Restriction Fragments for YGR161C-D



Send questions or suggestions to SGD

BLAST search | Genome Restriction Map | Design Primers for this sequence


The currently selected gene/sequence is :

YGR161C-D on chromosome VII from coordinates 823015 to 817747.

The sequence you have requested is oriented with respect to the Crick (bottom) strand. Thus, the chromosomal coordinate of the beginning of the gene or sequence is larger than that of the end. The sequence shown here is the 5'-3' direction of the Crick strand and is the reverse complement of the Watson (top) strand.

seqfile=/share/crumb/www-data/html/tmp/gcgseq.tmp.2.28112.2

Start End Strand Enzyme_name Restriction_site 5prime 3prime 5primerev 3primerev 4 8 + TfiI GAWTC 4 7 . . 4 8 + HinfI GANTC 4 7 . . 14 17 + TspEI AATT 13 17 . . 22 25 + TspEI AATT 21 25 . . 40 43 + FatI CATG 39 43 . . 40 43 + NlaIII CATG 43 39 . . 40 43 + CviAII CATG 40 42 . . 46 51 + HaeII RGCGCY 50 46 . . 47 50 + Hin6I GCGC 47 49 . . 47 50 + GlaI GCGC 48 48 . . 47 50 + HhaI GCGC 49 47 . . 61 65 + MaeIII GTNAC 60 65 . . 68 72 + DdeI CTNAG 68 71 . . 76 81 + Hpy166II GTNNAC 78 78 . . 87 92 + Hpy178III* TCNNGA 88 90 . . 90 95 + XhoII RGATCY 90 94 . . 91 94 + DpnI GATC 92 92 . . 91 94 + BstKTI GATC 93 91 . . 91 94 + MboI GATC 90 94 . . 91 95 - BinI* GGATC 85 86 . . 93 97 - TspGWI ACGGA 83 81 . . 101 104 + TaiI ACGT 104 100 . . 101 104 + SetI ASST 104 100 . . 101 104 + MaeII ACGT 101 103 . . 108 111 + SetI ASST 111 107 . . 108 111 + CviJI RGCY 109 109 . . 108 111 + AluI AGCT 109 109 . . 116 121 + ApoI RAATTY 116 120 . . 117 120 + TspEI AATT 116 120 . . 120 125 + Hpy178III* TCNNGA 121 123 . . 135 138 + CviJI RGCY 136 136 . . 143 147 + DdeI CTNAG 143 146 . . 147 150 + CviJI RGCY 148 148 . . 170 176 + AarI CACCTGC 180 184 . . 171 174 + SetI ASST 174 170 . . 171 176 + BspMI ACCTGC 180 184 . . 175 185 + MwoI GCNNNNNNNGC 181 178 . . 177 181 - TspDTI ATGAA 167 165 . . 182 187 + PvuII CAGCTG 184 184 . . 182 187 + NspBII* CMGCKG 184 184 . . 183 186 + SetI ASST 186 182 . . 183 186 + CviJI RGCY 184 184 . . 183 186 + AluI AGCT 184 184 . . 189 194 + Hpy178III* TCNNGA 190 192 . . 201 205 + BccI CCATC 209 210 . . 205 208 + FatI CATG 204 208 . . 205 208 + NlaIII CATG 208 204 . . 205 208 + CviAII CATG 205 207 . . 209 212 + MnlI CCTC 219 218 . . 214 217 + MnlI CCTC 224 223 . . 212 217 - BseRI GAGGAG 203 201 . . 219 222 + SetI ASST 222 218 . . 219 224 + BspMI ACCTGC 228 232 . . 224 229 - Eco57MI CTGRAG 209 207 . . 229 232 + Csp6I GTAC 229 231 . . 229 232 + RsaI GTAC 230 230 . . 224 229 - Eco57I CTGAAG 209 207 . . 234 237 + SetI ASST 237 233 . . 235 238 + MnlI CCTC 245 244 . . 238 248 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 244 241 . . 238 248 + PflMI CCANNNNNTGG 244 241 . . 247 251 + BmgT120I GGNCC 248 249 . . 247 251 + AsuI* GGNCC 247 250 . . 248 251 + CviJI RGCY 249 249 . . 248 251 + HaeIII GGCC 249 249 . . 252 255 + Csp6I GTAC 252 254 . . 252 255 + RsaI GTAC 253 253 . . 249 253 - BceAI ACGGC 234 236 . . 257 266 + MslI CAYNNNNRTG 261 261 . . 257 266 + OliI CACNNNNGTG 261 261 . . 259 264 + EcoP15I CAGCAG 289 291 . . 261 266 + BtsI GCAGTG 268 266 . . 262 268 + TspRI CASTGNN 268 259 . . 265 268 + CviRI* TGCA 266 266 . . 267 270 + FatI CATG 266 270 . . 267 270 + NlaIII CATG 270 266 . . 267 270 + CviAII CATG 267 269 . . 285 288 + CviJI RGCY 286 286 . . 292 303 + BstXI CCANNNNNNTGG 299 295 . . 292 296 + BccI CCATC 300 301 . . 311 315 + TspGWI ACGGA 326 324 . . 316 321 + TaqII CACCCA 332 330 . . 319 323 + BccI CCATC 327 328 . . 327 331 + TfiI GAWTC 327 330 . . 327 331 + HinfI GANTC 327 330 . . 333 338 + Hpy166II GTNNAC 335 335 . . 333 338 + BssNAI GTATAC 335 335 . . 333 338 + AccI GTMKAC 334 336 . . 330 334 - TspGWI ACGGA 320 318 . . 339 342 + SetI ASST 342 338 . . 359 364 + TatI WGTACW 359 363 . . 360 363 + Csp6I GTAC 360 362 . . 360 363 + RsaI GTAC 361 361 . . 369 372 + SetI ASST 372 368 . . 370 374 + BssKI CCNGG 369 374 . . 370 374 + BseBI CCWGG 371 372 . . 370 375 + SecI* CCNNGG 370 374 . . 370 374 + ScrFI CCNGG 371 372 . . 370 374 + EcoRII CCWGG 369 374 . . 373 377 + BmgT120I GGNCC 374 375 . . 373 377 + AsuI* GGNCC 373 376 . . 374 377 + CviJI RGCY 375 375 . . 374 377 + HaeIII GGCC 375 375 . . 384 388 + Tsp4CI* ACNGT 386 385 . . 391 394 + AciI CCGC 391 393 . . 396 401 + BciVI GTATCC 407 406 . . 400 404 + BccI CCATC 408 409 . . 409 414 - MmeI TCCRAC 390 388 . . 418 421 + MnlI CCTC 428 427 . . 420 424 + Hpy188I TCNGA 422 421 . . 421 425 + DdeI CTNAG 421 424 . . 423 428 + SduI GDGCHC 427 423 . . 423 428 + HgiAI* GWGCWC 427 423 . . 421 425 - BspCNI CTCAG 413 411 . . 421 425 - BseMII CTCAG 412 410 . . 430 434 + BccI CCATC 438 439 . . 435 438 + SetI ASST 438 434 . . 436 446 + EcoNI CCTNNNNNAGG 440 441 . . 436 446 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 442 439 . . 437 441 + DdeI CTNAG 437 440 . . 433 437 - HphI GGTGA 425 424 . . 439 443 + PleI GAGTC 447 448 . . 439 443 + MlyI GAGTC 448 448 . . 439 443 + HinfI GANTC 439 442 . . 437 441 - BspCNI CTCAG 429 427 . . 437 441 - BseMII CTCAG 428 426 . . 444 447 + SetI ASST 447 443 . . 460 464 + TfiI GAWTC 460 463 . . 460 464 + HinfI GANTC 460 463 . . 460 470 + Hin4I GAYNNNNNVTC 451 446 483 478 462 466 - TspDTI ATGAA 452 450 . . 467 470 + MnlI CCTC 477 476 . . 467 473 + Bpu10I CCTNAGC 468 471 . . 467 473 + BbvCI CCTCAGC 468 471 . . 464 468 - FokI GGATG 450 454 . . 468 472 + DdeI CTNAG 468 471 . . 468 472 + BspCNI CTCAG 481 479 . . 468 472 + BseMII CTCAG 482 480 . . 464 468 - BseGI GGATG 463 461 . . 470 475 + NspBII* CMGCKG 472 472 . . 475 479 + HinfI GANTC 475 478 . . 472 475 - AciI CCGC 472 474 . . 478 482 + Hpy188I TCNGA 480 479 . . 475 479 - PleI GAGTC 469 470 . . 475 479 - MlyI GAGTC 469 469 . . 481 491 + Hin4I GAYNNNNNVTC 472 467 504 499 481 491 - Hin4I GAYNNNNNVTC 504 499 472 467 488 492 - FokI GGATG 474 478 . . 488 492 - BseGI GGATG 487 485 . . 506 510 + Hpy188I TCNGA 508 507 . . 522 527 + Hpy166II GTNNAC 524 524 . . 522 527 + HpaI GTTAAC 524 524 . . 522 527 + HindII GTYRAC 524 524 . . 523 526 + MseI TTAA 523 525 . . 526 529 + SetI ASST 529 525 . . 527 530 + MnlI CCTC 537 536 . . 531 534 + SetI ASST 534 530 . . 529 533 - HphI GGTGA 521 520 . . 547 550 + TspEI AATT 546 550 . . 554 557 + MseI TTAA 554 556 . . 568 573 + ApoI RAATTY 568 572 . . 569 572 + TspEI AATT 568 572 . . 583 586 + TaqI TCGA 583 585 . . 585 589 + TfiI GAWTC 585 588 . . 585 589 + HinfI GANTC 585 588 . . 603 608 + MmeI TCCRAC 628 626 . . 603 607 + Hpy188I TCNGA 605 604 . . 607 611 + Tsp4CI* ACNGT 609 608 . . 610 615 + Hpy166II GTNNAC 612 612 . . 614 618 + TspGWI ACGGA 629 627 . . 624 629 + SplI* CGTACG 624 628 . . 625 628 + Csp6I GTAC 625 627 . . 625 628 + RsaI GTAC 626 626 . . 627 630 + TaiI ACGT 630 626 . . 627 630 + SetI ASST 630 626 . . 627 630 + MaeII ACGT 627 629 . . 630 634 + Hpy188I TCNGA 632 631 . . 633 636 + DpnI GATC 634 634 . . 633 636 + BstKTI GATC 635 633 . . 633 636 + MboI GATC 632 636 . . 636 642 + TspRI CASTGNN 642 633 . . 644 648 + TspDTI ATGAA 659 657 . . 652 655 + SetI ASST 655 651 . . 653 657 + Hin4II* CCTTC 663 662 . . 650 654 - HphI GGTGA 642 641 . . 675 680 + SspI AATATT 677 677 . . 686 689 + MnlI CCTC 696 695 . . 