Restriction Fragments for RPO21/YDL140C



Send questions or suggestions to SGD

BLAST search | Genome Restriction Map | Design Primers for this sequence


The currently selected gene/sequence is :

RPO21/YDL140C on chromosome IV from coordinates 210561 to 205360.

The sequence you have requested is oriented with respect to the Crick (bottom) strand. Thus, the chromosomal coordinate of the beginning of the gene or sequence is larger than that of the end. The sequence shown here is the 5'-3' direction of the Crick strand and is the reverse complement of the Watson (top) strand.

seqfile=/share/crumb/www-data/html/tmp/gcgseq.tmp.2.27844.2

Start End Strand Enzyme_name Restriction_site 5prime 3prime 5primerev 3primerev 12 16 + Tsp4CI* ACNGT 14 13 . . 20 23 + MaeI CTAG 20 22 . . 23 28 + SduI GDGCHC 27 23 . . 23 28 + HgiAI* GWGCWC 27 23 . . 35 38 + Csp6I GTAC 35 37 . . 35 38 + RsaI GTAC 36 36 . . 32 36 - TspGWI ACGGA 22 20 . . 37 41 + Tsp4CI* ACNGT 39 38 . . 47 50 + SetI ASST 50 46 . . 48 52 + BmgT120I GGNCC 49 50 . . 48 52 + AvaII GGWCC 48 51 . . 48 52 + AsuI* GGNCC 48 51 . . 46 49 - MnlI CCTC 39 38 . . 53 56 + TspEI AATT 52 56 . . 56 61 - TaqII GACCGA 46 44 . . 69 72 + SetI ASST 72 68 . . 71 76 + Eco57MI CTGRAG 92 90 . . 67 71 - HphI GGTGA 59 58 . . 71 76 + Eco57I CTGAAG 92 90 . . 73 77 + MboII GAAGA 85 84 . . 86 97 + CspCI CAANNNNNGTGG 74 72 109 107 90 96 + TspRI CASTGNN 96 87 . . 95 100 + BalI TGGCCA 97 97 . . 95 100 + CfrI YGGCCR 95 99 . . 96 99 + CviJI RGCY 97 97 . . 96 99 + HaeIII GGCC 97 97 . . 102 105 + TspEI AATT 101 105 . . 111 116 + Hpy178III* TCNNGA 112 114 . . 115 119 - BsmAI GTCTC 109 113 . . 123 127 + FokI GGATG 136 140 . . 123 127 + BseGI GGATG 129 127 . . 125 129 + TspDTI ATGAA 140 138 . . 147 150 + TspEI AATT 146 150 . . 166 176 + EcoNI CCTNNNNNAGG 170 171 . . 166 171 + StyI CCWWGG 166 170 . . 166 171 + SecI* CCNNGG 166 170 . . 166 171 + AvrII CCTAGG 166 170 . . 166 176 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 172 169 . . 167 170 + MaeI CTAG 167 169 . . 169 172 + SetI ASST 172 168 . . 175 178 + CviJI RGCY 176 176 . . 184 187 + DpnI GATC 185 185 . . 184 187 + BstKTI GATC 186 184 . . 184 193 + BsaBI GATNNNNATC 188 188 . . 184 187 + MboI GATC 183 187 . . 192 196 + Hpy188I TCNGA 194 193 . . 193 198 + Eco57MI CTGRAG 214 212 . . 193 198 + Eco57I CTGAAG 214 212 . . 210 215 + Hpy178III* TCNNGA 211 213 . . 214 217 - MnlI CCTC 207 206 . . 220 224 + TspDTI ATGAA 235 233 . . 232 236 + BssKI CCNGG 231 236 . . 232 236 + BseBI CCWGG 233 234 . . 232 236 + ScrFI CCNGG 233 234 . . 232 236 + EcoRII CCWGG 231 236 . . 245 249 + Tsp45I GTSAC 244 249 . . 245 249 + MaeIII GTNAC 244 249 . . 264 267 + SetI ASST 267 263 . . 274 277 + FatI CATG 273 277 . . 274 277 + NlaIII CATG 277 273 . . 274 277 + CviAII CATG 274 276 . . 272 276 - TspDTI ATGAA 262 260 . . 294 297 + TspEI AATT 293 297 . . 296 299 + MseI TTAA 296 298 . . 323 326 + CviRI* TGCA 324 324 . . 325 331 + TspRI CASTGNN 331 322 . . 326 330 + Tsp4CI* ACNGT 328 327 . . 335 338 + SetI ASST 338 334 . . 335 338 + CviJI RGCY 336 336 . . 335 338 + AluI AGCT 336 336 . . 342 346 + BsrI ACTGG 347 345 . . 345 349 + FokI GGATG 358 362 . . 345 349 + BseGI GGATG 351 349 . . 347 351 + TspDTI ATGAA 362 360 . . 356 360 + TspDTI ATGAA 371 369 . . 359 362 + TspEI AATT 358 362 . . 360 365 + VspI ATTAAT 361 363 . . 361 364 + MseI TTAA 361 363 . . 366 376 + BplI GAGNNNNNCTC 357 352 389 384 366 370 - BsmAI GTCTC 360 364 . . 372 375 + SetI ASST 375 371 . . 372 375 + CviJI RGCY 373 373 . . 372 375 + AluI AGCT 373 373 . . 366 376 - BplI GAGNNNNNCTC 389 384 357 352 376 379 + MaeI CTAG 376 378 . . 389 393 + Tsp4CI* ACNGT 391 390 . . 400 403 + SetI ASST 403 399 . . 406 410 + BlsI GCNGC 408 407 . . 406 410 + BisI GCNGC 407 408 . . 406 410 + TseI GCWGC 406 409 . . 408 411 + CviRI* TGCA 409 409 . . 406 410 - BbvI GCAGC 393 397 . . 411 414 + TspEI AATT 410 414 . . 457 461 + Hin4II* CCTTC 467 466 . . 454 458 - BslFI GGGAC 439 443 . . 460 464 + Hpy188I TCNGA 462 461 . . 461 466 + Eco57MI CTGRAG 482 480 . . 461 466 + Eco57I CTGAAG 482 480 . . 463 467 + MboII GAAGA 475 474 . . 468 479 + BdaI TGANNNNNNTCA 457 455 491 489 469 472 + DpnI GATC 470 470 . . 469 472 + BstKTI GATC 471 469 . . 469 472 + MboI GATC 468 472 . . 469 473 - BinI* GGATC 463 464 . . 476 480 + DdeI CTNAG 476 479 . . 476 480 + BspCNI CTCAG 489 487 . . 476 480 + BseMII CTCAG 490 488 . . 479 482 + SetI ASST 482 478 . . 479 482 + CviJI RGCY 480 480 . . 468 479 - BdaI TGANNNNNNTCA 491 489 457 455 479 482 + AluI AGCT 480 480 . . 495 498 + SetI ASST 498 494 . . 494 497 - MnlI CCTC 487 486 . . 512 515 + CviJI RGCY 513 513 . . 519 522 + TspEI AATT 518 522 . . 528 532 + FokI GGATG 541 545 . . 528 532 + BseGI GGATG 534 532 . . 529 533 - BccI CCATC 523 524 . . 539 542 + TspEI AATT 538 542 . . 551 556 - MmeI TCCRAC 532 530 . . 567 570 + CviJI RGCY 568 568 . . 569 574 + DsaI* CCRYGG 569 573 . . 569 574 + SecI* CCNNGG 569 573 . . 576 580 + FokI GGATG 589 593 . . 576 580 + BseGI GGATG 582 580 . . 577 581 - SfaNI GCATC 567 571 . . 582 586 + FokI GGATG 595 599 . . 582 586 + BseGI GGATG 588 586 . . 580 583 - AciI CCGC 580 582 . . 584 588 + TspDTI ATGAA 599 597 . . 595 599 + DdeI CTNAG 595 598 . . 604 607 + MseI TTAA 604 606 . . 608 611 + Csp6I GTAC 608 610 . . 608 611 + RsaI GTAC 609 609 . . 610 614 + TspGWI ACGGA 625 623 . . 613 616 - MnlI CCTC 606 605 . . 620 625 + Hpy178III* TCNNGA 621 623 . . 625 630 + SspI AATATT 627 627 . . 632 635 + MseI TTAA 632 634 . . 642 646 + DdeI CTNAG 642 645 . . 642 646 + BspCNI CTCAG 655 653 . . 642 646 + BseMII CTCAG 656 654 . . 658 663 + SpeI ACTAGT 658 662 . . 659 662 + MaeI CTAG 659 661 . . 690 695 + Hpy178III* TCNNGA 691 693 . . 698 702 + FokI GGATG 711 715 . . 698 702 + BseGI GGATG 704 702 . . 706 709 + MseI TTAA 706 708 . . 709 714 + NspI RCATGY 713 709 . . 710 713 + FatI CATG 709 713 . . 710 713 + NlaIII CATG 713 709 . . 710 713 + CviAII CATG 710 712 . . 714 718 + Hin4II* CCTTC 724 723 . . 721 725 - BslFI GGGAC 706 710 . . 731 738 + SgrAI CRCCGGYG 732 736 . . 732 737 + Cfr10I RCCGGY 732 736 . . 732 737 + BetI* WCCGGW 732 736 . . 732 737 + AgeI ACCGGT 732 736 . . 733 736 + HpaII CCGG 733 735 . . 738 742 - HgaI GACGC 727 732 . . 742 746 + BccI CCATC 750 751 . . 743 747 - FokI GGATG 729 733 . . 743 747 - BseGI GGATG 742 740 . . 752 756 + Hin4II* CCTTC 762 761 . . 758 762 + TspDTI ATGAA 773 771 . . 760 764 + TfiI GAWTC 760 763 . . 760 764 + HinfI GANTC 760 763 . . 771 774 + SetI ASST 774 770 . . 772 776 + HphI GGTGA 784 783 . . 770 773 - MnlI CCTC 763 762 . . 777 781 + FokI GGATG 790 794 . . 777 781 + BseGI GGATG 783 781 . . 775 778 - MnlI CCTC 768 767 . . 784 787 + MseI TTAA 784 786 . . 787 790 + SetI ASST 790 786 . . 790 795 + AhaIII* TTTAAA 792 792 . . 791 794 + MseI TTAA 791 793 . . 807 812 + AhaIII* TTTAAA 809 809 . . 808 811 + MseI TTAA 808 810 . . 813 816 + SetI ASST 816 812 . . 813 816 + CviJI RGCY 814 814 . . 