Restriction Fragments for DUR1,2/YBR208C



Send questions or suggestions to SGD

BLAST search | Genome Restriction Map | Design Primers for this sequence


The currently selected gene/sequence is :

DUR1,2/YBR208C on chromosome II from coordinates 642210 to 636703.

The sequence you have requested is oriented with respect to the Crick (bottom) strand. Thus, the chromosomal coordinate of the beginning of the gene or sequence is larger than that of the end. The sequence shown here is the 5'-3' direction of the Crick strand and is the reverse complement of the Watson (top) strand.

seqfile=/share/crumb/www-data/html/tmp/gcgseq.tmp.2.29068.2

Start End Strand Enzyme_name Restriction_site 5prime 3prime 5primerev 3primerev 4 8 + Tsp4CI* ACNGT 6 5 . . 13 17 + Hpy188I TCNGA 15 14 . . 15 26 + BcgI CGANNNNNNTGC 4 2 38 36 39 42 + SetI ASST 42 38 . . 56 60 + BsrI ACTGG 61 59 . . 82 85 + SetI ASST 85 81 . . 82 85 + CviJI RGCY 83 83 . . 82 85 + AluI AGCT 83 83 . . 86 91 + SecI* CCNNGG 86 90 . . 87 91 + BssKI CCNGG 86 91 . . 87 91 + BseBI CCWGG 88 89 . . 87 91 + ScrFI CCNGG 88 89 . . 87 91 + EcoRII CCWGG 86 91 . . 90 93 + CviJI RGCY 91 91 . . 97 101 + DdeI CTNAG 97 100 . . 101 104 + CviJI RGCY 102 102 . . 105 110 + Hpy178III* TCNNGA 106 108 . . 109 113 + TfiI GAWTC 109 112 . . 109 113 + HinfI GANTC 109 112 . . 118 121 + MaeI CTAG 118 120 . . 121 125 + HinfI GANTC 121 124 . . 121 125 - PleI GAGTC 115 116 . . 121 125 - MlyI GAGTC 115 115 . . 136 139 + Hin6I GCGC 136 138 . . 136 139 + GlaI GCGC 137 137 . . 136 139 + HhaI GCGC 138 136 . . 143 146 + TaqI TCGA 143 145 . . 139 143 - BsrI ACTGG 139 137 . . 156 161 + EcoRV GATATC 158 158 . . 165 168 + TspEI AATT 164 168 . . 177 182 + ApoI RAATTY 177 181 . . 178 181 + TspEI AATT 177 181 . . 185 188 + CviRI* TGCA 186 186 . . 184 189 - BsgI GTGCAG 169 167 . . 191 194 + TspEI AATT 190 194 . . 197 202 + ApoI RAATTY 197 201 . . 198 201 + TspEI AATT 197 201 . . 201 206 + AhaIII* TTTAAA 203 203 . . 202 205 + MseI TTAA 202 204 . . 231 234 + SetI ASST 234 230 . . 232 235 + MnlI CCTC 242 241 . . 232 242 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 238 235 . . 239 243 + Tsp4CI* ACNGT 241 240 . . 244 248 - BslFI GGGAC 229 233 . . 257 260 + MseI TTAA 257 259 . . 269 272 + TaqI TCGA 269 271 . . 270 274 + Hpy99I CGWCG 274 269 . . 272 275 + TaiI ACGT 275 271 . . 272 275 + SetI ASST 275 271 . . 272 275 + MaeII ACGT 272 274 . . 279 282 + SetI ASST 282 278 . . 278 281 - MnlI CCTC 271 270 . . 281 286 + Hpy166II GTNNAC 283 283 . . 281 286 + AccI GTMKAC 282 284 . . 293 298 + NspBII* CMGCKG 295 295 . . 293 296 + AciI CCGC 293 295 . . 295 299 + BlsI GCNGC 297 296 . . 295 299 + BisI GCNGC 296 297 . . 295 299 + TseI GCWGC 295 298 . . 297 300 + CviRI* TGCA 298 298 . . 298 303 + NspI RCATGY 302 298 . . 299 302 + FatI CATG 298 302 . . 299 302 + NlaIII CATG 302 298 . . 299 302 + CviAII CATG 299 301 . . 