692 695 + TspEI AATT 691 695 . . 699 702 + SetI ASST 702 698 . . 703 706 + SetI ASST 706 702 . . 704 708 + BssKI CCNGG 703 708 . . 704 708 + BseBI CCWGG 705 706 . . 704 709 + SecI* CCNNGG 704 708 . . 704 708 + ScrFI CCNGG 705 706 . . 704 708 + EcoRII CCWGG 703 708 . . 715 725 + Hin4I GAYNNNNNVTC 706 701 738 733 717 721 - FokI GGATG 703 707 . . 717 721 - BseGI GGATG 716 714 . . 715 725 - Hin4I GAYNNNNNVTC 738 733 706 701 724 728 - TspGWI ACGGA 714 712 . . 736 740 + TspGWI ACGGA 751 749 . . 739 744 + EcoRV GATATC 741 741 . . 743 748 + Hpy178III* TCNNGA 744 746 . . 743 748 + BspHI TCATGA 743 747 . . 744 747 + FatI CATG 743 747 . . 744 747 + NlaIII CATG 747 743 . . 744 747 + CviAII CATG 744 746 . . 745 749 + TspDTI ATGAA 760 758 . . 749 754 + ApoI RAATTY 749 753 . . 750 753 + TspEI AATT 749 753 . . 776 779 + CviRI* TGCA 777 777 . . 781 785 + Hpy188I TCNGA 783 782 . . 793 796 - MnlI CCTC 786 785 . . 808 812 + Tsp45I GTSAC 807 812 . . 808 812 + MaeIII GTNAC 807 812 . . 812 817 + SecI* CCNNGG 812 816 . . 813 817 + BssKI CCNGG 812 817 . . 813 817 + BseBI CCWGG 814 815 . . 813 817 + ScrFI CCNGG 814 815 . . 813 817 + EcoRII CCWGG 812 817 . . 819 824 + ApoI RAATTY 819 823 . . 820 823 + TspEI AATT 819 823 . . 824 827 + CviRI* TGCA 825 825 . . 838 843 + TatI WGTACW 838 842 . . 839 844 + Hpy166II GTNNAC 841 841 . . 839 842 + Csp6I GTAC 839 841 . . 839 842 + RsaI GTAC 840 840 . . 842 848 + AarI CACCTGC 852 856 . . 843 846 + SetI ASST 846 842 . . 843 848 + BspMI ACCTGC 852 856 . . 845 850 + PstI CTGCAG 849 845 . . 845 850 + SfeI* CTRYAG 845 849 . . 846 849 + CviRI* TGCA 847 847 . . 851 856 + EcoT22I ATGCAT 855 851 . . 852 855 + CviRI* TGCA 853 853 . . 850 854 - SfaNI GCATC 840 844 . . 868 872 + Tsp45I GTSAC 867 872 . . 868 872 + MaeIII GTNAC 867 872 . . 881 884 + TaqI TCGA 881 883 . . 902 907 - BsmI GAATGC 902 900 . . 905 909 - TspDTI ATGAA 895 893 . . 920 923 + SetI ASST 923 919 . . 925 930 + NspI RCATGY 929 925 . . 925 930 + Cac8I GCNNGC 927 927 . . 925 930 + SphI GCATGC 929 925 . . 926 929 + FatI CATG 925 929 . . 926 929 + NlaIII CATG 929 925 . . 926 929 + CviAII CATG 926 928 . . 932 935 + TspEI AATT 931 935 . . 933 938 + VspI ATTAAT 934 936 . . 934 937 + MseI TTAA 934 936 . . 936 939 + TspEI AATT 935 939 . . 945 948 + SetI ASST 948 944 . . 944 947 - MnlI CCTC 937 936 . . 964 969 + ApoI RAATTY 964 968 . . 965 968 + TspEI AATT 964 968 . . 979 984 + AflIII ACRYGT 979 983 . . 980 985 + BtrI CACGTC 982 982 . . 981 984 + TaiI ACGT 984 980 . . 981 984 + SetI ASST 984 980 . . 981 984 + MaeII ACGT 981 983 . . 987 990 + TaqI TCGA 987 989 . . 1003 1007 + Tsp4CI* ACNGT 1005 1004 . . 1004 1012 + AlwNI CAGNNNCTG 1009 1006 . . 1014 1018 + Tsp4CI* ACNGT 1016 1015 . . 1020 1024 + DdeI CTNAG 1020 1023 . . 1024 1029 + EcoRV GATATC 1026 1026 . . 1030 1033 + FatI CATG 1029 1033 . . 1030 1033 + NlaIII CATG 1033 1029 . . 1030 1033 + CviAII CATG 1030 1032 . . 1040 1044 + TspDTI ATGAA 1055 1053 . . 1042 1046 + MboII GAAGA 1054 1053 . . 1054 1058 + BinI* GGATC 1062 1063 . . 1055 1058 + DpnI GATC 1056 1056 . . 1055 1058 + BstKTI GATC 1057 1055 . . 1055 1058 + MboI GATC 1054 1058 . . 1057 1060 + TaqI TCGA 1057 1059 . . 1057 1062 + Hpy178III* TCNNGA 1058 1060 . . 1071 1074 + SetI ASST 1074 1070 . . 1075 1078 + TspEI AATT 1074 1078 . . 1089 1093 + Hpy188I TCNGA 1091 1090 . . 1101 1105 + MboII GAAGA 1113 1112 . . 1108 1112 + TfiI GAWTC 1108 1111 . . 1108 1112 + HinfI GANTC 1108 1111 . . 1115 1119 + BlsI GCNGC 1117 1116 . . 1115 1119 + BisI GCNGC 1116 1117 . . 1115 1119 + BbvI GCAGC 1127 1131 . . 1115 1119 + TseI GCWGC 1115 1118 . . 1117 1120 + SetI ASST 1120 1116 . . 1117 1120 + CviJI RGCY 1118 1118 . . 1117 1120 + AluI AGCT 1118 1118 . . 1149 1152 + SetI ASST 1152 1148 . . 1149 1152 + CviJI RGCY 1150 1150 . . 1149 1152 + AluI AGCT 1150 1150 . . 1152 1156 + Hpy188I TCNGA 1154 1153 . . 1155 1159 + TfiI GAWTC 1155 1158 . . 1155 1159 + HinfI GANTC 1155 1158 . . 1159 1162 + MnlI CCTC 1169 1168 . . 1174 1177 + TspEI AATT 1173 1177 . . 1176 1181 + AsuII TTCGAA 1177 1179 . . 1177 1180 + TaqI TCGA 1177 1179 . . 1183 1186 + TaqI TCGA 1183 1185 . . 1191 1194 + CviJI RGCY 1192 1192 . . 1193 1197 + BssKI CCNGG 1192 1197 . . 1193 1197 + BseBI CCWGG 1194 1195 . . 1193 1198 + SecI* CCNNGG 1193 1197 . . 1193 1197 + ScrFI CCNGG 1194 1195 . . 1193 1197 + EcoRII CCWGG 1192 1197 . . 1196 1201 + SduI GDGCHC 1200 1196 . . 1196 1201 + HgiJII* GRGCYC 1200 1196 . . 1197 1200 + CviJI RGCY 1198 1198 . . 1201 1212 + TstI CACNNNNNNTCC 1192 1187 1224 1219 1207 1212 + BciVI GTATCC 1218 1217 . . 1228 1233 + GsaI CCCAGC 1232 1228 . . 1228 1233 + BseYI CCCAGC 1228 1232 . . 1234 1238 + TspGWI ACGGA 1249 1247 . . 1243 1247 + TfiI GAWTC 1243 1246 . . 1243 1247 + HinfI GANTC 1243 1246 . . 1247 1251 + BccI CCATC 1255 1256 . . 1266 1277 + BdaI TGANNNNNNTCA 1255 1253 1289 1287 1267 1276 + XmnI GAANNNNTTC 1271 1271 . . 1272 1276 + TfiI GAWTC 1272 1275 . . 1272 1276 + HinfI GANTC 1272 1275 . . 1276 1281 + MfeI CAATTG 1276 1280 . . 1277 1280 + TspEI AATT 1276 1280 . . 1266 1277 - BdaI TGANNNNNNTCA 1289 1287 1255 1253 1295 1298 + SetI ASST 1298 1294 . . 1296 1300 + Hin4II* CCTTC 1306 1305 . . 1298 1302 - TspDTI ATGAA 1288 1286 . . 1303 1307 + DdeI CTNAG 1303 1306 . . 1307 1310 + CviJI RGCY 1308 1308 . . 1307 1310 + HaeIII GGCC 1308 1308 . . 1322 1326 + TfiI GAWTC 1322 1325 . . 1322 1326 + HinfI GANTC 1322 1325 . . 1326 1331 + SfeI* CTRYAG 1326 1330 . . 1328 1332 + Tsp4CI* ACNGT 1330 1329 . . 1346 1355 + MslI CAYNNNNRTG 1350 1350 . . 1349 1353 + Hpy188I TCNGA 1351 1350 . . 1356 1360 + TspDTI ATGAA 1371 1369 . . 1363 1368 + SecI* CCNNGG 1363 1367 . . 1364 1368 + BssKI CCNGG 1363 1368 . . 1364 1368 + BseBI CCWGG 1365 1366 . . 1364 1368 + ScrFI CCNGG 1365 1366 . . 1364 1368 + EcoRII CCWGG 1363 1368 . . 1371 1374 + SetI ASST 1374 1370 . . 1372 1375 + MnlI CCTC 1382 1381 . . 1375 1379 + Hin4II* CCTTC 1385 1384 . . 1378 1383 + Hpy178III* TCNNGA 1379 1381 . . 1380 1383 + TaqI TCGA 1380 1382 . . 1382 1386 + TfiI GAWTC 1382 1385 . . 1382 1386 + HinfI GANTC 1382 1385 . . 1385 1390 + Hpy178III* TCNNGA 1386 1388 . . 1391 1395 + SfaNI GCATC 1400 1404 . . 1394 1399 + Hpy178III* TCNNGA 1395 1397 . . 1404 1409 + PsiI TTATAA 1406 1406 . . 1409 1414 + XhoII RGATCY 1409 1413 . . 1409 1414 + BglII AGATCT 1409 1413 . . 1410 1413 + DpnI GATC 1411 1411 . . 1410 1413 + BstKTI GATC 1412 1410 . . 1410 1413 + MboI GATC 1409 1413 . . 1429 1433 + DdeI CTNAG 1429 1432 . . 1429 1433 + BspCNI CTCAG 1442 1440 . . 1429 1433 + BseMII CTCAG 1443 1441 . . 1433 1437 + SfaNI GCATC 1442 1446 . . 1444 1449 + Hpy178III* TCNNGA 1445 1447 . . 1455 1458 + TaiI ACGT 1458 1454 . . 1455 1458 + SetI ASST 1458 1454 . . 1455 1458 + MaeII ACGT 1455 1457 . . 1463 1467 - SfaNI GCATC 1453 1457 . . 1486 1489 + TspEI AATT 1485 1489 . . 1488 1491 + MseI TTAA 1488 1490 . . 1499 1505 + BstEII GGTNACC 1499 1504 . . 1499 1503 + HphI GGTGA 1511 1510 . . 1500 1504 + Tsp45I GTSAC 1499 1504 . . 1500 1504 + MaeIII GTNAC 1499 1504 . . 1503 1506 + SetI ASST 1506 1502 . . 1509 1512 + TspEI AATT 1508 1512 . . 1518 1524 + PfoI TCCNGGA 1518 1523 . . 1519 1523 + BssKI CCNGG 1518 1523 . . 1519 1523 + BseBI CCWGG 1520 1521 . . 1519 1523 + ScrFI CCNGG 1520 1521 . . 