Restriction Fragments for POL2/YNL262W



Send questions or suggestions to SGD

BLAST search | Genome Restriction Map | Design Primers for this sequence


The currently selected gene/sequence is :

POL2/YNL262W on chromosome XIV from coordinates 148212 to 154880.

seqfile=/share/crumb/www-data/html/tmp/gcgseq.tmp.31718.2

Start End Strand Enzyme_name Restriction_site 5prime 3prime 5primerev 3primerev 26 30 + TspGWI ACGGA 41 39 . . 31 36 + XhoII RGATCY 31 35 . . 31 35 + BinI* GGATC 39 40 . . 29 32 - MnlI CCTC 22 21 . . 32 35 + DpnI GATC 33 33 . . 32 35 + BstKTI GATC 34 32 . . 32 35 + MboI GATC 31 35 . . 34 38 - MboII GAAGA 26 25 . . 39 45 + TspRI CASTGNN 45 36 . . 42 45 + CviRI* TGCA 43 43 . . 39 44 - BtsI GCAGTG 38 36 . . 53 58 + PvuII CAGCTG 55 55 . . 53 58 + NspBII* CMGCKG 55 55 . . 54 57 + SetI ASST 57 53 . . 54 57 + CviJI RGCY 55 55 . . 54 57 + AluI AGCT 55 55 . . 55 60 + Cac8I GCNNGC 57 57 . . 65 70 + TatI WGTACW 65 69 . . 66 69 + Csp6I GTAC 66 68 . . 66 69 + RsaI GTAC 67 67 . . 85 88 + TspEI AATT 84 88 . . 91 94 + Hin6I GCGC 91 93 . . 91 94 + GlaI GCGC 92 92 . . 91 101 + MwoI GCNNNNNNNGC 97 94 . . 91 94 + HhaI GCGC 93 91 . . 93 103 + MwoI GCNNNNNNNGC 99 96 . . 93 99 + EspI* GCTNAGC 94 97 . . 94 98 + DdeI CTNAG 94 97 . . 98 101 + Hin6I GCGC 98 100 . . 98 101 + GlaI GCGC 99 99 . . 98 103 + Cac8I GCNNGC 100 100 . . 98 103 + BsePI GCGCGC 98 102 . . 98 101 + HhaI GCGC 100 98 . . 99 102 + FnuDII* CGCG 100 100 . . 100 103 + Hin6I GCGC 100 102 . . 100 103 + GlaI GCGC 101 101 . . 100 103 + HhaI GCGC 102 100 . . 107 110 + SetI ASST 110 106 . . 107 110 + CviJI RGCY 108 108 . . 107 110 + AluI AGCT 108 108 . . 112 115 + MseI TTAA 112 114 . . 119 122 + MaeI CTAG 119 121 . . 126 129 + DpnI GATC 127 127 . . 126 129 + BstKTI GATC 128 126 . . 126 129 + MboI GATC 125 129 . . 127 132 + ClaI ATCGAT 128 130 . . 128 131 + TaqI TCGA 128 130 . . 136 141 + ClaI ATCGAT 137 139 . . 137 140 + TaqI TCGA 137 139 . . 139 143 + TfiI GAWTC 139 142 . . 139 143 + HinfI GANTC 139 142 . . 142 145 + TaqI TCGA 142 144 . . 147 151 - BccI CCATC 141 142 . . 163 168 + SnaBI TACGTA 165 165 . . 163 168 + BsaAI YACGTR 165 165 . . 164 167 + TaiI ACGT 167 163 . . 164 167 + SetI ASST 167 163 . . 164 167 + MaeII ACGT 164 166 . . 166 169 + Csp6I GTAC 166 168 . . 166 169 + RsaI GTAC 167 167 . . 169 172 + AciI CCGC 169 171 . . 171 175 + TauI GCSGC 174 171 . . 171 175 + BlsI GCNGC 173 172 . . 171 175 + BisI GCNGC 172 173 . . 172 175 + AciI CCGC 172 174 . . 187 190 + SetI ASST 190 186 . . 185 190 - BspMI ACCTGC 176 180 . . 193 197 - SfaNI GCATC 183 187 . . 198 202 - Hin4II* CCTTC 192 191 . . 202 211 + BsaBI GATNNNNATC 206 206 . . 208 211 + DpnI GATC 209 209 . . 208 211 + BstKTI GATC 210 208 . . 208 211 + MboI GATC 207 211 . . 210 214 + Hpy188I TCNGA 212 211 . . 213 217 + TfiI GAWTC 213 216 . . 213 217 + HinfI GANTC 213 216 . . 217 221 + BssKI CCNGG 216 221 . . 217 221 + BseBI CCWGG 218 219 . . 217 221 + ScrFI CCNGG 218 219 . . 217 221 + EcoRII CCWGG 216 221 . . 220 223 + CviJI RGCY 221 221 . . 220 223 + HaeIII GGCC 221 221 . . 221 225 + TauI GCSGC 224 221 . . 221 225 + BlsI GCNGC 223 222 . . 221 225 + BisI GCNGC 222 223 . . 222 225 + AciI CCGC 222 224 . . 223 226 + FnuDII* CGCG 224 224 . . 233 236 + CviJI RGCY 234 234 . . 242 247 + NspI RCATGY 246 242 . . 243 246 + FatI CATG 242 246 . . 243 246 + NlaIII CATG 246 242 . . 243 246 + CviAII CATG 243 245 . . 245 248 + CviRI* TGCA 246 246 . . 246 256 + MwoI GCNNNNNNNGC 252 249 . . 246 251 + Cac8I GCNNGC 248 248 . . 258 263 + Eco31I GGTCTC 264 268 . . 259 263 + BsmAI GTCTC 264 268 . . 263 267 + DdeI CTNAG 263 266 . . 263 267 + BspCNI CTCAG 276 274 . . 263 267 + BseMII CTCAG 277 275 . . 264 269 + Hpy178III* TCNNGA 265 267 . . 271 274 + SetI ASST 274 270 . . 279 285 + TspRI CASTGNN 285 276 . . 278 282 - BsrI ACTGG 278 276 . . 293 297 + TauI GCSGC 296 293 . . 293 297 + BlsI GCNGC 295 294 . . 293 297 + BisI GCNGC 294 295 . . 296 300 + TauI GCSGC 299 296 . . 296 300 + BlsI GCNGC 298 297 . . 296 300 + BisI GCNGC 297 298 . . 293 296 - AciI CCGC 293 295 . . 296 299 - AciI CCGC 296 298 . . 301 304 + TspEI AATT 300 304 . . 303 308 + AsuII TTCGAA 304 306 . . 304 307 + TaqI TCGA 304 306 . . 311 315 + TspGWI ACGGA 326 324 . . 318 321 + TaiI ACGT 321 317 . . 318 321 + SetI ASST 321 317 . . 318 321 + MaeII ACGT 318 320 . . 318 323 + AflIII ACRYGT 318 322 . . 322 326 + MaeIII GTNAC 321 326 . . 313 323 - BsaXI ACNNNNNCTCC 335 332 305 302 333 338 + StyI CCWWGG 333 337 . . 333 338 + SecI* CCNNGG 333 337 . . 336 339 + SetI ASST 339 335 . . 343 348 + Hpy178III* TCNNGA 344 346 . . 343 348 + BetI* WCCGGW 343 347 . . 343 348 + BspMII* TCCGGA 343 347 . . 344 347 + HpaII CCGG 344 346 . . 349 354 + Hpy166II GTNNAC 351 351 . . 349 354 + HindII GTYRAC 351 351 . . 368 372 + TspDTI ATGAA 383 381 . . 370 374 + MboII GAAGA 382 381 . . 370 375 - Ksp632I* CTCTTC 365 368 . . 373 376 - MnlI CCTC 366 365 . . 382 385 + SetI ASST 385 381 . . 382 385 + CviJI RGCY 383 383 . . 382 385 + AluI AGCT 383 383 . . 390 395 + SalI GTCGAC 390 394 . . 390 395 + Hpy166II GTNNAC 392 392 . . 390 395 + HindII GTYRAC 392 392 . . 390 395 + AccI GTMKAC 391 393 . . 391 394 + TaqI TCGA 391 393 . . 393 402 + PshAI GACNNNNGTC 397 397 . . 394 398 + Tsp4CI* ACNGT 396 395 . . 428 432 + MaeIII GTNAC 427 432 . . 434 438 + TspDTI ATGAA 449 447 . . 436 440 + TfiI GAWTC 436 439 . . 436 440 + HinfI GANTC 436 439 . . 439 444 + Hpy178III* TCNNGA 440 442 . . 457 460 - MnlI CCTC 450 449 . . 462 467 + SpeI ACTAGT 462 466 . . 463 466 + MaeI CTAG 463 465 . . 477 482 + Hpy178III* TCNNGA 478 480 . . 481 485 + TfiI GAWTC 481 484 . . 481 485 + HinfI GANTC 481 484 . . 488 492 + BsmAI GTCTC 493 497 . . 495 500 + HindIII AAGCTT 495 499 . . 496 499 + SetI ASST 499 495 . . 496 499 + CviJI RGCY 497 497 . . 496 499 + AluI AGCT 497 497 . . 517 521 + MboII GAAGA 529 528 . . 519 524 + XhoII RGATCY 519 523 . . 519 524 + BglII AGATCT 519 523 . . 520 523 + DpnI GATC 521 521 . . 520 523 + BstKTI GATC 522 520 . . 520 523 + MboI GATC 519 523 . . 527 532 + DsaI* CCRYGG 527 531 . . 527 532 + StyI CCWWGG 527 531 . . 527 532 + NcoI CCATGG 527 531 . . 527 532 + SecI* CCNNGG 527 531 . . 528 531 + FatI CATG 527 531 . . 528 531 + NlaIII CATG 531 527 . . 528 531 + CviAII CATG 528 530 . . 539 542 + SetI ASST 542 538 . . 537 541 - HphI GGTGA 529 528 . . 548 551 + CviJI RGCY 549 549 . . 549 553 + BlsI GCNGC 551 550 . . 549 553 + BisI GCNGC 550 551 . . 549 553 + TseI GCWGC 549 552 . . 550 555 + PstI CTGCAG 554 550 . . 550 555 + SfeI* CTRYAG 550 554 . . 551 554 + CviRI* TGCA 552 552 . . 549 553 - BbvI GCAGC 536 540 . . 555 559 + MboII GAAGA 567 566 . . 555 560 + BbvII* GAAGAC 562 566 . . 566 569 + MseI TTAA 566 568 . . 582 587 + ApoI RAATTY 582 586 . . 583 586 + TspEI AATT 582 586 . . 599 602 + TaqI TCGA 599 601 . . 587 600 - AjuI GAANNNNNNNTTGG 612 607 580 575 603 606 + CviJI RGCY 604 604 . . 603 606 + HaeIII GGCC 604 604 . . 601 604 - MnlI CCTC 594 593 . . 605 609 + BssKI CCNGG 604 609 . . 605 609 + BseBI CCWGG 606 607 . . 605 609 + ScrFI CCNGG 606 607 . . 605 609 + EcoRII CCWGG 604 609 . . 614 619 + Hpy178III* TCNNGA 615 617 . . 615 621 + SauI* CCTNAGG 616 619 . . 616 620 + DdeI CTNAG 616 619 . . 620 623 + CviJI RGCY 621 621 . . 616 620 - BspCNI CTCAG 608 606 . . 620 623 + HaeIII GGCC 621 621 . . 616 620 - BseMII CTCAG 607 605 . . 618 621 - MnlI CCTC 611 610 . . 621 631 + MwoI GCNNNNNNNGC 627 624 . . 629 632 + CviRI* TGCA 630 630 . . 630 641 + AlfI GCANNNNNNTGC 619 617 653 651 630 641 - AlfI GCANNNNNNTGC 653 651 619 617 653 656 + CviRI* TGCA 654 654 . . 670 675 + AclI AACGTT 671 673 . . 671 674 + TaiI ACGT 674 670 . . 671 674 + SetI ASST 674 670 . . 671 674 + MaeII ACGT 671 673 . . 676 680 + BlsI GCNGC 678 677 . . 676 680 + BisI GCNGC 677 678 . . 676 680 + TseI GCWGC 676 679 . . 678 681 + CviRI* TGCA 679 679 . . 676 680 - BbvI GCAGC 663 667 . . 685 688 + CviJI RGCY 686 686 . . 688 692 + Hpy188I TCNGA 690 689 . . 679 690 - BcgI CGANNNNNNTGC 702 700 668 666 697 702 + Hpy166II GTNNAC 699 699 . . 697 702 + HindII GTYRAC 699 699 . . 700 704 + HgaI GACGC 709 714 . . 700 705 + AcyI GRCGYC 701 703 . . 711 715 + Hpy188I TCNGA 713 712 . . 714 717 + DpnI GATC 715 715 . . 714 717 + BstKTI GATC 716 714 . . 714 717 + MboI GATC 713 717 . . 716 719 + TaqI TCGA 716 718 . . 718 722 + MboII GAAGA 730 729 . . 721 726 + EcoRV GATATC 723 723 . . 741 745 - BceAI ACGGC 726 728 . . 748 751 + FatI CATG 747 751 . . 