Restriction Fragments for PCA1/YBR295W



Send questions or suggestions to SGD

BLAST search | Genome Restriction Map | Design Primers for this sequence


The currently selected gene/sequence is :

PCA1/YBR295W on chromosome II from coordinates 792849 to 796499.

seqfile=/share/crumb/www-data/html/tmp/gcgseq.tmp.2258.2

Start End Strand Enzyme_name Restriction_site 5prime 3prime 5primerev 3primerev 1 5 + TspDTI ATGAA 16 14 . . 5 8 + CviJI RGCY 6 6 . . 7 10 + HpaII CCGG 7 9 . . 16 21 + Ksp632I* CTCTTC 22 25 . . 17 21 - MboII GAAGA 9 8 . . 22 27 + BetI* WCCGGW 22 26 . . 23 26 + HpaII CCGG 23 25 . . 30 33 + SetI ASST 33 29 . . 31 36 + KpnI GGTACC 35 31 . . 31 36 + NlaIV GGNNCC 33 33 . . 31 36 + HgiCI* GGYRCC 31 35 . . 31 36 + Acc65I GGTACC 31 35 . . 32 35 + Csp6I GTAC 32 34 . . 32 35 + RsaI GTAC 33 33 . . 38 43 + BtgZI GCGATG 53 57 . . 40 44 - BccI CCATC 34 35 . . 67 77 - Hin4I GAYNNNNNVTC 90 85 58 53 82 86 - SfaNI GCATC 72 76 . . 89 92 + CviRI* TGCA 90 90 . . 101 104 - MnlI CCTC 94 93 . . 118 123 + XhoII RGATCY 118 122 . . 119 122 + DpnI GATC 120 120 . . 119 122 + BstKTI GATC 121 119 . . 119 122 + MboI GATC 118 122 . . 123 132 + MslI CAYNNNNRTG 127 127 . . 119 123 - BinI* GGATC 113 114 . . 130 135 + EcoT22I ATGCAT 134 130 . . 131 134 + CviRI* TGCA 132 132 . . 132 137 + NspI RCATGY 136 132 . . 132 137 + Cac8I GCNNGC 134 134 . . 132 137 + SphI GCATGC 136 132 . . 133 142 + MslI CAYNNNNRTG 137 137 . . 133 136 + FatI CATG 132 136 . . 133 136 + NlaIII CATG 136 132 . . 133 136 + CviAII CATG 133 135 . . 156 161 + Eco31I GGTCTC 162 166 . . 157 161 + BsmAI GTCTC 162 166 . . 161 166 + GsaI CCCAGC 165 161 . . 161 166 + BseYI CCCAGC 161 165 . . 170 174 + Tsp4CI* ACNGT 172 171 . . 167 171 - BsmAI GTCTC 161 165 . . 173 176 + Csp6I GTAC 173 175 . . 173 176 + RsaI GTAC 174 174 . . 182 185 + CviJI RGCY 183 183 . . 182 185 + HaeIII GGCC 183 183 . . 182 186 + BmgT120I GGNCC 183 184 . . 182 186 + AsuI* GGNCC 182 185 . . 189 192 + TspEI AATT 188 192 . . 196 199 + MnlI CCTC 206 205 . . 196 202 + SauI* CCTNAGG 197 200 . . 197 201 + DdeI CTNAG 197 200 . . 197 201 + BspCNI CTCAG 210 208 . . 197 201 + BseMII CTCAG 211 209 . . 198 203 + Hpy178III* TCNNGA 199 201 . . 194 199 - BseRI GAGGAG 185 183 . . 218 222 + DdeI CTNAG 218 221 . . 214 218 - BsmAI GTCTC 208 212 . . 218 222 - BseMII CTCAG 209 207 . . 225 235 + Hin4I GAYNNNNNVTC 216 211 248 243 230 240 + MwoI GCNNNNNNNGC 236 233 . . 230 240 + BglI GCCNNNNNGGC 236 233 . . 231 235 + BccI CCATC 239 240 . . 225 235 - Hin4I GAYNNNNNVTC 248 243 216 211 235 238 + FatI CATG 234 238 . . 235 238 + NlaIII CATG 238 234 . . 235 238 + CviAII CATG 235 237 . . 251 255 + DdeI CTNAG 251 254 . . 255 258 + CviJI RGCY 256 256 . . 256 261 - GsaI CCCAGC 260 256 . . 256 261 - BseYI CCCAGC 256 260 . . 268 273 + Hpy166II GTNNAC 270 270 . . 268 273 + AccI GTMKAC 269 271 . . 274 278 - SfaNI GCATC 264 268 . . 283 288 + Cfr10I RCCGGY 283 287 . . 283 288 + BetI* WCCGGW 283 287 . . 283 288 + AgeI ACCGGT 283 287 . . 284 287 + HpaII CCGG 284 286 . . 289 293 + HphI GGTGA 301 300 . . 291 296 + BclI TGATCA 291 295 . . 292 295 + DpnI GATC 293 293 . . 292 295 + BstKTI GATC 294 292 . . 292 295 + MboI GATC 291 295 . . 295 304 + MslI CAYNNNNRTG 299 299 . . 302 306 + TspDTI ATGAA 317 315 . . 304 308 + TfiI GAWTC 304 307 . . 304 308 + HinfI GANTC 304 307 . . 317 321 + TspDTI ATGAA 332 330 . . 329 333 + DdeI CTNAG 329 332 . . 329 333 - BspCNI CTCAG 321 319 . . 329 333 - BseMII CTCAG 320 318 . . 337 342 + Hpy166II GTNNAC 339 339 . . 345 351 + TspRI CASTGNN 351 342 . . 347 351 + DdeI CTNAG 347 350 . . 347 351 - BspCNI CTCAG 339 337 . . 347 351 - BseMII CTCAG 338 336 . . 352 356 + BsrI ACTGG 357 355 . . 349 353 - BsmAI GTCTC 343 347 . . 355 358 + CviJI RGCY 356 356 . . 360 364 + FokI GGATG 373 377 . . 360 364 + BseGI GGATG 366 364 . . 364 369 + Hpy166II GTNNAC 366 366 . . 369 374 + PvuII CAGCTG 371 371 . . 369 374 + NspBII* CMGCKG 371 371 . . 370 373 + SetI ASST 373 369 . . 370 373 + CviJI RGCY 371 371 . . 370 373 + AluI AGCT 371 371 . . 371 381 + MwoI GCNNNNNNNGC 377 374 . . 377 381 + TauI GCSGC 380 377 . . 377 381 + BlsI GCNGC 379 378 . . 377 381 + BisI GCNGC 378 379 . . 380 385 + BtgZI GCGATG 395 399 . . 377 380 - AciI CCGC 377 379 . . 382 386 - SfaNI GCATC 372 376 . . 393 396 + SetI ASST 396 392 . . 397 403 + BstEII GGTNACC 397 402 . . 397 401 + HphI GGTGA 409 408 . . 398 402 + Tsp45I GTSAC 397 402 . . 398 402 + MaeIII GTNAC 397 402 . . 403 412 + MslI CAYNNNNRTG 407 407 . . 410 414 + TspDTI ATGAA 425 423 . . 412 416 + TfiI GAWTC 412 415 . . 412 416 + HinfI GANTC 412 415 . . 427 431 + FokI GGATG 440 444 . . 427 431 + BseGI GGATG 433 431 . . 424 428 - BccI CCATC 418 419 . . 431 435 + BlsI GCNGC 433 432 . . 431 435 + BisI GCNGC 432 433 . . 431 435 + TseI GCWGC 431 434 . . 428 432 - SfaNI GCATC 418 422 . . 431 435 - BbvI GCAGC 418 422 . . 442 446 + TfiI GAWTC 442 445 . . 442 446 + HinfI GANTC 442 445 . . 449 455 + TspRI CASTGNN 455 446 . . 445 449 - MboII GAAGA 437 436 . . 446 451 - Eco57MI CTGRAG 431 429 . . 446 451 - Eco57I CTGAAG 431 429 . . 453 457 - BccI CCATC 447 448 . . 458 461 + TaqI TCGA 458 460 . . 460 463 - MnlI CCTC 453 452 . . 466 470 + MaeIII GTNAC 465 470 . . 473 477 + BlsI GCNGC 475 474 . . 473 477 + BisI GCNGC 474 475 . . 