1519 1523 + EcoRII CCWGG 1518 1523 . . 1545 1548 + SetI ASST 1548 1544 . . 1551 1554 + CviRI* TGCA 1552 1552 . . 1567 1570 + CviJI RGCY 1568 1568 . . 1580 1584 + DdeI CTNAG 1580 1583 . . 1580 1584 + BspCNI CTCAG 1593 1591 . . 1580 1584 + BseMII CTCAG 1594 1592 . . 1590 1594 + TspDTI ATGAA 1605 1603 . . 1593 1596 + TspEI AATT 1592 1596 . . 1597 1600 + CviJI RGCY 1598 1598 . . 1598 1602 + BlsI GCNGC 1600 1599 . . 1598 1602 + BisI GCNGC 1599 1600 . . 1598 1602 + TseI GCWGC 1598 1601 . . 1599 1604 + PstI CTGCAG 1603 1599 . . 1599 1604 + SfeI* CTRYAG 1599 1603 . . 1600 1603 + CviRI* TGCA 1601 1601 . . 1598 1602 - BbvI GCAGC 1585 1589 . . 1607 1612 + EcoRV GATATC 1609 1609 . . 1616 1621 + NspI RCATGY 1620 1616 . . 1616 1621 + Cac8I GCNNGC 1618 1618 . . 1616 1621 + SphI GCATGC 1620 1616 . . 1617 1620 + FatI CATG 1616 1620 . . 1617 1620 + NlaIII CATG 1620 1616 . . 1617 1620 + CviAII CATG 1617 1619 . . 1632 1635 + TaiI ACGT 1635 1631 . . 1632 1635 + SetI ASST 1635 1631 . . 1632 1635 + MaeII ACGT 1632 1634 . . 1636 1640 + DdeI CTNAG 1636 1639 . . 1642 1646 + Tsp4CI* ACNGT 1644 1643 . . 1646 1650 + Hpy188I TCNGA 1648 1647 . . 1650 1654 + BceAI ACGGC 1666 1668 . . 1654 1660 + TspRI CASTGNN 1660 1651 . . 1655 1659 + Tsp4CI* ACNGT 1657 1656 . . 1657 1662 + TatI WGTACW 1657 1661 . . 1658 1661 + Csp6I GTAC 1658 1660 . . 1658 1661 + RsaI GTAC 1659 1659 . . 1663 1666 + CviRI* TGCA 1664 1664 . . 1666 1669 + SetI ASST 1669 1665 . . 1671 1676 + Hpy178III* TCNNGA 1672 1674 . . 1683 1687 - BsmAI GTCTC 1677 1681 . . 1692 1696 + BsrI ACTGG 1697 1695 . . 1692 1697 + BfiI ACTGGG 1702 1701 . . 1707 1712 + TatI WGTACW 1707 1711 . . 1707 1712 + ScaI AGTACT 1709 1709 . . 1708 1711 + Csp6I GTAC 1708 1710 . . 1708 1711 + RsaI GTAC 1709 1709 . . 1718 1722 + BccI CCATC 1726 1727 . . 1733 1736 + Csp6I GTAC 1733 1735 . . 1733 1736 + RsaI GTAC 1734 1734 . . 1730 1734 - TspGWI ACGGA 1720 1718 . . 1740 1744 + BccI CCATC 1748 1749 . . 1754 1763 + MslI CAYNNNNRTG 1758 1758 . . 1766 1771 + TatI WGTACW 1766 1770 . . 1767 1772 + Hpy166II GTNNAC 1769 1769 . . 1767 1770 + Csp6I GTAC 1767 1769 . . 1767 1770 + RsaI GTAC 1768 1768 . . 1790 1794 - TspDTI ATGAA 1780 1778 . . 1794 1798 - TspDTI ATGAA 1784 1782 . . 1798 1801 + TaqI TCGA 1798 1800 . . 1800 1805 + BsmI GAATGC 1806 1804 . . 1804 1809 + Cac8I GCNNGC 1806 1806 . . 1807 1812 + MstI* TGCGCA 1809 1809 . . 1808 1811 + Hin6I GCGC 1808 1810 . . 1808 1811 + GlaI GCGC 1809 1809 . . 1808 1811 + HhaI GCGC 1810 1808 . . 1810 1815 + NspI RCATGY 1814 1810 . . 1810 1815 + Cac8I GCNNGC 1812 1812 . . 1810 1815 + SphI GCATGC 1814 1810 . . 1810 1821 + AlfI GCANNNNNNTGC 1799 1797 1833 1831 1811 1820 + MslI CAYNNNNRTG 1815 1815 . . 1811 1814 + FatI CATG 1810 1814 . . 1811 1814 + NlaIII CATG 1814 1810 . . 1811 1814 + CviAII CATG 1811 1813 . . 1819 1822 + CviRI* TGCA 1820 1820 . . 1810 1821 - AlfI GCANNNNNNTGC 1833 1831 1799 1797 1828 1831 + TspEI AATT 1827 1831 . . 1831 1834 + TaqI TCGA 1831 1833 . . 1842 1845 + MseI TTAA 1842 1844 . . 1854 1858 + BccI CCATC 1862 1863 . . 1858 1863 + BsaAI YACGTR 1860 1860 . . 1859 1862 + TaiI ACGT 1862 1858 . . 1859 1862 + SetI ASST 1862 1858 . . 1859 1862 + MaeII ACGT 1859 1861 . . 1866 1869 + MseI TTAA 1866 1868 . . 1871 1875 + TfiI GAWTC 1871 1874 . . 1871 1875 + HinfI GANTC 1871 1874 . . 1874 1878 + Hpy188I TCNGA 1876 1875 . . 1880 1885 + SalI GTCGAC 1880 1884 . . 1880 1885 + Hpy166II GTNNAC 1882 1882 . . 1880 1885 + HindII GTYRAC 1882 1882 . . 1880 1885 + AccI GTMKAC 1881 1883 . . 1881 1884 + TaqI TCGA 1881 1883 . . 1884 1888 + BsrI ACTGG 1889 1887 . . 1890 1893 + MaeI CTAG 1890 1892 . . 1912 1917 + Hpy178III* TCNNGA 1913 1915 . . 1922 1925 + MseI TTAA 1922 1924 . . 1957 1960 + SetI ASST 1960 1956 . . 1959 1964 + Hpy166II GTNNAC 1961 1961 . . 1961 1966 + Hpy178III* TCNNGA 1962 1964 . . 1978 1983 + ApoI RAATTY 1978 1982 . . 1979 1982 + TspEI AATT 1978 1982 . . 1981 1985 - TspDTI ATGAA 1971 1969 . . 1988 1997 + XmnI GAANNNNTTC 1992 1992 . . 2001 2004 + SetI ASST 2004 2000 . . 2021 2025 + BmgT120I GGNCC 2022 2023 . . 2021 2025 + AvaII GGWCC 2021 2024 . . 2021 2025 + AsuI* GGNCC 2021 2024 . . 2027 2032 + Hpy166II GTNNAC 2029 2029 . . 2024 2028 - BsrI ACTGG 2024 2022 . . 2034 2037 + SetI ASST 2037 2033 . . 2046 2051 + Hpy166II GTNNAC 2048 2048 . . 2046 2051 + SduI GDGCHC 2050 2046 . . 2046 2051 + BseSI GKGCMC 2050 2046 . . 2046 2051 + ApaLI GTGCAC 2046 2050 . . 2046 2051 + HgiAI* GWGCWC 2050 2046 . . 2047 2050 + CviRI* TGCA 2048 2048 . . 2051 2055 + BccI CCATC 2059 2060 . . 2052 2056 - FokI GGATG 2038 2042 . . 2052 2056 - BseGI GGATG 2051 2049 . . 2060 2064 - TspDTI ATGAA 2050 2048 . . 2078 2082 - BsmAI GTCTC 2072 2076 . . 2087 2092 + ApoI RAATTY 2087 2091 . . 2088 2091 + TspEI AATT 2087 2091 . . 2091 2095 - TspGWI ACGGA 2081 2079 . . 2113 2118 + McrI* CGRYCG 2116 2114 . . 2115 2119 + Tsp4CI* ACNGT 2117 2116 . . 2116 2126 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2122 2119 . . 2117 2121 + Hpy99I CGWCG 2121 2116 . . 2119 2124 + Hpy178III* TCNNGA 2120 2122 . . 2119 2124 + NruI TCGCGA 2121 2121 . . 2120 2123 + FnuDII* CGCG 2121 2121 . . 2123 2126 - MnlI CCTC 2116 2115 . . 2126 2130 + HinfI GANTC 2126 2129 . . 2126 2130 - PleI GAGTC 2120 2121 . . 2126 2130 - MlyI GAGTC 2120 2120 . . 2134 2137 + MnlI CCTC 2144 2143 . . 2136 2139 + TaqI TCGA 2136 2138 . . 2156 2159 + MaeI CTAG 2156 2158 . . 2158 2161 + SetI ASST 2161 2157 . . 2158 2161 + CviJI RGCY 2159 2159 . . 2158 2161 + AluI AGCT 2159 2159 . . 2166 2169 + MseI TTAA 2166 2168 . . 2173 2183 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2179 2176 . . 2173 2177 - BsrI ACTGG 2173 2171 . . 2182 2185 + CviJI RGCY 2183 2183 . . 2182 2185 + HaeIII GGCC 2183 2183 . . 2185 2191 + TspRI CASTGNN 2191 2182 . . 2184 2188 - BsrI ACTGG 2184 2182 . . 2191 2195 + DdeI CTNAG 2191 2194 . . 2206 2210 + BmgT120I GGNCC 2207 2208 . . 2206 2210 + AvaII GGWCC 2206 2209 . . 2206 2210 + AsuI* GGNCC 2206 2209 . . 2208 2212 + Tsp4CI* ACNGT 2210 2209 . . 2209 2214 + DsaI* CCRYGG 2209 2213 . . 2209 2214 + SecI* CCNNGG 2209 2213 . . 2216 2220 + Hpy188I TCNGA 2218 2217 . . 2217 2221 + DdeI CTNAG 2217 2220 . . 2221 2226 + Hpy166II GTNNAC 2223 2223 . . 2221 2226 + BssNAI GTATAC 2223 2223 . . 2217 2221 - BspCNI CTCAG 2209 2207 . . 2217 2221 - BseMII CTCAG 2208 2206 . . 2221 2226 + AccI GTMKAC 2222 2224 . . 2243 2248 + ApoI RAATTY 2243 2247 . . 2244 2247 + TspEI AATT 2243 2247 . . 2271 2274 + FatI CATG 2270 2274 . . 2271 2274 + NlaIII CATG 2274 2270 . . 2271 2274 + CviAII CATG 2271 2273 . . 2286 2291 + NspBII* CMGCKG 2288 2288 . . 2291 2295 + TfiI GAWTC 2291 2294 . . 2291 2295 + HinfI GANTC 2291 2294 . . 2288 2291 - AciI CCGC 2288 2290 . . 2294 2299 + Hpy178III* TCNNGA 2295 2297 . . 2295 2300 + BmeT110I CYCGRG 2296 2298 . . 2295 2300 + AvaI CYCGRG 2295 2299 . . 2298 2303 + SduI GDGCHC 2302 2298 . . 2298 2303 + HgiAI* GWGCWC 2302 2298 . . 2303 2306 + FatI CATG 2302 2306 . . 2303 2306 + NlaIII CATG 2306 2302 . . 2303 2306 + CviAII CATG 2303 2305 . . 2307 2311 + PleI GAGTC 2315 2316 . . 2307 2311 + MlyI GAGTC 2316 2316 . . 2307 2311 + HinfI GANTC 2307 2310 . . 2317 2321 + BceAI ACGGC 2333 2335 . . 