813 816 + AluI AGCT 814 814 . . 817 822 + SspI AATATT 819 819 . . 835 838 + MaeI CTAG 835 837 . . 840 851 + AlfI GCANNNNNNTGC 829 827 863 861 841 850 + MslI CAYNNNNRTG 845 845 . . 845 849 + Tsp4CI* ACNGT 847 846 . . 848 853 + SduI GDGCHC 852 848 . . 848 853 + HgiAI* GWGCWC 852 848 . . 840 851 - AlfI GCANNNNNNTGC 863 861 829 827 859 862 + FatI CATG 858 862 . . 859 862 + NlaIII CATG 862 858 . . 859 862 + CviAII CATG 859 861 . . 868 872 + MboII GAAGA 880 879 . . 890 893 + TspEI AATT 889 893 . . 895 898 + FatI CATG 894 898 . . 895 898 + NlaIII CATG 898 894 . . 895 898 + CviAII CATG 895 897 . . 893 897 - TspDTI ATGAA 883 881 . . 902 913 + BstXI CCANNNNNNTGG 909 905 . . 903 912 + MslI CAYNNNNRTG 907 907 . . 929 934 + Hpy166II GTNNAC 931 931 . . 929 934 + HindII GTYRAC 931 931 . . 939 942 + SetI ASST 942 938 . . 939 942 + CviJI RGCY 940 940 . . 939 942 + AluI AGCT 940 940 . . 940 946 + SapI GCTCTTC 947 950 . . 941 946 + Ksp632I* CTCTTC 947 950 . . 942 946 - MboII GAAGA 934 933 . . 953 956 + HpaII CCGG 953 955 . . 954 959 + McrI* CGRYCG 957 955 . . 954 959 + XmaIII* CGGCCG 954 958 . . 954 959 + CfrI YGGCCR 954 958 . . 955 958 + CviJI RGCY 956 956 . . 955 958 + HaeIII GGCC 956 956 . . 956 960 - BceAI ACGGC 941 943 . . 959 963 - BslFI GGGAC 944 948 . . 965 968 + MseI TTAA 965 967 . . 977 982 + SduI GDGCHC 981 977 . . 977 982 + HgiAI* GWGCWC 981 977 . . 987 991 - Hin4II* CCTTC 981 980 . . 997 1000 - MnlI CCTC 990 989 . . 1007 1011 + Hpy188I TCNGA 1009 1008 . . 1011 1014 + SetI ASST 1014 1010 . . 1010 1013 - MnlI CCTC 1003 1002 . . 1015 1018 + TspEI AATT 1014 1018 . . 1018 1021 + MseI TTAA 1018 1020 . . 1051 1055 + Tsp4CI* ACNGT 1053 1052 . . 1063 1067 + HphI GGTGA 1075 1074 . . 1066 1069 + DpnI GATC 1067 1067 . . 1066 1069 + BstKTI GATC 1068 1066 . . 1066 1069 + MboI GATC 1065 1069 . . 1066 1070 - BinI* GGATC 1060 1061 . . 1072 1075 + TspEI AATT 1071 1075 . . 1079 1082 + TspEI AATT 1078 1082 . . 1084 1092 + Tth111I GACNNNGTC 1087 1088 . . 1086 1099 - AjuI GAANNNNNNNTTGG 1111 1106 1079 1074 1120 1123 + MseI TTAA 1120 1122 . . 1128 1138 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 1134 1131 . . 1138 1142 + Tsp45I GTSAC 1137 1142 . . 1138 1142 + MaeIII GTNAC 1137 1142 . . 1156 1159 + DpnI GATC 1157 1157 . . 1156 1159 + BstKTI GATC 1158 1156 . . 1156 1159 + MboI GATC 1155 1159 . . 1161 1165 + Hpy188I TCNGA 1163 1162 . . 1164 1168 + HgaI GACGC 1173 1178 . . 1183 1187 + BmgT120I GGNCC 1184 1185 . . 1183 1187 + AvaII GGWCC 1183 1186 . . 1183 1187 + AsuI* GGNCC 1183 1186 . . 1192 1197 + SduI GDGCHC 1196 1192 . . 1192 1197 + HgiAI* GWGCWC 1196 1192 . . 1194 1205 + AlfI GCANNNNNNTGC 1183 1181 1217 1215 1195 1204 + MslI CAYNNNNRTG 1199 1199 . . 1195 1204 + OliI CACNNNNGTG 1199 1199 . . 1197 1202 + SecI* CCNNGG 1197 1201 . . 1198 1202 + BssKI CCNGG 1197 1202 . . 1198 1202 + ScrFI CCNGG 1199 1200 . . 1198 1202 + CauII* CCSGG 1199 1200 . . 1199 1202 + HpaII CCGG 1199 1201 . . 1201 1206 + NlaIV GGNNCC 1203 1203 . . 1201 1206 + HgiCI* GGYRCC 1201 1205 . . 1194 1205 - AlfI GCANNNNNNTGC 1217 1215 1183 1181 1211 1214 + TaiI ACGT 1214 1210 . . 1211 1214 + SetI ASST 1214 1210 . . 1211 1214 + MaeII ACGT 1211 1213 . . 1218 1223 + Hpy178III* TCNNGA 1219 1221 . . 1226 1229 - AciI CCGC 1226 1228 . . 1232 1236 + Tsp4CI* ACNGT 1234 1233 . . 1229 1233 - BsmAI GTCTC 1223 1227 . . 1229 1234 - Eco31I GGTCTC 1223 1227 . . 1243 1246 + MseI TTAA 1243 1245 . . 1250 1254 + Tsp4CI* ACNGT 1252 1251 . . 1263 1266 + SetI ASST 1266 1262 . . 1264 1268 + HphI GGTGA 1276 1275 . . 1261 1266 - BspMI ACCTGC 1252 1256 . . 1261 1267 - AarI CACCTGC 1252 1256 . . 1274 1277 + TspEI AATT 1273 1277 . . 1278 1282 + Tsp4CI* ACNGT 1280 1279 . . 1284 1289 - TaqII CACCCA 1274 1272 . . 1299 1302 + TaiI ACGT 1302 1298 . . 1299 1302 + SetI ASST 1302 1298 . . 1299 1302 + MaeII ACGT 1299 1301 . . 1318 1321 + DpnI GATC 1319 1319 . . 1318 1321 + BstKTI GATC 1320 1318 . . 1318 1321 + MboI GATC 1317 1321 . . 1318 1322 - BinI* GGATC 1312 1313 . . 1321 1325 - BsrI ACTGG 1321 1319 . . 1334 1338 + Tsp4CI* ACNGT 1336 1335 . . 1337 1342 + Hpy166II GTNNAC 1339 1339 . . 1337 1342 + HindII GTYRAC 1339 1339 . . 1341 1344 + SetI ASST 1344 1340 . . 1342 1346 + Hin4II* CCTTC 1352 1351 . . 1349 1352 + CviRI* TGCA 1350 1350 . . 1351 1362 + TstI CACNNNNNNTCC 1342 1337 1374 1369 1362 1365 + FatI CATG 1361 1365 . . 1362 1365 + NlaIII CATG 1365 1361 . . 1362 1365 + CviAII CATG 1362 1364 . . 1368 1371 + CviJI RGCY 1369 1369 . . 1368 1371 + HaeIII GGCC 1369 1369 . . 1368 1372 + BmgT120I GGNCC 1369 1370 . . 1368 1372 + AsuI* GGNCC 1368 1371 . . 1365 1369 - BccI CCATC 1359 1360 . . 1410 1415 + ApoI RAATTY 1410 1414 . . 1411 1414 + TspEI AATT 1410 1414 . . 1420 1424 + MaeIII GTNAC 1419 1424 . . 1417 1421 - TspGWI ACGGA 1407 1405 . . 1445 1448 + TaqI TCGA 1445 1447 . . 1446 1450 + Hpy99I CGWCG 1450 1445 . . 1448 1452 + Tsp4CI* ACNGT 1450 1449 . . 1450 1454 + HphI GGTGA 1462 1461 . . 1451 1455 + Tsp45I GTSAC 1450 1455 . . 1451 1455 + MaeIII GTNAC 1450 1455 . . 1459 1463 + TspDTI ATGAA 1474 1472 . . 1461 1465 + TfiI GAWTC 1461 1464 . . 1461 1465 + HinfI GANTC 1461 1464 . . 1464 1468 - MboII GAAGA 1456 1455 . . 1469 1472 + TaiI ACGT 1472 1468 . . 1469 1472 + SetI ASST 1472 1468 . . 1469 1472 + MaeII ACGT 1469 1471 . . 1474 1477 + MnlI CCTC 1484 1483 . . 1475 1479 + DdeI CTNAG 1475 1478 . . 1475 1479 + BspCNI CTCAG 1488 1486 . . 1475 1479 + BseMII CTCAG 1489 1487 . . 1480 1484 + Hpy188I TCNGA 1482 1481 . . 1481 1485 + DdeI CTNAG 1481 1484 . . 1481 1485 - BspCNI CTCAG 1473 1471 . . 1481 1485 - BseMII CTCAG 1472 1470 . . 1483 1486 - MnlI CCTC 1476 1475 . . 1494 1499 + EciI GGCGGA 1510 1508 . . 1495 1498 - AciI CCGC 1495 1497 . . 1508 1511 + TspEI AATT 1507 1511 . . 1522 1525 + MnlI CCTC 1532 1531 . . 1526 1529 + CviRI* TGCA 1527 1527 . . 1530 1533 + TspEI AATT 1529 1533 . . 1537 1541 - HphI GGTGA 1529 1528 . . 1554 1557 + SetI ASST 1557 1553 . . 1555 1565 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 1561 1558 . . 1572 1577 + Hpy178III* TCNNGA 1573 1575 . . 1595 1600 + Hpy166II GTNNAC 1597 1597 . . 1606 1609 + MseI TTAA 1606 1608 . . 1629 1634 + BclI TGATCA 1629 1633 . . 1630 1633 + DpnI GATC 1631 1631 . . 1630 1633 + BstKTI GATC 1632 1630 . . 1630 1633 + MboI GATC 1629 1633 . . 1656 1661 + NlaIV GGNNCC 1658 1658 . . 1659 1664 + Hpy178III* TCNNGA 1660 1662 . . 1668 1672 + FokI GGATG 1681 1685 . . 1668 1672 + BseGI GGATG 1674 1672 . . 1669 1673 - BccI CCATC 1663 1664 . . 1680 1685 + MmeI TCCRAC 1705 1703 . . 1680 1684 + Hpy188I TCNGA 1682 1681 . . 1685 1691 + AarI CACCTGC 1695 1699 . . 1686 1689 + SetI ASST 1689 1685 . . 1686 1691 + BspMI ACCTGC 1695 1699 . . 1689 1692 + CviRI* TGCA 1690 1690 . . 1692 1695 + TspEI AATT 1691 1695 . . 1700 1703 + CviJI RGCY 1701 1701 . . 1707 1710 + SetI ASST 1710 1706 . . 1715 1719 + BmgT120I GGNCC 1716 1717 . . 1715 1719 + AvaII GGWCC 1715 1718 . . 