Restriction Fragments for YGRCTy1-3



Send questions or suggestions to SGD

BLAST search | Genome Restriction Map | Design Primers for this sequence


The currently selected gene/sequence is :

YGRCTy1-3 on chromosome VII from coordinates 823306 to 817393.

The sequence you have requested is oriented with respect to the Crick (bottom) strand. Thus, the chromosomal coordinate of the beginning of the gene or sequence is larger than that of the end. The sequence shown here is the 5'-3' direction of the Crick strand and is the reverse complement of the Watson (top) strand.

seqfile=/share/crumb/www-data/html/tmp/gcgseq.tmp.2.11393.2

Start End Strand Enzyme_name Restriction_site 5prime 3prime 5primerev 3primerev 65 69 + Tsp4CI* ACNGT 67 66 . . 71 74 + MseI TTAA 71 73 . . 97 100 + SetI ASST 100 96 . . 97 100 + CviJI RGCY 98 98 . . 97 100 + AluI AGCT 98 98 . . 93 103 - Hin4I GAYNNNNNVTC 116 111 84 79 105 108 + TaqI TCGA 105 107 . . 114 117 - MnlI CCTC 107 106 . . 119 122 + SetI ASST 122 118 . . 119 122 + CviJI RGCY 120 120 . . 119 122 + AluI AGCT 120 120 . . 121 126 + Eco57MI CTGRAG 142 140 . . 121 126 + Eco57I CTGAAG 142 140 . . 127 130 + CviRI* TGCA 128 128 . . 154 158 + TspDTI ATGAA 169 167 . . 168 172 + TspGWI ACGGA 183 181 . . 175 178 - MnlI CCTC 168 167 . . 175 185 - Hin4I GAYNNNNNVTC 198 193 166 161 188 193 + SspI AATATT 190 190 . . 210 214 + TfiI GAWTC 210 213 . . 210 214 + HinfI GANTC 210 213 . . 214 224 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 220 217 . . 224 228 + TfiI GAWTC 224 227 . . 221 224 - MnlI CCTC 214 213 . . 224 228 + HinfI GANTC 224 227 . . 235 242 + PspXI VCTCGAGB 236 240 . . 235 238 + MnlI CCTC 245 244 . . 235 242 + AbsI CCTCGAGG 236 240 . . 236 241 + SmlI CTYRAG 236 240 . . 236 241 + XhoI CTCGAG 236 240 . . 236 241 + BmeT110I CYCGRG 237 239 . . 236 241 + AvaI CYCGRG 236 240 . . 237 240 + TaqI TCGA 237 239 . . 239 244 + BseRI GAGGAG 254 252 . . 239 242 - MnlI CCTC 232 231 . . 250 253 + MaeI CTAG 250 252 . . 262 267 + Hpy166II GTNNAC 264 264 . . 262 267 + BssNAI GTATAC 264 264 . . 262 267 + AccI GTMKAC 263 265 . . 266 269 + SetI ASST 269 265 . . 270 275 + SspI AATATT 272 272 . . 278 281 + CviJI RGCY 279 279 . . 295 299 + TfiI GAWTC 295 298 . . 295 299 + HinfI GANTC 295 298 . . 305 308 + TspEI AATT 304 308 . . 313 316 + TspEI AATT 312 316 . . 331 334 + FatI CATG 330 334 . . 331 334 + NlaIII CATG 334 330 . . 331 334 + CviAII CATG 331 333 . . 337 342 + HaeII RGCGCY 341 337 . . 338 341 + Hin6I GCGC 338 340 . . 338 341 + GlaI GCGC 339 339 . . 338 341 + HhaI GCGC 340 338 . . 352 356 + MaeIII GTNAC 351 356 . . 359 363 + DdeI CTNAG 359 362 . . 367 372 + Hpy166II GTNNAC 369 369 . . 378 383 + Hpy178III* TCNNGA 379 381 . . 381 386 + XhoII RGATCY 381 385 . . 382 385 + DpnI GATC 383 383 . . 382 385 + BstKTI GATC 384 382 . . 382 385 + MboI GATC 381 385 . . 382 386 - BinI* GGATC 376 377 . . 384 388 - TspGWI ACGGA 374 372 . . 392 395 + TaiI ACGT 395 391 . . 392 395 + SetI ASST 395 391 . . 392 395 + MaeII ACGT 392 394 . . 399 402 + SetI ASST 402 398 . . 399 402 + CviJI RGCY 400 400 . . 399 402 + AluI AGCT 400 400 . . 407 412 + ApoI RAATTY 407 411 . . 408 411 + TspEI AATT 407 411 . . 411 416 + Hpy178III* TCNNGA 412 414 . . 426 429 + CviJI RGCY 427 427 . . 434 438 + DdeI CTNAG 434 437 . . 438 441 + CviJI RGCY 439 439 . . 461 467 + AarI CACCTGC 471 475 . . 462 465 + SetI ASST 465 461 . . 462 467 + BspMI ACCTGC 471 475 . . 466 476 + MwoI GCNNNNNNNGC 472 469 . . 468 472 - TspDTI ATGAA 458 456 . . 473 478 + PvuII CAGCTG 475 475 . . 473 478 + NspBII* CMGCKG 475 475 . . 474 477 + SetI ASST 477 473 . . 474 477 + CviJI RGCY 475 475 . . 474 477 + AluI AGCT 475 475 . . 480 485 + Hpy178III* TCNNGA 481 483 . . 492 496 + BccI CCATC 500 501 . . 496 499 + FatI CATG 495 499 . . 496 499 + NlaIII CATG 499 495 . . 496 499 + CviAII CATG 496 498 . . 500 503 + MnlI CCTC 510 509 . . 505 508 + MnlI CCTC 515 514 . . 503 508 - BseRI GAGGAG 494 492 . . 510 513 + SetI ASST 513 509 . . 510 515 + BspMI ACCTGC 519 523 . . 515 520 - Eco57MI CTGRAG 500 498 . . 520 523 + Csp6I GTAC 520 522 . . 520 523 + RsaI GTAC 521 521 . . 515 520 - Eco57I CTGAAG 500 498 . . 525 528 + SetI ASST 528 524 . . 526 529 + MnlI CCTC 536 535 . . 529 539 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 535 532 . . 529 539 + PflMI CCANNNNNTGG 535 532 . . 538 542 + BmgT120I GGNCC 539 540 . . 538 542 + AsuI* GGNCC 538 541 . . 539 542 + CviJI RGCY 540 540 . . 539 542 + HaeIII GGCC 540 540 . . 543 546 + Csp6I GTAC 543 545 . . 543 546 + RsaI GTAC 544 544 . . 540 544 - BceAI ACGGC 525 527 . . 548 557 + MslI CAYNNNNRTG 552 552 . . 548 557 + OliI CACNNNNGTG 552 552 . . 550 555 + EcoP15I CAGCAG 580 582 . . 552 557 + BtsI GCAGTG 559 557 . . 553 559 + TspRI CASTGNN 559 550 . . 556 559 + CviRI* TGCA 557 557 . . 558 561 + FatI CATG 557 561 . . 558 561 + NlaIII CATG 561 557 . . 558 561 + CviAII CATG 558 560 . . 576 579 + CviJI RGCY 577 577 . . 583 594 + BstXI CCANNNNNNTGG 590 586 . . 583 587 + BccI CCATC 591 592 . . 602 606 + TspGWI ACGGA 617 615 . . 607 612 + TaqII CACCCA 623 621 . . 610 614 + BccI CCATC 618 619 . . 618 622 + TfiI GAWTC 618 621 . . 618 622 + HinfI GANTC 618 621 . . 624 629 + Hpy166II GTNNAC 626 626 . . 624 629 + BssNAI GTATAC 626 626 . . 624 629 + AccI GTMKAC 625 627 . . 621 625 - TspGWI ACGGA 611 609 . . 630 633 + SetI ASST 633 629 . . 650 655 + TatI WGTACW 650 654 . . 651 654 + Csp6I GTAC 651 653 . . 651 654 + RsaI GTAC 652 652 . . 660 663 + SetI ASST 663 659 . . 661 665 + BssKI CCNGG 660 665 . . 661 665 + BseBI CCWGG 662 663 . . 661 666 + SecI* CCNNGG 661 665 . . 661 665 + ScrFI CCNGG 662 663 . . 661 665 + EcoRII CCWGG 660 665 . . 664 668 + BmgT120I GGNCC 665 666 . . 664 668 + AsuI* GGNCC 664 667 . . 665 668 + CviJI RGCY 666 666 . . 665 668 + HaeIII GGCC 666 666 . . 675 679 + Tsp4CI* ACNGT 677 676 . . 682 685 + AciI CCGC 682 684 . . 687 692 + BciVI GTATCC 698 697 . . 691 695 + BccI CCATC 699 700 . . 700 705 - MmeI TCCRAC 681 679 . . 709 712 + MnlI CCTC 719 718 . . 711 715 + Hpy188I TCNGA 713 712 . . 712 716 + DdeI CTNAG 712 715 . . 714 719 + SduI GDGCHC 718 714 . . 714 719 + HgiAI* GWGCWC 718 714 . . 712 716 - BspCNI CTCAG 704 702 . . 712 716 - BseMII CTCAG 703 701 . . 721 725 + BccI CCATC 729 730 . . 726 729 + SetI ASST 729 725 . . 727 737 + EcoNI CCTNNNNNAGG 731 732 . . 727 737 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 733 730 . . 728 732 + DdeI CTNAG 728 731 . . 724 728 - HphI GGTGA 716 715 . . 730 734 + PleI GAGTC 738 739 . . 730 734 + MlyI GAGTC 739 739 . . 730 734 + HinfI GANTC 730 733 . . 728 732 - BspCNI CTCAG 720 718 . . 728 732 - BseMII CTCAG 719 717 . . 735 738 + SetI ASST 738 734 . . 751 755 + TfiI GAWTC 751 754 . . 751 755 + HinfI GANTC 751 754 . . 751 761 + Hin4I GAYNNNNNVTC 742 737 774 769 753 757 - TspDTI ATGAA 743 741 . . 758 761 + MnlI CCTC 768 767 . . 758 764 + Bpu10I CCTNAGC 759 762 . . 758 764 + BbvCI CCTCAGC 759 762 . . 755 759 - FokI GGATG 741 745 . . 759 763 + DdeI CTNAG 759 762 . . 759 763 + BspCNI CTCAG 772 770 . . 759 763 + BseMII CTCAG 773 771 . . 755 759 - BseGI GGATG 754 752 . . 761 766 + NspBII* CMGCKG 763 763 . . 766 770 + HinfI GANTC 766 769 . . 763 766 - AciI CCGC 763 765 . . 769 773 + Hpy188I TCNGA 771 770 . . 766 770 - PleI GAGTC 760 761 . . 766 770 - MlyI GAGTC 760 760 . . 772 782 + Hin4I GAYNNNNNVTC 763 758 795 790 772 782 - Hin4I GAYNNNNNVTC 795 790 763 758 779 783 - FokI GGATG 765 769 . . 779 783 - BseGI GGATG 778 776 . . 797 801 + Hpy188I TCNGA 799 798 . . 813 818 + Hpy166II GTNNAC 815 815 . . 813 818 + HpaI GTTAAC 815 815 . . 813 818 + HindII GTYRAC 815 815 . . 814 817 + MseI TTAA 814 816 . . 817 820 + SetI ASST 820 816 . . 818 821 + MnlI CCTC 828 827 . . 822 825 + SetI ASST 825 821 . . 820 824 - HphI GGTGA 812 811 . . 