Restriction Fragments for YNL054W-B



Send questions or suggestions to SGD

BLAST search | Genome Restriction Map | Design Primers for this sequence


The currently selected gene/sequence is :

YNL054W-B on chromosome XIV from coordinates 519456 to 524706.

seqfile=/share/crumb/www-data/html/tmp/gcgseq.tmp.3322.2

Start End Strand Enzyme_name Restriction_site 5prime 3prime 5primerev 3primerev 4 8 + TfiI GAWTC 4 7 . . 4 8 + HinfI GANTC 4 7 . . 14 17 + TspEI AATT 13 17 . . 29 34 + TaqII CACCCA 45 43 . . 28 32 - HphI GGTGA 20 19 . . 40 43 + FatI CATG 39 43 . . 40 43 + NlaIII CATG 43 39 . . 40 43 + CviAII CATG 40 42 . . 46 51 + HaeII RGCGCY 50 46 . . 47 50 + Hin6I GCGC 47 49 . . 47 50 + GlaI GCGC 48 48 . . 47 50 + HhaI GCGC 49 47 . . 61 65 + MaeIII GTNAC 60 65 . . 68 72 + DdeI CTNAG 68 71 . . 76 81 + Hpy166II GTNNAC 78 78 . . 87 92 + Hpy178III* TCNNGA 88 90 . . 90 95 + XhoII RGATCY 90 94 . . 91 94 + DpnI GATC 92 92 . . 91 94 + BstKTI GATC 93 91 . . 91 94 + MboI GATC 90 94 . . 91 95 - BinI* GGATC 85 86 . . 93 97 - TspGWI ACGGA 83 81 . . 101 104 + TaiI ACGT 104 100 . . 101 104 + SetI ASST 104 100 . . 101 104 + MaeII ACGT 101 103 . . 108 111 + SetI ASST 111 107 . . 108 111 + CviJI RGCY 109 109 . . 108 111 + AluI AGCT 109 109 . . 116 121 + ApoI RAATTY 116 120 . . 117 120 + TspEI AATT 116 120 . . 120 125 + Hpy178III* TCNNGA 121 123 . . 135 138 + CviJI RGCY 136 136 . . 143 147 + DdeI CTNAG 143 146 . . 147 150 + CviJI RGCY 148 148 . . 170 176 + AarI CACCTGC 180 184 . . 171 174 + SetI ASST 174 170 . . 171 176 + BspMI ACCTGC 180 184 . . 175 185 + MwoI GCNNNNNNNGC 181 178 . . 177 181 - TspDTI ATGAA 167 165 . . 182 187 + PvuII CAGCTG 184 184 . . 182 187 + NspBII* CMGCKG 184 184 . . 183 186 + SetI ASST 186 182 . . 183 186 + CviJI RGCY 184 184 . . 183 186 + AluI AGCT 184 184 . . 189 194 + Hpy178III* TCNNGA 190 192 . . 201 205 + BccI CCATC 209 210 . . 205 208 + FatI CATG 204 208 . . 205 208 + NlaIII CATG 208 204 . . 205 208 + CviAII CATG 205 207 . . 209 212 + MnlI CCTC 219 218 . . 214 217 + MnlI CCTC 224 223 . . 212 217 - BseRI GAGGAG 203 201 . . 224 228 + DdeI CTNAG 224 227 . . 224 228 + BspCNI CTCAG 237 235 . . 224 228 + BseMII CTCAG 238 236 . . 228 232 + Tsp45I GTSAC 227 232 . . 228 232 + MaeIII GTNAC 227 232 . . 238 248 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 244 241 . . 238 248 + PflMI CCANNNNNTGG 244 241 . . 235 239 - HphI GGTGA 227 226 . . 247 251 + BmgT120I GGNCC 248 249 . . 247 251 + AsuI* GGNCC 247 250 . . 248 251 + CviJI RGCY 249 249 . . 248 251 + HaeIII GGCC 249 249 . . 252 255 + Csp6I GTAC 252 254 . . 252 255 + RsaI GTAC 253 253 . . 249 253 - BceAI ACGGC 234 236 . . 257 266 + MslI CAYNNNNRTG 261 261 . . 257 266 + OliI CACNNNNGTG 261 261 . . 259 264 + EcoP15I CAGCAG 289 291 . . 261 266 + BtsI GCAGTG 268 266 . . 262 268 + TspRI CASTGNN 268 259 . . 265 268 + CviRI* TGCA 266 266 . . 267 270 + FatI CATG 266 270 . . 267 270 + NlaIII CATG 270 266 . . 267 270 + CviAII CATG 267 269 . . 285 288 + CviJI RGCY 286 286 . . 292 303 + BstXI CCANNNNNNTGG 299 295 . . 292 296 + BccI CCATC 300 301 . . 295 299 + Hpy188I TCNGA 297 296 . . 311 315 + TspGWI ACGGA 326 324 . . 314 318 + HgaI GACGC 323 328 . . 314 319 + AcyI GRCGYC 315 317 . . 319 323 + BccI CCATC 327 328 . . 327 331 + TfiI GAWTC 327 330 . . 327 331 + HinfI GANTC 327 330 . . 333 338 + Hpy166II GTNNAC 335 335 . . 333 338 + BssNAI GTATAC 335 335 . . 333 338 + AccI GTMKAC 334 336 . . 330 334 - TspGWI ACGGA 320 318 . . 339 342 + SetI ASST 342 338 . . 359 364 + TatI WGTACW 359 363 . . 360 363 + Csp6I GTAC 360 362 . . 360 363 + RsaI GTAC 361 361 . . 369 372 + SetI ASST 372 368 . . 370 374 + BssKI CCNGG 369 374 . . 370 374 + BseBI CCWGG 371 372 . . 370 375 + SecI* CCNNGG 370 374 . . 370 374 + ScrFI CCNGG 371 372 . . 370 374 + EcoRII CCWGG 369 374 . . 373 377 + BmgT120I GGNCC 374 375 . . 373 377 + AsuI* GGNCC 373 376 . . 374 377 + CviJI RGCY 375 375 . . 374 377 + HaeIII GGCC 375 375 . . 384 388 + Tsp4CI* ACNGT 386 385 . . 391 394 + AciI CCGC 391 393 . . 396 401 + BciVI GTATCC 407 406 . . 400 404 + BccI CCATC 408 409 . . 409 414 - MmeI TCCRAC 390 388 . . 418 421 + MnlI CCTC 428 427 . . 420 424 + Hpy188I TCNGA 422 421 . . 421 425 + DdeI CTNAG 421 424 . . 423 428 + SduI GDGCHC 427 423 . . 423 428 + HgiAI* GWGCWC 427 423 . . 421 425 - BspCNI CTCAG 413 411 . . 421 425 - BseMII CTCAG 412 410 . . 430 434 + BccI CCATC 438 439 . . 435 438 + SetI ASST 438 434 . . 436 446 + EcoNI CCTNNNNNAGG 440 441 . . 436 446 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 442 439 . . 437 441 + DdeI CTNAG 437 440 . . 433 437 - HphI GGTGA 425 424 . . 439 443 + PleI GAGTC 447 448 . . 439 443 + MlyI GAGTC 448 448 . . 439 443 + HinfI GANTC 439 442 . . 437 441 - BspCNI CTCAG 429 427 . . 437 441 - BseMII CTCAG 428 426 . . 444 447 + SetI ASST 447 443 . . 460 464 + TfiI GAWTC 460 463 . . 460 464 + HinfI GANTC 460 463 . . 460 470 + Hin4I GAYNNNNNVTC 451 446 483 478 462 466 - TspDTI ATGAA 452 450 . . 467 470 + MnlI CCTC 477 476 . . 467 473 + Bpu10I CCTNAGC 468 471 . . 467 473 + BbvCI CCTCAGC 468 471 . . 464 468 - FokI GGATG 450 454 . . 468 472 + DdeI CTNAG 468 471 . . 468 472 + BspCNI CTCAG 481 479 . . 468 472 + BseMII CTCAG 482 480 . . 464 468 - BseGI GGATG 463 461 . . 470 475 + NspBII* CMGCKG 472 472 . . 475 479 + HinfI GANTC 475 478 . . 472 475 - AciI CCGC 472 474 . . 478 482 + Hpy188I TCNGA 480 479 . . 475 479 - PleI GAGTC 469 470 . . 475 479 - MlyI GAGTC 469 469 . . 481 491 + Hin4I GAYNNNNNVTC 472 467 504 499 481 491 - Hin4I GAYNNNNNVTC 504 499 472 467 488 492 - FokI GGATG 474 478 . . 488 492 - BseGI GGATG 487 485 . . 506 510 + Hpy188I TCNGA 508 507 . . 522 527 + Hpy166II GTNNAC 524 524 . . 522 527 + HpaI GTTAAC 524 524 . . 522 527 + HindII GTYRAC 524 524 . . 523 526 + MseI TTAA 523 525 . . 526 529 + SetI ASST 529 525 . . 527 530 + MnlI CCTC 537 536 . . 531 534 + SetI ASST 534 530 . . 529 533 - HphI GGTGA 521 520 . . 547 550 + TspEI AATT 546 550 . . 554 557 + MseI TTAA 554 556 . . 568 573 + ApoI RAATTY 568 572 . . 569 572 + TspEI AATT 568 572 . . 583 586 + TaqI TCGA 583 585 . . 585 589 + TfiI GAWTC 585 588 . . 585 589 + HinfI GANTC 585 588 . . 603 608 + MmeI TCCRAC 628 626 . . 603 607 + Hpy188I TCNGA 605 604 . . 607 611 + Tsp4CI* ACNGT 609 608 . . 610 615 + Hpy166II GTNNAC 612 612 . . 614 618 + TspGWI ACGGA 629 627 . . 624 629 + SplI* CGTACG 624 628 . . 625 628 + Csp6I GTAC 625 627 . . 625 628 + RsaI GTAC 626 626 . . 627 630 + TaiI ACGT 630 626 . . 627 630 + SetI ASST 630 626 . . 627 630 + MaeII ACGT 627 629 . . 630 634 + Hpy188I TCNGA 632 631 . . 633 636 + DpnI GATC 634 634 . . 633 636 + BstKTI GATC 635 633 . . 633 636 + MboI GATC 632 636 . . 636 642 + TspRI CASTGNN 642 633 . . 644 648 + TspDTI ATGAA 659 657 . . 652 655 + SetI ASST 655 651 . . 653 657 + Hin4II* CCTTC 663 662 . . 650 654 - HphI GGTGA 642 641 . . 675 680 + SspI AATATT 677 677 . . 685 689 + BccI CCATC 693 694 . . 692 695 + TspEI AATT 691 695 . . 699 702 + SetI ASST 702 698 . . 703 706 + SetI ASST 706 702 . . 704 708 + BssKI CCNGG 703 708 . . 704 708 + BseBI CCWGG 705 706 . . 704 709 + SecI* CCNNGG 704 708 . . 704 708 + ScrFI CCNGG 705 706 . . 704 708 + EcoRII CCWGG 703 708 . . 715 725 + Hin4I GAYNNNNNVTC 706 701 738 733 717 721 - FokI GGATG 703 707 . . 