2319 2322 + CviJI RGCY 2320 2320 . . 2325 2329 + Tsp4CI* ACNGT 2327 2326 . . 2328 2331 + Csp6I GTAC 2328 2330 . . 2328 2331 + RsaI GTAC 2329 2329 . . 2330 2333 + SetI ASST 2333 2329 . . 2349 2352 + Csp6I GTAC 2349 2351 . . 2349 2352 + RsaI GTAC 2350 2350 . . 2346 2350 - BceAI ACGGC 2331 2333 . . 2358 2361 + CviRI* TGCA 2359 2359 . . 2359 2364 + BsrDI GCAATG 2366 2364 . . 2370 2375 + Hpy166II GTNNAC 2372 2372 . . 2395 2398 + CviRI* TGCA 2396 2396 . . 2400 2403 + TaqI TCGA 2400 2402 . . 2402 2407 + ApoI RAATTY 2402 2406 . . 2403 2406 + TspEI AATT 2402 2406 . . 2422 2427 + ApoI RAATTY 2422 2426 . . 2423 2426 + TspEI AATT 2422 2426 . . 2429 2432 + MaeI CTAG 2429 2431 . . 2431 2434 + SetI ASST 2434 2430 . . 2431 2434 + CviJI RGCY 2432 2432 . . 2431 2434 + AluI AGCT 2432 2432 . . 2437 2440 + SetI ASST 2440 2436 . . 2435 2439 - HphI GGTGA 2427 2426 . . 2455 2458 + CviRI* TGCA 2456 2456 . . 2464 2469 + NspI RCATGY 2468 2464 . . 2465 2468 + FatI CATG 2464 2468 . . 2465 2468 + NlaIII CATG 2468 2464 . . 2465 2468 + CviAII CATG 2465 2467 . . 2468 2478 + MwoI GCNNNNNNNGC 2474 2471 . . 2468 2473 + Cac8I GCNNGC 2470 2470 . . 2471 2474 + CviJI RGCY 2472 2472 . . 2481 2491 + Hin4I GAYNNNNNVTC 2472 2467 2504 2499 2486 2491 + EcoRV GATATC 2488 2488 . . 2481 2491 - Hin4I GAYNNNNNVTC 2504 2499 2472 2467 2492 2497 + TatI WGTACW 2492 2496 . . 2492 2497 + ScaI AGTACT 2494 2494 . . 2493 2496 + Csp6I GTAC 2493 2495 . . 2493 2496 + RsaI GTAC 2494 2494 . . 2500 2504 + MaeIII GTNAC 2499 2504 . . 2503 2506 + SetI ASST 2506 2502 . . 2511 2516 + Hpy166II GTNNAC 2513 2513 . . 2511 2516 + HindII GTYRAC 2513 2513 . . 2508 2513 - TaqII GACCGA 2498 2496 . . 2515 2518 + SetI ASST 2518 2514 . . 2530 2535 + BclI TGATCA 2530 2534 . . 2531 2534 + DpnI GATC 2532 2532 . . 2531 2534 + BstKTI GATC 2533 2531 . . 2531 2534 + MboI GATC 2530 2534 . . 2538 2548 + BsaXI ACNNNNNCTCC 2528 2525 2558 2555 2555 2564 + MslI CAYNNNNRTG 2559 2559 . . 2558 2561 + MnlI CCTC 2568 2567 . . 2555 2559 - FokI GGATG 2541 2545 . . 2555 2559 - BseGI GGATG 2554 2552 . . 2559 2564 - BsiI* CACGAG 2559 2563 . . 2565 2569 + SfaNI GCATC 2574 2578 . . 2565 2575 + MwoI GCNNNNNNNGC 2571 2568 . . 2569 2574 + SecI* CCNNGG 2569 2573 . . 2566 2570 - FokI GGATG 2552 2556 . . 2570 2574 + BssKI CCNGG 2569 2574 . . 2566 2570 - BseGI GGATG 2565 2563 . . 2570 2574 + BseBI CCWGG 2571 2572 . . 2570 2574 + ScrFI CCNGG 2571 2572 . . 2570 2574 + EcoRII CCWGG 2569 2574 . . 2573 2576 + CviJI RGCY 2574 2574 . . 2585 2589 - FokI GGATG 2571 2575 . . 2589 2594 + Esp3I CGTCTC 2595 2599 . . 2585 2589 - BseGI GGATG 2584 2582 . . 2590 2594 + BsmAI GTCTC 2595 2599 . . 2587 2591 - TspGWI ACGGA 2577 2575 . . 2591 2596 + Hpy178III* TCNNGA 2592 2594 . . 2593 2596 + TaqI TCGA 2593 2595 . . 2607 2617 + Hin4I GAYNNNNNVTC 2598 2593 2630 2625 2607 2617 - Hin4I GAYNNNNNVTC 2630 2625 2598 2593 2620 2624 - MboII GAAGA 2612 2611 . . 2624 2628 + BccI CCATC 2632 2633 . . 2625 2629 - FokI GGATG 2611 2615 . . 2625 2629 - BseGI GGATG 2624 2622 . . 2630 2633 + MseI TTAA 2630 2632 . . 2635 2639 + MboII GAAGA 2647 2646 . . 2635 2640 + BbvII* GAAGAC 2642 2646 . . 2639 2643 + Tsp4CI* ACNGT 2641 2640 . . 2665 2669 - MboII GAAGA 2657 2656 . . 2666 2671 - Eco57MI CTGRAG 2651 2649 . . 2666 2671 - Eco57I CTGAAG 2651 2649 . . 2678 2682 + TfiI GAWTC 2678 2681 . . 2678 2682 + HinfI GANTC 2678 2681 . . 2681 2686 + Hpy178III* TCNNGA 2682 2684 . . 2690 2693 + DpnI GATC 2691 2691 . . 2690 2693 + BstKTI GATC 2692 2690 . . 2690 2693 + MboI GATC 2689 2693 . . 2694 2697 + TspEI AATT 2693 2697 . . 2699 2702 + TspEI AATT 2698 2702 . . 2704 2708 + Hpy99I CGWCG 2708 2703 . . 2705 2709 + HgaI GACGC 2714 2719 . . 2718 2721 + TaqI TCGA 2718 2720 . . 2721 2725 + TspDTI ATGAA 2736 2734 . . 2723 2727 + MboII GAAGA 2735 2734 . . 2723 2728 + BbvII* GAAGAC 2730 2734 . . 2729 2732 + MseI TTAA 2729 2731 . . 2733 2737 + Tsp4CI* ACNGT 2735 2734 . . 2738 2741 + MseI TTAA 2738 2740 . . 2759 2763 - TspDTI ATGAA 2749 2747 . . 2761 2766 - BsrDI GCAATG 2760 2758 . . 2765 2769 - HgaI GACGC 2754 2759 . . 2775 2780 + XhoII RGATCY 2775 2779 . . 2776 2779 + DpnI GATC 2777 2777 . . 2776 2779 + BstKTI GATC 2778 2776 . . 2776 2779 + MboI GATC 2775 2779 . . 2776 2780 - BinI* GGATC 2770 2771 . . 2783 2787 + TfiI GAWTC 2783 2786 . . 2783 2787 + HinfI GANTC 2783 2786 . . 2792 2795 + DpnI GATC 2793 2793 . . 2792 2795 + BstKTI GATC 2794 2792 . . 2792 2795 + MboI GATC 2791 2795 . . 2796 2799 + MseI TTAA 2796 2798 . . 2804 2808 + TfiI GAWTC 2804 2807 . . 2804 2808 + HinfI GANTC 2804 2807 . . 2807 2811 + Hpy188I TCNGA 2809 2808 . . 2813 2816 + FatI CATG 2812 2816 . . 2813 2816 + NlaIII CATG 2816 2812 . . 2813 2816 + CviAII CATG 2813 2815 . . 2816 2826 + Hin4I GAYNNNNNVTC 2807 2802 2839 2834 2825 2830 + MmeI TCCRAC 2850 2848 . . 2825 2829 + Hpy188I TCNGA 2827 2826 . . 2816 2826 - Hin4I GAYNNNNNVTC 2839 2834 2807 2802 2842 2847 + Hpy178III* TCNNGA 2843 2845 . . 2843 2849 + Bpu10I CCTNAGC 2844 2847 . . 2840 2844 - FokI GGATG 2826 2830 . . 2844 2848 + DdeI CTNAG 2844 2847 . . 2840 2844 - BseGI GGATG 2839 2837 . . 2844 2848 - BspCNI CTCAG 2836 2834 . . 2844 2848 - BseMII CTCAG 2835 2833 . . 2872 2875 + SetI ASST 2875 2871 . . 2872 2875 + CviJI RGCY 2873 2873 . . 2872 2875 + AluI AGCT 2873 2873 . . 2878 2882 + PleI GAGTC 2886 2887 . . 2878 2882 + MlyI GAGTC 2887 2887 . . 2878 2882 + HinfI GANTC 2878 2881 . . 2881 2886 + MmeI TCCRAC 2906 2904 . . 2888 2892 + TfiI GAWTC 2888 2891 . . 2888 2892 + HinfI GANTC 2888 2891 . . 2896 2899 + SetI ASST 2899 2895 . . 2897 2900 + MnlI CCTC 2907 2906 . . 2902 2907 + Hpy166II GTNNAC 2904 2904 . . 2902 2907 + HindII GTYRAC 2904 2904 . . 2899 2903 - TspGWI ACGGA 2889 2887 . . 2913 2918 + Eco57MI CTGRAG 2934 2932 . . 2913 2918 + Eco57I CTGAAG 2934 2932 . . 2915 2919 + MboII GAAGA 2927 2926 . . 2918 2922 + TfiI GAWTC 2918 2921 . . 2918 2922 + HinfI GANTC 2918 2921 . . 2920 2925 + AsuII TTCGAA 2921 2923 . . 2921 2924 + TaqI TCGA 2921 2923 . . 2926 2929 + TaiI ACGT 2929 2925 . . 2926 2929 + SetI ASST 2929 2925 . . 2926 2929 + MaeII ACGT 2926 2928 . . 2926 2931 + AflIII ACRYGT 2926 2930 . . 2942 2947 + SspI AATATT 2944 2944 . . 2948 2951 + FnuDII* CGCG 2949 2949 . . 2949 2952 + Hin6I GCGC 2949 2951 . . 2949 2952 + GlaI GCGC 2950 2950 . . 2949 2952 + HhaI GCGC 2951 2949 . . 2952 2957 + TaqII CACCCA 2968 2966 . . 2963 2968 + Hpy166II GTNNAC 2965 2965 . . 2963 2968 + HindII GTYRAC 2965 2965 . . 2978 2982 + Hpy188I TCNGA 2980 2979 . . 2981 2985 + TfiI GAWTC 2981 2984 . . 2981 2985 + HinfI GANTC 2981 2984 . . 2987 2992 + SspI AATATT 2989 2989 . . 2992 2996 - MboII GAAGA 2984 2983 . . 2996 3000 + BccI CCATC 3004 3005 . . 3004 3008 + MboII GAAGA 3016 3015 . . 3008 3013 + XhoII RGATCY 3008 3012 . . 3008 3013 + BglII AGATCT 3008 3012 . . 3009 3012 + DpnI GATC 3010 3010 . . 3009 3012 + BstKTI GATC 3011 3009 . . 3004 3009 - Ksp632I* CTCTTC 2999 3002 . . 3009 3012 + MboI GATC 3008 3012 . . 3012 3015 + MaeI CTAG 3012 3014 . . 3024 3029 + ApoI RAATTY 3024 3028 . . 3025 3028 + TspEI AATT 3024 3028 . . 3036 3039 + TaqI TCGA 3036 3038 . . 3036 3041 + Hpy178III* TCNNGA 3037 3039 . . 3042 3045 + Csp6I GTAC 3042 3044 . . 3042 3045 + RsaI GTAC 3043 3043 . . 