838 841 + TspEI AATT 837 841 . . 845 848 + MseI TTAA 845 847 . . 859 864 + ApoI RAATTY 859 863 . . 860 863 + TspEI AATT 859 863 . . 874 877 + TaqI TCGA 874 876 . . 876 880 + TfiI GAWTC 876 879 . . 876 880 + HinfI GANTC 876 879 . . 894 899 + MmeI TCCRAC 919 917 . . 894 898 + Hpy188I TCNGA 896 895 . . 898 902 + Tsp4CI* ACNGT 900 899 . . 901 906 + Hpy166II GTNNAC 903 903 . . 905 909 + TspGWI ACGGA 920 918 . . 915 920 + SplI* CGTACG 915 919 . . 916 919 + Csp6I GTAC 916 918 . . 916 919 + RsaI GTAC 917 917 . . 918 921 + TaiI ACGT 921 917 . . 918 921 + SetI ASST 921 917 . . 918 921 + MaeII ACGT 918 920 . . 921 925 + Hpy188I TCNGA 923 922 . . 924 927 + DpnI GATC 925 925 . . 924 927 + BstKTI GATC 926 924 . . 924 927 + MboI GATC 923 927 . . 927 933 + TspRI CASTGNN 933 924 . . 935 939 + TspDTI ATGAA 950 948 . . 943 946 + SetI ASST 946 942 . . 944 948 + Hin4II* CCTTC 954 953 . . 941 945 - HphI GGTGA 933 932 . . 966 971 + SspI AATATT 968 968 . . 977 980 + MnlI CCTC 987 986 . . 983 986 + TspEI AATT 982 986 . . 990 993 + SetI ASST 993 989 . . 994 997 + SetI ASST 997 993 . . 995 999 + BssKI CCNGG 994 999 . . 995 999 + BseBI CCWGG 996 997 . . 995 1000 + SecI* CCNNGG 995 999 . . 995 999 + ScrFI CCNGG 996 997 . . 995 999 + EcoRII CCWGG 994 999 . . 1006 1016 + Hin4I GAYNNNNNVTC 997 992 1029 1024 1008 1012 - FokI GGATG 994 998 . . 1008 1012 - BseGI GGATG 1007 1005 . . 1006 1016 - Hin4I GAYNNNNNVTC 1029 1024 997 992 1015 1019 - TspGWI ACGGA 1005 1003 . . 1027 1031 + TspGWI ACGGA 1042 1040 . . 1030 1035 + EcoRV GATATC 1032 1032 . . 1034 1039 + Hpy178III* TCNNGA 1035 1037 . . 1034 1039 + BspHI TCATGA 1034 1038 . . 1035 1038 + FatI CATG 1034 1038 . . 1035 1038 + NlaIII CATG 1038 1034 . . 1035 1038 + CviAII CATG 1035 1037 . . 1036 1040 + TspDTI ATGAA 1051 1049 . . 1040 1045 + ApoI RAATTY 1040 1044 . . 1041 1044 + TspEI AATT 1040 1044 . . 1067 1070 + CviRI* TGCA 1068 1068 . . 1072 1076 + Hpy188I TCNGA 1074 1073 . . 1084 1087 - MnlI CCTC 1077 1076 . . 1099 1103 + Tsp45I GTSAC 1098 1103 . . 1099 1103 + MaeIII GTNAC 1098 1103 . . 1103 1108 + SecI* CCNNGG 1103 1107 . . 1104 1108 + BssKI CCNGG 1103 1108 . . 1104 1108 + BseBI CCWGG 1105 1106 . . 1104 1108 + ScrFI CCNGG 1105 1106 . . 1104 1108 + EcoRII CCWGG 1103 1108 . . 1110 1115 + ApoI RAATTY 1110 1114 . . 1111 1114 + TspEI AATT 1110 1114 . . 1115 1118 + CviRI* TGCA 1116 1116 . . 1129 1134 + TatI WGTACW 1129 1133 . . 1130 1135 + Hpy166II GTNNAC 1132 1132 . . 1130 1133 + Csp6I GTAC 1130 1132 . . 1130 1133 + RsaI GTAC 1131 1131 . . 1133 1139 + AarI CACCTGC 1143 1147 . . 1134 1137 + SetI ASST 1137 1133 . . 1134 1139 + BspMI ACCTGC 1143 1147 . . 1136 1141 + PstI CTGCAG 1140 1136 . . 1136 1141 + SfeI* CTRYAG 1136 1140 . . 1137 1140 + CviRI* TGCA 1138 1138 . . 1142 1147 + EcoT22I ATGCAT 1146 1142 . . 1143 1146 + CviRI* TGCA 1144 1144 . . 1141 1145 - SfaNI GCATC 1131 1135 . . 1159 1163 + Tsp45I GTSAC 1158 1163 . . 1159 1163 + MaeIII GTNAC 1158 1163 . . 1172 1175 + TaqI TCGA 1172 1174 . . 1193 1198 - BsmI GAATGC 1193 1191 . . 1196 1200 - TspDTI ATGAA 1186 1184 . . 1211 1214 + SetI ASST 1214 1210 . . 1216 1221 + NspI RCATGY 1220 1216 . . 1216 1221 + Cac8I GCNNGC 1218 1218 . . 1216 1221 + SphI GCATGC 1220 1216 . . 1217 1220 + FatI CATG 1216 1220 . . 1217 1220 + NlaIII CATG 1220 1216 . . 1217 1220 + CviAII CATG 1217 1219 . . 1223 1226 + TspEI AATT 1222 1226 . . 1224 1229 + VspI ATTAAT 1225 1227 . . 1225 1228 + MseI TTAA 1225 1227 . . 1227 1230 + TspEI AATT 1226 1230 . . 1236 1239 + SetI ASST 1239 1235 . . 1235 1238 - MnlI CCTC 1228 1227 . . 1255 1260 + ApoI RAATTY 1255 1259 . . 1256 1259 + TspEI AATT 1255 1259 . . 1270 1275 + AflIII ACRYGT 1270 1274 . . 1271 1276 + BtrI CACGTC 1273 1273 . . 1272 1275 + TaiI ACGT 1275 1271 . . 1272 1275 + SetI ASST 1275 1271 . . 1272 1275 + MaeII ACGT 1272 1274 . . 1278 1281 + TaqI TCGA 1278 1280 . . 1294 1298 + Tsp4CI* ACNGT 1296 1295 . . 1295 1303 + AlwNI CAGNNNCTG 1300 1297 . . 1305 1309 + Tsp4CI* ACNGT 1307 1306 . . 1311 1315 + DdeI CTNAG 1311 1314 . . 1315 1320 + EcoRV GATATC 1317 1317 . . 1321 1324 + FatI CATG 1320 1324 . . 1321 1324 + NlaIII CATG 1324 1320 . . 1321 1324 + CviAII CATG 1321 1323 . . 1331 1335 + TspDTI ATGAA 1346 1344 . . 1333 1337 + MboII GAAGA 1345 1344 . . 1345 1349 + BinI* GGATC 1353 1354 . . 1346 1349 + DpnI GATC 1347 1347 . . 1346 1349 + BstKTI GATC 1348 1346 . . 1346 1349 + MboI GATC 1345 1349 . . 1348 1351 + TaqI TCGA 1348 1350 . . 1348 1353 + Hpy178III* TCNNGA 1349 1351 . . 1362 1365 + SetI ASST 1365 1361 . . 1366 1369 + TspEI AATT 1365 1369 . . 1380 1384 + Hpy188I TCNGA 1382 1381 . . 1392 1396 + MboII GAAGA 1404 1403 . . 1399 1403 + TfiI GAWTC 1399 1402 . . 1399 1403 + HinfI GANTC 1399 1402 . . 1406 1410 + BlsI GCNGC 1408 1407 . . 1406 1410 + BisI GCNGC 1407 1408 . . 1406 1410 + BbvI GCAGC 1418 1422 . . 1406 1410 + TseI GCWGC 1406 1409 . . 1408 1411 + SetI ASST 1411 1407 . . 1408 1411 + CviJI RGCY 1409 1409 . . 1408 1411 + AluI AGCT 1409 1409 . . 1440 1443 + SetI ASST 1443 1439 . . 1440 1443 + CviJI RGCY 1441 1441 . . 1440 1443 + AluI AGCT 1441 1441 . . 1443 1447 + Hpy188I TCNGA 1445 1444 . . 1446 1450 + TfiI GAWTC 1446 1449 . . 1446 1450 + HinfI GANTC 1446 1449 . . 1450 1453 + MnlI CCTC 1460 1459 . . 1465 1468 + TspEI AATT 1464 1468 . . 1467 1472 + AsuII TTCGAA 1468 1470 . . 1468 1471 + TaqI TCGA 1468 1470 . . 1474 1477 + TaqI TCGA 1474 1476 . . 1482 1485 + CviJI RGCY 1483 1483 . . 1484 1488 + BssKI CCNGG 1483 1488 . . 1484 1488 + BseBI CCWGG 1485 1486 . . 1484 1489 + SecI* CCNNGG 1484 1488 . . 1484 1488 + ScrFI CCNGG 1485 1486 . . 1484 1488 + EcoRII CCWGG 1483 1488 . . 1487 1492 + SduI GDGCHC 1491 1487 . . 1487 1492 + HgiJII* GRGCYC 1491 1487 . . 1488 1491 + CviJI RGCY 1489 1489 . . 1492 1503 + TstI CACNNNNNNTCC 1483 1478 1515 1510 1498 1503 + BciVI GTATCC 1509 1508 . . 1519 1524 + GsaI CCCAGC 1523 1519 . . 1519 1524 + BseYI CCCAGC 1519 1523 . . 1525 1529 + TspGWI ACGGA 1540 1538 . . 1534 1538 + TfiI GAWTC 1534 1537 . . 1534 1538 + HinfI GANTC 1534 1537 . . 1538 1542 + BccI CCATC 1546 1547 . . 1557 1568 + BdaI TGANNNNNNTCA 1546 1544 1580 1578 1558 1567 + XmnI GAANNNNTTC 1562 1562 . . 1563 1567 + TfiI GAWTC 1563 1566 . . 1563 1567 + HinfI GANTC 1563 1566 . . 1567 1572 + MfeI CAATTG 1567 1571 . . 1568 1571 + TspEI AATT 1567 1571 . . 1557 1568 - BdaI TGANNNNNNTCA 1580 1578 1546 1544 1586 1589 + SetI ASST 1589 1585 . . 1587 1591 + Hin4II* CCTTC 1597 1596 . . 1589 1593 - TspDTI ATGAA 1579 1577 . . 1594 1598 + DdeI CTNAG 1594 1597 . . 1598 1601 + CviJI RGCY 1599 1599 . . 1598 1601 + HaeIII GGCC 1599 1599 . . 1613 1617 + TfiI GAWTC 1613 1616 . . 1613 1617 + HinfI GANTC 1613 1616 . . 1617 1622 + SfeI* CTRYAG 1617 1621 . . 1619 1623 + Tsp4CI* ACNGT 1621 1620 . . 1637 1646 + MslI CAYNNNNRTG 1641 1641 . . 1640 1644 + Hpy188I TCNGA 1642 1641 . . 1647 1651 + TspDTI ATGAA 1662 1660 . . 1654 1659 + SecI* CCNNGG 1654 1658 . . 1655 1659 + BssKI CCNGG 1654 1659 . . 1655 1659 + BseBI CCWGG 1656 1657 . . 1655 1659 + ScrFI CCNGG 1656 1657 . . 1655 1659 + EcoRII CCWGG 1654 1659 . . 1662 1665 + SetI ASST 1665 1661 . . 1663 1666 + MnlI CCTC 1673 1672 . . 1666 1670 + Hin4II* CCTTC 1676 1675 . . 1669 1674 + Hpy178III* TCNNGA 1670 1672 . . 1671 1674 + TaqI TCGA 1671 1673 . . 1673 1677 + TfiI GAWTC 1673 1676 . . 1673 1677 + HinfI GANTC 1673 1676 . . 1676 1681 + Hpy178III* TCNNGA 1677 1679 . . 1682 1686 + SfaNI GCATC 1691 1695 . . 1685 1690 + Hpy178III* TCNNGA 1686 1688 . . 1695 1700 + PsiI TTATAA 1697 1697 . . 1700 1705 + XhoII RGATCY 1700 1704 . . 1700 1705 + BglII AGATCT 1700 1704 . . 1701 1704 + DpnI GATC 1702 1702 . . 1701 1704 + BstKTI GATC 1703 1701 . . 1701 1704 + MboI GATC 1700 1704 . . 1720 1724 + DdeI CTNAG 1720 1723 . . 1720 1724 + BspCNI CTCAG 1733 1731 . . 1720 1724 + BseMII CTCAG 1734 1732 . . 