748 751 + NlaIII CATG 751 747 . . 748 751 + CviAII CATG 748 750 . . 752 756 + Hpy188I TCNGA 754 753 . . 761 766 + SfeI* CTRYAG 761 765 . . 772 783 + DrdI GACNNNNNNGTC 778 776 . . 779 783 + PleI GAGTC 787 788 . . 779 783 + MlyI GAGTC 788 788 . . 779 783 + HinfI GANTC 779 782 . . 797 800 + SetI ASST 800 796 . . 799 803 + MaeIII GTNAC 798 803 . . 812 816 + TfiI GAWTC 812 815 . . 812 816 + HinfI GANTC 812 815 . . 814 818 - TspDTI ATGAA 804 802 . . 820 824 + MboII GAAGA 832 831 . . 827 830 + MaeI CTAG 827 829 . . 834 837 + TspEI AATT 833 837 . . 837 840 + CviRI* TGCA 838 838 . . 884 887 + CviJI RGCY 885 885 . . 885 889 + TauI GCSGC 888 885 . . 885 889 + BlsI GCNGC 887 886 . . 885 889 + BisI GCNGC 886 887 . . 886 889 + AciI CCGC 886 888 . . 891 896 + AhaIII* TTTAAA 893 893 . . 892 895 + MseI TTAA 892 894 . . 895 900 + ApoI RAATTY 895 899 . . 896 899 + TspEI AATT 895 899 . . 899 905 + PfoI TCCNGGA 899 904 . . 900 904 + BssKI CCNGG 899 904 . . 900 904 + ScrFI CCNGG 901 902 . . 900 904 + CauII* CCSGG 901 902 . . 901 904 + HpaII CCGG 901 903 . . 904 908 + TfiI GAWTC 904 907 . . 904 908 + HinfI GANTC 904 907 . . 908 911 + AciI CCGC 908 910 . . 907 912 - EciI GGCGGA 897 895 . . 910 914 - BceAI ACGGC 895 897 . . 916 919 + DpnI GATC 917 917 . . 916 919 + BstKTI GATC 918 916 . . 916 919 + MboI GATC 915 919 . . 942 945 + DpnI GATC 943 943 . . 942 945 + BstKTI GATC 944 942 . . 942 945 + MboI GATC 941 945 . . 943 948 + ClaI ATCGAT 944 946 . . 944 947 + TaqI TCGA 944 946 . . 946 950 - BccI CCATC 940 941 . . 954 957 + SetI ASST 957 953 . . 952 956 - Hin4II* CCTTC 946 945 . . 976 986 + BplI GAGNNNNNCTC 967 962 999 994 985 989 + Hpy188I TCNGA 987 986 . . 986 990 + DdeI CTNAG 986 989 . . 976 986 - BplI GAGNNNNNCTC 999 994 967 962 986 990 - BspCNI CTCAG 978 976 . . 986 990 - BseMII CTCAG 977 975 . . 988 991 - MnlI CCTC 981 980 . . 997 1001 + MboII GAAGA 1009 1008 . . 997 1002 + BbvII* GAAGAC 1004 1008 . . 1008 1013 + Hpy166II GTNNAC 1010 1010 . . 1008 1013 + BssNAI GTATAC 1010 1010 . . 1008 1013 + AccI GTMKAC 1009 1011 . . 1020 1025 + BetI* WCCGGW 1020 1024 . . 1020 1030 + BaeI ACNNNNGTAYC 1009 1004 1042 1037 1021 1024 + HpaII CCGG 1021 1023 . . 1026 1031 + BciVI GTATCC 1037 1036 . . 1030 1034 + BssKI CCNGG 1029 1034 . . 1030 1034 + BseBI CCWGG 1031 1032 . . 1030 1034 + ScrFI CCNGG 1031 1032 . . 1030 1034 + EcoRII CCWGG 1029 1034 . . 1040 1044 - HphI GGTGA 1032 1031 . . 1049 1052 + MseI TTAA 1049 1051 . . 1061 1065 + TspDTI ATGAA 1076 1074 . . 1064 1074 + FalI AAGNNNNNCTT 1055 1050 1087 1082 1068 1073 + HaeII RGCGCY 1072 1068 . . 1069 1072 + Hin6I GCGC 1069 1071 . . 1069 1072 + GlaI GCGC 1070 1070 . . 1069 1072 + HhaI GCGC 1071 1069 . . 1064 1074 - FalI AAGNNNNNCTT 1087 1082 1055 1050 1081 1084 + SetI ASST 1084 1080 . . 1105 1108 + Csp6I GTAC 1105 1107 . . 1105 1108 + RsaI GTAC 1106 1106 . . 1113 1119 + TspRI CASTGNN 1119 1110 . . 1114 1118 + Tsp4CI* ACNGT 1116 1115 . . 1126 1129 + SetI ASST 1129 1125 . . 1127 1131 + Hin4II* CCTTC 1137 1136 . . 1135 1139 + HphI GGTGA 1147 1146 . . 1136 1140 + Tsp45I GTSAC 1135 1140 . . 1136 1140 + MaeIII GTNAC 1135 1140 . . 1145 1148 + TaqI TCGA 1145 1147 . . 1151 1154 + CviJI RGCY 1152 1152 . . 1151 1154 + HaeIII GGCC 1152 1152 . . 1176 1180 + TfiI GAWTC 1176 1179 . . 1176 1180 + HinfI GANTC 1176 1179 . . 1181 1185 + BceAI ACGGC 1197 1199 . . 1183 1186 + CviJI RGCY 1184 1184 . . 1190 1195 + BspLU11I* ACATGT 1190 1194 . . 1190 1195 + NspI RCATGY 1194 1190 . . 1190 1195 + AflIII ACRYGT 1190 1194 . . 1191 1194 + FatI CATG 1190 1194 . . 1191 1194 + NlaIII CATG 1194 1190 . . 1191 1194 + CviAII CATG 1191 1193 . . 1196 1199 + TaqI TCGA 1196 1198 . . 1199 1203 + TspDTI ATGAA 1214 1212 . . 1203 1206 + TspEI AATT 1202 1206 . . 1213 1223 + MwoI GCNNNNNNNGC 1219 1216 . . 1215 1220 + Hpy178III* TCNNGA 1216 1218 . . 1217 1225 + AlwNI CAGNNNCTG 1222 1219 . . 1214 1219 - Eco57MI CTGRAG 1199 1197 . . 1214 1219 - GsuI CTGGAG 1199 1197 . . 1219 1223 - SfaNI GCATC 1209 1213 . . 1223 1228 + Eco57MI CTGRAG 1244 1242 . . 1223 1228 + Eco57I CTGAAG 1244 1242 . . 1227 1230 + SetI ASST 1230 1226 . . 1228 1232 + HphI GGTGA 1240 1239 . . 1225 1229 - Hin4II* CCTTC 1219 1218 . . 1232 1237 + TatI WGTACW 1232 1236 . . 1233 1236 + Csp6I GTAC 1233 1235 . . 1233 1236 + RsaI GTAC 1234 1234 . . 1241 1244 + MnlI CCTC 1251 1250 . . 1231 1241 - Hin4I GAYNNNNNVTC 1254 1249 1222 1217 1257 1260 + FatI CATG 1256 1260 . . 1257 1260 + NlaIII CATG 1260 1256 . . 1257 1260 + CviAII CATG 1257 1259 . . 1268 1272 - TspGWI ACGGA 1258 1256 . . 1275 1279 + HphI GGTGA 1287 1286 . . 1273 1278 - TaqII CACCCA 1263 1261 . . 1285 1289 + TfiI GAWTC 1285 1288 . . 1285 1289 + HinfI GANTC 1285 1288 . . 1302 1305 + SetI ASST 1305 1301 . . 1303 1308 + NlaIV GGNNCC 1305 1305 . . 1307 1313 + PasI CCCWGGG 1308 1311 . . 1307 1312 + SecI* CCNNGG 1307 1311 . . 1308 1312 + BssKI CCNGG 1307 1312 . . 1308 1312 + BseBI CCWGG 1309 1310 . . 1308 1313 + SecI* CCNNGG 1308 1312 . . 1308 1312 + ScrFI CCNGG 1309 1310 . . 1308 1312 + EcoRII CCWGG 1307 1312 . . 1314 1319 + AhaIII* TTTAAA 1316 1316 . . 1315 1318 + MseI TTAA 1315 1317 . . 1320 1323 + SetI ASST 1323 1319 . . 1320 1323 + CviJI RGCY 1321 1321 . . 1320 1323 + AluI AGCT 1321 1321 . . 1324 1328 + MaeIII GTNAC 1323 1328 . . 1334 1338 + DdeI CTNAG 1334 1337 . . 1337 1340 + SetI ASST 1340 1336 . . 1337 1340 + CviJI RGCY 1338 1338 . . 1337 1340 + AluI AGCT 1338 1338 . . 1339 1342 + MaeI CTAG 1339 1341 . . 1341 1344 + SetI ASST 1344 1340 . . 1344 1349 + PsiI TTATAA 1346 1346 . . 1352 1357 + MfeI CAATTG 1352 1356 . . 1353 1356 + TspEI AATT 1352 1356 . . 1359 1363 + BsrI ACTGG 1364 1362 . . 1362 1367 + XhoII RGATCY 1362 1366 . . 1362 1367 + NlaIV GGNNCC 1364 1364 . . 1362 1367 + BamHI GGATCC 1362 1366 . . 1362 1366 + BinI* GGATC 1370 1371 . . 1363 1366 + DpnI GATC 1364 1364 . . 1363 1366 + BstKTI GATC 1365 1363 . . 1363 1366 + MboI GATC 1362 1366 . . 1365 1370 + Hpy178III* TCNNGA 1366 1368 . . 1363 1367 - BinI* GGATC 1357 1358 . . 1370 1373 + TspEI AATT 1369 1373 . . 1371 1376 + VspI ATTAAT 1372 1374 . . 1372 1375 + MseI TTAA 1372 1374 . . 1377 1381 + HgaI GACGC 1386 1391 . . 1377 1382 + AcyI GRCGYC 1378 1380 . . 1380 1384 - BceAI ACGGC 1365 1367 . . 1385 1390 + EcoT22I ATGCAT 1389 1385 . . 1386 1389 + CviRI* TGCA 1387 1387 . . 1397 1400 + CviJI RGCY 1398 1398 . . 1406 1409 + SetI ASST 1409 1405 . . 1411 1415 + Hpy188I TCNGA 1413 1412 . . 1415 1420 + SspI AATATT 1417 1417 . . 1426 1430 + Hpy188I TCNGA 1428 1427 . . 1431 1434 + CviRI* TGCA 1432 1432 . . 1429 1433 - SfaNI GCATC 1419 1423 . . 1440 1445 + SnaBI TACGTA 1442 1442 . . 1440 1445 + BsaAI YACGTR 1442 1442 . . 1441 1444 + TaiI ACGT 1444 1440 . . 1441 1444 + SetI ASST 1444 1440 . . 1441 1444 + MaeII ACGT 1441 1443 . . 1448 1451 + SetI ASST 1451 1447 . . 1455 1458 + FatI CATG 1454 1458 . . 1455 1458 + NlaIII CATG 1458 1454 . . 1455 1458 + CviAII CATG 1455 1457 . . 1456 1460 + TspDTI ATGAA 1471 1469 . . 1466 1470 - TspDTI ATGAA 1456 1454 . . 1468 1472 - FokI GGATG 1454 1458 . . 1468 1472 - BseGI GGATG 1467 1465 . . 1489 1494 + TatI WGTACW 1489 1493 . . 1490 1493 + Csp6I GTAC 1490 1492 . . 1490 1493 + RsaI GTAC 1491 1491 . . 1509 1513 + BssKI CCNGG 1508 1513 . . 1509 1513 + ScrFI CCNGG 1510 1511 . . 1509 1513 + CauII* CCSGG 1510 1511 . . 1510 1513 + HpaII CCGG 1510 1512 . . 1512 1516 + FokI GGATG 1525 1529 . . 1512 1516 + BseGI GGATG 1518 1516 . . 1514 1518 + TspDTI ATGAA 1529 1527 . . 1531 1536 + KpnI GGTACC 1535 1531 . . 1531 1536 + NlaIV GGNNCC 1533 1533 . . 1531 1536 + HgiCI* GGYRCC 1531 1535 . . 1531 1536 + Acc65I GGTACC 1531 1535 . . 1532 1535 + Csp6I GTAC 1532 1534 . . 1532 1535 + RsaI GTAC 1533 1533 . . 1534 1539 + Cfr10I RCCGGY 1534 1538 . . 1534 1539 + BetI* WCCGGW 1534 1538 . . 1534 1539 + AgeI ACCGGT 1534 1538 . . 1535 1538 + HpaII CCGG 1535 1537 . . 1538 1541 + Csp6I GTAC 1538 1540 . . 1538 1541 + RsaI GTAC 1539 1539 . . 1560 1564 - BccI CCATC 1554 1555 . . 1568 1573 + HindIII AAGCTT 1568 1572 . . 1569 1572 + SetI ASST 1572 1568 . . 1569 1572 + CviJI RGCY 1570 1570 . . 1569 1572 + AluI AGCT 1570 1570 . . 1582 1587 + SspI AATATT 1584 1584 . . 1587 1591 - MboII GAAGA 1579 1578 . . 1608 1613 + XhoII RGATCY 1608 1612 . . 1609 1612 + DpnI GATC 1610 1610 . . 1609 1612 + BstKTI GATC 1611 1609 . . 1609 1612 + MboI GATC 1608 1612 . . 1613 1623 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 1619 1616 . . 1609 1613 - BinI* GGATC 1603 1604 . . 1621 1624 + SetI ASST 1624 1620 . . 