717 721 - BseGI GGATG 716 714 . . 715 725 - Hin4I GAYNNNNNVTC 738 733 706 701 724 728 - TspGWI ACGGA 714 712 . . 736 740 + TspGWI ACGGA 751 749 . . 739 744 + EcoRV GATATC 741 741 . . 743 748 + Hpy178III* TCNNGA 744 746 . . 743 748 + BspHI TCATGA 743 747 . . 744 747 + FatI CATG 743 747 . . 744 747 + NlaIII CATG 747 743 . . 744 747 + CviAII CATG 744 746 . . 745 749 + TspDTI ATGAA 760 758 . . 749 754 + ApoI RAATTY 749 753 . . 750 753 + TspEI AATT 749 753 . . 776 779 + CviRI* TGCA 777 777 . . 781 785 + Hpy188I TCNGA 783 782 . . 793 796 - MnlI CCTC 786 785 . . 808 812 + Tsp45I GTSAC 807 812 . . 808 812 + MaeIII GTNAC 807 812 . . 812 817 + SecI* CCNNGG 812 816 . . 813 817 + BssKI CCNGG 812 817 . . 813 817 + BseBI CCWGG 814 815 . . 813 817 + ScrFI CCNGG 814 815 . . 813 817 + EcoRII CCWGG 812 817 . . 819 824 + ApoI RAATTY 819 823 . . 820 823 + TspEI AATT 819 823 . . 824 827 + CviRI* TGCA 825 825 . . 838 843 + TatI WGTACW 838 842 . . 839 844 + Hpy166II GTNNAC 841 841 . . 839 842 + Csp6I GTAC 839 841 . . 839 842 + RsaI GTAC 840 840 . . 842 848 + AarI CACCTGC 852 856 . . 843 846 + SetI ASST 846 842 . . 843 848 + BspMI ACCTGC 852 856 . . 845 850 + PstI CTGCAG 849 845 . . 845 850 + SfeI* CTRYAG 845 849 . . 846 849 + CviRI* TGCA 847 847 . . 851 856 + EcoT22I ATGCAT 855 851 . . 852 855 + CviRI* TGCA 853 853 . . 850 854 - SfaNI GCATC 840 844 . . 868 872 + Tsp45I GTSAC 867 872 . . 868 872 + MaeIII GTNAC 867 872 . . 881 884 + TaqI TCGA 881 883 . . 902 907 - BsmI GAATGC 902 900 . . 905 909 - TspDTI ATGAA 895 893 . . 920 923 + SetI ASST 923 919 . . 925 930 + NspI RCATGY 929 925 . . 925 930 + Cac8I GCNNGC 927 927 . . 925 930 + SphI GCATGC 929 925 . . 926 929 + FatI CATG 925 929 . . 926 929 + NlaIII CATG 929 925 . . 926 929 + CviAII CATG 926 928 . . 932 935 + TspEI AATT 931 935 . . 933 938 + VspI ATTAAT 934 936 . . 934 937 + MseI TTAA 934 936 . . 936 939 + TspEI AATT 935 939 . . 945 948 + SetI ASST 948 944 . . 944 947 - MnlI CCTC 937 936 . . 964 969 + ApoI RAATTY 964 968 . . 965 968 + TspEI AATT 964 968 . . 979 984 + AflIII ACRYGT 979 983 . . 980 985 + BtrI CACGTC 982 982 . . 981 984 + TaiI ACGT 984 980 . . 981 984 + SetI ASST 984 980 . . 981 984 + MaeII ACGT 981 983 . . 987 990 + TaqI TCGA 987 989 . . 1003 1007 + Tsp4CI* ACNGT 1005 1004 . . 1004 1012 + AlwNI CAGNNNCTG 1009 1006 . . 1014 1018 + Tsp4CI* ACNGT 1016 1015 . . 1020 1024 + DdeI CTNAG 1020 1023 . . 1024 1029 + EcoRV GATATC 1026 1026 . . 1030 1033 + FatI CATG 1029 1033 . . 1030 1033 + NlaIII CATG 1033 1029 . . 1030 1033 + CviAII CATG 1030 1032 . . 1040 1044 + TspDTI ATGAA 1055 1053 . . 1042 1046 + MboII GAAGA 1054 1053 . . 1054 1058 + BinI* GGATC 1062 1063 . . 1055 1058 + DpnI GATC 1056 1056 . . 1055 1058 + BstKTI GATC 1057 1055 . . 1055 1058 + MboI GATC 1054 1058 . . 1057 1060 + TaqI TCGA 1057 1059 . . 1057 1062 + Hpy178III* TCNNGA 1058 1060 . . 1071 1074 + SetI ASST 1074 1070 . . 1075 1078 + TspEI AATT 1074 1078 . . 1089 1093 + Hpy188I TCNGA 1091 1090 . . 1101 1105 + MboII GAAGA 1113 1112 . . 1108 1112 + TfiI GAWTC 1108 1111 . . 1108 1112 + HinfI GANTC 1108 1111 . . 1115 1119 + BlsI GCNGC 1117 1116 . . 1115 1119 + BisI GCNGC 1116 1117 . . 1115 1119 + BbvI GCAGC 1127 1131 . . 1115 1119 + TseI GCWGC 1115 1118 . . 1117 1120 + SetI ASST 1120 1116 . . 1117 1120 + CviJI RGCY 1118 1118 . . 1117 1120 + AluI AGCT 1118 1118 . . 1149 1152 + SetI ASST 1152 1148 . . 1149 1152 + CviJI RGCY 1150 1150 . . 1149 1152 + AluI AGCT 1150 1150 . . 1152 1156 + Hpy188I TCNGA 1154 1153 . . 1155 1159 + TfiI GAWTC 1155 1158 . . 1155 1159 + HinfI GANTC 1155 1158 . . 1159 1162 + MnlI CCTC 1169 1168 . . 1174 1177 + TspEI AATT 1173 1177 . . 1176 1181 + AsuII TTCGAA 1177 1179 . . 1177 1180 + TaqI TCGA 1177 1179 . . 1183 1186 + TaqI TCGA 1183 1185 . . 1191 1194 + CviJI RGCY 1192 1192 . . 1193 1197 + BssKI CCNGG 1192 1197 . . 1193 1197 + BseBI CCWGG 1194 1195 . . 1193 1198 + SecI* CCNNGG 1193 1197 . . 1193 1197 + ScrFI CCNGG 1194 1195 . . 1193 1197 + EcoRII CCWGG 1192 1197 . . 1196 1201 + SduI GDGCHC 1200 1196 . . 1196 1201 + HgiJII* GRGCYC 1200 1196 . . 1197 1200 + CviJI RGCY 1198 1198 . . 1201 1212 + TstI CACNNNNNNTCC 1192 1187 1224 1219 1207 1212 + BciVI GTATCC 1218 1217 . . 1228 1233 + GsaI CCCAGC 1232 1228 . . 1228 1233 + BseYI CCCAGC 1228 1232 . . 1234 1238 + TspGWI ACGGA 1249 1247 . . 1243 1247 + TfiI GAWTC 1243 1246 . . 1243 1247 + HinfI GANTC 1243 1246 . . 1247 1251 + BccI CCATC 1255 1256 . . 1266 1277 + BdaI TGANNNNNNTCA 1255 1253 1289 1287 1267 1276 + XmnI GAANNNNTTC 1271 1271 . . 1272 1276 + TfiI GAWTC 1272 1275 . . 1272 1276 + HinfI GANTC 1272 1275 . . 1276 1281 + MfeI CAATTG 1276 1280 . . 1277 1280 + TspEI AATT 1276 1280 . . 1266 1277 - BdaI TGANNNNNNTCA 1289 1287 1255 1253 1295 1298 + SetI ASST 1298 1294 . . 1296 1300 + Hin4II* CCTTC 1306 1305 . . 1298 1302 - TspDTI ATGAA 1288 1286 . . 1303 1307 + DdeI CTNAG 1303 1306 . . 1307 1310 + CviJI RGCY 1308 1308 . . 1307 1310 + HaeIII GGCC 1308 1308 . . 1322 1326 + TfiI GAWTC 1322 1325 . . 1322 1326 + HinfI GANTC 1322 1325 . . 1326 1331 + SfeI* CTRYAG 1326 1330 . . 1328 1332 + Tsp4CI* ACNGT 1330 1329 . . 1346 1355 + MslI CAYNNNNRTG 1350 1350 . . 1349 1353 + Hpy188I TCNGA 1351 1350 . . 1356 1360 + TspDTI ATGAA 1371 1369 . . 1363 1368 + SecI* CCNNGG 1363 1367 . . 1364 1368 + BssKI CCNGG 1363 1368 . . 1364 1368 + BseBI CCWGG 1365 1366 . . 1364 1368 + ScrFI CCNGG 1365 1366 . . 1364 1368 + EcoRII CCWGG 1363 1368 . . 1371 1374 + SetI ASST 1374 1370 . . 1372 1375 + MnlI CCTC 1382 1381 . . 1375 1379 + Hin4II* CCTTC 1385 1384 . . 1378 1383 + Hpy178III* TCNNGA 1379 1381 . . 1380 1383 + TaqI TCGA 1380 1382 . . 1382 1386 + TfiI GAWTC 1382 1385 . . 1382 1386 + HinfI GANTC 1382 1385 . . 1385 1390 + Hpy178III* TCNNGA 1386 1388 . . 1391 1395 + SfaNI GCATC 1400 1404 . . 1394 1399 + Hpy178III* TCNNGA 1395 1397 . . 1404 1409 + PsiI TTATAA 1406 1406 . . 1409 1414 + XhoII RGATCY 1409 1413 . . 1409 1414 + BglII AGATCT 1409 1413 . . 1410 1413 + DpnI GATC 1411 1411 . . 1410 1413 + BstKTI GATC 1412 1410 . . 1410 1413 + MboI GATC 1409 1413 . . 1429 1433 + DdeI CTNAG 1429 1432 . . 1429 1433 + BspCNI CTCAG 1442 1440 . . 1429 1433 + BseMII CTCAG 1443 1441 . . 1433 1437 + SfaNI GCATC 1442 1446 . . 1444 1449 + Hpy178III* TCNNGA 1445 1447 . . 1455 1458 + TaiI ACGT 1458 1454 . . 1455 1458 + SetI ASST 1458 1454 . . 1455 1458 + MaeII ACGT 1455 1457 . . 1463 1467 - SfaNI GCATC 1453 1457 . . 1486 1489 + TspEI AATT 1485 1489 . . 1488 1491 + MseI TTAA 1488 1490 . . 1499 1505 + BstEII GGTNACC 1499 1504 . . 1499 1503 + HphI GGTGA 1511 1510 . . 1500 1504 + Tsp45I GTSAC 1499 1504 . . 1500 1504 + MaeIII GTNAC 1499 1504 . . 1503 1506 + SetI ASST 1506 1502 . . 1509 1512 + TspEI AATT 1508 1512 . . 1518 1524 + PfoI TCCNGGA 1518 1523 . . 1519 1523 + BssKI CCNGG 1518 1523 . . 1519 1523 + BseBI CCWGG 1520 1521 . . 1519 1523 + ScrFI CCNGG 1520 1521 . . 1519 1523 + EcoRII CCWGG 1518 1523 . . 1545 1548 + SetI ASST 1548 1544 . . 1551 1554 + CviRI* TGCA 1552 1552 . . 1567 1570 + CviJI RGCY 1568 1568 . . 1580 1584 + DdeI CTNAG 1580 1583 . . 1580 1584 + BspCNI CTCAG 1593 1591 . . 1580 1584 + BseMII CTCAG 1594 1592 . . 1590 1594 + TspDTI ATGAA 1605 1603 . . 1593 1596 + TspEI AATT 1592 1596 . . 