 . . 389 393 - TspGWI ACGGA 379 377 . . 397 400 + TaiI ACGT 400 396 . . 397 400 + SetI ASST 400 396 . . 397 400 + MaeII ACGT 397 399 . . 404 407 + SetI ASST 407 403 . . 404 407 + CviJI RGCY 405 405 . . 404 407 + AluI AGCT 405 405 . . 417 421 + MboII GAAGA 429 428 . . 431 434 + CviJI RGCY 432 432 . . 428 432 - Hin4II* CCTTC 422 421 . . 439 443 + DdeI CTNAG 439 442 . . 443 446 + CviJI RGCY 444 444 . . 466 472 + AarI CACCTGC 476 480 . . 467 470 + SetI ASST 470 466 . . 467 472 + BspMI ACCTGC 476 480 . . 471 481 + MwoI GCNNNNNNNGC 477 474 . . 473 477 - TspDTI ATGAA 463 461 . . 478 483 + PvuII CAGCTG 480 480 . . 478 483 + NspBII* CMGCKG 480 480 . . 479 482 + SetI ASST 482 478 . . 479 482 + CviJI RGCY 480 480 . . 479 482 + AluI AGCT 480 480 . . 485 490 + Hpy178III* TCNNGA 486 488 . . 497 501 + BccI CCATC 505 506 . . 501 504 + FatI CATG 500 504 . . 501 504 + NlaIII CATG 504 500 . . 501 504 + CviAII CATG 501 503 . . 505 508 + MnlI CCTC 515 514 . . 510 513 + MnlI CCTC 520 519 . . 508 513 - BseRI GAGGAG 499 497 . . 515 518 + SetI ASST 518 514 . . 515 520 + BspMI ACCTGC 524 528 . . 520 525 - Eco57MI CTGRAG 505 503 . . 525 528 + Csp6I GTAC 525 527 . . 525 528 + RsaI GTAC 526 526 . . 520 525 - Eco57I CTGAAG 505 503 . . 530 533 + SetI ASST 533 529 . . 531 534 + MnlI CCTC 541 540 . . 534 544 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 540 537 . . 534 544 + PflMI CCANNNNNTGG 540 537 . . 543 547 + BmgT120I GGNCC 544 545 . . 543 547 + AsuI* GGNCC 543 546 . . 544 547 + CviJI RGCY 545 545 . . 544 547 + HaeIII GGCC 545 545 . . 548 551 + Csp6I GTAC 548 550 . . 548 551 + RsaI GTAC 549 549 . . 545 549 - BceAI ACGGC 530 532 . . 553 562 + MslI CAYNNNNRTG 557 557 . . 553 562 + OliI CACNNNNGTG 557 557 . . 555 560 + EcoP15I CAGCAG 585 587 . . 557 562 + BtsI GCAGTG 564 562 . . 558 564 + TspRI CASTGNN 564 555 . . 561 564 + CviRI* TGCA 562 562 . . 563 566 + FatI CATG 562 566 . . 563 566 + NlaIII CATG 566 562 . . 563 566 + CviAII CATG 563 565 . . 581 584 + CviJI RGCY 582 582 . . 588 599 + BstXI CCANNNNNNTGG 595 591 . . 588 592 + BccI CCATC 596 597 . . 607 611 + TspGWI ACGGA 622 620 . . 612 617 + TaqII CACCCA 628 626 . . 615 619 + BccI CCATC 623 624 . . 623 627 + TfiI GAWTC 623 626 . . 623 627 + HinfI GANTC 623 626 . . 629 634 + Hpy166II GTNNAC 631 631 . . 629 634 + BssNAI GTATAC 631 631 . . 629 634 + AccI GTMKAC 630 632 . . 626 630 - TspGWI ACGGA 616 614 . . 635 638 + SetI ASST 638 634 . . 655 660 + TatI WGTACW 655 659 . . 656 659 + Csp6I GTAC 656 658 . . 656 659 + RsaI GTAC 657 657 . . 665 668 + SetI ASST 668 664 . . 666 670 + BssKI CCNGG 665 670 . . 666 670 + BseBI CCWGG 667 668 . . 666 671 + SecI* CCNNGG 666 670 . . 666 670 + ScrFI CCNGG 667 668 . . 666 670 + EcoRII CCWGG 665 670 . . 669 673 + BmgT120I GGNCC 670 671 . . 669 673 + AsuI* GGNCC 669 672 . . 670 673 + CviJI RGCY 671 671 . . 670 673 + HaeIII GGCC 671 671 . . 680 684 + Tsp4CI* ACNGT 682 681 . . 687 690 + AciI CCGC 687 689 . . 692 697 + BciVI GTATCC 703 702 . . 696 700 + BccI CCATC 704 705 . . 705 710 - MmeI TCCRAC 686 684 . . 714 717 + MnlI CCTC 724 723 . . 716 720 + Hpy188I TCNGA 718 717 . . 717 721 + DdeI CTNAG 717 720 . . 719 724 + SduI GDGCHC 723 719 . . 719 724 + HgiAI* GWGCWC 723 719 . . 717 721 - BspCNI CTCAG 709 707 . . 717 721 - BseMII CTCAG 708 706 . . 726 730 + BccI CCATC 734 735 . . 731 734 + SetI ASST 734 730 . . 732 742 + EcoNI CCTNNNNNAGG 736 737 . . 732 742 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 738 735 . . 733 737 + DdeI CTNAG 733 736 . . 729 733 - HphI GGTGA 721 720 . . 735 739 + PleI GAGTC 743 744 . . 735 739 + MlyI GAGTC 744 744 . . 735 739 + HinfI GANTC 735 738 . . 733 737 - BspCNI CTCAG 725 723 . . 733 737 - BseMII CTCAG 724 722 . . 740 743 + SetI ASST 743 739 . . 756 760 + TfiI GAWTC 756 759 . . 756 760 + HinfI GANTC 756 759 . . 756 766 + Hin4I GAYNNNNNVTC 747 742 779 774 758 762 - TspDTI ATGAA 748 746 . . 763 766 + MnlI CCTC 773 772 . . 763 769 + Bpu10I CCTNAGC 764 767 . . 763 769 + BbvCI CCTCAGC 764 767 . . 760 764 - FokI GGATG 746 750 . . 764 768 + DdeI CTNAG 764 767 . . 764 768 + BspCNI CTCAG 777 775 . . 764 768 + BseMII CTCAG 778 776 . . 760 764 - BseGI GGATG 759 757 . . 766 771 + NspBII* CMGCKG 768 768 . . 771 775 + HinfI GANTC 771 774 . . 768 771 - AciI CCGC 768 770 . . 774 778 + Hpy188I TCNGA 776 775 . . 771 775 - PleI GAGTC 765 766 . . 771 775 - MlyI GAGTC 765 765 . . 777 787 + Hin4I GAYNNNNNVTC 768 763 800 795 777 787 - Hin4I GAYNNNNNVTC 800 795 768 763 784 788 - FokI GGATG 770 774 . . 784 788 - BseGI GGATG 783 781 . . 802 806 + Hpy188I TCNGA 804 803 . . 818 823 + Hpy166II GTNNAC 820 820 . . 818 823 + HpaI GTTAAC 820 820 . . 818 823 + HindII GTYRAC 820 820 . . 819 822 + MseI TTAA 819 821 . . 822 825 + SetI ASST 825 821 . . 823 826 + MnlI CCTC 833 832 . . 827 830 + SetI ASST 830 826 . . 825 829 - HphI GGTGA 817 816 . . 843 846 + TspEI AATT 842 846 . . 850 853 + MseI TTAA 850 852 . . 864 869 + ApoI RAATTY 864 868 . . 865 868 + TspEI AATT 864 868 . . 879 882 + TaqI TCGA 879 881 . . 881 885 + TfiI GAWTC 881 884 . . 881 885 + HinfI GANTC 881 884 . . 899 904 + MmeI TCCRAC 924 922 . . 899 903 + Hpy188I TCNGA 901 900 . . 903 907 + Tsp4CI* ACNGT 905 904 . . 906 911 + Hpy166II GTNNAC 908 908 . . 910 914 + TspGWI ACGGA 925 923 . . 920 925 + SplI* CGTACG 920 924 . . 921 924 + Csp6I GTAC 921 923 . . 921 924 + RsaI GTAC 922 922 . . 923 926 + TaiI ACGT 926 922 . . 923 926 + SetI ASST 926 922 . . 923 926 + MaeII ACGT 923 925 . . 926 930 + Hpy188I TCNGA 928 927 . . 929 932 + DpnI GATC 930 930 . . 929 932 + BstKTI GATC 931 929 . . 929 932 + MboI GATC 928 932 . . 932 938 + TspRI CASTGNN 938 929 . . 940 944 + TspDTI ATGAA 955 953 . . 948 951 + SetI ASST 951 947 . . 949 953 + Hin4II* CCTTC 959 958 . . 946 950 - HphI GGTGA 938 937 . . 971 976 + SspI AATATT 973 973 . . 982 985 + MnlI CCTC 992 991 . . 988 991 + TspEI AATT 987 991 . . 995 998 + SetI ASST 998 994 . . 999 1002 + SetI ASST 1002 998 . . 1000 1004 + BssKI CCNGG 999 1004 . . 1000 1004 + BseBI CCWGG 1001 1002 . . 1000 1005 + SecI* CCNNGG 1000 1004 . . 1000 1004 + ScrFI CCNGG 1001 1002 . . 1000 1004 + EcoRII CCWGG 999 1004 . . 1011 1021 + Hin4I GAYNNNNNVTC 1002 997 1034 1029 1013 1017 - FokI GGATG 999 1003 . . 1013 1017 - BseGI GGATG 1012 1010 . . 1011 1021 - Hin4I GAYNNNNNVTC 1034 1029 1002 997 1020 1024 - TspGWI ACGGA 1010 1008 . . 1032 1036 + TspGWI ACGGA 1047 1045 . . 1035 1040 + EcoRV GATATC 1037 1037 . . 1039 1044 + Hpy178III* TCNNGA 1040 1042 . . 1039 1044 + BspHI TCATGA 1039 1043 . . 1040 1043 + FatI CATG 1039 1043 . . 1040 1043 + NlaIII CATG 1043 1039 . . 1040 1043 + CviAII CATG 1040 1042 . . 1041 1045 + TspDTI ATGAA 1056 1054 . . 1045 1050 + ApoI RAATTY 1045 1049 . . 1046 1049 + TspEI AATT 1045 1049 . . 1072 1075 + CviRI* TGCA 1073 1073 . . 1077 1081 + Hpy188I TCNGA 1079 1078 . . 1089 1092 - MnlI CCTC 1082 1081 . . 1104 1108 + Tsp45I GTSAC 1103 1108 . . 1104 1108 + MaeIII GTNAC 1103 1108 . . 1108 1113 + SecI* CCNNGG 1108 1112 . . 1109 1113 + BssKI CCNGG 1108 1113 . . 1109 1113 + BseBI CCWGG 1110 1111 . . 1109 1113 + ScrFI CCNGG 1110 1111 . . 1109 1113 + EcoRII CCWGG 1108 1113 . . 1115 1120 + ApoI RAATTY 1115 1119 . . 1116 1119 + TspEI AATT 1115 1119 . . 1120 1123 + CviRI* TGCA 1121 1121 . . 1134 1139 + TatI WGTACW 1134 1138 . . 1135 1140 + Hpy166II GTNNAC 1137 1137 . . 1135 1138 + Csp6I GTAC 1135 1137 . . 1135 1138 + RsaI GTAC 1136 1136 . . 1138 1144 + AarI CACCTGC 1148 1152 . . 