1724 1728 + SfaNI GCATC 1733 1737 . . 1735 1740 + Hpy178III* TCNNGA 1736 1738 . . 1746 1749 + TaiI ACGT 1749 1745 . . 1746 1749 + SetI ASST 1749 1745 . . 1746 1749 + MaeII ACGT 1746 1748 . . 1754 1758 - SfaNI GCATC 1744 1748 . . 1777 1780 + TspEI AATT 1776 1780 . . 1779 1782 + MseI TTAA 1779 1781 . . 1790 1796 + BstEII GGTNACC 1790 1795 . . 1790 1794 + HphI GGTGA 1802 1801 . . 1791 1795 + Tsp45I GTSAC 1790 1795 . . 1791 1795 + MaeIII GTNAC 1790 1795 . . 1794 1797 + SetI ASST 1797 1793 . . 1800 1803 + TspEI AATT 1799 1803 . . 1809 1815 + PfoI TCCNGGA 1809 1814 . . 1810 1814 + BssKI CCNGG 1809 1814 . . 1810 1814 + BseBI CCWGG 1811 1812 . . 1810 1814 + ScrFI CCNGG 1811 1812 . . 1810 1814 + EcoRII CCWGG 1809 1814 . . 1836 1839 + SetI ASST 1839 1835 . . 1842 1845 + CviRI* TGCA 1843 1843 . . 1858 1861 + CviJI RGCY 1859 1859 . . 1871 1875 + DdeI CTNAG 1871 1874 . . 1871 1875 + BspCNI CTCAG 1884 1882 . . 1871 1875 + BseMII CTCAG 1885 1883 . . 1881 1885 + TspDTI ATGAA 1896 1894 . . 1884 1887 + TspEI AATT 1883 1887 . . 1888 1891 + CviJI RGCY 1889 1889 . . 1889 1893 + BlsI GCNGC 1891 1890 . . 1889 1893 + BisI GCNGC 1890 1891 . . 1889 1893 + TseI GCWGC 1889 1892 . . 1890 1895 + PstI CTGCAG 1894 1890 . . 1890 1895 + SfeI* CTRYAG 1890 1894 . . 1891 1894 + CviRI* TGCA 1892 1892 . . 1889 1893 - BbvI GCAGC 1876 1880 . . 1898 1903 + EcoRV GATATC 1900 1900 . . 1907 1912 + NspI RCATGY 1911 1907 . . 1907 1912 + Cac8I GCNNGC 1909 1909 . . 1907 1912 + SphI GCATGC 1911 1907 . . 1908 1911 + FatI CATG 1907 1911 . . 1908 1911 + NlaIII CATG 1911 1907 . . 1908 1911 + CviAII CATG 1908 1910 . . 1923 1926 + TaiI ACGT 1926 1922 . . 1923 1926 + SetI ASST 1926 1922 . . 1923 1926 + MaeII ACGT 1923 1925 . . 1927 1931 + DdeI CTNAG 1927 1930 . . 1933 1937 + Tsp4CI* ACNGT 1935 1934 . . 1937 1941 + Hpy188I TCNGA 1939 1938 . . 1941 1945 + BceAI ACGGC 1957 1959 . . 1945 1951 + TspRI CASTGNN 1951 1942 . . 1946 1950 + Tsp4CI* ACNGT 1948 1947 . . 1948 1953 + TatI WGTACW 1948 1952 . . 1949 1952 + Csp6I GTAC 1949 1951 . . 1949 1952 + RsaI GTAC 1950 1950 . . 1954 1957 + CviRI* TGCA 1955 1955 . . 1957 1960 + SetI ASST 1960 1956 . . 1962 1967 + Hpy178III* TCNNGA 1963 1965 . . 1974 1978 - BsmAI GTCTC 1968 1972 . . 1983 1987 + BsrI ACTGG 1988 1986 . . 1983 1988 + BfiI ACTGGG 1993 1992 . . 1998 2003 + TatI WGTACW 1998 2002 . . 1998 2003 + ScaI AGTACT 2000 2000 . . 1999 2002 + Csp6I GTAC 1999 2001 . . 1999 2002 + RsaI GTAC 2000 2000 . . 2009 2013 + BccI CCATC 2017 2018 . . 2024 2027 + Csp6I GTAC 2024 2026 . . 2024 2027 + RsaI GTAC 2025 2025 . . 2021 2025 - TspGWI ACGGA 2011 2009 . . 2031 2035 + BccI CCATC 2039 2040 . . 2045 2054 + MslI CAYNNNNRTG 2049 2049 . . 2057 2062 + TatI WGTACW 2057 2061 . . 2058 2063 + Hpy166II GTNNAC 2060 2060 . . 2058 2061 + Csp6I GTAC 2058 2060 . . 2058 2061 + RsaI GTAC 2059 2059 . . 2081 2085 - TspDTI ATGAA 2071 2069 . . 2085 2089 - TspDTI ATGAA 2075 2073 . . 2089 2092 + TaqI TCGA 2089 2091 . . 2091 2096 + BsmI GAATGC 2097 2095 . . 2095 2100 + Cac8I GCNNGC 2097 2097 . . 2098 2103 + MstI* TGCGCA 2100 2100 . . 2099 2102 + Hin6I GCGC 2099 2101 . . 2099 2102 + GlaI GCGC 2100 2100 . . 2099 2102 + HhaI GCGC 2101 2099 . . 2101 2106 + NspI RCATGY 2105 2101 . . 2101 2106 + Cac8I GCNNGC 2103 2103 . . 2101 2106 + SphI GCATGC 2105 2101 . . 2101 2112 + AlfI GCANNNNNNTGC 2090 2088 2124 2122 2102 2111 + MslI CAYNNNNRTG 2106 2106 . . 2102 2105 + FatI CATG 2101 2105 . . 2102 2105 + NlaIII CATG 2105 2101 . . 2102 2105 + CviAII CATG 2102 2104 . . 2110 2113 + CviRI* TGCA 2111 2111 . . 2101 2112 - AlfI GCANNNNNNTGC 2124 2122 2090 2088 2119 2122 + TspEI AATT 2118 2122 . . 2122 2125 + TaqI TCGA 2122 2124 . . 2133 2136 + MseI TTAA 2133 2135 . . 2145 2149 + BccI CCATC 2153 2154 . . 2149 2154 + BsaAI YACGTR 2151 2151 . . 2150 2153 + TaiI ACGT 2153 2149 . . 2150 2153 + SetI ASST 2153 2149 . . 2150 2153 + MaeII ACGT 2150 2152 . . 2157 2160 + MseI TTAA 2157 2159 . . 2162 2166 + TfiI GAWTC 2162 2165 . . 2162 2166 + HinfI GANTC 2162 2165 . . 2165 2169 + Hpy188I TCNGA 2167 2166 . . 2171 2176 + SalI GTCGAC 2171 2175 . . 2171 2176 + Hpy166II GTNNAC 2173 2173 . . 2171 2176 + HindII GTYRAC 2173 2173 . . 2171 2176 + AccI GTMKAC 2172 2174 . . 2172 2175 + TaqI TCGA 2172 2174 . . 2175 2179 + BsrI ACTGG 2180 2178 . . 2181 2184 + MaeI CTAG 2181 2183 . . 2203 2208 + Hpy178III* TCNNGA 2204 2206 . . 2213 2216 + MseI TTAA 2213 2215 . . 2248 2251 + SetI ASST 2251 2247 . . 2250 2255 + Hpy166II GTNNAC 2252 2252 . . 2252 2257 + Hpy178III* TCNNGA 2253 2255 . . 2269 2274 + ApoI RAATTY 2269 2273 . . 2270 2273 + TspEI AATT 2269 2273 . . 2272 2276 - TspDTI ATGAA 2262 2260 . . 2279 2288 + XmnI GAANNNNTTC 2283 2283 . . 2292 2295 + SetI ASST 2295 2291 . . 2312 2316 + BmgT120I GGNCC 2313 2314 . . 2312 2316 + AvaII GGWCC 2312 2315 . . 2312 2316 + AsuI* GGNCC 2312 2315 . . 2318 2323 + Hpy166II GTNNAC 2320 2320 . . 2315 2319 - BsrI ACTGG 2315 2313 . . 2325 2328 + SetI ASST 2328 2324 . . 2337 2342 + Hpy166II GTNNAC 2339 2339 . . 2337 2342 + SduI GDGCHC 2341 2337 . . 2337 2342 + BseSI GKGCMC 2341 2337 . . 2337 2342 + ApaLI GTGCAC 2337 2341 . . 2337 2342 + HgiAI* GWGCWC 2341 2337 . . 2338 2341 + CviRI* TGCA 2339 2339 . . 2342 2346 + BccI CCATC 2350 2351 . . 2343 2347 - FokI GGATG 2329 2333 . . 2343 2347 - BseGI GGATG 2342 2340 . . 2351 2355 - TspDTI ATGAA 2341 2339 . . 2369 2373 - BsmAI GTCTC 2363 2367 . . 2378 2383 + ApoI RAATTY 2378 2382 . . 2379 2382 + TspEI AATT 2378 2382 . . 2382 2386 - TspGWI ACGGA 2372 2370 . . 2404 2409 + McrI* CGRYCG 2407 2405 . . 2406 2410 + Tsp4CI* ACNGT 2408 2407 . . 2407 2417 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2413 2410 . . 2408 2412 + Hpy99I CGWCG 2412 2407 . . 2410 2415 + Hpy178III* TCNNGA 2411 2413 . . 2410 2415 + NruI TCGCGA 2412 2412 . . 2411 2414 + FnuDII* CGCG 2412 2412 . . 2414 2417 - MnlI CCTC 2407 2406 . . 2417 2421 + HinfI GANTC 2417 2420 . . 2417 2421 - PleI GAGTC 2411 2412 . . 2417 2421 - MlyI GAGTC 2411 2411 . . 2425 2428 + MnlI CCTC 2435 2434 . . 2427 2430 + TaqI TCGA 2427 2429 . . 2447 2450 + MaeI CTAG 2447 2449 . . 2449 2452 + SetI ASST 2452 2448 . . 2449 2452 + CviJI RGCY 2450 2450 . . 2449 2452 + AluI AGCT 2450 2450 . . 2457 2460 + MseI TTAA 2457 2459 . . 2464 2474 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2470 2467 . . 2464 2468 - BsrI ACTGG 2464 2462 . . 2473 2476 + CviJI RGCY 2474 2474 . . 2473 2476 + HaeIII GGCC 2474 2474 . . 2476 2482 + TspRI CASTGNN 2482 2473 . . 2475 2479 - BsrI ACTGG 2475 2473 . . 2482 2486 + DdeI CTNAG 2482 2485 . . 2497 2501 + BmgT120I GGNCC 2498 2499 . . 2497 2501 + AvaII GGWCC 2497 2500 . . 2497 2501 + AsuI* GGNCC 2497 2500 . . 2499 2503 + Tsp4CI* ACNGT 2501 2500 . . 2500 2505 + DsaI* CCRYGG 2500 2504 . . 2500 2505 + SecI* CCNNGG 2500 2504 . . 2507 2511 + Hpy188I TCNGA 2509 2508 . . 2508 2512 + DdeI CTNAG 2508 2511 . . 2512 2517 + Hpy166II GTNNAC 2514 2514 . . 2512 2517 + BssNAI GTATAC 2514 2514 . . 2508 2512 - BspCNI CTCAG 2500 2498 . . 2508 2512 - BseMII CTCAG 2499 2497 . . 2512 2517 + AccI GTMKAC 2513 2515 . . 2534 2539 + ApoI RAATTY 2534 2538 . . 2535 2538 + TspEI AATT 2534 2538 . . 2562 2565 + FatI CATG 2561 2565 . . 2562 2565 + NlaIII CATG 2565 2561 . . 2562 2565 + CviAII CATG 2562 2564 . . 2577 2582 + NspBII* CMGCKG 2579 2579 . . 2582 2586 + TfiI GAWTC 2582 2585 . . 2582 2586 + HinfI GANTC 2582 2585 . . 2579 2582 - AciI CCGC 2579 2581 . . 2585 2590 + Hpy178III* TCNNGA 2586 2588 . . 2586 2591 + BmeT110I CYCGRG 2587 2589 . . 2586 2591 + AvaI CYCGRG 2586 2590 . . 2589 2594 + SduI GDGCHC 2593 2589 . . 2589 2594 + HgiAI* GWGCWC 2593 2589 . . 2594 2597 + FatI CATG 2593 2597 . . 2594 2597 + NlaIII CATG 2597 2593 . . 2594 2597 + CviAII CATG 2594 2596 . . 2598 2602 + PleI GAGTC 2606 2607 . . 2598 2602 + MlyI GAGTC 2607 2607 . . 