473 477 + BbvI GCAGC 485 489 . . 473 477 + TseI GCWGC 473 476 . . 474 479 + PvuII CAGCTG 476 476 . . 474 479 + NspBII* CMGCKG 476 476 . . 475 478 + SetI ASST 478 474 . . 475 478 + CviJI RGCY 476 476 . . 475 478 + AluI AGCT 476 476 . . 476 480 + BlsI GCNGC 478 477 . . 476 480 + BisI GCNGC 477 478 . . 476 480 + TseI GCWGC 476 479 . . 476 480 - BbvI GCAGC 463 467 . . 483 486 + SetI ASST 486 482 . . 483 486 + CviJI RGCY 484 484 . . 483 486 + AluI AGCT 484 484 . . 490 494 - MboII GAAGA 482 481 . . 502 507 + MfeI CAATTG 502 506 . . 503 506 + TspEI AATT 502 506 . . 514 517 + SetI ASST 517 513 . . 514 517 + CviJI RGCY 515 515 . . 514 517 + AluI AGCT 515 515 . . 520 529 + XmnI GAANNNNTTC 524 524 . . 538 542 + Hpy188I TCNGA 540 539 . . 539 544 + Eco57MI CTGRAG 560 558 . . 539 544 + Eco57I CTGAAG 560 558 . . 543 546 + SetI ASST 546 542 . . 541 545 - Hin4II* CCTTC 535 534 . . 548 551 + CviRI* TGCA 549 549 . . 558 563 + Hpy178III* TCNNGA 559 561 . . 558 563 + BspHI TCATGA 558 562 . . 559 562 + FatI CATG 558 562 . . 559 562 + NlaIII CATG 562 558 . . 559 562 + CviAII CATG 559 561 . . 557 561 - TspDTI ATGAA 547 545 . . 571 575 - BsmAI GTCTC 565 569 . . 581 585 + BlsI GCNGC 583 582 . . 581 585 + BisI GCNGC 582 583 . . 581 585 + TseI GCWGC 581 584 . . 583 586 + CviRI* TGCA 584 584 . . 581 585 - BbvI GCAGC 568 572 . . 592 595 + TspEI AATT 591 595 . . 595 600 + MmeI TCCRAC 620 618 . . 612 616 - Hin4II* CCTTC 606 605 . . 620 623 + CviJI RGCY 621 621 . . 625 628 + CviRI* TGCA 626 626 . . 626 630 + SfaNI GCATC 635 639 . . 629 632 + TaqI TCGA 629 631 . . 631 635 + TfiI GAWTC 631 634 . . 631 635 + HinfI GANTC 631 634 . . 638 642 + Tsp45I GTSAC 637 642 . . 638 642 + MaeIII GTNAC 637 642 . . 640 644 + HinfI GANTC 640 643 . . 640 644 - PleI GAGTC 634 635 . . 640 644 - MlyI GAGTC 634 634 . . 649 654 + SmlI CTYRAG 649 653 . . 650 655 + Hpy178III* TCNNGA 651 653 . . 649 654 - Bce83I* CTTGAG 634 632 . . 684 687 + TspEI AATT 683 687 . . 689 692 + SetI ASST 692 688 . . 688 691 - MnlI CCTC 681 680 . . 695 699 - BsrI ACTGG 695 693 . . 701 704 + CviJI RGCY 702 702 . . 704 708 + DdeI CTNAG 704 707 . . 704 708 - BspCNI CTCAG 696 694 . . 704 708 - BseMII CTCAG 695 693 . . 710 714 + BlsI GCNGC 712 711 . . 710 714 + BisI GCNGC 711 712 . . 710 714 + TseI GCWGC 710 713 . . 712 715 + CviRI* TGCA 713 713 . . 710 714 - BbvI GCAGC 697 701 . . 722 725 + FatI CATG 721 725 . . 722 725 + NlaIII CATG 725 721 . . 722 725 + CviAII CATG 722 724 . . 720 724 - TspDTI ATGAA 710 708 . . 735 745 + Hin4I GAYNNNNNVTC 726 721 758 753 732 735 - AciI CCGC 732 734 . . 730 735 - BsrBI CCGCTC 732 732 . . 738 741 + CviRI* TGCA 739 739 . . 739 743 + SfaNI GCATC 748 752 . . 748 751 + SetI ASST 751 747 . . 748 751 + CviJI RGCY 749 749 . . 748 751 + AluI AGCT 749 749 . . 759 762 - MnlI CCTC 752 751 . . 766 771 + AhaIII* TTTAAA 768 768 . . 767 770 + MseI TTAA 767 769 . . 771 774 + SetI ASST 774 770 . . 788 793 + ApoI RAATTY 788 792 . . 789 792 + TspEI AATT 788 792 . . 784 789 - MmeI TCCRAC 765 763 . . 802 805 + SetI ASST 805 801 . . 802 805 + CviJI RGCY 803 803 . . 802 805 + AluI AGCT 803 803 . . 812 816 + Tsp4CI* ACNGT 814 813 . . 817 820 + MseI TTAA 817 819 . . 825 834 + XmnI GAANNNNTTC 829 829 . . 830 834 - MboII GAAGA 822 821 . . 831 836 - Eco57MI CTGRAG 816 814 . . 831 836 - Eco57I CTGAAG 816 814 . . 840 844 + Tsp4CI* ACNGT 842 841 . . 842 847 + TatI WGTACW 842 846 . . 842 847 + ScaI AGTACT 844 844 . . 843 846 + Csp6I GTAC 843 845 . . 843 846 + RsaI GTAC 844 844 . . 847 852 + XbaI TCTAGA 847 851 . . 847 852 + Hpy178III* TCNNGA 848 850 . . 848 851 + MaeI CTAG 848 850 . . 854 859 + TatI WGTACW 854 858 . . 854 859 + Bsp1407I TGTACA 854 858 . . 855 858 + Csp6I GTAC 855 857 . . 855 858 + RsaI GTAC 856 856 . . 863 867 + MaeIII GTNAC 862 867 . . 869 872 + MnlI CCTC 879 878 . . 867 872 - BseRI GAGGAG 858 856 . . 873 876 + TspEI AATT 872 876 . . 882 887 + ApoI RAATTY 882 886 . . 883 886 + TspEI AATT 882 886 . . 888 891 + SetI ASST 891 887 . . 899 903 + MaeIII GTNAC 898 903 . . 911 914 + Csp6I GTAC 911 913 . . 911 914 + RsaI GTAC 912 912 . . 925 929 + TfiI GAWTC 925 928 . . 925 929 + HinfI GANTC 925 928 . . 935 939 + BsmAI GTCTC 940 944 . . 944 947 + SetI ASST 947 943 . . 959 962 - AciI CCGC 959 961 . . 959 963 - FauI CCCGC 952 954 . . 964 967 - MnlI CCTC 957 956 . . 996 999 + AciI CCGC 996 998 . . 1001 1005 + Tsp4CI* ACNGT 1003 1002 . . 1006 1011 + Hpy178III* TCNNGA 1007 1009 . . 1009 1013 + FokI GGATG 1022 1026 . . 1009 1013 + BseGI GGATG 1015 1013 . . 1015 1018 + MseI TTAA 1015 1017 . . 1032 1037 + DsaI* CCRYGG 1032 1036 . . 1032 1037 + StyI CCWWGG 1032 1036 . . 1032 1037 + NcoI CCATGG 1032 1036 . . 1032 1037 + SecI* CCNNGG 1032 1036 . . 1033 1036 + FatI CATG 1032 1036 . . 1033 1036 + NlaIII CATG 1036 1032 . . 1033 1036 + CviAII CATG 1033 1035 . . 1037 1041 - BsmAI GTCTC 1031 1035 . . 1048 1051 + SetI ASST 1051 1047 . . 1055 1060 + BsrDI GCAATG 1062 1060 . . 1065 1070 + BalI TGGCCA 1067 1067 . . 1065 1070 + CfrI YGGCCR 1065 1069 . . 1066 1069 + CviJI RGCY 1067 1067 . . 1066 1069 + HaeIII GGCC 1067 1067 . . 1069 1072 + FatI CATG 1068 1072 . . 1069 1072 + NlaIII CATG 1072 1068 . . 1069 1072 + CviAII CATG 1069 1071 . . 1099 1102 + CviRI* TGCA 1100 1100 . . 1101 1110 + MslI CAYNNNNRTG 1105 1105 . . 