1597 1600 + CviJI RGCY 1598 1598 . . 1598 1602 + BlsI GCNGC 1600 1599 . . 1598 1602 + BisI GCNGC 1599 1600 . . 1598 1602 + TseI GCWGC 1598 1601 . . 1599 1604 + PstI CTGCAG 1603 1599 . . 1599 1604 + SfeI* CTRYAG 1599 1603 . . 1600 1603 + CviRI* TGCA 1601 1601 . . 1598 1602 - BbvI GCAGC 1585 1589 . . 1607 1612 + EcoRV GATATC 1609 1609 . . 1616 1621 + NspI RCATGY 1620 1616 . . 1616 1621 + Cac8I GCNNGC 1618 1618 . . 1616 1621 + SphI GCATGC 1620 1616 . . 1617 1620 + FatI CATG 1616 1620 . . 1617 1620 + NlaIII CATG 1620 1616 . . 1617 1620 + CviAII CATG 1617 1619 . . 1632 1635 + TaiI ACGT 1635 1631 . . 1632 1635 + SetI ASST 1635 1631 . . 1632 1635 + MaeII ACGT 1632 1634 . . 1636 1640 + DdeI CTNAG 1636 1639 . . 1644 1647 + DpnI GATC 1645 1645 . . 1644 1647 + BstKTI GATC 1646 1644 . . 1644 1647 + MboI GATC 1643 1647 . . 1646 1650 + Hpy188I TCNGA 1648 1647 . . 1650 1654 + BceAI ACGGC 1666 1668 . . 1654 1660 + TspRI CASTGNN 1660 1651 . . 1655 1659 + Tsp4CI* ACNGT 1657 1656 . . 1657 1662 + TatI WGTACW 1657 1661 . . 1658 1661 + Csp6I GTAC 1658 1660 . . 1658 1661 + RsaI GTAC 1659 1659 . . 1663 1666 + CviRI* TGCA 1664 1664 . . 1666 1669 + SetI ASST 1669 1665 . . 1683 1687 - BsmAI GTCTC 1677 1681 . . 1692 1696 + BsrI ACTGG 1697 1695 . . 1692 1697 + BfiI ACTGGG 1702 1701 . . 1707 1712 + TatI WGTACW 1707 1711 . . 1707 1712 + ScaI AGTACT 1709 1709 . . 1708 1711 + Csp6I GTAC 1708 1710 . . 1708 1711 + RsaI GTAC 1709 1709 . . 1718 1722 + BccI CCATC 1726 1727 . . 1733 1736 + Csp6I GTAC 1733 1735 . . 1733 1736 + RsaI GTAC 1734 1734 . . 1730 1734 - TspGWI ACGGA 1720 1718 . . 1740 1744 + BccI CCATC 1748 1749 . . 1754 1763 + MslI CAYNNNNRTG 1758 1758 . . 1766 1771 + TatI WGTACW 1766 1770 . . 1767 1772 + Hpy166II GTNNAC 1769 1769 . . 1767 1770 + Csp6I GTAC 1767 1769 . . 1767 1770 + RsaI GTAC 1768 1768 . . 1790 1794 - TspDTI ATGAA 1780 1778 . . 1794 1798 - TspDTI ATGAA 1784 1782 . . 1798 1801 + TaqI TCGA 1798 1800 . . 1800 1805 + BsmI GAATGC 1806 1804 . . 1804 1809 + Cac8I GCNNGC 1806 1806 . . 1807 1812 + MstI* TGCGCA 1809 1809 . . 1808 1811 + Hin6I GCGC 1808 1810 . . 1808 1811 + GlaI GCGC 1809 1809 . . 1808 1811 + HhaI GCGC 1810 1808 . . 1810 1815 + NspI RCATGY 1814 1810 . . 1810 1815 + Cac8I GCNNGC 1812 1812 . . 1810 1815 + SphI GCATGC 1814 1810 . . 1810 1821 + AlfI GCANNNNNNTGC 1799 1797 1833 1831 1811 1820 + MslI CAYNNNNRTG 1815 1815 . . 1811 1814 + FatI CATG 1810 1814 . . 1811 1814 + NlaIII CATG 1814 1810 . . 1811 1814 + CviAII CATG 1811 1813 . . 1819 1822 + CviRI* TGCA 1820 1820 . . 1810 1821 - AlfI GCANNNNNNTGC 1833 1831 1799 1797 1828 1831 + TspEI AATT 1827 1831 . . 1831 1834 + TaqI TCGA 1831 1833 . . 1842 1845 + MseI TTAA 1842 1844 . . 1854 1858 + BccI CCATC 1862 1863 . . 1858 1863 + BsaAI YACGTR 1860 1860 . . 1859 1862 + TaiI ACGT 1862 1858 . . 1859 1862 + SetI ASST 1862 1858 . . 1859 1862 + MaeII ACGT 1859 1861 . . 1866 1869 + MseI TTAA 1866 1868 . . 1871 1875 + TfiI GAWTC 1871 1874 . . 1871 1875 + HinfI GANTC 1871 1874 . . 1874 1878 + Hpy188I TCNGA 1876 1875 . . 1880 1885 + SalI GTCGAC 1880 1884 . . 1880 1885 + Hpy166II GTNNAC 1882 1882 . . 1880 1885 + HindII GTYRAC 1882 1882 . . 1880 1885 + AccI GTMKAC 1881 1883 . . 1881 1884 + TaqI TCGA 1881 1883 . . 1884 1888 + BsrI ACTGG 1889 1887 . . 1890 1893 + MaeI CTAG 1890 1892 . . 1912 1917 + Hpy178III* TCNNGA 1913 1915 . . 1922 1925 + MseI TTAA 1922 1924 . . 1957 1960 + SetI ASST 1960 1956 . . 1959 1964 + Hpy166II GTNNAC 1961 1961 . . 1961 1966 + Hpy178III* TCNNGA 1962 1964 . . 1978 1983 + ApoI RAATTY 1978 1982 . . 1979 1982 + TspEI AATT 1978 1982 . . 1981 1985 - TspDTI ATGAA 1971 1969 . . 1988 1997 + XmnI GAANNNNTTC 1992 1992 . . 2001 2004 + SetI ASST 2004 2000 . . 2021 2025 + BmgT120I GGNCC 2022 2023 . . 2021 2025 + AvaII GGWCC 2021 2024 . . 2021 2025 + AsuI* GGNCC 2021 2024 . . 2027 2032 + Hpy166II GTNNAC 2029 2029 . . 2024 2028 - BsrI ACTGG 2024 2022 . . 2034 2037 + SetI ASST 2037 2033 . . 2046 2051 + Hpy166II GTNNAC 2048 2048 . . 2046 2051 + SduI GDGCHC 2050 2046 . . 2046 2051 + BseSI GKGCMC 2050 2046 . . 2046 2051 + ApaLI GTGCAC 2046 2050 . . 2046 2051 + HgiAI* GWGCWC 2050 2046 . . 2047 2050 + CviRI* TGCA 2048 2048 . . 2051 2055 + BccI CCATC 2059 2060 . . 2052 2056 - FokI GGATG 2038 2042 . . 2052 2056 - BseGI GGATG 2051 2049 . . 2060 2064 - TspDTI ATGAA 2050 2048 . . 2078 2082 - BsmAI GTCTC 2072 2076 . . 2087 2092 + ApoI RAATTY 2087 2091 . . 2088 2091 + TspEI AATT 2087 2091 . . 2091 2095 - TspGWI ACGGA 2081 2079 . . 2113 2118 + McrI* CGRYCG 2116 2114 . . 2115 2119 + Tsp4CI* ACNGT 2117 2116 . . 2116 2126 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2122 2119 . . 2117 2121 + Hpy99I CGWCG 2121 2116 . . 2119 2124 + Hpy178III* TCNNGA 2120 2122 . . 2119 2124 + NruI TCGCGA 2121 2121 . . 2120 2123 + FnuDII* CGCG 2121 2121 . . 2123 2126 - MnlI CCTC 2116 2115 . . 2126 2130 + HinfI GANTC 2126 2129 . . 2126 2130 - PleI GAGTC 2120 2121 . . 2126 2130 - MlyI GAGTC 2120 2120 . . 2134 2137 + MnlI CCTC 2144 2143 . . 2136 2139 + TaqI TCGA 2136 2138 . . 2156 2159 + MaeI CTAG 2156 2158 . . 2158 2161 + SetI ASST 2161 2157 . . 2158 2161 + CviJI RGCY 2159 2159 . . 2158 2161 + AluI AGCT 2159 2159 . . 2166 2169 + MseI TTAA 2166 2168 . . 2173 2183 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2179 2176 . . 2173 2177 - BsrI ACTGG 2173 2171 . . 2182 2185 + CviJI RGCY 2183 2183 . . 2182 2185 + HaeIII GGCC 2183 2183 . . 2184 2195 + BstXI CCANNNNNNTGG 2191 2187 . . 2185 2191 + TspRI CASTGNN 2191 2182 . . 2184 2188 - BsrI ACTGG 2184 2182 . . 2193 2198 - TsoI TARCCA 2183 2181 . . 2206 2210 + BmgT120I GGNCC 2207 2208 . . 2206 2210 + AvaII GGWCC 2206 2209 . . 2206 2210 + AsuI* GGNCC 2206 2209 . . 2208 2212 + Tsp4CI* ACNGT 2210 2209 . . 2209 2214 + DsaI* CCRYGG 2209 2213 . . 2209 2214 + SecI* CCNNGG 2209 2213 . . 2216 2220 + Hpy188I TCNGA 2218 2217 . . 2217 2221 + DdeI CTNAG 2217 2220 . . 2221 2226 + Hpy166II GTNNAC 2223 2223 . . 2221 2226 + BssNAI GTATAC 2223 2223 . . 2217 2221 - BspCNI CTCAG 2209 2207 . . 2217 2221 - BseMII CTCAG 2208 2206 . . 2221 2226 + AccI GTMKAC 2222 2224 . . 2243 2248 + ApoI RAATTY 2243 2247 . . 2244 2247 + TspEI AATT 2243 2247 . . 2271 2274 + FatI CATG 2270 2274 . . 2271 2274 + NlaIII CATG 2274 2270 . . 2271 2274 + CviAII CATG 2271 2273 . . 2286 2291 + NspBII* CMGCKG 2288 2288 . . 2291 2295 + TfiI GAWTC 2291 2294 . . 2291 2295 + HinfI GANTC 2291 2294 . . 2288 2291 - AciI CCGC 2288 2290 . . 2294 2299 + Hpy178III* TCNNGA 2295 2297 . . 2295 2300 + BmeT110I CYCGRG 2296 2298 . . 2295 2300 + AvaI CYCGRG 2295 2299 . . 2298 2303 + SduI GDGCHC 2302 2298 . . 2298 2303 + HgiAI* GWGCWC 2302 2298 . . 2303 2306 + FatI CATG 2302 2306 . . 2303 2306 + NlaIII CATG 2306 2302 . . 2303 2306 + CviAII CATG 2303 2305 . . 2307 2311 + PleI GAGTC 2315 2316 . . 2307 2311 + MlyI GAGTC 2316 2316 . . 2307 2311 + HinfI GANTC 2307 2310 . . 2317 2321 + BceAI ACGGC 2333 2335 . . 2319 2322 + CviJI RGCY 2320 2320 . . 2325 2329 + Tsp4CI* ACNGT 2327 2326 . . 2328 2331 + Csp6I GTAC 2328 2330 . . 2328 2331 + RsaI GTAC 2329 2329 . . 2330 2333 + SetI ASST 2333 2329 . . 2349 2352 + Csp6I GTAC 2349 2351 . . 2349 2352 + RsaI GTAC 2350 2350 . . 2346 2350 - BceAI ACGGC 2331 2333 . . 2358 2361 + CviRI* TGCA 2359 2359 . . 