2598 2602 + HinfI GANTC 2598 2601 . . 2608 2612 + BceAI ACGGC 2624 2626 . . 2610 2613 + CviJI RGCY 2611 2611 . . 2616 2620 + Tsp4CI* ACNGT 2618 2617 . . 2619 2622 + Csp6I GTAC 2619 2621 . . 2619 2622 + RsaI GTAC 2620 2620 . . 2621 2624 + SetI ASST 2624 2620 . . 2640 2643 + Csp6I GTAC 2640 2642 . . 2640 2643 + RsaI GTAC 2641 2641 . . 2637 2641 - BceAI ACGGC 2622 2624 . . 2649 2652 + CviRI* TGCA 2650 2650 . . 2650 2655 + BsrDI GCAATG 2657 2655 . . 2661 2666 + Hpy166II GTNNAC 2663 2663 . . 2686 2689 + CviRI* TGCA 2687 2687 . . 2691 2694 + TaqI TCGA 2691 2693 . . 2693 2698 + ApoI RAATTY 2693 2697 . . 2694 2697 + TspEI AATT 2693 2697 . . 2713 2718 + ApoI RAATTY 2713 2717 . . 2714 2717 + TspEI AATT 2713 2717 . . 2720 2723 + MaeI CTAG 2720 2722 . . 2722 2725 + SetI ASST 2725 2721 . . 2722 2725 + CviJI RGCY 2723 2723 . . 2722 2725 + AluI AGCT 2723 2723 . . 2728 2731 + SetI ASST 2731 2727 . . 2726 2730 - HphI GGTGA 2718 2717 . . 2746 2749 + CviRI* TGCA 2747 2747 . . 2755 2760 + NspI RCATGY 2759 2755 . . 2756 2759 + FatI CATG 2755 2759 . . 2756 2759 + NlaIII CATG 2759 2755 . . 2756 2759 + CviAII CATG 2756 2758 . . 2759 2769 + MwoI GCNNNNNNNGC 2765 2762 . . 2759 2764 + Cac8I GCNNGC 2761 2761 . . 2762 2765 + CviJI RGCY 2763 2763 . . 2772 2782 + Hin4I GAYNNNNNVTC 2763 2758 2795 2790 2777 2782 + EcoRV GATATC 2779 2779 . . 2772 2782 - Hin4I GAYNNNNNVTC 2795 2790 2763 2758 2783 2788 + TatI WGTACW 2783 2787 . . 2783 2788 + ScaI AGTACT 2785 2785 . . 2784 2787 + Csp6I GTAC 2784 2786 . . 2784 2787 + RsaI GTAC 2785 2785 . . 2791 2795 + MaeIII GTNAC 2790 2795 . . 2794 2797 + SetI ASST 2797 2793 . . 2802 2807 + Hpy166II GTNNAC 2804 2804 . . 2802 2807 + HindII GTYRAC 2804 2804 . . 2799 2804 - TaqII GACCGA 2789 2787 . . 2806 2809 + SetI ASST 2809 2805 . . 2821 2826 + BclI TGATCA 2821 2825 . . 2822 2825 + DpnI GATC 2823 2823 . . 2822 2825 + BstKTI GATC 2824 2822 . . 2822 2825 + MboI GATC 2821 2825 . . 2829 2839 + BsaXI ACNNNNNCTCC 2819 2816 2849 2846 2846 2855 + MslI CAYNNNNRTG 2850 2850 . . 2849 2852 + MnlI CCTC 2859 2858 . . 2846 2850 - FokI GGATG 2832 2836 . . 2846 2850 - BseGI GGATG 2845 2843 . . 2850 2855 - BsiI* CACGAG 2850 2854 . . 2856 2860 + SfaNI GCATC 2865 2869 . . 2856 2866 + MwoI GCNNNNNNNGC 2862 2859 . . 2860 2865 + SecI* CCNNGG 2860 2864 . . 2857 2861 - FokI GGATG 2843 2847 . . 2861 2865 + BssKI CCNGG 2860 2865 . . 2857 2861 - BseGI GGATG 2856 2854 . . 2861 2865 + BseBI CCWGG 2862 2863 . . 2861 2865 + ScrFI CCNGG 2862 2863 . . 2861 2865 + EcoRII CCWGG 2860 2865 . . 2864 2867 + CviJI RGCY 2865 2865 . . 2876 2880 - FokI GGATG 2862 2866 . . 2880 2885 + Esp3I CGTCTC 2886 2890 . . 2876 2880 - BseGI GGATG 2875 2873 . . 2881 2885 + BsmAI GTCTC 2886 2890 . . 2878 2882 - TspGWI ACGGA 2868 2866 . . 2882 2887 + Hpy178III* TCNNGA 2883 2885 . . 2884 2887 + TaqI TCGA 2884 2886 . . 2898 2908 + Hin4I GAYNNNNNVTC 2889 2884 2921 2916 2898 2908 - Hin4I GAYNNNNNVTC 2921 2916 2889 2884 2911 2915 - MboII GAAGA 2903 2902 . . 2915 2919 + BccI CCATC 2923 2924 . . 2916 2920 - FokI GGATG 2902 2906 . . 2916 2920 - BseGI GGATG 2915 2913 . . 2921 2924 + MseI TTAA 2921 2923 . . 2926 2930 + MboII GAAGA 2938 2937 . . 2926 2931 + BbvII* GAAGAC 2933 2937 . . 2930 2934 + Tsp4CI* ACNGT 2932 2931 . . 2956 2960 - MboII GAAGA 2948 2947 . . 2957 2962 - Eco57MI CTGRAG 2942 2940 . . 2957 2962 - Eco57I CTGAAG 2942 2940 . . 2969 2973 + TfiI GAWTC 2969 2972 . . 2969 2973 + HinfI GANTC 2969 2972 . . 2972 2977 + Hpy178III* TCNNGA 2973 2975 . . 2981 2984 + DpnI GATC 2982 2982 . . 2981 2984 + BstKTI GATC 2983 2981 . . 2981 2984 + MboI GATC 2980 2984 . . 2985 2988 + TspEI AATT 2984 2988 . . 2990 2993 + TspEI AATT 2989 2993 . . 2995 2999 + Hpy99I CGWCG 2999 2994 . . 2996 3000 + HgaI GACGC 3005 3010 . . 3009 3012 + TaqI TCGA 3009 3011 . . 3012 3016 + TspDTI ATGAA 3027 3025 . . 3014 3018 + MboII GAAGA 3026 3025 . . 3014 3019 + BbvII* GAAGAC 3021 3025 . . 3020 3023 + MseI TTAA 3020 3022 . . 3024 3028 + Tsp4CI* ACNGT 3026 3025 . . 3029 3032 + MseI TTAA 3029 3031 . . 3050 3054 - TspDTI ATGAA 3040 3038 . . 3052 3057 - BsrDI GCAATG 3051 3049 . . 3056 3060 - HgaI GACGC 3045 3050 . . 3066 3071 + XhoII RGATCY 3066 3070 . . 3067 3070 + DpnI GATC 3068 3068 . . 3067 3070 + BstKTI GATC 3069 3067 . . 3067 3070 + MboI GATC 3066 3070 . . 3067 3071 - BinI* GGATC 3061 3062 . . 3074 3078 + TfiI GAWTC 3074 3077 . . 3074 3078 + HinfI GANTC 3074 3077 . . 3083 3086 + DpnI GATC 3084 3084 . . 3083 3086 + BstKTI GATC 3085 3083 . . 3083 3086 + MboI GATC 3082 3086 . . 3087 3090 + MseI TTAA 3087 3089 . . 3095 3099 + TfiI GAWTC 3095 3098 . . 3095 3099 + HinfI GANTC 3095 3098 . . 3098 3102 + Hpy188I TCNGA 3100 3099 . . 3104 3107 + FatI CATG 3103 3107 . . 3104 3107 + NlaIII CATG 3107 3103 . . 3104 3107 + CviAII CATG 3104 3106 . . 3107 3117 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3098 3093 3130 3125 3116 3121 + MmeI TCCRAC 3141 3139 . . 3116 3120 + Hpy188I TCNGA 3118 3117 . . 3107 3117 - Hin4I GAYNNNNNVTC 3130 3125 3098 3093 3133 3138 + Hpy178III* TCNNGA 3134 3136 . . 3134 3140 + Bpu10I CCTNAGC 3135 3138 . . 3131 3135 - FokI GGATG 3117 3121 . . 3135 3139 + DdeI CTNAG 3135 3138 . . 3131 3135 - BseGI GGATG 3130 3128 . . 3135 3139 - BspCNI CTCAG 3127 3125 . . 3135 3139 - BseMII CTCAG 3126 3124 . . 3163 3166 + SetI ASST 3166 3162 . . 3163 3166 + CviJI RGCY 3164 3164 . . 3163 3166 + AluI AGCT 3164 3164 . . 3169 3173 + PleI GAGTC 3177 3178 . . 3169 3173 + MlyI GAGTC 3178 3178 . . 3169 3173 + HinfI GANTC 3169 3172 . . 3172 3177 + MmeI TCCRAC 3197 3195 . . 3179 3183 + TfiI GAWTC 3179 3182 . . 3179 3183 + HinfI GANTC 3179 3182 . . 3187 3190 + SetI ASST 3190 3186 . . 3188 3191 + MnlI CCTC 3198 3197 . . 3193 3198 + Hpy166II GTNNAC 3195 3195 . . 3193 3198 + HindII GTYRAC 3195 3195 . . 3190 3194 - TspGWI ACGGA 3180 3178 . . 3204 3209 + Eco57MI CTGRAG 3225 3223 . . 3204 3209 + Eco57I CTGAAG 3225 3223 . . 3206 3210 + MboII GAAGA 3218 3217 . . 3209 3213 + TfiI GAWTC 3209 3212 . . 3209 3213 + HinfI GANTC 3209 3212 . . 3211 3216 + AsuII TTCGAA 3212 3214 . . 3212 3215 + TaqI TCGA 3212 3214 . . 3217 3220 + TaiI ACGT 3220 3216 . . 3217 3220 + SetI ASST 3220 3216 . . 3217 3220 + MaeII ACGT 3217 3219 . . 3217 3222 + AflIII ACRYGT 3217 3221 . . 3233 3238 + SspI AATATT 3235 3235 . . 3239 3242 + FnuDII* CGCG 3240 3240 . . 3240 3243 + Hin6I GCGC 3240 3242 . . 3240 3243 + GlaI GCGC 3241 3241 . . 3240 3243 + HhaI GCGC 3242 3240 . . 3243 3248 + TaqII CACCCA 3259 3257 . . 3254 3259 + Hpy166II GTNNAC 3256 3256 . . 3254 3259 + HindII GTYRAC 3256 3256 . . 3269 3273 + Hpy188I TCNGA 3271 3270 . . 3272 3276 + TfiI GAWTC 3272 3275 . . 3272 3276 + HinfI GANTC 3272 3275 . . 3278 3283 + SspI AATATT 3280 3280 . . 3283 3287 - MboII GAAGA 3275 3274 . . 3287 3291 + BccI CCATC 3295 3296 . . 3295 3299 + MboII GAAGA 3307 3306 . . 3299 3304 + XhoII RGATCY 3299 3303 . . 3299 3304 + BglII AGATCT 3299 3303 . . 3300 3303 + DpnI GATC 3301 3301 . . 3300 3303 + BstKTI GATC 3302 3300 . . 3295 3300 - Ksp632I* CTCTTC 3290 3293 . . 3300 3303 + MboI GATC 3299 3303 . . 3303 3306 + MaeI CTAG 3303 3305 . . 3315 3320 + ApoI RAATTY 3315 3319 . . 3316 3319 + TspEI AATT 3315 3319 . . 3327 3330 + TaqI TCGA 3327 3329 . . 3327 3332 + Hpy178III* TCNNGA 3328 3330 . . 3333 3336 + Csp6I GTAC 3333 3335 . . 3333 3336 + RsaI GTAC 3334 3334 . . 3335 3340 + Cfr10I RCCGGY 3335 3339 . . 3335 3340 + BetI* WCCGGW 3335 3339 . . 3335 3340 + AgeI ACCGGT 3335 3339 . . 3336 3339 + HpaII CCGG 3336 3338 . . 3331 3342 - PpiI GAACNNNNNCTC 3354 3349 3322 3317 3350 3355 + EcoT22I ATGCAT 3354 3350 . . 3351 3354 + CviRI* TGCA 3352 3352 . . 3357 3360 + TspEI AATT 3356 3360 . . 3359 3362 + MseI TTAA 3359 3361 . . 3382 3385 + FatI CATG 3381 3385 . . 3382 3385 + NlaIII CATG 3385 3381 . . 3382 3385 + CviAII CATG 3382 3384 . . 