3044 3049 + Cfr10I RCCGGY 3044 3048 . . 3044 3049 + BetI* WCCGGW 3044 3048 . . 3044 3049 + AgeI ACCGGT 3044 3048 . . 3045 3048 + HpaII CCGG 3045 3047 . . 3040 3051 - PpiI GAACNNNNNCTC 3063 3058 3031 3026 3059 3064 + EcoT22I ATGCAT 3063 3059 . . 3060 3063 + CviRI* TGCA 3061 3061 . . 3066 3069 + TspEI AATT 3065 3069 . . 3068 3071 + MseI TTAA 3068 3070 . . 3091 3094 + FatI CATG 3090 3094 . . 3091 3094 + NlaIII CATG 3094 3090 . . 3091 3094 + CviAII CATG 3091 3093 . . 3094 3098 - BslFI GGGAC 3079 3083 . . 3110 3113 + FatI CATG 3109 3113 . . 3110 3113 + NlaIII CATG 3113 3109 . . 3110 3113 + CviAII CATG 3110 3112 . . 3113 3117 + PleI GAGTC 3121 3122 . . 3113 3117 + MlyI GAGTC 3122 3122 . . 3113 3117 + HinfI GANTC 3113 3116 . . 3117 3121 + Hpy99I CGWCG 3121 3116 . . 3120 3125 + SplI* CGTACG 3120 3124 . . 3121 3124 + Csp6I GTAC 3121 3123 . . 3121 3124 + RsaI GTAC 3122 3122 . . 3126 3130 - BsrI ACTGG 3126 3124 . . 3144 3148 + Hpy188I TCNGA 3146 3145 . . 3151 3155 + DdeI CTNAG 3151 3154 . . 3151 3155 + BspCNI CTCAG 3164 3162 . . 3151 3155 + BseMII CTCAG 3165 3163 . . 3152 3156 + Hpy188I TCNGA 3154 3153 . . 3155 3159 + HinfI GANTC 3155 3158 . . 3155 3159 - PleI GAGTC 3149 3150 . . 3155 3159 - MlyI GAGTC 3149 3149 . . 3160 3163 + Csp6I GTAC 3160 3162 . . 3160 3163 + RsaI GTAC 3161 3161 . . 3162 3166 + Tsp4CI* ACNGT 3164 3163 . . 3163 3169 + TspRI CASTGNN 3169 3160 . . 3165 3169 + Tsp45I GTSAC 3164 3169 . . 3165 3169 + MaeIII GTNAC 3164 3169 . . 3172 3183 + BdaI TGANNNNNNTCA 3161 3159 3195 3193 3173 3177 - BsmAI GTCTC 3167 3171 . . 3172 3183 - BdaI TGANNNNNNTCA 3195 3193 3161 3159 3185 3195 + BaeI ACNNNNGTAYC 3174 3169 3207 3202 3189 3192 + TaiI ACGT 3192 3188 . . 3189 3192 + SetI ASST 3192 3188 . . 3189 3192 + MaeII ACGT 3189 3191 . . 3191 3194 + Csp6I GTAC 3191 3193 . . 3191 3194 + RsaI GTAC 3192 3192 . . 3204 3207 + Csp6I GTAC 3204 3206 . . 3204 3207 + RsaI GTAC 3205 3205 . . 3201 3205 - BsrI ACTGG 3201 3199 . . 3212 3217 + KpnI GGTACC 3216 3212 . . 3212 3217 + NlaIV GGNNCC 3214 3214 . . 3212 3217 + HgiCI* GGYRCC 3212 3216 . . 3212 3217 + Acc65I GGTACC 3212 3216 . . 3213 3216 + Csp6I GTAC 3213 3215 . . 3213 3216 + RsaI GTAC 3214 3214 . . 3227 3231 + Tsp4CI* ACNGT 3229 3228 . . 3233 3236 + AciI CCGC 3233 3235 . . 3255 3259 + DdeI CTNAG 3255 3258 . . 3251 3255 - BsmAI GTCTC 3245 3249 . . 3255 3259 - BspCNI CTCAG 3247 3245 . . 3255 3259 - BseMII CTCAG 3246 3244 . . 3273 3277 + Tsp4CI* ACNGT 3275 3274 . . 3276 3281 + Hpy166II GTNNAC 3278 3278 . . 3280 3283 + SetI ASST 3283 3279 . . 3281 3285 + Hin4II* CCTTC 3291 3290 . . 3278 3282 - HphI GGTGA 3270 3269 . . 3284 3287 + TaqI TCGA 3284 3286 . . 3285 3290 + McrI* CGRYCG 3288 3286 . . 3285 3290 + PvuI CGATCG 3288 3286 . . 3286 3289 + DpnI GATC 3287 3287 . . 3286 3289 + BstKTI GATC 3288 3286 . . 3286 3289 + MboI GATC 3285 3289 . . 3287 3292 + ClaI ATCGAT 3288 3290 . . 3288 3291 + TaqI TCGA 3288 3290 . . 3290 3300 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3281 3276 3313 3308 3297 3300 + MnlI CCTC 3307 3306 . . 3302 3306 + Hpy188I TCNGA 3304 3303 . . 3311 3314 + TspEI AATT 3310 3314 . . 3323 3328 + BtrI CACGTC 3325 3325 . . 3324 3327 + TaiI ACGT 3327 3323 . . 3324 3327 + SetI ASST 3327 3323 . . 3324 3327 + MaeII ACGT 3324 3326 . . 3325 3329 + Hpy99I CGWCG 3329 3324 . . 3341 3344 + TaiI ACGT 3344 3340 . . 3341 3344 + SetI ASST 3344 3340 . . 3341 3344 + MaeII ACGT 3341 3343 . . 3344 3348 + Hpy188I TCNGA 3346 3345 . . 3350 3353 + SetI ASST 3353 3349 . . 3356 3362 + SauI* CCTNAGG 3357 3360 . . 3357 3361 + DdeI CTNAG 3357 3360 . . 3374 3378 + TfiI GAWTC 3374 3377 . . 3371 3374 - MnlI CCTC 3364 3363 . . 3374 3378 + HinfI GANTC 3374 3377 . . 3382 3385 + TspEI AATT 3381 3385 . . 3389 3392 + DpnI GATC 3390 3390 . . 3389 3392 + BstKTI GATC 3391 3389 . . 3389 3392 + MboI GATC 3388 3392 . . 3391 3395 - MboII GAAGA 3383 3382 . . 3400 3405 + Hpy178III* TCNNGA 3401 3403 . . 3404 3407 + DpnI GATC 3405 3405 . . 3404 3407 + BstKTI GATC 3406 3404 . . 3404 3407 + MboI GATC 3403 3407 . . 3410 3413 + MnlI CCTC 3420 3419 . . 3412 3417 + Hpy178III* TCNNGA 3413 3415 . . 3411 3416 - Eco57MI CTGRAG 3396 3394 . . 3411 3416 - GsuI CTGGAG 3396 3394 . . 3418 3421 + SetI ASST 3421 3417 . . 3419 3422 + MnlI CCTC 3429 3428 . . 3429 3432 + TspEI AATT 3428 3432 . . 3434 3438 + Hpy188I TCNGA 3436 3435 . . 3437 3441 + HinfI GANTC 3437 3440 . . 3437 3441 - PleI GAGTC 3431 3432 . . 3437 3441 - MlyI GAGTC 3431 3431 . . 3443 3448 + AhaIII* TTTAAA 3445 3445 . . 3444 3447 + MseI TTAA 3444 3446 . . 3460 3470 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3451 3446 3483 3478 3460 3463 + DpnI GATC 3461 3461 . . 3460 3463 + BstKTI GATC 3462 3460 . . 3460 3463 + MboI GATC 3459 3463 . . 3464 3467 + TspEI AATT 3463 3467 . . 3479 3482 + TspEI AATT 3478 3482 . . 3483 3487 - BsrI ACTGG 3483 3481 . . 3489 3494 - TaqII CACCCA 3479 3477 . . 3500 3504 + HphI GGTGA 3512 3511 . . 3501 3505 + Tsp45I GTSAC 3500 3505 . . 3501 3505 + MaeIII GTNAC 3500 3505 . . 3503 3507 + HinfI GANTC 3503 3506 . . 3503 3507 - PleI GAGTC 3497 3498 . . 3503 3507 - MlyI GAGTC 3497 3497 . . 3528 3532 + Tsp4CI* ACNGT 3530 3529 . . 3540 3543 + DpnI GATC 3541 3541 . . 3540 3543 + BstKTI GATC 3542 3540 . . 3540 3543 + MboI GATC 3539 3543 . . 3548 3552 + MboII GAAGA 3560 3559 . . 3555 3559 + TspDTI ATGAA 3570 3568 . . 3565 3568 + TspEI AATT 3564 3568 . . 3567 3570 + MseI TTAA 3567 3569 . . 3570 3573 + SetI ASST 3573 3569 . . 3575 3580 + Hpy178III* TCNNGA 3576 3578 . . 3576 3581 + BsiI* CACGAG 3576 3580 . . 3579 3583 - BsmAI GTCTC 3573 3577 . . 3585 3588 + FatI CATG 3584 3588 . . 3585 3588 + NlaIII CATG 3588 3584 . . 3585 3588 + CviAII CATG 3585 3587 . . 3594 3598 + DdeI CTNAG 3594 3597 . . 3616 3619 + SetI ASST 3619 3615 . . 3617 3620 + MnlI CCTC 3627 3626 . . 3619 3623 + Hpy188I TCNGA 3621 3620 . . 3624 3627 + DpnI GATC 3625 3625 . . 3624 3627 + BstKTI GATC 3626 3624 . . 3624 3627 + MboI GATC 3623 3627 . . 3626 3629 + TaqI TCGA 3626 3628 . . 3628 3632 + MboII GAAGA 3640 3639 . . 3636 3641 + EcoRI GAATTC 3636 3640 . . 3636 3641 + ApoI RAATTY 3636 3640 . . 3637 3640 + TspEI AATT 3636 3640 . . 3642 3645 + SetI ASST 3645 3641 . . 3640 3644 - HphI GGTGA 3632 3631 . . 3649 3652 + CviRI* TGCA 3650 3650 . . 3650 3654 + BlsI GCNGC 3652 3651 . . 3650 3654 + BisI GCNGC 3651 3652 . . 3650 3654 + BbvI GCAGC 3662 3666 . . 3650 3654 + TseI GCWGC 3650 3653 . . 3651 3656 + PvuII CAGCTG 3653 3653 . . 3651 3656 + NspBII* CMGCKG 3653 3653 . . 3652 3655 + SetI ASST 3655 3651 . . 3652 3655 + CviJI RGCY 3653 3653 . . 3652 3655 + AluI AGCT 3653 3653 . . 3653 3663 + MwoI GCNNNNNNNGC 3659 3656 . . 3685 3689 + TspGWI ACGGA 3700 3698 . . 3692 3695 + SetI ASST 3695 3691 . . 3694 3699 + SmlI CTYRAG 3694 3698 . . 3694 3699 + AflII CTTAAG 3694 3698 . . 3695 3698 + MseI TTAA 3695 3697 . . 3707 3710 - MnlI CCTC 3700 3699 . . 3716 3719 + SetI ASST 3719 3715 . . 3714 3718 - HphI GGTGA 3706 3705 . . 3732 3735 + MseI TTAA 3732 3734 . . 3753 3756 + TaqI TCGA 3753 3755 . . 3773 3778 + Hpy166II GTNNAC 3775 3775 . . 3773 3778 + HindII GTYRAC 3775 3775 . . 3791 3795 + TspDTI ATGAA 3806 3804 . . 3801 3805 + BslFI GGGAC 3815 3819 . . 3805 3811 + TspRI CASTGNN 3811 3802 . . 