2359 2364 + BsrDI GCAATG 2366 2364 . . 2370 2375 + Hpy166II GTNNAC 2372 2372 . . 2395 2398 + CviRI* TGCA 2396 2396 . . 2400 2403 + TaqI TCGA 2400 2402 . . 2402 2407 + ApoI RAATTY 2402 2406 . . 2403 2406 + TspEI AATT 2402 2406 . . 2422 2427 + ApoI RAATTY 2422 2426 . . 2423 2426 + TspEI AATT 2422 2426 . . 2429 2432 + MaeI CTAG 2429 2431 . . 2431 2434 + SetI ASST 2434 2430 . . 2431 2434 + CviJI RGCY 2432 2432 . . 2431 2434 + AluI AGCT 2432 2432 . . 2437 2440 + SetI ASST 2440 2436 . . 2435 2439 - HphI GGTGA 2427 2426 . . 2455 2458 + CviRI* TGCA 2456 2456 . . 2464 2469 + NspI RCATGY 2468 2464 . . 2465 2468 + FatI CATG 2464 2468 . . 2465 2468 + NlaIII CATG 2468 2464 . . 2465 2468 + CviAII CATG 2465 2467 . . 2468 2478 + MwoI GCNNNNNNNGC 2474 2471 . . 2468 2473 + Cac8I GCNNGC 2470 2470 . . 2471 2474 + CviJI RGCY 2472 2472 . . 2481 2491 + Hin4I GAYNNNNNVTC 2472 2467 2504 2499 2486 2491 + EcoRV GATATC 2488 2488 . . 2481 2491 - Hin4I GAYNNNNNVTC 2504 2499 2472 2467 2492 2497 + TatI WGTACW 2492 2496 . . 2492 2497 + ScaI AGTACT 2494 2494 . . 2493 2496 + Csp6I GTAC 2493 2495 . . 2493 2496 + RsaI GTAC 2494 2494 . . 2500 2504 + MaeIII GTNAC 2499 2504 . . 2503 2506 + SetI ASST 2506 2502 . . 2511 2516 + Hpy166II GTNNAC 2513 2513 . . 2511 2516 + HindII GTYRAC 2513 2513 . . 2508 2513 - TaqII GACCGA 2498 2496 . . 2515 2518 + SetI ASST 2518 2514 . . 2530 2535 + BclI TGATCA 2530 2534 . . 2531 2534 + DpnI GATC 2532 2532 . . 2531 2534 + BstKTI GATC 2533 2531 . . 2531 2534 + MboI GATC 2530 2534 . . 2538 2548 + BsaXI ACNNNNNCTCC 2528 2525 2558 2555 2555 2564 + MslI CAYNNNNRTG 2559 2559 . . 2558 2561 + MnlI CCTC 2568 2567 . . 2555 2559 - FokI GGATG 2541 2545 . . 2555 2559 - BseGI GGATG 2554 2552 . . 2559 2564 - BsiI* CACGAG 2559 2563 . . 2565 2569 + SfaNI GCATC 2574 2578 . . 2565 2575 + MwoI GCNNNNNNNGC 2571 2568 . . 2569 2574 + SecI* CCNNGG 2569 2573 . . 2566 2570 - FokI GGATG 2552 2556 . . 2570 2574 + BssKI CCNGG 2569 2574 . . 2566 2570 - BseGI GGATG 2565 2563 . . 2570 2574 + BseBI CCWGG 2571 2572 . . 2570 2574 + ScrFI CCNGG 2571 2572 . . 2570 2574 + EcoRII CCWGG 2569 2574 . . 2573 2576 + CviJI RGCY 2574 2574 . . 2585 2589 - FokI GGATG 2571 2575 . . 2589 2594 + Esp3I CGTCTC 2595 2599 . . 2585 2589 - BseGI GGATG 2584 2582 . . 2590 2594 + BsmAI GTCTC 2595 2599 . . 2587 2591 - TspGWI ACGGA 2577 2575 . . 2591 2596 + Hpy178III* TCNNGA 2592 2594 . . 2593 2596 + TaqI TCGA 2593 2595 . . 2607 2617 + Hin4I GAYNNNNNVTC 2598 2593 2630 2625 2607 2617 - Hin4I GAYNNNNNVTC 2630 2625 2598 2593 2620 2624 - MboII GAAGA 2612 2611 . . 2624 2628 + BccI CCATC 2632 2633 . . 2625 2629 - FokI GGATG 2611 2615 . . 2625 2629 - BseGI GGATG 2624 2622 . . 2630 2633 + MseI TTAA 2630 2632 . . 2635 2639 + MboII GAAGA 2647 2646 . . 2635 2640 + BbvII* GAAGAC 2642 2646 . . 2639 2643 + Tsp4CI* ACNGT 2641 2640 . . 2665 2669 - MboII GAAGA 2657 2656 . . 2666 2671 - Eco57MI CTGRAG 2651 2649 . . 2666 2671 - Eco57I CTGAAG 2651 2649 . . 2678 2682 + TfiI GAWTC 2678 2681 . . 2678 2682 + HinfI GANTC 2678 2681 . . 2681 2686 + Hpy178III* TCNNGA 2682 2684 . . 2690 2693 + DpnI GATC 2691 2691 . . 2690 2693 + BstKTI GATC 2692 2690 . . 2690 2693 + MboI GATC 2689 2693 . . 2694 2697 + TspEI AATT 2693 2697 . . 2699 2702 + TspEI AATT 2698 2702 . . 2704 2708 + Hpy99I CGWCG 2708 2703 . . 2705 2709 + HgaI GACGC 2714 2719 . . 2718 2721 + TaqI TCGA 2718 2720 . . 2721 2725 + TspDTI ATGAA 2736 2734 . . 2723 2727 + MboII GAAGA 2735 2734 . . 2723 2728 + BbvII* GAAGAC 2730 2734 . . 2729 2732 + MseI TTAA 2729 2731 . . 2733 2737 + Tsp4CI* ACNGT 2735 2734 . . 2738 2741 + MseI TTAA 2738 2740 . . 2759 2763 - TspDTI ATGAA 2749 2747 . . 2761 2766 - BsrDI GCAATG 2760 2758 . . 2765 2769 - HgaI GACGC 2754 2759 . . 2775 2780 + XhoII RGATCY 2775 2779 . . 2776 2779 + DpnI GATC 2777 2777 . . 2776 2779 + BstKTI GATC 2778 2776 . . 2776 2779 + MboI GATC 2775 2779 . . 2778 2783 + MmeI TCCRAC 2803 2801 . . 2776 2780 - BinI* GGATC 2770 2771 . . 2786 2790 + Hpy188I TCNGA 2788 2787 . . 2792 2795 + DpnI GATC 2793 2793 . . 2792 2795 + BstKTI GATC 2794 2792 . . 2792 2795 + MboI GATC 2791 2795 . . 2796 2799 + MseI TTAA 2796 2798 . . 2807 2811 + Hpy188I TCNGA 2809 2808 . . 2814 2817 + TaqI TCGA 2814 2816 . . 2824 2829 + Hpy178III* TCNNGA 2825 2827 . . 2825 2831 + Bpu10I CCTNAGC 2826 2829 . . 2822 2826 - FokI GGATG 2808 2812 . . 2826 2830 + DdeI CTNAG 2826 2829 . . 2822 2826 - BseGI GGATG 2821 2819 . . 2826 2830 - BspCNI CTCAG 2818 2816 . . 2826 2830 - BseMII CTCAG 2817 2815 . . 2854 2857 + SetI ASST 2857 2853 . . 2854 2857 + CviJI RGCY 2855 2855 . . 2854 2857 + AluI AGCT 2855 2855 . . 2860 2864 + PleI GAGTC 2868 2869 . . 2860 2864 + MlyI GAGTC 2869 2869 . . 2860 2864 + HinfI GANTC 2860 2863 . . 2863 2868 + MmeI TCCRAC 2888 2886 . . 2870 2874 + TfiI GAWTC 2870 2873 . . 2870 2874 + HinfI GANTC 2870 2873 . . 2878 2881 + SetI ASST 2881 2877 . . 2879 2882 + MnlI CCTC 2889 2888 . . 2884 2889 + Hpy166II GTNNAC 2886 2886 . . 2884 2889 + HindII GTYRAC 2886 2886 . . 2881 2885 - TspGWI ACGGA 2871 2869 . . 2895 2900 + Eco57MI CTGRAG 2916 2914 . . 2895 2900 + Eco57I CTGAAG 2916 2914 . . 2897 2901 + MboII GAAGA 2909 2908 . . 2900 2904 + TfiI GAWTC 2900 2903 . . 2900 2904 + HinfI GANTC 2900 2903 . . 2902 2907 + AsuII TTCGAA 2903 2905 . . 2903 2906 + TaqI TCGA 2903 2905 . . 2908 2911 + TaiI ACGT 2911 2907 . . 2908 2911 + SetI ASST 2911 2907 . . 2908 2911 + MaeII ACGT 2908 2910 . . 2908 2913 + AflIII ACRYGT 2908 2912 . . 2924 2929 + SspI AATATT 2926 2926 . . 2930 2933 + FnuDII* CGCG 2931 2931 . . 2931 2934 + Hin6I GCGC 2931 2933 . . 2931 2934 + GlaI GCGC 2932 2932 . . 2931 2934 + HhaI GCGC 2933 2931 . . 2934 2939 + TaqII CACCCA 2950 2948 . . 2948 2951 + DpnI GATC 2949 2949 . . 2948 2951 + BstKTI GATC 2950 2948 . . 2948 2951 + MboI GATC 2947 2951 . . 2948 2952 - BinI* GGATC 2942 2943 . . 2966 2970 + Hpy188I TCNGA 2968 2967 . . 2969 2974 + EcoRV GATATC 2971 2971 . . 2974 2978 + Hin4II* CCTTC 2984 2983 . . 2978 2982 + BccI CCATC 2986 2987 . . 2986 2990 + MboII GAAGA 2998 2997 . . 2990 2995 + XhoII RGATCY 2990 2994 . . 2990 2995 + BglII AGATCT 2990 2994 . . 2991 2994 + DpnI GATC 2992 2992 . . 2991 2994 + BstKTI GATC 2993 2991 . . 2986 2991 - Ksp632I* CTCTTC 2981 2984 . . 2991 2994 + MboI GATC 2990 2994 . . 2994 2997 + MaeI CTAG 2994 2996 . . 3006 3011 + ApoI RAATTY 3006 3010 . . 3007 3010 + TspEI AATT 3006 3010 . . 3011 3015 + Hpy188I TCNGA 3013 3012 . . 3014 3019 + EcoRV GATATC 3016 3016 . . 3018 3021 + TaqI TCGA 3018 3020 . . 3018 3023 + Hpy178III* TCNNGA 3019 3021 . . 3023 3028 + TatI WGTACW 3023 3027 . . 3023 3028 + ScaI AGTACT 3025 3025 . . 3024 3027 + Csp6I GTAC 3024 3026 . . 3024 3027 + RsaI GTAC 3025 3025 . . 3026 3030 + BsrI ACTGG 3031 3029 . . 3022 3033 - PpiI GAACNNNNNCTC 3045 3040 3013 3008 3041 3046 + EcoT22I ATGCAT 3045 3041 . . 3042 3045 + CviRI* TGCA 3043 3043 . . 3073 3076 + FatI CATG 3072 3076 . . 3073 3076 + NlaIII CATG 3076 3072 . . 3073 3076 + CviAII CATG 3073 3075 . . 3076 3080 - BslFI GGGAC 3061 3065 . . 3092 3095 + FatI CATG 3091 3095 . . 3092 3095 + NlaIII CATG 3095 3091 . . 3092 3095 + CviAII CATG 3092 3094 . . 3093 3097 + TspDTI ATGAA 3108 3106 . . 3095 3099 + TfiI GAWTC 3095 3098 . . 3095 3099 + HinfI GANTC 3095 3098 . . 