1139 1142 + SetI ASST 1142 1138 . . 1139 1144 + BspMI ACCTGC 1148 1152 . . 1141 1146 + PstI CTGCAG 1145 1141 . . 1141 1146 + SfeI* CTRYAG 1141 1145 . . 1142 1145 + CviRI* TGCA 1143 1143 . . 1147 1152 + EcoT22I ATGCAT 1151 1147 . . 1148 1151 + CviRI* TGCA 1149 1149 . . 1146 1150 - SfaNI GCATC 1136 1140 . . 1164 1168 + Tsp45I GTSAC 1163 1168 . . 1164 1168 + MaeIII GTNAC 1163 1168 . . 1177 1180 + TaqI TCGA 1177 1179 . . 1198 1203 - BsmI GAATGC 1198 1196 . . 1201 1205 - TspDTI ATGAA 1191 1189 . . 1216 1219 + SetI ASST 1219 1215 . . 1221 1226 + NspI RCATGY 1225 1221 . . 1221 1226 + Cac8I GCNNGC 1223 1223 . . 1221 1226 + SphI GCATGC 1225 1221 . . 1222 1225 + FatI CATG 1221 1225 . . 1222 1225 + NlaIII CATG 1225 1221 . . 1222 1225 + CviAII CATG 1222 1224 . . 1228 1231 + TspEI AATT 1227 1231 . . 1229 1234 + VspI ATTAAT 1230 1232 . . 1230 1233 + MseI TTAA 1230 1232 . . 1232 1235 + TspEI AATT 1231 1235 . . 1241 1244 + SetI ASST 1244 1240 . . 1240 1243 - MnlI CCTC 1233 1232 . . 1260 1265 + ApoI RAATTY 1260 1264 . . 1261 1264 + TspEI AATT 1260 1264 . . 1275 1280 + AflIII ACRYGT 1275 1279 . . 1276 1281 + BtrI CACGTC 1278 1278 . . 1277 1280 + TaiI ACGT 1280 1276 . . 1277 1280 + SetI ASST 1280 1276 . . 1277 1280 + MaeII ACGT 1277 1279 . . 1283 1286 + TaqI TCGA 1283 1285 . . 1299 1303 + Tsp4CI* ACNGT 1301 1300 . . 1300 1308 + AlwNI CAGNNNCTG 1305 1302 . . 1310 1314 + Tsp4CI* ACNGT 1312 1311 . . 1316 1320 + DdeI CTNAG 1316 1319 . . 1320 1325 + EcoRV GATATC 1322 1322 . . 1326 1329 + FatI CATG 1325 1329 . . 1326 1329 + NlaIII CATG 1329 1325 . . 1326 1329 + CviAII CATG 1326 1328 . . 1336 1340 + TspDTI ATGAA 1351 1349 . . 1338 1342 + MboII GAAGA 1350 1349 . . 1350 1354 + BinI* GGATC 1358 1359 . . 1351 1354 + DpnI GATC 1352 1352 . . 1351 1354 + BstKTI GATC 1353 1351 . . 1351 1354 + MboI GATC 1350 1354 . . 1353 1356 + TaqI TCGA 1353 1355 . . 1353 1358 + Hpy178III* TCNNGA 1354 1356 . . 1367 1370 + SetI ASST 1370 1366 . . 1371 1374 + TspEI AATT 1370 1374 . . 1385 1389 + Hpy188I TCNGA 1387 1386 . . 1386 1390 + DdeI CTNAG 1386 1389 . . 1386 1390 - BspCNI CTCAG 1378 1376 . . 1386 1390 - BseMII CTCAG 1377 1375 . . 1397 1401 + MboII GAAGA 1409 1408 . . 1404 1408 + TfiI GAWTC 1404 1407 . . 1404 1408 + HinfI GANTC 1404 1407 . . 1411 1415 + BlsI GCNGC 1413 1412 . . 1411 1415 + BisI GCNGC 1412 1413 . . 1411 1415 + BbvI GCAGC 1423 1427 . . 1411 1415 + TseI GCWGC 1411 1414 . . 1413 1416 + SetI ASST 1416 1412 . . 1413 1416 + CviJI RGCY 1414 1414 . . 1413 1416 + AluI AGCT 1414 1414 . . 1445 1448 + SetI ASST 1448 1444 . . 1445 1448 + CviJI RGCY 1446 1446 . . 1445 1448 + AluI AGCT 1446 1446 . . 1448 1452 + Hpy188I TCNGA 1450 1449 . . 1451 1455 + TfiI GAWTC 1451 1454 . . 1451 1455 + HinfI GANTC 1451 1454 . . 1455 1458 + MnlI CCTC 1465 1464 . . 1470 1473 + TspEI AATT 1469 1473 . . 1472 1477 + AsuII TTCGAA 1473 1475 . . 1473 1476 + TaqI TCGA 1473 1475 . . 1479 1482 + TaqI TCGA 1479 1481 . . 1487 1490 + CviJI RGCY 1488 1488 . . 1489 1493 + BssKI CCNGG 1488 1493 . . 1489 1493 + BseBI CCWGG 1490 1491 . . 1489 1494 + SecI* CCNNGG 1489 1493 . . 1489 1493 + ScrFI CCNGG 1490 1491 . . 1489 1493 + EcoRII CCWGG 1488 1493 . . 1492 1497 + SduI GDGCHC 1496 1492 . . 1492 1497 + HgiJII* GRGCYC 1496 1492 . . 1493 1496 + CviJI RGCY 1494 1494 . . 1497 1508 + TstI CACNNNNNNTCC 1488 1483 1520 1515 1503 1508 + BciVI GTATCC 1514 1513 . . 1524 1529 + GsaI CCCAGC 1528 1524 . . 1524 1529 + BseYI CCCAGC 1524 1528 . . 1530 1534 + TspGWI ACGGA 1545 1543 . . 1539 1543 + TfiI GAWTC 1539 1542 . . 1539 1543 + HinfI GANTC 1539 1542 . . 1543 1547 + BccI CCATC 1551 1552 . . 1562 1573 + BdaI TGANNNNNNTCA 1551 1549 1585 1583 1563 1572 + XmnI GAANNNNTTC 1567 1567 . . 1568 1572 + TfiI GAWTC 1568 1571 . . 1568 1572 + HinfI GANTC 1568 1571 . . 1572 1577 + MfeI CAATTG 1572 1576 . . 1573 1576 + TspEI AATT 1572 1576 . . 1562 1573 - BdaI TGANNNNNNTCA 1585 1583 1551 1549 1591 1594 + SetI ASST 1594 1590 . . 1592 1596 + Hin4II* CCTTC 1602 1601 . . 1597 1600 + SetI ASST 1600 1596 . . 1598 1604 + SauI* CCTNAGG 1599 1602 . . 1599 1603 + DdeI CTNAG 1599 1602 . . 1595 1599 - HphI GGTGA 1587 1586 . . 1603 1606 + CviJI RGCY 1604 1604 . . 1603 1606 + HaeIII GGCC 1604 1604 . . 1605 1609 + BssKI CCNGG 1604 1609 . . 1605 1609 + BseBI CCWGG 1606 1607 . . 1605 1609 + ScrFI CCNGG 1606 1607 . . 1605 1609 + EcoRII CCWGG 1604 1609 . . 1618 1622 + TfiI GAWTC 1618 1621 . . 1618 1622 + HinfI GANTC 1618 1621 . . 1624 1628 + Tsp4CI* ACNGT 1626 1625 . . 1642 1651 + MslI CAYNNNNRTG 1646 1646 . . 1645 1649 + Hpy188I TCNGA 1647 1646 . . 1652 1656 + TspDTI ATGAA 1667 1665 . . 1659 1664 + SecI* CCNNGG 1659 1663 . . 1660 1664 + BssKI CCNGG 1659 1664 . . 1660 1664 + BseBI CCWGG 1661 1662 . . 1660 1664 + ScrFI CCNGG 1661 1662 . . 1660 1664 + EcoRII CCWGG 1659 1664 . . 1667 1670 + SetI ASST 1670 1666 . . 1668 1671 + MnlI CCTC 1678 1677 . . 1671 1675 + Hin4II* CCTTC 1681 1680 . . 1674 1679 + Hpy178III* TCNNGA 1675 1677 . . 1676 1679 + TaqI TCGA 1676 1678 . . 1678 1682 + TfiI GAWTC 1678 1681 . . 1678 1682 + HinfI GANTC 1678 1681 . . 1681 1686 + Hpy178III* TCNNGA 1682 1684 . . 1687 1691 + SfaNI GCATC 1696 1700 . . 1690 1695 + Hpy178III* TCNNGA 1691 1693 . . 1700 1705 + PsiI TTATAA 1702 1702 . . 1705 1710 + XhoII RGATCY 1705 1709 . . 1705 1710 + BglII AGATCT 1705 1709 . . 1706 1709 + DpnI GATC 1707 1707 . . 1706 1709 + BstKTI GATC 1708 1706 . . 1706 1709 + MboI GATC 1705 1709 . . 1725 1729 + DdeI CTNAG 1725 1728 . . 1725 1729 + BspCNI CTCAG 1738 1736 . . 1725 1729 + BseMII CTCAG 1739 1737 . . 1729 1733 + SfaNI GCATC 1738 1742 . . 1740 1745 + Hpy178III* TCNNGA 1741 1743 . . 1751 1754 + TaiI ACGT 1754 1750 . . 1751 1754 + SetI ASST 1754 1750 . . 1751 1754 + MaeII ACGT 1751 1753 . . 1759 1763 - SfaNI GCATC 1749 1753 . . 1782 1785 + TspEI AATT 1781 1785 . . 1784 1787 + MseI TTAA 1784 1786 . . 1795 1801 + BstEII GGTNACC 1795 1800 . . 1795 1799 + HphI GGTGA 1807 1806 . . 1796 1800 + Tsp45I GTSAC 1795 1800 . . 1796 1800 + MaeIII GTNAC 1795 1800 . . 1799 1802 + SetI ASST 1802 1798 . . 1805 1808 + TspEI AATT 1804 1808 . . 1814 1820 + PfoI TCCNGGA 1814 1819 . . 1815 1819 + BssKI CCNGG 1814 1819 . . 1815 1819 + BseBI CCWGG 1816 1817 . . 1815 1819 + ScrFI CCNGG 1816 1817 . . 1815 1819 + EcoRII CCWGG 1814 1819 . . 1841 1844 + SetI ASST 1844 1840 . . 1847 1850 + CviRI* TGCA 1848 1848 . . 1863 1866 + CviJI RGCY 1864 1864 . . 1876 1880 + DdeI CTNAG 1876 1879 . . 1876 1880 + BspCNI CTCAG 1889 1887 . . 1876 1880 + BseMII CTCAG 1890 1888 . . 1886 1890 + TspDTI ATGAA 1901 1899 . . 1889 1892 + TspEI AATT 1888 1892 . . 1893 1896 + CviJI RGCY 1894 1894 . . 1894 1898 + BlsI GCNGC 1896 1895 . . 1894 1898 + BisI GCNGC 1895 1896 . . 1894 1898 + TseI GCWGC 1894 1897 . . 1895 1900 + PstI CTGCAG 1899 1895 . . 1895 1900 + SfeI* CTRYAG 1895 1899 . . 1896 1899 + CviRI* TGCA 1897 1897 . . 1894 1898 - BbvI GCAGC 1881 1885 . . 1903 1908 + EcoRV GATATC 1905 1905 . . 1912 1917 + NspI RCATGY 1916 1912 . . 1912 1917 + Cac8I GCNNGC 1914 1914 . . 1912 1917 + SphI GCATGC 1916 1912 . . 1913 1916 + FatI CATG 1912 1916 . . 1913 1916 + NlaIII CATG 1916 1912 . . 1913 1916 + CviAII CATG 1913 1915 . . 1928 1931 + TaiI ACGT 1931 1927 . . 1928 1931 + SetI ASST 1931 1927 . . 1928 1931 + MaeII ACGT 1928 1930 . . 1932 1936 + DdeI CTNAG 1932 1935 . . 1940 1943 + DpnI GATC 1941 1941 . . 1940 1943 + BstKTI GATC 1942 1940 . . 1940 1943 + MboI GATC 1939 1943 . . 1942 1946 + Hpy188I TCNGA 1944 1943 . . 