3385 3389 - BslFI GGGAC 3370 3374 . . 3401 3404 + FatI CATG 3400 3404 . . 3401 3404 + NlaIII CATG 3404 3400 . . 3401 3404 + CviAII CATG 3401 3403 . . 3404 3408 + PleI GAGTC 3412 3413 . . 3404 3408 + MlyI GAGTC 3413 3413 . . 3404 3408 + HinfI GANTC 3404 3407 . . 3408 3412 + Hpy99I CGWCG 3412 3407 . . 3411 3416 + SplI* CGTACG 3411 3415 . . 3412 3415 + Csp6I GTAC 3412 3414 . . 3412 3415 + RsaI GTAC 3413 3413 . . 3417 3421 - BsrI ACTGG 3417 3415 . . 3435 3439 + Hpy188I TCNGA 3437 3436 . . 3442 3446 + DdeI CTNAG 3442 3445 . . 3442 3446 + BspCNI CTCAG 3455 3453 . . 3442 3446 + BseMII CTCAG 3456 3454 . . 3443 3447 + Hpy188I TCNGA 3445 3444 . . 3446 3450 + HinfI GANTC 3446 3449 . . 3446 3450 - PleI GAGTC 3440 3441 . . 3446 3450 - MlyI GAGTC 3440 3440 . . 3451 3454 + Csp6I GTAC 3451 3453 . . 3451 3454 + RsaI GTAC 3452 3452 . . 3453 3457 + Tsp4CI* ACNGT 3455 3454 . . 3454 3460 + TspRI CASTGNN 3460 3451 . . 3456 3460 + Tsp45I GTSAC 3455 3460 . . 3456 3460 + MaeIII GTNAC 3455 3460 . . 3463 3474 + BdaI TGANNNNNNTCA 3452 3450 3486 3484 3464 3468 - BsmAI GTCTC 3458 3462 . . 3463 3474 - BdaI TGANNNNNNTCA 3486 3484 3452 3450 3476 3486 + BaeI ACNNNNGTAYC 3465 3460 3498 3493 3480 3483 + TaiI ACGT 3483 3479 . . 3480 3483 + SetI ASST 3483 3479 . . 3480 3483 + MaeII ACGT 3480 3482 . . 3482 3485 + Csp6I GTAC 3482 3484 . . 3482 3485 + RsaI GTAC 3483 3483 . . 3495 3498 + Csp6I GTAC 3495 3497 . . 3495 3498 + RsaI GTAC 3496 3496 . . 3492 3496 - BsrI ACTGG 3492 3490 . . 3503 3508 + KpnI GGTACC 3507 3503 . . 3503 3508 + NlaIV GGNNCC 3505 3505 . . 3503 3508 + HgiCI* GGYRCC 3503 3507 . . 3503 3508 + Acc65I GGTACC 3503 3507 . . 3504 3507 + Csp6I GTAC 3504 3506 . . 3504 3507 + RsaI GTAC 3505 3505 . . 3518 3522 + Tsp4CI* ACNGT 3520 3519 . . 3524 3527 + AciI CCGC 3524 3526 . . 3546 3550 + DdeI CTNAG 3546 3549 . . 3542 3546 - BsmAI GTCTC 3536 3540 . . 3546 3550 - BspCNI CTCAG 3538 3536 . . 3546 3550 - BseMII CTCAG 3537 3535 . . 3564 3568 + Tsp4CI* ACNGT 3566 3565 . . 3567 3572 + Hpy166II GTNNAC 3569 3569 . . 3571 3574 + SetI ASST 3574 3570 . . 3572 3576 + Hin4II* CCTTC 3582 3581 . . 3569 3573 - HphI GGTGA 3561 3560 . . 3575 3578 + TaqI TCGA 3575 3577 . . 3576 3581 + McrI* CGRYCG 3579 3577 . . 3576 3581 + PvuI CGATCG 3579 3577 . . 3577 3580 + DpnI GATC 3578 3578 . . 3577 3580 + BstKTI GATC 3579 3577 . . 3577 3580 + MboI GATC 3576 3580 . . 3578 3583 + ClaI ATCGAT 3579 3581 . . 3579 3582 + TaqI TCGA 3579 3581 . . 3581 3591 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3572 3567 3604 3599 3588 3591 + MnlI CCTC 3598 3597 . . 3593 3597 + Hpy188I TCNGA 3595 3594 . . 3602 3605 + TspEI AATT 3601 3605 . . 3614 3619 + BtrI CACGTC 3616 3616 . . 3615 3618 + TaiI ACGT 3618 3614 . . 3615 3618 + SetI ASST 3618 3614 . . 3615 3618 + MaeII ACGT 3615 3617 . . 3616 3620 + Hpy99I CGWCG 3620 3615 . . 3632 3635 + TaiI ACGT 3635 3631 . . 3632 3635 + SetI ASST 3635 3631 . . 3632 3635 + MaeII ACGT 3632 3634 . . 3635 3639 + Hpy188I TCNGA 3637 3636 . . 3641 3644 + SetI ASST 3644 3640 . . 3647 3653 + SauI* CCTNAGG 3648 3651 . . 3648 3652 + DdeI CTNAG 3648 3651 . . 3665 3669 + TfiI GAWTC 3665 3668 . . 3662 3665 - MnlI CCTC 3655 3654 . . 3665 3669 + HinfI GANTC 3665 3668 . . 3673 3676 + TspEI AATT 3672 3676 . . 3680 3683 + DpnI GATC 3681 3681 . . 3680 3683 + BstKTI GATC 3682 3680 . . 3680 3683 + MboI GATC 3679 3683 . . 3682 3686 - MboII GAAGA 3674 3673 . . 3691 3696 + Hpy178III* TCNNGA 3692 3694 . . 3695 3698 + DpnI GATC 3696 3696 . . 3695 3698 + BstKTI GATC 3697 3695 . . 3695 3698 + MboI GATC 3694 3698 . . 3701 3704 + MnlI CCTC 3711 3710 . . 3703 3708 + Hpy178III* TCNNGA 3704 3706 . . 3702 3707 - Eco57MI CTGRAG 3687 3685 . . 3702 3707 - GsuI CTGGAG 3687 3685 . . 3709 3712 + SetI ASST 3712 3708 . . 3710 3713 + MnlI CCTC 3720 3719 . . 3720 3723 + TspEI AATT 3719 3723 . . 3725 3729 + Hpy188I TCNGA 3727 3726 . . 3728 3732 + HinfI GANTC 3728 3731 . . 3728 3732 - PleI GAGTC 3722 3723 . . 3728 3732 - MlyI GAGTC 3722 3722 . . 3734 3739 + AhaIII* TTTAAA 3736 3736 . . 3735 3738 + MseI TTAA 3735 3737 . . 3751 3761 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3742 3737 3774 3769 3751 3754 + DpnI GATC 3752 3752 . . 3751 3754 + BstKTI GATC 3753 3751 . . 3751 3754 + MboI GATC 3750 3754 . . 3755 3758 + TspEI AATT 3754 3758 . . 3770 3773 + TspEI AATT 3769 3773 . . 3774 3778 - BsrI ACTGG 3774 3772 . . 3780 3785 - TaqII CACCCA 3770 3768 . . 3791 3795 + HphI GGTGA 3803 3802 . . 3792 3796 + Tsp45I GTSAC 3791 3796 . . 3792 3796 + MaeIII GTNAC 3791 3796 . . 3794 3798 + HinfI GANTC 3794 3797 . . 3794 3798 - PleI GAGTC 3788 3789 . . 3794 3798 - MlyI GAGTC 3788 3788 . . 3819 3823 + Tsp4CI* ACNGT 3821 3820 . . 3831 3834 + DpnI GATC 3832 3832 . . 3831 3834 + BstKTI GATC 3833 3831 . . 3831 3834 + MboI GATC 3830 3834 . . 3839 3843 + MboII GAAGA 3851 3850 . . 3846 3850 + TspDTI ATGAA 3861 3859 . . 3856 3859 + TspEI AATT 3855 3859 . . 3858 3861 + MseI TTAA 3858 3860 . . 3861 3864 + SetI ASST 3864 3860 . . 3866 3871 + Hpy178III* TCNNGA 3867 3869 . . 3867 3872 + BsiI* CACGAG 3867 3871 . . 3870 3874 - BsmAI GTCTC 3864 3868 . . 3876 3879 + FatI CATG 3875 3879 . . 3876 3879 + NlaIII CATG 3879 3875 . . 3876 3879 + CviAII CATG 3876 3878 . . 3885 3889 + DdeI CTNAG 3885 3888 . . 3907 3910 + SetI ASST 3910 3906 . . 3908 3911 + MnlI CCTC 3918 3917 . . 3910 3914 + Hpy188I TCNGA 3912 3911 . . 3915 3918 + DpnI GATC 3916 3916 . . 3915 3918 + BstKTI GATC 3917 3915 . . 3915 3918 + MboI GATC 3914 3918 . . 3917 3920 + TaqI TCGA 3917 3919 . . 3919 3923 + MboII GAAGA 3931 3930 . . 3927 3932 + EcoRI GAATTC 3927 3931 . . 3927 3932 + ApoI RAATTY 3927 3931 . . 3928 3931 + TspEI AATT 3927 3931 . . 3933 3936 + SetI ASST 3936 3932 . . 3931 3935 - HphI GGTGA 3923 3922 . . 3940 3943 + CviRI* TGCA 3941 3941 . . 3941 3945 + BlsI GCNGC 3943 3942 . . 3941 3945 + BisI GCNGC 3942 3943 . . 3941 3945 + BbvI GCAGC 3953 3957 . . 3941 3945 + TseI GCWGC 3941 3944 . . 3942 3947 + PvuII CAGCTG 3944 3944 . . 3942 3947 + NspBII* CMGCKG 3944 3944 . . 3943 3946 + SetI ASST 3946 3942 . . 3943 3946 + CviJI RGCY 3944 3944 . . 3943 3946 + AluI AGCT 3944 3944 . . 3944 3954 + MwoI GCNNNNNNNGC 3950 3947 . . 3976 3980 + TspGWI ACGGA 3991 3989 . . 3983 3986 + SetI ASST 3986 3982 . . 3985 3990 + SmlI CTYRAG 3985 3989 . . 3985 3990 + AflII CTTAAG 3985 3989 . . 3986 3989 + MseI TTAA 3986 3988 . . 3998 4001 - MnlI CCTC 3991 3990 . . 4007 4010 + SetI ASST 4010 4006 . . 4005 4009 - HphI GGTGA 3997 3996 . . 4023 4026 + MseI TTAA 4023 4025 . . 4044 4047 + TaqI TCGA 4044 4046 . . 4064 4069 + Hpy166II GTNNAC 4066 4066 . . 4064 4069 + HindII GTYRAC 4066 4066 . . 4082 4086 + TspDTI ATGAA 4097 4095 . . 4092 4096 + BslFI GGGAC 4106 4110 . . 4096 4102 + TspRI CASTGNN 4102 4093 . . 4104 4109 + SspI AATATT 4106 4106 . . 4144 4149 + ApoI RAATTY 4144 4148 . . 4145 4148 + TspEI AATT 4144 4148 . . 4158 4162 - MboII GAAGA 4150 4149 . . 4171 4174 + TaiI ACGT 4174 4170 . . 4171 4174 + SetI ASST 4174 4170 . . 4171 4174 + MaeII ACGT 4171 4173 . . 4173 4177 + Tsp45I GTSAC 4172 4177 . . 4173 4177 + MaeIII GTNAC 4172 4177 . . 4174 4185 + BdaI TGANNNNNNTCA 4163 4161 4197 4195 4176 4180 + Tsp4CI* ACNGT 4178 4177 . . 4179 4182 + Csp6I GTAC 4179 4181 . . 4179 4182 + RsaI GTAC 4180 4180 . . 4174 4185 - BdaI TGANNNNNNTCA 4197 4195 4163 4161 4189 4192 + SetI ASST 4192 4188 . . 4189 4192 + CviJI RGCY 4190 4190 . . 4189 4192 + AluI AGCT 4190 4190 . . 4191 4194 + MaeI CTAG 4191 4193 . . 4201 4204 + CviRI* TGCA 4202 4202 . . 4207 4210 + SetI ASST 4210 4206 . . 4208 4212 + HphI GGTGA 4220 4219 . . 4206 4209 - MnlI CCTC 4199 4198 . . 4219 4223 + SfaNI GCATC 4228 4232 . . 4222 4227 + Hpy178III* TCNNGA 4223 4225 . . 4220 4224 - FokI GGATG 4206 4210 . . 4220 4224 - BseGI GGATG 4219 4217 . . 4235 4239 + HinfI GANTC 4235 4238 . . 