3099 3103 + Hpy99I CGWCG 3103 3098 . . 3108 3112 - BsrI ACTGG 3108 3106 . . 3126 3130 + Hpy188I TCNGA 3128 3127 . . 3133 3137 + DdeI CTNAG 3133 3136 . . 3133 3137 + BspCNI CTCAG 3146 3144 . . 3133 3137 + BseMII CTCAG 3147 3145 . . 3134 3138 + Hpy188I TCNGA 3136 3135 . . 3137 3141 + HinfI GANTC 3137 3140 . . 3137 3141 - PleI GAGTC 3131 3132 . . 3137 3141 - MlyI GAGTC 3131 3131 . . 3142 3145 + Csp6I GTAC 3142 3144 . . 3142 3145 + RsaI GTAC 3143 3143 . . 3144 3148 + Tsp4CI* ACNGT 3146 3145 . . 3145 3151 + TspRI CASTGNN 3151 3142 . . 3147 3151 + Tsp45I GTSAC 3146 3151 . . 3147 3151 + MaeIII GTNAC 3146 3151 . . 3154 3165 + BdaI TGANNNNNNTCA 3143 3141 3177 3175 3155 3159 - BsmAI GTCTC 3149 3153 . . 3154 3165 - BdaI TGANNNNNNTCA 3177 3175 3143 3141 3167 3177 + BaeI ACNNNNGTAYC 3156 3151 3189 3184 3171 3174 + TaiI ACGT 3174 3170 . . 3171 3174 + SetI ASST 3174 3170 . . 3171 3174 + MaeII ACGT 3171 3173 . . 3173 3176 + Csp6I GTAC 3173 3175 . . 3173 3176 + RsaI GTAC 3174 3174 . . 3186 3189 + Csp6I GTAC 3186 3188 . . 3186 3189 + RsaI GTAC 3187 3187 . . 3183 3187 - BsrI ACTGG 3183 3181 . . 3194 3199 + KpnI GGTACC 3198 3194 . . 3194 3199 + NlaIV GGNNCC 3196 3196 . . 3194 3199 + HgiCI* GGYRCC 3194 3198 . . 3194 3199 + Acc65I GGTACC 3194 3198 . . 3195 3198 + Csp6I GTAC 3195 3197 . . 3195 3198 + RsaI GTAC 3196 3196 . . 3209 3213 + Tsp4CI* ACNGT 3211 3210 . . 3215 3218 + AciI CCGC 3215 3217 . . 3237 3241 + DdeI CTNAG 3237 3240 . . 3233 3237 - BsmAI GTCTC 3227 3231 . . 3237 3241 - BspCNI CTCAG 3229 3227 . . 3237 3241 - BseMII CTCAG 3228 3226 . . 3255 3259 + Tsp4CI* ACNGT 3257 3256 . . 3258 3263 + Hpy166II GTNNAC 3260 3260 . . 3262 3265 + SetI ASST 3265 3261 . . 3263 3267 + Hin4II* CCTTC 3273 3272 . . 3260 3264 - HphI GGTGA 3252 3251 . . 3266 3269 + TaqI TCGA 3266 3268 . . 3267 3272 + McrI* CGRYCG 3270 3268 . . 3267 3272 + PvuI CGATCG 3270 3268 . . 3268 3271 + DpnI GATC 3269 3269 . . 3268 3271 + BstKTI GATC 3270 3268 . . 3268 3271 + MboI GATC 3267 3271 . . 3269 3274 + ClaI ATCGAT 3270 3272 . . 3270 3273 + TaqI TCGA 3270 3272 . . 3272 3282 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3263 3258 3295 3290 3279 3282 + MnlI CCTC 3289 3288 . . 3284 3288 + Hpy188I TCNGA 3286 3285 . . 3293 3296 + TspEI AATT 3292 3296 . . 3305 3310 + BtrI CACGTC 3307 3307 . . 3306 3309 + TaiI ACGT 3309 3305 . . 3306 3309 + SetI ASST 3309 3305 . . 3306 3309 + MaeII ACGT 3306 3308 . . 3307 3311 + Hpy99I CGWCG 3311 3306 . . 3323 3326 + TaiI ACGT 3326 3322 . . 3323 3326 + SetI ASST 3326 3322 . . 3323 3326 + MaeII ACGT 3323 3325 . . 3326 3330 + Hpy188I TCNGA 3328 3327 . . 3332 3335 + SetI ASST 3335 3331 . . 3338 3344 + SauI* CCTNAGG 3339 3342 . . 3339 3343 + DdeI CTNAG 3339 3342 . . 3356 3360 + TfiI GAWTC 3356 3359 . . 3353 3356 - MnlI CCTC 3346 3345 . . 3356 3360 + HinfI GANTC 3356 3359 . . 3364 3367 + TspEI AATT 3363 3367 . . 3371 3374 + DpnI GATC 3372 3372 . . 3371 3374 + BstKTI GATC 3373 3371 . . 3371 3374 + MboI GATC 3370 3374 . . 3373 3377 - MboII GAAGA 3365 3364 . . 3382 3387 + Hpy178III* TCNNGA 3383 3385 . . 3386 3389 + DpnI GATC 3387 3387 . . 3386 3389 + BstKTI GATC 3388 3386 . . 3386 3389 + MboI GATC 3385 3389 . . 3392 3395 + MnlI CCTC 3402 3401 . . 3394 3399 + Hpy178III* TCNNGA 3395 3397 . . 3393 3398 - Eco57MI CTGRAG 3378 3376 . . 3393 3398 - GsuI CTGGAG 3378 3376 . . 3400 3403 + SetI ASST 3403 3399 . . 3401 3404 + MnlI CCTC 3411 3410 . . 3411 3414 + TspEI AATT 3410 3414 . . 3416 3420 + Hpy188I TCNGA 3418 3417 . . 3419 3423 + HinfI GANTC 3419 3422 . . 3419 3423 - PleI GAGTC 3413 3414 . . 3419 3423 - MlyI GAGTC 3413 3413 . . 3425 3430 + AhaIII* TTTAAA 3427 3427 . . 3426 3429 + MseI TTAA 3426 3428 . . 3442 3452 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3433 3428 3465 3460 3442 3445 + DpnI GATC 3443 3443 . . 3442 3445 + BstKTI GATC 3444 3442 . . 3442 3445 + MboI GATC 3441 3445 . . 3446 3449 + TspEI AATT 3445 3449 . . 3461 3464 + TspEI AATT 3460 3464 . . 3465 3469 - BsrI ACTGG 3465 3463 . . 3471 3476 - TaqII CACCCA 3461 3459 . . 3482 3486 + HphI GGTGA 3494 3493 . . 3483 3487 + Tsp45I GTSAC 3482 3487 . . 3483 3487 + MaeIII GTNAC 3482 3487 . . 3485 3489 + HinfI GANTC 3485 3488 . . 3485 3489 - PleI GAGTC 3479 3480 . . 3485 3489 - MlyI GAGTC 3479 3479 . . 3510 3514 + Tsp4CI* ACNGT 3512 3511 . . 3522 3525 + DpnI GATC 3523 3523 . . 3522 3525 + BstKTI GATC 3524 3522 . . 3522 3525 + MboI GATC 3521 3525 . . 3530 3534 + MboII GAAGA 3542 3541 . . 3537 3541 + TspDTI ATGAA 3552 3550 . . 3547 3550 + TspEI AATT 3546 3550 . . 3549 3552 + MseI TTAA 3549 3551 . . 3552 3555 + SetI ASST 3555 3551 . . 3557 3562 + Hpy178III* TCNNGA 3558 3560 . . 3558 3563 + BsiI* CACGAG 3558 3562 . . 3561 3565 - BsmAI GTCTC 3555 3559 . . 3567 3570 + FatI CATG 3566 3570 . . 3567 3570 + NlaIII CATG 3570 3566 . . 3567 3570 + CviAII CATG 3567 3569 . . 3576 3580 + DdeI CTNAG 3576 3579 . . 3598 3601 + SetI ASST 3601 3597 . . 3599 3602 + MnlI CCTC 3609 3608 . . 3601 3605 + Hpy188I TCNGA 3603 3602 . . 3606 3609 + DpnI GATC 3607 3607 . . 3606 3609 + BstKTI GATC 3608 3606 . . 3606 3609 + MboI GATC 3605 3609 . . 3608 3611 + TaqI TCGA 3608 3610 . . 3610 3614 + MboII GAAGA 3622 3621 . . 3618 3623 + EcoRI GAATTC 3618 3622 . . 3618 3623 + ApoI RAATTY 3618 3622 . . 3619 3622 + TspEI AATT 3618 3622 . . 3624 3627 + SetI ASST 3627 3623 . . 3622 3626 - HphI GGTGA 3614 3613 . . 3631 3634 + CviRI* TGCA 3632 3632 . . 3632 3636 + BlsI GCNGC 3634 3633 . . 3632 3636 + BisI GCNGC 3633 3634 . . 3632 3636 + BbvI GCAGC 3644 3648 . . 3632 3636 + TseI GCWGC 3632 3635 . . 3633 3638 + PvuII CAGCTG 3635 3635 . . 3633 3638 + NspBII* CMGCKG 3635 3635 . . 3634 3637 + SetI ASST 3637 3633 . . 3634 3637 + CviJI RGCY 3635 3635 . . 3634 3637 + AluI AGCT 3635 3635 . . 3635 3645 + MwoI GCNNNNNNNGC 3641 3638 . . 3667 3671 + TspGWI ACGGA 3682 3680 . . 3674 3677 + SetI ASST 3677 3673 . . 3689 3692 - MnlI CCTC 3682 3681 . . 3698 3701 + SetI ASST 3701 3697 . . 3696 3700 - HphI GGTGA 3688 3687 . . 3714 3717 + MseI TTAA 3714 3716 . . 3735 3738 + TaqI TCGA 3735 3737 . . 3737 3740 - MnlI CCTC 3730 3729 . . 3763 3767 + Tsp4CI* ACNGT 3765 3764 . . 3769 3773 + MboII GAAGA 3781 3780 . . 3773 3777 + TspDTI ATGAA 3788 3786 . . 3783 3787 + BslFI GGGAC 3797 3801 . . 3787 3793 + TspRI CASTGNN 3793 3784 . . 3795 3800 + SspI AATATT 3797 3797 . . 3835 3840 + ApoI RAATTY 3835 3839 . . 3836 3839 + TspEI AATT 3835 3839 . . 3849 3853 - MboII GAAGA 3841 3840 . . 3862 3865 + TaiI ACGT 3865 3861 . . 3862 3865 + SetI ASST 3865 3861 . . 3862 3865 + MaeII ACGT 3862 3864 . . 3864 3868 + Tsp45I GTSAC 3863 3868 . . 3864 3868 + MaeIII GTNAC 3863 3868 . . 3865 3876 + BdaI TGANNNNNNTCA 3854 3852 3888 3886 3867 3871 + Tsp4CI* ACNGT 3869 3868 . . 3870 3873 + Csp6I GTAC 3870 3872 . . 3870 3873 + RsaI GTAC 3871 3871 . . 3865 3876 - BdaI TGANNNNNNTCA 3888 3886 3854 3852 3880 3883 + SetI ASST 3883 3879 . . 3880 3883 + CviJI RGCY 3881 3881 . . 3880 3883 + AluI AGCT 3881 3881 . . 3882 3885 + MaeI CTAG 3882 3884 . . 3892 3895 + CviRI* TGCA 3893 3893 . . 3898 3901 + SetI ASST 3901 3897 . . 3899 3903 + HphI GGTGA 3911 3910 . . 3897 3900 - MnlI CCTC 3890 3889 . . 3910 3914 + SfaNI GCATC 3919 3923 . . 3913 3918 + Hpy178III* TCNNGA 3914 3916 . . 3911 3915 - FokI GGATG 3897 3901 . . 