1715 1719 + AsuI* GGNCC 1715 1718 . . 1717 1722 + BetI* WCCGGW 1717 1721 . . 1718 1721 + HpaII CCGG 1718 1720 . . 1721 1726 + Hpy166II GTNNAC 1723 1723 . . 1740 1743 + CviJI RGCY 1741 1741 . . 1739 1744 - TsoI TARCCA 1729 1727 . . 1751 1755 + Tsp4CI* ACNGT 1753 1752 . . 1757 1761 - TspDTI ATGAA 1747 1745 . . 1766 1771 + AclI AACGTT 1767 1769 . . 1767 1770 + TaiI ACGT 1770 1766 . . 1767 1770 + SetI ASST 1770 1766 . . 1767 1770 + MaeII ACGT 1767 1769 . . 1779 1784 + SduI GDGCHC 1783 1779 . . 1779 1784 + BseSI GKGCMC 1783 1779 . . 1777 1780 - MnlI CCTC 1770 1769 . . 1781 1792 + AlfI GCANNNNNNTGC 1770 1768 1804 1802 1781 1792 - AlfI GCANNNNNNTGC 1804 1802 1770 1768 1826 1830 + Tsp4CI* ACNGT 1828 1827 . . 1861 1865 + Tsp4CI* ACNGT 1863 1862 . . 1867 1872 + NlaIV GGNNCC 1869 1869 . . 1871 1874 + MnlI CCTC 1881 1880 . . 1885 1888 + MseI TTAA 1885 1887 . . 1887 1890 + TspEI AATT 1886 1890 . . 1891 1894 + FatI CATG 1890 1894 . . 1891 1894 + NlaIII CATG 1894 1890 . . 1891 1894 + CviAII CATG 1891 1893 . . 1889 1893 - TspDTI ATGAA 1879 1877 . . 1897 1901 + MaeIII GTNAC 1896 1901 . . 1911 1917 + PpuMI RGGWCCY 1912 1915 . . 1911 1917 + DraII RGGNCCY 1912 1915 . . 1911 1915 + BslFI GGGAC 1925 1929 . . 1911 1916 + NlaIV GGNNCC 1913 1913 . . 1912 1916 + BmgT120I GGNCC 1913 1914 . . 1912 1916 + AvaII GGWCC 1912 1915 . . 1912 1916 + AsuI* GGNCC 1912 1915 . . 1914 1917 + SetI ASST 1917 1913 . . 1915 1918 + MnlI CCTC 1925 1924 . . 1916 1921 + SmlI CTYRAG 1916 1920 . . 1916 1921 - Bce83I* CTTGAG 1901 1899 . . 1928 1932 + DdeI CTNAG 1928 1931 . . 1940 1944 + MaeIII GTNAC 1939 1944 . . 1957 1962 + Hpy166II GTNNAC 1959 1959 . . 1957 1962 + HpaI GTTAAC 1959 1959 . . 1957 1962 + HindII GTYRAC 1959 1959 . . 1958 1961 + MseI TTAA 1958 1960 . . 1968 1972 + MaeIII GTNAC 1967 1972 . . 1966 1971 - TsoI TARCCA 1956 1954 . . 1992 1995 + SetI ASST 1995 1991 . . 1999 2003 + HphI GGTGA 2011 2010 . . 2007 2012 - BsrDI GCAATG 2006 2004 . . 2011 2014 - AciI CCGC 2011 2013 . . 2015 2019 + BceAI ACGGC 2031 2033 . . 2017 2020 + CviJI RGCY 2018 2018 . . 2017 2020 + HaeIII GGCC 2018 2018 . . 2017 2021 + BmgT120I GGNCC 2018 2019 . . 2017 2021 + AsuI* GGNCC 2017 2020 . . 2028 2031 - MnlI CCTC 2021 2020 . . 2034 2037 + TspEI AATT 2033 2037 . . 2045 2050 + MfeI CAATTG 2045 2049 . . 2041 2045 - BsmAI GTCTC 2035 2039 . . 2046 2049 + TspEI AATT 2045 2049 . . 2049 2052 + CviRI* TGCA 2050 2050 . . 2055 2058 + CviJI RGCY 2056 2056 . . 2053 2056 - MnlI CCTC 2046 2045 . . 2073 2077 + FokI GGATG 2086 2090 . . 2073 2077 + BseGI GGATG 2079 2077 . . 2077 2081 + MaeIII GTNAC 2076 2081 . . 2088 2091 + CviJI RGCY 2089 2089 . . 2090 2095 + SecI* CCNNGG 2090 2094 . . 2091 2095 + BssKI CCNGG 2090 2095 . . 2091 2095 + BseBI CCWGG 2092 2093 . . 2091 2095 + ScrFI CCNGG 2092 2093 . . 2091 2095 + EcoRII CCWGG 2090 2095 . . 2116 2119 + FatI CATG 2115 2119 . . 2116 2119 + NlaIII CATG 2119 2115 . . 2116 2119 + CviAII CATG 2116 2118 . . 2124 2128 + HinfI GANTC 2124 2127 . . 2124 2128 - PleI GAGTC 2118 2119 . . 2124 2128 - MlyI GAGTC 2118 2118 . . 2129 2133 - TspGWI ACGGA 2119 2117 . . 2134 2138 + PleI GAGTC 2142 2143 . . 2134 2138 + MlyI GAGTC 2143 2143 . . 2134 2138 + HinfI GANTC 2134 2137 . . 2143 2146 - MnlI CCTC 2136 2135 . . 2149 2154 + AclI AACGTT 2150 2152 . . 2150 2153 + TaiI ACGT 2153 2149 . . 2150 2153 + SetI ASST 2153 2149 . . 2150 2153 + MaeII ACGT 2150 2152 . . 2159 2164 + NlaIV GGNNCC 2161 2161 . . 2168 2172 + TspDTI ATGAA 2183 2181 . . 2187 2190 + SetI ASST 2190 2186 . . 2185 2190 - BspMI ACCTGC 2176 2180 . . 2196 2199 + SetI ASST 2199 2195 . . 2196 2199 + CviJI RGCY 2197 2197 . . 2196 2199 + AluI AGCT 2197 2197 . . 2198 2203 + Eco57MI CTGRAG 2219 2217 . . 2198 2203 + Eco57I CTGAAG 2219 2217 . . 2206 2209 + TspEI AATT 2205 2209 . . 2237 2242 - TsoI TARCCA 2227 2225 . . 2247 2250 + SetI ASST 2250 2246 . . 2248 2253 + NlaIV GGNNCC 2250 2250 . . 2245 2250 - BspMI ACCTGC 2236 2240 . . 2252 2257 + StyI CCWWGG 2252 2256 . . 2252 2257 + SecI* CCNNGG 2252 2256 . . 2259 2263 - TspDTI ATGAA 2249 2247 . . 2266 2271 + VspI ATTAAT 2267 2269 . . 2267 2270 + MseI TTAA 2267 2269 . . 2274 2277 + FnuDII* CGCG 2275 2275 . . 2275 2278 + Hin6I GCGC 2275 2277 . . 2275 2278 + GlaI GCGC 2276 2276 . . 2275 2278 + HhaI GCGC 2277 2275 . . 2286 2289 + SetI ASST 2289 2285 . . 2286 2289 + CviJI RGCY 2287 2287 . . 2286 2289 + AluI AGCT 2287 2287 . . 2313 2316 + SetI ASST 2316 2312 . . 2311 2315 - Hin4II* CCTTC 2305 2304 . . 2315 2320 + Hpy166II GTNNAC 2317 2317 . . 2319 2322 + TaiI ACGT 2322 2318 . . 2319 2322 + SetI ASST 2322 2318 . . 2319 2322 + MaeII ACGT 2319 2321 . . 2341 2344 + DpnI GATC 2342 2342 . . 2341 2344 + BstKTI GATC 2343 2341 . . 2341 2344 + MboI GATC 2340 2344 . . 2345 2348 + Csp6I GTAC 2345 2347 . . 2345 2348 + RsaI GTAC 2346 2346 . . 2347 2350 + SetI ASST 2350 2346 . . 2352 2355 + SetI ASST 2355 2351 . . 2353 2356 + MnlI CCTC 2363 2362 . . 2368 2378 + Hin4I GAYNNNNNVTC 2359 2354 2391 2386 2383 2387 + PleI GAGTC 2391 2392 . . 2383 2387 + MlyI GAGTC 2392 2392 . . 2383 2387 + HinfI GANTC 2383 2386 . . 2391 2394 + SetI ASST 2394 2390 . . 2418 2421 + SetI ASST 2421 2417 . . 2417 2420 - MnlI CCTC 2410 2409 . . 2434 2439 + ApoI RAATTY 2434 2438 . . 2435 2438 + TspEI AATT 2434 2438 . . 2445 2459 + XcmI CCANNNNNNNNNTGG 2452 2451 . . 2445 2455 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2451 2448 . . 2445 2455 + PflMI CCANNNNNTGG 2451 2448 . . 2446 2449 + FatI CATG 2445 2449 . . 2446 2449 + NlaIII CATG 2449 2445 . . 2446 2449 + CviAII CATG 2446 2448 . . 2448 2451 + CviRI* TGCA 2449 2449 . . 2449 2454 + BsrDI GCAATG 2456 2454 . . 2453 2458 - TaqII CACCCA 2443 2441 . . 2460 2465 + Hpy178III* TCNNGA 2461 2463 . . 2466 2469 + SetI ASST 2469 2465 . . 2464 2468 - Hin4II* CCTTC 2458 2457 . . 2473 2478 + ClaI ATCGAT 2474 2476 . . 2474 2477 + TaqI TCGA 2474 2476 . . 2480 2483 + AciI CCGC 2480 2482 . . 2482 2486 - BceAI ACGGC 2467 2469 . . 2476 2486 - BaeI ACNNNNGTAYC 2501 2496 2468 2463 2493 2496 + CviJI RGCY 2494 2494 . . 2502 2505 + SetI ASST 2505 2501 . . 2514 2517 + TaiI ACGT 2517 2513 . . 2514 2517 + SetI ASST 2517 2513 . . 2514 2517 + MaeII ACGT 2514 2516 . . 2515 2519 + Hpy99I CGWCG 2519 2514 . . 2529 2532 + SetI ASST 2532 2528 . . 2529 2532 + CviJI RGCY 2530 2530 . . 2529 2532 + AluI AGCT 2530 2530 . . 2532 2537 + XbaI TCTAGA 2532 2536 . . 2532 2537 + Hpy178III* TCNNGA 2533 2535 . . 2533 2536 + MaeI CTAG 2533 2535 . . 2536 2540 + MboII GAAGA 2548 2547 . . 2539 2544 + EcoRV GATATC 2541 2541 . . 2544 2547 + FatI CATG 2543 2547 . . 2544 2547 + NlaIII CATG 2547 2543 . . 2544 2547 + CviAII CATG 2544 2546 . . 2549 2553 - TspDTI ATGAA 2539 2537 . . 2582 2586 + MaeIII GTNAC 2581 2586 . . 2584 2589 + AclI AACGTT 2585 2587 . . 2585 2588 + TaiI ACGT 2588 2584 . . 2585 2588 + SetI ASST 2588 2584 . . 2585 2588 + MaeII ACGT 2585 2587 . . 2605 2609 + HphI GGTGA 2617 2616 . . 2608 2612 + MboII GAAGA 2620 2619 . . 