4237 4241 + DdeI CTNAG 4237 4240 . . 4237 4241 + BspCNI CTCAG 4250 4248 . . 4237 4241 + BseMII CTCAG 4251 4249 . . 4235 4239 - PleI GAGTC 4229 4230 . . 4235 4239 - MlyI GAGTC 4229 4229 . . 4242 4247 + NspI RCATGY 4246 4242 . . 4242 4247 + Cac8I GCNNGC 4244 4244 . . 4242 4247 + SphI GCATGC 4246 4242 . . 4243 4246 + FatI CATG 4242 4246 . . 4243 4246 + NlaIII CATG 4246 4242 . . 4243 4246 + CviAII CATG 4243 4245 . . 4245 4248 + CviRI* TGCA 4246 4246 . . 4256 4260 + Tsp4CI* ACNGT 4258 4257 . . 4259 4262 + Csp6I GTAC 4259 4261 . . 4259 4262 + RsaI GTAC 4260 4260 . . 4262 4271 + MslI CAYNNNNRTG 4266 4266 . . 4269 4274 + EcoT22I ATGCAT 4273 4269 . . 4270 4273 + CviRI* TGCA 4271 4271 . . 4273 4278 + VspI ATTAAT 4274 4276 . . 4274 4277 + MseI TTAA 4274 4276 . . 4279 4290 + DrdI GACNNNNNNGTC 4285 4283 . . 4281 4285 - FokI GGATG 4267 4271 . . 4281 4285 - BseGI GGATG 4280 4278 . . 4288 4292 + Tsp45I GTSAC 4287 4292 . . 4288 4292 + MaeIII GTNAC 4287 4292 . . 4294 4297 + CviRI* TGCA 4295 4295 . . 4323 4326 + TspEI AATT 4322 4326 . . 4334 4338 - MboII GAAGA 4326 4325 . . 4351 4354 + CviRI* TGCA 4352 4352 . . 4364 4368 + MboII GAAGA 4376 4375 . . 4368 4371 + TspEI AATT 4367 4371 . . 4381 4384 + SetI ASST 4384 4380 . . 4382 4385 + MnlI CCTC 4392 4391 . . 4388 4398 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 4394 4391 . . 4400 4404 + TspDTI ATGAA 4415 4413 . . 4417 4420 + TaiI ACGT 4420 4416 . . 4417 4420 + SetI ASST 4420 4416 . . 4417 4420 + MaeII ACGT 4417 4419 . . 4423 4427 + MboII GAAGA 4435 4434 . . 4461 4465 + BsrI ACTGG 4466 4464 . . 4465 4468 + Csp6I GTAC 4465 4467 . . 4465 4468 + RsaI GTAC 4466 4466 . . 4485 4488 + SetI ASST 4488 4484 . . 4495 4499 + Tsp4CI* ACNGT 4497 4496 . . 4496 4502 + TspRI CASTGNN 4502 4493 . . 4508 4512 + MboII GAAGA 4520 4519 . . 4508 4517 + XmnI GAANNNNTTC 4512 4512 . . 4520 4524 + FokI GGATG 4533 4537 . . 4520 4524 + BseGI GGATG 4526 4524 . . 4521 4525 - BccI CCATC 4515 4516 . . 4527 4530 + FatI CATG 4526 4530 . . 4527 4530 + NlaIII CATG 4530 4526 . . 4527 4530 + CviAII CATG 4527 4529 . . 4536 4539 + MseI TTAA 4536 4538 . . 4550 4554 + MaeIII GTNAC 4549 4554 . . 4555 4558 + TspEI AATT 4554 4558 . . 4578 4589 + BdaI TGANNNNNNTCA 4567 4565 4601 4599 4578 4589 - BdaI TGANNNNNNTCA 4601 4599 4567 4565 4598 4601 + MseI TTAA 4598 4600 . . 4600 4605 + ApoI RAATTY 4600 4604 . . 4601 4604 + TspEI AATT 4600 4604 . . 4603 4608 + AsuII TTCGAA 4604 4606 . . 4604 4607 + TaqI TCGA 4604 4606 . . 4615 4618 + TspEI AATT 4614 4618 . . 4628 4633 + SmlI CTYRAG 4628 4632 . . 4629 4634 + Hpy178III* TCNNGA 4630 4632 . . 4628 4633 - Bce83I* CTTGAG 4613 4611 . . 4635 4638 + CviRI* TGCA 4636 4636 . . 4633 4637 - SfaNI GCATC 4623 4627 . . 4651 4661 + Hin4I GAYNNNNNVTC 4642 4637 4674 4669 4653 4658 + PsiI TTATAA 4655 4655 . . 4651 4661 - Hin4I GAYNNNNNVTC 4674 4669 4642 4637 4661 4664 + MaeI CTAG 4661 4663 . . 4663 4666 + SetI ASST 4666 4662 . . 4664 4668 + HphI GGTGA 4676 4675 . . 4671 4676 + BtgZI GCGATG 4686 4690 . . 4675 4686 + BdaI TGANNNNNNTCA 4664 4662 4698 4696 4677 4681 + TspDTI ATGAA 4692 4690 . . 4680 4685 + ApoI RAATTY 4680 4684 . . 4681 4684 + TspEI AATT 4680 4684 . . 4675 4686 - BdaI TGANNNNNNTCA 4698 4696 4664 4662 4696 4701 + StyI CCWWGG 4696 4700 . . 4696 4701 + SecI* CCNNGG 4696 4700 . . 4693 4697 - FokI GGATG 4679 4683 . . 4693 4697 - BseGI GGATG 4692 4690 . . 4700 4703 + CviJI RGCY 4701 4701 . . 4702 4706 + DdeI CTNAG 4702 4705 . . 4723 4726 + SetI ASST 4726 4722 . . 4722 4725 - MnlI CCTC 4715 4714 . . 4732 4735 + FatI CATG 4731 4735 . . 4732 4735 + NlaIII CATG 4735 4731 . . 4732 4735 + CviAII CATG 4732 4734 . . 4733 4737 + TspDTI ATGAA 4748 4746 . . 4737 4740 + TspEI AATT 4736 4740 . . 4741 4744 + SetI ASST 4744 4740 . . 4757 4760 + MseI TTAA 4757 4759 . . 4761 4765 + DdeI CTNAG 4761 4764 . . 4761 4765 - BspCNI CTCAG 4753 4751 . . 4761 4765 - BseMII CTCAG 4752 4750 . . 4776 4779 + TspEI AATT 4775 4779 . . 4778 4781 + MseI TTAA 4778 4780 . . 4782 4785 + TaiI ACGT 4785 4781 . . 4782 4785 + SetI ASST 4785 4781 . . 4782 4785 + MaeII ACGT 4782 4784 . . 4784 4787 + Csp6I GTAC 4784 4786 . . 4784 4787 + RsaI GTAC 4785 4785 . . 4786 4789 + SetI ASST 4789 4785 . . 4792 4796 + TfiI GAWTC 4792 4795 . . 4792 4796 + HinfI GANTC 4792 4795 . . 4800 4804 + TspGWI ACGGA 4815 4813 . . 4803 4807 + MboII GAAGA 4815 4814 . . 4814 4819 + NlaIV GGNNCC 4816 4816 . . 4814 4819 + HgiCI* GGYRCC 4814 4818 . . 4815 4820 + SduI GDGCHC 4819 4815 . . 4815 4820 + BseSI GKGCMC 4819 4815 . . 4819 4824 + SecI* CCNNGG 4819 4823 . . 4820 4824 + BssKI CCNGG 4819 4824 . . 4820 4824 + BseBI CCWGG 4821 4822 . . 4820 4824 + ScrFI CCNGG 4821 4822 . . 4820 4824 + EcoRII CCWGG 4819 4824 . . 4823 4826 + CviJI RGCY 4824 4824 . . 4823 4826 + HaeIII GGCC 4824 4824 . . 4828 4834 + SexAI ACCWGGT 4828 4833 . . 4829 4833 + BssKI CCNGG 4828 4833 . . 4829 4833 + BseBI CCWGG 4830 4831 . . 4829 4833 + ScrFI CCNGG 4830 4831 . . 4829 4833 + EcoRII CCWGG 4828 4833 . . 4831 4834 + SetI ASST 4834 4830 . . 4832 4837 + Eco31I GGTCTC 4838 4842 . . 4833 4837 + BsmAI GTCTC 4838 4842 . . 4856 4859 + MaeI CTAG 4856 4858 . . 4860 4863 + SetI ASST 4863 4859 . . 4860 4863 + CviJI RGCY 4861 4861 . . 4860 4863 + AluI AGCT 4861 4861 . . 4862 4865 + MaeI CTAG 4862 4864 . . 4865 4869 + MboII GAAGA 4877 4876 . . 4868 4872 + MboII GAAGA 4880 4879 . . 4883 4887 + TspDTI ATGAA 4898 4896 . . 4887 4890 + SetI ASST 4890 4886 . . 4885 4889 - Hin4II* CCTTC 4879 4878 . . 4889 4892 + Csp6I GTAC 4889 4891 . . 4889 4892 + RsaI GTAC 4890 4890 . . 4892 4895 + FatI CATG 4891 4895 . . 4892 4895 + NlaIII CATG 4895 4891 . . 4892 4895 + CviAII CATG 4892 4894 . . 4893 4897 + TspDTI ATGAA 4908 4906 . . 4899 4902 + CviRI* TGCA 4900 4900 . . 4905 4908 + SetI ASST 4908 4904 . . 4905 4908 + CviJI RGCY 4906 4906 . . 4905 4908 + AluI AGCT 4906 4906 . . 4912 4915 + SetI ASST 4915 4911 . . 4916 4919 + MaeI CTAG 4916 4918 . . 4919 4923 + SfaNI GCATC 4928 4932 . . 4923 4928 + NdeI CATATG 4924 4926 . . 4928 4933 - MmeI TCCRAC 4909 4907 . . 4937 4942 + ApoI RAATTY 4937 4941 . . 4938 4941 + TspEI AATT 4937 4941 . . 4950 4953 + SetI ASST 4953 4949 . . 4975 4978 + CviRI* TGCA 4976 4976 . . 4993 4997 - TspGWI ACGGA 4983 4981 . . 5019 5024 + NdeI CATATG 5020 5022 . . 5022 5026 + TspDTI ATGAA 5037 5035 . . 5025 5028 + TspEI AATT 5024 5028 . . 5028 5039 + BdaI TGANNNNNNTCA 5017 5015 5051 5049 5032 5036 + Tsp4CI* ACNGT 5034 5033 . . 5038 5043 + NdeI CATATG 5039 5041 . . 5028 5039 - BdaI TGANNNNNNTCA 5051 5049 5017 5015 5036 5040 - TspDTI ATGAA 5026 5024 . . 5061 5064 + TspEI AATT 5060 5064 . . 5062 5067 + VspI ATTAAT 5063 5065 . . 5063 5066 + MseI TTAA 5063 5065 . . 5083 5086 + SetI ASST 5086 5082 . . 5088 5091 + MseI TTAA 5088 5090 . . 5091 5094 + CviJI RGCY 5092 5092 . . 5103 5106 + TspEI AATT 5102 5106 . . 5112 5117 + PsiI TTATAA 5114 5114 . . 5118 5123 + BtgZI GCGATG 5133 5137 . . 5124 5127 + MnlI CCTC 5134 5133 . . 5120 5124 - SfaNI GCATC 5110 5114 . . 5132 5138 + BstEII GGTNACC 5132 5137 . . 5133 5137 + MaeIII GTNAC 5132 5137 . . 5134 5139 + TsoI TARCCA 5150 5148 . . 5140 5144 + Tsp4CI* ACNGT 5142 5141 . . 5146 5151 + PsiI TTATAA 5148 5148 . . 5158 5161 + TspEI AATT 5157 5161 . . 5178 5181 + MseI TTAA 5178 5180 . . 5191 5194 + TspEI AATT 5190 5194 . . 5196 5199 - MnlI CCTC 5189 5188 . . 5203 5208 + Hpy166II GTNNAC 5205 5205 . . 5208 5213 + StyI CCWWGG 5208 5212 . . 5208 5213 + SecI* CCNNGG 5208 5212 . . 5212 5215 + CviJI RGCY 5213 5213 . . 5217 5226 + MslI CAYNNNNRTG 5221 5221 . . 5215 5219 - TspDTI ATGAA 5205 5203 . . 5219 5222 + MseI TTAA 5219 5221 . . 5222 5227 + BspLU11I* ACATGT 5222 5226 . . 5222 5227 + NspI RCATGY 5226 5222 . . 5222 5227 + AflIII ACRYGT 5222 5226 . . 5223 5226 + FatI CATG 5222 5226 . . 