295 299 - BbvI GCAGC 282 286 . . 304 308 + BccI CCATC 312 313 . . 305 309 - FokI GGATG 291 295 . . 305 309 - BseGI GGATG 304 302 . . 312 315 + CviRI* TGCA 313 313 . . 314 319 + NdeI CATATG 315 317 . . 320 323 + CviJI RGCY 321 321 . . 322 326 + Hin4II* CCTTC 332 331 . . 331 335 + HinfI GANTC 331 334 . . 331 335 - PleI GAGTC 325 326 . . 331 335 - MlyI GAGTC 325 325 . . 352 356 + DdeI CTNAG 352 355 . . 360 363 + CviRI* TGCA 361 361 . . 363 366 + SetI ASST 366 362 . . 361 366 - BspMI ACCTGC 352 356 . . 361 367 - AarI CACCTGC 352 356 . . 382 392 + FalI AAGNNNNNCTT 373 368 405 400 382 392 - FalI AAGNNNNNCTT 405 400 373 368 393 397 + BmgT120I GGNCC 394 395 . . 393 397 + AvaII GGWCC 393 396 . . 393 397 + AsuI* GGNCC 393 396 . . 398 401 + TspEI AATT 397 401 . . 420 431 + TstI CACNNNNNNTCC 411 406 443 438 421 431 + BsaXI ACNNNNNCTCC 411 408 441 438 423 427 + Tsp4CI* ACNGT 425 424 . . 425 430 + Eco31I GGTCTC 431 435 . . 426 430 + BsmAI GTCTC 431 435 . . 431 436 + NdeI CATATG 432 434 . . 444 447 + SetI ASST 447 443 . . 449 452 + Hin6I GCGC 449 451 . . 449 452 + GlaI GCGC 450 450 . . 449 459 + MwoI GCNNNNNNNGC 455 452 . . 449 452 + HhaI GCGC 451 449 . . 465 470 + NspI RCATGY 469 465 . . 466 469 + FatI CATG 465 469 . . 466 469 + NlaIII CATG 469 465 . . 466 469 + CviAII CATG 466 468 . . 463 473 - Hin4I GAYNNNNNVTC 486 481 454 449 478 483 + NlaIV GGNNCC 480 480 . . 482 485 + MnlI CCTC 492 491 . . 482 492 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 488 485 . . 485 490 + NspBII* CMGCKG 487 487 . . 485 488 + AciI CCGC 485 487 . . 487 497 + MwoI GCNNNNNNNGC 493 490 . . 487 492 - GsaI CCCAGC 491 487 . . 487 492 - BseYI CCCAGC 487 491 . . 496 500 + SfaNI GCATC 505 509 . . 513 516 + SetI ASST 516 512 . . 512 515 - MnlI CCTC 505 504 . . 520 523 + Csp6I GTAC 520 522 . . 520 523 + RsaI GTAC 521 521 . . 524 529 + MfeI CAATTG 524 528 . . 525 528 + TspEI AATT 524 528 . . 528 531 + CviRI* TGCA 529 529 . . 536 539 + Csp6I GTAC 536 538 . . 536 539 + RsaI GTAC 537 537 . . 545 550 + EcoP15I CAGCAG 575 577 . . 548 556 + AlwNI CAGNNNCTG 553 550 . . 549 552 + SetI ASST 552 548 . . 547 552 - BspMI ACCTGC 538 542 . . 560 564 + PleI GAGTC 568 569 . . 560 564 + MlyI GAGTC 569 569 . . 560 564 + HinfI GANTC 560 563 . . 564 569 + GsaI CCCAGC 568 564 . . 564 569 + BseYI CCCAGC 564 568 . . 562 566 - BslFI GGGAC 547 551 . . 567 570 + CviJI RGCY 568 568 . . 568 572 + TauI GCSGC 571 568 . . 568 572 + BlsI GCNGC 570 569 . . 568 572 + BisI GCNGC 569 570 . . 569 572 + AciI CCGC 569 571 . . 581 584 + SetI ASST 584 580 . . 589 592 + CviJI RGCY 590 590 . . 589 592 + HaeIII GGCC 590 590 . . 596 599 + CviJI RGCY 597 597 . . 598 608 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 604 601 . . 604 614 + FalI AAGNNNNNCTT 595 590 627 622 607 612 + AcyI GRCGYC 608 610 . . 608 612 - HgaI GACGC 597 602 . . 604 614 - FalI AAGNNNNNCTT 627 622 595 590 624 627 + SetI ASST 627 623 . . 