1108 1112 + TspDTI ATGAA 1123 1121 . . 1110 1114 - Hin4II* CCTTC 1104 1103 . . 1123 1127 + MaeIII GTNAC 1122 1127 . . 1126 1129 + SetI ASST 1129 1125 . . 1127 1130 + MnlI CCTC 1137 1136 . . 1138 1143 + Hpy178III* TCNNGA 1139 1141 . . 1146 1151 + Ksp632I* CTCTTC 1152 1155 . . 1150 1153 + TaqI TCGA 1150 1152 . . 1147 1151 - MboII GAAGA 1139 1138 . . 1157 1162 + ApoI RAATTY 1157 1161 . . 1158 1161 + TspEI AATT 1157 1161 . . 1162 1167 + Hpy178III* TCNNGA 1163 1165 . . 1166 1170 + TfiI GAWTC 1166 1169 . . 1166 1170 + HinfI GANTC 1166 1169 . . 1179 1184 + NlaIV GGNNCC 1181 1181 . . 1184 1189 + MfeI CAATTG 1184 1188 . . 1185 1188 + TspEI AATT 1184 1188 . . 1199 1202 + MseI TTAA 1199 1201 . . 1203 1208 + Hpy178III* TCNNGA 1204 1206 . . 1204 1209 + SmlI CTYRAG 1204 1208 . . 1204 1209 + Bce83I* CTTGAG 1225 1223 . . 1207 1210 - MnlI CCTC 1200 1199 . . 1213 1218 + XhoII RGATCY 1213 1217 . . 1213 1217 + BinI* GGATC 1221 1222 . . 1214 1217 + DpnI GATC 1215 1215 . . 1214 1217 + BstKTI GATC 1216 1214 . . 1214 1217 + MboI GATC 1213 1217 . . 1207 1217 - Hin4I GAYNNNNNVTC 1230 1225 1198 1193 1219 1224 + Cfr10I RCCGGY 1219 1223 . . 1219 1224 + BetI* WCCGGW 1219 1223 . . 1219 1224 + AgeI ACCGGT 1219 1223 . . 1220 1223 + HpaII CCGG 1220 1222 . . 1222 1227 + KpnI GGTACC 1226 1222 . . 1222 1227 + NlaIV GGNNCC 1224 1224 . . 1222 1227 + HgiCI* GGYRCC 1222 1226 . . 1222 1227 + Acc65I GGTACC 1222 1226 . . 1223 1226 + Csp6I GTAC 1223 1225 . . 1223 1226 + RsaI GTAC 1224 1224 . . 1228 1233 + SduI GDGCHC 1232 1228 . . 1228 1233 + HgiAI* GWGCWC 1232 1228 . . 1240 1244 + DdeI CTNAG 1240 1243 . . 1249 1254 + Hpy178III* TCNNGA 1250 1252 . . 1261 1266 + TatI WGTACW 1261 1265 . . 1262 1265 + Csp6I GTAC 1262 1264 . . 1262 1265 + RsaI GTAC 1263 1263 . . 1264 1268 + BsrI ACTGG 1269 1267 . . 1273 1277 + TfiI GAWTC 1273 1276 . . 1273 1277 + HinfI GANTC 1273 1276 . . 1282 1287 + SmlI CTYRAG 1282 1286 . . 1282 1287 + AflII CTTAAG 1282 1286 . . 1283 1286 + MseI TTAA 1283 1285 . . 1298 1301 + Hin6I GCGC 1298 1300 . . 1298 1301 + GlaI GCGC 1299 1299 . . 1298 1303 + Cac8I GCNNGC 1300 1300 . . 1298 1303 + BsePI GCGCGC 1298 1302 . . 1298 1301 + HhaI GCGC 1300 1298 . . 1299 1302 + FnuDII* CGCG 1300 1300 . . 1300 1303 + Hin6I GCGC 1300 1302 . . 1300 1303 + GlaI GCGC 1301 1301 . . 1300 1303 + HhaI GCGC 1302 1300 . . 1312 1317 + Hpy166II GTNNAC 1314 1314 . . 1316 1320 + Tsp4CI* ACNGT 1318 1317 . . 1323 1327 + MboII GAAGA 1335 1334 . . 1323 1328 + BbvII* GAAGAC 1330 1334 . . 1328 1332 - BsrI ACTGG 1328 1326 . . 1333 1336 + MseI TTAA 1333 1335 . . 1335 1340 + SspI AATATT 1337 1337 . . 1344 1349 + Cac8I GCNNGC 1346 1346 . . 1347 1350 + SetI ASST 1350 1346 . . 1347 1350 + CviJI RGCY 1348 1348 . . 1347 1350 + AluI AGCT 1348 1348 . . 1351 1356 + ApoI RAATTY 1351 1355 . . 1352 1355 + TspEI AATT 1351 1355 . . 1355 1358 + MseI TTAA 1355 1357 . . 1359 1364 + Hpy178III* TCNNGA 1360 1362 . . 1362 1367 + XhoII RGATCY 1362 1366 . . 1362 1366 + BinI* GGATC 1370 1371 . . 1363 1366 + DpnI GATC 1364 1364 . . 1363 1366 + BstKTI GATC 1365 1363 . . 1363 1366 + MboI GATC 1362 1366 . . 1370 1374 + DdeI CTNAG 1370 1373 . . 1370 1374 + BspCNI CTCAG 1383 1381 . . 1370 1374 + BseMII CTCAG 1384 1382 . . 1375 1380 + XhoII RGATCY 1375 1379 . . 1369 1375 - Bpu10I CCTNAGC 1370 1373 . . 1375 1379 + BinI* GGATC 1383 1384 . . 1376 1379 + DpnI GATC 1377 1377 . . 1376 1379 + BstKTI GATC 1378 1376 . . 1376 1379 + MboI GATC 1375 1379 . . 1386 1390 + FokI GGATG 1399 1403 . . 1386 1390 + BseGI GGATG 1392 1390 . . 1401 1406 + SmlI CTYRAG 1401 1405 . . 1401 1406 + Bce83I* CTTGAG 1422 1420 . . 1417 1422 + EcoRI GAATTC 1417 1421 . . 1417 1422 + ApoI RAATTY 1417 1421 . . 1418 1421 + TspEI AATT 1417 1421 . . 1425 1428 + Csp6I GTAC 1425 1427 . . 1425 1428 + RsaI GTAC 1426 1426 . . 1434 1444 + Hin4I GAYNNNNNVTC 1425 1420 1457 1452 1434 1444 - Hin4I GAYNNNNNVTC 1457 1452 1425 1420 1444 1447 + FatI CATG 1443 1447 . . 1444 1447 + NlaIII CATG 1447 1443 . . 1444 1447 + CviAII CATG 1444 1446 . . 1454 1459 + SfeI* CTRYAG 1454 1458 . . 1476 1479 + CviRI* TGCA 1477 1477 . . 1477 1481 + BlsI GCNGC 1479 1478 . . 1477 1481 + BisI GCNGC 1478 1479 . . 1477 1481 + BbvI GCAGC 1489 1493 . . 1477 1481 + TseI GCWGC 1477 1480 . . 1492 1497 + VspI ATTAAT 1493 1495 . . 1493 1496 + MseI TTAA 1493 1495 . . 1498 1501 - MnlI CCTC 1491 1490 . . 1504 1509 + BalI TGGCCA 1506 1506 . . 1504 1509 + CfrI YGGCCR 1504 1508 . . 1505 1508 + CviJI RGCY 1506 1506 . . 1505 1508 + HaeIII GGCC 1506 1506 . . 1508 1516 + DraIII CACNNNGTG 1513 1510 . . 1512 1515 + SetI ASST 1515 1511 . . 1516 1520 + Tsp45I GTSAC 1515 1520 . . 1516 1520 + MaeIII GTNAC 1515 1520 . . 1523 1526 + SetI ASST 1526 1522 . . 1523 1526 + CviJI RGCY 1524 1524 . . 1523 1526 + AluI AGCT 1524 1524 . . 1530 1533 + TspEI AATT 1529 1533 . . 1571 1574 + SetI ASST 1574 1570 . . 1578 1581 + SetI ASST 1581 1577 . . 1579 1584 + NlaIV GGNNCC 1581 1581 . . 1579 1584 + HgiCI* GGYRCC 1579 1583 . . 1587 1592 + XhoII RGATCY 1587 1591 . . 1587 1592 + BglII AGATCT 1587 1591 . . 1588 1591 + DpnI GATC 1589 1589 . . 1588 1591 + BstKTI GATC 1590 1588 . . 1588 1591 + MboI GATC 1587 1591 . . 1586 1596 - Hin4I GAYNNNNNVTC 1609 1604 1577 1572 1598 1602 + TspDTI ATGAA 1613 1611 . . 