5223 5226 + NlaIII CATG 5226 5222 . . 5223 5226 + CviAII CATG 5223 5225 . . 5225 5230 + TatI WGTACW 5225 5229 . . 5226 5229 + Csp6I GTAC 5226 5228 . . 5226 5229 + RsaI GTAC 5227 5227 . . 5237 5241 + TspGWI ACGGA 5252 5250 . . 5240 5252 + BarI GAAGNNNNNNTAC 5232 5227 5264 5259 5264 5268 + TfiI GAWTC 5264 5267 . . 5264 5268 + HinfI GANTC 5264 5267 . . 5270 5274 - BslFI GGGAC 5255 5259 . . 5279 5282 + MseI TTAA 5279 5281 . . 5288 5292 + DdeI CTNAG 5288 5291 . . 5292 5296 + MaeIII GTNAC 5291 5296 . . 5295 5298 + SetI ASST 5298 5294 . . 5310 5313 + TaqI TCGA 5310 5312 . . 5323 5326 + TspEI AATT 5322 5326 . . 5345 5355 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5336 5331 5368 5363 5346 5350 + Tsp4CI* ACNGT 5348 5347 . . 5345 5355 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5368 5363 5336 5331 5368 5371 + TspEI AATT 5367 5371 . . 5382 5386 + TspDTI ATGAA 5397 5395 . . 5384 5388 + MboII GAAGA 5396 5395 . . 5384 5389 - Ksp632I* CTCTTC 5379 5382 . . 5390 5395 + ApoI RAATTY 5390 5394 . . 5391 5394 + TspEI AATT 5390 5394 . . 5412 5415 + Csp6I GTAC 5412 5414 . . 5412 5415 + RsaI GTAC 5413 5413 . . 5420 5425 + BsrDI GCAATG 5427 5425 . . 5429 5433 + DdeI CTNAG 5429 5432 . . 5425 5429 - BsmAI GTCTC 5419 5423 . . 5429 5433 - BspCNI CTCAG 5421 5419 . . 5429 5433 - BseMII CTCAG 5420 5418 . . 5435 5445 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5426 5421 5458 5453 5436 5440 + TspDTI ATGAA 5451 5449 . . 5444 5449 + Hpy178III* TCNNGA 5445 5447 . . 5435 5445 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5458 5453 5426 5421 5457 5460 + CviRI* TGCA 5458 5458 . . 5459 5464 + BsaAI YACGTR 5461 5461 . . 5460 5463 + TaiI ACGT 5463 5459 . . 5460 5463 + SetI ASST 5463 5459 . . 5460 5463 + MaeII ACGT 5460 5462 . . 5456 5461 - BsgI GTGCAG 5441 5439 . . 5472 5475 + TaqI TCGA 5472 5474 . . 5486 5491 + SspI AATATT 5488 5488 . . 5491 5494 + CviRI* TGCA 5492 5492 . . 5496 5499 + TaiI ACGT 5499 5495 . . 5496 5499 + SetI ASST 5499 5495 . . 5496 5499 + MaeII ACGT 5496 5498 . . 5503 5513 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5494 5489 5526 5521 5509 5512 + SetI ASST 5512 5508 . . 5510 5513 + MnlI CCTC 5520 5519 . . 5511 5516 + Ksp632I* CTCTTC 5517 5520 . . 5515 5519 + Hpy188I TCNGA 5517 5516 . . 5512 5516 - MboII GAAGA 5504 5503 . . 5537 5540 + MseI TTAA 5537 5539 . . 5551 5555 + TfiI GAWTC 5551 5554 . . 5551 5555 + HinfI GANTC 5551 5554 . . 5553 5557 - TspDTI ATGAA 5543 5541 . . 5559 5564 + XhoII RGATCY 5559 5563 . . 5559 5564 + BglII AGATCT 5559 5563 . . 5560 5563 + DpnI GATC 5561 5561 . . 5560 5563 + BstKTI GATC 5562 5560 . . 5560 5563 + MboI GATC 5559 5563 . . 5574 5579 - TaqII CACCCA 5564 5562 . . 5584 5589 - MmeI TCCRAC 5565 5563 . . 5647 5651 + Tsp4CI* ACNGT 5649 5648 . . 5653 5656 + MseI TTAA 5653 5655 . . 5679 5682 + SetI ASST 5682 5678 . . 5679 5682 + CviJI RGCY 5680 5680 . . 5679 5682 + AluI AGCT 5680 5680 . . 5675 5685 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5698 5693 5666 5661 5687 5690 + TaqI TCGA 5687 5689 . . 5696 5699 - MnlI CCTC 5689 5688 . . 5701 5704 + SetI ASST 5704 5700 . . 5701 5704 + CviJI RGCY 5702 5702 . . 5701 5704 + AluI AGCT 5702 5702 . . 5703 5708 + Eco57MI CTGRAG 5724 5722 . . 5703 5708 + Eco57I CTGAAG 5724 5722 . . 5709 5712 + CviRI* TGCA 5710 5710 . . 5736 5740 + TspDTI ATGAA 5751 5749 . . 5750 5754 + TspGWI ACGGA 5765 5763 . . 5757 5760 - MnlI CCTC 5750 5749 . . 5757 5767 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5780 5775 5748 5743 5770 5775 + SspI AATATT 5772 5772 . . 5792 5796 + TfiI GAWTC 5792 5795 . . 5792 5796 + HinfI GANTC 5792 5795 . . 5796 5806 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 5802 5799 . . 5806 5810 + TfiI GAWTC 5806 5809 . . 5803 5806 - MnlI CCTC 5796 5795 . . 5806 5810 + HinfI GANTC 5806 5809 . . 5817 5824 + PspXI VCTCGAGB 5818 5822 . . 5817 5820 + MnlI CCTC 5827 5826 . . 5817 5824 + AbsI CCTCGAGG 5818 5822 . . 5818 5823 + SmlI CTYRAG 5818 5822 . . 5818 5823 + XhoI CTCGAG 5818 5822 . . 5818 5823 + BmeT110I CYCGRG 5819 5821 . . 5818 5823 + AvaI CYCGRG 5818 5822 . . 5819 5822 + TaqI TCGA 5819 5821 . . 5821 5826 + BseRI GAGGAG 5836 5834 . . 5821 5824 - MnlI CCTC 5814 5813 . . 5832 5835 + MaeI CTAG 5832 5834 . . 5844 5849 + Hpy166II GTNNAC 5846 5846 . . 5844 5849 + BssNAI GTATAC 5846 5846 . . 5844 5849 + AccI GTMKAC 5845 5847 . . 5848 5851 + SetI ASST 5851 5847 . . 5852 5857 + SspI AATATT 5854 5854 . . 5860 5863 + CviJI RGCY 5861 5861 . . 5877 5881 + TfiI GAWTC 5877 5880 . . 5877 5881 + HinfI GANTC 5877 5880 . . 5887 5890 + TspEI AATT 5886 5890 . . 5895 5898 + TspEI AATT 5894 5898 . . #--------------------------------------- # # # AarI: # [CACCTGC] # 471 672 4771 # # AbsI: # [CCTCGAGG] # 96 236 5582 # # Acc65I: # [GGTACC] # 2411 3503 # # AccI: # [GTMKAC] # 69 263 341 362 1547 3332 # # AciI: # [CCGC] # 81 682 945 1816 2390 # # AflII: # [CTTAAG] # 1929 3985 # # AflIII: # [ACRYGT] # 692 1270 1947 2005 # # AgeI: # [ACCGGT] # 2579 3335 # # AhaIII*: # [TTTAAA] # 2178 3736 # # AlfI: # [GCANNNNNNTGC] # 0 0 34 2090 3790 # # AluI: # [AGCT] # 22 22 32 45 75 98 # 212 246 273 280 441 671 # 774 780 934 1009 # # AlwNI: # [CAGNNNCTG] # 1300 4614 # # ApaLI: # [GTGCAC] # 2337 3577 # # ApoI: # [RAATTY] # 20 70 80 109 145 156 # 159 181 217 257 407 452 # 453 456 524 602 612 1014 # # AsuI*: # [GGNCC] # 126 185 538 1648 3417 # # AsuII: # [TTCGAA] # 1310 1392 1468 1744 # # AvaI: # [CYCGRG] # 96 236 2350 3232 # # AvaII: # [GGWCC] # 185 2312 3417 # # BaeI: # [ACNNNNGTAYC] # 33 2416 3465 # # BarI: # [GAAGNNNNNNTAC] # 32 650 5232 # # BbvCI: # [CCTCAGC] # 759 5155 # # BbvI: # [GCAGC] # 458 1418 1961 2077 # # BbvII*: # [GAAGAC] # 88 2893 2933 # # BccI: # [CCATC] # 22 27 30 81 91 114 # 197 372 471 500 573 817 # 1220 1399 # # Bce83I*: # [CTTGAG] # 1301 4613 # # BceAI: # [ACGGC] # 2 525 665 1432 3290 # # BciVI: # [GTATCC] # 698 811 4405 # # BclI: # [TGATCA] # 2821 3093 # # BdaI: # [TGANNNNNNTCA] # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 0 0 # 34 34 34 34 34 34 # 63 319 370 677 863 1546 # 1872 # # BetI*: # [WCCGGW] # 2579 3335 # # BfiI: # [ACTGGG] # 1993 3921 # # BglII: # [AGATCT] # 355 1599 1700 2260 # # BinI*: # [GGATC] # 376 977 1708 2853 # # BisI: # [GCNGC] # 483 1407 1972 2052 # # BlsI: # [GCNGC] # 483 1408 1971 2052 # # BmeT110I: # [CYCGRG] # 95 237 2350 3232 # # BmgT120I: # [GGNCC] # 126 185 539 1648 3416 # # Bpu10I: # [CCTNAGC] # 759 2376 2779 # # BsaAI: # [YACGTR] # 453 2151 3310 # # BsaXI: # [ACNNNNNCTCC] # 30 2819 3065 # # BseBI: # [CCWGG] # 9 109 155 171 334 380 # 662 1051 1084 1959 # # BseGI: # [GGATG] # 11 19 24 40 61 166 # 215 229 246 503 754 1089 # 1222 1335 # # BseMII: # [CTCAG] # 16 54 81 151 330 494 # 501 614 627 668 703 714 # 961 # # BseRI: # [GAGGAG] # 78 240 254 5342 # # BseSI: # [GKGCMC] # 1095 2341 2478 # # BseYI: # [CCCAGC] # 1519 4395 # # BsgI: # [GTGCAG] # 473 5441 # # BsiI*: # [CACGAG] # 1017 2047 2850 # # BsiYI*: # [CCNNNNNNNGG] # 57 112 198 220 315 1408 # 1680 1924 # # BslFI: # [GGGAC] # 659 736 1149 3370 # # BsmAI: # [GTCTC] # 78 328 395 495 523 572 # 581 974 1968 # # BsmI: # [GAATGC] # 904 1193 3817 # # BspCNI: # [CTCAG] # 16 52 83 151 328 493 # 503 616 627 668 704 712 # 961 # # BspHI: # [TCATGA] # 1034 4880 # # BspLU11I*: # [ACATGT] # 692 5222 # # BspMI: # [ACCTGC] # 48 471 624 4771 # # BsrDI: # [GCAATG] # 394 487 2376 2657 # # BsrI: # [ACTGG] # 11 75 135 149 192 282 # 692 942 1448 1988 # # BssKI: # [CCNGG] # 9 109 155 171 334 380 # 660 1051 1086 1959 # # BssNAI: # [GTATAC] # 68 264 362 1888 3332 # # BstEII: # [GGTNACC] # 782 1790 3342 # # BstKTI: # [GATC] # 15 16 56 80 84 86 # 103 159 217 277 352 355 # 384 422 542 1121 1645 # # BstXI: # [CCANNNNNNTGG] # 590 5324 # # BtgZI: # [GCGATG] # 447 781 4686 # # BtrI: # [CACGTC] # 1273 2298 2343 # # BtsI: # [GCAGTG] # 