3813 3818 + SspI AATATT 3815 3815 . . 3853 3858 + ApoI RAATTY 3853 3857 . . 3854 3857 + TspEI AATT 3853 3857 . . 3867 3871 - MboII GAAGA 3859 3858 . . 3880 3883 + TaiI ACGT 3883 3879 . . 3880 3883 + SetI ASST 3883 3879 . . 3880 3883 + MaeII ACGT 3880 3882 . . 3882 3886 + Tsp45I GTSAC 3881 3886 . . 3882 3886 + MaeIII GTNAC 3881 3886 . . 3883 3894 + BdaI TGANNNNNNTCA 3872 3870 3906 3904 3885 3889 + Tsp4CI* ACNGT 3887 3886 . . 3888 3891 + Csp6I GTAC 3888 3890 . . 3888 3891 + RsaI GTAC 3889 3889 . . 3883 3894 - BdaI TGANNNNNNTCA 3906 3904 3872 3870 3898 3901 + SetI ASST 3901 3897 . . 3898 3901 + CviJI RGCY 3899 3899 . . 3898 3901 + AluI AGCT 3899 3899 . . 3900 3903 + MaeI CTAG 3900 3902 . . 3910 3913 + CviRI* TGCA 3911 3911 . . 3916 3919 + SetI ASST 3919 3915 . . 3917 3921 + HphI GGTGA 3929 3928 . . 3915 3918 - MnlI CCTC 3908 3907 . . 3928 3932 + SfaNI GCATC 3937 3941 . . 3931 3936 + Hpy178III* TCNNGA 3932 3934 . . 3929 3933 - FokI GGATG 3915 3919 . . 3929 3933 - BseGI GGATG 3928 3926 . . 3944 3948 + HinfI GANTC 3944 3947 . . 3946 3950 + DdeI CTNAG 3946 3949 . . 3946 3950 + BspCNI CTCAG 3959 3957 . . 3946 3950 + BseMII CTCAG 3960 3958 . . 3944 3948 - PleI GAGTC 3938 3939 . . 3944 3948 - MlyI GAGTC 3938 3938 . . 3951 3956 + NspI RCATGY 3955 3951 . . 3951 3956 + Cac8I GCNNGC 3953 3953 . . 3951 3956 + SphI GCATGC 3955 3951 . . 3952 3955 + FatI CATG 3951 3955 . . 3952 3955 + NlaIII CATG 3955 3951 . . 3952 3955 + CviAII CATG 3952 3954 . . 3954 3957 + CviRI* TGCA 3955 3955 . . 3965 3969 + Tsp4CI* ACNGT 3967 3966 . . 3968 3971 + Csp6I GTAC 3968 3970 . . 3968 3971 + RsaI GTAC 3969 3969 . . 3971 3980 + MslI CAYNNNNRTG 3975 3975 . . 3978 3983 + EcoT22I ATGCAT 3982 3978 . . 3979 3982 + CviRI* TGCA 3980 3980 . . 3982 3987 + VspI ATTAAT 3983 3985 . . 3983 3986 + MseI TTAA 3983 3985 . . 3988 3999 + DrdI GACNNNNNNGTC 3994 3992 . . 3990 3994 - FokI GGATG 3976 3980 . . 3990 3994 - BseGI GGATG 3989 3987 . . 3997 4001 + Tsp45I GTSAC 3996 4001 . . 3997 4001 + MaeIII GTNAC 3996 4001 . . 4003 4006 + CviRI* TGCA 4004 4004 . . 4032 4035 + TspEI AATT 4031 4035 . . 4043 4047 - MboII GAAGA 4035 4034 . . 4060 4063 + CviRI* TGCA 4061 4061 . . 4073 4077 + MboII GAAGA 4085 4084 . . 4077 4080 + TspEI AATT 4076 4080 . . 4090 4093 + SetI ASST 4093 4089 . . 4091 4094 + MnlI CCTC 4101 4100 . . 4097 4107 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 4103 4100 . . 4109 4113 + TspDTI ATGAA 4124 4122 . . 4126 4129 + TaiI ACGT 4129 4125 . . 4126 4129 + SetI ASST 4129 4125 . . 4126 4129 + MaeII ACGT 4126 4128 . . 4132 4136 + MboII GAAGA 4144 4143 . . 4170 4174 + BsrI ACTGG 4175 4173 . . 4174 4177 + Csp6I GTAC 4174 4176 . . 4174 4177 + RsaI GTAC 4175 4175 . . 4194 4197 + SetI ASST 4197 4193 . . 4204 4208 + Tsp4CI* ACNGT 4206 4205 . . 4205 4211 + TspRI CASTGNN 4211 4202 . . 4217 4221 + MboII GAAGA 4229 4228 . . 4217 4226 + XmnI GAANNNNTTC 4221 4221 . . 4229 4233 + FokI GGATG 4242 4246 . . 4229 4233 + BseGI GGATG 4235 4233 . . 4230 4234 - BccI CCATC 4224 4225 . . 4236 4239 + FatI CATG 4235 4239 . . 4236 4239 + NlaIII CATG 4239 4235 . . 4236 4239 + CviAII CATG 4236 4238 . . 4245 4248 + MseI TTAA 4245 4247 . . 4259 4263 + MaeIII GTNAC 4258 4263 . . 4264 4267 + TspEI AATT 4263 4267 . . 4287 4298 + BdaI TGANNNNNNTCA 4276 4274 4310 4308 4287 4298 - BdaI TGANNNNNNTCA 4310 4308 4276 4274 4307 4310 + MseI TTAA 4307 4309 . . 4309 4314 + ApoI RAATTY 4309 4313 . . 4310 4313 + TspEI AATT 4309 4313 . . 4312 4317 + AsuII TTCGAA 4313 4315 . . 4313 4316 + TaqI TCGA 4313 4315 . . 4324 4327 + TspEI AATT 4323 4327 . . 4337 4342 + SmlI CTYRAG 4337 4341 . . 4338 4343 + Hpy178III* TCNNGA 4339 4341 . . 4337 4342 - Bce83I* CTTGAG 4322 4320 . . 4344 4347 + CviRI* TGCA 4345 4345 . . 4342 4346 - SfaNI GCATC 4332 4336 . . 4360 4370 + Hin4I GAYNNNNNVTC 4351 4346 4383 4378 4362 4367 + PsiI TTATAA 4364 4364 . . 4360 4370 - Hin4I GAYNNNNNVTC 4383 4378 4351 4346 4370 4373 + MaeI CTAG 4370 4372 . . 4372 4375 + SetI ASST 4375 4371 . . 4373 4377 + HphI GGTGA 4385 4384 . . 4380 4385 + BtgZI GCGATG 4395 4399 . . 4384 4395 + BdaI TGANNNNNNTCA 4373 4371 4407 4405 4386 4390 + TspDTI ATGAA 4401 4399 . . 4389 4394 + ApoI RAATTY 4389 4393 . . 4390 4393 + TspEI AATT 4389 4393 . . 4384 4395 - BdaI TGANNNNNNTCA 4407 4405 4373 4371 4405 4410 + StyI CCWWGG 4405 4409 . . 4405 4410 + SecI* CCNNGG 4405 4409 . . 4402 4406 - FokI GGATG 4388 4392 . . 4402 4406 - BseGI GGATG 4401 4399 . . 4409 4412 + CviJI RGCY 4410 4410 . . 4411 4415 + DdeI CTNAG 4411 4414 . . 4432 4435 + SetI ASST 4435 4431 . . 4431 4434 - MnlI CCTC 4424 4423 . . 4441 4444 + FatI CATG 4440 4444 . . 4441 4444 + NlaIII CATG 4444 4440 . . 4441 4444 + CviAII CATG 4441 4443 . . 4442 4446 + TspDTI ATGAA 4457 4455 . . 4446 4449 + TspEI AATT 4445 4449 . . 4450 4453 + SetI ASST 4453 4449 . . 4466 4469 + MseI TTAA 4466 4468 . . 4470 4474 + DdeI CTNAG 4470 4473 . . 4470 4474 - BspCNI CTCAG 4462 4460 . . 4470 4474 - BseMII CTCAG 4461 4459 . . 4485 4488 + TspEI AATT 4484 4488 . . 4487 4490 + MseI TTAA 4487 4489 . . 4491 4494 + TaiI ACGT 4494 4490 . . 4491 4494 + SetI ASST 4494 4490 . . 4491 4494 + MaeII ACGT 4491 4493 . . 4493 4496 + Csp6I GTAC 4493 4495 . . 4493 4496 + RsaI GTAC 4494 4494 . . 4495 4498 + SetI ASST 4498 4494 . . 4501 4505 + TfiI GAWTC 4501 4504 . . 4501 4505 + HinfI GANTC 4501 4504 . . 4509 4513 + TspGWI ACGGA 4524 4522 . . 4512 4516 + MboII GAAGA 4524 4523 . . 4523 4528 + NlaIV GGNNCC 4525 4525 . . 4523 4528 + HgiCI* GGYRCC 4523 4527 . . 4524 4529 + SduI GDGCHC 4528 4524 . . 4524 4529 + BseSI GKGCMC 4528 4524 . . 4528 4533 + SecI* CCNNGG 4528 4532 . . 4529 4533 + BssKI CCNGG 4528 4533 . . 4529 4533 + BseBI CCWGG 4530 4531 . . 4529 4533 + ScrFI CCNGG 4530 4531 . . 4529 4533 + EcoRII CCWGG 4528 4533 . . 4532 4535 + CviJI RGCY 4533 4533 . . 4532 4535 + HaeIII GGCC 4533 4533 . . 4537 4543 + SexAI ACCWGGT 4537 4542 . . 4538 4542 + BssKI CCNGG 4537 4542 . . 4538 4542 + BseBI CCWGG 4539 4540 . . 4538 4542 + ScrFI CCNGG 4539 4540 . . 4538 4542 + EcoRII CCWGG 4537 4542 . . 4540 4543 + SetI ASST 4543 4539 . . 4541 4546 + Eco31I GGTCTC 4547 4551 . . 4542 4546 + BsmAI GTCTC 4547 4551 . . 4565 4568 + MaeI CTAG 4565 4567 . . 4569 4572 + SetI ASST 4572 4568 . . 4569 4572 + CviJI RGCY 4570 4570 . . 4569 4572 + AluI AGCT 4570 4570 . . 4571 4574 + MaeI CTAG 4571 4573 . . 4574 4578 + MboII GAAGA 4586 4585 . . 4577 4581 + MboII GAAGA 4589 4588 . . 4592 4596 + TspDTI ATGAA 4607 4605 . . 4596 4599 + SetI ASST 4599 4595 . . 4594 4598 - Hin4II* CCTTC 4588 4587 . . 4598 4601 + Csp6I GTAC 4598 4600 . . 4598 4601 + RsaI GTAC 4599 4599 . . 4601 4604 + FatI CATG 4600 4604 . . 4601 4604 + NlaIII CATG 4604 4600 . . 4601 4604 + CviAII CATG 4601 4603 . . 4602 4606 + TspDTI ATGAA 4617 4615 . . 4608 4611 + CviRI* TGCA 4609 4609 . . 4614 4617 + SetI ASST 4617 4613 . . 4614 4617 + CviJI RGCY 4615 4615 . . 4614 4617 + AluI AGCT 4615 4615 . . 4621 4624 + SetI ASST 4624 4620 . . 4625 4628 + MaeI CTAG 4625 4627 . . 4628 4632 + SfaNI GCATC 4637 4641 . . 4632 4637 + NdeI CATATG 4633 4635 . . 4637 4642 - MmeI TCCRAC 4618 4616 . . 4646 4651 + ApoI RAATTY 4646 4650 . . 4647 4650 + TspEI AATT 4646 4650 . . 4659 4662 + SetI ASST 4662 4658 . . 