1946 1950 + BceAI ACGGC 1962 1964 . . 1950 1956 + TspRI CASTGNN 1956 1947 . . 1951 1955 + Tsp4CI* ACNGT 1953 1952 . . 1953 1958 + TatI WGTACW 1953 1957 . . 1954 1957 + Csp6I GTAC 1954 1956 . . 1954 1957 + RsaI GTAC 1955 1955 . . 1959 1962 + CviRI* TGCA 1960 1960 . . 1962 1965 + SetI ASST 1965 1961 . . 1979 1983 - BsmAI GTCTC 1973 1977 . . 1988 1992 + BsrI ACTGG 1993 1991 . . 1988 1993 + BfiI ACTGGG 1998 1997 . . 2003 2008 + TatI WGTACW 2003 2007 . . 2003 2008 + ScaI AGTACT 2005 2005 . . 2004 2007 + Csp6I GTAC 2004 2006 . . 2004 2007 + RsaI GTAC 2005 2005 . . 2014 2018 + BccI CCATC 2022 2023 . . 2029 2032 + Csp6I GTAC 2029 2031 . . 2029 2032 + RsaI GTAC 2030 2030 . . 2026 2030 - TspGWI ACGGA 2016 2014 . . 2036 2040 + BccI CCATC 2044 2045 . . 2050 2059 + MslI CAYNNNNRTG 2054 2054 . . 2062 2067 + TatI WGTACW 2062 2066 . . 2063 2068 + Hpy166II GTNNAC 2065 2065 . . 2063 2066 + Csp6I GTAC 2063 2065 . . 2063 2066 + RsaI GTAC 2064 2064 . . 2086 2090 - TspDTI ATGAA 2076 2074 . . 2090 2094 - TspDTI ATGAA 2080 2078 . . 2094 2097 + TaqI TCGA 2094 2096 . . 2096 2101 + BsmI GAATGC 2102 2100 . . 2100 2105 + Cac8I GCNNGC 2102 2102 . . 2103 2108 + MstI* TGCGCA 2105 2105 . . 2104 2107 + Hin6I GCGC 2104 2106 . . 2104 2107 + GlaI GCGC 2105 2105 . . 2104 2107 + HhaI GCGC 2106 2104 . . 2106 2111 + NspI RCATGY 2110 2106 . . 2106 2111 + Cac8I GCNNGC 2108 2108 . . 2106 2111 + SphI GCATGC 2110 2106 . . 2106 2117 + AlfI GCANNNNNNTGC 2095 2093 2129 2127 2107 2116 + MslI CAYNNNNRTG 2111 2111 . . 2107 2110 + FatI CATG 2106 2110 . . 2107 2110 + NlaIII CATG 2110 2106 . . 2107 2110 + CviAII CATG 2107 2109 . . 2115 2118 + CviRI* TGCA 2116 2116 . . 2106 2117 - AlfI GCANNNNNNTGC 2129 2127 2095 2093 2124 2127 + TspEI AATT 2123 2127 . . 2127 2130 + TaqI TCGA 2127 2129 . . 2138 2141 + MseI TTAA 2138 2140 . . 2150 2154 + BccI CCATC 2158 2159 . . 2154 2159 + BsaAI YACGTR 2156 2156 . . 2155 2158 + TaiI ACGT 2158 2154 . . 2155 2158 + SetI ASST 2158 2154 . . 2155 2158 + MaeII ACGT 2155 2157 . . 2162 2165 + MseI TTAA 2162 2164 . . 2167 2171 + TfiI GAWTC 2167 2170 . . 2167 2171 + HinfI GANTC 2167 2170 . . 2170 2174 + Hpy188I TCNGA 2172 2171 . . 2176 2181 + SalI GTCGAC 2176 2180 . . 2176 2181 + Hpy166II GTNNAC 2178 2178 . . 2176 2181 + HindII GTYRAC 2178 2178 . . 2176 2181 + AccI GTMKAC 2177 2179 . . 2177 2180 + TaqI TCGA 2177 2179 . . 2180 2184 + BsrI ACTGG 2185 2183 . . 2186 2189 + MaeI CTAG 2186 2188 . . 2208 2213 + Hpy178III* TCNNGA 2209 2211 . . 2218 2221 + MseI TTAA 2218 2220 . . 2253 2256 + SetI ASST 2256 2252 . . 2255 2260 + Hpy166II GTNNAC 2257 2257 . . 2257 2262 + Hpy178III* TCNNGA 2258 2260 . . 2274 2279 + ApoI RAATTY 2274 2278 . . 2275 2278 + TspEI AATT 2274 2278 . . 2277 2281 - TspDTI ATGAA 2267 2265 . . 2284 2293 + XmnI GAANNNNTTC 2288 2288 . . 2297 2300 + SetI ASST 2300 2296 . . 2317 2321 + BmgT120I GGNCC 2318 2319 . . 2317 2321 + AvaII GGWCC 2317 2320 . . 2317 2321 + AsuI* GGNCC 2317 2320 . . 2323 2328 + Hpy166II GTNNAC 2325 2325 . . 2320 2324 - BsrI ACTGG 2320 2318 . . 2330 2333 + SetI ASST 2333 2329 . . 2342 2347 + Hpy166II GTNNAC 2344 2344 . . 2342 2347 + SduI GDGCHC 2346 2342 . . 2342 2347 + BseSI GKGCMC 2346 2342 . . 2342 2347 + ApaLI GTGCAC 2342 2346 . . 2342 2347 + HgiAI* GWGCWC 2346 2342 . . 2343 2346 + CviRI* TGCA 2344 2344 . . 2347 2351 + BccI CCATC 2355 2356 . . 2348 2352 - FokI GGATG 2334 2338 . . 2348 2352 - BseGI GGATG 2347 2345 . . 2356 2360 - TspDTI ATGAA 2346 2344 . . 2374 2378 - BsmAI GTCTC 2368 2372 . . 2383 2388 + ApoI RAATTY 2383 2387 . . 2384 2387 + TspEI AATT 2383 2387 . . 2387 2391 - TspGWI ACGGA 2377 2375 . . 2409 2414 + McrI* CGRYCG 2412 2410 . . 2411 2415 + Tsp4CI* ACNGT 2413 2412 . . 2412 2422 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2418 2415 . . 2413 2417 + Hpy99I CGWCG 2417 2412 . . 2415 2420 + Hpy178III* TCNNGA 2416 2418 . . 2415 2420 + NruI TCGCGA 2417 2417 . . 2416 2419 + FnuDII* CGCG 2417 2417 . . 2419 2422 - MnlI CCTC 2412 2411 . . 2422 2426 + HinfI GANTC 2422 2425 . . 2422 2426 - PleI GAGTC 2416 2417 . . 2422 2426 - MlyI GAGTC 2416 2416 . . 2430 2433 + MnlI CCTC 2440 2439 . . 2432 2435 + TaqI TCGA 2432 2434 . . 2452 2455 + MaeI CTAG 2452 2454 . . 2454 2457 + SetI ASST 2457 2453 . . 2454 2457 + CviJI RGCY 2455 2455 . . 2454 2457 + AluI AGCT 2455 2455 . . 2462 2465 + MseI TTAA 2462 2464 . . 2469 2479 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2475 2472 . . 2469 2473 - BsrI ACTGG 2469 2467 . . 2478 2481 + CviJI RGCY 2479 2479 . . 2478 2481 + HaeIII GGCC 2479 2479 . . 2480 2491 + BstXI CCANNNNNNTGG 2487 2483 . . 2481 2487 + TspRI CASTGNN 2487 2478 . . 2480 2484 - BsrI ACTGG 2480 2478 . . 2489 2494 - TsoI TARCCA 2479 2477 . . 2502 2506 + BmgT120I GGNCC 2503 2504 . . 2502 2506 + AvaII GGWCC 2502 2505 . . 2502 2506 + AsuI* GGNCC 2502 2505 . . 2504 2508 + Tsp4CI* ACNGT 2506 2505 . . 2505 2510 + DsaI* CCRYGG 2505 2509 . . 2505 2510 + SecI* CCNNGG 2505 2509 . . 2512 2516 + Hpy188I TCNGA 2514 2513 . . 2513 2517 + DdeI CTNAG 2513 2516 . . 2517 2522 + Hpy166II GTNNAC 2519 2519 . . 2517 2522 + BssNAI GTATAC 2519 2519 . . 2513 2517 - BspCNI CTCAG 2505 2503 . . 2513 2517 - BseMII CTCAG 2504 2502 . . 2517 2522 + AccI GTMKAC 2518 2520 . . 2539 2544 + ApoI RAATTY 2539 2543 . . 2540 2543 + TspEI AATT 2539 2543 . . 2567 2570 + FatI CATG 2566 2570 . . 2567 2570 + NlaIII CATG 2570 2566 . . 2567 2570 + CviAII CATG 2567 2569 . . 2582 2587 + NspBII* CMGCKG 2584 2584 . . 2587 2591 + TfiI GAWTC 2587 2590 . . 2587 2591 + HinfI GANTC 2587 2590 . . 2584 2587 - AciI CCGC 2584 2586 . . 2590 2595 + Hpy178III* TCNNGA 2591 2593 . . 2591 2596 + BmeT110I CYCGRG 2592 2594 . . 2591 2596 + AvaI CYCGRG 2591 2595 . . 2594 2599 + SduI GDGCHC 2598 2594 . . 2594 2599 + HgiAI* GWGCWC 2598 2594 . . 2599 2602 + FatI CATG 2598 2602 . . 2599 2602 + NlaIII CATG 2602 2598 . . 2599 2602 + CviAII CATG 2599 2601 . . 2603 2607 + PleI GAGTC 2611 2612 . . 2603 2607 + MlyI GAGTC 2612 2612 . . 2603 2607 + HinfI GANTC 2603 2606 . . 2613 2617 + BceAI ACGGC 2629 2631 . . 2615 2618 + CviJI RGCY 2616 2616 . . 2621 2625 + Tsp4CI* ACNGT 2623 2622 . . 2624 2627 + Csp6I GTAC 2624 2626 . . 2624 2627 + RsaI GTAC 2625 2625 . . 2626 2629 + SetI ASST 2629 2625 . . 2645 2648 + Csp6I GTAC 2645 2647 . . 2645 2648 + RsaI GTAC 2646 2646 . . 2642 2646 - BceAI ACGGC 2627 2629 . . 2654 2657 + CviRI* TGCA 2655 2655 . . 2655 2660 + BsrDI GCAATG 2662 2660 . . 2666 2671 + Hpy166II GTNNAC 2668 2668 . . 2691 2694 + CviRI* TGCA 2692 2692 . . 2696 2699 + TaqI TCGA 2696 2698 . . 2698 2703 + ApoI RAATTY 2698 2702 . . 2699 2702 + TspEI AATT 2698 2702 . . 2718 2723 + ApoI RAATTY 2718 2722 . . 2719 2722 + TspEI AATT 2718 2722 . . 2725 2728 + MaeI CTAG 2725 2727 . . 2727 2730 + SetI ASST 2730 2726 . . 2727 2730 + CviJI RGCY 2728 2728 . . 2727 2730 + AluI AGCT 2728 2728 . . 2733 2736 + SetI ASST 2736 2732 . . 2731 2735 - HphI GGTGA 2723 2722 . . 2751 2754 + CviRI* TGCA 2752 2752 . . 2760 2765 + NspI RCATGY 2764 2760 . . 2761 2764 + FatI CATG 2760 2764 . . 2761 2764 + NlaIII CATG 2764 2760 . . 2761 2764 + CviAII CATG 2761 2763 . . 2764 2774 + MwoI GCNNNNNNNGC 2770 2767 . . 2764 2769 + Cac8I GCNNGC 2766 2766 . . 2767 2770 + CviJI RGCY 2768 2768 . . 2777 2787 + Hin4I GAYNNNNNVTC 2768 2763 2800 2795 2782 2787 + EcoRV GATATC 2784 2784 . . 2777 2787 - Hin4I GAYNNNNNVTC 2800 2795 2768 2763 2788 2793 + TatI WGTACW 2788 2792 . . 2788 2793 + ScaI AGTACT 2790 2790 . . 