2611 2615 - BccI CCATC 2605 2606 . . 2619 2623 + FokI GGATG 2632 2636 . . 2619 2623 + BseGI GGATG 2625 2623 . . 2623 2627 + BlsI GCNGC 2625 2624 . . 2623 2627 + BisI GCNGC 2624 2625 . . 2623 2627 + TseI GCWGC 2623 2626 . . 2620 2624 - SfaNI GCATC 2610 2614 . . 2625 2630 + MstI* TGCGCA 2627 2627 . . 2626 2629 + Hin6I GCGC 2626 2628 . . 2626 2629 + GlaI GCGC 2627 2627 . . 2626 2629 + HhaI GCGC 2628 2626 . . 2623 2627 - BbvI GCAGC 2610 2614 . . 2647 2650 + MaeI CTAG 2647 2649 . . 2662 2665 + CviJI RGCY 2663 2663 . . 2662 2667 + NlaIV GGNNCC 2664 2664 . . 2665 2669 + Hpy188I TCNGA 2667 2666 . . 2670 2673 + CviRI* TGCA 2671 2671 . . 2671 2675 + BlsI GCNGC 2673 2672 . . 2671 2675 + BisI GCNGC 2672 2673 . . 2671 2675 + BbvI GCAGC 2683 2687 . . 2671 2675 + TseI GCWGC 2671 2674 . . 2668 2672 - SfaNI GCATC 2658 2662 . . 2673 2676 + SetI ASST 2676 2672 . . 2673 2676 + CviJI RGCY 2674 2674 . . 2673 2676 + AluI AGCT 2674 2674 . . 2725 2728 + DpnI GATC 2726 2726 . . 2725 2728 + BstKTI GATC 2727 2725 . . 2725 2728 + MboI GATC 2724 2728 . . 2729 2732 + MnlI CCTC 2739 2738 . . 2725 2729 - BinI* GGATC 2719 2720 . . 2740 2744 + TfiI GAWTC 2740 2743 . . 2740 2744 + HinfI GANTC 2740 2743 . . 2743 2748 + Hpy178III* TCNNGA 2744 2746 . . 2743 2748 + BetI* WCCGGW 2743 2747 . . 2743 2748 + BspMII* TCCGGA 2743 2747 . . 2744 2747 + HpaII CCGG 2744 2746 . . 2746 2751 + XhoII RGATCY 2746 2750 . . 2746 2750 + BinI* GGATC 2754 2755 . . 2747 2750 + DpnI GATC 2748 2748 . . 2747 2750 + BstKTI GATC 2749 2747 . . 2747 2750 + MboI GATC 2746 2750 . . 2749 2753 + Hpy188I TCNGA 2751 2750 . . 2750 2754 + DdeI CTNAG 2750 2753 . . 2750 2754 - BspCNI CTCAG 2742 2740 . . 2750 2754 - BseMII CTCAG 2741 2739 . . 2783 2789 + PfoI TCCNGGA 2783 2788 . . 2784 2788 + BssKI CCNGG 2783 2788 . . 2784 2788 + BseBI CCWGG 2785 2786 . . 2784 2788 + ScrFI CCNGG 2785 2786 . . 2784 2788 + EcoRII CCWGG 2783 2788 . . 2787 2791 + FokI GGATG 2800 2804 . . 2787 2791 + BseGI GGATG 2793 2791 . . 2789 2793 + TspDTI ATGAA 2804 2802 . . 2791 2795 + MboII GAAGA 2803 2802 . . 2804 2807 + TspEI AATT 2803 2807 . . 2815 2818 + DpnI GATC 2816 2816 . . 2815 2818 + BstKTI GATC 2817 2815 . . 2815 2818 + MboI GATC 2814 2818 . . 2821 2826 + ApoI RAATTY 2821 2825 . . 2822 2825 + TspEI AATT 2821 2825 . . 2829 2832 - MnlI CCTC 2822 2821 . . 2848 2852 + HphI GGTGA 2860 2859 . . 2845 2849 - BccI CCATC 2839 2840 . . 2858 2862 + BsrI ACTGG 2863 2861 . . 2860 2865 + BalI TGGCCA 2862 2862 . . 2860 2865 + CfrI YGGCCR 2860 2864 . . 2861 2864 + CviJI RGCY 2862 2862 . . 2861 2864 + HaeIII GGCC 2862 2862 . . 2872 2877 + Hpy166II GTNNAC 2874 2874 . . 2872 2877 + HindII GTYRAC 2874 2874 . . 2869 2873 - BsrI ACTGG 2869 2867 . . 2883 2886 + TaiI ACGT 2886 2882 . . 2883 2886 + SetI ASST 2886 2882 . . 2883 2886 + MaeII ACGT 2883 2885 . . 2920 2923 + DpnI GATC 2921 2921 . . 2920 2923 + BstKTI GATC 2922 2920 . . 2920 2923 + MboI GATC 2919 2923 . . 2932 2936 + BccI CCATC 2940 2941 . . 2935 2939 + Hpy188I TCNGA 2937 2936 . . 2941 2944 + MseI TTAA 2941 2943 . . 2978 2981 + CviRI* TGCA 2979 2979 . . 3011 3015 + TspDTI ATGAA 3026 3024 . . 3015 3018 + TspEI AATT 3014 3018 . . 3029 3034 + GsaI CCCAGC 3033 3029 . . 3029 3034 + BseYI CCCAGC 3029 3033 . . 3039 3042 + CviRI* TGCA 3040 3040 . . 3037 3041 - SfaNI GCATC 3027 3031 . . 3043 3047 + MaeIII GTNAC 3042 3047 . . 3054 3059 - EcoP15I CAGCAG 3026 3028 . . 3066 3069 + TaiI ACGT 3069 3065 . . 3066 3069 + SetI ASST 3069 3065 . . 3066 3069 + MaeII ACGT 3066 3068 . . 3077 3082 + BalI TGGCCA 3079 3079 . . 3077 3082 + CfrI YGGCCR 3077 3081 . . 3078 3081 + CviJI RGCY 3079 3079 . . 3078 3081 + HaeIII GGCC 3079 3079 . . 3082 3087 + AflIII ACRYGT 3082 3086 . . 3083 3088 + BsaAI YACGTR 3085 3085 . . 3084 3087 + TaiI ACGT 3087 3083 . . 3084 3087 + SetI ASST 3087 3083 . . 3084 3087 + MaeII ACGT 3084 3086 . . 3101 3106 + TatI WGTACW 3101 3105 . . 3102 3105 + Csp6I GTAC 3102 3104 . . 3102 3105 + RsaI GTAC 3103 3103 . . 3125 3128 + TaqI TCGA 3125 3127 . . 3121 3126 - BsmI GAATGC 3121 3119 . . 3136 3139 + MseI TTAA 3136 3138 . . 3146 3149 + TaqI TCGA 3146 3148 . . 3148 3151 - MnlI CCTC 3141 3140 . . 3152 3163 + TstI CACNNNNNNTCC 3143 3138 3175 3170 3153 3163 + BsaXI ACNNNNNCTCC 3143 3140 3173 3170 3155 3158 + TspEI AATT 3154 3158 . . 3159 3162 + MnlI CCTC 3169 3168 . . 3161 3165 - TspGWI ACGGA 3151 3149 . . 3172 3177 + Hpy166II GTNNAC 3174 3174 . . 3175 3184 + MslI CAYNNNNRTG 3179 3179 . . 3175 3184 + OliI CACNNNNGTG 3179 3179 . . 3177 3182 + SecI* CCNNGG 3177 3181 . . 3178 3182 + BssKI CCNGG 3177 3182 . . 3178 3182 + BseBI CCWGG 3179 3180 . . 3178 3182 + ScrFI CCNGG 3179 3180 . . 3174 3178 - HphI GGTGA 3166 3165 . . 3178 3182 + EcoRII CCWGG 3177 3182 . . 3181 3185 + HphI GGTGA 3193 3192 . . 3199 3202 + MaeI CTAG 3199 3201 . . 3202 3206 + BlsI GCNGC 3204 3203 . . 3202 3206 + BisI GCNGC 3203 3204 . . 3202 3206 + BbvI GCAGC 3214 3218 . . 3202 3206 + TseI GCWGC 3202 3205 . . 3204 3207 + CviJI RGCY 3205 3205 . . 3207 3218 + BstXI CCANNNNNNTGG 3214 3210 . . 3217 3221 + HphI GGTGA 3229 3228 . . 3218 3223 + Hpy166II GTNNAC 3220 3220 . . 3225 3228 + CviJI RGCY 3226 3226 . . 3228 3237 + MslI CAYNNNNRTG 3232 3232 . . 3242 3245 + MseI TTAA 3242 3244 . . 3247 3250 + SetI ASST 3250 3246 . . 3248 3252 + Hin4II* CCTTC 3258 3257 . . 3252 3263 + BstXI CCANNNNNNTGG 3259 3255 . . 3259 3269 + MwoI GCNNNNNNNGC 3265 3262 . . 3280 3284 + MaeIII GTNAC 3279 3284 . . 3292 3296 - BslFI GGGAC 3277 3281 . . 3297 3307 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 3303 3300 . . 3300 3305 + AhaIII* TTTAAA 3302 3302 . . 3301 3304 + MseI TTAA 3301 3303 . . 3308 3313 + ApoI RAATTY 3308 3312 . . 3309 3312 + TspEI AATT 3308 3312 . . 3320 3325 + BalI TGGCCA 3322 3322 . . 3320 3325 + CfrI YGGCCR 3320 3324 . . 3321 3324 + CviJI RGCY 3322 3322 . . 3321 3324 + HaeIII GGCC 3322 3322 . . 3330 3333 + FatI CATG 3329 3333 . . 3330 3333 + NlaIII CATG 3333 3329 . . 3330 3333 + CviAII CATG 3330 3332 . . 3331 3335 + TspDTI ATGAA 3346 3344 . . 3340 3344 + Hin4II* CCTTC 3350 3349 . . 3349 3353 + Tsp4CI* ACNGT 3351 3350 . . 3352 3357 + Hpy166II GTNNAC 3354 3354 . . 3352 3357 + BssNAI GTATAC 3354 3354 . . 3352 3357 + AccI GTMKAC 3353 3355 . . 3357 3361 + DdeI CTNAG 3357 3360 . . 3362 3365 + CviJI RGCY 3363 3363 . . 3364 3368 + BssKI CCNGG 3363 3368 . . 3364 3368 + BseBI CCWGG 3365 3366 . . 3364 3368 + ScrFI CCNGG 3365 3366 . . 3364 3368 + EcoRII CCWGG 3363 3368 . . 3370 3373 + FatI CATG 3369 3373 . . 3370 3373 + NlaIII CATG 3373 3369 . . 3370 3373 + CviAII CATG 3370 3372 . . 3373 3377 + BlsI GCNGC 3375 3374 . . 3373 3377 + BisI GCNGC 3374 3375 . . 3373 3377 + TseI GCWGC 3373 3376 . . 3373 3377 - BbvI GCAGC 3360 3364 . . 3379 3382 + DpnI GATC 3380 3380 . . 3379 3382 + BstKTI GATC 3381 3379 . . 3379 3382 + MboI GATC 3378 3382 . . 3381 3386 + Hpy178III* TCNNGA 3382 3384 . . 3398 3403 + BclI TGATCA 3398 3402 . . 3399 3402 + DpnI GATC 3400 3400 . . 