634 638 + FauI CCCGC 642 644 . . 635 638 + AciI CCGC 635 637 . . 652 662 + Hin4I GAYNNNNNVTC 643 638 675 670 652 660 + Tth111I GACNNNGTC 655 656 . . 653 663 + BsaXI ACNNNNNCTCC 643 640 673 670 657 662 + Esp3I CGTCTC 663 667 . . 658 662 + BsmAI GTCTC 663 667 . . 656 660 - HgaI GACGC 645 650 . . 662 666 + BccI CCATC 670 671 . . 669 672 + CviRI* TGCA 670 670 . . 673 676 + MseI TTAA 673 675 . . 677 680 + SetI ASST 680 676 . . 679 683 + DdeI CTNAG 679 682 . . 685 689 - SfaNI GCATC 675 679 . . 691 703 + AloI GAACNNNNNNTCC 683 678 715 710 695 705 + MwoI GCNNNNNNNGC 701 698 . . 695 699 + BlsI GCNGC 697 696 . . 695 699 + BisI GCNGC 696 697 . . 695 699 + TseI GCWGC 695 698 . . 695 699 - BbvI GCAGC 682 686 . . 702 705 + AciI CCGC 702 704 . . 704 708 + SfaNI GCATC 713 717 . . 704 714 + MwoI GCNNNNNNNGC 710 707 . . 704 714 + BstAPI GCANNNNNTGC 710 707 . . 708 711 + FatI CATG 707 711 . . 708 711 + NlaIII CATG 711 707 . . 708 711 + CviAII CATG 708 710 . . 713 718 + Cac8I GCNNGC 715 715 . . 716 719 + CviJI RGCY 717 717 . . 719 727 + AlwNI CAGNNNCTG 724 721 . . 720 725 + XhoII RGATCY 720 724 . . 721 724 + DpnI GATC 722 722 . . 721 724 + BstKTI GATC 723 721 . . 721 724 + MboI GATC 720 724 . . 723 728 + Hpy178III* TCNNGA 724 726 . . 721 725 - BinI* GGATC 715 716 . . 734 738 + TspDTI ATGAA 749 747 . . 737 742 + SspI AATATT 739 739 . . 742 747 + XbaI TCTAGA 742 746 . . 742 747 + Hpy178III* TCNNGA 743 745 . . 743 746 + MaeI CTAG 743 745 . . 757 762 + MmeI TCCRAC 782 780 . . 772 777 + ApoI RAATTY 772 776 . . 773 776 + TspEI AATT 772 776 . . 782 787 + BsrDI GCAATG 789 787 . . 787 791 + MaeIII GTNAC 786 791 . . 814 819 + DsaI* CCRYGG 814 818 . . 814 819 + StyI CCWWGG 814 818 . . 814 819 + NcoI CCATGG 814 818 . . 814 819 + SecI* CCNNGG 814 818 . . 814 824 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 820 817 . . 814 824 + PflMI CCANNNNNTGG 820 817 . . 815 818 + FatI CATG 814 818 . . 815 818 + NlaIII CATG 818 814 . . 815 818 + CviAII CATG 815 817 . . 823 827 + HphI GGTGA 835 834 . . 834 838 + TfiI GAWTC 834 837 . . 834 838 + HinfI GANTC 834 837 . . 840 845 + TatI WGTACW 840 844 . . 841 844 + Csp6I GTAC 841 843 . . 841 844 + RsaI GTAC 842 842 . . 843 847 + Tsp4CI* ACNGT 845 844 . . 860 863 + TaqI TCGA 860 862 . . 871 876 + Hpy178III* TCNNGA 872 874 . . 880 885 + HaeII RGCGCY 884 880 . . 881 884 + Hin6I GCGC 881 883 . . 881 884 + GlaI GCGC 882 882 . . 881 884 + HhaI GCGC 883 881 . . 887 890 + TaiI ACGT 890 886 . . 887 890 + SetI ASST 890 886 . . 887 890 + MaeII ACGT 887 889 . . 897 900 + TspEI AATT 896 900 . . 908 911 + CviJI RGCY 909 909 . . 910 913 + MnlI CCTC 920 919 . . 924 927 + SetI ASST 927 923 . . 924 927 + CviJI RGCY 925 925 . . 924 927 + AluI AGCT 925 925 . . 925 930 + Cac8I GCNNGC 927 927 . . 942 945 + SetI ASST 945 941 . . 940 944 - Hin4II* CCTTC 934 933 . . 944 947 + Csp6I GTAC 944 946 . . 944 947 + RsaI GTAC 945 945 . . 