2789 2792 + Csp6I GTAC 2789 2791 . . 2789 2792 + RsaI GTAC 2790 2790 . . 2796 2800 + MaeIII GTNAC 2795 2800 . . 2799 2802 + SetI ASST 2802 2798 . . 2807 2812 + Hpy166II GTNNAC 2809 2809 . . 2807 2812 + HindII GTYRAC 2809 2809 . . 2804 2809 - TaqII GACCGA 2794 2792 . . 2811 2814 + SetI ASST 2814 2810 . . 2826 2831 + BclI TGATCA 2826 2830 . . 2827 2830 + DpnI GATC 2828 2828 . . 2827 2830 + BstKTI GATC 2829 2827 . . 2827 2830 + MboI GATC 2826 2830 . . 2834 2844 + BsaXI ACNNNNNCTCC 2824 2821 2854 2851 2851 2860 + MslI CAYNNNNRTG 2855 2855 . . 2854 2857 + MnlI CCTC 2864 2863 . . 2851 2855 - FokI GGATG 2837 2841 . . 2851 2855 - BseGI GGATG 2850 2848 . . 2855 2860 - BsiI* CACGAG 2855 2859 . . 2861 2865 + SfaNI GCATC 2870 2874 . . 2861 2871 + MwoI GCNNNNNNNGC 2867 2864 . . 2865 2870 + SecI* CCNNGG 2865 2869 . . 2862 2866 - FokI GGATG 2848 2852 . . 2866 2870 + BssKI CCNGG 2865 2870 . . 2862 2866 - BseGI GGATG 2861 2859 . . 2866 2870 + BseBI CCWGG 2867 2868 . . 2866 2870 + ScrFI CCNGG 2867 2868 . . 2866 2870 + EcoRII CCWGG 2865 2870 . . 2869 2872 + CviJI RGCY 2870 2870 . . 2881 2885 - FokI GGATG 2867 2871 . . 2885 2890 + Esp3I CGTCTC 2891 2895 . . 2881 2885 - BseGI GGATG 2880 2878 . . 2886 2890 + BsmAI GTCTC 2891 2895 . . 2883 2887 - TspGWI ACGGA 2873 2871 . . 2887 2892 + Hpy178III* TCNNGA 2888 2890 . . 2889 2892 + TaqI TCGA 2889 2891 . . 2903 2913 + Hin4I GAYNNNNNVTC 2894 2889 2926 2921 2903 2913 - Hin4I GAYNNNNNVTC 2926 2921 2894 2889 2916 2920 - MboII GAAGA 2908 2907 . . 2920 2924 + BccI CCATC 2928 2929 . . 2921 2925 - FokI GGATG 2907 2911 . . 2921 2925 - BseGI GGATG 2920 2918 . . 2926 2929 + MseI TTAA 2926 2928 . . 2931 2935 + MboII GAAGA 2943 2942 . . 2931 2936 + BbvII* GAAGAC 2938 2942 . . 2935 2939 + Tsp4CI* ACNGT 2937 2936 . . 2961 2965 - MboII GAAGA 2953 2952 . . 2962 2967 - Eco57MI CTGRAG 2947 2945 . . 2962 2967 - Eco57I CTGAAG 2947 2945 . . 2974 2978 + TfiI GAWTC 2974 2977 . . 2974 2978 + HinfI GANTC 2974 2977 . . 2977 2982 + Hpy178III* TCNNGA 2978 2980 . . 2986 2989 + DpnI GATC 2987 2987 . . 2986 2989 + BstKTI GATC 2988 2986 . . 2986 2989 + MboI GATC 2985 2989 . . 2990 2993 + TspEI AATT 2989 2993 . . 2995 2998 + TspEI AATT 2994 2998 . . 3000 3004 + Hpy99I CGWCG 3004 2999 . . 3001 3005 + HgaI GACGC 3010 3015 . . 3014 3017 + TaqI TCGA 3014 3016 . . 3017 3021 + TspDTI ATGAA 3032 3030 . . 3019 3023 + MboII GAAGA 3031 3030 . . 3019 3024 + BbvII* GAAGAC 3026 3030 . . 3025 3028 + MseI TTAA 3025 3027 . . 3029 3033 + Tsp4CI* ACNGT 3031 3030 . . 3034 3037 + MseI TTAA 3034 3036 . . 3055 3059 - TspDTI ATGAA 3045 3043 . . 3057 3062 - BsrDI GCAATG 3056 3054 . . 3061 3065 - HgaI GACGC 3050 3055 . . 3071 3076 + XhoII RGATCY 3071 3075 . . 3072 3075 + DpnI GATC 3073 3073 . . 3072 3075 + BstKTI GATC 3074 3072 . . 3072 3075 + MboI GATC 3071 3075 . . 3072 3076 - BinI* GGATC 3066 3067 . . 3079 3083 + TfiI GAWTC 3079 3082 . . 3079 3083 + HinfI GANTC 3079 3082 . . 3088 3091 + DpnI GATC 3089 3089 . . 3088 3091 + BstKTI GATC 3090 3088 . . 3088 3091 + MboI GATC 3087 3091 . . 3092 3095 + MseI TTAA 3092 3094 . . 3100 3104 + TfiI GAWTC 3100 3103 . . 3100 3104 + HinfI GANTC 3100 3103 . . 3103 3107 + Hpy188I TCNGA 3105 3104 . . 3109 3112 + FatI CATG 3108 3112 . . 3109 3112 + NlaIII CATG 3112 3108 . . 3109 3112 + CviAII CATG 3109 3111 . . 3112 3122 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3103 3098 3135 3130 3121 3126 + MmeI TCCRAC 3146 3144 . . 3121 3125 + Hpy188I TCNGA 3123 3122 . . 3112 3122 - Hin4I GAYNNNNNVTC 3135 3130 3103 3098 3138 3143 + Hpy178III* TCNNGA 3139 3141 . . 3139 3145 + Bpu10I CCTNAGC 3140 3143 . . 3136 3140 - FokI GGATG 3122 3126 . . 3140 3144 + DdeI CTNAG 3140 3143 . . 3136 3140 - BseGI GGATG 3135 3133 . . 3140 3144 - BspCNI CTCAG 3132 3130 . . 3140 3144 - BseMII CTCAG 3131 3129 . . 3168 3171 + SetI ASST 3171 3167 . . 3168 3171 + CviJI RGCY 3169 3169 . . 3168 3171 + AluI AGCT 3169 3169 . . 3174 3178 + PleI GAGTC 3182 3183 . . 3174 3178 + MlyI GAGTC 3183 3183 . . 3174 3178 + HinfI GANTC 3174 3177 . . 3177 3182 + MmeI TCCRAC 3202 3200 . . 3184 3188 + TfiI GAWTC 3184 3187 . . 3184 3188 + HinfI GANTC 3184 3187 . . 3192 3195 + SetI ASST 3195 3191 . . 3193 3196 + MnlI CCTC 3203 3202 . . 3198 3203 + Hpy166II GTNNAC 3200 3200 . . 3198 3203 + HindII GTYRAC 3200 3200 . . 3195 3199 - TspGWI ACGGA 3185 3183 . . 3209 3214 + Eco57MI CTGRAG 3230 3228 . . 3209 3214 + Eco57I CTGAAG 3230 3228 . . 3211 3215 + MboII GAAGA 3223 3222 . . 3214 3218 + TfiI GAWTC 3214 3217 . . 3214 3218 + HinfI GANTC 3214 3217 . . 3216 3221 + AsuII TTCGAA 3217 3219 . . 3217 3220 + TaqI TCGA 3217 3219 . . 3222 3225 + TaiI ACGT 3225 3221 . . 3222 3225 + SetI ASST 3225 3221 . . 3222 3225 + MaeII ACGT 3222 3224 . . 3222 3227 + AflIII ACRYGT 3222 3226 . . 3238 3243 + SspI AATATT 3240 3240 . . 3244 3247 + FnuDII* CGCG 3245 3245 . . 3245 3248 + Hin6I GCGC 3245 3247 . . 3245 3248 + GlaI GCGC 3246 3246 . . 3245 3248 + HhaI GCGC 3247 3245 . . 3248 3253 + TaqII CACCCA 3264 3262 . . 3259 3264 + Hpy166II GTNNAC 3261 3261 . . 3259 3264 + HindII GTYRAC 3261 3261 . . 3274 3278 + Hpy188I TCNGA 3276 3275 . . 3277 3281 + TfiI GAWTC 3277 3280 . . 3277 3281 + HinfI GANTC 3277 3280 . . 3283 3288 + SspI AATATT 3285 3285 . . 3288 3292 - MboII GAAGA 3280 3279 . . 3292 3296 + BccI CCATC 3300 3301 . . 3300 3304 + MboII GAAGA 3312 3311 . . 3304 3309 + XhoII RGATCY 3304 3308 . . 3304 3309 + BglII AGATCT 3304 3308 . . 3305 3308 + DpnI GATC 3306 3306 . . 3305 3308 + BstKTI GATC 3307 3305 . . 3300 3305 - Ksp632I* CTCTTC 3295 3298 . . 3305 3308 + MboI GATC 3304 3308 . . 3308 3311 + MaeI CTAG 3308 3310 . . 3320 3325 + ApoI RAATTY 3320 3324 . . 3321 3324 + TspEI AATT 3320 3324 . . 3332 3335 + TaqI TCGA 3332 3334 . . 3332 3337 + Hpy178III* TCNNGA 3333 3335 . . 3338 3341 + Csp6I GTAC 3338 3340 . . 3338 3341 + RsaI GTAC 3339 3339 . . 3340 3345 + Cfr10I RCCGGY 3340 3344 . . 3340 3345 + BetI* WCCGGW 3340 3344 . . 3340 3345 + AgeI ACCGGT 3340 3344 . . 3341 3344 + HpaII CCGG 3341 3343 . . 3336 3347 - PpiI GAACNNNNNCTC 3359 3354 3327 3322 3355 3360 + EcoT22I ATGCAT 3359 3355 . . 3356 3359 + CviRI* TGCA 3357 3357 . . 3362 3365 + TspEI AATT 3361 3365 . . 3364 3367 + MseI TTAA 3364 3366 . . 3387 3390 + FatI CATG 3386 3390 . . 3387 3390 + NlaIII CATG 3390 3386 . . 3387 3390 + CviAII CATG 3387 3389 . . 3390 3394 - BslFI GGGAC 3375 3379 . . 3406 3409 + FatI CATG 3405 3409 . . 3406 3409 + NlaIII CATG 3409 3405 . . 3406 3409 + CviAII CATG 3406 3408 . . 3409 3413 + PleI GAGTC 3417 3418 . . 3409 3413 + MlyI GAGTC 3418 3418 . . 3409 3413 + HinfI GANTC 3409 3412 . . 3413 3417 + Hpy99I CGWCG 3417 3412 . . 3417 3422 + Cac8I GCNNGC 3419 3419 . . 3422 3426 - BsrI ACTGG 3422 3420 . . 3440 3444 + Hpy188I TCNGA 3442 3441 . . 3447 3451 + DdeI CTNAG 3447 3450 . . 3447 3451 + BspCNI CTCAG 3460 3458 . . 3447 3451 + BseMII CTCAG 3461 3459 . . 3448 3452 + Hpy188I TCNGA 3450 3449 . . 3451 3455 + HinfI GANTC 3451 3454 . . 3451 3455 - PleI GAGTC 3445 3446 . . 3451 3455 - MlyI GAGTC 3445 3445 . . 3456 3459 + Csp6I GTAC 3456 3458 . . 3456 3459 + RsaI GTAC 3457 3457 . . 3458 3462 + Tsp4CI* ACNGT 3460 3459 . . 3459 3465 + TspRI CASTGNN 3465 3456 . . 3468 3479 + BdaI TGANNNNNNTCA 3457 3455 3491 3489 3469 3473 - BsmAI GTCTC 3463 3467 . . 3468 3479 - BdaI TGANNNNNNTCA 3491 3489 3457 3455 3481 3491 + BaeI ACNNNNGTAYC 3470 3465 3503 3498 3485 3488 + TaiI ACGT 3488 3484 . . 3485 3488 + SetI ASST 3488 3484 . . 3485 3488 + MaeII ACGT 3485 3487 . . 