1603 1607 + FokI GGATG 1616 1620 . . 1603 1607 + BseGI GGATG 1609 1607 . . 1600 1604 - Hin4II* CCTTC 1594 1593 . . 1604 1608 - BccI CCATC 1598 1599 . . 1610 1615 + Cac8I GCNNGC 1612 1612 . . 1603 1614 - TstI CACNNNNNNTCC 1627 1622 1595 1590 1644 1649 + MmeI TCCRAC 1669 1667 . . 1642 1646 - FokI GGATG 1628 1632 . . 1642 1646 - BseGI GGATG 1641 1639 . . 1649 1660 + BstXI CCANNNNNNTGG 1656 1652 . . 1650 1659 + MslI CAYNNNNRTG 1654 1654 . . 1661 1665 - Hin4II* CCTTC 1655 1654 . . 1668 1679 - BcgI CGANNNNNNTGC 1691 1689 1657 1655 1684 1687 + CviJI RGCY 1685 1685 . . 1685 1689 + BlsI GCNGC 1687 1686 . . 1685 1689 + BisI GCNGC 1686 1687 . . 1685 1689 + TseI GCWGC 1685 1688 . . 1687 1690 + CviRI* TGCA 1688 1688 . . 1685 1689 - BbvI GCAGC 1672 1676 . . 1691 1696 + McrI* CGRYCG 1694 1692 . . 1686 1691 - BsgI GTGCAG 1671 1669 . . 1694 1697 + AciI CCGC 1694 1696 . . 1707 1712 + SspI AATATT 1709 1709 . . 1716 1719 + DpnI GATC 1717 1717 . . 1716 1719 + BstKTI GATC 1718 1716 . . 1716 1719 + MboI GATC 1715 1719 . . 1718 1723 + Hpy178III* TCNNGA 1719 1721 . . 1716 1720 - BinI* GGATC 1710 1711 . . 1722 1726 + TfiI GAWTC 1722 1725 . . 1722 1726 + HinfI GANTC 1722 1725 . . 1727 1732 + Hpy178III* TCNNGA 1728 1730 . . 1726 1731 - BsiI* CACGAG 1726 1730 . . 1734 1737 + CviJI RGCY 1735 1735 . . 1731 1735 - BccI CCATC 1725 1726 . . 1739 1744 + SduI GDGCHC 1743 1739 . . 1739 1744 + HgiJII* GRGCYC 1743 1739 . . 1740 1743 + CviJI RGCY 1741 1741 . . 1740 1745 + NlaIV GGNNCC 1742 1742 . . 1748 1751 + SetI ASST 1751 1747 . . 1748 1751 + CviJI RGCY 1749 1749 . . 1748 1751 + AluI AGCT 1749 1749 . . 1752 1757 + Hpy178III* TCNNGA 1753 1755 . . 1760 1765 + ApoI RAATTY 1760 1764 . . 1761 1764 + TspEI AATT 1760 1764 . . 1775 1778 + AciI CCGC 1775 1777 . . 1776 1779 + FnuDII* CGCG 1777 1777 . . 1777 1781 - HgaI GACGC 1766 1771 . . 1788 1793 + Cac8I GCNNGC 1790 1790 . . 1788 1793 + BmtI GCTAGC 1792 1788 . . 1788 1793 + NheI GCTAGC 1788 1792 . . 1789 1792 + MaeI CTAG 1789 1791 . . 1805 1808 + TspEI AATT 1804 1808 . . 1815 1818 + CviRI* TGCA 1816 1816 . . 1819 1823 + BmgT120I GGNCC 1820 1821 . . 1819 1823 + AvaII GGWCC 1819 1822 . . 1819 1823 + AsuI* GGNCC 1819 1822 . . 1821 1825 + Tsp4CI* ACNGT 1823 1822 . . 1831 1834 + MseI TTAA 1831 1833 . . 1842 1846 + MboII GAAGA 1854 1853 . . 1842 1847 - Ksp632I* CTCTTC 1837 1840 . . 1859 1863 + BssKI CCNGG 1858 1863 . . 1859 1863 + BseBI CCWGG 1860 1861 . . 1859 1863 + ScrFI CCNGG 1860 1861 . . 1859 1863 + EcoRII CCWGG 1858 1863 . . 1862 1865 + CviJI RGCY 1863 1863 . . 1866 1875 + MslI CAYNNNNRTG 1870 1870 . . 1875 1880 + XhoII RGATCY 1875 1879 . . 1875 1879 + BinI* GGATC 1883 1884 . . 1876 1879 + DpnI GATC 1877 1877 . . 1876 1879 + BstKTI GATC 1878 1876 . . 1876 1879 + MboI GATC 1875 1879 . . 1891 1894 + MseI TTAA 1891 1893 . . 1898 1901 + MaeI CTAG 1898 1900 . . 1900 1905 + HaeII RGCGCY 1904 1900 . . 1900 1905 + Eco47III AGCGCT 1902 1902 . . 1901 1904 + Hin6I GCGC 1901 1903 . . 1901 1904 + GlaI GCGC 1902 1902 . . 1901 1904 + HhaI GCGC 1903 1901 . . 1903 1907 + BlsI GCNGC 1905 1904 . . 1903 1907 + BisI GCNGC 1904 1905 . . 1903 1907 + TseI GCWGC 1903 1906 . . 1903 1907 - BbvI GCAGC 1890 1894 . . 1918 1921 + TaqI TCGA 1918 1920 . . 1949 1953 + HgaI GACGC 1958 1963 . . 1949 1954 + AcyI GRCGYC 1950 1952 . . 1945 1950 - MmeI TCCRAC 1926 1924 . . 1963 1967 + TspGWI ACGGA 1978 1976 . . 1984 1987 + SetI ASST 1987 1983 . . 1984 1987 + CviJI RGCY 1985 1985 . . 1984 1987 + AluI AGCT 1985 1985 . . 1996 2000 + MaeIII GTNAC 1995 2000 . . 2007 2010 + FatI CATG 2006 2010 . . 2007 2010 + NlaIII CATG 2010 2006 . . 2007 2010 + CviAII CATG 2007 2009 . . 2027 2032 + Hpy166II GTNNAC 2029 2029 . . 2032 2035 + MaeI CTAG 2032 2034 . . 2034 2037 + SetI ASST 2037 2033 . . 2034 2037 + CviJI RGCY 2035 2035 . . 2034 2037 + AluI AGCT 2035 2035 . . 2036 2039 + MaeI CTAG 2036 2038 . . 2046 2049 + CviJI RGCY 2047 2047 . . 2065 2068 + Csp6I GTAC 2065 2067 . . 2065 2068 + RsaI GTAC 2066 2066 . . 2067 2070 + TaiI ACGT 2070 2066 . . 2067 2070 + SetI ASST 2070 2066 . . 2067 2070 + MaeII ACGT 2067 2069 . . 2078 2083 + StuI AGGCCT 2080 2080 . . 2079 2082 + CviJI RGCY 2080 2080 . . 2079 2082 + HaeIII GGCC 2080 2080 . . 2080 2090 + MwoI GCNNNNNNNGC 2086 2083 . . 2081 2084 + MnlI CCTC 2091 2090 . . 2082 2087 + Ksp632I* CTCTTC 2088 2091 . . 2083 2087 - MboII GAAGA 2075 2074 . . 2107 2111 + BsrI ACTGG 2112 2110 . . 2119 2123 + TspGWI ACGGA 2134 2132 . . 2116 2120 - BsmAI GTCTC 2110 2114 . . 2116 2121 - Esp3I CGTCTC 2110 2114 . . 2124 2127 + TspEI AATT 2123 2127 . . 2125 2130 + VspI ATTAAT 2126 2128 . . 2126 2129 + MseI TTAA 2126 2128 . . 2128 2133 + SspI AATATT 2130 2130 . . 2159 2162 + MseI TTAA 2159 2161 . . 2162 2165 + SetI ASST 2165 2161 . . 2169 2172 + SetI ASST 2172 2168 . . 2173 2177 + TfiI GAWTC 2173 2176 . . 2173 2177 + HinfI GANTC 2173 2176 . . 2176 2181 + Hpy178III* TCNNGA 2177 2179 . . 2180 2184 + TfiI GAWTC 2180 2183 . . 2180 2184 + HinfI GANTC 2180 2183 . . 2185 2195 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2191 2188 . . 2185 2195 + PflMI CCANNNNNTGG 2191 2188 . . 2191 2195 - BccI CCATC 2185 2186 . . 2197 2201 + Tsp4CI* ACNGT 2199 2198 . . 2215 2219 + Hpy188I TCNGA 2217 2216 . . 2212 2216 - MboII GAAGA 2204 2203 . . 2216 2221 + Eco57MI CTGRAG 2237 2235 . . 