943 953 - BaeI ACNNNNGTAYC 968 963 935 930 953 958 + CfrI YGGCCR 953 957 . . 949 954 - TaqII CACCCA 939 937 . . 954 957 + CviJI RGCY 955 955 . . 954 957 + HaeIII GGCC 955 955 . . 955 960 + NmeAIII GCCGAG 981 979 . . 969 972 + SetI ASST 972 968 . . 969 972 + CviJI RGCY 970 970 . . 969 972 + AluI AGCT 970 970 . . 989 993 + Tsp4CI* ACNGT 991 990 . . 992 997 + Hpy166II GTNNAC 994 994 . . 1006 1010 + TfiI GAWTC 1006 1009 . . 1006 1010 + HinfI GANTC 1006 1009 . . 1014 1019 + NlaIV GGNNCC 1016 1016 . . 1014 1018 + BmgT120I GGNCC 1015 1016 . . 1014 1018 + AvaII GGWCC 1014 1017 . . 1014 1018 + AsuI* GGNCC 1014 1017 . . 1021 1025 + Tsp4CI* ACNGT 1023 1022 . . 1032 1035 + TspEI AATT 1031 1035 . . 1042 1047 + NlaIV GGNNCC 1044 1044 . . 1039 1043 - Hin4II* CCTTC 1033 1032 . . 1043 1047 + BmgT120I GGNCC 1044 1045 . . 1043 1047 + AsuI* GGNCC 1043 1046 . . 1044 1047 + CviJI RGCY 1045 1045 . . 1044 1047 + HaeIII GGCC 1045 1045 . . 1055 1059 + Tsp4CI* ACNGT 1057 1056 . . 1056 1062 + TspRI CASTGNN 1062 1053 . . 1058 1063 + BsgI GTGCAG 1079 1077 . . 1059 1062 + CviRI* TGCA 1060 1060 . . 1060 1071 + AlfI GCANNNNNNTGC 1049 1047 1083 1081 1063 1068 + Hpy166II GTNNAC 1065 1065 . . 1063 1068 + AccI GTMKAC 1064 1066 . . 1060 1071 - AlfI GCANNNNNNTGC 1083 1081 1049 1047 1071 1076 - Eco57MI CTGRAG 1056 1054 . . 1071 1076 - Eco57I CTGAAG 1056 1054 . . 1091 1101 + Hin4I GAYNNNNNVTC 1082 1077 1114 1109 1097 1101 + SfaNI GCATC 1106 1110 . . 1091 1101 - Hin4I GAYNNNNNVTC 1114 1109 1082 1077 1103 1106 + CviRI* TGCA 1104 1104 . . 1115 1125 + Hin4I GAYNNNNNVTC 1106 1101 1138 1133 1113 1117 - BsmAI GTCTC 1107 1111 . . 1113 1118 - Esp3I CGTCTC 1107 1111 . . 1122 1127 + Hpy178III* TCNNGA 1123 1125 . . 1124 1127 + TaqI TCGA 1124 1126 . . 1126 1130 + TfiI GAWTC 1126 1129 . . 1126 1130 + HinfI GANTC 1126 1129 . . 1133 1136 + TaqI TCGA 1133 1135 . . 1147 1152 + SduI GDGCHC 1151 1147 . . 1147 1152 + BseSI GKGCMC 1151 1147 . . 1153 1158 + BspLU11I* ACATGT 1153 1157 . . 1153 1158 + NspI RCATGY 1157 1153 . . 1153 1158 + AflIII ACRYGT 1153 1157 . . 1154 1157 + FatI CATG 1153 1157 . . 1154 1157 + NlaIII CATG 1157 1153 . . 1154 1157 + CviAII CATG 1154 1156 . . 1161 1166 + AhaIII* TTTAAA 1163 1163 . . 1162 1165 + MseI TTAA 1162 1164 . . 1175 1178 + CviRI* TGCA 1176 1176 . . 1176 1187 + AlfI GCANNNNNNTGC 1165 1163 1199 1197 1176 1187 - AlfI GCANNNNNNTGC 1199 1197 1165 1163 1188 1192 + FokI GGATG 1201 1205 . . 1188 1192 + BseGI GGATG 1194 1192 . . 1186 1189 - AciI CCGC 1186 1188 . . 1190 1194 + TspDTI ATGAA 1205 1203 . . 1195 1199 - BsrI ACTGG 1195 1193 . . 1201 1204 + MaeI CTAG 1201 1203 . . 1207 1210 + TspEI AATT 1206 1210 . . 1210 1215 + Hpy178III* TCNNGA 1211 1213 . . 1223 1226 + FatI CATG 1222 1226 . . 1223 1226 + NlaIII CATG 1226 1222 . . 1223 1226 + CviAII CATG 1223 1225 . . 1231 1234 + TspEI AATT 1230 1234 . . 1237 1242 + Hpy166II GTNNAC 1239 1239 . . 