3487 3490 + Csp6I GTAC 3487 3489 . . 3487 3490 + RsaI GTAC 3488 3488 . . 3500 3503 + Csp6I GTAC 3500 3502 . . 3500 3503 + RsaI GTAC 3501 3501 . . 3497 3501 - BsrI ACTGG 3497 3495 . . 3508 3513 + KpnI GGTACC 3512 3508 . . 3508 3513 + NlaIV GGNNCC 3510 3510 . . 3508 3513 + HgiCI* GGYRCC 3508 3512 . . 3508 3513 + Acc65I GGTACC 3508 3512 . . 3509 3512 + Csp6I GTAC 3509 3511 . . 3509 3512 + RsaI GTAC 3510 3510 . . 3523 3527 + Tsp4CI* ACNGT 3525 3524 . . 3529 3532 + AciI CCGC 3529 3531 . . 3539 3543 + Tsp45I GTSAC 3538 3543 . . 3539 3543 + MaeIII GTNAC 3538 3543 . . 3551 3555 + DdeI CTNAG 3551 3554 . . 3547 3551 - BsmAI GTCTC 3541 3545 . . 3551 3555 - BspCNI CTCAG 3543 3541 . . 3551 3555 - BseMII CTCAG 3542 3540 . . 3569 3573 + Tsp4CI* ACNGT 3571 3570 . . 3572 3577 + Hpy166II GTNNAC 3574 3574 . . 3576 3579 + SetI ASST 3579 3575 . . 3577 3581 + Hin4II* CCTTC 3587 3586 . . 3574 3578 - HphI GGTGA 3566 3565 . . 3583 3588 + ClaI ATCGAT 3584 3586 . . 3584 3587 + TaqI TCGA 3584 3586 . . 3586 3590 - SfaNI GCATC 3576 3580 . . 3597 3602 + BetI* WCCGGW 3597 3601 . . 3598 3601 + HpaII CCGG 3598 3600 . . 3607 3610 + TspEI AATT 3606 3610 . . 3609 3613 - TspDTI ATGAA 3599 3597 . . 3611 3616 - BtgZI GCGATG 3596 3600 . . 3619 3624 + SspI AATATT 3621 3621 . . 3646 3650 + Tsp4CI* ACNGT 3648 3647 . . 3652 3656 + Hpy188I TCNGA 3654 3653 . . 3640 3653 - AjuI GAANNNNNNNTTGG 3665 3660 3633 3628 3665 3670 + SecI* CCNNGG 3665 3669 . . 3670 3674 + TfiI GAWTC 3670 3673 . . 3667 3670 - MnlI CCTC 3660 3659 . . 3670 3674 + HinfI GANTC 3670 3673 . . 3678 3683 - BtgZI GCGATG 3663 3667 . . 3685 3688 + DpnI GATC 3686 3686 . . 3685 3688 + BstKTI GATC 3687 3685 . . 3685 3688 + MboI GATC 3684 3688 . . 3700 3703 + DpnI GATC 3701 3701 . . 3700 3703 + BstKTI GATC 3702 3700 . . 3700 3703 + MboI GATC 3699 3703 . . 3705 3708 + SetI ASST 3708 3704 . . 3706 3709 + MnlI CCTC 3716 3715 . . 3708 3713 + Hpy178III* TCNNGA 3709 3711 . . 3712 3716 + TfiI GAWTC 3712 3715 . . 3712 3716 + HinfI GANTC 3712 3715 . . 3707 3712 - Eco57MI CTGRAG 3692 3690 . . 3707 3712 - GsuI CTGGAG 3692 3690 . . 3724 3729 + EcoRI GAATTC 3724 3728 . . 3724 3729 + ApoI RAATTY 3724 3728 . . 3725 3728 + TspEI AATT 3724 3728 . . 3739 3744 + AhaIII* TTTAAA 3741 3741 . . 3740 3743 + MseI TTAA 3740 3742 . . 3756 3766 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3747 3742 3779 3774 3759 3764 + ApoI RAATTY 3759 3763 . . 3760 3763 + TspEI AATT 3759 3763 . . 3775 3778 + TspEI AATT 3774 3778 . . 3779 3783 - BsrI ACTGG 3779 3777 . . 3785 3790 - TaqII CACCCA 3775 3773 . . 3796 3800 + HphI GGTGA 3808 3807 . . 3797 3801 + Tsp45I GTSAC 3796 3801 . . 3797 3801 + MaeIII GTNAC 3796 3801 . . 3799 3803 + HinfI GANTC 3799 3802 . . 3799 3803 - PleI GAGTC 3793 3794 . . 3799 3803 - MlyI GAGTC 3793 3793 . . 3824 3828 + Tsp4CI* ACNGT 3826 3825 . . 3836 3839 + DpnI GATC 3837 3837 . . 3836 3839 + BstKTI GATC 3838 3836 . . 3836 3839 + MboI GATC 3835 3839 . . 3844 3848 + MboII GAAGA 3856 3855 . . 3851 3855 + TspDTI ATGAA 3866 3864 . . 3861 3864 + TspEI AATT 3860 3864 . . 3863 3866 + MseI TTAA 3863 3865 . . 3866 3869 + SetI ASST 3869 3865 . . 3871 3876 + Hpy178III* TCNNGA 3872 3874 . . 3872 3877 + BsiI* CACGAG 3872 3876 . . 3875 3879 - BsmAI GTCTC 3869 3873 . . 3881 3884 + FatI CATG 3880 3884 . . 3881 3884 + NlaIII CATG 3884 3880 . . 3881 3884 + CviAII CATG 3881 3883 . . 3890 3894 + DdeI CTNAG 3890 3893 . . 3912 3915 + SetI ASST 3915 3911 . . 3913 3916 + MnlI CCTC 3923 3922 . . 3915 3919 + Hpy188I TCNGA 3917 3916 . . 3920 3923 + DpnI GATC 3921 3921 . . 3920 3923 + BstKTI GATC 3922 3920 . . 3920 3923 + MboI GATC 3919 3923 . . 3922 3925 + TaqI TCGA 3922 3924 . . 3924 3928 + MboII GAAGA 3936 3935 . . 3932 3937 + EcoRI GAATTC 3932 3936 . . 3932 3937 + ApoI RAATTY 3932 3936 . . 3933 3936 + TspEI AATT 3932 3936 . . 3938 3941 + SetI ASST 3941 3937 . . 3936 3940 - HphI GGTGA 3928 3927 . . 3945 3948 + CviRI* TGCA 3946 3946 . . 3946 3950 + BlsI GCNGC 3948 3947 . . 3946 3950 + BisI GCNGC 3947 3948 . . 3946 3950 + BbvI GCAGC 3958 3962 . . 3946 3950 + TseI GCWGC 3946 3949 . . 3947 3952 + PvuII CAGCTG 3949 3949 . . 3947 3952 + NspBII* CMGCKG 3949 3949 . . 3948 3951 + SetI ASST 3951 3947 . . 3948 3951 + CviJI RGCY 3949 3949 . . 3948 3951 + AluI AGCT 3949 3949 . . 3949 3959 + MwoI GCNNNNNNNGC 3955 3952 . . 3981 3985 + TspGWI ACGGA 3996 3994 . . 3988 3991 + SetI ASST 3991 3987 . . 4003 4006 - MnlI CCTC 3996 3995 . . 4012 4015 + SetI ASST 4015 4011 . . 4010 4014 - HphI GGTGA 4002 4001 . . 4028 4031 + MseI TTAA 4028 4030 . . 4049 4052 + TaqI TCGA 4049 4051 . . 4051 4054 - MnlI CCTC 4044 4043 . . 4077 4081 + Tsp4CI* ACNGT 4079 4078 . . 4083 4087 + MboII GAAGA 4095 4094 . . 4087 4091 + TspDTI ATGAA 4102 4100 . . 4097 4101 + BslFI GGGAC 4111 4115 . . 4101 4107 + TspRI CASTGNN 4107 4098 . . 4109 4114 + SspI AATATT 4111 4111 . . 4163 4167 - MboII GAAGA 4155 4154 . . 4176 4179 + TaiI ACGT 4179 4175 . . 4176 4179 + SetI ASST 4179 4175 . . 4176 4179 + MaeII ACGT 4176 4178 . . 4178 4182 + Tsp45I GTSAC 4177 4182 . . 4178 4182 + MaeIII GTNAC 4177 4182 . . 4179 4190 + BdaI TGANNNNNNTCA 4168 4166 4202 4200 4181 4185 + Tsp4CI* ACNGT 4183 4182 . . 4184 4187 + Csp6I GTAC 4184 4186 . . 4184 4187 + RsaI GTAC 4185 4185 . . 4179 4190 - BdaI TGANNNNNNTCA 4202 4200 4168 4166 4194 4197 + SetI ASST 4197 4193 . . 4194 4197 + CviJI RGCY 4195 4195 . . 4194 4197 + AluI AGCT 4195 4195 . . 4196 4199 + MaeI CTAG 4196 4198 . . 4206 4209 + CviRI* TGCA 4207 4207 . . 4212 4215 + SetI ASST 4215 4211 . . 4213 4217 + HphI GGTGA 4225 4224 . . 4211 4214 - MnlI CCTC 4204 4203 . . 4224 4228 + SfaNI GCATC 4233 4237 . . 4227 4232 + Hpy178III* TCNNGA 4228 4230 . . 4225 4229 - FokI GGATG 4211 4215 . . 4225 4229 - BseGI GGATG 4224 4222 . . 4240 4244 + HinfI GANTC 4240 4243 . . 4242 4246 + DdeI CTNAG 4242 4245 . . 4242 4246 + BspCNI CTCAG 4255 4253 . . 4242 4246 + BseMII CTCAG 4256 4254 . . 4240 4244 - PleI GAGTC 4234 4235 . . 4240 4244 - MlyI GAGTC 4234 4234 . . 4247 4252 + NspI RCATGY 4251 4247 . . 4247 4252 + Cac8I GCNNGC 4249 4249 . . 4247 4252 + SphI GCATGC 4251 4247 . . 4248 4251 + FatI CATG 4247 4251 . . 4248 4251 + NlaIII CATG 4251 4247 . . 4248 4251 + CviAII CATG 4248 4250 . . 4250 4253 + CviRI* TGCA 4251 4251 . . 4261 4265 + Tsp4CI* ACNGT 4263 4262 . . 4264 4267 + Csp6I GTAC 4264 4266 . . 4264 4267 + RsaI GTAC 4265 4265 . . 4267 4276 + MslI CAYNNNNRTG 4271 4271 . . 4274 4279 + EcoT22I ATGCAT 4278 4274 . . 4275 4278 + CviRI* TGCA 4276 4276 . . 4278 4283 + VspI ATTAAT 4279 4281 . . 4279 4282 + MseI TTAA 4279 4281 . . 4284 4295 + DrdI GACNNNNNNGTC 4290 4288 . . 4286 4290 - FokI GGATG 4272 4276 . . 4286 4290 - BseGI GGATG 4285 4283 . . 4293 4297 + Tsp45I GTSAC 4292 4297 . . 4293 4297 + MaeIII GTNAC 4292 4297 . . 4299 4302 + CviRI* TGCA 4300 4300 . . 4328 4331 + TspEI AATT 4327 4331 . . 4339 4343 - MboII GAAGA 4331 4330 . . 4356 4359 + CviRI* TGCA 4357 4357 . . 4369 4373 + MboII GAAGA 4381 4380 . . 4373 4376 + TspEI AATT 4372 4376 . . 4386 4389 + SetI ASST 4389 4385 . . 4387 4390 + MnlI CCTC 4397 4396 . . 4393 4403 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 4399 4396 . . 4405 4409 + TspDTI ATGAA 4420 4418 . . 4422 4425 + TaiI ACGT 4425 4421 . . 4422 4425 + SetI ASST 4425 4421 . . 4422 4425 + MaeII ACGT 4422 4424 . . 4428 4432 + MboII GAAGA 4440 4439 . . 4466 4470 + BsrI ACTGG 4471 4469 . . 4470 4473 + Csp6I GTAC 4470 4472 . . 4470 4473 + RsaI GTAC 4471 4471 . . 