559 5355 # # Cac8I: # [GCNNGC] # 6 188 658 691 1218 1483 # 1670 # # Cfr10I: # [RCCGGY] # 2579 3335 # # ClaI: # [ATCGAT] # 2335 3579 # # Csp6I: # [GTAC] # 9 13 21 23 25 31 # 34 39 50 79 80 105 # 108 144 186 206 214 265 # 319 337 502 520 549 561 # 675 819 # # CviAII: # [CATG] # 19 32 62 104 160 162 # 165 182 194 205 278 284 # 331 331 348 367 460 475 # 477 587 691 # # CviJI: # [RGCY] # 6 12 22 22 24 27 # 30 32 36 37 37 40 # 42 45 53 65 89 98 # 102 110 112 121 121 123 # 137 159 159 186 246 260 # 299 467 511 561 743 780 # # CviRI*: # [TGCA] # 6 22 24 25 34 37 # 44 48 49 57 60 63 # 76 128 156 204 218 228 # 261 264 284 311 429 482 # 511 589 605 699 # # DdeI: # [CTNAG] # 16 26 31 56 59 75 # 102 104 126 141 151 237 # 278 283 307 352 359 465 # 485 527 552 555 627 # # DpnI: # [GATC] # 15 16 56 80 84 86 # 103 159 217 277 353 355 # 383 422 542 1121 1645 # # DrdI: # [GACNNNNNNGTC] # 1629 4285 # # DsaI*: # [CCRYGG] # 2500 3414 # # Eco31I: # [GGTCTC] # 1076 4838 # # Eco57I: # [CTGAAG] # 142 190 283 358 2442 2499 # # Eco57MI: # [CTGRAG] # 142 190 283 358 462 2037 # 2442 # # EcoNI: # [CCTNNNNNAGG] # 731 5183 # # EcoP15I: # [CAGCAG] # 580 5334 # # EcoRI: # [GAATTC] # 1987 3927 # # EcoRII: # [CCWGG] # 9 109 155 171 334 380 # 660 1051 1086 1959 # # EcoRV: # [GATATC] # 285 583 879 1032 3135 # # EcoT22I: # [ATGCAT] # 919 1146 1641 2208 # # Esp3I: # [CGTCTC] # 2886 3028 # # FatI: # [CATG] # 19 32 62 104 160 162 # 165 182 194 205 278 284 # 330 331 348 367 460 475 # 477 587 692 # # FnuDII*: # [CGCG] # 828 2412 2674 # # FokI: # [GGATG] # 11 19 24 40 61 146 # 215 229 266 503 741 1089 # 1235 1335 # # GlaI: # [GCGC] # 339 1141 1761 2673 # # GsaI: # [CCCAGC] # 1523 4391 # # GsuI: # [CTGGAG] # 2227 3687 # # HaeII: # [RGCGCY] # 341 5573 # # HaeIII: # [GGCC] # 126 540 875 933 1090 2350 # # HgaI: # [GACGC] # 40 2869 3005 # # HgiAI*: # [GWGCWC] # 252 718 1623 3321 # # HgiCI*: # [GGYRCC] # 1100 1311 3503 # # HgiJII*: # [GRGCYC] # 1491 4423 # # HhaI: # [GCGC] # 340 1141 1761 2672 # # Hin4I: # [GAYNNNNNVTC] # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 11 21 # 21 32 32 32 32 32 # 32 32 32 32 32 32 # 32 32 32 36 50 50 # 58 84 94 134 138 140 # 177 202 442 544 662 868 # 1734 # # Hin4II*: # [CCTTC] # 79 643 954 1035 1297 1906 # # Hin6I: # [GCGC] # 338 1141 1761 2674 # # HindII: # [GTYRAC] # 61 391 631 810 815 1358 # 1848 # # HinfI: # [GANTC] # 10 14 14 15 16 21 # 21 29 30 37 42 47 # 50 60 63 63 66 71 # 71 74 88 105 110 112 # 132 165 210 219 241 255 # 287 323 371 441 472 489 # 523 557 # # HpaI: # [GTTAAC] # 815 5099 # # HpaII: # [CCGG] # 2578 3336 # # HphI: # [GGTGA] # 74 96 120 121 223 242 # 456 716 843 869 916 1238 # # Hpy166II: # [GTNNAC] # 19 61 68 68 79 88 # 105 113 141 149 175 189 # 229 257 264 313 391 497 # 641 928 1139 # # Hpy178III*: # [TCNNGA] # 7 9 12 33 49 50 # 69 90 158 161 163 175 # 194 227 241 297 314 321 # 356 364 379 407 469 554 # 815 # # Hpy188I: # [TCNGA] # 8 18 27 28 42 58 # 63 90 97 150 151 153 # 166 185 197 228 297 308 # 342 397 591 713 1605 # # Hpy99I: # [CGWCG] # 208 413 587 2294 2412 # # KpnI: # [GGTACC] # 2407 3507 # # Ksp632I*: # [CTCTTC] # 138 397 2089 3290 # # MaeI: # [CTAG] # 6 54 82 195 250 266 # 273 470 583 888 916 1931 # # MaeII: # [ACGT] # 17 36 135 177 227 246 # 263 354 365 392 418 474 # 526 539 678 1067 # # MaeIII: # [GTNAC] # 60 115 159 262 336 351 # 381 583 623 632 665 747 # 1000 # # MboI: # [GATC] # 15 16 56 80 84 86 # 103 159 217 277 355 355 # 381 422 542 1121 1645 # # MboII: # [GAAGA] # 3 10 32 35 50 57 # 59 59 62 78 80 85 # 108 176 177 192 219 295 # 367 410 516 1345 1499 # # McrI*: # [CGRYCG] # 1172 2335 2407 # # MfeI: # [CAATTG] # 1567 4347 # # MlyI: # [GAGTC] # 21 27 66 196 235 282 # 441 571 739 1651 1685 # # MmeI: # [TCCRAC] # 56 238 349 656 681 1712 # 2222 # # MnlI: # [CCTC] # 5 9 13 13 18 18 # 21 28 46 46 49 55 # 56 57 60 61 61 73 # 87 90 107 151 159 169 # 183 193 198 208 213 232 # 265 323 331 339 400 419 # 424 734 # # MseI: # [TTAA] # 9 21 24 25 31 37 # 41 56 58 60 62 71 # 90 99 116 123 128 159 # 244 251 258 261 262 272 # 285 354 376 380 464 554 # 743 # # MslI: # [CAYNNNNRTG] # 57 408 552 693 744 955 # 1089 1416 # # MstI*: # [TGCGCA] # 2100 3814 # # MwoI: # [GCNNNNNNNGC] # 97 472 1088 1964 2293 # # NdeI: # [CATATG] # 19 96 875 4924 # # NlaIII: # [CATG] # 19 32 62 104 160 162 # 165 182 194 205 278 284 # 331 334 348 367 460 475 # 477 587 688 # # NlaIV: # [GGNNCC] # 1098 1311 3505 # # NruI: # [TCGCGA] # 2412 3502 # # NspBII*: # [CMGCKG] # 288 475 1365 1816 1970 # # NspI: # [RCATGY] # 194 654 688 691 980 1220 # 1487 # # OliI: # [CACNNNNGTG] # 552 5362 # # PflMI: # [CCANNNNNTGG] # 535 5379 # # PfoI: # [TCCNGGA] # 1809 4105 # # PleI: # [GAGTC] # 22 28 66 195 235 282 # 441 571 738 1651 1685 # # PpiI: # [GAACNNNNNCTC] # 32 2560 3322 # # PsiI: # [TTATAA] # 34 459 766 1697 2958 # # PspXI: # [VCTCGAGB] # 96 236 5582 # # PstI: # [CTGCAG] # 754 1140 4020 # # PvuI: # [CGATCG] # 2335 3579 # # PvuII: # [CAGCTG] # 475 1970 3469 # # RsaI: # [GTAC] # 9 13 21 23 25 31 # 34 39 50 79 80 105 # 108 144 186 206 214 265 # 319 337 501 521 549 561 # 675 819 # # SalI: # [GTCGAC] # 2171 3743 # # SauI*: # [CCTNAGG] # 2266 3648 # # ScaI: # [AGTACT] # 785 2000 3129 # # ScrFI: # [CCNGG] # 9 109 155 171 334 380 # 662 1051 1084 1959 # # SduI: # [GDGCHC] # 252 718 773 850 1095 2226 # # SecI*: # [CCNNGG] # 108 123 170 334 360 381 # 389 661 706 846 1836 # # SetI: # [ASST] # 4 4 5 6 7 7 # 9 9 10 12 12 13 # 15 17 18 18 18 18 # 22 22 24 24 25 25 # 26 27 29 30 30 32 # 33 34 36 36 36 36 # 38 40 41 42 44 44 # 45 46 46 47 48 60 # 63 63 66 66 68 68 # 76 77 82 84 87 90 # 91 96 98 100 101 105 # 124 126 133 140 146 147 # 147 152 164 165 170 172 # 174 178 193 212 263 357 # # SexAI: # [ACCWGGT] # 1086 4828 # # SfaNI: # [GCATC] # 11 42 182 305 395 560 # 804 1121 1131 1363 # # SfeI*: # [CTRYAG] # 273 481 1136 4024 # # SmlI: # [CTYRAG] # 96 236 643 1190 3749 # # SphI: # [GCATGC] # 194 691 1220 1668 2141 # # SplI*: # [CGTACG] # 915 2496 2503 # # SspI: # [AATATT] # 45 60 82 82 190 284 # 696 826 1382 2267 # # StyI: # [CCWWGG] # 512 706 4696 # # TaiI: # [ACGT] # 17 36 135 177 227 246 # 263 354 365 395 415 474 # 526 539 678 1067 # # TaqI: # [TCGA] # 4 6 33 50 70 95 # 105 106 115 120 125 127 # 132 132 162 193 197 203 # 215 248 255 264 298 338 # 418 560 637 706 # # TaqII: # [CACCCA] # 350 470 511 623 1794 2166 # # TatI: # [WGTACW] # 50 59 479 650 689 726 # 819 2442 # # TfiI: # [GAWTC] # 14 14 21 29 30 37 # 47 50 60 63 71 71 # 84 88 105 125 133 210 # 241 287 323 387 393 420 # 472 489 523 1127 # # TseI: # [GCWGC] # 483 1406 1973 2052 # # TsoI: # [TARCCA] # 764 5150 # # Tsp45I: # [GTSAC] # 60 115 336 381 632 1098 # 1627 1665 # # Tsp4CI*: # [ACNGT] # 11 13 46 65 67 80 # 93 94 108 117 206 223 # 239 255 265 301 314 314 # 314 357 396 429 460 537 # 610 # # TspDTI: # [ATGAA] # 4 10 11 13 54 56 # 79 83 92 101 118 135 # 150 160 163 168 169 175 # 187 192 207 208 233 234 # 236 277 285 289 318 686 # 821 # # TspEI: # [AATT] # 4 5 8 8 14 15 # 20 20 22 23 23 29 # 33 35 36 39 41 42 # 45 45 46 47 55 56 # 58 66 70 71 72 84 # 86 87 95 99 103 109 # 110 112 123 132 151 156 # 159 162 178 187 209 217 # 235 245 271 304 326 430 # 496 # # TspGWI: # [ACGGA] # 6 37 85 149 168 183 # 191 237 269 303 312 361 # 471 496 498 513 811 824 # # TspRI: # [CASTGNN] # 374 400 531 559 642 978 # 1018 1412 # # TstI: # [CACNNNNNNTCC] # 32 1483 4399 # # VspI: # [ATTAAT] # 789 851 1225 3049 # # XhoI: # [CTCGAG] # 96 236 5582 # # XhoII: # [RGATCY] # 233 355 381 1319 1366 2260 # # XmnI: # [GAANNNNTTC] # 721 1402 1562 2229 # #--------------------------------------- #--------------------------------------- # Total_sequences: 1 # Total_length: 5914 # Reported_sequences: 1 # Reported_hitcount: 1313 #---------------------------------------