1237 1242 + HindII GTYRAC 1239 1239 . . 1246 1256 + MwoI GCNNNNNNNGC 1252 1249 . . 1255 1265 + MwoI GCNNNNNNNGC 1261 1258 . . 1255 1265 + BstAPI GCANNNNNTGC 1261 1258 . . 1255 1259 + BlsI GCNGC 1257 1256 . . 1255 1259 + BisI GCNGC 1256 1257 . . 1255 1259 + BbvI GCAGC 1267 1271 . . 1255 1259 + TseI GCWGC 1255 1258 . . 1257 1260 + CviJI RGCY 1258 1258 . . 1264 1274 + MwoI GCNNNNNNNGC 1270 1267 . . 1270 1274 + FauI CCCGC 1278 1280 . . 1271 1274 + AciI CCGC 1271 1273 . . 1277 1282 + NlaIV GGNNCC 1279 1279 . . 1280 1284 + Hpy188I TCNGA 1282 1281 . . 1283 1287 - BsmAI GTCTC 1277 1281 . . 1283 1288 - Esp3I CGTCTC 1277 1281 . . 1288 1292 - BccI CCATC 1282 1283 . . 1312 1315 + MseI TTAA 1312 1314 . . 1324 1329 + ApoI RAATTY 1324 1328 . . 1325 1328 + TspEI AATT 1324 1328 . . 1353 1356 + CviJI RGCY 1354 1354 . . 1352 1357 - TsoI TARCCA 1342 1340 . . 1359 1362 + AciI CCGC 1359 1361 . . 1385 1389 + Tsp4CI* ACNGT 1387 1386 . . 1387 1392 + NlaIV GGNNCC 1389 1389 . . 1390 1395 + Hpy178III* TCNNGA 1391 1393 . . 1394 1406 + PsrI GAACNNNNNNTAC 1386 1381 1418 1413 1400 1404 + Tsp4CI* ACNGT 1402 1401 . . 1403 1406 + Csp6I GTAC 1403 1405 . . 1403 1406 + RsaI GTAC 1404 1404 . . 1411 1414 + SetI ASST 1414 1410 . . 1412 1415 + MnlI CCTC 1422 1421 . . 1413 1418 + Ksp632I* CTCTTC 1419 1422 . . 1414 1418 - MboII GAAGA 1406 1405 . . 1417 1421 - MboII GAAGA 1409 1408 . . 1418 1423 - Eco57MI CTGRAG 1403 1401 . . 1418 1423 - Eco57I CTGAAG 1403 1401 . . 1427 1430 + CviJI RGCY 1428 1428 . . 1428 1433 + Cac8I GCNNGC 1430 1430 . . 1438 1441 + DpnI GATC 1439 1439 . . 1438 1441 + BstKTI GATC 1440 1438 . . 1438 1441 + MboI GATC 1437 1441 . . 1442 1445 + TspEI AATT 1441 1445 . . 1449 1453 + BslFI GGGAC 1463 1467 . . 1449 1454 + NlaIV GGNNCC 1451 1451 . . 1450 1454 + BmgT120I GGNCC 1451 1452 . . 1450 1454 + AvaII GGWCC 1450 1453 . . 1450 1454 + AsuI* GGNCC 1450 1453 . . 1465 1469 + BccI CCATC 1473 1474 . . 1471 1474 + TaiI ACGT 1474 1470 . . 1471 1474 + SetI ASST 1474 1470 . . 1471 1474 + MaeII ACGT 1471 1473 . . 1475 1486 + BstXI CCANNNNNNTGG 1482 1478 . . 1481 1484 + TspEI AATT 1480 1484 . . 1485 1488 + CviJI RGCY 1486 1486 . . 1496 1501 + Hpy166II GTNNAC 1498 1498 . . 1496 1501 + SduI GDGCHC 1500 1496 . . 1496 1501 + BseSI GKGCMC 1500 1496 . . 1496 1501 + ApaLI GTGCAC 1496 1500 . . 1496 1501 + HgiAI* GWGCWC 1500 1496 . . 1497 1500 + CviRI* TGCA 1498 1498 . . 1504 1509 + SmlI CTYRAG 1504 1508 . . 1504 1509 + AflII CTTAAG 1504 1508 . . 1505 1508 + MseI TTAA 1505 1507 . . 1516 1519 + MnlI CCTC 1526 1525 . . 1528 1533 + MfeI CAATTG 1528 1532 . . 1529 1532 + TspEI AATT 1528 1532 . . 1538 1541 + SetI ASST 1541 1537 . . 1545 1548 + CviRI* TGCA 1546 1546 . . 1550 1559 + MslI CAYNNNNRTG 1554 1554 . . 1558 1563 + TatI WGTACW 1558 1562 . . 1558 1563 + Bsp1407I TGTACA 1558 1562 . . 1559 1562 + Csp6I GTAC 1559 1561 . . 1559 1562 + RsaI GTAC 1560 1560 . . 1577 1582 + HindIII AAGCTT 1577 1581 . . 