3399 3402 + BstKTI GATC 3401 3399 . . 3399 3402 + MboI GATC 3398 3402 . . 3401 3405 + Hpy188I TCNGA 3403 3402 . . 3403 3408 + XhoII RGATCY 3403 3407 . . 3403 3408 + BglII AGATCT 3403 3407 . . 3404 3414 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3395 3390 3427 3422 3404 3407 + DpnI GATC 3405 3405 . . 3404 3407 + BstKTI GATC 3406 3404 . . 3404 3407 + MboI GATC 3403 3407 . . 3413 3416 + TaqI TCGA 3413 3415 . . 3404 3414 - Hin4I GAYNNNNNVTC 3427 3422 3395 3390 3426 3431 + AhaIII* TTTAAA 3428 3428 . . 3427 3430 + MseI TTAA 3427 3429 . . 3436 3440 + Tsp45I GTSAC 3435 3440 . . 3436 3440 + MaeIII GTNAC 3435 3440 . . 3448 3452 + Hpy188I TCNGA 3450 3449 . . 3446 3451 - Eco57MI CTGRAG 3431 3429 . . 3446 3451 - Eco57I CTGAAG 3431 3429 . . 3452 3457 + ApoI RAATTY 3452 3456 . . 3453 3456 + TspEI AATT 3452 3456 . . 3463 3466 + DpnI GATC 3464 3464 . . 3463 3466 + BstKTI GATC 3465 3463 . . 3463 3472 + BsaBI GATNNNNATC 3467 3467 . . 3463 3466 + MboI GATC 3462 3466 . . 3465 3470 + Hpy178III* TCNNGA 3466 3468 . . 3463 3467 - BinI* GGATC 3457 3458 . . 3469 3472 + DpnI GATC 3470 3470 . . 3469 3472 + BstKTI GATC 3471 3469 . . 3469 3472 + MboI GATC 3468 3472 . . 3469 3473 - BinI* GGATC 3463 3464 . . 3474 3477 + TaiI ACGT 3477 3473 . . 3474 3477 + SetI ASST 3477 3473 . . 3474 3477 + MaeII ACGT 3474 3476 . . 3480 3491 + TstI CACNNNNNNTCC 3471 3466 3503 3498 3481 3485 + Tsp4CI* ACNGT 3483 3482 . . 3489 3494 + Hpy178III* TCNNGA 3490 3492 . . 3493 3497 + MboII GAAGA 3505 3504 . . 3497 3501 + TspDTI ATGAA 3512 3510 . . 3499 3503 + MboII GAAGA 3511 3510 . . 3504 3507 + TspEI AATT 3503 3507 . . 3509 3514 + MmeI TCCRAC 3534 3532 . . 3515 3519 - TspDTI ATGAA 3505 3503 . . 3531 3535 + FokI GGATG 3544 3548 . . 3531 3535 + BseGI GGATG 3537 3535 . . 3533 3537 + TspDTI ATGAA 3548 3546 . . 3535 3539 + MboII GAAGA 3547 3546 . . 3540 3543 + CviJI RGCY 3541 3541 . . 3535 3540 - Ksp632I* CTCTTC 3530 3533 . . 3538 3541 - MnlI CCTC 3531 3530 . . 3556 3566 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3547 3542 3579 3574 3556 3566 - Hin4I GAYNNNNNVTC 3579 3574 3547 3542 3567 3570 + SetI ASST 3570 3566 . . 3568 3573 + StyI CCWWGG 3568 3572 . . 3568 3573 + SecI* CCNNGG 3568 3572 . . 3565 3569 - HphI GGTGA 3557 3556 . . 3571 3576 - TsoI TARCCA 3561 3559 . . 3579 3582 + TaiI ACGT 3582 3578 . . 3579 3582 + SetI ASST 3582 3578 . . 3579 3582 + MaeII ACGT 3579 3581 . . 3582 3587 + Hpy178III* TCNNGA 3583 3585 . . 3588 3592 + BsrI ACTGG 3593 3591 . . 3591 3595 + BinI* GGATC 3599 3600 . . 3592 3595 + DpnI GATC 3593 3593 . . 3592 3595 + BstKTI GATC 3594 3592 . . 3592 3595 + MboI GATC 3591 3595 . . 3596 3601 + BsgI GTGCAG 3617 3615 . . 3597 3600 + CviRI* TGCA 3598 3598 . . 3598 3602 + BlsI GCNGC 3600 3599 . . 3598 3602 + BisI GCNGC 3599 3600 . . 3598 3602 + BbvI GCAGC 3610 3614 . . 3598 3602 + TseI GCWGC 3598 3601 . . 3601 3606 + BsrDI GCAATG 3608 3606 . . 3604 3608 + TspDTI ATGAA 3619 3617 . . 3619 3622 + MseI TTAA 3619 3621 . . 3632 3635 + SetI ASST 3635 3631 . . 3637 3641 + HphI GGTGA 3649 3648 . . 3644 3648 + TfiI GAWTC 3644 3647 . . 3644 3648 + HinfI GANTC 3644 3647 . . 3685 3689 + Hpy188I TCNGA 3687 3686 . . 3686 3691 + Eco57MI CTGRAG 3707 3705 . . 3686 3691 + Eco57I CTGAAG 3707 3705 . . 3688 3692 + MboII GAAGA 3700 3699 . . 3688 3693 + BbvII* GAAGAC 3695 3699 . . 3707 3712 + BclI TGATCA 3707 3711 . . 3708 3711 + DpnI GATC 3709 3709 . . 3708 3711 + BstKTI GATC 3710 3708 . . 3708 3711 + MboI GATC 3707 3711 . . 3711 3715 - FokI GGATG 3697 3701 . . 3711 3715 - BseGI GGATG 3710 3708 . . 3713 3717 - TspGWI ACGGA 3703 3701 . . 3738 3742 + Tsp45I GTSAC 3737 3742 . . 3738 3742 + MaeIII GTNAC 3737 3742 . . 3742 3745 + MaeI CTAG 3742 3744 . . 3745 3749 - SfaNI GCATC 3735 3739 . . 3749 3753 + DdeI CTNAG 3749 3752 . . 3749 3753 - BspCNI CTCAG 3741 3739 . . 3749 3753 - BseMII CTCAG 3740 3738 . . 3755 3760 + Eco57MI CTGRAG 3776 3774 . . 3751 3755 - BsmAI GTCTC 3745 3749 . . 3755 3760 + Eco57I CTGAAG 3776 3774 . . 3763 3767 + MboII GAAGA 3775 3774 . . 3766 3770 + MboII GAAGA 3778 3777 . . 3769 3772 + DpnI GATC 3770 3770 . . 3769 3772 + BstKTI GATC 3771 3769 . . 3769 3772 + MboI GATC 3768 3772 . . 3772 3777 + NdeI CATATG 3773 3775 . . 3780 3784 + MboII GAAGA 3792 3791 . . 3786 3789 + TspEI AATT 3785 3789 . . 3808 3813 + SspI AATATT 3810 3810 . . 3818 3823 + BsaAI YACGTR 3820 3820 . . 3819 3822 + TaiI ACGT 3822 3818 . . 3819 3822 + SetI ASST 3822 3818 . . 3819 3822 + MaeII ACGT 3819 3821 . . 3836 3839 + TaqI TCGA 3836 3838 . . 3848 3853 + Hpy178III* TCNNGA 3849 3851 . . 3848 3853 + BspHI TCATGA 3848 3852 . . 3849 3852 + FatI CATG 3848 3852 . . 3849 3852 + NlaIII CATG 3852 3848 . . 3849 3852 + CviAII CATG 3849 3851 . . 3853 3857 + TspDTI ATGAA 3868 3866 . . 3863 3867 + Tsp4CI* ACNGT 3865 3864 . . 3871 3874 + Csp6I GTAC 3871 3873 . . 3871 3874 + RsaI GTAC 3872 3872 . . 3879 3884 + MmeI TCCRAC 3904 3902 . . 3883 3887 + BsrI ACTGG 3888 3886 . . 3886 3890 + HphI GGTGA 3898 3897 . . 3893 3896 + TaiI ACGT 3896 3892 . . 3893 3896 + SetI ASST 3896 3892 . . 3893 3896 + MaeII ACGT 3893 3895 . . 3896 3899 + MseI TTAA 3896 3898 . . 3900 3905 + NlaIV GGNNCC 3902 3902 . . 3903 3906 + SetI ASST 3906 3902 . . 3910 3915 - TaqII CACCCA 3900 3898 . . 3915 3920 - MmeI TCCRAC 3896 3894 . . 3925 3929 - BccI CCATC 3919 3920 . . 3931 3936 + Hpy166II GTNNAC 3933 3933 . . 3931 3936 + HpaI GTTAAC 3933 3933 . . 3931 3936 + HindII GTYRAC 3933 3933 . . 3932 3935 + MseI TTAA 3932 3934 . . 3940 3944 + Hpy188I TCNGA 3942 3941 . . 3941 3946 + Eco57MI CTGRAG 3962 3960 . . 3941 3946 + Eco57I CTGAAG 3962 3960 . . 3952 3956 + Tsp4CI* ACNGT 3954 3953 . . 3958 3962 + BssKI CCNGG 3957 3962 . . 3958 3962 + BseBI CCWGG 3959 3960 . . 3958 3962 + ScrFI CCNGG 3959 3960 . . 3958 3962 + EcoRII CCWGG 3957 3962 . . 3965 3968 + TaqI TCGA 3965 3967 . . 3977 3981 + TfiI GAWTC 3977 3980 . . 3977 3981 + HinfI GANTC 3977 3980 . . 3992 3996 + Hin4II* CCTTC 4002 4001 . . 3994 3998 - TspDTI ATGAA 3984 3982 . . 4015 4018 + MaeI CTAG 4015 4017 . . 4017 4020 + SetI ASST 4020 4016 . . 4026 4029 + SetI ASST 4029 4025 . . 4026 4029 + CviJI RGCY 4027 4027 . . 4026 4029 + AluI AGCT 4027 4027 . . 4027 4037 + MwoI GCNNNNNNNGC 4033 4030 . . 4034 4039 + BsgI GTGCAG 4055 4053 . . 4035 4038 + CviRI* TGCA 4036 4036 . . 4036 4040 + BlsI GCNGC 4038 4037 . . 4036 4040 + BisI GCNGC 4037 4038 . . 4036 4040 + BbvI GCAGC 4048 4052 . . 4036 4040 + TseI GCWGC 4036 4039 . . 4038 4041 + CviJI RGCY 4039 4039 . . 4054 4059 + Hpy166II GTNNAC 4056 4056 . . 4072 4076 + Hpy188I TCNGA 4074 4073 . . 4075 4079 - BccI CCATC 4069 4070 . . 4087 4092 + Hpy166II GTNNAC 4089 4089 . . 4087 4092 + HpaI GTTAAC 4089 4089 . . 4087 4092 + HindII GTYRAC 4089 4089 . . 4088 4091 + MseI TTAA 4088 4090 . . 4094 4098 + Tsp4CI* ACNGT 4096 4095 . . 4095 4105 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 4101 4098 . . 4099 4104 + NdeI CATATG 4100 4102 . . 