1620 1623 - MnlI CCTC 1613 1612 . . 1630 1639 + BsaBI GATNNNNATC 1634 1634 . . 1630 1634 - BccI CCATC 1624 1625 . . 1641 1646 + XbaI TCTAGA 1641 1645 . . 1641 1646 + Hpy178III* TCNNGA 1642 1644 . . 1638 1642 - MboII GAAGA 1630 1629 . . 1642 1645 + MaeI CTAG 1642 1644 . . 1645 1649 + TfiI GAWTC 1645 1648 . . 1645 1649 + HinfI GANTC 1645 1648 . . 1648 1652 + Hpy188I TCNGA 1650 1649 . . 1651 1655 - BsmAI GTCTC 1645 1649 . . 1657 1662 + BsaAI YACGTR 1659 1659 . . 1658 1661 + TaiI ACGT 1661 1657 . . 1658 1661 + SetI ASST 1661 1657 . . 1658 1661 + MaeII ACGT 1658 1660 . . 1664 1669 + Hpy166II GTNNAC 1666 1666 . . 1661 1666 - TaqII CACCCA 1651 1649 . . 1668 1673 + BspLU11I* ACATGT 1668 1672 . . 1668 1673 + NspI RCATGY 1672 1668 . . 1668 1673 + AflIII ACRYGT 1668 1672 . . 1669 1672 + FatI CATG 1668 1672 . . 1669 1672 + NlaIII CATG 1672 1668 . . 1669 1672 + CviAII CATG 1669 1671 . . 1675 1679 + PleI GAGTC 1683 1684 . . 1675 1679 + MlyI GAGTC 1684 1684 . . 1675 1679 + HinfI GANTC 1675 1678 . . 1686 1689 + SetI ASST 1689 1685 . . 1686 1689 + CviJI RGCY 1687 1687 . . 1686 1689 + AluI AGCT 1687 1687 . . 1710 1714 + MboII GAAGA 1722 1721 . . 1713 1722 + XmnI GAANNNNTTC 1717 1717 . . 1715 1719 + TspDTI ATGAA 1730 1728 . . 1717 1722 + EcoRI GAATTC 1717 1721 . . 1717 1722 + ApoI RAATTY 1717 1721 . . 1718 1721 + TspEI AATT 1717 1721 . . 1721 1726 + Hpy178III* TCNNGA 1722 1724 . . 1728 1733 + XhoII RGATCY 1728 1732 . . 1729 1732 + DpnI GATC 1730 1730 . . 1729 1732 + BstKTI GATC 1731 1729 . . 1729 1732 + MboI GATC 1728 1732 . . 1732 1736 + Hin4II* CCTTC 1742 1741 . . 1729 1733 - BinI* GGATC 1723 1724 . . 1745 1749 + TspDTI ATGAA 1760 1758 . . 1748 1751 + TspEI AATT 1747 1751 . . 1760 1763 + TspEI AATT 1759 1763 . . 1769 1774 + HindIII AAGCTT 1769 1773 . . 1770 1773 + SetI ASST 1773 1769 . . 1770 1773 + CviJI RGCY 1771 1771 . . 1770 1773 + AluI AGCT 1771 1771 . . 1777 1782 + ApoI RAATTY 1777 1781 . . 1778 1781 + TspEI AATT 1777 1781 . . 1806 1812 + TspRI CASTGNN 1812 1803 . . 1805 1809 - BsrI ACTGG 1805 1803 . . 1819 1823 + MaeIII GTNAC 1818 1823 . . 1824 1829 + ApoI RAATTY 1824 1828 . . 1825 1828 + TspEI AATT 1824 1828 . . 1831 1834 - MnlI CCTC 1824 1823 . . 1859 1862 + TspEI AATT 1858 1862 . . 1872 1876 - Hin4II* CCTTC 1866 1865 . . 1899 1902 + SetI ASST 1902 1898 . . 1905 1908 + DpnI GATC 1906 1906 . . 1905 1908 + BstKTI GATC 1907 1905 . . 1905 1908 + MboI GATC 1904 1908 . . 1912 1921 + MslI CAYNNNNRTG 1916 1916 . . 1912 1915 + FatI CATG 1911 1915 . . 1912 1915 + NlaIII CATG 1915 1911 . . 1912 1915 + CviAII CATG 1912 1914 . . 1918 1928 + Hin4I GAYNNNNNVTC 1909 1904 1941 1936 1925 1928 + MnlI CCTC 1935 1934 . . 1932 1935 + Csp6I GTAC 1932 1934 . . 1932 1935 + RsaI GTAC 1933 1933 . . 1943 1948 + Hpy178III* TCNNGA 1944 1946 . . 1943 1948 + BspHI TCATGA 1943 1947 . . 1944 1947 + FatI CATG 1943 1947 . . 1944 1947 + NlaIII CATG 1947 1943 . . 1944 1947 + CviAII CATG 1944 1946 . . 1986 1989 + Hin6I GCGC 1986 1988 . . 1986 1989 + GlaI GCGC 1987 1987 . . 1986 1989 + HhaI GCGC 1988 1986 . . 1987 1990 + FnuDII* CGCG 1988 1988 . . 1997 2000 + MaeI CTAG 1997 1999 . . 2009 2012 + MseI TTAA 2009 2011 . . 2017 2021 + BssKI CCNGG 2016 2021 . . 2017 2021 + ScrFI CCNGG 2018 2019 . . 2017 2021 + CauII* CCSGG 2018 2019 . . 2018 2021 + HpaII CCGG 2018 2020 . . 2026 2029 + SetI ASST 2029 2025 . . 2031 2034 + CviRI* TGCA 2032 2032 . . 2041 2044 + MseI TTAA 2041 2043 . . 2049 2052 + CviJI RGCY 2050 2050 . . 2057 2062 + BseRI GAGGAG 2072 2070 . . 2057 2060 - MnlI CCTC 2050 2049 . . 2062 2067 + EcoRI GAATTC 2062 2066 . . 2062 2071 + XmnI GAANNNNTTC 2066 2066 . . 2062 2067 + ApoI RAATTY 2062 2066 . . 2063 2066 + TspEI AATT 2062 2066 . . 2072 2083 + BstXI CCANNNNNNTGG 2079 2075 . . 2072 2076 - BsrI ACTGG 2072 2070 . . 2071 2076 - BfiI ACTGGG 2066 2065 . . 2082 2086 + FokI GGATG 2095 2099 . . 2082 2086 + BseGI GGATG 2088 2086 . . 2079 2083 - BccI CCATC 2073 2074 . . 2094 2097 + FatI CATG 2093 2097 . . 2094 2097 + NlaIII CATG 2097 2093 . . 2094 2097 + CviAII CATG 2094 2096 . . 2096 2101 + BclI TGATCA 2096 2100 . . 2097 2100 + DpnI GATC 2098 2098 . . 2097 2100 + BstKTI GATC 2099 2097 . . 2097 2100 + MboI GATC 2096 2100 . . 2103 2108 + Cac8I GCNNGC 2105 2105 . . 2106 2109 + CviRI* TGCA 2107 2107 . . 2119 2123 - BsmAI GTCTC 2113 2117 . . 2171 2175 + TspDTI ATGAA 2186 2184 . . 2176 2180 + DdeI CTNAG 2176 2179 . . 2180 2184 + MaeIII GTNAC 2179 2184 . . 2210 2215 + AclI AACGTT 2211 2213 . . 2211 2214 + TaiI ACGT 2214 2210 . . 2211 2214 + SetI ASST 2214 2210 . . 2211 2214 + MaeII ACGT 2211 2213 . . 2215 2218 + MseI TTAA 2215 2217 . . 2222 2227 + SspI AATATT 2224 2224 . . 2249 2252 + MseI TTAA 2249 2251 . . 2257 2261 + Hpy188I TCNGA 2259 2258 . . 2262 2265 + TspEI AATT 2261 2265 . . 2267 2270 + TaqI TCGA 2267 2269 . . 2277 2280 + CviJI RGCY 2278 2278 . . 2309 2312 + TaiI ACGT 2312 2308 . . 2309 2312 + SetI ASST 2312 2308 . . 2309 2312 + MaeII ACGT 2309 2311 . . 2310 2314 + Hpy99I CGWCG 2314 2309 . . 2312 2315 + TaqI TCGA 2312 2314 . . 2317 2321 + Tsp4CI* ACNGT 2319 2318 . . 2331 2336 + Hpy178III* TCNNGA 2332 2334 . . 2342 2346 + MaeIII GTNAC 2341 2346 . . 2347 2352 + EcoRI GAATTC 2347 2351 . . 2347 2352 + ApoI RAATTY 2347 2351 . . 2348 2351 + TspEI AATT 2347 2351 . . 2355 2358 + SetI ASST 2358 2354 . . 2360 2365 + TsoI TARCCA 2376 2374 . . 2361 2364 + CviJI RGCY 2362 2362 . . 2363 2373 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2369 2366 . . 2363 2373 + PflMI CCANNNNNTGG 2369 2366 . . 2373 2377 - Hin4II* CCTTC 2367 2366 . . 2391 2394 + TspEI AATT 2390 2394 . . 2398 2402 + BccI CCATC 2406 2407 . . 2401 2405 + Hpy188I TCNGA 2403 2402 . . 2409 2414 + NspI RCATGY 2413 2409 . . 2409 2414 + Cac8I GCNNGC 2411 2411 . . 2409 2414 + SphI GCATGC 2413 2409 . . 2410 2413 + FatI CATG 2409 2413 . . 2410 2413 + NlaIII CATG 2413 2409 . . 2410 2413 + CviAII CATG 2410 2412 . . 2417 2421 - BsmAI GTCTC 2411 2415 . . 2417 2422 - Esp3I CGTCTC 2411 2415 . . 2424 2427 + CviJI RGCY 2425 2425 . . 2424 2427 + HaeIII GGCC 2425 2425 . . 2422 2425 - MnlI CCTC 2415 2414 . . 2449 2453 + HinfI GANTC 2449 2452 . . 2449 2453 - PleI GAGTC 2443 2444 . . 2449 2453 - MlyI GAGTC 2443 2443 . . 2459 2462 + TspEI AATT 2458 2462 . . 2463 2466 + SetI ASST 2466 2462 . . 2463 2466 + CviJI RGCY 2464 2464 . . 2463 2466 + AluI AGCT 2464 2464 . . 2481 2486 + EcoRI GAATTC 2481 2485 . . 2481 2486 + ApoI RAATTY 2481 2485 . . 2482 2485 + TspEI AATT 2481 2485 . . 2505 2508 - MnlI CCTC 2498 2497 . . 2512 2515 + CviJI RGCY 2513 2513 . . 2528 2539 + BstXI CCANNNNNNTGG 2535 2531 . . 2528 2533 + DsaI* CCRYGG 2528 2532 . . 2528 2533 + StyI CCWWGG 2528 2532 . . 2528 2533 + NcoI CCATGG 2528 2532 . . 2528 2533 + SecI* CCNNGG 2528 2532 . . 2529 2538 + MslI CAYNNNNRTG 2533 2533 . . 2529 2532 + FatI CATG 2528 2532 . . 2529 2532 + NlaIII CATG 2532 2528 . . 2529 2532 + CviAII CATG 2529 2531 . . 2539 2542 - AciI CCGC 2539 2541 . . 2539 2543 - FauI CCCGC 2532 2534 . . 2547 2552 + BsaAI YACGTR 2549 2549 . . 2548 2551 + TaiI ACGT 2551 2547 . . 2548 2551 + SetI ASST 2551 2547 . . 2548 2551 + MaeII ACGT 2548 2550 . . 2548 2553 + AflIII ACRYGT 2548 2552 . . 2554 2557 + MseI TTAA 2554 2556 . . 2559 2562 + SetI ASST 2562 2558 . . 2560 2565 + NlaIV GGNNCC 2562 2562 . . 2560 2565 + HgiCI* GGYRCC 2560 2564 . . 2568 2571 + DpnI GATC 2569 2569 . . 2568 2571 + BstKTI GATC 2570 2568 . . 2568 2571 + MboI GATC 2567 2571 . . 2571 2580 + MslI CAYNNNNRTG 2575 2575 . . 2586 2589 + SetI ASST 2589 2585 . . 2586 2589 + CviJI RGCY 2587 2587 . . 2586 2589 + AluI AGCT 2587 2587 . . 2606 2610 + MboII GAAGA 2618 2617 . . 2606 2611 + BbvII* GAAGAC 2613 2617 . . 2618 2621 + TspEI AATT 2617 2621 . . 2629 2633 - BccI CCATC 2623 2624 . . 2698 2703 + HindIII AAGCTT 2698 2702 . . 2699 2702 + SetI ASST 2702 2698 . . 2699 2702 + CviJI RGCY 2700 2700 . . 2699 2702 + AluI AGCT 2700 2700 . . 2717 2720 + FatI CATG 2716 2720 . . 2717 2720 + NlaIII CATG 2720 2716 . . 2717 2720 + CviAII CATG 2717 2719 . . 2724 2727 + FatI CATG 2723 2727 . . 2724 2727 + NlaIII CATG 2727 2723 . . 2724 2727 + CviAII CATG 2724 2726 . . 2731 2734 + TspEI AATT 2730 2734 . . 2740 2745 + Hpy166II GTNNAC 2742 2742 . . 2742 2746 - HphI GGTGA 2734 2733 . . 2751 2756 + Hpy166II GTNNAC 2753 2753 . . 2757 2761 + TfiI GAWTC 2757 2760 . . 2757 2761 + HinfI GANTC 2757 2760 . . 2760 2764 - HphI GGTGA 2752 2751 . . 2774 2777 + TspEI AATT 2773 2777 . . 2776 2779 + MseI TTAA 2776 2778 . . 