3911 3915 - BseGI GGATG 3910 3908 . . 3926 3930 + HinfI GANTC 3926 3929 . . 3928 3932 + DdeI CTNAG 3928 3931 . . 3928 3932 + BspCNI CTCAG 3941 3939 . . 3928 3932 + BseMII CTCAG 3942 3940 . . 3926 3930 - PleI GAGTC 3920 3921 . . 3926 3930 - MlyI GAGTC 3920 3920 . . 3933 3938 + NspI RCATGY 3937 3933 . . 3933 3938 + Cac8I GCNNGC 3935 3935 . . 3933 3938 + SphI GCATGC 3937 3933 . . 3934 3937 + FatI CATG 3933 3937 . . 3934 3937 + NlaIII CATG 3937 3933 . . 3934 3937 + CviAII CATG 3934 3936 . . 3936 3939 + CviRI* TGCA 3937 3937 . . 3947 3951 + Tsp4CI* ACNGT 3949 3948 . . 3950 3953 + Csp6I GTAC 3950 3952 . . 3950 3953 + RsaI GTAC 3951 3951 . . 3953 3962 + MslI CAYNNNNRTG 3957 3957 . . 3960 3965 + EcoT22I ATGCAT 3964 3960 . . 3961 3964 + CviRI* TGCA 3962 3962 . . 3970 3981 + DrdI GACNNNNNNGTC 3976 3974 . . 3972 3976 - FokI GGATG 3958 3962 . . 3972 3976 - BseGI GGATG 3971 3969 . . 3979 3983 + Tsp45I GTSAC 3978 3983 . . 3979 3983 + MaeIII GTNAC 3978 3983 . . 3985 3988 + CviRI* TGCA 3986 3986 . . 4014 4017 + TspEI AATT 4013 4017 . . 4025 4029 - MboII GAAGA 4017 4016 . . 4042 4045 + CviRI* TGCA 4043 4043 . . 4055 4059 + MboII GAAGA 4067 4066 . . 4059 4062 + TspEI AATT 4058 4062 . . 4072 4075 + SetI ASST 4075 4071 . . 4073 4076 + MnlI CCTC 4083 4082 . . 4079 4089 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 4085 4082 . . 4091 4095 + TspDTI ATGAA 4106 4104 . . 4108 4111 + TaiI ACGT 4111 4107 . . 4108 4111 + SetI ASST 4111 4107 . . 4108 4111 + MaeII ACGT 4108 4110 . . 4114 4118 + MboII GAAGA 4126 4125 . . 4147 4150 + CviRI* TGCA 4148 4148 . . 4152 4156 + BsrI ACTGG 4157 4155 . . 4158 4162 + TspDTI ATGAA 4173 4171 . . 4165 4168 + DpnI GATC 4166 4166 . . 4165 4168 + BstKTI GATC 4167 4165 . . 4165 4168 + MboI GATC 4164 4168 . . 4177 4181 + Hpy188I TCNGA 4179 4178 . . 4199 4203 + MboII GAAGA 4211 4210 . . 4199 4208 + XmnI GAANNNNTTC 4203 4203 . . 4208 4211 + FnuDII* CGCG 4209 4209 . . 4211 4215 + FokI GGATG 4224 4228 . . 4211 4215 + BseGI GGATG 4217 4215 . . 4209 4212 - AciI CCGC 4209 4211 . . 4212 4216 - BccI CCATC 4206 4207 . . 4218 4221 + FatI CATG 4217 4221 . . 4218 4221 + NlaIII CATG 4221 4217 . . 4218 4221 + CviAII CATG 4218 4220 . . 4227 4230 + MseI TTAA 4227 4229 . . 4241 4245 + MaeIII GTNAC 4240 4245 . . 4246 4249 + TspEI AATT 4245 4249 . . 4269 4280 + BdaI TGANNNNNNTCA 4258 4256 4292 4290 4269 4280 - BdaI TGANNNNNNTCA 4292 4290 4258 4256 4289 4292 + MseI TTAA 4289 4291 . . 4294 4297 + CviRI* TGCA 4295 4295 . . 4319 4324 + SmlI CTYRAG 4319 4323 . . 4320 4325 + Hpy178III* TCNNGA 4321 4323 . . 4319 4324 - Bce83I* CTTGAG 4304 4302 . . 4342 4352 + Hin4I GAYNNNNNVTC 4333 4328 4365 4360 4342 4352 - Hin4I GAYNNNNNVTC 4365 4360 4333 4328 4355 4359 + HphI GGTGA 4367 4366 . . 4353 4358 - TaqII CACCCA 4343 4341 . . 4371 4376 + ApoI RAATTY 4371 4375 . . 4372 4375 + TspEI AATT 4371 4375 . . 4378 4381 + Csp6I GTAC 4378 4380 . . 4378 4381 + RsaI GTAC 4379 4379 . . 4392 4402 + Hin4I GAYNNNNNVTC 4383 4378 4415 4410 4399 4409 + Hin4I GAYNNNNNVTC 4390 4385 4422 4417 4399 4402 + DpnI GATC 4400 4400 . . 4399 4402 + BstKTI GATC 4401 4399 . . 4399 4402 + MboI GATC 4398 4402 . . 4392 4402 - Hin4I GAYNNNNNVTC 4415 4410 4383 4378 4399 4409 - Hin4I GAYNNNNNVTC 4422 4417 4390 4385 4419 4424 + TatI WGTACW 4419 4423 . . 4420 4423 + Csp6I GTAC 4420 4422 . . 4420 4423 + RsaI GTAC 4421 4421 . . 4423 4426 + FatI CATG 4422 4426 . . 4423 4426 + NlaIII CATG 4426 4422 . . 4423 4426 + CviAII CATG 4423 4425 . . 4424 4428 + TspDTI ATGAA 4439 4437 . . 4428 4431 + TspEI AATT 4427 4431 . . 4432 4435 + SetI ASST 4435 4431 . . 4458 4461 + TspEI AATT 4457 4461 . . 4472 4477 + AclI AACGTT 4473 4475 . . 4473 4476 + TaiI ACGT 4476 4472 . . 4473 4476 + SetI ASST 4476 4472 . . 4473 4476 + MaeII ACGT 4473 4475 . . 4479 4486 + SwaI ATTTAAAT 4482 4482 . . 4476 4480 - TspDTI ATGAA 4466 4464 . . 4480 4485 + AhaIII* TTTAAA 4482 4482 . . 4481 4484 + MseI TTAA 4481 4483 . . 4502 4506 + DdeI CTNAG 4502 4505 . . 4505 4510 + HaeII RGCGCY 4509 4505 . . 4505 4510 + Eco47III AGCGCT 4507 4507 . . 4506 4509 + Hin6I GCGC 4506 4508 . . 4506 4509 + GlaI GCGC 4507 4507 . . 4506 4509 + HhaI GCGC 4508 4506 . . 4511 4515 + BssKI CCNGG 4510 4515 . . 4511 4515 + BseBI CCWGG 4512 4513 . . 4511 4515 + ScrFI CCNGG 4512 4513 . . 4511 4515 + EcoRII CCWGG 4510 4515 . . 4513 4516 + SetI ASST 4516 4512 . . 4509 4514 - Eco57MI CTGRAG 4494 4492 . . 4509 4514 - GsuI CTGGAG 4494 4492 . . 4515 4520 + Hpy166II GTNNAC 4517 4517 . . 4515 4520 + HindII GTYRAC 4517 4517 . . 4519 4525 + SexAI ACCWGGT 4519 4524 . . 4520 4524 + BssKI CCNGG 4519 4524 . . 4520 4524 + BseBI CCWGG 4521 4522 . . 4520 4524 + ScrFI CCNGG 4521 4522 . . 4520 4524 + EcoRII CCWGG 4519 4524 . . 4522 4525 + SetI ASST 4525 4521 . . 4537 4541 + BssKI CCNGG 4536 4541 . . 4537 4541 + BseBI CCWGG 4538 4539 . . 4537 4541 + ScrFI CCNGG 4538 4539 . . 4537 4541 + EcoRII CCWGG 4536 4541 . . 4540 4544 + FokI GGATG 4553 4557 . . 4540 4544 + BseGI GGATG 4546 4544 . . 4542 4546 + TspDTI ATGAA 4557 4555 . . 4547 4550 + MaeI CTAG 4547 4549 . . 4557 4561 + TspDTI ATGAA 4572 4570 . . 4559 4563 + MboII GAAGA 4571 4570 . . 4563 4567 + TspDTI ATGAA 4578 4576 . . 4578 4581 + SetI ASST 4581 4577 . . 4576 4580 - Hin4II* CCTTC 4570 4569 . . 4580 4583 + Csp6I GTAC 4580 4582 . . 4580 4583 + RsaI GTAC 4581 4581 . . 4583 4586 + FatI CATG 4582 4586 . . 4583 4586 + NlaIII CATG 4586 4582 . . 4583 4586 + CviAII CATG 4583 4585 . . 4584 4588 + TspDTI ATGAA 4599 4597 . . 4590 4593 + CviRI* TGCA 4591 4591 . . 4607 4610 + MaeI CTAG 4607 4609 . . 4609 4612 + SetI ASST 4612 4608 . . 4609 4612 + CviJI RGCY 4610 4610 . . 4609 4612 + AluI AGCT 4610 4610 . . 4614 4619 + NdeI CATATG 4615 4617 . . 4612 4616 - TspDTI ATGAA 4602 4600 . . 4619 4624 - MmeI TCCRAC 4600 4598 . . 4628 4633 + ApoI RAATTY 4628 4632 . . 4629 4632 + TspEI AATT 4628 4632 . . 4686 4689 + MnlI CCTC 4696 4695 . . 4689 4692 + MaeI CTAG 4689 4691 . . 4705 4708 + FatI CATG 4704 4708 . . 4705 4708 + NlaIII CATG 4708 4704 . . 4705 4708 + CviAII CATG 4705 4707 . . 4710 4715 + NdeI CATATG 4711 4713 . . 4718 4721 + MseI TTAA 4718 4720 . . 4724 4735 + CspCI CAANNNNNGTGG 4712 4710 4747 4745 4725 4728 + TspEI AATT 4724 4728 . . 4729 4732 + FatI CATG 4728 4732 . . 4729 4732 + NlaIII CATG 4732 4728 . . 4729 4732 + CviAII CATG 4729 4731 . . 4727 4731 - TspDTI ATGAA 4717 4715 . . 4734 4738 + BslFI GGGAC 4748 4752 . . 4740 4743 + MaeI CTAG 4740 4742 . . 4774 4777 + SetI ASST 4777 4773 . . 4782 4785 + CviJI RGCY 4783 4783 . . 4795 4800 + SpeI ACTAGT 4795 4799 . . 4796 4799 + MaeI CTAG 4796 4798 . . 4807 4817 + FalI AAGNNNNNCTT 4798 4793 4830 4825 4809 4814 + BtgZI GCGATG 4824 4828 . . 4811 4815 - SfaNI GCATC 4801 4805 . . 4807 4817 - FalI AAGNNNNNCTT 4830 4825 4798 4793 4818 4823 + NdeI CATATG 4819 4821 . . 4816 4820 - TspDTI ATGAA 4806 4804 . . 4823 4829 + BstEII GGTNACC 4823 4828 . . 4824 4828 + MaeIII GTNAC 4823 4828 . . 4825 4830 + TsoI TARCCA 4841 4839 . . 4843 4847 + Tsp45I GTSAC 4842 4847 . . 4843 4847 + MaeIII GTNAC 4842 4847 . . 4849 4852 + TspEI AATT 4848 4852 . . 4854 4858 + MaeIII GTNAC 4853 4858 . . 4872 4876 + TspGWI ACGGA 4887 4885 . . 4887 4890 - MnlI CCTC 4880 4879 . . 4894 4899 + SalI GTCGAC 4894 4898 . . 