1578 1581 + SetI ASST 1581 1577 . . 1578 1581 + CviJI RGCY 1579 1579 . . 1578 1581 + AluI AGCT 1579 1579 . . 1586 1589 + SetI ASST 1589 1585 . . 1586 1589 + CviJI RGCY 1587 1587 . . 1586 1589 + AluI AGCT 1587 1587 . . 1600 1610 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 1606 1603 . . 1609 1613 + BmgT120I GGNCC 1610 1611 . . 1609 1613 + AvaII GGWCC 1609 1612 . . 1609 1613 + AsuI* GGNCC 1609 1612 . . 1612 1616 - BsrI ACTGG 1612 1610 . . 1617 1622 + AhaIII* TTTAAA 1619 1619 . . 1618 1621 + MseI TTAA 1618 1620 . . 1623 1626 + SetI ASST 1626 1622 . . 1623 1629 + SexAI ACCWGGT 1623 1628 . . 1624 1628 + BssKI CCNGG 1623 1628 . . 1624 1628 + BseBI CCWGG 1625 1626 . . 1624 1628 + ScrFI CCNGG 1625 1626 . . 1624 1628 + EcoRII CCWGG 1623 1628 . . 1634 1638 + MboII GAAGA 1646 1645 . . 1634 1639 - Ksp632I* CTCTTC 1629 1632 . . 1641 1646 + Hpy178III* TCNNGA 1642 1644 . . 1649 1654 + BsrDI GCAATG 1656 1654 . . 1654 1657 + CviJI RGCY 1655 1655 . . 1664 1667 + TaqI TCGA 1664 1666 . . 1667 1670 + TspEI AATT 1666 1670 . . 1675 1680 + Hpy166II GTNNAC 1677 1677 . . 1676 1681 + TatI WGTACW 1676 1680 . . 1676 1681 + Bsp1407I TGTACA 1676 1680 . . 1677 1680 + Csp6I GTAC 1677 1679 . . 1677 1680 + RsaI GTAC 1678 1678 . . 1679 1683 + Tsp4CI* ACNGT 1681 1680 . . 1680 1686 + TspRI CASTGNN 1686 1677 . . 1695 1699 + Tsp4CI* ACNGT 1697 1696 . . 1715 1720 + DsaI* CCRYGG 1715 1719 . . 1715 1720 + StyI CCWWGG 1715 1719 . . 1715 1720 + NcoI CCATGG 1715 1719 . . 1715 1720 + SecI* CCNNGG 1715 1719 . . 1716 1719 + FatI CATG 1715 1719 . . 1716 1719 + NlaIII CATG 1719 1715 . . 1716 1719 + CviAII CATG 1716 1718 . . 1719 1724 + NlaIV GGNNCC 1721 1721 . . 1722 1727 + Hpy178III* TCNNGA 1723 1725 . . 1736 1745 + XmnI GAANNNNTTC 1740 1740 . . 1740 1743 + SetI ASST 1743 1739 . . 1745 1751 + TspRI CASTGNN 1751 1742 . . 1756 1760 + TfiI GAWTC 1756 1759 . . 1756 1760 + HinfI GANTC 1756 1759 . . 1750 1760 - Hin4I GAYNNNNNVTC 1773 1768 1741 1736 1762 1766 + HphI GGTGA 1774 1773 . . 1769 1773 + BinI* GGATC 1777 1778 . . 1770 1773 + DpnI GATC 1771 1771 . . 1770 1773 + BstKTI GATC 1772 1770 . . 1770 1773 + MboI GATC 1769 1773 . . 1789 1793 + MboII GAAGA 1801 1800 . . 1792 1796 + TfiI GAWTC 1792 1795 . . 1792 1796 + HinfI GANTC 1792 1795 . . 1799 1803 + MaeIII GTNAC 1798 1803 . . 1797 1802 - TsoI TARCCA 1787 1785 . . 1806 1809 + CviJI RGCY 1807 1807 . . 1812 1815 + SetI ASST 1815 1811 . . 1814 1817 + Csp6I GTAC 1814 1816 . . 1814 1817 + RsaI GTAC 1815 1815 . . 1816 1820 + Tsp4CI* ACNGT 1818 1817 . . 1822 1827 + EcoRV GATATC 1824 1824 . . 1866 1870 + MboII GAAGA 1878 1877 . . 1876 1880 + PleI GAGTC 1884 1885 . . 1876 1880 + MlyI GAGTC 1885 1885 . . 1876 1880 + HinfI GANTC 1876 1879 . . 1878 1882 - BslFI GGGAC 1863 1867 . . 1887 1891 + MboII GAAGA 1899 1898 . . 1903 1907 + Tsp4CI* ACNGT 1905 1904 . . 1909 1912 + MseI TTAA 1909 1911 . . 1911 1914 + TspEI AATT 1910 1914 . . 