2805 2809 + HgaI GACGC 2814 2819 . . 2803 2807 - BsmAI GTCTC 2797 2801 . . 2803 2808 - Esp3I CGTCTC 2797 2801 . . 2810 2814 + Tsp4CI* ACNGT 2812 2811 . . 2811 2817 + TspRI CASTGNN 2817 2808 . . 2830 2835 + AsuII TTCGAA 2831 2833 . . 2831 2834 + TaqI TCGA 2831 2833 . . 2836 2841 + Hpy166II GTNNAC 2838 2838 . . 2836 2841 + HindII GTYRAC 2838 2838 . . 2840 2844 + TspGWI ACGGA 2855 2853 . . 2842 2846 + BmgT120I GGNCC 2843 2844 . . 2842 2846 + AvaII GGWCC 2842 2845 . . 2842 2846 + AsuI* GGNCC 2842 2845 . . 2853 2856 + CviJI RGCY 2854 2854 . . 2853 2856 + HaeIII GGCC 2854 2854 . . 2856 2859 + FatI CATG 2855 2859 . . 2856 2859 + NlaIII CATG 2859 2855 . . 2856 2859 + CviAII CATG 2856 2858 . . 2867 2870 + MaeI CTAG 2867 2869 . . 2873 2878 + StyI CCWWGG 2873 2877 . . 2873 2878 + SecI* CCNNGG 2873 2877 . . 2878 2882 + MboII GAAGA 2890 2889 . . 2881 2885 - Hin4II* CCTTC 2875 2874 . . 2889 2892 + SetI ASST 2892 2888 . . 2903 2913 + Hin4I GAYNNNNNVTC 2894 2889 2926 2921 2903 2913 - Hin4I GAYNNNNNVTC 2926 2921 2894 2889 2912 2916 - MboII GAAGA 2904 2903 . . 2911 2916 - BbvII* GAAGAC 2904 2908 . . 2918 2922 + TspDTI ATGAA 2933 2931 . . 2920 2924 + MboII GAAGA 2932 2931 . . 2920 2925 + BbvII* GAAGAC 2927 2931 . . 2924 2928 + BceAI ACGGC 2940 2942 . . 2926 2929 + CviJI RGCY 2927 2927 . . 2946 2949 + SetI ASST 2949 2945 . . 2954 2957 + TspEI AATT 2953 2957 . . 2958 2962 + MboII GAAGA 2970 2969 . . 2958 2963 - Ksp632I* CTCTTC 2953 2956 . . 2961 2964 - MnlI CCTC 2954 2953 . . 2968 2972 + HphI GGTGA 2980 2979 . . 2972 2975 + TspEI AATT 2971 2975 . . 2988 2993 + ApoI RAATTY 2988 2992 . . 2989 2992 + TspEI AATT 2988 2992 . . 3011 3014 + SetI ASST 3014 3010 . . 3024 3027 + SetI ASST 3027 3023 . . 3025 3029 + HphI GGTGA 3037 3036 . . 3022 3026 - Hin4II* CCTTC 3016 3015 . . 3040 3044 + FokI GGATG 3053 3057 . . 3040 3044 + BseGI GGATG 3046 3044 . . 3037 3041 - Hin4II* CCTTC 3031 3030 . . 3044 3048 + MaeIII GTNAC 3043 3048 . . 3047 3051 + Tsp4CI* ACNGT 3049 3048 . . 3048 3054 + TspRI CASTGNN 3054 3045 . . 3053 3058 + SfeI* CTRYAG 3053 3057 . . 3058 3063 + Cac8I GCNNGC 3060 3060 . . 3068 3072 + MaeIII GTNAC 3067 3072 . . 3071 3075 + Tsp4CI* ACNGT 3073 3072 . . 3076 3081 - TsoI TARCCA 3066 3064 . . 3087 3092 + Hpy178III* TCNNGA 3088 3090 . . 3091 3095 + TfiI GAWTC 3091 3094 . . 3091 3095 + HinfI GANTC 3091 3094 . . 3097 3100 + FatI CATG 3096 3100 . . 3097 3100 + NlaIII CATG 3100 3096 . . 3097 3100 + CviAII CATG 3097 3099 . . 3112 3116 + MboII GAAGA 3124 3123 . . 3116 3120 + TspDTI ATGAA 3131 3129 . . 3118 3122 + MboII GAAGA 3130 3129 . . 3118 3123 + BbvII* GAAGAC 3125 3129 . . 3121 3129 + Tth111I GACNNNGTC 3124 3125 . . 3165 3170 + AhaIII* TTTAAA 3167 3167 . . 3166 3169 + MseI TTAA 3166 3168 . . 3176 3180 + TspDTI ATGAA 3191 3189 . . 3178 3182 - Hin4II* CCTTC 3172 3171 . . 3203 3207 + Hpy99I CGWCG 3207 3202 . . 3205 3209 + BceAI ACGGC 3221 3223 . . 3232 3236 + HphI GGTGA 3244 3243 . . 3230 3235 - TaqII CACCCA 3220 3218 . . 3235 3239 + MboII GAAGA 3247 3246 . . 3255 3258 + SetI ASST 3258 3254 . . 3257 3262 + Hpy166II GTNNAC 3259 3259 . . 3257 3262 + AccI GTMKAC 3258 3260 . . 3288 3291 + SetI ASST 3291 3287 . . 3297 3300 + CviRI* TGCA 3298 3298 . . 3300 3303 + SetI ASST 3303 3299 . . 3304 3308 + MaeIII GTNAC 3303 3308 . . 3315 3318 + CviJI RGCY 3316 3316 . . 3322 3326 - BsrI ACTGG 3322 3320 . . 3330 3335 + SspI AATATT 3332 3332 . . 3338 3343 + NspBII* CMGCKG 3340 3340 . . 3340 3343 - AciI CCGC 3340 3342 . . 3350 3354 + BccI CCATC 3358 3359 . . 3350 3360 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 3356 3353 . . 3358 3361 + SetI ASST 3361 3357 . . 3366 3370 + Hpy188I TCNGA 3368 3367 . . 3367 3371 + DdeI CTNAG 3367 3370 . . 3367 3371 - BspCNI CTCAG 3359 3357 . . 3367 3371 - BseMII CTCAG 3358 3356 . . 3369 3372 - MnlI CCTC 3362 3361 . . 3372 3377 + BtgZI GCGATG 3387 3391 . . 3378 3388 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3369 3364 3401 3396 3374 3378 - BccI CCATC 3368 3369 . . 3384 3389 + XhoII RGATCY 3384 3388 . . 3385 3388 + DpnI GATC 3386 3386 . . 3385 3388 + BstKTI GATC 3387 3385 . . 3385 3388 + MboI GATC 3384 3388 . . 3378 3388 - Hin4I GAYNNNNNVTC 3401 3396 3369 3364 3388 3392 + BccI CCATC 3396 3397 . . 3385 3389 - BinI* GGATC 3379 3380 . . 3397 3401 + MboII GAAGA 3409 3408 . . 3399 3404 + XhoII RGATCY 3399 3403 . . 3399 3404 + BglII AGATCT 3399 3403 . . 3400 3403 + DpnI GATC 3401 3401 . . 3400 3403 + BstKTI GATC 3402 3400 . . 3400 3403 + MboI GATC 3399 3403 . . 3402 3407 + Hpy178III* TCNNGA 3403 3405 . . 3406 3411 + EcoRV GATATC 3408 3408 . . 3410 3414 + Hpy188I TCNGA 3412 3411 . . 3421 3426 + ClaI ATCGAT 3422 3424 . . 3422 3425 + TaqI TCGA 3422 3424 . . 3451 3456 + XhoII RGATCY 3451 3455 . . 3451 3455 + BinI* GGATC 3459 3460 . . 3452 3455 + DpnI GATC 3453 3453 . . 3452 3455 + BstKTI GATC 3454 3452 . . 3452 3455 + MboI GATC 3451 3455 . . 3471 3474 + TspEI AATT 3470 3474 . . 3482 3487 + EcoP15I CAGCAG 3512 3514 . . 3484 3488 + BlsI GCNGC 3486 3485 . . 3484 3488 + BisI GCNGC 3485 3486 . . 3484 3488 + BbvI GCAGC 3496 3500 . . 3484 3488 + TseI GCWGC 3484 3487 . . 3514 3519 + StyI CCWWGG 3514 3518 . . 3514 3519 + SecI* CCNNGG 3514 3518 . . 3528 3533 + Hpy178III* TCNNGA 3529 3531 . . 3526 3530 - FokI GGATG 3512 3516 . . 3526 3530 - BseGI GGATG 3525 3523 . . 3536 3539 + CviJI RGCY 3537 3537 . . 3535 3540 - TsoI TARCCA 3525 3523 . . 3562 3565 - MnlI CCTC 3555 3554 . . 3561 3571 - BsaXI ACNNNNNCTCC 3583 3580 3553 3550 3572 3575 + MseI TTAA 3572 3574 . . 3587 3592 + TsoI TARCCA 3603 3601 . . 3592 3597 + ApoI RAATTY 3592 3596 . . 3593 3596 + TspEI AATT 3592 3596 . . 3600 3605 + AsuII TTCGAA 3601 3603 . . 3601 3604 + TaqI TCGA 3601 3603 . . 3603 3607 + MboII GAAGA 3615 3614 . . 3603 3608 + BbvII* GAAGAC 3610 3614 . . 3616 3619 + Csp6I GTAC 3616 3618 . . 3616 3619 + RsaI GTAC 3617 3617 . . 3619 3629 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 3625 3622 . . 3640 3645 + EcoRV GATATC 3642 3642 . . 3644 3647 + TaqI TCGA 3644 3646 . . 3646 3649 - MnlI CCTC 3639 3638 . . 3664 3668 + Tsp4CI* ACNGT 3666 3665 . . 3665 3670 + SfeI* CTRYAG 3665 3669 . . 3670 3674 + MboII GAAGA 3682 3681 . . 3673 3677 + MboII GAAGA 3685 3684 . . 3687 3690 + TspEI AATT 3686 3690 . . 3689 3692 + MseI TTAA 3689 3691 . . 3693 3696 + TspEI AATT 3692 3696 . . 3696 3699 + CviRI* TGCA 3697 3697 . . 3717 3720 + CviJI RGCY 3718 3718 . . 3721 3726 + BciVI GTATCC 3732 3731 . . 3718 3722 - BceAI ACGGC 3703 3705 . . 3729 3732 - MnlI CCTC 3722 3721 . . 3743 3746 + SetI ASST 3746 3742 . . 3743 3746 + CviJI RGCY 3744 3744 . . 3743 3746 + AluI AGCT 3744 3744 . . 3752 3756 + TspDTI ATGAA 3767 3765 . . 3754 3758 + MboII GAAGA 3766 3765 . . 3757 3761 + MboII GAAGA 3769 3768 . . 3759 3764 + XhoII RGATCY 3759 3763 . . 3760 3763 + DpnI GATC 3761 3761 . . 3760 3763 + BstKTI GATC 3762 3760 . . 3760 3763 + MboI GATC 3759 3763 . . 3760 3764 - BinI* GGATC 3754 3755 . . 3765 3770 + SpeI ACTAGT 3765 3769 . . 3766 3769 + MaeI CTAG 3766 3768 . . 3763 3774 - CspCI CAANNNNNGTGG 3787 3785 3752 3750 3776 3779 + MnlI CCTC 3786 3785 . . 3776 3781 + SecI* CCNNGG 3776 3780 . . 3778 3782 + Hpy188I TCNGA 3780 3779 . . 3783 3787 + TfiI GAWTC 3783 3786 . . 3783 3787 + HinfI GANTC 3783 3786 . . 3787 3791 + Hin4II* CCTTC 3797 3796 . . 3791 3796 + DsaI* CCRYGG 3791 3795 . . 3791 3796 + StyI CCWWGG 3791 3795 . . 3791 3796 + NcoI CCATGG 3791 3795 . . 3791 3796 + SecI* CCNNGG 3791 3795 . . 3792 3795 + FatI CATG 3791 3795 . . 3792 3795 + NlaIII CATG 3795 3791 . . 3792 3795 + CviAII CATG 3792 3794 . . 3799 3802 - MnlI CCTC 3792 3791 . . 3810 3815 - TaqII CACCCA 3800 3798 . . 3815 3818 + CviJI RGCY 3816 3816 . . 3814 3819 - TsoI TARCCA 3804 3802 . . 3820 3823 + TspEI AATT 3819 3823 . . 3831 3834 + TspEI AATT 3830 3834 . . 3833 3836 + MseI TTAA 3833 3835 . . 3865 3869 + Hpy99I CGWCG 3869 3864 . . 3867 3870 + TaqI TCGA 3867 3869 . . 3867 3872 + Hpy178III* TCNNGA 3868 3870 . . 3864 3868 - HgaI GACGC 3853 3858 . . 3873 3884 + BstXI CCANNNNNNTGG 3880 3876 . . 3869 3873 - BsmAI GTCTC 3863 3867 . . 3869 3874 - Eco31I GGTCTC 3863 3867 . . 3875 3878 + TspEI AATT 3874 3878 . . 3895 3898 + SetI ASST 3898 3894 . . 3895 3898 + CviJI RGCY 3896 3896 . . 3895 3898 + AluI AGCT 3896 3896 . . 3911 3916 + Hpy166II GTNNAC 3913 3913 . . 3911 3916 + SduI GDGCHC 3915 3911 . . 3911 3916 + BseSI GKGCMC 3915 3911 . . 3911 3916 + ApaLI GTGCAC 3911 3915 . . 3911 3916 + HgiAI* GWGCWC 3915 3911 . . 