4894 4899 + Hpy166II GTNNAC 4896 4896 . . 4894 4899 + HindII GTYRAC 4896 4896 . . 4894 4899 + AccI GTMKAC 4895 4897 . . 4895 4898 + TaqI TCGA 4895 4897 . . 4903 4906 + CviJI RGCY 4904 4904 . . 4909 4914 + Hpy166II GTNNAC 4911 4911 . . 4909 4914 + HpaI GTTAAC 4911 4911 . . 4909 4914 + HindII GTYRAC 4911 4911 . . 4910 4913 + MseI TTAA 4910 4912 . . 4913 4918 + NspI RCATGY 4917 4913 . . 4914 4917 + FatI CATG 4913 4917 . . 4914 4917 + NlaIII CATG 4917 4913 . . 4914 4917 + CviAII CATG 4914 4916 . . 4916 4919 + CviRI* TGCA 4917 4917 . . 4926 4931 + SfeI* CTRYAG 4926 4930 . . 4931 4943 + BarI GAAGNNNNNNTAC 4923 4918 4955 4950 4951 4957 + TspRI CASTGNN 4957 4948 . . 4955 4964 + XmnI GAANNNNTTC 4959 4959 . . 4957 4960 + SetI ASST 4960 4956 . . 4957 4960 + CviJI RGCY 4958 4958 . . 4957 4960 + AluI AGCT 4958 4958 . . 4964 4967 + AciI CCGC 4964 4966 . . 4971 4982 + BdaI TGANNNNNNTCA 4960 4958 4994 4992 4977 4980 + SetI ASST 4980 4976 . . 4978 4981 + MnlI CCTC 4988 4987 . . 4979 4983 + DdeI CTNAG 4979 4982 . . 4979 4983 + BspCNI CTCAG 4992 4990 . . 4979 4983 + BseMII CTCAG 4993 4991 . . 4971 4982 - BdaI TGANNNNNNTCA 4994 4992 4960 4958 4983 4987 + Tsp45I GTSAC 4982 4987 . . 4983 4987 + MaeIII GTNAC 4982 4987 . . 4985 4993 + DraIII CACNNNGTG 4990 4987 . . 4986 4989 + SetI ASST 4989 4985 . . 4984 4988 - HphI GGTGA 4976 4975 . . 4992 4995 + CviRI* TGCA 4993 4993 . . 5001 5004 + MseI TTAA 5001 5003 . . 5014 5017 + TspEI AATT 5013 5017 . . 5019 5022 + MseI TTAA 5019 5021 . . 5022 5032 + FalI AAGNNNNNCTT 5013 5008 5045 5040 5024 5027 + CviJI RGCY 5025 5025 . . 5022 5032 - FalI AAGNNNNNCTT 5045 5040 5013 5008 5036 5046 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5027 5022 5059 5054 5043 5053 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5034 5029 5066 5061 5043 5046 + DpnI GATC 5044 5044 . . 5043 5046 + BstKTI GATC 5045 5043 . . 5043 5046 + MboI GATC 5042 5046 . . 5036 5046 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5059 5054 5027 5022 5050 5053 + DpnI GATC 5051 5051 . . 5050 5053 + BstKTI GATC 5052 5050 . . 5050 5053 + MboI GATC 5049 5053 . . 5043 5053 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5066 5061 5034 5029 5059 5062 + TspEI AATT 5058 5062 . . 5061 5064 + MseI TTAA 5061 5063 . . 5065 5070 + Hpy166II GTNNAC 5067 5067 . . 5065 5070 + AccI GTMKAC 5066 5068 . . 5073 5077 + TspDTI ATGAA 5088 5086 . . 5075 5079 + MboII GAAGA 5087 5086 . . 5075 5080 - Ksp632I* CTCTTC 5070 5073 . . 5081 5086 + ApoI RAATTY 5081 5085 . . 5082 5085 + TspEI AATT 5081 5085 . . 5111 5116 + BsrDI GCAATG 5118 5116 . . 5120 5124 + DdeI CTNAG 5120 5123 . . 5116 5120 - BsmAI GTCTC 5110 5114 . . 5126 5136 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5117 5112 5149 5144 5127 5131 + TspDTI ATGAA 5142 5140 . . 5126 5136 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5149 5144 5117 5112 5137 5140 + SetI ASST 5140 5136 . . 5144 5147 + TspEI AATT 5143 5147 . . 5150 5155 + SnaBI TACGTA 5152 5152 . . 5150 5155 + BsaAI YACGTR 5152 5152 . . 5151 5154 + TaiI ACGT 5154 5150 . . 5151 5154 + SetI ASST 5154 5150 . . 5151 5154 + MaeII ACGT 5151 5153 . . 5153 5158 + Hpy166II GTNNAC 5155 5155 . . 5153 5158 + BssNAI GTATAC 5155 5155 . . 5153 5158 + AccI GTMKAC 5154 5156 . . 5163 5166 + TaqI TCGA 5163 5165 . . 5163 5168 + Hpy178III* TCNNGA 5164 5166 . . 5165 5169 - BsmAI GTCTC 5159 5163 . . 5165 5170 - Eco31I GGTCTC 5159 5163 . . 5173 5177 + MboII GAAGA 5185 5184 . . 5179 5184 - BsrDI GCAATG 5178 5176 . . 5194 5204 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5185 5180 5217 5212 5200 5203 + SetI ASST 5203 5199 . . 5201 5204 + MnlI CCTC 5211 5210 . . 5202 5207 + Ksp632I* CTCTTC 5208 5211 . . 5206 5210 + Hpy188I TCNGA 5208 5207 . . 5203 5207 - MboII GAAGA 5195 5194 . . 5219 5224 + AhaIII* TTTAAA 5221 5221 . . 5220 5223 + MseI TTAA 5220 5222 . . 5228 5231 + MseI TTAA 5228 5230 . . 5242 5246 + TfiI GAWTC 5242 5245 . . 5242 5246 + HinfI GANTC 5242 5245 . . 5244 5248 - TspDTI ATGAA 5234 5232 . . #--------------------------------------- # # # AarI: # [CACCTGC] # 180 672 4399 # # Acc65I: # [GGTACC] # 2057 3194 # # AccI: # [GTMKAC] # 88 97 171 334 341 1547 # 2673 # # AciI: # [CCGC] # 81 287 391 755 927 994 # 1816 # # AclI: # [AACGTT] # 778 4473 # # AcyI: # [GRCGYC] # 315 4936 # # AflIII: # [ACRYGT] # 979 1929 2343 # # AhaIII*: # [TTTAAA] # 30 739 1055 3427 # # AlfI: # [GCANNNNNNTGC] # 0 0 34 1799 3418 # # AluI: # [AGCT] # 32 75 109 246 273 293 # 348 423 729 780 934 1009 # # AlwNI: # [CAGNNNCTG] # 1009 4242 # # ApaLI: # [GTGCAC] # 2046 3205 # # ApoI: # [RAATTY] # 20 70 109 116 145 156 # 159 170 181 217 257 452 # 453 536 584 612 1014 # # AsuI*: # [GGNCC] # 126 185 247 1648 3045 # # AsuII: # [TTCGAA] # 1177 1726 2348 # # AvaI: # [CYCGRG] # 2295 2956 # # AvaII: # [GGWCC] # 185 2021 3045 # # BaeI: # [ACNNNNGTAYC] # 33 2062 3156 # # BarI: # [GAAGNNNNNNTAC] # 32 296 4923 # # BbvCI: # [CCTCAGC] # 468 4783 # # BbvI: # [GCAGC] # 458 1127 1607 2059 # # BbvII*: # [GAAGAC] # 88 2521 2642 # # BccI: # [CCATC] # 22 27 30 81 91 114 # 197 209 255 354 471 562 # 573 1045 1220 # # Bce83I*: # [CTTGAG] # 947 4304 # # BceAI: # [ACGGC] # 2 234 665 1432 2918 # # BciVI: # [GTATCC] # 407 811 4033 # # BclI: # [TGATCA] # 2530 2721 # # BdaI: # [TGANNNNNNTCA] # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 34 34 # 34 34 34 257 370 668 # 677 1255 1854 # # BfiI: # [ACTGGG] # 1702 3549 # # BglII: # [AGATCT] # 1409 1581 2261 # # BinI*: # [GGATC] # 85 172 977 1708 2309 # # BisI: # [GCNGC] # 483 1116 1618 2034 # # BlsI: # [GCNGC] # 483 1117 1617 2034 # # BmeT110I: # [CYCGRG] # 2296 2955 # # BmgT120I: # [GGNCC] # 126 185 248 1648 3044 # # Bpu10I: # [CCTNAGC] # 468 2358 2425 # # BsaAI: # [YACGTR] # 99 1860 3292 # # BsaXI: # [ACNNNNNCTCC] # 30 2528 2693 # # BseBI: # [CCWGG] # 9 17 109 155 171 334 # 371 380 713 1051 1941 # # BseGI: # [GGATG] # 11 19 24 40 61 197 # 229 246 329 463 503 705 # 1089 1335 # # BseMII: # [CTCAG] # 16 54 81 151 174 238 # 258 330 609 614 714 961 # 1051 # # BseRI: # [GAGGAG] # 203 5048 # # BseSI: # [GKGCMC] # 2050 3201 # # BseYI: # [CCCAGC] # 1228 4023 # # BsiI*: # [CACGAG] # 999 1693 2559 # # BsiYI*: # [CCNNNNNNNGG] # 57 198 244 1166 1680 1906 # # BslFI: # [GGGAC] # 503 736 951 3061 # # BsmAI: # [GTCTC] # 49 78 92 328 395 523 # 554 1555 1677 # # BsmI: # [GAATGC] # 902 904 3445 # # BspCNI: # [CTCAG] # 16 52 83 151 176 237 # 259 328 609 616 712 961 # 1051 # # BspHI: # [TCATGA] # 743 4508 # # BspMI: # [ACCTGC] # 180 672 4399 # # BsrDI: # [GCAATG] # 60 73 394 2358 2366 # # BsrI: # [ACTGG] # 11 75 77 135 149 192 # 282 692 847 1094 1697 # # BssKI: # [CCNGG] # 9 17 109 155 171 334 # 369 380 715 1051 1941 # # BssNAI: # [GTATAC] # 96 335 1888 2932 # # BstEII: # [GGTNACC] # 428 1499 3324 # # BstKTI: # [GATC] # 7 15 16 43 56 80 # 84 86 93 103 156 159 # 199 234 234 277 355 422 # 542 559 644 887 # # BstXI: # [CCANNNNNNTGG] # 299 1892 3060 # # BtgZI: # [GCGATG] # 427 4824 # # BtrI: # [CACGTC] # 982 1944 2325 # # BtsI: # [GCAGTG] # 268 4983 # # Cac8I: # [GCNNGC] # 6 188 658 691 927 1316 # 1465 # # ClaI: # [ATCGAT] # 1981 3270 # # Csp6I: # [GTAC] # 9 13 21 25 31 34 # 42 50 80 108 118 144 # 160 214 252 265 428 531 # 561 671 675 819 # # CspCI: # [CAANNNNNGTGG] # 35 504 4712 # # CviAII: # [CATG] # 19 24 32 40 62 104 # 122 160 162 165 182 185 # 194 205 284 337 367 460 # 475 477 587 608 # # CviJI: # [RGCY] # 6 12 24 27 30 32 # 36 37 40 42 54 65 # 67 89 102 109 110 112 # 121 137 173 226 246 260 # 281 561 729 743 780 # # CviRI*: # [TGCA] # 6 22 24 25 37 44 # 48 49 57 60 63 76 # 105 147 156 228 258 261 # 266 296 311 326 511 587 # 589 699 # # DdeI: # [CTNAG] # 16 31 56 68 75 81 # 102 104 126 131 141 151 # 197 237 283 307 352 477 # 552 574 581 609 # # DpnI: # [GATC] # 7 15 16 43 56 80 # 84 86 92 103 156 159 # 200 234 234 277 355 422 # 542 559 644 887 # # DraIII: # [CACNNNGTG] # 261 4990 # # DrdI: # [GACNNNNNNGTC] # 1275 3976 # # DsaI*: # [CCRYGG] # 2209 3042 # # Eco31I: # [GGTCTC] # 92 5159 # # Eco47III: # [AGCGCT] # 744 4507 # # Eco57I: # [CTGAAG] # 265 2335 2651 # # Eco57MI: # [CTGRAG] # 265 462 757 1116 2651 # # EcoNI: # [CCTNNNNNAGG] # 440 4811 # # EcoP15I: # [CAGCAG] # 289 4962 # # EcoRI: # [GAATTC] # 1633 3618 # # EcoRII: # [CCWGG] # 9 17 109 155 171 334 # 369 380 715 1051 1941 # # EcoRV: # [GATATC] # 45 285 483 583 741 879 # 2235 # # EcoT22I: # [ATGCAT] # 855 919 1287 2190 # # Esp3I: # [CGTCTC] # 2595 2656 # # FalI: # [AAGNNNNNCTT] # 0 0 0 0 32 32 # 183 206 4798 # # FatI: # [CATG] # 19 24 32 39 62 104 # 122 160 162 165 182 185 # 194 205 284 338 367 460 # 475 477 587 608 # # FnuDII*: # [CGCG] # 810 1042 1278 2121 # # FokI: # [GGATG] # 11 19 24 40 61 197 # 229 266 329 450 503 698 # 1089 1335 # # GlaI: # [GCGC] # 48 744 1123 1575 1761 # # GsaI: # [CCCAGC] # 1232 4019 # # GsuI: # [CTGGAG] # 757 1116 3378 # # HaeII: # [RGCGCY] # 50 742 4459 # # HaeIII: # [GGCC] # 126 249 875 933 3068 # # HgaI: # [GACGC] # 40 323 2391 2497 # # HgiAI*: # [GWGCWC] # 252 427 1623 2949 # # HgiCI*: # [GGYRCC] # 2057 3194 # # HgiJII*: # [GRGCYC] # 1200 4051 # # HhaI: # [GCGC] # 49 743 1123 1575 1761 # # Hin4I: # [GAYNNNNNVTC] # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 7 7 7 7 # 11 18 21 21 25 25 # 32 32 32 32 32 32 # 32 32 34 36 51 94 # 138 202 451 605 633 868 # 1734 # # Hin4II*: # [CCTTC] # 79 289 643 663 681 1297 # 1599 # # Hin6I: # [GCGC] # 47 745 1123 1575 1761 # # HindII: # [GTYRAC] # 15 340 373 379 524 631 # 1358 1631 # # HinfI: # [GANTC] # 4 9 10 15 16 21 # 29 30 42 47 50 60 # 63 66 88 110 112 165 # 182 195 219 255 323 371 # 441 489 523 1316 # # HpaI: # [GTTAAC] # 340 524 4387 # # HphI: # [GGTGA] # 20 74 96 120 121 198 # 207 223 242 275 456 609 # 825 869 916 # # Hpy166II: # [GTNNAC] # 15 19 68 78 79 88 # 88 96 113 141 149 156 # 175 189 229 257 373 374 # 379 928 1257 # # Hpy178III*: # [TCNNGA] # 7 9 12 33 49 50 # 69 87 88 90 143 158 # 163 175 194 297 314 321 # 356 364 407 468 554 843 # # Hpy188I: # [TCNGA] # 8 21 27 28 42 43 # 45 58 63 90 97 115 # 125 150 151 159 185 197 # 228 297 297 308 342 570 # 576 1029 # # Hpy99I: # [CGWCG] # 208 395 587 1940 2121 # # KpnI: # [GGTACC] # 2053 3198 # # Ksp632I*: # [CTCTTC] # 43 138 2089 2981 # # MaeI: # [CTAG] # 51 56 60 82 266 273 # 455 565 665 888 1890 # # MaeII: # [ACGT] # 17 100 101 135 177 227 # 246 263 354 365 474 526 # 539 678 1049 # # MaeIII: # [GTNAC] # 11 19 60 60 115 129 # 167 262 269 336 381 580 # 583 632 647 1000 # # MboI: # [GATC] # 7 15 16 43 56 80 # 84 86 90 103 156 159 # 202 234 234 277 355 422 # 542 559 644 887 # # MboII: # [GAAGA] # 10 10 35 50 56 59 # 59 60 78 80 85 89 # 98 159 174 176 177 360 # 367 516 1054 1499 # # McrI*: # [CGRYCG] # 1154 1981 2116 # # MfeI: # [CAATTG] # 1276 3975 # # MlyI: # [GAGTC] # 21 66 196 262 282 441 # 448 553 1331 1651 # # MmeI: # [TCCRAC] # 85 238 390 651 1712 2175 # # MnlI: # [CCTC] # 5 9 28 40 48 49 # 56 57 60 73 108 151 # 160 184 193 198 204 213 # 219 223 232 249 321 400 # 424 613 734 # # MseI: # [TTAA] # 8 9 18 23 24 31 # 42 56 58 62 91 99 # 123 159 165 192 192 237 # 244 354 380 464 513 523 # 554 630 # # MslI: # [CAYNNNNRTG] # 57 261 408 744 1089 1294 # 1398 # # MstI*: # [TGCGCA] # 1809 3442 # # MwoI: # [GCNNNNNNNGC] # 97 181 1070 1610 2293 # # NdeI: # [CATATG] # 96 108 432 4615 # # NlaIII: # [CATG] # 19 24 32 43 62 104 # 122 160 162 165 182 185 # 194 205 284 334 367 460 # 475 477 587 608 # # NlaIV: # [GGNNCC] # 2055 3196 # # NruI: # [TCGCGA] # 2121 3130 # # NspBII*: # [CMGCKG] # 184 288 1347 1616 1816 # # NspI: # [RCATGY] # 194 334 654 691 929 980 # 1469 # # OliI: # [CACNNNNGTG] # 261 4990 # # PflMI: # [CCANNNNNTGG] # 244 5007 # # PfoI: # [TCCNGGA] # 1518 3733 # # PleI: # [GAGTC] # 22 66 195 263 282 441 # 447 553 1331 1651 # # PpiI: # [GAACNNNNNCTC] # 32 2206 3013 # # PsiI: # [TTATAA] # 1406 3845 # # PstI: # [CTGCAG] # 754 849 3648 # # PvuI: # [CGATCG] # 1981 3270 # # PvuII: # [CAGCTG] # 184 1616 3451 # # RsaI: # [GTAC] # 9 13 21 25 31 34 # 42 50 80 108 118 144 # 160 214 253 265 428 531 # 561 670 675 819 # # SalI: # [GTCGAC] # 357 1880 3014 # # SauI*: # [CCTNAGG] # 1912 3339 # # ScaI: # [AGTACT] # 531 785 1709 2226 # # ScrFI: # [CCNGG] # 9 17 109 155 171 334 # 371 380 713 1051 1941 # # SduI: # [GDGCHC] # 252 427 773 850 2949 # # SecI*: # [CCNNGG] # 108 170 334 360 370 381 # 846 2682 # # SetI: # [ASST] # 4 5 6 7 9 9 # 9 9 10 12 12 14 # 17 18 18 20 24 24 # 25 25 26 30 30 31 # 32 33 34 36 36 40 # 40 41 42 44 44 46 # 46 47 48 48 49 56 # 63 66 66 68 76 77 # 82 84 87 90 91 96 # 98 101 104 124 140 146 # 151 152 156 164 165 172 # 174 183 193 263 324 339 # # SexAI: # [ACCWGGT] # 732 4519 # # SfaNI: # [GCATC] # 11 42 450 560 840 882 # 1121 1345 # # SfeI*: # [CTRYAG] # 273 325 481 845 3327 # # SmlI: # [CTYRAG] # 932 4319 # # SnaBI: # [TACGTA] # 99 5152 # # SpeI: # [ACTAGT] # 456 4795 # # SphI: # [GCATGC] # 194 691 929 1314 2123 # # SplI*: # [CGTACG] # 624 4627 # # SspI: # [AATATT] # 677 871 1454 2249 # # SwaI: # [ATTTAAAT] # 769 4482 # # TaiI: # [ACGT] # 17 97 104 135 177 227 # 246 263 354 365 474 526 # 539 678 1049 # # TaqI: # [TCGA] # 4 6 33 50 70 88 # 89 96 106 115 120 125 # 127 193 197 248 255 264 # 268 298 338 418 583 1160 # # TaqII: # [CACCCA] # 45 452 511 882 908 2453 # # TatI: # [WGTACW] # 50 59 359 479 531 726 # 819 832 1396 # # TfiI: # [GAWTC] # 4 9 29 30 47 50 # 60 88 125 133 192 195 # 261 323 387 420 489 523 # 1886 # # TseI: # [GCWGC] # 483 1115 1619 2034 # # TsoI: # [TARCCA] # 410 2183 2658 # # Tsp45I: # [GTSAC] # 60 115 140 227 269 336 # 381 580 632 864 1647 # # Tsp4CI*: # [ACNGT] # 11 46 65 80 93 94 # 104 117 223 253 255 314 # 314 327 386 396 411 460 # 1302 # # TspDTI: # [ATGAA] # 3 4 6 13 15 17 # 21 27 54 67 79 83 # 89 91 92 101 115 135 # 160 167 175 187 207 233 # 234 236 266 282 285 318 # 359 444 686 # # TspEI: # [AATT] # 4 5 13 15 20 22 # 23 23 29 30 35 45 # 45 47 56 58 62 70 # 71 72 84 86 96 99 # 103 103 108 109 110 112 # 123 124 126 151 156 159 # 165 171 178 187 209 217 # 235 271 286 308 430 # # TspGWI: # [ACGGA] # 6 37 83 85 237 294 # 303 361 364 471 496 498 # 811 1205 # # TspRI: # [CASTGNN] # 268 294 374 531 642 960 # 1018 1164 # # TstI: # [CACNNNNNNTCC] # 32 1192 4027 # # VspI: # [ATTAAT] # 934 4317 # # XhoII: # [RGATCY] # 90 215 1319 1366 2261 # # XmnI: # [GAANNNNTTC] # 292 721 756 1271 2211 # #--------------------------------------- #--------------------------------------- # Total_sequences: 1 # Total_length: 5251 # Reported_sequences: 1 # Reported_hitcount: 1226 #---------------------------------------