4490 4493 + SetI ASST 4493 4489 . . 4500 4504 + Tsp4CI* ACNGT 4502 4501 . . 4501 4507 + TspRI CASTGNN 4507 4498 . . 4513 4517 + MboII GAAGA 4525 4524 . . 4513 4522 + XmnI GAANNNNTTC 4517 4517 . . 4525 4529 + FokI GGATG 4538 4542 . . 4525 4529 + BseGI GGATG 4531 4529 . . 4526 4530 - BccI CCATC 4520 4521 . . 4532 4535 + FatI CATG 4531 4535 . . 4532 4535 + NlaIII CATG 4535 4531 . . 4532 4535 + CviAII CATG 4532 4534 . . 4541 4544 + MseI TTAA 4541 4543 . . 4555 4559 + MaeIII GTNAC 4554 4559 . . 4573 4578 + Hpy166II GTNNAC 4575 4575 . . 4573 4578 + HindII GTYRAC 4575 4575 . . 4581 4584 + FatI CATG 4580 4584 . . 4581 4584 + NlaIII CATG 4584 4580 . . 4581 4584 + CviAII CATG 4581 4583 . . 4583 4594 + BdaI TGANNNNNNTCA 4572 4570 4606 4604 4583 4594 - BdaI TGANNNNNNTCA 4606 4604 4572 4570 4603 4606 + MseI TTAA 4603 4605 . . 4608 4611 + CviRI* TGCA 4609 4609 . . 4633 4638 + SmlI CTYRAG 4633 4637 . . 4634 4639 + Hpy178III* TCNNGA 4635 4637 . . 4633 4638 - Bce83I* CTTGAG 4618 4616 . . 4656 4666 + Hin4I GAYNNNNNVTC 4647 4642 4679 4674 4656 4666 - Hin4I GAYNNNNNVTC 4679 4674 4647 4642 4669 4673 + HphI GGTGA 4681 4680 . . 4667 4672 - TaqII CACCCA 4657 4655 . . 4685 4690 + ApoI RAATTY 4685 4689 . . 4686 4689 + TspEI AATT 4685 4689 . . 4692 4695 + Csp6I GTAC 4692 4694 . . 4692 4695 + RsaI GTAC 4693 4693 . . 4705 4708 + CviJI RGCY 4706 4706 . . 4707 4711 + DdeI CTNAG 4707 4710 . . 4728 4731 + SetI ASST 4731 4727 . . 4727 4730 - MnlI CCTC 4720 4719 . . 4737 4740 + FatI CATG 4736 4740 . . 4737 4740 + NlaIII CATG 4740 4736 . . 4737 4740 + CviAII CATG 4737 4739 . . 4738 4742 + TspDTI ATGAA 4753 4751 . . 4742 4745 + TspEI AATT 4741 4745 . . 4746 4749 + SetI ASST 4749 4745 . . 4762 4765 + MseI TTAA 4762 4764 . . 4766 4770 + DdeI CTNAG 4766 4769 . . 4766 4770 - BspCNI CTCAG 4758 4756 . . 4766 4770 - BseMII CTCAG 4757 4755 . . 4781 4784 + TspEI AATT 4780 4784 . . 4783 4786 + MseI TTAA 4783 4785 . . 4787 4790 + TaiI ACGT 4790 4786 . . 4787 4790 + SetI ASST 4790 4786 . . 4787 4790 + MaeII ACGT 4787 4789 . . 4789 4792 + Csp6I GTAC 4789 4791 . . 4789 4792 + RsaI GTAC 4790 4790 . . 4791 4794 + SetI ASST 4794 4790 . . 4797 4801 + TfiI GAWTC 4797 4800 . . 4797 4801 + HinfI GANTC 4797 4800 . . 4808 4812 + MboII GAAGA 4820 4819 . . 4816 4820 + DdeI CTNAG 4816 4819 . . 4819 4824 + HaeII RGCGCY 4823 4819 . . 4819 4824 + Eco47III AGCGCT 4821 4821 . . 4820 4823 + Hin6I GCGC 4820 4822 . . 4820 4823 + GlaI GCGC 4821 4821 . . 4820 4823 + HhaI GCGC 4822 4820 . . 4825 4829 + BssKI CCNGG 4824 4829 . . 4825 4829 + BseBI CCWGG 4826 4827 . . 4825 4829 + ScrFI CCNGG 4826 4827 . . 4825 4829 + EcoRII CCWGG 4824 4829 . . 4827 4830 + SetI ASST 4830 4826 . . 4823 4828 - Eco57MI CTGRAG 4808 4806 . . 4823 4828 - GsuI CTGGAG 4808 4806 . . 4829 4834 + Hpy166II GTNNAC 4831 4831 . . 4829 4834 + HindII GTYRAC 4831 4831 . . 4833 4839 + SexAI ACCWGGT 4833 4838 . . 4834 4838 + BssKI CCNGG 4833 4838 . . 4834 4838 + BseBI CCWGG 4835 4836 . . 4834 4838 + ScrFI CCNGG 4835 4836 . . 4834 4838 + EcoRII CCWGG 4833 4838 . . 4836 4839 + SetI ASST 4839 4835 . . 4851 4855 + BssKI CCNGG 4850 4855 . . 4851 4855 + BseBI CCWGG 4852 4853 . . 4851 4855 + ScrFI CCNGG 4852 4853 . . 4851 4855 + EcoRII CCWGG 4850 4855 . . 4854 4858 + FokI GGATG 4867 4871 . . 4854 4858 + BseGI GGATG 4860 4858 . . 4856 4860 + TspDTI ATGAA 4871 4869 . . 4861 4864 + MaeI CTAG 4861 4863 . . 4871 4875 + TspDTI ATGAA 4886 4884 . . 4873 4877 + MboII GAAGA 4885 4884 . . 4877 4881 + TspDTI ATGAA 4892 4890 . . 4892 4895 + SetI ASST 4895 4891 . . 4890 4894 - Hin4II* CCTTC 4884 4883 . . 4894 4897 + Csp6I GTAC 4894 4896 . . 4894 4897 + RsaI GTAC 4895 4895 . . 4897 4900 + FatI CATG 4896 4900 . . 4897 4900 + NlaIII CATG 4900 4896 . . 4897 4900 + CviAII CATG 4897 4899 . . 4898 4902 + TspDTI ATGAA 4913 4911 . . 4904 4907 + CviRI* TGCA 4905 4905 . . 4921 4924 + MaeI CTAG 4921 4923 . . 4923 4926 + SetI ASST 4926 4922 . . 4923 4926 + CviJI RGCY 4924 4924 . . 4923 4926 + AluI AGCT 4924 4924 . . 4928 4933 + NdeI CATATG 4929 4931 . . 4926 4930 - TspDTI ATGAA 4916 4914 . . 4933 4938 - MmeI TCCRAC 4914 4912 . . 4942 4947 + ApoI RAATTY 4942 4946 . . 4943 4946 + TspEI AATT 4942 4946 . . 5000 5003 + MnlI CCTC 5010 5009 . . 5003 5006 + MaeI CTAG 5003 5005 . . 5019 5022 + FatI CATG 5018 5022 . . 5019 5022 + NlaIII CATG 5022 5018 . . 5019 5022 + CviAII CATG 5019 5021 . . 5024 5029 + NdeI CATATG 5025 5027 . . 5033 5044 + BdaI TGANNNNNNTCA 5022 5020 5056 5054 5038 5049 + CspCI CAANNNNNGTGG 5026 5024 5061 5059 5039 5042 + TspEI AATT 5038 5042 . . 5043 5046 + FatI CATG 5042 5046 . . 5043 5046 + NlaIII CATG 5046 5042 . . 5043 5046 + CviAII CATG 5043 5045 . . 5033 5044 - BdaI TGANNNNNNTCA 5056 5054 5022 5020 5041 5045 - TspDTI ATGAA 5031 5029 . . 5048 5052 + BslFI GGGAC 5062 5066 . . 5054 5057 + MaeI CTAG 5054 5056 . . 5088 5091 + SetI ASST 5091 5087 . . 5096 5099 + CviJI RGCY 5097 5097 . . 5109 5114 + SpeI ACTAGT 5109 5113 . . 5110 5113 + MaeI CTAG 5110 5112 . . 5121 5131 + FalI AAGNNNNNCTT 5112 5107 5144 5139 5125 5129 - SfaNI GCATC 5115 5119 . . 5121 5131 - FalI AAGNNNNNCTT 5144 5139 5112 5107 5145 5149 + Tsp4CI* ACNGT 5147 5146 . . 5151 5156 + PsiI TTATAA 5153 5153 . . 5163 5166 + TspEI AATT 5162 5166 . . 5183 5186 + MseI TTAA 5183 5185 . . 5192 5195 + SetI ASST 5195 5191 . . 5196 5199 + TspEI AATT 5195 5199 . . 5201 5204 - MnlI CCTC 5194 5193 . . 5208 5213 + Hpy166II GTNNAC 5210 5210 . . 5213 5218 + StyI CCWWGG 5213 5217 . . 5213 5218 + SecI* CCNNGG 5213 5217 . . 5217 5220 + CviJI RGCY 5218 5218 . . 5222 5231 + MslI CAYNNNNRTG 5226 5226 . . 5220 5224 - TspDTI ATGAA 5210 5208 . . 5224 5227 + MseI TTAA 5224 5226 . . 5227 5232 + BspLU11I* ACATGT 5227 5231 . . 5227 5232 + NspI RCATGY 5231 5227 . . 5227 5232 + AflIII ACRYGT 5227 5231 . . 5228 5231 + FatI CATG 5227 5231 . . 5228 5231 + NlaIII CATG 5231 5227 . . 5228 5231 + CviAII CATG 5228 5230 . . 5230 5235 + TatI WGTACW 5230 5234 . . 5231 5234 + Csp6I GTAC 5231 5233 . . 5231 5234 + RsaI GTAC 5232 5232 . . 5242 5246 + TspGWI ACGGA 5257 5255 . . 5245 5257 + BarI GAAGNNNNNNTAC 5237 5232 5269 5264 5259 5262 + FnuDII* CGCG 5260 5260 . . 5269 5273 + TfiI GAWTC 5269 5272 . . 5269 5273 + HinfI GANTC 5269 5272 . . 5275 5279 - BslFI GGGAC 5260 5264 . . 5284 5287 + MseI TTAA 5284 5286 . . 5293 5297 + DdeI CTNAG 5293 5296 . . 5297 5301 + MaeIII GTNAC 5296 5301 . . 5300 5303 + SetI ASST 5303 5299 . . 5315 5318 + MseI TTAA 5315 5317 . . 5328 5331 + TspEI AATT 5327 5331 . . 5333 5336 + MseI TTAA 5333 5335 . . 5336 5346 + FalI AAGNNNNNCTT 5327 5322 5359 5354 5338 5341 + CviJI RGCY 5339 5339 . . 5336 5346 - FalI AAGNNNNNCTT 5359 5354 5327 5322 5350 5360 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5341 5336 5373 5368 5357 5367 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5348 5343 5380 5375 5357 5360 + DpnI GATC 5358 5358 . . 5357 5360 + BstKTI GATC 5359 5357 . . 5357 5360 + MboI GATC 5356 5360 . . 5350 5360 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5373 5368 5341 5336 5364 5367 + DpnI GATC 5365 5365 . . 5364 5367 + BstKTI GATC 5366 5364 . . 5364 5367 + MboI GATC 5363 5367 . . 5357 5367 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5380 5375 5348 5343 5373 5376 + TspEI AATT 5372 5376 . . 5375 5378 + MseI TTAA 5375 5377 . . 5379 5384 + Hpy166II GTNNAC 5381 5381 . . 5379 5384 + AccI GTMKAC 5380 5382 . . 5387 5391 + TspDTI ATGAA 5402 5400 . . 5389 5393 + MboII GAAGA 5401 5400 . . 