3912 3915 + CviRI* TGCA 3913 3913 . . 3916 3919 + MaeI CTAG 3916 3918 . . 3936 3941 + Cac8I GCNNGC 3938 3938 . . 3939 3942 + SetI ASST 3942 3938 . . 3939 3942 + CviJI RGCY 3940 3940 . . 3939 3942 + AluI AGCT 3940 3940 . . 3943 3947 + TfiI GAWTC 3943 3946 . . 3943 3947 + HinfI GANTC 3943 3946 . . 3947 3952 + NdeI CATATG 3948 3950 . . 3968 3971 + SetI ASST 3971 3967 . . 3967 3970 - MnlI CCTC 3960 3959 . . 3985 3989 + TfiI GAWTC 3985 3988 . . 3985 3989 + HinfI GANTC 3985 3988 . . 3988 3993 + BetI* WCCGGW 3988 3992 . . 3989 3992 + HpaII CCGG 3989 3991 . . 3991 3995 + HphI GGTGA 4003 4002 . . 3995 3998 + CviJI RGCY 3996 3996 . . 3997 4001 + BssKI CCNGG 3996 4001 . . 3997 4001 + BseBI CCWGG 3998 3999 . . 3997 4002 + SecI* CCNNGG 3997 4001 . . 3997 4001 + ScrFI CCNGG 3998 3999 . . 3997 4001 + EcoRII CCWGG 3996 4001 . . 4018 4022 + MaeIII GTNAC 4017 4022 . . 4023 4026 + TspEI AATT 4022 4026 . . 4024 4029 + VspI ATTAAT 4025 4027 . . 4025 4028 + MseI TTAA 4025 4027 . . 4037 4042 + Hpy178III* TCNNGA 4038 4040 . . 4048 4051 + SetI ASST 4051 4047 . . 4049 4053 + Hin4II* CCTTC 4059 4058 . . 4046 4050 - HphI GGTGA 4038 4037 . . 4075 4079 + TspDTI ATGAA 4090 4088 . . 4078 4083 + ApoI RAATTY 4078 4082 . . 4079 4082 + TspEI AATT 4078 4082 . . 4098 4102 + TauI GCSGC 4101 4098 . . 4098 4102 + BlsI GCNGC 4100 4099 . . 4098 4102 + BisI GCNGC 4099 4100 . . 4099 4102 + AciI CCGC 4099 4101 . . 4112 4115 + MseI TTAA 4112 4114 . . 4117 4120 + TspEI AATT 4116 4120 . . 4135 4139 - MboII GAAGA 4127 4126 . . 4140 4143 + CviRI* TGCA 4141 4141 . . 4141 4145 + SfaNI GCATC 4150 4154 . . 4146 4150 + MaeIII GTNAC 4145 4150 . . 4165 4168 + TaiI ACGT 4168 4164 . . 4165 4168 + SetI ASST 4168 4164 . . 4165 4168 + MaeII ACGT 4165 4167 . . 4174 4184 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 4180 4177 . . 4175 4180 + EcoP15I CAGCAG 4205 4207 . . 4177 4182 + Cac8I GCNNGC 4179 4179 . . 4181 4184 - AciI CCGC 4181 4183 . . 4187 4190 + SetI ASST 4190 4186 . . 4187 4190 + CviJI RGCY 4188 4188 . . 4187 4190 + AluI AGCT 4188 4188 . . 4197 4200 + TspEI AATT 4196 4200 . . 4206 4211 + BetI* WCCGGW 4206 4210 . . 4207 4210 + HpaII CCGG 4207 4209 . . 4210 4214 + TfiI GAWTC 4210 4213 . . 4210 4214 + HinfI GANTC 4210 4213 . . 4221 4226 + Hpy178III* TCNNGA 4222 4224 . . 4225 4229 + MboII GAAGA 4237 4236 . . 4240 4243 + CviRI* TGCA 4241 4241 . . 4243 4248 + SpeI ACTAGT 4243 4247 . . 4239 4244 - BsgI GTGCAG 4224 4222 . . 4244 4247 + MaeI CTAG 4244 4246 . . 4250 4254 - MboII GAAGA 4242 4241 . . 4259 4263 + TspDTI ATGAA 4274 4272 . . 4261 4274 + AjuI GAANNNNNNNTTGG 4253 4248 4285 4280 4266 4271 + TatI WGTACW 4266 4270 . . 4267 4270 + Csp6I GTAC 4267 4269 . . 4267 4270 + RsaI GTAC 4268 4268 . . 4284 4289 + SduI GDGCHC 4288 4284 . . 4284 4289 + BseSI GKGCMC 4288 4284 . . 4282 4285 - MnlI CCTC 4275 4274 . . 4287 4298 + TstI CACNNNNNNTCC 4278 4273 4310 4305 4288 4298 + BsaXI ACNNNNNCTCC 4278 4275 4308 4305 4297 4300 + MnlI CCTC 4307 4306 . . 4295 4300 - BseRI GAGGAG 4286 4284 . . 4311 4314 + DpnI GATC 4312 4312 . . 4311 4314 + BstKTI GATC 4313 4311 . . 4311 4314 + MboI GATC 4310 4314 . . 4314 4317 + FatI CATG 4313 4317 . . 4314 4317 + NlaIII CATG 4317 4313 . . 4314 4317 + CviAII CATG 4314 4316 . . 4326 4329 + SetI ASST 4329 4325 . . 4326 4329 + CviJI RGCY 4327 4327 . . 4326 4329 + AluI AGCT 4327 4327 . . 4333 4337 + MaeIII GTNAC 4332 4337 . . 4324 4334 - BsaXI ACNNNNNCTCC 4346 4343 4316 4313 4335 4340 + AclI AACGTT 4336 4338 . . 4336 4339 + TaiI ACGT 4339 4335 . . 4336 4339 + SetI ASST 4339 4335 . . 4336 4339 + MaeII ACGT 4336 4338 . . 4341 4344 + AciI CCGC 4341 4343 . . 4341 4346 + BsrBI CCGCTC 4343 4343 . . 4351 4361 + MwoI GCNNNNNNNGC 4357 4354 . . 4351 4361 + BstAPI GCANNNNNTGC 4357 4354 . . 4351 4356 + BsrDI GCAATG 4358 4356 . . 4355 4360 - TaqII CACCCA 4345 4343 . . 4378 4383 + EcoP15I CAGCAG 4408 4410 . . 4393 4397 + TspDTI ATGAA 4408 4406 . . 4398 4403 + XhoII RGATCY 4398 4402 . . 4398 4402 + BinI* GGATC 4406 4407 . . 4395 4399 - Hin4II* CCTTC 4389 4388 . . 4399 4402 + DpnI GATC 4400 4400 . . 4399 4402 + BstKTI GATC 4401 4399 . . 4399 4402 + MboI GATC 4398 4402 . . 4410 4415 + EciI GGCGGA 4426 4424 . . 4411 4414 - AciI CCGC 4411 4413 . . 4418 4422 + TspDTI ATGAA 4433 4431 . . 4423 4426 + SetI ASST 4426 4422 . . 4428 4432 + Hpy188I TCNGA 4430 4429 . . 4429 4433 + DdeI CTNAG 4429 4432 . . 4429 4433 - BspCNI CTCAG 4421 4419 . . 4429 4433 - BseMII CTCAG 4420 4418 . . 4453 4456 + CviJI RGCY 4454 4454 . . 4452 4457 - TsoI TARCCA 4442 4440 . . 4478 4483 + MfeI CAATTG 4478 4482 . . 4479 4482 + TspEI AATT 4478 4482 . . 4487 4491 + TspDTI ATGAA 4502 4500 . . 4489 4494 + ApoI RAATTY 4489 4493 . . 4490 4493 + TspEI AATT 4489 4493 . . 4497 4501 - TspDTI ATGAA 4487 4485 . . 4511 4514 + FatI CATG 4510 4514 . . 4511 4514 + NlaIII CATG 4514 4510 . . 4511 4514 + CviAII CATG 4511 4513 . . 4546 4550 + BccI CCATC 4554 4555 . . 4549 4554 + MmeI TCCRAC 4574 4572 . . 4547 4551 - FokI GGATG 4533 4537 . . 4547 4551 - BseGI GGATG 4546 4544 . . 4554 4558 + BssKI CCNGG 4553 4558 . . 4554 4558 + BseBI CCWGG 4555 4556 . . 4554 4558 + ScrFI CCNGG 4555 4556 . . 4554 4558 + EcoRII CCWGG 4553 4558 . . 4554 4564 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 4560 4557 . . 4557 4560 + CviJI RGCY 4558 4558 . . 4559 4563 + DdeI CTNAG 4559 4562 . . 4559 4563 + BspCNI CTCAG 4572 4570 . . 4559 4563 + BseMII CTCAG 4573 4571 . . 4560 4565 + Hpy178III* TCNNGA 4561 4563 . . 4558 4564 - Bpu10I CCTNAGC 4559 4562 . . 4574 4577 + MnlI CCTC 4584 4583 . . 4620 4623 + SetI ASST 4623 4619 . . 4655 4658 + MseI TTAA 4655 4657 . . 4660 4664 + MboII GAAGA 4672 4671 . . 4663 4668 + EcoRV GATATC 4665 4665 . . 4669 4672 + TspEI AATT 4668 4672 . . 4693 4698 + EcoRV GATATC 4695 4695 . . 4703 4706 + TspEI AATT 4702 4706 . . 4706 4711 + TatI WGTACW 4706 4710 . . 4706 4711 + Bsp1407I TGTACA 4706 4710 . . 4707 4710 + Csp6I GTAC 4707 4709 . . 4707 4710 + RsaI GTAC 4708 4708 . . 4712 4716 + MboII GAAGA 4724 4723 . . 4712 4717 + BbvII* GAAGAC 4719 4723 . . 4736 4739 + TspEI AATT 4735 4739 . . 4738 4741 + MseI TTAA 4738 4740 . . 4744 4748 + MboII GAAGA 4756 4755 . . 4752 4755 + SetI ASST 4755 4751 . . 4751 4754 - MnlI CCTC 4744 4743 . . 4756 4761 + PstI CTGCAG 4760 4756 . . 4756 4761 + SfeI* CTRYAG 4756 4760 . . 4757 4760 + CviRI* TGCA 4758 4758 . . 4773 4777 + MaeIII GTNAC 4772 4777 . . 4782 4786 - TspGWI ACGGA 4772 4770 . . 4793 4797 + DdeI CTNAG 4793 4796 . . 4796 4799 + SetI ASST 4799 4795 . . 4796 4799 + CviJI RGCY 4797 4797 . . 4796 4799 + AluI AGCT 4797 4797 . . 4800 4804 + DdeI CTNAG 4800 4803 . . 4812 4815 + HpaII CCGG 4812 4814 . . 4814 4817 + CviJI RGCY 4815 4815 . . 4827 4831 - SfaNI GCATC 4817 4821 . . 4838 4841 + MseI TTAA 4838 4840 . . 4840 4845 + HindIII AAGCTT 4840 4844 . . 4840 4850 + FalI AAGNNNNNCTT 4831 4826 4863 4858 4841 4844 + SetI ASST 4844 4840 . . 4841 4844 + CviJI RGCY 4842 4842 . . 4841 4844 + AluI AGCT 4842 4842 . . 4840 4850 - FalI AAGNNNNNCTT 4863 4858 4831 4826 4853 4857 + TspDTI ATGAA 4868 4866 . . 4855 4867 + BarI GAAGNNNNNNTAC 4847 4842 4879 4874 4855 4864 + XmnI GAANNNNTTC 4859 4859 . . 4860 4864 - MboII GAAGA 4852 4851 . . 4870 4875 + MfeI CAATTG 4870 4874 . . 4871 4874 + TspEI AATT 4870 4874 . . 4877 4881 + BsrI ACTGG 4882 4880 . . 4896 4900 + MboII GAAGA 4908 4907 . . 4906 4911 + Hpy166II GTNNAC 4908 4908 . . 4906 4911 + HpaI GTTAAC 4908 4908 . . 4906 4911 + HindII GTYRAC 4908 4908 . . 4907 4910 + MseI TTAA 4907 4909 . . 4908 4913 + TsoI TARCCA 4924 4922 . . 4912 4923 + TstI CACNNNNNNTCC 4903 4898 4935 4930 4913 4916 + TaiI ACGT 4916 4912 . . 4913 4916 + SetI ASST 4916 4912 . . 4913 4916 + MaeII ACGT 4913 4915 . . 4923 4929 + TspRI CASTGNN 4929 4920 . . 4922 4926 - BsrI ACTGG 4922 4920 . . 4946 4951 + BclI TGATCA 4946 4950 . . 4947 4950 + DpnI GATC 4948 4948 . . 4947 4950 + BstKTI GATC 4949 4947 . . 4947 4950 + MboI GATC 4946 4950 . . 4959 4963 - BsrI ACTGG 4959 4957 . . 4958 4963 - BfiI ACTGGG 4953 4952 . . 4967 4971 + MaeIII GTNAC 4966 4971 . . 4984 4987 + TspEI AATT 4983 4987 . . 4991 4994 + CviJI RGCY 4992 4992 . . 4989 4992 - MnlI CCTC 4982 4981 . . 5028 5031 + CviRI* TGCA 5029 5029 . . 5075 5085 + FalI AAGNNNNNCTT 5066 5061 5098 5093 5076 5079 + SetI ASST 5079 5075 . . 5076 5079 + CviJI RGCY 5077 5077 . . 5076 5079 + AluI AGCT 5077 5077 . . 5085 5090 + Hpy178III* TCNNGA 5086 5088 . . 5075 5085 - FalI AAGNNNNNCTT 5098 5093 5066 5061 5086 5096 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 5092 5089 . . 