1923 1926 + SetI ASST 1926 1922 . . 1924 1928 + HphI GGTGA 1936 1935 . . 1922 1925 - MnlI CCTC 1915 1914 . . 1929 1932 + TspEI AATT 1928 1932 . . 1933 1937 - BceAI ACGGC 1918 1920 . . 1946 1951 + Hpy178III* TCNNGA 1947 1949 . . 1954 1957 + MseI TTAA 1954 1956 . . 1961 1964 + TspEI AATT 1960 1964 . . 1973 1976 + DpnI GATC 1974 1974 . . 1973 1976 + BstKTI GATC 1975 1973 . . 1973 1976 + MboI GATC 1972 1976 . . 1980 1983 + CviRI* TGCA 1981 1981 . . 1990 1995 + MmeI TCCRAC 2015 2013 . . 1990 1994 + Hpy188I TCNGA 1992 1991 . . 2003 2008 + SspI AATATT 2005 2005 . . 2013 2018 + AflIII ACRYGT 2013 2017 . . 2015 2018 + TaiI ACGT 2018 2014 . . 2015 2018 + SetI ASST 2018 2014 . . 2015 2018 + MaeII ACGT 2015 2017 . . 2017 2021 + MaeIII GTNAC 2016 2021 . . 2025 2028 + CviRI* TGCA 2026 2026 . . 2023 2027 - SfaNI GCATC 2013 2017 . . 2038 2041 + Csp6I GTAC 2038 2040 . . 2038 2041 + RsaI GTAC 2039 2039 . . 2041 2051 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2047 2044 . . 2043 2047 + Hin4II* CCTTC 2053 2052 . . 2047 2050 + FatI CATG 2046 2050 . . 2047 2050 + NlaIII CATG 2050 2046 . . 2047 2050 + CviAII CATG 2047 2049 . . 2045 2049 - TspDTI ATGAA 2035 2033 . . 2057 2060 + AciI CCGC 2057 2059 . . 2059 2063 + BlsI GCNGC 2061 2060 . . 2059 2063 + BisI GCNGC 2060 2061 . . 2059 2063 + BbvI GCAGC 2071 2075 . . 2059 2063 + TseI GCWGC 2059 2062 . . 2061 2064 + CviJI RGCY 2062 2062 . . 2079 2082 + FatI CATG 2078 2082 . . 2079 2082 + NlaIII CATG 2082 2078 . . 2079 2082 + CviAII CATG 2079 2081 . . 2080 2084 + TspDTI ATGAA 2095 2093 . . 2081 2092 + BdaI TGANNNNNNTCA 2070 2068 2104 2102 2088 2091 + DpnI GATC 2089 2089 . . 2088 2091 + BstKTI GATC 2090 2088 . . 2088 2091 + MboI GATC 2087 2091 . . 2081 2092 - BdaI TGANNNNNNTCA 2104 2102 2070 2068 2098 2102 + TauI GCSGC 2101 2098 . . 2098 2102 + BlsI GCNGC 2100 2099 . . 2098 2102 + BisI GCNGC 2099 2100 . . 2095 2099 - SfaNI GCATC 2085 2089 . . 2099 2102 + AciI CCGC 2099 2101 . . 2101 2107 + EspI* GCTNAGC 2102 2105 . . 2102 2106 + DdeI CTNAG 2102 2105 . . 2106 2117 + AlfI GCANNNNNNTGC 2095 2093 2129 2127 2115 2118 + CviRI* TGCA 2116 2116 . . 2106 2117 - AlfI GCANNNNNNTGC 2129 2127 2095 2093 2121 2124 + CviJI RGCY 2122 2122 . . 2121 2124 + HaeIII GGCC 2122 2122 . . 2131 2135 + BssKI CCNGG 2130 2135 . . 2131 2135 + BseBI CCWGG 2132 2133 . . 2131 2135 + ScrFI CCNGG 2132 2133 . . 2131 2135 + EcoRII CCWGG 2130 2135 . . 2131 2141 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2137 2134 . . 2133 2138 - TsoI TARCCA 2123 2121 . . 2149 2153 + Hpy188I TCNGA 2151 2150 . . 2148 2153 - MmeI TCCRAC 2129 2127 . . 2158 2161 - AciI CCGC 2158 2160 . . 2167 2171 + Hpy188I TCNGA 2169 2168 . . 2173 2178 + Cac8I GCNNGC 2175 2175 . . 2170 2174 - SfaNI GCATC 2160 2164 . . 2175 2180 + Hpy166II GTNNAC 2177 2177 . . 2175 2180 + SduI GDGCHC 2179 2175 . . 2175 2180 + BseSI GKGCMC 2179 2175 . . 