2211 2216 - BbvII* GAAGAC 2204 2208 . . 2216 2221 + Eco57I CTGAAG 2237 2235 . . 2221 2226 + SalI GTCGAC 2221 2225 . . 2221 2226 + Hpy166II GTNNAC 2223 2223 . . 2221 2226 + HindII GTYRAC 2223 2223 . . 2221 2226 + AccI GTMKAC 2222 2224 . . 2222 2225 + TaqI TCGA 2222 2224 . . 2223 2227 + Hpy99I CGWCG 2227 2222 . . 2233 2236 + MseI TTAA 2233 2235 . . 2241 2244 + SetI ASST 2244 2240 . . 2242 2246 + HphI GGTGA 2254 2253 . . 2245 2249 + TfiI GAWTC 2245 2248 . . 2245 2249 + HinfI GANTC 2245 2248 . . 2258 2263 + Hpy178III* TCNNGA 2259 2261 . . 2254 2258 - BsrI ACTGG 2254 2252 . . 2257 2261 - BslFI GGGAC 2242 2246 . . 2276 2281 + MfeI CAATTG 2276 2280 . . 2277 2280 + TspEI AATT 2276 2280 . . 2286 2289 + CviRI* TGCA 2287 2287 . . 2290 2294 + BinI* GGATC 2298 2299 . . 2291 2294 + DpnI GATC 2292 2292 . . 2291 2294 + BstKTI GATC 2293 2291 . . 2291 2294 + MboI GATC 2290 2294 . . 2295 2299 + HphI GGTGA 2307 2306 . . 2304 2310 + TspRI CASTGNN 2310 2301 . . 2305 2309 + BsrI ACTGG 2310 2308 . . 2309 2312 + Csp6I GTAC 2309 2311 . . 2309 2312 + RsaI GTAC 2310 2310 . . 2324 2327 + SetI ASST 2327 2323 . . 2324 2327 + CviJI RGCY 2325 2325 . . 2324 2327 + AluI AGCT 2325 2325 . . 2325 2335 + MwoI GCNNNNNNNGC 2331 2328 . . 2325 2331 + EspI* GCTNAGC 2326 2329 . . 2326 2330 + DdeI CTNAG 2326 2329 . . 2330 2335 + Cac8I GCNNGC 2332 2332 . . 2326 2330 - BspCNI CTCAG 2318 2316 . . 2326 2330 - BseMII CTCAG 2317 2315 . . 2332 2337 + HindIII AAGCTT 2332 2336 . . 2333 2336 + SetI ASST 2336 2332 . . 2333 2336 + CviJI RGCY 2334 2334 . . 2333 2336 + AluI AGCT 2334 2334 . . 2338 2342 + BssKI CCNGG 2337 2342 . . 2338 2342 + BseBI CCWGG 2339 2340 . . 2338 2343 + SecI* CCNNGG 2338 2342 . . 2338 2342 + ScrFI CCNGG 2339 2340 . . 2338 2342 + EcoRII CCWGG 2337 2342 . . 2357 2360 + Csp6I GTAC 2357 2359 . . 2357 2360 + RsaI GTAC 2358 2358 . . 2360 2374 + XcmI CCANNNNNNNNNTGG 2367 2366 . . 2363 2368 + TsoI TARCCA 2379 2377 . . 2364 2367 + CviJI RGCY 2365 2365 . . 2370 2374 - BccI CCATC 2364 2365 . . 2366 2377 - CspCI CAANNNNNGTGG 2390 2388 2355 2353 2378 2382 + TspDTI ATGAA 2393 2391 . . 2387 2390 + TspEI AATT 2386 2390 . . 2389 2392 + MseI TTAA 2389 2391 . . 2393 2397 + DdeI CTNAG 2393 2396 . . 2396 2399 + CviJI RGCY 2397 2397 . . 2402 2407 + XhoII RGATCY 2402 2406 . . 2403 2406 + DpnI GATC 2404 2404 . . 2403 2406 + BstKTI GATC 2405 2403 . . 2403 2406 + MboI GATC 2402 2406 . . 2403 2407 - BinI* GGATC 2397 2398 . . 2424 2427 + TspEI AATT 2423 2427 . . 2427 2430 + CviRI* TGCA 2428 2428 . . 2456 2460 + TfiI GAWTC 2456 2459 . . 2456 2460 + HinfI GANTC 2456 2459 . . 2460 2466 + TspRI CASTGNN 2466 2457 . . 2461 2465 + Tsp4CI* ACNGT 2463 2462 . . 2467 2471 + Tsp45I GTSAC 2466 2471 . . 2467 2471 + MaeIII GTNAC 2466 2471 . . 2470 2473 + SetI ASST 2473 2469 . . 2468 2472 - HphI GGTGA 2460 2459 . . 2488 2491 - AciI CCGC 2488 2490 . . 2495 2499 + TfiI GAWTC 2495 2498 . . 2495 2499 + HinfI GANTC 2495 2498 . . 2491 2496 - MmeI TCCRAC 2472 2470 . . 2498 2502 - TspGWI ACGGA 2488 2486 . . 2494 2505 - TstI CACNNNNNNTCC 2518 2513 2486 2481 2516 2520 + FauI CCCGC 2524 2526 . . 2517 2520 + AciI CCGC 2517 2519 . . 2517 2522 + BsrBI CCGCTC 2519 2519 . . 2521 2525 + Hpy188I TCNGA 2523 2522 . . 2524 2528 - SfaNI GCATC 2514 2518 . . 2527 2531 - BceAI ACGGC 2512 2514 . . 2532 2535 + TspEI AATT 2531 2535 . . 2538 2541 + CviJI RGCY 2539 2539 . . 2538 2541 + HaeIII GGCC 2539 2539 . . 2557 2561 + Tsp4CI* ACNGT 2559 2558 . . 2560 2563 + Csp6I GTAC 2560 2562 . . 2560 2563 + RsaI GTAC 2561 2561 . . 2576 2580 - BslFI GGGAC 2561 2565 . . 2596 2600 - BceAI ACGGC 2581 2583 . . 2590 2602 - AloI GAACNNNNNNTCC 2614 2609 2582 2577 2619 2622 + CviRI* TGCA 2620 2620 . . 2626 2631 + AcyI GRCGYC 2627 2629 . . 2628 2632 + Hpy99I CGWCG 2632 2627 . . 2627 2631 - HgaI GACGC 2616 2621 . . 2632 2636 + BlsI GCNGC 2634 2633 . . 2632 2636 + BisI GCNGC 2633 2634 . . 2632 2636 + TseI GCWGC 2632 2635 . . 2632 2636 - BbvI GCAGC 2619 2623 . . 2642 2645 - MnlI CCTC 2635 2634 . . 2642 2652 - Hin4I GAYNNNNNVTC 2665 2660 2633 2628 2651 2655 - MboII GAAGA 2643 2642 . . 2660 2665 + EcoP15I CAGCAG 2690 2692 . . 2694 2699 + NspI RCATGY 2698 2694 . . 2695 2698 + FatI CATG 2694 2698 . . 2695 2698 + NlaIII CATG 2698 2694 . . 2695 2698 + CviAII CATG 2695 2697 . . 2705 2708 + TaqI TCGA 2705 2707 . . 2702 2706 - MboII GAAGA 2694 2693 . . 2701 2706 - BbvII* GAAGAC 2694 2698 . . 2716 2721 + KpnI GGTACC 2720 2716 . . 2716 2721 + NlaIV GGNNCC 2718 2718 . . 2716 2721 + HgiCI* GGYRCC 2716 2720 . . 2716 2721 + Acc65I GGTACC 2716 2720 . . 2717 2720 + Csp6I GTAC 2717 2719 . . 2717 2720 + RsaI GTAC 2718 2718 . . 2726 2731 + Eco57MI CTGRAG 2747 2745 . . 2726 2731 + Eco57I CTGAAG 2747 2745 . . 2729 2739 + FalI AAGNNNNNCTT 2720 2715 2752 2747 2728 2732 - Hin4II* CCTTC 2722 2721 . . 2729 2739 - FalI AAGNNNNNCTT 2752 2747 2720 2715 2740 2744 + Tsp4CI* ACNGT 2742 2741 . . 2741 2746 + SfeI* CTRYAG 2741 2745 . . 2745 2750 + TatI WGTACW 2745 2749 . . 2746 2749 + Csp6I GTAC 2746 2748 . . 2746 2749 + RsaI GTAC 2747 2747 . . 2749 2752 + FatI CATG 2748 2752 . . 2749 2752 + NlaIII CATG 2752 2748 . . 2749 2752 + CviAII CATG 2749 2751 . . 2750 2754 + TspDTI ATGAA 2765 2763 . . 2755 2759 + Tsp4CI* ACNGT 2757 2756 . . 2764 2768 + HphI GGTGA 2776 2775 . . 