5086 5096 + PflMI CCANNNNNTGG 5092 5089 . . 5089 5092 + DpnI GATC 5090 5090 . . 5089 5092 + BstKTI GATC 5091 5089 . . 5089 5092 + MboI GATC 5088 5092 . . 5092 5095 + FatI CATG 5091 5095 . . 5092 5095 + NlaIII CATG 5095 5091 . . 5092 5095 + CviAII CATG 5092 5094 . . 5096 5099 - MnlI CCTC 5089 5088 . . 5099 5104 - BsmI GAATGC 5099 5097 . . 5117 5124 + SwaI ATTTAAAT 5120 5120 . . 5118 5123 + AhaIII* TTTAAA 5120 5120 . . 5119 5122 + MseI TTAA 5119 5121 . . 5129 5132 + FatI CATG 5128 5132 . . 5129 5132 + NlaIII CATG 5132 5128 . . 5129 5132 + CviAII CATG 5129 5131 . . 5137 5141 + TspDTI ATGAA 5152 5150 . . 5143 5147 + TfiI GAWTC 5143 5146 . . 5143 5147 + HinfI GANTC 5143 5146 . . 5146 5150 + Hpy188I TCNGA 5148 5147 . . 5149 5154 + ApoI RAATTY 5149 5153 . . 5150 5153 + TspEI AATT 5149 5153 . . 5160 5163 + TspEI AATT 5159 5163 . . 5161 5166 + VspI ATTAAT 5162 5164 . . 5162 5165 + MseI TTAA 5162 5164 . . 5169 5173 + DdeI CTNAG 5169 5172 . . 5169 5173 + BspCNI CTCAG 5182 5180 . . 5169 5173 + BseMII CTCAG 5183 5181 . . 5172 5175 + SetI ASST 5175 5171 . . 5193 5198 + Hpy178III* TCNNGA 5194 5196 . . 5195 5198 + TaqI TCGA 5195 5197 . . 5212 5215 + TspEI AATT 5211 5215 . . 5215 5218 + MseI TTAA 5215 5217 . . 5218 5222 + Tsp4CI* ACNGT 5220 5219 . . 5219 5225 + TspRI CASTGNN 5225 5216 . . 5221 5226 + Hpy166II GTNNAC 5223 5223 . . 5229 5232 + TspEI AATT 5228 5232 . . 5244 5249 + VspI ATTAAT 5245 5247 . . 5245 5248 + MseI TTAA 5245 5247 . . 5254 5258 - SfaNI GCATC 5244 5248 . . 5258 5263 + Eco57MI CTGRAG 5279 5277 . . 5258 5263 + Eco57I CTGAAG 5279 5277 . . 5260 5264 - Hin4II* CCTTC 5254 5253 . . 5264 5269 + BtsI GCAGTG 5271 5269 . . 5265 5271 + TspRI CASTGNN 5271 5262 . . 5269 5272 + DpnI GATC 5270 5270 . . 5269 5272 + BstKTI GATC 5271 5269 . . 5269 5272 + MboI GATC 5268 5272 . . 5272 5275 + MaeI CTAG 5272 5274 . . 5275 5280 + Hpy166II GTNNAC 5277 5277 . . 5275 5280 + HpaI GTTAAC 5277 5277 . . 5275 5280 + HindII GTYRAC 5277 5277 . . 5276 5279 + MseI TTAA 5276 5278 . . 5305 5309 - SfaNI GCATC 5295 5299 . . 5308 5312 - BceAI ACGGC 5293 5295 . . 5315 5318 + MseI TTAA 5315 5317 . . 5323 5327 + BccI CCATC 5331 5332 . . 5326 5330 + Hpy188I TCNGA 5328 5327 . . 5329 5334 + EcoRI GAATTC 5329 5333 . . 5329 5334 + ApoI RAATTY 5329 5333 . . 5330 5333 + TspEI AATT 5329 5333 . . 5335 5340 + Hpy166II GTNNAC 5337 5337 . . 5335 5340 + SduI GDGCHC 5339 5335 . . 5335 5340 + BseSI GKGCMC 5339 5335 . . 5335 5340 + ApaLI GTGCAC 5335 5339 . . 5335 5340 + HgiAI* GWGCWC 5339 5335 . . 5336 5339 + CviRI* TGCA 5337 5337 . . 5340 5344 + Hpy99I CGWCG 5344 5339 . . 5341 5345 + HgaI GACGC 5350 5355 . . 5341 5346 + AcyI GRCGYC 5342 5344 . . 5356 5360 + HgaI GACGC 5365 5370 . . 5371 5374 + MseI TTAA 5371 5373 . . 5376 5379 + SetI ASST 5379 5375 . . 5375 5378 - MnlI CCTC 5368 5367 . . 5383 5386 + MseI TTAA 5383 5385 . . 5397 5401 + FokI GGATG 5410 5414 . . 5397 5401 + BseGI GGATG 5403 5401 . . 5402 5408 + DraII RGGNCCY 5403 5406 . . 5403 5406 + CviJI RGCY 5404 5404 . . 5403 5406 + HaeIII GGCC 5404 5404 . . 5403 5407 + BmgT120I GGNCC 5404 5405 . . 5403 5407 + AsuI* GGNCC 5403 5406 . . 5401 5404 - MnlI CCTC 5394 5393 . . 5415 5420 + ApoI RAATTY 5415 5419 . . 5416 5419 + TspEI AATT 5415 5419 . . 5423 5426 + AciI CCGC 5423 5425 . . 5439 5444 + ApoI RAATTY 5439 5443 . . 5440 5443 + TspEI AATT 5439 5443 . . 5444 5449 + SecI* CCNNGG 5444 5448 . . 5445 5449 + BssKI CCNGG 5444 5449 . . 5445 5449 + BseBI CCWGG 5446 5447 . . 5445 5449 + ScrFI CCNGG 5446 5447 . . 5445 5449 + EcoRII CCWGG 5444 5449 . . 5469 5474 + BsmI GAATGC 5475 5473 . . 5475 5484 + XmnI GAANNNNTTC 5479 5479 . . 5483 5486 + TaqI TCGA 5483 5485 . . 5484 5488 + Hpy99I CGWCG 5488 5483 . . 5486 5490 + TspGWI ACGGA 5501 5499 . . 5494 5498 + DdeI CTNAG 5494 5497 . . 5498 5503 + EcoRV GATATC 5500 5500 . . 5504 5507 + TaiI ACGT 5507 5503 . . 5504 5507 + SetI ASST 5507 5503 . . 5504 5507 + MaeII ACGT 5504 5506 . . 5507 5511 - TspDTI ATGAA 5497 5495 . . 5515 5518 + MseI TTAA 5515 5517 . . 5525 5535 + FalI AAGNNNNNCTT 5516 5511 5548 5543 5526 5529 + CviJI RGCY 5527 5527 . . 5525 5535 - FalI AAGNNNNNCTT 5548 5543 5516 5511 5537 5540 + TspEI AATT 5536 5540 . . 5546 5550 + TspDTI ATGAA 5561 5559 . . 5548 5553 + ApoI RAATTY 5548 5552 . . 5549 5552 + TspEI AATT 5548 5552 . . 5555 5560 + Hpy166II GTNNAC 5557 5557 . . 5555 5560 + SduI GDGCHC 5559 5555 . . 5555 5560 + BseSI GKGCMC 5559 5555 . . 5555 5560 + ApaLI GTGCAC 5555 5559 . . 5555 5560 + HgiAI* GWGCWC 5559 5555 . . 5556 5559 + CviRI* TGCA 5557 5557 . . 5563 5566 + CviJI RGCY 5564 5564 . . 5580 5583 + CviRI* TGCA 5581 5581 . . 5589 5593 + TfiI GAWTC 5589 5592 . . 5589 5593 + HinfI GANTC 5589 5592 . . 5594 5599 + ApoI RAATTY 5594 5598 . . 5595 5598 + TspEI AATT 5594 5598 . . 5615 5620 + TatI WGTACW 5615 5619 . . 5615 5620 + ScaI AGTACT 5617 5617 . . 5616 5619 + Csp6I GTAC 5616 5618 . . 5616 5619 + RsaI GTAC 5617 5617 . . 5622 5625 + SetI ASST 5625 5621 . . 5620 5624 - HphI GGTGA 5612 5611 . . 5630 5634 + Tsp4CI* ACNGT 5632 5631 . . 5633 5637 + MaeIII GTNAC 5632 5637 . . 5640 5645 + SfeI* CTRYAG 5640 5644 . . 5644 5647 + CviJI RGCY 5645 5645 . . 5656 5660 + TspDTI ATGAA 5671 5669 . . 5658 5662 - Hin4II* CCTTC 5652 5651 . . 5691 5696 + Hpy178III* TCNNGA 5692 5694 . . 5698 5701 + MseI TTAA 5698 5700 . . 5708 5713 + AclI AACGTT 5709 5711 . . 5709 5712 + TaiI ACGT 5712 5708 . . 5709 5712 + SetI ASST 5712 5708 . . 5709 5712 + MaeII ACGT 5709 5711 . . 5718 5723 + XhoII RGATCY 5718 5722 . . 5718 5722 + BinI* GGATC 5726 5727 . . 5719 5722 + DpnI GATC 5720 5720 . . 5719 5722 + BstKTI GATC 5721 5719 . . 5719 5722 + MboI GATC 5718 5722 . . 5732 5736 + FokI GGATG 5745 5749 . . 5732 5736 + BseGI GGATG 5738 5736 . . 5733 5737 - BccI CCATC 5727 5728 . . 5744 5747 + MseI TTAA 5744 5746 . . 5746 5749 + TspEI AATT 5745 5749 . . 5761 5766 + NspI RCATGY 5765 5761 . . 5762 5765 + FatI CATG 5761 5765 . . 5762 5765 + NlaIII CATG 5765 5761 . . 5762 5765 + CviAII CATG 5762 5764 . . 5776 5779 - MnlI CCTC 5769 5768 . . 5790 5795 + Hpy178III* TCNNGA 5791 5793 . . 5801 5806 + NspBII* CMGCKG 5803 5803 . . 5801 5804 + AciI CCGC 5801 5803 . . 5811 5816 + BsrDI GCAATG 5818 5816 . . 5835 5839 + Tsp45I GTSAC 5834 5839 . . 5835 5839 + MaeIII GTNAC 5834 5839 . . 5836 5840 - HphI GGTGA 5828 5827 . . 5849 5852 + CviJI RGCY 5850 5850 . . 5854 5859 + ApoI RAATTY 5854 5858 . . 5855 5858 + TspEI AATT 5854 5858 . . 5860 5863 - MnlI CCTC 5853 5852 . . 5867 5871 + FokI GGATG 5880 5884 . . 5867 5871 + BseGI GGATG 5873 5871 . . 5868 5877 + BsaBI GATNNNNATC 5872 5872 . . 5873 5878 + BclI TGATCA 5873 5877 . . 5874 5877 + DpnI GATC 5875 5875 . . 5874 5877 + BstKTI GATC 5876 5874 . . 5874 5877 + MboI GATC 5873 5877 . . 5908 5911 + SetI ASST 5911 5907 . . 5908 5911 + CviJI RGCY 5909 5909 . . 5908 5911 + AluI AGCT 5909 5909 . . 5918 5921 + TspEI AATT 5917 5921 . . 5922 5927 + EcoRI GAATTC 5922 5926 . . 5922 5927 + ApoI RAATTY 5922 5926 . . 5923 5926 + TspEI AATT 5922 5926 . . 5929 5933 + BslFI GGGAC 5943 5947 . . 5931 5935 + HgaI GACGC 5940 5945 . . 5940 5943 + SetI ASST 5943 5939 . . 5954 5957 + MseI TTAA 5954 5956 . . 5977 5981 + MboII GAAGA 5989 5988 . . 6002 6006 + TspGWI ACGGA 6017 6015 . . 6013 6024 + TstI CACNNNNNNTCC 6004 5999 6036 6031 6014 6017 + SetI ASST 6017 6013 . . 6012 6016 - HphI GGTGA 6004 6003 . . 6034 6038 + TspDTI ATGAA 6049 6047 . . 6035 6046 + BdaI TGANNNNNNTCA 6024 6022 6058 6056 6041 6045 + PleI GAGTC 6049 6050 . . 6041 6045 + MlyI GAGTC 6050 6050 . . 6041 6045 + HinfI GANTC 6041 6044 . . 6035 6046 - BdaI TGANNNNNNTCA 6058 6056 6024 6022 6049 6054 + HindIII AAGCTT 6049 6053 . . 6050 6053 + SetI ASST 6053 6049 . . 6050 6053 + CviJI RGCY 6051 6051 . . 6050 6053 + AluI AGCT 6051 6051 . . 6055 6060 + AhaIII* TTTAAA 6057 6057 . . 6056 6059 + MseI TTAA 6056 6058 . . 6073 6077 - TspDTI ATGAA 6063 6061 . . 6081 6086 + XhoII RGATCY 6081 6085 . . 6082 6085 + DpnI GATC 6083 6083 . . 6082 6085 + BstKTI GATC 6084 6082 . . 6082 6085 + MboI GATC 6081 6085 . . 6085 6088 + MnlI CCTC 6095 6094 . . 6086 6090 + DdeI CTNAG 6086 6089 . . 6086 6090 + BspCNI CTCAG 6099 6097 . . 6086 6090 + BseMII CTCAG 6100 6098 . . 6082 6086 - BinI* GGATC 6076 6077 . . 6094 6097 - MnlI CCTC 6087 6086 . . 6117 6121 - MboII GAAGA 6109 6108 . . 6121 6125 + BssKI CCNGG 6120 6125 . . 6121 6125 + BseBI CCWGG 6122 6123 . . 6121 6125 + ScrFI CCNGG 6122 6123 . . 