4104 4107 + CviJI RGCY 4105 4105 . . 4115 4118 + TaqI TCGA 4115 4117 . . 4131 4136 + StyI CCWWGG 4131 4135 . . 4131 4136 + SecI* CCNNGG 4131 4135 . . 4134 4137 + SetI ASST 4137 4133 . . 4138 4141 + CviJI RGCY 4139 4139 . . 4141 4144 + MseI TTAA 4141 4143 . . 4150 4154 + MaeIII GTNAC 4149 4154 . . 4159 4162 + FatI CATG 4158 4162 . . 4159 4162 + NlaIII CATG 4162 4158 . . 4159 4162 + CviAII CATG 4159 4161 . . 4172 4175 + DpnI GATC 4173 4173 . . 4172 4175 + BstKTI GATC 4174 4172 . . 4172 4175 + MboI GATC 4171 4175 . . 4182 4185 + SetI ASST 4185 4181 . . 4183 4188 + NlaIV GGNNCC 4185 4185 . . 4183 4188 + HgiCI* GGYRCC 4183 4187 . . 4189 4192 + MseI TTAA 4189 4191 . . 4200 4204 - TspDTI ATGAA 4190 4188 . . 4207 4211 + MboII GAAGA 4219 4218 . . 4213 4217 + Tsp4CI* ACNGT 4215 4214 . . 4217 4220 + TaqI TCGA 4217 4219 . . 4220 4225 + ApoI RAATTY 4220 4224 . . 4221 4224 + TspEI AATT 4220 4224 . . 4233 4236 + SetI ASST 4236 4232 . . 4233 4236 + CviJI RGCY 4234 4234 . . 4233 4236 + AluI AGCT 4234 4234 . . 4245 4248 + CviJI RGCY 4246 4246 . . 4241 4246 - Eco57MI CTGRAG 4226 4224 . . 4241 4246 - Eco57I CTGAAG 4226 4224 . . 4250 4253 + TspEI AATT 4249 4253 . . 4273 4277 + Hpy188I TCNGA 4275 4274 . . 4299 4302 + CviJI RGCY 4300 4300 . . 4299 4304 + NlaIV GGNNCC 4301 4301 . . 4309 4314 + KpnI GGTACC 4313 4309 . . 4309 4314 + NlaIV GGNNCC 4311 4311 . . 4309 4314 + HgiCI* GGYRCC 4309 4313 . . 4309 4314 + Acc65I GGTACC 4309 4313 . . 4310 4313 + Csp6I GTAC 4310 4312 . . 4310 4313 + RsaI GTAC 4311 4311 . . 4312 4317 + Cfr10I RCCGGY 4312 4316 . . 4312 4317 + BetI* WCCGGW 4312 4316 . . 4312 4317 + AgeI ACCGGT 4312 4316 . . 4313 4316 + HpaII CCGG 4313 4315 . . 4317 4320 + CviRI* TGCA 4318 4318 . . 4332 4335 + DpnI GATC 4333 4333 . . 4332 4335 + BstKTI GATC 4334 4332 . . 4332 4335 + MboI GATC 4331 4335 . . 4333 4338 + ClaI ATCGAT 4334 4336 . . 4334 4337 + TaqI TCGA 4334 4336 . . 4336 4346 + Hin4I GAYNNNNNVTC 4327 4322 4359 4354 4339 4344 + BseRI GAGGAG 4354 4352 . . 4342 4346 + PleI GAGTC 4350 4351 . . 4339 4342 - MnlI CCTC 4332 4331 . . 4342 4346 + MlyI GAGTC 4351 4351 . . 4342 4346 + HinfI GANTC 4342 4345 . . 4344 4348 + Tsp45I GTSAC 4343 4348 . . 4344 4348 + MaeIII GTNAC 4343 4348 . . 4346 4352 + TspRI CASTGNN 4352 4343 . . 4336 4346 - Hin4I GAYNNNNNVTC 4359 4354 4327 4322 4347 4351 + BsrI ACTGG 4352 4350 . . 4358 4363 + NspI RCATGY 4362 4358 . . 4359 4362 + FatI CATG 4358 4362 . . 4359 4362 + NlaIII CATG 4362 4358 . . 4359 4362 + CviAII CATG 4359 4361 . . 4379 4383 + DdeI CTNAG 4379 4382 . . 4379 4383 - BspCNI CTCAG 4371 4369 . . 4379 4383 - BseMII CTCAG 4370 4368 . . 4387 4391 + MboII GAAGA 4399 4398 . . 4387 4392 + BbvII* GAAGAC 4394 4398 . . 4391 4395 + TspGWI ACGGA 4406 4404 . . 4399 4403 - BccI CCATC 4393 4394 . . 4405 4410 + AcyI GRCGYC 4406 4408 . . 4408 4412 + Tsp45I GTSAC 4407 4412 . . 4408 4412 + MaeIII GTNAC 4407 4412 . . 4406 4410 - HgaI GACGC 4395 4400 . . 4418 4422 + Tsp4CI* ACNGT 4420 4419 . . 4421 4425 + MaeIII GTNAC 4420 4425 . . 4443 4446 + CviRI* TGCA 4444 4444 . . 4446 4451 + XhoII RGATCY 4446 4450 . . 4446 4451 + BglII AGATCT 4446 4450 . . 4447 4450 + DpnI GATC 4448 4448 . . 4447 4450 + BstKTI GATC 4449 4447 . . 4447 4450 + MboI GATC 4446 4450 . . 4449 4454 + Hpy178III* TCNNGA 4450 4452 . . 4454 4457 + TaiI ACGT 4457 4453 . . 4454 4457 + SetI ASST 4457 4453 . . 4454 4457 + MaeII ACGT 4454 4456 . . 4457 4460 + MseI TTAA 4457 4459 . . 4466 4469 + SetI ASST 4469 4465 . . 4466 4469 + CviJI RGCY 4467 4467 . . 4466 4469 + AluI AGCT 4467 4467 . . 4479 4482 + SetI ASST 4482 4478 . . 4480 4483 + MnlI CCTC 4490 4489 . . 4477 4481 - HphI GGTGA 4469 4468 . . 4489 4493 + TfiI GAWTC 4489 4492 . . 4489 4493 + HinfI GANTC 4489 4492 . . 4504 4508 + HgaI GACGC 4513 4518 . . 4512 4515 + CviJI RGCY 4513 4513 . . 4514 4519 + Eco57MI CTGRAG 4535 4533 . . 4514 4519 + GsuI CTGGAG 4535 4533 . . 4517 4520 - MnlI CCTC 4510 4509 . . 4529 4534 + SplI* CGTACG 4529 4533 . . 4530 4533 + Csp6I GTAC 4530 4532 . . 4530 4533 + RsaI GTAC 4531 4531 . . 4532 4536 + Tsp4CI* ACNGT 4534 4533 . . 4549 4553 + HphI GGTGA 4561 4560 . . 4554 4557 + CviJI RGCY 4555 4555 . . 4557 4562 + BtrI CACGTC 4559 4559 . . 4558 4561 + TaiI ACGT 4561 4557 . . 4558 4561 + SetI ASST 4561 4557 . . 4558 4561 + MaeII ACGT 4558 4560 . . 4559 4564 + Esp3I CGTCTC 4565 4569 . . 4560 4564 + BsmAI GTCTC 4565 4569 . . 4579 4583 + HphI GGTGA 4591 4590 . . 4587 4590 + SetI ASST 4590 4586 . . 4596 4602 + PfoI TCCNGGA 4596 4601 . . 4597 4601 + BssKI CCNGG 4596 4601 . . 4597 4601 + ScrFI CCNGG 4598 4599 . . 4597 4601 + CauII* CCSGG 4598 4599 . . 4597 4607 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 4603 4600 . . 4598 4601 + HpaII CCGG 4598 4600 . . 4601 4611 + Hin4I GAYNNNNNVTC 4592 4587 4624 4619 4607 4611 + PleI GAGTC 4615 4616 . . 4607 4611 + MlyI GAGTC 4616 4616 . . 4607 4611 + HinfI GANTC 4607 4610 . . 4609 4613 + BsmAI GTCTC 4614 4618 . . 4601 4611 - Hin4I GAYNNNNNVTC 4624 4619 4592 4587 4613 4616 + MnlI CCTC 4623 4622 . . 4611 4616 - BseRI GAGGAG 4602 4600 . . 4618 4622 + BssKI CCNGG 4617 4622 . . 4618 4622 + BseBI CCWGG 4619 4620 . . 4618 4622 + ScrFI CCNGG 4619 4620 . . 4618 4622 + EcoRII CCWGG 4617 4622 . . 4615 4619 - HphI GGTGA 4607 4606 . . 4621 4624 + CviJI RGCY 4622 4622 . . 4629 4634 + MmeI TCCRAC 4654 4652 . . 4642 4652 + BsaXI ACNNNNNCTCC 4632 4629 4662 4659 4654 4657 + SetI ASST 4657 4653 . . 4655 4658 + MnlI CCTC 4665 4664 . . 4658 4663 - Eco57MI CTGRAG 4643 4641 . . 4658 4663 - GsuI CTGGAG 4643 4641 . . 4665 4668 + Csp6I GTAC 4665 4667 . . 4665 4668 + RsaI GTAC 4666 4666 . . 4669 4673 - HphI GGTGA 4661 4660 . . 4681 4685 + BccI CCATC 4689 4690 . . 4678 4682 - HphI GGTGA 4670 4669 . . 4686 4689 + Csp6I GTAC 4686 4688 . . 4686 4689 + RsaI GTAC 4687 4687 . . 4690 4694 - HphI GGTGA 4682 4681 . . 4702 4706 + BccI CCATC 4710 4711 . . 4699 4703 - HphI GGTGA 4691 4690 . . 4707 4710 + Csp6I GTAC 4707 4709 . . 4707 4710 + RsaI GTAC 4708 4708 . . 4723 4727 + BccI CCATC 4731 4732 . . 4720 4724 - HphI GGTGA 4712 4711 . . 4728 4731 + Csp6I GTAC 4728 4730 . . 4728 4731 + RsaI GTAC 4729 4729 . . 4734 4737 + SetI ASST 4737 4733 . . 4732 4736 - HphI GGTGA 4724 4723 . . 4744 4748 + BccI CCATC 4752 4753 . . 4741 4745 - HphI GGTGA 4733 4732 . . 4753 4757 - HphI GGTGA 4745 4744 . . 4759 4762 + TaiI ACGT 4762 4758 . . 4759 4762 + SetI ASST 4762 4758 . . 4759 4762 + MaeII ACGT 4759 4761 . . 4761 4765 + Tsp45I GTSAC 4760 4765 . . 4761 4765 + MaeIII GTNAC 4760 4765 . . 4765 4769 + BccI CCATC 4773 4774 . . 4762 4766 - HphI GGTGA 4754 4753 . . 4780 4783 + TaiI ACGT 4783 4779 . . 4780 4783 + SetI ASST 4783 4779 . . 4780 4783 + MaeII ACGT 4780 4782 . . 4782 4786 + Tsp45I GTSAC 4781 4786 . . 4782 4786 + MaeIII GTNAC 4781 4786 . . 4786 4790 + BccI CCATC 4794 4795 . . 4783 4787 - HphI GGTGA 4775 4774 . . 4797 4807 + MwoI GCNNNNNNNGC 4803 4800 . . 4801 4804 + TaiI ACGT 4804 4800 . . 4801 4804 + SetI ASST 4804 4800 . . 