5389 5394 - Ksp632I* CTCTTC 5384 5387 . . 5395 5400 + ApoI RAATTY 5395 5399 . . 5396 5399 + TspEI AATT 5395 5399 . . 5425 5430 + BsrDI GCAATG 5432 5430 . . 5434 5438 + DdeI CTNAG 5434 5437 . . 5430 5434 - BsmAI GTCTC 5424 5428 . . 5440 5450 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5431 5426 5463 5458 5441 5445 + TspDTI ATGAA 5456 5454 . . 5440 5450 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5463 5458 5431 5426 5451 5454 + SetI ASST 5454 5450 . . 5458 5461 + TspEI AATT 5457 5461 . . 5464 5469 + SnaBI TACGTA 5466 5466 . . 5464 5469 + BsaAI YACGTR 5466 5466 . . 5465 5468 + TaiI ACGT 5468 5464 . . 5465 5468 + SetI ASST 5468 5464 . . 5465 5468 + MaeII ACGT 5465 5467 . . 5467 5472 + Hpy166II GTNNAC 5469 5469 . . 5467 5472 + BssNAI GTATAC 5469 5469 . . 5467 5472 + AccI GTMKAC 5468 5470 . . 5477 5480 + TaqI TCGA 5477 5479 . . 5477 5482 + Hpy178III* TCNNGA 5478 5480 . . 5479 5483 - BsmAI GTCTC 5473 5477 . . 5479 5484 - Eco31I GGTCTC 5473 5477 . . 5487 5491 + MboII GAAGA 5499 5498 . . 5493 5498 - BsrDI GCAATG 5492 5490 . . 5508 5518 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5499 5494 5531 5526 5514 5517 + SetI ASST 5517 5513 . . 5515 5518 + MnlI CCTC 5525 5524 . . 5516 5521 + Ksp632I* CTCTTC 5522 5525 . . 5520 5524 + Hpy188I TCNGA 5522 5521 . . 5517 5521 - MboII GAAGA 5509 5508 . . 5533 5538 + AhaIII* TTTAAA 5535 5535 . . 5534 5537 + MseI TTAA 5534 5536 . . 5542 5545 + MseI TTAA 5542 5544 . . 5556 5560 + TfiI GAWTC 5556 5559 . . 5556 5560 + HinfI GANTC 5556 5559 . . 5558 5562 - TspDTI ATGAA 5548 5546 . . 5564 5569 + XhoII RGATCY 5564 5568 . . 5564 5569 + BglII AGATCT 5564 5568 . . 5565 5568 + DpnI GATC 5566 5566 . . 5565 5568 + BstKTI GATC 5567 5565 . . 5565 5568 + MboI GATC 5564 5568 . . 5579 5584 - TaqII CACCCA 5569 5567 . . 5589 5594 - MmeI TCCRAC 5570 5568 . . 5619 5624 + SpeI ACTAGT 5619 5623 . . 5620 5623 + MaeI CTAG 5620 5622 . . 5634 5639 + SpeI ACTAGT 5634 5638 . . 5635 5638 + MaeI CTAG 5635 5637 . . 5652 5656 + Tsp4CI* ACNGT 5654 5653 . . 5661 5665 + MboII GAAGA 5673 5672 . . 5667 5671 + HgaI GACGC 5676 5681 . . 5679 5689 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5702 5697 5670 5665 5695 5698 + TspEI AATT 5694 5698 . . 5705 5708 + SetI ASST 5708 5704 . . 5705 5708 + CviJI RGCY 5706 5706 . . 5705 5708 + AluI AGCT 5706 5706 . . 5735 5739 + BinI* GGATC 5743 5744 . . 5736 5739 + DpnI GATC 5737 5737 . . 5736 5739 + BstKTI GATC 5738 5736 . . 5736 5739 + MboI GATC 5735 5739 . . 5741 5745 + TspDTI ATGAA 5756 5754 . . 5760 5764 + TspGWI ACGGA 5775 5773 . . 5767 5770 - MnlI CCTC 5760 5759 . . 5767 5777 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5790 5785 5758 5753 5780 5785 + SspI AATATT 5782 5782 . . 5802 5806 + TfiI GAWTC 5802 5805 . . 5802 5806 + HinfI GANTC 5802 5805 . . 5806 5816 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 5812 5809 . . 5816 5820 + TfiI GAWTC 5816 5819 . . 5813 5816 - MnlI CCTC 5806 5805 . . 5816 5820 + HinfI GANTC 5816 5819 . . 5827 5834 + PspXI VCTCGAGB 5828 5832 . . 5827 5830 + MnlI CCTC 5837 5836 . . 5827 5834 + AbsI CCTCGAGG 5828 5832 . . 5828 5833 + SmlI CTYRAG 5828 5832 . . 5828 5833 + XhoI CTCGAG 5828 5832 . . 5828 5833 + BmeT110I CYCGRG 5829 5831 . . 5828 5833 + AvaI CYCGRG 5828 5832 . . 5829 5832 + TaqI TCGA 5829 5831 . . 5831 5836 + BseRI GAGGAG 5846 5844 . . 5831 5834 - MnlI CCTC 5824 5823 . . 5842 5845 + MaeI CTAG 5842 5844 . . 5854 5859 + Hpy166II GTNNAC 5856 5856 . . 5854 5859 + BssNAI GTATAC 5856 5856 . . 5854 5859 + AccI GTMKAC 5855 5857 . . 5858 5861 + SetI ASST 5861 5857 . . 5862 5867 + SspI AATATT 5864 5864 . . 5870 5873 + CviJI RGCY 5871 5871 . . 5887 5891 + TfiI GAWTC 5887 5890 . . 5887 5891 + HinfI GANTC 5887 5890 . . 5897 5900 + TspEI AATT 5896 5900 . . 5911 5915 - HphI GGTGA 5903 5902 . . #--------------------------------------- # # # AarI: # [CACCTGC] # 476 672 4776 # # AbsI: # [CCTCGAGG] # 96 241 5587 # # Acc65I: # [GGTACC] # 2416 3508 # # AccI: # [GTMKAC] # 69 88 268 341 362 387 # 1547 2862 # # AciI: # [CCGC] # 81 687 945 1816 2395 # # AflIII: # [ACRYGT] # 697 1275 1947 2005 # # AgeI: # [ACCGGT] # 2584 3340 # # AhaIII*: # [TTTAAA] # 389 1794 3741 # # AjuI: # [GAANNNNNNNTTGG] # 32 2259 3633 # # AlfI: # [GCANNNNNNTGC] # 0 0 34 2095 3795 # # AluI: # [AGCT] # 32 75 119 218 246 273 # 286 441 729 780 782 934 # 1009 # # AlwNI: # [CAGNNNCTG] # 1305 4619 # # ApaLI: # [GTGCAC] # 2342 3582 # # ApoI: # [RAATTY] # 20 35 70 109 145 156 # 159 173 181 257 404 453 # 529 602 753 864 1014 # # AsuI*: # [GGNCC] # 126 185 543 1648 3422 # # AsuII: # [TTCGAA] # 1473 1744 2707 # # AvaI: # [CYCGRG] # 96 241 2350 3237 # # AvaII: # [GGWCC] # 185 2317 3422 # # BaeI: # [ACNNNNGTAYC] # 33 2421 3470 # # BarI: # [GAAGNNNNNNTAC] # 32 655 5237 # # BbvCI: # [CCTCAGC] # 764 5160 # # BbvI: # [GCAGC] # 458 1423 1966 2077 # # BbvII*: # [GAAGAC] # 88 2898 2938 # # BccI: # [CCATC] # 22 27 30 81 91 114 # 197 372 471 505 573 817 # 1220 1404 # # Bce83I*: # [CTTGAG] # 1306 4618 # # BceAI: # [ACGGC] # 2 530 665 1432 3295 # # BciVI: # [GTATCC] # 703 811 4410 # # BclI: # [TGATCA] # 2826 3098 # # BdaI: # [TGANNNNNNTCA] # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 34 34 # 34 34 34 370 416 677 # 868 1551 1872 # # BetI*: # [WCCGGW] # 257 2327 3340 # # BfiI: # [ACTGGG] # 1998 3926 # # BglII: # [AGATCT] # 360 1599 1705 2260 # # BinI*: # [GGATC] # 156 181 225 977 1708 2677 # # BisI: # [GCNGC] # 483 1412 1977 2052 # # BlsI: # [GCNGC] # 483 1413 1976 2052 # # BmeT110I: # [CYCGRG] # 95 242 2350 3237 # # BmgT120I: # [GGNCC] # 126 185 544 1648 3421 # # Bpu10I: # [CCTNAGC] # 764 2376 2784 # # BsaAI: # [YACGTR] # 458 2156 3310 # # BsaXI: # [ACNNNNNCTCC] # 30 2824 3070 # # BseBI: # [CCWGG] # 9 17 55 109 116 155 # 334 380 667 1051 1072 1959 # # BseGI: # [GGATG] # 11 19 24 40 61 215 # 229 246 329 503 759 1064 # 1089 1335 # # BseMII: # [CTCAG] # 16 54 81 151 330 362 # 501 599 614 627 708 714 # 1167 # # BseRI: # [GAGGAG] # 78 240 259 5347 # # BseSI: # [GKGCMC] # 2346 3578 # # BseYI: # [CCCAGC] # 1524 4400 # # BsiI*: # [CACGAG] # 1017 2052 2855 # # BsiYI*: # [CCNNNNNNNGG] # 57 112 198 225 315 1413 # 1680 1924 # # BslFI: # [GGGAC] # 198 664 736 951 3375 # # BsmAI: # [GTCTC] # 49 78 328 395 451 523 # 572 1555 1973 # # BsmI: # [GAATGC] # 904 1198 3822 # # BspCNI: # [CTCAG] # 16 52 83 151 328 360 # 503 601 616 627 709 712 # 1166 # # BspHI: # [TCATGA] # 1039 4885 # # BspLU11I*: # [ACATGT] # 697 5227 # # BspMI: # [ACCTGC] # 48 476 624 4776 # # BsrDI: # [GCAATG] # 60 394 432 2376 2662 # # BsrI: # [ACTGG] # 11 75 135 149 192 282 # 692 942 1453 1993 # # BssKI: # [CCNGG] # 9 17 55 109 116 155 # 334 380 665 1051 1074 1959 # # BssNAI: # [GTATAC] # 68 269 362 387 1888 2950 # # BstEII: # [GGTNACC] # 1795 4129 # # BstKTI: # [GATC] # 7 15 16 84 86 136 # 151 159 171 186 201 217 # 234 238 355 380 422 542 # 887 1437 # # BstXI: # [CCANNNNNNTGG] # 595 1892 3437 # # BtgZI: # [GCGATG] # 67 2261 3596 # # BtrI: # [CACGTC] # 1278 4646 # # BtsI: # [GCAGTG] # 564 5360 # # Cac8I: # [GCNNGC] # 6 188 653 658 691 830 # 1223 1675 # # Cfr10I: # [RCCGGY] # 2584 3340 # # ClaI: # [ATCGAT] # 2340 3584 # # Csp6I: # [GTAC] # 9 13 21 23 25 31 # 34 50 80 97 105 108 # 118 144 206 214 222 265 # 337 525 549 561 675 693 # 819 # # CspCI: # [CAANNNNNGTGG] # 35 863 5026 # # CviAII: # [CATG] # 19 24 32 49 62 104 # 122 156 160 162 165 182 # 185 194 278 284 336 348 # 367 460 475 477 587 696 # # CviJI: # [RGCY] # 6 12 24 27 30 32 # 