6121 6125 + EcoRII CCWGG 6120 6125 . . 6124 6129 + NlaIV GGNNCC 6126 6126 . . 6129 6133 + BccI CCATC 6137 6138 . . 6130 6139 + MslI CAYNNNNRTG 6134 6134 . . 6132 6136 + Hpy188I TCNGA 6134 6133 . . 6150 6154 + Hin4II* CCTTC 6160 6159 . . 6153 6158 + XbaI TCTAGA 6153 6157 . . 6153 6158 + Hpy178III* TCNNGA 6154 6156 . . 6154 6157 + MaeI CTAG 6154 6156 . . 6178 6181 + FatI CATG 6177 6181 . . 6178 6181 + NlaIII CATG 6181 6177 . . 6178 6181 + CviAII CATG 6178 6180 . . 6183 6186 + FatI CATG 6182 6186 . . 6183 6186 + NlaIII CATG 6186 6182 . . 6183 6186 + CviAII CATG 6183 6185 . . 6186 6190 + MaeIII GTNAC 6185 6190 . . 6199 6204 + TatI WGTACW 6199 6203 . . 6200 6203 + Csp6I GTAC 6200 6202 . . 6200 6203 + RsaI GTAC 6201 6201 . . 6204 6207 + TspEI AATT 6203 6207 . . 6215 6220 + Hpy178III* TCNNGA 6216 6218 . . 6217 6223 + PpuMI RGGWCCY 6218 6221 . . 6217 6223 + DraII RGGNCCY 6218 6221 . . 6218 6223 + NlaIV GGNNCC 6220 6220 . . 6218 6222 + BmgT120I GGNCC 6219 6220 . . 6218 6222 + AvaII GGWCC 6218 6221 . . 6218 6222 + AsuI* GGNCC 6218 6221 . . 6223 6227 + DdeI CTNAG 6223 6226 . . 6223 6227 - BspCNI CTCAG 6215 6213 . . 6223 6227 - BseMII CTCAG 6214 6212 . . 6238 6243 + Eco57MI CTGRAG 6259 6257 . . 6238 6243 + Eco57I CTGAAG 6259 6257 . . 6240 6244 + MboII GAAGA 6252 6251 . . 6235 6240 - EcoP15I CAGCAG 6207 6209 . . 6251 6254 + TspEI AATT 6250 6254 . . 6265 6275 + MwoI GCNNNNNNNGC 6271 6268 . . 6277 6282 + EcoRI GAATTC 6277 6281 . . 6277 6282 + ApoI RAATTY 6277 6281 . . 6274 6277 - AciI CCGC 6274 6276 . . 6278 6281 + TspEI AATT 6277 6281 . . 6285 6290 + XhoII RGATCY 6285 6289 . . 6286 6289 + DpnI GATC 6287 6287 . . 6286 6289 + BstKTI GATC 6288 6286 . . 6286 6289 + MboI GATC 6285 6289 . . 6286 6290 - BinI* GGATC 6280 6281 . . 6297 6301 + PleI GAGTC 6305 6306 . . 6297 6301 + MlyI GAGTC 6306 6306 . . 6297 6301 + HinfI GANTC 6297 6300 . . 6299 6303 + BsmAI GTCTC 6304 6308 . . 6306 6311 + NlaIV GGNNCC 6308 6308 . . 6301 6306 - BsiI* CACGAG 6301 6305 . . 6306 6311 + HgiCI* GGYRCC 6306 6310 . . 6310 6313 + HpaII CCGG 6310 6312 . . 6329 6333 + Tsp4CI* ACNGT 6331 6330 . . 6337 6341 - TspDTI ATGAA 6327 6325 . . 6343 6347 + Hpy188I TCNGA 6345 6344 . . 6364 6368 + BlsI GCNGC 6366 6365 . . 6364 6368 + BisI GCNGC 6365 6366 . . 6364 6368 + BbvI GCAGC 6376 6380 . . 6364 6368 + TseI GCWGC 6364 6367 . . 6365 6373 + AlwNI CAGNNNCTG 6370 6367 . . 6366 6369 + SetI ASST 6369 6365 . . 6366 6369 + CviJI RGCY 6367 6367 . . 6366 6369 + AluI AGCT 6367 6367 . . 6369 6374 + Hpy178III* TCNNGA 6370 6372 . . 6373 6377 + TfiI GAWTC 6373 6376 . . 6373 6377 + HinfI GANTC 6373 6376 . . 6386 6389 + FatI CATG 6385 6389 . . 6386 6389 + NlaIII CATG 6389 6385 . . 6386 6389 + CviAII CATG 6386 6388 . . 6384 6388 - TspDTI ATGAA 6374 6372 . . 6392 6396 + Hpy188I TCNGA 6394 6393 . . 6389 6393 - HgaI GACGC 6378 6383 . . 6398 6402 + Tsp45I GTSAC 6397 6402 . . 6398 6402 + MaeIII GTNAC 6397 6402 . . 6405 6408 + CviJI RGCY 6406 6406 . . 6410 6413 + MseI TTAA 6410 6412 . . 6425 6428 + CviRI* TGCA 6426 6426 . . 6434 6437 + SetI ASST 6437 6433 . . 6438 6442 + TfiI GAWTC 6438 6441 . . 6438 6442 + HinfI GANTC 6438 6441 . . 6450 6453 + TaiI ACGT 6453 6449 . . 6450 6453 + SetI ASST 6453 6449 . . 6450 6453 + MaeII ACGT 6450 6452 . . 6454 6458 + Hpy188I TCNGA 6456 6455 . . 6457 6467 + Hin4I GAYNNNNNVTC 6448 6443 6480 6475 6457 6462 + EcoRV GATATC 6459 6459 . . 6461 6464 + TaqI TCGA 6461 6463 . . 6463 6467 + TfiI GAWTC 6463 6466 . . 6463 6467 + HinfI GANTC 6463 6466 . . 6457 6467 - Hin4I GAYNNNNNVTC 6480 6475 6448 6443 6472 6475 + MseI TTAA 6472 6474 . . 6474 6477 + TspEI AATT 6473 6477 . . 6477 6482 + Hpy178III* TCNNGA 6478 6480 . . 6488 6492 - SfaNI GCATC 6478 6482 . . 6493 6498 + Hpy178III* TCNNGA 6494 6496 . . 6492 6497 - Eco57MI CTGRAG 6477 6475 . . 6492 6497 - GsuI CTGGAG 6477 6475 . . 6513 6516 + TaiI ACGT 6516 6512 . . 6513 6516 + SetI ASST 6516 6512 . . 6513 6516 + MaeII ACGT 6513 6515 . . 6515 6519 + Tsp45I GTSAC 6514 6519 . . 6515 6519 + MaeIII GTNAC 6514 6519 . . 6527 6532 + SduI GDGCHC 6531 6527 . . 6527 6532 + BseSI GKGCMC 6531 6527 . . 6532 6538 + TspRI CASTGNN 6538 6529 . . 6533 6537 + Tsp4CI* ACNGT 6535 6534 . . 6538 6548 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 6544 6541 . . 6539 6542 + FatI CATG 6538 6542 . . 6539 6542 + NlaIII CATG 6542 6538 . . 6539 6542 + CviAII CATG 6539 6541 . . 6544 6549 + NaeI GCCGGC 6546 6546 . . 6544 6549 + MroNI GCCGGC 6544 6548 . . 6544 6549 + Cac8I GCNNGC 6546 6546 . . 6544 6549 + Cfr10I RCCGGY 6544 6548 . . 6545 6548 + HpaII CCGG 6545 6547 . . 6545 6555 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 6551 6548 . . 6548 6551 + Hin6I GCGC 6548 6550 . . 6548 6551 + GlaI GCGC 6549 6549 . . 6548 6551 + HhaI GCGC 6550 6548 . . 6549 6552 + FnuDII* CGCG 6550 6550 . . 6556 6560 - Hin4II* CCTTC 6550 6549 . . 6592 6595 + MseI TTAA 6592 6594 . . 6602 6605 + MseI TTAA 6602 6604 . . 6611 6616 + TsoI TARCCA 6627 6625 . . 6612 6615 + CviJI RGCY 6613 6613 . . 6623 6627 + Tsp4CI* ACNGT 6625 6624 . . 6663 6668 + NdeI CATATG 6664 6666 . . #--------------------------------------- # # # Acc65I: # [GGTACC] # 1531 5138 # # AccI: # [GTMKAC] # 391 618 2249 3411 # # AciI: # [CCGC] # 3 3 22 50 70 71 # 82 160 169 378 395 473 # 590 759 801 1012 1631 # # AclI: # [AACGTT] # 671 960 1373 1540 2125 # # AcyI: # [GRCGYC] # 677 701 1327 3964 # # AflIII: # [ACRYGT] # 318 478 872 880 4121 # # AgeI: # [ACCGGT] # 1534 5135 # # AhaIII*: # [TTTAAA] # 423 612 893 937 1851 1953 # # AjuI: # [GAANNNNNNNTTGG] # 32 32 580 2384 3641 # # AlfI: # [GCANNNNNNTGC] # 0 0 34 619 6016 # # AluI: # [AGCT] # 17 44 45 53 55 84 # 113 114 117 123 139 142 # 152 232 235 248 275 302 # 316 470 693 824 832 1044 # # AlwNI: # [CAGNNNCTG] # 299 1222 5148 # # ApaLI: # [GTGCAC] # 220 1114 1424 3911 # # ApoI: # [RAATTY] # 24 46 47 60 68 86 # 109 134 180 238 260 285 # 313 355 392 411 486 507 # 582 604 660 822 # # AsuI*: # [GGNCC] # 451 815 2561 2842 # # AsuII: # [TTCGAA] # 304 770 2527 3068 # # AvaII: # [GGWCC] # 451 2842 3376 # # BaeI: # [ACNNNNGTAYC] # 33 1009 5627 # # BamHI: # [GGATCC] # 1362 5307 # # BarI: # [GAAGNNNNNNTAC] # 32 1790 4847 # # BbvI: # [GCAGC] # 127 293 536 2833 2880 # # BbvII*: # [GAAGAC] # 23 198 291 442 485 562 # 1109 1609 1950 # # BccI: # [CCATC] # 10 28 70 141 217 333 # 396 410 449 532 614 735 # 777 799 1158 # # BceAI: # [ACGGC] # 168 169 281 302 482 726 # 1376 1575 1590 # # BcgI: # [CGANNNNNNTGC] # 34 668 5967 # # BciVI: # [GTATCC] # 1037 2695 2937 # # BclI: # [TGATCA] # 796 927 2096 2850 # # BdaI: # [TGANNNNNNTCA] # 0 0 34 611 6024 # # BetI*: # [WCCGGW] # 218 343 514 677 2454 2463 # # BfiI: # [ACTGGG] # 1716 2066 2887 # # BglII: # [AGATCT] # 519 2880 3270 # # BinI*: # [GGATC] # 13 39 80 120 204 233 # 295 350 389 652 1318 1320 # 1656 # # BisI: # [GCNGC] # 3 50 72 127 172 209 # 253 304 614 2266 2599 # # BlsI: # [GCNGC] # 3 50 72 127 173 209 # 253 303 614 2266 2599 # # BmgT120I: # [GGNCC] # 450 815 2561 2843 # # BplI: # [GAGNNNNNCTC] # 0 0 32 967 5670 # # Bpu10I: # [CCTNAGC] # 2110 4559 # # BsaAI: # [YACGTR] # 165 217 890 1277 4120 # # BsaBI: # [GATNNNNATC] # 206 797 1428 4238 # # BsaXI: # [ACNNNNNCTCC] # 8 30 30 30 30 305 # 695 2323 3218 # # BseBI: # [CCWGG] # 218 278 388 425 547 557 # 676 891 2689 # # BseGI: # [GGATG] # 51 135 335 479 570 796 # 857 958 1021 1467 # # BseMII: # [CTCAG] # 114 153 277 330 370 455 # 610 917 1062 2381 # # BsePI: # [GCGCGC] # 98 6571 # # BseRI: # [GAGGAG] # 2072 2214 2383 # # BseSI: # [GKGCMC] # 138 220 373 972 1051 3915 # # BsgI: # [GTGCAG] # 2445 4224 # # BsiI*: # [CACGAG] # 368 6301 # # BsiYI*: # [CCNNNNNNNGG] # 7 118 269 380 532 555 # 750 987 1452 1619 # # BslFI: # [GGGAC] # 726 5943 # # BsmAI: # [GTCTC] # 229 264 298 365 386 468 # 1066 1152 2441 # # BsmI: # [GAATGC] # 376 1194 5099 # # Bsp1407I: # [TGTACA] # 1963 4706 # # BspCNI: # [CTCAG] # 116 151 276 332 370 454 # 610 917 1062 2381 # # BspHI: # [TCATGA] # 1943 4726 # # BspLU11I*: # [ACATGT] # 478 1190 5001 # # BspMI: # [ACCTGC] # 176 6493 # # BspMII*: # [TCCGGA] # 343 6326 # # BsrBI: # [CCGCTC] # 2326 4343 # # BsrDI: # [GCAATG] # 851 1460 4358 # # BsrI: # [ACTGG] # 37 40 267 278 441 1086 # 1250 1560 1710 # # BssKI: # [CCNGG] # 130 201 216 278 295 388 # 508 549 557 676 891 1980 # # BssNAI: # [GTATAC] # 1010 5659 # # BstAPI: # [GCANNNNNTGC] # 2312 4357 # # BstKTI: # [GATC] # 15 26 34 52 82 88 # 94 120 142 155 176 180 # 192 194 202 204 208 246 # 308 312 381 421 450 471 # 548 551 817 # # BstXI: # [CCANNNNNNTGG] # 456 1345 2079 2789 # # BtgZI: # [GCGATG] # 3282 3387 # # BtsI: # [GCAGTG] # 38 1398 5233 # # Cac8I: # [GCNNGC] # 43 57 123 148 241 306 # 649 878 1857 2367 # # CauII*: # [CCSGG] # 508 609 901 4651 # # Cfr10I: # [RCCGGY] # 125 1534 5010 # # ClaI: # [ATCGAT] # 9 128 807 2478 3247 # # Csp6I: # [GTAC] # 6 42 66 100 128 257 # 394 440 469 584 651 909 # 939 1684 # # CspCI: # [CAANNNNNGTGG] # 35 2882 3752 # # CviAII: # [CATG] # 5 7 32 37 66 119 # 130 132 150 153 188 197 # 198 203 214 220 241 243 # 243 285 316 416 443 522 # 581 633 695 # # CviJI: # [RGCY] # 13 17 17 18 26 27 # 32 37 39 39 44 49 # 52 53 55 55 56 56 # 59 60 63 65 72 73 # 74 80 81 84 84 85 # 104 113 113 114 117 123 # 127 137 139 142 149 150 # 154 172 181 192 199 205 # 207 221 228 239 267 279 # 316 327 389 # # CviRI*: # [TGCA] # 24 24 25 43 45 75 # 78 100 159 203 216 220 # 228 243 271 306 308 399 # 517 549 600 845 1191 # # DdeI: # [CTNAG] # 7 94 130 137 169 234 # 325 348 353 369 370 446 # 592 842 1062 1191 # # DpnI: # [GATC] # 15 26 33 52 82 88 # 94 120 142 155 176 180 # 192 194 202 204 208 246 # 308 312 382 421 450 471 # 548 551 817 # # DraII: # [RGGNCCY] # 451 815 5403 # # DrdI: # [GACNNNNNNGTC] # 778 5891 # # DsaI*: # [CCRYGG] # 527 1263 2001 2878 # # EciI: # [GGCGGA] # 897 2243 3529 # # Eco31I: # [GGTCTC] # 264 2806 3599 # # Eco57I: # [CTGAAG] # 410 980 1244 4035 # # Eco57MI: # [CTGRAG] # 45 192 218 980 1199 4035 # # EcoP15I: # [CAGCAG] # 203 462 693 1799 3512 # # EcoRI: # [GAATTC] # 134 285 345 355 392 593 # 1717 2848 # # EcoRII: # [CCWGG] # 216 278 388 425 549 557 # 676 891 2689 # # EcoRV: # [GATATC] # 30 210 234 723 805 959 # 1023 2685 # # EcoT22I: # [ATGCAT] # 1389 5280 # # Esp3I: # [CGTCTC] # 386 2411 3872 # # EspI*: # [GCTNAGC] # 94 6575 # # FalI: # [AAGNNNNNCTT] # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 32 32 32 32 # 203 418 1055 1121 3744 # # FatI: # [CATG] # 5 7 32 37 66 119 # 131 132 150 153 188 197 # 198 203 214 220 241 242 # 243 285 316 416 443 522 # 581 633 695 # # FauI: # [CCCGC] # 2532 4137 # # FnuDII*: # [CGCG] # 100 119 124 1764 4562 # # FokI: # [GGATG] # 71 135 335 459 570 789 # 877 958 1021 1454 # # GlaI: # [GCGC] # 2 7 92 120 917 969 # 4562 # # GsuI: # [CTGGAG] # 192 1199 5278 # # HaeII: # [RGCGCY] # 1072 5597 # # HaeIII: # [GGCC] # 17 221 383 429 531 1265 # 1273 2550 # # HgaI: # [GACGC] # 15 291 438 575 677 709 # 1039 1428 1497 # # HgiAI*: # [GWGCWC] # 220 1110 1424 3915 # # HgiCI*: # [GGYRCC] # 363 1029 1531 3746 # # HhaI: # [GCGC] # 2 7 93 119 917 969 # 4562 # # Hin4I: # [GAYNNNNNVTC] # 0 0 0 0 0 0 # 32 32 32 32 32 189 # 443 655 953 1222 3047 # # Hin4II*: # [CCTTC] # 15 82 119 124 141 141 # 191 192 262 330 390 398 # 501 508 508 523 625 754 # 865 # # Hin6I: # [GCGC] # 2 7 91 121 917 969 # 4562 # # HindII: # [GTYRAC] # 41 307 351 369 1392 2070 # 2139 # # HindIII: # [AAGCTT] # 201 495 620 929 1073 1209 # 2142 # # HinfI: # [GANTC] # 25 30 33 42 45 65 # 74 76 92 109 139 160 # 206 223 225 256 272 298 # 308 334 360 446 452 692 # 774 933 # # HpaI: # [GTTAAC] # 369 1392 4908 # # HpaII: # [CCGG] # 25 120 124 218 235 344 # 483 489 557 605 1498 1971 # # HphI: # [GGTGA] # 18 35 47 57 93 115 # 176 207 216 228 503 529 # 665 759 1447 1574 # # Hpy166II: # [GTNNAC] # 11 41 54 60 85 220 # 307 311 315 351 421 654 # 656 995 1076 1112 # # Hpy178III*: # [TCNNGA] # 16 38 62 79 80 96 # 99 108 108 126 137 150 # 154 170 175 184 222 265 # 276 315 339 339 363 388 # 498 525 601 756 # # Hpy188I: # [TCNGA] # 15 23 41 44 49 62 # 144 180 211 212 213 222 # 233 368 426 478 609 650 # 718 806 965 # # Hpy99I: # [CGWCG] # 144 662 893 1181 1475 2314 # # KpnI: # [GGTACC] # 1535 5134 # # Ksp632I*: # [CTCTTC] # 365 2588 3716 # # MaeI: # [CTAG] # 119 150 303 328 344 355 # 364 512 515 870 882 899 # 1028 # # MaeII: # [ACGT] # 63 98 154 156 164 171 # 205 217 239 353 553 577 # 591 741 770 1617 # # MaeIII: # [GTNAC] # 24 106 117 128 155 162 # 187 188 194 202 212 236 # 321 337 351 361 371 440 # 495 666 702 714 # # MboI: # [GATC] # 15 26 31 52 82 88 # 94 120 142 155 176 180 # 192 194 202 204 208 246 # 308 312 384 421 450 471 # 548 551 817 # # MboII: # [GAAGA] # 3 3 5 6 14 26 # 28 32 38 38 51 52 # 56 67 81 92 96 102 # 110 117 120 143 147 154 # 162 163 177 206 272 356 # 358 417 430 570 896 1081 # # MfeI: # [CAATTG] # 392 1352 1799 3126 # # MlyI: # [GAGTC] # 256 363 759 788 896 3607 # # MmeI: # [TCCRAC] # 2095 4574 # # MnlI: # [CCTC] # 6 8 17 22 26 32 # 64 83 83 84 84 84 # 107 111 115 144 160 168 # 193 211 234 238 270 277 # 279 315 344 362 365 370 # 375 408 456 574 # # MroNI: # [GCCGGC] # 125 6544 # # MseI: # [TTAA] # 10 12 30 31 32 34 # 39 43 46 53 56 57 # 62 67 69 83 87 100 # 102 112 117 120 132 144 # 157 174 183 192 210 212 # 222 266 305 326 354 390 # 406 454 543 637 # # MslI: # [CAYNNNNRTG] # 42 535 617 1916 3559 # # MwoI: # [GCNNNNNNNGC] # 2 97 153 375 398 592 # 1914 3138 # # NaeI: # [GCCGGC] # 123 6546 # # NcoI: # [CCATGG] # 527 1263 2001 2878 # # NdeI: # [CATATG] # 5 2716 3948 # # NlaIII: # [CATG] # 5 7 32 37 66 119 # 127 132 150 153 188 197 # 198 203 214 220 241 243 # 246 285 316 416 443 522 # 581 633 695 # # NlaIV: # [GGNNCC] # 59 88 94 169 361 1029 # 1305 3564 # # NspBII*: # [CMGCKG] # 55 866 2463 3285 # # NspI: # [RCATGY] # 246 478 741 904 948 3352 # # PasI: # [CCCWGGG] # 1308 5361 # # PflMI: # [CCANNNNNTGG] # 1577 2369 2723 # # PfoI: # [TCCNGGA] # 899 5770 # # PleI: # [GAGTC] # 256 364 760 787 896 3606 # # PpuMI: # [RGGWCCY] # 451 6218 # # PshAI: # [GACNNNNGTC] # 397 6272 # # PsiI: # [TTATAA] # 1346 5323 # # PstI: # [CTGCAG] # 554 1909 4206 # # PvuII: # [CAGCTG] # 55 6614 # # RsaI: # [GTAC] # 6 42 67 100 128 257 # 394 440 468 584 651 909 # 939 1684 # # SalI: # [GTCGAC] # 390 6279 # # SauI*: # [CCTNAGG] # 616 6053 # # ScaI: # [AGTACT] # 1052 5617 # # ScrFI: # [CCNGG] # 130 201 218 278 295 388 # 508 547 557 676 891 1980 # # SduI: # [GDGCHC] # 138 220 373 972 1051 3915 # # SecI*: # [CCNNGG] # 1 15 194 206 262 333 # 345 641 780 1220 1225 1447 # # SetI: # [ASST] # 4 7 10 11 12 13 # 16 17 18 18 22 23 # 27 28 29 32 33 35 # 36 37 43 44 44 45 # 45 46 46 47 52 53 # 57 57 57 58 63 65 # 65 68 72 74 75 80 # 84 84 85 87 87 96 # 98 101 108 113 114 117 # 118 121 126 127 127 128 # 129 132 132 139 152 153 # 157 163 185 190 197 199 # 204 231 316 385 # # SfaNI: # [GCATC] # 51 183 191 210 427 667 # 1026 1183 2731 # # SfeI*: # [CTRYAG] # 211 550 612 884 1029 1091 # 2292 # # SnaBI: # [TACGTA] # 165 1277 5227 # # SpeI: # [ACTAGT] # 462 478 2426 3303 # # SphI: # [GCATGC] # 2413 4256 # # SspI: # [AATATT] # 167 640 1108 1417 3337 # # StyI: # [CCWWGG] # 194 277 333 345 641 2001 # 2878 # # SwaI: # [ATTTAAAT] # 1549 5120 # # TaiI: # [ACGT] # 63 98 153 154 167 171 # 205 217 239 353 553 577 # 591 741 770 1617 # # TaqI: # [TCGA] # 5 9 43 45 51 87 # 117 128 162 179 201 208 # 208 223 228 288 519 591 # 978 1071 1328 # # TaqII: # [CACCCA] # 388 545 580 1263 1569 2324 # # TatI: # [WGTACW] # 65 257 440 470 584 909 # 1167 2777 # # TauI: # [GCSGC] # 3 50 72 174 589 2568 # 3213 # # TfiI: # [GAWTC] # 25 42 45 65 74 92 # 109 139 160 206 223 225 # 272 331 334 360 446 692 # 784 933 1112 # # TseI: # [GCWGC] # 127 305 549 2808 2880 # # TsoI: # [TARCCA] # 42 78 201 459 482 638 # 690 1703 2376 # # Tsp45I: # [GTSAC] # 117 155 563 1135 4699 # # Tsp4CI*: # [ACNGT] # 24 44 90 204 237 396 # 412 493 593 699 720 1203 # 1554 # # TspDTI: # [ATGAA] # 14 15 15 25 30 47 # 54 58 60 64 66 110 # 134 138 184 198 201 242 # 264 272 284 295 323 345 # 355 366 378 383 426 576 # 747 # # TspEI: # [AATT] # 5 6 10 11 11 12 # 12 17 17 17 18 18 # 23 24 27 30 33 34 # 34 38 43 43 44 46 # 47 47 52 56 62 63 # 68 80 84 86 86 94 # 97 101 109 113 113 122 # 127 135 136 148 150 151 # 166 179 180 196 196 199 # 204 216 251 281 282 282 # 307 348 482 # # TspGWI: # [ACGGA] # 41 285 516 652 729 932 # 1597 1917 # # TspRI: # [CASTGNN] # 45 46 131 237 240 296 # 693 834 1005 1267 1875 # # TstI: # [CACNNNNNNTCC] # 32 32 32 593 633 1069 # 4278 # # Tth111I: # [GACNNNGTC] # 3124 3545 # # VspI: # [ATTAAT] # 83 1137 1372 1424 2653 # # XbaI: # [TCTAGA] # 516 1641 4512 # # XhoII: # [RGATCY] # 15 31 52 120 204 246 # 308 363 384 488 639 843 # 1320 1656 # # XmnI: # [GAANNNNTTC] # 349 620 1190 1717 2793 # #--------------------------------------- #--------------------------------------- # Total_sequences: 1 # Total_length: 6669 # Reported_sequences: 1 # Reported_hitcount: 1454 #---------------------------------------