4684 4687 + CviRI* TGCA 4685 4685 . . 4702 4706 - TspGWI ACGGA 4692 4690 . . 4728 4733 + NdeI CATATG 4729 4731 . . 4731 4735 + TspDTI ATGAA 4746 4744 . . 4734 4737 + TspEI AATT 4733 4737 . . 4737 4748 + BdaI TGANNNNNNTCA 4726 4724 4760 4758 4741 4745 + Tsp4CI* ACNGT 4743 4742 . . 4747 4752 + NdeI CATATG 4748 4750 . . 4737 4748 - BdaI TGANNNNNNTCA 4760 4758 4726 4724 4745 4749 - TspDTI ATGAA 4735 4733 . . 4770 4773 + TspEI AATT 4769 4773 . . 4771 4776 + VspI ATTAAT 4772 4774 . . 4772 4775 + MseI TTAA 4772 4774 . . 4792 4795 + SetI ASST 4795 4791 . . 4797 4800 + MseI TTAA 4797 4799 . . 4800 4803 + CviJI RGCY 4801 4801 . . 4812 4815 + TspEI AATT 4811 4815 . . 4821 4826 + PsiI TTATAA 4823 4823 . . 4827 4832 + BtgZI GCGATG 4842 4846 . . 4833 4836 + MnlI CCTC 4843 4842 . . 4829 4833 - SfaNI GCATC 4819 4823 . . 4841 4847 + BstEII GGTNACC 4841 4846 . . 4842 4846 + MaeIII GTNAC 4841 4846 . . 4843 4848 + TsoI TARCCA 4859 4857 . . 4849 4853 + Tsp4CI* ACNGT 4851 4850 . . 4855 4860 + PsiI TTATAA 4857 4857 . . 4867 4870 + TspEI AATT 4866 4870 . . 4887 4890 + MseI TTAA 4887 4889 . . 4900 4903 + TspEI AATT 4899 4903 . . 4905 4908 - MnlI CCTC 4898 4897 . . 4912 4917 + Hpy166II GTNNAC 4914 4914 . . 4917 4922 + StyI CCWWGG 4917 4921 . . 4917 4922 + SecI* CCNNGG 4917 4921 . . 4921 4924 + CviJI RGCY 4922 4922 . . 4926 4935 + MslI CAYNNNNRTG 4930 4930 . . 4924 4928 - TspDTI ATGAA 4914 4912 . . 4928 4931 + MseI TTAA 4928 4930 . . 4931 4936 + BspLU11I* ACATGT 4931 4935 . . 4931 4936 + NspI RCATGY 4935 4931 . . 4931 4936 + AflIII ACRYGT 4931 4935 . . 4932 4935 + FatI CATG 4931 4935 . . 4932 4935 + NlaIII CATG 4935 4931 . . 4932 4935 + CviAII CATG 4932 4934 . . 4934 4939 + TatI WGTACW 4934 4938 . . 4935 4938 + Csp6I GTAC 4935 4937 . . 4935 4938 + RsaI GTAC 4936 4936 . . 4946 4950 + TspGWI ACGGA 4961 4959 . . 4949 4961 + BarI GAAGNNNNNNTAC 4941 4936 4973 4968 4973 4977 + TfiI GAWTC 4973 4976 . . 4973 4977 + HinfI GANTC 4973 4976 . . 4979 4983 - BslFI GGGAC 4964 4968 . . 4988 4991 + MseI TTAA 4988 4990 . . 4997 5001 + DdeI CTNAG 4997 5000 . . 5001 5005 + MaeIII GTNAC 5000 5005 . . 5004 5007 + SetI ASST 5007 5003 . . 5019 5022 + TaqI TCGA 5019 5021 . . 5032 5035 + TspEI AATT 5031 5035 . . 5054 5064 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5045 5040 5077 5072 5055 5059 + Tsp4CI* ACNGT 5057 5056 . . 5054 5064 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5077 5072 5045 5040 5077 5080 + TspEI AATT 5076 5080 . . 5091 5095 + TspDTI ATGAA 5106 5104 . . 5093 5097 + MboII GAAGA 5105 5104 . . 5093 5098 - Ksp632I* CTCTTC 5088 5091 . . 5099 5104 + ApoI RAATTY 5099 5103 . . 5100 5103 + TspEI AATT 5099 5103 . . 5121 5124 + Csp6I GTAC 5121 5123 . . 5121 5124 + RsaI GTAC 5122 5122 . . 5129 5134 + BsrDI GCAATG 5136 5134 . . 5138 5142 + DdeI CTNAG 5138 5141 . . 5134 5138 - BsmAI GTCTC 5128 5132 . . 5138 5142 - BspCNI CTCAG 5130 5128 . . 5138 5142 - BseMII CTCAG 5129 5127 . . 5144 5154 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5135 5130 5167 5162 5145 5149 + TspDTI ATGAA 5160 5158 . . 5153 5158 + Hpy178III* TCNNGA 5154 5156 . . 5144 5154 - Hin4I GAYNNNNNVTC 5167 5162 5135 5130 5166 5169 + CviRI* TGCA 5167 5167 . . 5168 5173 + BsaAI YACGTR 5170 5170 . . 5169 5172 + TaiI ACGT 5172 5168 . . 5169 5172 + SetI ASST 5172 5168 . . 5169 5172 + MaeII ACGT 5169 5171 . . 5165 5170 - BsgI GTGCAG 5150 5148 . . 5181 5184 + TaqI TCGA 5181 5183 . . 5195 5200 + SspI AATATT 5197 5197 . . 5200 5203 + CviRI* TGCA 5201 5201 . . 5205 5208 + TaiI ACGT 5208 5204 . . 5205 5208 + SetI ASST 5208 5204 . . 5205 5208 + MaeII ACGT 5205 5207 . . 5212 5222 + Hin4I GAYNNNNNVTC 5203 5198 5235 5230 5218 5221 + SetI ASST 5221 5217 . . 5219 5222 + MnlI CCTC 5229 5228 . . 5220 5225 + Ksp632I* CTCTTC 5226 5229 . . 5224 5228 + Hpy188I TCNGA 5226 5225 . . 5221 5225 - MboII GAAGA 5213 5212 . . 5246 5249 + MseI TTAA 5246 5248 . . 5260 5264 + TfiI GAWTC 5260 5263 . . 5260 5264 + HinfI GANTC 5260 5263 . . 5262 5266 - TspDTI ATGAA 5252 5250 . . #--------------------------------------- # # # AarI: # [CACCTGC] # 180 672 4417 # # Acc65I: # [GGTACC] # 2057 3212 # # AccI: # [GTMKAC] # 334 341 1547 3047 # # AciI: # [CCGC] # 81 391 945 1816 2036 # # AflII: # [CTTAAG] # 1575 3694 # # AflIII: # [ACRYGT] # 338 979 1947 2005 # # AgeI: # [ACCGGT] # 2225 3044 # # AhaIII*: # [TTTAAA] # 1824 3445 # # AlfI: # [GCANNNNNNTGC] # 0 0 34 1799 3436 # # AluI: # [AGCT] # 32 45 75 109 246 273 # 441 654 671 780 934 1009 # # AlwNI: # [CAGNNNCTG] # 1009 4260 # # ApaLI: # [GTGCAC] # 2046 3223 # # ApoI: # [RAATTY] # 20 70 80 109 116 145 # 156 159 170 181 217 257 # 452 453 456 602 612 1014 # # AsuI*: # [GGNCC] # 126 185 247 1648 3063 # # AsuII: # [TTCGAA] # 956 1177 1392 1744 # # AvaI: # [CYCGRG] # 2295 2974 # # AvaII: # [GGWCC] # 185 2021 3063 # # BaeI: # [ACNNNNGTAYC] # 33 2062 3174 # # BarI: # [GAAGNNNNNNTAC] # 32 296 4941 # # BbvCI: # [CCTCAGC] # 468 4801 # # BbvI: # [GCAGC] # 458 1127 1607 2077 # # BbvII*: # [GAAGAC] # 88 2539 2642 # # BccI: # [CCATC] # 22 27 30 81 91 114 # 197 209 372 471 573 817 # 1045 1220 # # Bce83I*: # [CTTGAG] # 947 4322 # # BceAI: # [ACGGC] # 2 234 665 1432 2936 # # BciVI: # [GTATCC] # 407 811 4051 # # BclI: # [TGATCA] # 2530 2739 # # BdaI: # [TGANNNNNNTCA] # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 0 0 # 34 34 34 34 34 34 # 63 319 370 509 677 1255 # 1872 # # BetI*: # [WCCGGW] # 2225 3044 # # BfiI: # [ACTGGG] # 1702 3567 # # BglII: # [AGATCT] # 1409 1599 2261 # # BinI*: # [GGATC] # 85 977 1708 2499 # # BisI: # [GCNGC] # 483 1116 1618 2052 # # BlsI: # [GCNGC] # 483 1117 1617 2052 # # BmeT110I: # [CYCGRG] # 2296 2973 # # BmgT120I: # [GGNCC] # 126 185 248 1648 3062 # # Bpu10I: # [CCTNAGC] # 468 2376 2425 # # BsaAI: # [YACGTR] # 99 1860 3310 # # BsaXI: # [ACNNNNNCTCC] # 30 2528 2711 # # BseBI: # [CCWGG] # 9 109 155 171 334 371 # 380 730 1051 1959 # # BseGI: # [GGATG] # 11 19 24 40 61 166 # 215 229 246 463 503 868 # 1089 1335 # # BseMII: # [CTCAG] # 16 54 81 140 151 330 # 412 501 614 627 668 714 # 961 # # BseRI: # [GAGGAG] # 203 5066 # # BseSI: # [GKGCMC] # 741 2050 2478 # # BseYI: # [CCCAGC] # 1228 4041 # # BsgI: # [GTGCAG] # 119 5150 # # BsiI*: # [CACGAG] # 1017 1693 2559 # # BsiYI*: # [CCNNNNNNNGG] # 57 198 244 1166 1680 1924 # # BslFI: # [GGGAC] # 305 736 1149 3079 # # BsmAI: # [GTCTC] # 78 141 328 395 523 572 # 581 974 1677 # # BsmI: # [GAATGC] # 902 904 3463 # # BspCNI: # [CTCAG] # 16 52 83 139 151 328 # 413 503 616 627 668 712 # 961 # # BspHI: # [TCATGA] # 743 4526 # # BspLU11I*: # [ACATGT] # 338 4931 # # BspMI: # [ACCTGC] # 48 180 624 4417 # # BsrDI: # [GCAATG] # 133 394 2366 2376 # # BsrI: # [ACTGG] # 11 75 135 149 192 282 # 692 942 1094 1697 # # BssKI: # [CCNGG] # 9 109 155 171 334 369 # 380 732 1051 1959 # # BssNAI: # [GTATAC] # 335 1888 3046 # # BstEII: # [GGTNACC] # 428 1499 3342 # # BstKTI: # [GATC] # 15 16 56 80 84 86 # 93 103 159 217 277 355 # 422 542 1121 1643 # # BstXI: # [CCANNNNNNTGG] # 299 4970 # # BtgZI: # [GCGATG] # 427 447 4395 # # BtrI: # [CACGTC] # 982 1944 2343 # # BtsI: # [GCAGTG] # 268 5001 # # Cac8I: # [GCNNGC] # 6 188 658 691 927 1316 # 1483 # # Cfr10I: # [RCCGGY] # 2225 3044 # # ClaI: # [ATCGAT] # 1981 3288 # # Csp6I: # [GTAC] # 