4801 4804 + MaeII ACGT 4801 4803 . . 4802 4806 + Hpy99I CGWCG 4806 4801 . . 4807 4811 + BccI CCATC 4815 4816 . . 4818 4823 + MmeI TCCRAC 4843 4841 . . 4822 4825 + TaiI ACGT 4825 4821 . . 4822 4825 + SetI ASST 4825 4821 . . 4822 4825 + MaeII ACGT 4822 4824 . . 4824 4828 + Tsp45I GTSAC 4823 4828 . . 4824 4828 + MaeIII GTNAC 4823 4828 . . 4828 4832 + BccI CCATC 4836 4837 . . 4825 4829 - HphI GGTGA 4817 4816 . . 4839 4849 + MwoI GCNNNNNNNGC 4845 4842 . . 4843 4846 + TaiI ACGT 4846 4842 . . 4843 4846 + SetI ASST 4846 4842 . . 4843 4846 + MaeII ACGT 4843 4845 . . 4844 4848 + Hpy99I CGWCG 4848 4843 . . 4849 4853 + Hin4II* CCTTC 4859 4858 . . 4840 4853 - AjuI GAANNNNNNNTTGG 4865 4860 4833 4828 4863 4868 + BtrI CACGTC 4865 4865 . . 4864 4867 + TaiI ACGT 4867 4863 . . 4864 4867 + SetI ASST 4867 4863 . . 4864 4867 + MaeII ACGT 4864 4866 . . 4865 4869 + Hpy99I CGWCG 4869 4864 . . 4873 4876 + SetI ASST 4876 4872 . . 4873 4876 + CviJI RGCY 4874 4874 . . 4873 4876 + AluI AGCT 4874 4874 . . 4875 4880 + SfeI* CTRYAG 4875 4879 . . 4879 4882 + CviJI RGCY 4880 4880 . . 4885 4888 + TaiI ACGT 4888 4884 . . 4885 4888 + SetI ASST 4888 4884 . . 4885 4888 + MaeII ACGT 4885 4887 . . 4886 4891 + Esp3I CGTCTC 4892 4896 . . 4887 4891 + BsmAI GTCTC 4892 4896 . . 4891 4895 + Hin4II* CCTTC 4901 4900 . . 4912 4916 + BccI CCATC 4920 4921 . . 4927 4930 + TaiI ACGT 4930 4926 . . 4927 4930 + SetI ASST 4930 4926 . . 4927 4930 + MaeII ACGT 4927 4929 . . 4929 4933 + Tsp45I GTSAC 4928 4933 . . 4929 4933 + MaeIII GTNAC 4928 4933 . . 4930 4934 - HphI GGTGA 4922 4921 . . 4937 4941 + MaeIII GTNAC 4936 4941 . . 4942 4945 + CviJI RGCY 4943 4943 . . 4948 4951 + TaiI ACGT 4951 4947 . . 4948 4951 + SetI ASST 4951 4947 . . 4948 4951 + MaeII ACGT 4948 4950 . . 4950 4954 + Tsp45I GTSAC 4949 4954 . . 4950 4954 + MaeIII GTNAC 4949 4954 . . 4951 4955 - HphI GGTGA 4943 4942 . . 4958 4962 + MaeIII GTNAC 4957 4962 . . 4963 4966 + CviJI RGCY 4964 4964 . . 4969 4972 + TaiI ACGT 4972 4968 . . 4969 4972 + SetI ASST 4972 4968 . . 4969 4972 + MaeII ACGT 4969 4971 . . 4970 4975 + Esp3I CGTCTC 4976 4980 . . 4971 4975 + BsmAI GTCTC 4976 4980 . . 4977 4980 + CviJI RGCY 4978 4978 . . 4973 4978 - Eco57MI CTGRAG 4958 4956 . . 4973 4978 - GsuI CTGGAG 4958 4956 . . 4993 4997 - HphI GGTGA 4985 4984 . . 5017 5021 + Hin4II* CCTTC 5027 5026 . . 5012 5017 - BtgZI GCGATG 4997 5001 . . 5019 5023 - TspDTI ATGAA 5009 5007 . . 5028 5033 + MmeI TCCRAC 5053 5051 . . 5038 5042 + BccI CCATC 5046 5047 . . 5035 5039 - HphI GGTGA 5027 5026 . . 5039 5043 - FokI GGATG 5025 5029 . . 5039 5043 - BseGI GGATG 5038 5036 . . 5058 5061 + SetI ASST 5061 5057 . . 5059 5063 + Hin4II* CCTTC 5069 5068 . . 5056 5060 - HphI GGTGA 5048 5047 . . 5050 5063 - AjuI GAANNNNNNNTTGG 5075 5070 5043 5038 5074 5077 + SetI ASST 5077 5073 . . 5075 5078 + MnlI CCTC 5085 5084 . . 5085 5090 + SfeI* CTRYAG 5085 5089 . . 5089 5092 + CviJI RGCY 5090 5090 . . 5100 5103 + SetI ASST 5103 5099 . . 5101 5105 + Hin4II* CCTTC 5111 5110 . . 5098 5102 - HphI GGTGA 5090 5089 . . 5122 5126 + BssKI CCNGG 5121 5126 . . 5122 5126 + BseBI CCWGG 5123 5124 . . 5122 5126 + ScrFI CCNGG 5123 5124 . . 5122 5126 + EcoRII CCWGG 5121 5126 . . 5120 5125 - Eco57MI CTGRAG 5105 5103 . . 5125 5128 + CviJI RGCY 5126 5126 . . 5120 5125 - GsuI CTGGAG 5105 5103 . . 5127 5132 + SfeI* CTRYAG 5127 5131 . . 5131 5134 + CviJI RGCY 5132 5132 . . 5133 5138 + SecI* CCNNGG 5133 5137 . . 5134 5138 + BssKI CCNGG 5133 5138 . . 5134 5138 + BseBI CCWGG 5135 5136 . . 5134 5138 + ScrFI CCNGG 5135 5136 . . 5134 5138 + EcoRII CCWGG 5133 5138 . . 5137 5142 + XhoII RGATCY 5137 5141 . . 5137 5141 + BinI* GGATC 5145 5146 . . 5138 5141 + DpnI GATC 5139 5139 . . 5138 5141 + BstKTI GATC 5140 5138 . . 5138 5141 + MboI GATC 5137 5141 . . 5145 5148 + CviRI* TGCA 5146 5146 . . 5180 5184 + TspDTI ATGAA 5195 5193 . . 5186 5190 + TspDTI ATGAA 5201 5199 . . 5190 5195 + ApoI RAATTY 5190 5194 . . 5191 5194 + TspEI AATT 5190 5194 . . 5194 5199 + Hpy178III* TCNNGA 5195 5197 . . #--------------------------------------- # # # AarI: # [CACCTGC] # 443 1252 3507 # # Acc65I: # [GGTACC] # 893 4309 # # AccI: # [GTMKAC] # 1849 3353 # # AciI: # [CCGC] # 269 469 516 580 646 2722 # # AclI: # [AACGTT] # 383 435 1767 2617 # # AcyI: # [GRCGYC] # 796 4406 # # AflIII: # [ACRYGT] # 2120 3082 # # AgeI: # [ACCGGT] # 732 890 3580 # # AhaIII*: # [TTTAAA] # 17 126 792 1774 2493 # # AjuI: # [GAANNNNNNNTTGG] # 32 32 32 127 178 1079 # 3722 # # AlfI: # [GCANNNNNNTGC] # 0 0 0 0 0 0 # 34 34 34 320 553 829 # 3398 # # AluI: # [AGCT] # 37 90 107 126 144 207 # 233 243 328 334 336 407 # 1257 1353 # # ApoI: # [RAATTY] # 12 144 387 487 768 970 # 1024 1410 # # AsuI*: # [GGNCC] # 48 105 185 197 347 1135 # 3185 # # AvaII: # [GGWCC] # 48 197 532 1135 3290 # # AvrII: # [CCTAGG] # 166 5036 # # BaeI: # [ACNNNNGTAYC] # 33 2468 2701 # # BalI: # [TGGCCA] # 97 217 243 1880 2765 # # BbvI: # [GCAGC] # 73 146 250 393 438 531 # 1154 2217 # # BbvII*: # [GAAGAC] # 699 808 3695 # # BccI: # [CCATC] # 21 21 21 21 21 21 # 21 84 101 126 150 156 # 227 234 296 304 324 523 # 609 942 979 # # Bce83I*: # [CTTGAG] # 1901 3301 # # BceAI: # [ACGGC] # 436 941 1090 2735 # # BclI: # [TGATCA] # 309 1495 1629 1769 # # BdaI: # [TGANNNNNNTCA] # 0 0 34 457 4711 # # BetI*: # [WCCGGW] # 732 890 985 1026 1569 # # BglII: # [AGATCT] # 756 1043 3403 # # BinI*: # [GGATC] # 6 35 57 136 252 463 # 597 703 1407 1546 # # BisI: # [GCNGC] # 48 171 225 407 438 531 # 1165 2217 # # BlsI: # [GCNGC] # 48 171 225 408 438 531 # 1164 2217 # # BmgT120I: # [GGNCC] # 49 105 185 197 347 1135 # 3184 # # BplI: # [GAGNNNNNCTC] # 0 0 32 357 4813 # # BsaAI: # [YACGTR] # 735 1382 3085 # # BsaBI: # [GATNNNNATC] # 188 1735 3279 # # BsaXI: # [ACNNNNNCTCC] # 30 30 540 1459 3143 # # BseBI: # [CCWGG] # 12 67 186 233 394 504 # 594 660 693 1859 # # BseGI: # [GGATG] # 6 38 41 48 116 129 # 164 168 173 183 222 405 # 546 744 891 1328 # # BseMII: # [CTCAG] # 17 166 490 630 816 832 # 999 1252 # # BseRI: # [GAGGAG] # 248 600 4354 # # BseSI: # [GKGCMC] # 1783 3419 # # BseYI: # [CCCAGC] # 2173 3029 # # BsgI: # [GTGCAG] # 438 1147 3617 # # BsiYI*: # [CCNNNNNNNGG] # 172 427 502 599 798 852 # 890 962 # # BslFI: # [GGGAC] # 238 267 439 981 1352 1925 # # BsmAI: # [GTCTC] # 49 84 109 226 251 278 # 812 820 863 1710 # # BsmI: # [GAATGC] # 2081 3121 # # BspCNI: # [CTCAG] # 15 166 489 630 818 831 # 999 1254 # # BspHI: # [TCATGA] # 1354 3848 # # BspMI: # [ACCTGC] # 60 443 481 1252 2966 # # BspMII*: # [TCCGGA] # 2459 2743 # # BsrDI: # [GCAATG] # 450 1152 1594 2006 # # BsrI: # [ACTGG] # 6 295 347 464 724 850 # 974 1542 # # BssKI: # [CCNGG] # 12 21 69 186 231 394 # 504 594 639 693 893 966 # # BssNAI: # [GTATAC] # 1848 3354 # # BstKTI: # [GATC] # 5 6 20 22 59 61 # 62 68 90 105 115 116 # 123 160 162 186 285 312 # 384 403 459 597 691 711 # # BstXI: # [CCANNNNNNTGG] # 45 909 1943 2305 # # BtgZI: # [GCGATG] # 205 4997 # # BtrI: # [CACGTC] # 306 337 4559 # # CauII*: # [CCSGG] # 604 1199 3399 # # Cfr10I: # [RCCGGY] # 732 890 3580 # # CfrI: # [YGGCCR] # 95 217 243 859 1882 1906 # # ClaI: # [ATCGAT] # 868 1860 2474 # # Csp6I: # [GTAC] # 21 21 21 35 135 220 # 439 474 573 757 769 1737 # # CspCI: # [CAANNNNNGTGG] # 35 74 5093 # # CviAII: # [CATG] # 36 40 98 149 200 225 # 274 310 330 436 467 479 # 529 786 843 # # CviJI: # [RGCY] # 6 6 11 12 12 14 # 16 21 21 33 33 34 # 36 36 37 38 40 41 # 42 46 54 55 63 66 # 67 70 79 90 95 96 # 97 107 108 112 126 126 # 133 160 167 178 188 207 # 217 246 252 277 332 413 # 486 # # CviRI*: # [TGCA] # 56 61 85 126 163 177 # 222 282 308 324 360 399 # 438 558 702 941 # # DdeI: # [CTNAG] # 6 47 119 392 447 476 # 607 630 822 823 833 # # DpnI: # [GATC] # 5 6 20 22 59 61 # 63 68 90 105 115 116 # 123 160 162 185 285 312 # 384 403 459 597 691 711 # # DraII: # [RGGNCCY] # 1912 3290 # # DsaI*: # [CCRYGG] # 569 4633 # # EciI: # [GGCGGA] # 1510 3692 # # Eco31I: # [GGTCTC] # 1223 3979 # # Eco57I: # [CTGAAG] # 69 92 122 186 264 268 # 276 976 1212 1737 # # Eco57MI: # [CTGRAG] # 69 92 97 108 122 147 # 186 264 268 276 309 315 # 1212 1737 # # EcoNI: # [CCTNNNNNAGG] # 170 5032 # # EcoP15I: # [CAGCAG] # 2176 3026 # # EcoRII: # [CCWGG] # 12 69 186 231 394 504 # 594 660 693 1859 # # EcoRV: # [GATATC] # 2541 2661 # # Esp3I: # [CGTCTC] # 84 226 327 4565 # # FatI: # [CATG] # 36 40 98 149 200 225 # 273 310 330 436 467 479 # 529 786 844 # # FnuDII*: # [CGCG] # 2275 2927 # # FokI: # [GGATG] # 6 18 48 61 116 136 # 153 168 177 183 222 405 # 546 744 891 1328 # # GlaI: # [GCGC] # 351 2276 2575 # # GsaI: # [CCCAGC] # 2169 3033 # # GsuI: # [CTGGAG] # 97 108 147 315 4535 # # HaeIII: # [GGCC] # 97 217 243 413 649 844 # 859 1880 # # HgaI: # [GACGC] # 118 446 689 727 3222 # # HgiAI*: # [GWGCWC] # 27 129 215 825 4006 # # HgiCI*: # [GGYRCC] # 126 893 1201 2982 # # HhaI: # [GCGC] # 351 2277 2574 # # Hin4I: # [GAYNNNNNVTC] # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 32 32 32 32 # 32 120 233 578 748 1004 # 2359 # # Hin4II*: # [CCTTC] # 38 42 42 42 91 92 # 126 153 219 257 371 467 # 652 800 857 953 # # Hin6I: # [GCGC] # 351 2275 2576 # # HindII: # [GTYRAC] # 156 408 620 915 931 1059 # 1113 # # HinfI: # [GANTC] # 10 118 147 249 333 357 # 365 595 663 701 760 904 # # HpaI: # [GTTAAC] # 156 1113 1959 1974 # # HpaII: # [CCGG] # 220 246 285 519 604 733 # 1026 1569 # # HphI: # [GGTGA] # 9 9 9 9 12 12 # 12 16 21 21 21 21 # 27 30 36 42 42 42 # 42 54 59 67 92 92 # 105 112 186 201 243 249 # 291 306 328 482 571 606 # 725 # # Hpy166II: # [GTNNAC] # 33 46 123 126 134 236 # 258 300 358 408 557 579 # 931 1113 # # Hpy178III*: # [TCNNGA] # 7 24 70 72 84 87 # 93 99 112 211 266 354 # 410 528 601 638 745 801 # # Hpy188I: # [TCNGA] # 47 84 132 154 186 194 # 200 201 237 255 268 319 # 466 547 927 985 # # Hpy99I: # [CGWCG] # 21 42 333 1069 1450 2287 # # KpnI: # [GGTACC] # 889 4313 # # Ksp632I*: # [CTCTTC] # 947 1672 2583 # # MaeI: # [CTAG] # 20 114 147 176 209 273 # 283 543 552 1187 1698 # # MaeII: # [ACGT] # 18 21 21 21 21 21 # 21 21 21 42 71 74 # 88 104 105 169 170 183 # 195 201 233 240 298 298 # 383 390 561 1211 # # MaeIII: # [GTNAC] # 8 8 13 13 21 28 # 31 42 43 64 105 109 # 156 194 237 244 245 282 # 302 340 412 446 461 505 # 893 # # MboI: # [GATC] # 5 6 20 22 59 61 # 65 68 90 105 115 116 # 123 160 162 183 285 312 # 384 403 459 597 691 711 # # MboII: # [GAAGA] # 3 6 14 36 54 72 # 75 85 153 180 183 390 # 405 427 522 702 803 1092 # # McrI*: # [CGRYCG] # 957 4245 # # MfeI: # [CAATTG] # 2045 3157 # # MlyI: # [GAGTC] # 25 249 265 586 1959 2118 # # MmeI: # [TCCRAC] # 8 149 189 210 362 532 # 750 1173 1829 # # MnlI: # [CCTC] # 5 8 13 20 25 28 # 39 42 44 47 48 83 # 90 96 111 113 117 119 # 157 158 168 222 227 238 # 280 319 329 362 420 473 # 801 # # MseI: # [TTAA] # 7 17 28 36 48 53 # 53 59 65 73 74 78 # 102 106 123 126 156 157 # 192 195 243 268 277 279 # 296 309 363 674 745 # # MslI: # [CAYNNNNRTG] # 53 62 292 845 1970 1980 # # MstI*: # [TGCGCA] # 2575 2627 # # MwoI: # [GCNNNNNNNGC] # 42 357 768 770 3265 # # NdeI: # [CATATG] # 327 1102 3773 # # NlaIII: # [CATG] # 36 40 98 149 200 225 # 277 310 330 436 467 479 # 529 786 840 # # NlaIV: # [GGNNCC] # 10 44 89 116 211 248 # 283 414 455 891 1203 1238 # # NspI: # [RCATGY] # 713 840 3649 # # OliI: # [CACNNNNGTG] # 1199 1980 2023 # # PflMI: # [CCANNNNNTGG] # 2451 2751 # # PfoI: # [TCCNGGA] # 606 1813 2783 # # PleI: # [GAGTC] # 24 249 265 587 1959 2118 # # PpuMI: # [RGGWCCY] # 1912 3290 # # RsaI: # [GTAC] # 21 21 21 36 135 220 # 439 473 573 757 769 1737 # # SapI: # [GCTCTTC] # 947 4255 # # ScrFI: # [CCNGG] # 12 21 67 186 233 394 # 504 594 639 693 893 966 # # SduI: # [GDGCHC] # 27 129 215 587 825 3419 # # SecI*: # [CCNNGG] # 69 162 166 391 403 563 # 628 893 925 1002 # # SetI: # [ASST] # 5 6 9 9 9 10 # 12 12 12 12 13 15 # 16 16 16 18 21 21 # 21 21 21 21 21 21 # 22 25 26 26 27 27 # 28 28 29 36 36 37 # 37 39 39 42 42 48 # 48 50 51 51 52 53 # 56 60 67 71 72 74 # 78 79 79 80 85 88 # 89 93 95 99 100 108 # 114 126 128 132 147 158 # 163 183 187 200 210 221 # 227 276 # # SfaNI: # [GCATC] # 48 369 567 708 1467 2043 # # SfeI*: # [CTRYAG] # 42 75 210 4875 # # SgrAI: # [CRCCGGYG] # 732 4470 # # SmlI: # [CTYRAG] # 1916 3286 # # SpeI: # [ACTAGT] # 658 4544 # # SplI*: # [CGTACG] # 673 4529 # # SspI: # [AATATT] # 192 627 1392 2991 # # StyI: # [CCWWGG] # 166 563 1071 1316 2086 # # TaiI: # [ACGT] # 18 21 21 21 21 21 # 21 21 21 42 71 74 # 88 104 105 169 170 183 # 195 201 230 240 298 298 # 383 390 561 1214 # # TaqI: # [TCGA] # 21 102 117 129 150 267 # 423 651 868 1029 1445 # # TaqII: # [GACCGA] # 46 1169 1228 1302 1457 # # TatI: # [WGTACW] # 2101 3101 # # TfiI: # [GAWTC] # 333 512 701 713 760 904 # 1279 # # TseI: # [GCWGC] # 48 171 225 406 438 531 # 1166 2217 # # TsoI: # [TARCCA] # 227 271 1334 1641 1729 # # Tsp45I: # [GTSAC] # 21 21 42 64 105 244 # 253 302 313 353 606 893 # 1985 # # Tsp4CI*: # [ACNGT] # 14 18 25 28 35 56 # 63 75 89 114 114 119 # 132 142 181 205 206 289 # 303 382 456 668 1488 # # TspDTI: # [ATGAA] # 1 6 7 9 27 36 # 66 71 95 100 110 116 # 132 140 159 174 186 206 # 222 228 249 265 273 290 # 304 320 591 819 # # TspEI: # [AATT] # 7 12 12 18 20 22 # 29 45 49 51 52 52 # 57 65 97 108 125 137 # 140 144 147 147 154 160 # 162 193 195 195 229 282 # 351 369 435 941 # # TspGWI: # [ACGGA] # 22 552 603 703 712 782 # 796 1032 # # TspRI: # [CASTGNN] # 96 235 850 4021 # # TstI: # [CACNNNNNNTCC] # 32 32 32 296 1342 1699 # 1769 # # Tth111I: # [GACNNNGTC] # 1087 4115 # # VspI: # [ATTAAT] # 361 1906 2935 # # XbaI: # [TCTAGA] # 2532 2670 # # XcmI: # [CCANNNNNNNNNTGG] # 2452 2750 # # XhoII: # [RGATCY] # 65 657 691 1043 2746 # # XmaIII*: # [CGGCCG] # 954 4248 # #--------------------------------------- #--------------------------------------- # Total_sequences: 1 # Total_length: 5202 # Reported_sequences: 1 # Reported_hitcount: 1177 #---------------------------------------