2767 2770 + DpnI GATC 2768 2768 . . 2767 2770 + BstKTI GATC 2769 2767 . . 2767 2770 + MboI GATC 2766 2770 . . 2776 2779 + TspEI AATT 2775 2779 . . 2800 2803 + MseI TTAA 2800 2802 . . 2804 2809 + Eco57MI CTGRAG 2825 2823 . . 2804 2809 + Eco57I CTGAAG 2825 2823 . . 2806 2810 - Hin4II* CCTTC 2800 2799 . . 2818 2829 + TstI CACNNNNNNTCC 2809 2804 2841 2836 2818 2823 + TaqII CACCCA 2834 2832 . . 2821 2825 - BsrI ACTGG 2821 2819 . . 2820 2825 - BfiI ACTGGG 2815 2814 . . 2828 2833 + DsaI* CCRYGG 2828 2832 . . 2828 2833 + StyI CCWWGG 2828 2832 . . 2828 2833 + NcoI CCATGG 2828 2832 . . 2828 2833 + SecI* CCNNGG 2828 2832 . . 2829 2832 + FatI CATG 2828 2832 . . 2829 2832 + NlaIII CATG 2832 2828 . . 2829 2832 + CviAII CATG 2829 2831 . . 2839 2843 + SfaNI GCATC 2848 2852 . . 2840 2844 - FokI GGATG 2826 2830 . . 2840 2844 - BseGI GGATG 2839 2837 . . 2859 2862 + SetI ASST 2862 2858 . . 2892 2895 + SetI ASST 2895 2891 . . 2892 2895 + CviJI RGCY 2893 2893 . . 2892 2895 + AluI AGCT 2893 2893 . . 2896 2900 + Tsp45I GTSAC 2895 2900 . . 2896 2900 + MaeIII GTNAC 2895 2900 . . 2899 2903 + BsrI ACTGG 2904 2902 . . 2907 2910 - AciI CCGC 2907 2909 . . 2907 2911 - FauI CCCGC 2900 2902 . . 2914 2918 - Hin4II* CCTTC 2908 2907 . . 2940 2944 + MaeIII GTNAC 2939 2944 . . 2948 2951 - MnlI CCTC 2941 2940 . . 2954 2958 + Tsp4CI* ACNGT 2956 2955 . . 2963 2966 + CviJI RGCY 2964 2964 . . 2971 2980 + MslI CAYNNNNRTG 2975 2975 . . 2980 2983 + DpnI GATC 2981 2981 . . 2980 2983 + BstKTI GATC 2982 2980 . . 2980 2983 + MboI GATC 2979 2983 . . 2982 2987 + Hpy178III* TCNNGA 2983 2985 . . 2980 2984 - BinI* GGATC 2974 2975 . . 2987 2990 + TaiI ACGT 2990 2986 . . 2987 2990 + SetI ASST 2990 2986 . . 2987 2990 + MaeII ACGT 2987 2989 . . 2990 2995 + AsuII TTCGAA 2991 2993 . . 2991 2994 + TaqI TCGA 2991 2993 . . 2997 3000 + CviJI RGCY 2998 2998 . . 3035 3038 + MseI TTAA 3035 3037 . . 3044 3052 + AlwNI CAGNNNCTG 3049 3046 . . 3046 3050 + Tsp45I GTSAC 3045 3050 . . 3046 3050 + MaeIII GTNAC 3045 3050 . . 3048 3054 + TspRI CASTGNN 3054 3045 . . 3050 3055 + PstI CTGCAG 3054 3050 . . 3050 3055 + SfeI* CTRYAG 3050 3054 . . 3051 3054 + CviRI* TGCA 3052 3052 . . 3052 3062 + MwoI GCNNNNNNNGC 3058 3055 . . 3052 3062 + BstAPI GCANNNNNTGC 3058 3055 . . 3048 3053 - BtsI GCAGTG 3047 3045 . . 3059 3064 + EcoT22I ATGCAT 3063 3059 . . 3060 3063 + CviRI* TGCA 3061 3061 . . 3067 3070 - MnlI CCTC 3060 3059 . . 3070 3074 + HinfI GANTC 3070 3073 . . 3070 3074 - PleI GAGTC 3064 3065 . . 3070 3074 - MlyI GAGTC 3064 3064 . . 3083 3091 + AlwNI CAGNNNCTG 3088 3085 . . 3085 3095 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3076 3071 3108 3103 3085 3089 - SfaNI GCATC 3075 3079 . . 3091 3095 + BsmAI GTCTC 3096 3100 . . 3101 3104 + MseI TTAA 3101 3103 . . 3108 3112 + MaeIII GTNAC 3107 3112 . . 3119 3122 - MnlI CCTC 3112 3111 . . 3147 3151 + FokI GGATG 3160 3164 . . 3147 3151 + BseGI GGATG 3153 3151 . . 3157 3162 + NlaIV GGNNCC 3159 3159 . . 3154 3158 - BccI CCATC 3148 3149 . . 3159 3162 + CviJI RGCY 3160 3160 . . 3160 3164 - BceAI ACGGC 3145 3147 . . 3175 3179 + BlsI GCNGC 3177 3176 . . 3175 3179 + BisI GCNGC 3176 3177 . . 3175 3179 + BbvI GCAGC 3187 3191 . . 3175 3179 + TseI GCWGC 3175 3178 . . 3177 3180 + CviJI RGCY 3178 3178 . . 3189 3192 + TspEI AATT 3188 3192 . . 3196 3199 + SetI ASST 3199 3195 . . 3196 3199 + CviJI RGCY 3197 3197 . . 3196 3199 + AluI AGCT 3197 3197 . . 3202 3207 + SspI AATATT 3204 3204 . . 3217 3227 + MwoI GCNNNNNNNGC 3223 3220 . . 3217 3227 + BstAPI GCANNNNNTGC 3223 3220 . . 3222 3227 + Cac8I GCNNGC 3224 3224 . . 3224 3229 + PstI CTGCAG 3228 3224 . . 3224 3229 + SfeI* CTRYAG 3224 3228 . . 3225 3228 + CviRI* TGCA 3226 3226 . . 3245 3248 + MseI TTAA 3245 3247 . . 3257 3260 + TaqI TCGA 3257 3259 . . 3263 3267 + MboII GAAGA 3275 3274 . . 3259 3263 - Hin4II* CCTTC 3253 3252 . . 3268 3271 + TspEI AATT 3267 3271 . . 3280 3284 - MboII GAAGA 3272 3271 . . 3297 3302 + Cfr10I RCCGGY 3297 3301 . . 3297 3302 + BetI* WCCGGW 3297 3301 . . 3297 3302 + AgeI ACCGGT 3297 3301 . . 3298 3301 + HpaII CCGG 3298 3300 . . 3316 3320 + HphI GGTGA 3328 3327 . . 3317 3321 + Tsp45I GTSAC 3316 3321 . . 3317 3321 + MaeIII GTNAC 3316 3321 . . 3314 3317 - AciI CCGC 3314 3316 . . 3320 3324 + TspGWI ACGGA 3335 3333 . . 3330 3334 + Hpy99I CGWCG 3334 3329 . . 3331 3335 + HgaI GACGC 3340 3345 . . 3335 3340 + MfeI CAATTG 3335 3339 . . 3336 3339 + TspEI AATT 3335 3339 . . 3345 3349 + HinfI GANTC 3345 3348 . . 3347 3352 + SmlI CTYRAG 3347 3351 . . 3345 3349 - PleI GAGTC 3339 3340 . . 3345 3349 - MlyI GAGTC 3339 3339 . . 3347 3352 - Bce83I* CTTGAG 3332 3330 . . 3367 3376 + MslI CAYNNNNRTG 3371 3371 . . 3365 3369 - TspDTI ATGAA 3355 3353 . . 3362 3372 - Hin4I GAYNNNNNVTC 3385 3380 3353 3348 3376 3379 - MnlI CCTC 3369 3368 . . 3386 3389 + SetI ASST 3389 3385 . . 3385 3388 - MnlI CCTC 3378 3377 . . 3391 3401 + MwoI GCNNNNNNNGC 3397 3394 . . 3395 3398 + SetI ASST 3398 3394 . . 3395 3398 + CviJI RGCY 3396 3396 . . 3395 3398 + AluI AGCT 3396 3396 . . 3396 3401 + Cac8I GCNNGC 3398 3398 . . 3396 3401 + BmtI GCTAGC 3400 3396 . . 3396 3401 + NheI GCTAGC 3396 3400 . . 3397 3400 + MaeI CTAG 3397 3399 . . 3399 3402 + SetI ASST 3402 3398 . . 3399 3402 + CviJI RGCY 3400 3400 . . 3399 3402 + AluI AGCT 3400 3400 . . 