9 13 21 23 25 31 # 34 39 50 79 80 105 # 108 144 148 186 206 214 # 229 265 319 337 549 561 # 675 819 # # CviAII: # [CATG] # 19 32 40 62 104 160 # 162 165 182 194 205 278 # 284 331 337 348 367 460 # 475 477 587 # # CviJI: # [RGCY] # 6 12 24 27 30 32 # 36 37 37 40 42 45 # 65 89 102 109 110 112 # 121 123 137 186 246 260 # 299 347 511 561 743 780 # # CviRI*: # [TGCA] # 6 22 24 25 34 37 # 44 48 49 57 60 63 # 68 76 156 228 261 264 # 266 284 311 482 511 589 # 605 699 # # DdeI: # [CTNAG] # 16 26 31 56 59 68 # 75 102 104 126 131 141 # 151 237 278 283 307 352 # 465 527 552 555 627 # # DpnI: # [GATC] # 15 16 56 80 84 86 # 92 103 159 217 277 355 # 422 542 1121 1644 # # DrdI: # [GACNNNNNNGTC] # 1275 3994 # # DsaI*: # [CCRYGG] # 2209 3060 # # Eco31I: # [GGTCTC] # 722 4547 # # Eco57I: # [CTGAAG] # 209 283 2335 2442 # # Eco57MI: # [CTGRAG] # 209 283 462 1873 2442 # # EcoNI: # [CCTNNNNNAGG] # 440 4829 # # EcoP15I: # [CAGCAG] # 289 4980 # # EcoRI: # [GAATTC] # 1633 3636 # # EcoRII: # [CCWGG] # 9 109 155 171 334 369 # 380 732 1051 1959 # # EcoRV: # [GATATC] # 285 583 741 879 2781 # # EcoT22I: # [ATGCAT] # 855 919 1287 2208 # # Esp3I: # [CGTCTC] # 2595 2674 # # FatI: # [CATG] # 19 32 39 62 104 160 # 162 165 182 194 205 278 # 284 331 338 348 367 460 # 475 477 587 # # FnuDII*: # [CGCG] # 828 2121 2320 # # FokI: # [GGATG] # 11 19 24 40 61 146 # 215 229 266 450 503 881 # 1089 1335 # # GlaI: # [GCGC] # 48 1141 1761 2319 # # GsaI: # [CCCAGC] # 1232 4037 # # GsuI: # [CTGGAG] # 1873 3396 # # HaeII: # [RGCGCY] # 50 5219 # # HaeIII: # [GGCC] # 126 249 736 875 933 2350 # # HgaI: # [GACGC] # 40 2515 2714 # # HgiAI*: # [GWGCWC] # 252 427 1623 2967 # # HgiCI*: # [GGYRCC] # 746 1311 3212 # # HgiJII*: # [GRGCYC] # 1200 4069 # # HhaI: # [GCGC] # 49 1141 1761 2318 # # Hin4I: # [GAYNNNNNVTC] # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 11 21 # 21 32 32 32 32 32 # 32 32 32 32 32 34 # 36 58 94 138 177 202 # 442 451 662 868 1734 # # Hin4II*: # [CCTTC] # 79 643 663 681 1297 1906 # # Hin6I: # [GCGC] # 47 1141 1761 2320 # # HindII: # [GTYRAC] # 61 391 524 631 810 1358 # 1494 # # HinfI: # [GANTC] # 4 9 10 15 16 21 # 21 29 30 42 47 50 # 60 63 63 66 74 88 # 105 110 112 132 165 219 # 255 287 323 371 441 472 # 489 523 557 # # HpaI: # [GTTAAC] # 524 4745 # # HpaII: # [CCGG] # 2224 3045 # # HphI: # [GGTGA] # 74 96 120 121 223 242 # 425 456 843 869 884 916 # # Hpy166II: # [GTNNAC] # 19 61 68 78 79 88 # 113 141 149 175 189 229 # 257 313 355 391 497 928 # 1139 # # Hpy178III*: # [TCNNGA] # 7 9 12 33 49 50 # 69 88 90 115 158 161 # 163 175 194 227 241 297 # 314 321 356 364 407 554 # 815 # # Hpy188I: # [TCNGA] # 8 18 27 28 42 43 # 58 63 90 97 150 151 # 153 166 185 197 228 297 # 308 342 422 591 1605 # # Hpy99I: # [CGWCG] # 208 413 587 1940 2121 # # KpnI: # [GGTACC] # 2053 3216 # # Ksp632I*: # [CTCTTC] # 43 138 2089 2999 # # MaeI: # [CTAG] # 6 54 195 266 273 470 # 583 644 888 1890 # # MaeII: # [ACGT] # 17 36 64 101 135 177 # 227 246 263 354 365 474 # 526 539 678 1067 # # MaeIII: # [GTNAC] # 60 60 115 159 262 269 # 336 381 583 632 665 747 # 1000 # # MboI: # [GATC] # 15 16 56 80 84 86 # 90 103 159 217 277 355 # 422 542 1121 1646 # # MboII: # [GAAGA] # 3 10 32 35 50 56 # 57 59 59 62 78 80 # 85 108 176 177 192 219 # 295 367 516 1054 1499 # # McrI*: # [CGRYCG] # 1172 1981 2116 # # MfeI: # [CAATTG] # 1276 3993 # # MlyI: # [GAGTC] # 21 27 66 196 235 282 # 441 448 571 1331 1651 # # MmeI: # [TCCRAC] # 56 238 390 651 1712 2222 # # MnlI: # [CCTC] # 5 9 21 28 40 49 # 55 56 57 60 73 90 # 151 159 183 193 198 208 # 213 219 232 323 331 339 # 400 419 424 734 # # MseI: # [TTAA] # 9 21 23 24 25 31 # 37 41 56 58 60 62 # 90 99 123 128 159 244 # 251 258 262 272 285 354 # 376 380 464 523 554 # # MslI: # [CAYNNNNRTG] # 57 261 339 408 744 955 # 1089 1416 # # MstI*: # [TGCGCA] # 1809 3460 # # MwoI: # [GCNNNNNNNGC] # 97 181 1088 1610 2293 # # NdeI: # [CATATG] # 19 96 521 4633 # # NlaIII: # [CATG] # 19 32 43 62 104 160 # 162 165 182 194 205 278 # 284 331 334 348 367 460 # 475 477 587 # # NlaIV: # [GGNNCC] # 744 1311 3214 # # NruI: # [TCGCGA] # 2121 3148 # # NspBII*: # [CMGCKG] # 184 288 1365 1616 1816 # # NspI: # [RCATGY] # 194 334 654 691 929 980 # 1487 # # OliI: # [CACNNNNGTG] # 261 5008 # # PflMI: # [CCANNNNNTGG] # 244 5025 # # PfoI: # [TCCNGGA] # 1518 3751 # # PleI: # [GAGTC] # 22 28 66 195 235 282 # 441 447 571 1331 1651 # # PpiI: # [GAACNNNNNCTC] # 32 2206 3031 # # PsiI: # [TTATAA] # 34 412 459 1406 2958 # # PstI: # [CTGCAG] # 754 849 3666 # # PvuI: # [CGATCG] # 1981 3288 # # PvuII: # [CAGCTG] # 184 1616 3469 # # RsaI: # [GTAC] # 9 13 21 23 25 31 # 34 39 50 79 80 105 # 108 144 147 186 206 214 # 230 265 319 337 549 561 # 675 819 # # SalI: # [GTCGAC] # 1880 3389 # # SauI*: # [CCTNAGG] # 1912 3357 # # ScaI: # [AGTACT] # 785 1709 2775 # # ScrFI: # [CCNGG] # 9 109 155 171 334 371 # 380 730 1051 1959 # # SduI: # [GDGCHC] # 252 427 741 773 850 2226 # # SecI*: # [CCNNGG] # 108 123 170 334 352 360 # 370 381 389 846 1836 # # SetI: # [ASST] # 4 4 5 6 7 7 # 9 9 10 12 12 13 # 15 17 18 18 18 18 # 24 24 25 25 26 27 # 29 30 30 32 33 34 # 36 36 36 36 38 40 # 41 42 44 44 45 46 # 46 47 48 48 60 63 # 66 66 68 68 76 77 # 82 84 87 90 91 96 # 98 101 104 105 124 133 # 140 146 152 164 165 172 # 174 178 193 212 263 357 # # SexAI: # [ACCWGGT] # 732 4537 # # SfaNI: # [GCATC] # 11 42 182 305 395 450 # 560 840 1121 1363 # # SfeI*: # [CTRYAG] # 273 481 845 3670 # # SmlI: # [CTYRAG] # 643 932 3694 # # SphI: # [GCATGC] # 194 691 929 1314 2141 # # SplI*: # [CGTACG] # 624 2149 2496 # # SspI: # [AATATT] # 45 72 677 826 1382 2267 # # StyI: # [CCWWGG] # 352 512 4405 # # TaiI: # [ACGT] # 17 36 61 104 135 177 # 227 246 263 354 365 474 # 526 539 678 1067 # # TaqI: # [TCGA] # 4 6 33 50 70 88 # 106 115 120 125 127 162 # 193 197 203 248 255 264 # 298 338 418 560 583 706 # # TaqII: # [CACCCA] # 332 470 511 1790 2166 # # TatI: # [WGTACW] # 50 59 335 359 479 726 # 819 2442 # # TfiI: # [GAWTC] # 4 9 21 29 30 47 # 50 60 63 84 88 105 # 125 133 287 323 387 393 # 420 472 489 523 1127 # # TseI: # [GCWGC] # 483 1115 1619 2052 # # TsoI: # [TARCCA] # 410 4859 # # Tsp45I: # [GTSAC] # 60 115 336 381 632 807 # 1273 1665 # # Tsp4CI*: # [ACNGT] # 11 13 46 65 80 93 # 94 108 117 206 212 223 # 239 255 314 314 314 357 # 386 396 429 460 537 # # TspDTI: # [ATGAA] # 4 10 11 13 17 54 # 56 79 83 92 101 118 # 135 150 160 167 168 175 # 187 192 207 233 234 236 # 277 285 318 686 821 # # TspEI: # [AATT] # 4 5 8 13 14 15 # 20 22 23 23 29 33 # 35 36 39 41 42 45 # 45 46 47 55 56 58 # 66 70 71 72 84 86 # 87 95 99 103 109 110 # 112 123 132 151 156 159 # 162 170 178 187 209 217 # 235 245 271 326 430 # # TspGWI: # [ACGGA] # 6 37 83 85 168 237 # 269 303 308 312 361 471 # 496 498 811 824 # # TspRI: # [CASTGNN] # 268 374 400 531 642 978 # 1018 1058 # # TstI: # [CACNNNNNNTCC] # 32 1192 4045 # # VspI: # [ATTAAT] # 497 789 934 3049 # # XhoII: # [RGATCY] # 90 233 1319 1366 2261 # # XmnI: # [GAANNNNTTC] # 721 1048 1271 2229 # #--------------------------------------- #--------------------------------------- # Total_sequences: 1 # Total_length: 5269 # Reported_sequences: 1 # Reported_hitcount: 1218 #---------------------------------------