36 37 40 42 53 65 # 89 102 110 112 119 121 # 121 121 137 165 165 173 # 218 246 260 299 367 511 # 561 743 780 # # CviRI*: # [TGCA] # 6 22 24 25 37 44 # 48 49 57 60 63 156 # 228 252 261 296 311 511 # 562 589 605 699 1019 # # DdeI: # [CTNAG] # 16 31 50 56 59 70 # 75 104 126 141 151 213 # 278 307 339 352 364 465 # 477 490 552 581 627 # # DpnI: # [GATC] # 7 15 16 84 86 136 # 150 159 171 187 201 217 # 234 238 355 380 422 542 # 887 1437 # # DrdI: # [GACNNNNNNGTC] # 1634 4290 # # DsaI*: # [CCRYGG] # 2505 3419 # # Eco31I: # [GGTCTC] # 451 5473 # # Eco47III: # [AGCGCT] # 1103 4821 # # Eco57I: # [CTGAAG] # 283 505 2442 2694 # # Eco57MI: # [CTGRAG] # 283 462 505 1116 1116 2442 # # EcoNI: # [CCTNNNNNAGG] # 736 5188 # # EcoP15I: # [CAGCAG] # 585 5339 # # EcoRI: # [GAATTC] # 208 1992 3724 # # EcoRII: # [CCWGG] # 9 17 55 109 116 155 # 334 380 665 1051 1074 1959 # # EcoRV: # [GATATC] # 285 583 879 1037 3140 # # EcoT22I: # [ATGCAT] # 919 1151 1646 2208 # # Esp3I: # [CGTCTC] # 2891 3033 # # FalI: # [AAGNNNNNCTT] # 0 0 0 0 32 32 # 183 565 5112 # # FatI: # [CATG] # 19 24 32 49 62 104 # 122 156 160 162 165 182 # 185 194 278 284 335 348 # 367 460 475 477 587 697 # # FnuDII*: # [CGCG] # 664 828 2015 2417 # # FokI: # [GGATG] # 11 19 24 40 61 215 # 229 266 329 503 746 1057 # 1089 1335 # # GlaI: # [GCGC] # 344 1103 1141 1575 1761 # # GsaI: # [CCCAGC] # 1528 4396 # # GsuI: # [CTGGAG] # 1116 1116 3692 # # HaeII: # [RGCGCY] # 346 1101 4477 # # HaeIII: # [GGCC] # 126 545 875 933 3445 # # HgaI: # [GACGC] # 40 89 248 2626 2921 # # HgiAI*: # [GWGCWC] # 252 723 1623 3326 # # HgiCI*: # [GGYRCC] # 2416 3508 # # HgiJII*: # [GRGCYC] # 1496 4428 # # HhaI: # [GCGC] # 345 1102 1141 1575 1761 # # Hin4I: # [GAYNNNNNVTC] # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 0 0 # 7 7 11 21 21 25 # 32 32 32 32 32 32 # 32 32 32 32 32 32 # 36 51 56 56 83 94 # 134 139 177 202 544 612 # 662 868 1734 # # Hin4II*: # [CCTTC] # 79 422 537 643 1040 1297 # 1906 # # Hin6I: # [GCGC] # 343 1104 1141 1575 1761 # # HindII: # [GTYRAC] # 61 256 391 631 820 1093 # 1314 1358 # # HinfI: # [GANTC] # 10 14 14 15 16 21 # 21 29 30 37 42 42 # 47 50 60 63 71 71 # 74 87 88 105 110 112 # 132 165 215 219 246 255 # 287 323 371 441 472 489 # 523 557 # # HpaI: # [GTTAAC] # 820 5104 # # HpaII: # [CCGG] # 257 2326 3341 # # HphI: # [GGTGA] # 21 74 96 120 121 220 # 223 242 316 405 456 649 # 843 916 1222 # # Hpy166II: # [GTNNAC] # 19 61 68 68 79 88 # 88 105 113 141 149 171 # 175 189 229 256 257 269 # 313 379 387 391 928 1001 # # Hpy178III*: # [TCNNGA] # 7 9 49 50 90 102 # 158 161 163 175 194 297 # 314 321 356 376 384 407 # 446 468 554 843 # # Hpy188I: # [TCNGA] # 8 18 27 28 58 63 # 97 151 153 166 197 204 # 228 263 297 308 342 402 # 591 718 1605 # # Hpy99I: # [CGWCG] # 413 587 2417 2507 # # KpnI: # [GGTACC] # 2412 3512 # # Ksp632I*: # [CTCTTC] # 138 402 2089 3295 # # MaeI: # [CTAG] # 15 15 33 51 56 60 # 82 82 207 207 266 273 # 510 583 665 888 1931 # # MaeII: # [ACGT] # 177 227 246 263 354 365 # 397 459 474 526 678 691 # 1067 # # MaeIII: # [GTNAC] # 60 115 258 262 356 381 # 628 632 742 743 747 1000 # # MboI: # [GATC] # 7 15 16 84 86 136 # 148 159 171 189 201 217 # 234 238 355 380 422 542 # 887 1437 # # MboII: # [GAAGA] # 10 10 32 35 50 57 # 59 59 60 65 78 80 # 85 86 98 159 164 176 # 192 251 295 343 516 544 # 921 1499 # # McrI*: # [CGRYCG] # 2412 3512 # # MfeI: # [CAATTG] # 1572 4352 # # MlyI: # [GAGTC] # 21 27 196 235 348 441 # 571 744 1651 1690 # # MmeI: # [TCCRAC] # 56 238 354 656 686 1712 # 2222 # # MnlI: # [CCTC] # 5 13 13 18 18 21 # 28 46 46 48 49 56 # 60 73 87 90 151 159 # 160 173 183 184 193 207 # 213 232 235 265 290 323 # 331 339 424 457 734 # # MseI: # [TTAA] # 8 9 18 21 24 31 # 31 41 42 56 58 60 # 62 99 123 159 159 165 # 244 251 262 272 354 376 # 380 382 400 464 554 819 # # MslI: # [CAYNNNNRTG] # 57 408 557 698 744 955 # 1089 1416 # # MstI*: # [TGCGCA] # 2105 3819 # # MwoI: # [GCNNNNNNNGC] # 97 477 1088 1969 2293 # # NdeI: # [CATATG] # 96 899 4929 # # NlaIII: # [CATG] # 19 24 32 49 62 104 # 122 156 160 162 165 182 # 185 194 278 284 339 348 # 367 460 475 477 587 693 # # NlaIV: # [GGNNCC] # 2414 3510 # # NruI: # [TCGCGA] # 2417 3507 # # NspBII*: # [CMGCKG] # 288 480 1365 1816 1975 # # NspI: # [RCATGY] # 194 654 691 693 980 1225 # 1487 # # OliI: # [CACNNNNGTG] # 557 5367 # # PflMI: # [CCANNNNNTGG] # 540 5384 # # PfoI: # [TCCNGGA] # 1814 4110 # # PleI: # [GAGTC] # 22 28 195 235 348 441 # 571 743 1651 1690 # # PpiI: # [GAACNNNNNCTC] # 32 2565 3327 # # PsiI: # [TTATAA] # 771 1702 3451 # # PspXI: # [VCTCGAGB] # 96 241 5587 # # PstI: # [CTGCAG] # 754 1145 4025 # # PvuII: # [CAGCTG] # 480 1975 3469 # # RsaI: # [GTAC] # 9 13 21 23 25 31 # 34 50 80 97 105 108 # 118 144 206 214 222 265 # 337 526 549 561 675 692 # 819 # # SalI: # [GTCGAC] # 2176 3748 # # SauI*: # [CCTNAGG] # 1599 4325 # # ScaI: # [AGTACT] # 785 2005 3134 # # ScrFI: # [CCNGG] # 9 17 55 109 116 155 # 334 380 667 1051 1072 1959 # # SduI: # [GDGCHC] # 252 723 773 850 3326 # # SecI*: # [CCNNGG] # 108 170 334 360 381 666 # 711 800 846 1548 # # SetI: # [ASST] # 4 4 5 6 6 7 # 9 9 10 12 12 14 # 15 18 18 18 24 24 # 25 25 26 30 30 31 # 32 33 34 36 36 36 # 36 40 41 42 44 46 # 46 47 48 49 56 63 # 63 66 66 68 70 77 # 82 84 87 90 91 96 # 98 101 104 105 108 121 # 124 126 129 140 146 151 # 153 153 161 164 165 172 # 174 191 193 238 263 357 # # SexAI: # [ACCWGGT] # 1091 4833 # # SfaNI: # [GCATC] # 11 42 560 657 706 809 # 882 1121 1136 # # SfeI*: # [CTRYAG] # 754 1141 4029 # # SmlI: # [CTYRAG] # 96 241 1195 4392 # # SnaBI: # [TACGTA] # 458 5466 # # SpeI: # [ACTAGT] # 15 15 32 290 510 5062 # # SphI: # [GCATGC] # 194 691 1225 1673 2141 # # SplI*: # [CGTACG] # 920 5004 # # SspI: # [AATATT] # 45 60 82 82 195 336 # 490 696 1671 2267 # # StyI: # [CCWWGG] # 711 5213 # # TaiI: # [ACGT] # 177 227 246 263 354 365 # 400 456 474 526 678 691 # 1067 # # TaqI: # [TCGA] # 6 33 50 70 95 106 # 115 120 125 127 193 197 # 203 242 252 255 264 298 # 338 352 418 637 1428 # # TaqII: # [CACCCA] # 287 341 355 470 511 882 # 912 2166 # # TatI: # [WGTACW] # 50 59 479 655 694 726 # 819 2442 # # TfiI: # [GAWTC] # 14 14 21 29 30 37 # 42 47 50 60 63 71 # 71 84 88 105 125 133 # 215 246 287 323 387 393 # 420 472 489 523 1085 # # TseI: # [GCWGC] # 483 1411 1978 2052 # # TsoI: # [TARCCA] # 2479 3445 # # Tsp45I: # [GTSAC] # 60 115 258 381 632 1103 # 1632 1743 # # Tsp4CI*: # [ACNGT] # 11 46 65 67 77 80 # 93 94 104 117 178 223 # 239 253 270 314 314 327 # 396 429 460 507 615 645 # # TspDTI: # [ATGAA] # 3 4 6 13 15 21 # 54 79 92 101 115 118 # 135 160 168 169 175 179 # 187 192 207 208 234 236 # 267 285 294 316 318 333 # 554 686 # # TspEI: # [AATT] # 4 5 15 20 22 23 # 23 28 29 33 35 39 # 41 45 45 56 58 62 # 70 72 84 86 96 99 # 103 107 109 110 112 118 # 123 124 132 151 156 159 # 162 202 202 209 235 237 # 245 271 313 326 395 533 # # TspGWI: # [ACGGA] # 6 37 85 149 188 191 # 237 303 312 361 471 496 # 498 518 811 1261 # # TspRI: # [CASTGNN] # 374 400 531 564 642 978 # 1018 1417 # # TstI: # [CACNNNNNNTCC] # 32 1488 4404 # # VspI: # [ATTAAT] # 1230 1645 3049 # # XhoI: # [CTCGAG] # 96 241 5587 # # XhoII: # [RGATCY] # 233 360 386 1319 1366 2260 # # XmnI: # [GAANNNNTTC] # 721 1407 1567 2229 # #--------------------------------------- #--------------------------------------- # Total_sequences: 1 # Total_length: 5924 # Reported_sequences: 1 # Reported_hitcount: 1313 #---------------------------------------