3400 3404 + BlsI GCNGC 3402 3401 . . 3400 3404 + BisI GCNGC 3401 3402 . . 3400 3404 + TseI GCWGC 3400 3403 . . 3400 3404 - BbvI GCAGC 3387 3391 . . 3401 3406 - EcoP15I CAGCAG 3373 3375 . . 3418 3421 + MseI TTAA 3418 3420 . . 3422 3425 + CviJI RGCY 3423 3423 . . 3428 3431 + SetI ASST 3431 3427 . . 3428 3431 + CviJI RGCY 3429 3429 . . 3428 3431 + AluI AGCT 3429 3429 . . 3436 3441 + SspI AATATT 3438 3438 . . 3454 3458 + Tsp4CI* ACNGT 3456 3455 . . 3468 3471 + CviJI RGCY 3469 3469 . . 3468 3471 + HaeIII GGCC 3469 3469 . . 3470 3480 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 3476 3473 . . 3471 3474 + FatI CATG 3470 3474 . . 3471 3474 + NlaIII CATG 3474 3470 . . 3471 3474 + CviAII CATG 3471 3473 . . 3485 3488 + TspEI AATT 3484 3488 . . 3489 3494 + ApoI RAATTY 3489 3493 . . 3490 3493 + TspEI AATT 3489 3493 . . 3528 3538 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 3534 3531 . . 3535 3539 + TauI GCSGC 3538 3535 . . 3535 3545 + MwoI GCNNNNNNNGC 3541 3538 . . 3535 3539 + BlsI GCNGC 3537 3536 . . 3535 3539 + BisI GCNGC 3536 3537 . . 3537 3540 + CviJI RGCY 3538 3538 . . 3535 3538 - AciI CCGC 3535 3537 . . 3541 3546 + NlaIV GGNNCC 3543 3543 . . 3541 3546 + HgiCI* GGYRCC 3541 3545 . . 3550 3555 + Hpy166II GTNNAC 3552 3552 . . 3550 3555 + HindII GTYRAC 3552 3552 . . 3557 3561 - TspDTI ATGAA 3547 3545 . . 3577 3580 - AciI CCGC 3577 3579 . . 3577 3581 - FauI CCCGC 3570 3572 . . 3591 3596 + SpeI ACTAGT 3591 3595 . . 3592 3595 + MaeI CTAG 3592 3594 . . 3599 3604 + BciVI GTATCC 3610 3609 . . 3603 3606 + MnlI CCTC 3613 3612 . . 3612 3615 + TspEI AATT 3611 3615 . . 3621 3624 + SetI ASST 3624 3620 . . 3621 3624 + CviJI RGCY 3622 3622 . . 3621 3624 + AluI AGCT 3622 3622 . . 3619 3631 - BarI GAAGNNNNNNTAC 3643 3638 3611 3606 3639 3642 + CviRI* TGCA 3640 3640 . . #--------------------------------------- # # # Acc65I: # [GGTACC] # 31 935 1191 1494 # # AccI: # [GTMKAC] # 269 1429 1953 # # AciI: # [CCGC] # 29 37 42 74 81 221 # 227 355 377 390 407 698 # 713 # # AcyI: # [GRCGYC] # 677 1024 1950 # # AflII: # [CTTAAG] # 1282 2369 # # AgeI: # [ACCGGT] # 283 354 936 2078 # # AhaIII*: # [TTTAAA] # 768 2883 # # AloI: # [GAACNNNNNNTCC] # 32 1037 2582 # # AluI: # [AGCT] # 4 8 9 29 29 31 # 50 54 105 176 193 199 # 225 234 236 290 304 371 # 545 559 # # AlwNI: # [CAGNNNCTG] # 39 563 3049 # # ApoI: # [RAATTY] # 66 94 162 194 275 343 # 788 1729 # # AsuI*: # [GGNCC] # 182 1637 1832 # # AsuII: # [TTCGAA] # 660 2991 # # AvaII: # [GGWCC] # 1819 1832 # # BalI: # [TGGCCA] # 439 1067 2145 # # BarI: # [GAAGNNNNNNTAC] # 8 32 3611 # # BbvI: # [GCAGC] # 22 45 83 129 183 200 # 218 264 418 568 729 792 # # BbvII*: # [GAAGAC] # 490 874 957 1330 # # BccI: # [CCATC] # 29 34 127 179 179 205 # 460 503 784 1151 # # Bce83I*: # [CTTGAG] # 197 319 591 634 1910 # # BceAI: # [ACGGC] # 69 506 564 2512 # # BcgI: # [CGANNNNNNTGC] # 34 1657 1960 # # BciVI: # [GTATCC] # 41 3610 # # BclI: # [TGATCA] # 291 3360 # # BetI*: # [WCCGGW] # 22 261 354 936 2078 # # BfiI: # [ACTGGG] # 836 2815 # # BglI: # [GCCNNNNNGGC] # 236 3415 # # BglII: # [AGATCT] # 1587 2064 # # BinI*: # [GGATC] # 13 99 113 149 173 327 # 415 577 677 1108 # # BisI: # [GCNGC] # 3 42 54 105 115 129 # 135 208 218 225 378 543 # 729 767 # # BlsI: # [GCNGC] # 3 42 54 105 114 129 # 135 208 218 225 379 543 # 729 767 # # BmgT120I: # [GGNCC] # 183 1637 1831 # # BmtI: # [GCTAGC] # 251 1608 1792 # # Bpu10I: # [CCTNAGC] # 1370 2281 # # BseBI: # [CCWGG] # 479 1312 1860 # # BseGI: # [GGATG] # 32 67 217 314 366 377 # 498 582 1198 # # BseMII: # [CTCAG] # 2 18 109 209 357 689 # 933 1334 # # BsePI: # [GCGCGC] # 1298 2353 # # BseRI: # [GAGGAG] # 185 673 2793 # # BseYI: # [CCCAGC] # 95 161 3395 # # BsgI: # [GTGCAG] # 1671 1980 # # BsiI*: # [CACGAG] # 1726 1925 # # BsiYI*: # [CCNNNNNNNGG] # 58 117 1285 2191 # # BslFI: # [GGGAC] # 319 1090 2242 # # BsmAI: # [GTCTC] # 1 46 91 135 161 222 # 375 555 986 1079 # # Bsp1407I: # [TGTACA] # 854 2797 # # BspCNI: # [CTCAG] # 18 111 210 357 687 935 # 1333 # # BspHI: # [TCATGA] # 558 3093 # # BsrBI: # [CCGCTC] # 732 1132 1787 # # BsrDI: # [GCAATG] # 1062 2589 # # BsrI: # [ACTGG] # 56 59 83 142 338 357 # 511 574 747 784 # # BssKI: # [CCNGG] # 479 1314 1858 # # BstAPI: # [GCANNNNNTGC] # 165 428 3058 # # BstEII: # [GGTNACC] # 397 3254 # # BstKTI: # [GATC] # 13 112 121 128 149 160 # 173 212 213 364 415 669 # 922 # # BstXI: # [CCANNNNNNTGG] # 1656 1995 # # BtgZI: # [GCGATG] # 53 342 3256 # # BtsI: # [GCAGTG] # 604 3047 # # Cac8I: # [GCNNGC] # 46 134 174 178 253 266 # 542 892 1166 # # Cfr10I: # [RCCGGY] # 283 354 936 2078 # # CfrI: # [YGGCCR] # 439 1065 2147 # # Csp6I: # [GTAC] # 12 29 32 39 48 56 # 141 157 163 203 244 312 # 640 670 905 # # CspCI: # [CAANNNNNGTGG] # 35 1261 2355 # # CviAII: # [CATG] # 36 54 80 102 133 163 # 180 311 324 375 563 642 # 688 # # CviJI: # [RGCY] # 4 6 6 6 8 8 # 9 12 15 18 18 19 # 23 29 31 31 32 33 # 34 40 47 50 50 54 # 69 71 73 81 84 100 # 105 106 114 122 142 158 # 161 162 177 199 245 264 # 281 354 # # CviRI*: # [TGCA] # 9 11 26 35 42 42 # 87 90 128 141 165 192 # 211 361 377 414 417 432 # 471 # # DdeI: # [CTNAG] # 18 21 33 67 78 130 # 197 357 536 956 1258 # # DpnI: # [GATC] # 13 112 120 128 149 160 # 173 212 213 364 415 670 # 922 # # DraIII: # [CACNNNGTG] # 1513 2138 # # DsaI*: # [CCRYGG] # 823 1032 1796 # # Eco31I: # [GGTCTC] # 162 3489 # # Eco47III: # [AGCGCT] # 1749 1902 # # Eco57I: # [CTGAAG] # 78 129 256 431 510 826 # 1421 # # Eco57MI: # [CTGRAG] # 78 129 256 431 510 826 # 1421 # # EcoP15I: # [CAGCAG] # 278 683 2690 # # EcoRI: # [GAATTC] # 1417 2234 # # EcoRII: # [CCWGG] # 479 1314 1858 # # EcoT22I: # [ATGCAT] # 134 588 2929 # # Esp3I: # [CGTCTC] # 1541 2110 # # EspI*: # [GCTNAGC] # 1325 2326 # # FalI: # [AAGNNNNNCTT] # 0 0 32 899 2720 # # FatI: # [CATG] # 36 54 80 102 132 163 # 181 311 324 375 563 642 # 688 # # FauI: # [CCCGC] # 81 376 670 952 1572 # # FnuDII*: # [CGCG] # 477 1300 1874 # # FokI: # [GGATG] # 12 67 217 334 373 377 # 491 582 1198 # # GlaI: # [GCGC] # 2 601 1299 1749 # # GsaI: # [CCCAGC] # 95 165 3391 # # HaeII: # [RGCGCY] # 1747 1904 # # HaeIII: # [GGCC] # 182 183 439 459 574 884 # 930 # # HgaI: # [GACGC] # 192 311 658 724 1766 # # HgiAI*: # [GWGCWC] # 1232 2419 # # HgiCI*: # [GGYRCC] # 31 110 357 825 1137 1191 # # HgiJII*: # [GRGCYC] # 1743 1908 # # HhaI: # [GCGC] # 2 601 1300 1748 # # Hin4I: # [GAYNNNNNVTC] # 0 0 0 0 32 32 # 32 32 32 32 32 32 # 32 58 120 126 195 245 # 266 411 440 478 1024 # # Hin4II*: # [CCTTC] # 61 71 78 108 345 398 # 490 498 535 1067 # # Hin6I: # [GCGC] # 2 601 1298 1750 # # HindII: # [GTYRAC] # 99 1329 2223 # # HindIII: # [AAGCTT] # 1319 2332 # # HinfI: # [GANTC] # 7 9 30 39 65 107 # 108 189 211 241 275 285 # 304 306 449 451 575 # # HpaII: # [CCGG] # 7 16 261 353 936 2078 # # HphI: # [GGTGA] # 53 108 153 301 316 323 # 552 1845 # # Hpy166II: # [GTNNAC] # 27 69 99 194 270 715 # 948 1329 # # Hpy178III*: # [TCNNGA] # 9 24 25 41 46 82 # 92 110 132 159 197 199 # 359 360 424 668 724 # # Hpy188I: # [TCNGA] # 306 540 1128 1677 # # Hpy99I: # [CGWCG] # 317 405 702 2227 # # KpnI: # [GGTACC] # 35 931 1191 1494 # # Ksp632I*: # [CTCTTC] # 22 251 685 1130 1563 # # MaeI: # [CTAG] # 4 59 109 134 195 848 # 941 1361 # # MaeII: # [ACGT] # 664 920 2067 # # MaeIII: # [GTNAC] # 36 44 62 68 106 172 # 209 224 225 335 393 397 # 429 471 480 # # MboI: # [GATC] # 13 112 118 128 149 160 # 173 212 213 364 415 672 # 922 # # MboII: # [GAAGA] # 3 9 45 51 129 196 # 221 317 340 376 428 439 # 519 578 # # McrI*: # [CGRYCG] # 1694 1957 # # MfeI: # [CAATTG] # 316 502 682 1059 1092 # # MlyI: # [GAGTC] # 275 312 634 2430 # # MmeI: # [TCCRAC] # 145 257 546 620 904 1179 # # MnlI: # [CCTC] # 9 38 52 63 71 78 # 94 112 119 127 180 228 # 235 247 257 291 306 544 # 600 # # MseI: # [TTAA] # 22 33 50 50 60 66 # 74 84 138 144 156 173 # 184 198 233 235 235 338 # 411 767 # # MslI: # [CAYNNNNRTG] # 10 108 127 162 216 280 # 396 549 698 1105 # # MwoI: # [GCNNNNNNNGC] # 110 141 144 165 174 236 # 245 727 1709 # # NcoI: # [CCATGG] # 823 1032 1796 # # NheI: # [GCTAGC] # 255 1608 1788 # # NlaIII: # [CATG] # 36 54 80 102 136 163 # 177 311 324 375 563 642 # 688 # # NlaIV: # [GGNNCC] # 33 43 108 161 357 384 # 441 976 1148 # # NspBII*: # [CMGCKG] # 105 371 3175 # # NspI: # [RCATGY] # 136 953 2562 # # PflMI: # [CCANNNNNTGG] # 1460 2191 # # PleI: # [GAGTC] # 275 312 634 2430 # # PstI: # [CTGCAG] # 174 423 3054 # # PvuII: # [CAGCTG] # 105 371 3175 # # RsaI: # [GTAC] # 12 29 33 39 48 56 # 141 157 163 203 244 312 # 640 670 904 # # SalI: # [GTCGAC] # 1430 2221 # # SauI*: # [CCTNAGG] # 197 3454 # # ScaI: # [AGTACT] # 844 2807 # # ScrFI: # [CCNGG] # 479 1312 1860 # # SduI: # [GDGCHC] # 511 1232 1908 # # SecI*: # [CCNNGG] # 490 823 1032 1306 # # SetI: # [ASST] # 4 7 7 8 9 9 # 11 23 23 27 29 29 # 31 31 33 33 33 48 # 50 56 59 72 78 82 # 83 86 95 95 104 137 # 146 165 170 190 193 209 # 221 236 340 389 # # SfaNI: # [GCATC] # 46 72 108 113 192 217 # 227 334 576 1766 # # SfeI*: # [CTRYAG] # 174 309 427 1287 1454 # # SmlI: # [CTYRAG] # 78 119 304 555 649 1946 # # SpeI: # [ACTAGT] # 60 3591 # # SphI: # [GCATGC] # 136 3515 # # SspI: # [AATATT] # 213 234 372 421 1074 1337 # # StuI: # [AGGCCT] # 1571 2080 # # StyI: # [CCWWGG] # 823 1032 1796 # # TaiI: # [ACGT] # 661 920 2070 # # TaqI: # [TCGA] # 171 266 286 304 394 458 # 483 521 768 # # TaqII: # [CACCCA] # 817 2834 # # TatI: # [WGTACW] # 12 407 842 906 1484 # # TauI: # [GCSGC] # 113 380 3158 # # TfiI: # [GAWTC] # 7 30 39 65 107 108 # 189 211 241 294 304 449 # 451 1156 # # TseI: # [GCWGC] # 3 42 105 129 208 218 # 225 251 431 543 729 767 # # TsoI: # [TARCCA] # 1272 2379 # # Tsp45I: # [GTSAC] # 150 240 271 335 397 429 # 878 951 # # Tsp4CI*: # [ACNGT] # 15 28 96 161 172 183 # 195 199 264 315 376 500 # 505 642 # # TspDTI: # [ATGAA] # 15 16 93 104 122 163 # 192 301 372 413 490 590 # 780 # # TspEI: # [AATT] # 5 10 27 37 40 44 # 66 68 79 84 89 92 # 105 108 110 112 122 149 # 153 167 188 231 244 275 # 314 319 413 # # TspGWI: # [ACGGA] # 156 316 354 847 1978 # # TspRI: # [CASTGNN] # 104 156 351 588 597 1855 # # TstI: # [CACNNNNNNTCC] # 32 32 32 291 810 859 # 1595 # # VspI: # [ATTAAT] # 633 1493 1525 # # XbaI: # [TCTAGA] # 847 2804 # # XcmI: # [CCANNNNNNNNNTGG] # 1284 2367 # # XhoII: # [RGATCY] # 13 118 149 212 288 527 # 1095 1249 # # XmnI: # [GAANNNNTTC] # 305 524 2822 # #--------------------------------------- #--------------------------------------- # Total_sequences: 1 # Total_length: 3651 # Reported_sequences: 1 # Reported_hitcount: 879 #---------------------------------------