2175 2180 + ApaLI GTGCAC 2175 2179 . . 2175 2180 + HgiAI* GWGCWC 2179 2175 . . 2176 2179 + CviRI* TGCA 2177 2177 . . 2181 2187 + TspRI CASTGNN 2187 2178 . . 2180 2184 - BsrI ACTGG 2180 2178 . . 2185 2190 + Cac8I GCNNGC 2187 2187 . . 2194 2197 + SetI ASST 2197 2193 . . 2203 2207 + BmgT120I GGNCC 2204 2205 . . 2203 2207 + AvaII GGWCC 2203 2206 . . 2203 2207 + AsuI* GGNCC 2203 2206 . . 2206 2210 + Hin4II* CCTTC 2216 2215 . . 2209 2214 + Hpy178III* TCNNGA 2210 2212 . . 2222 2226 + Hpy188I TCNGA 2224 2223 . . 2213 2223 - Hin4I GAYNNNNNVTC 2236 2231 2204 2199 2226 2229 + SetI ASST 2229 2225 . . 2225 2228 - MnlI CCTC 2218 2217 . . 2236 2239 + MseI TTAA 2236 2238 . . 2249 2252 + MaeI CTAG 2249 2251 . . 2259 2262 + CviRI* TGCA 2260 2260 . . 2260 2270 + MwoI GCNNNNNNNGC 2266 2263 . . 2268 2271 + CviJI RGCY 2269 2269 . . 2265 2269 - Hin4II* CCTTC 2259 2258 . . 2269 2274 + Cac8I GCNNGC 2271 2271 . . 2278 2281 + MnlI CCTC 2288 2287 . . 2281 2284 + MaeI CTAG 2281 2283 . . 2287 2291 + BssKI CCNGG 2286 2291 . . 2287 2291 + BseBI CCWGG 2288 2289 . . 2287 2291 + ScrFI CCNGG 2288 2289 . . 2287 2291 + EcoRII CCWGG 2286 2291 . . 2290 2293 + CviJI RGCY 2291 2291 . . 2314 2318 + MboII GAAGA 2326 2325 . . 2319 2322 + CviJI RGCY 2320 2320 . . 2314 2319 - Ksp632I* CTCTTC 2309 2312 . . 2317 2320 - MnlI CCTC 2310 2309 . . 2321 2325 + DdeI CTNAG 2321 2324 . . 2332 2336 + BlsI GCNGC 2334 2333 . . 2332 2336 + BisI GCNGC 2333 2334 . . 2332 2336 + BbvI GCAGC 2344 2348 . . 2332 2336 + TseI GCWGC 2332 2335 . . 2333 2338 + NspBII* CMGCKG 2335 2335 . . 2335 2338 - AciI CCGC 2335 2337 . . 2339 2342 + TspEI AATT 2338 2342 . . 2349 2359 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2355 2352 . . 2350 2354 - BsrI ACTGG 2350 2348 . . 2349 2354 - BfiI ACTGGG 2344 2343 . . 2358 2362 + HphI GGTGA 2370 2369 . . 2364 2369 + Hpy166II GTNNAC 2366 2366 . . 2364 2369 + HindII GTYRAC 2366 2366 . . 2369 2374 - EcoP15I CAGCAG 2341 2343 . . 2378 2381 - AciI CCGC 2378 2380 . . 2393 2396 + CviRI* TGCA 2394 2394 . . 2402 2405 + TaqI TCGA 2402 2404 . . 2404 2408 + TfiI GAWTC 2404 2407 . . 2404 2408 + HinfI GANTC 2404 2407 . . 2407 2411 + Hpy188I TCNGA 2409 2408 . . 2408 2413 + Eco57MI CTGRAG 2429 2427 . . 2408 2413 + Eco57I CTGAAG 2429 2427 . . 2410 2414 + MboII GAAGA 2422 2421 . . 2410 2415 - Ksp632I* CTCTTC 2405 2408 . . 2413 2416 - MnlI CCTC 2406 2405 . . 2420 2423 + TaqI TCGA 2420 2422 . . 2437 2441 + Tsp4CI* ACNGT 2439 2438 . . 2434 2438 - BsmAI GTCTC 2428 2432 . . 2446 2455 + MslI CAYNNNNRTG 2450 2450 . . 2451 2454 + SetI ASST 2454 2450 . . 2452 2456 + HphI GGTGA 2464 2463 . . 2467 2471 + HphI GGTGA 2479 2478 . . 2468 2472 + Tsp45I GTSAC 2467 2472 . . 2468 2472 + MaeIII GTNAC 2467 2472 . . 2470 2474 + HgaI GACGC 2479 2484 . . 2484 2489 + Hpy178III* TCNNGA 2485 2487 . . 2490 2494 + Tsp4CI* ACNGT 2492 2491 . . 2498 2501 + TaqI TCGA 2498 2500 . . 2507 2511 + BssKI CCNGG 2506 2511 . . 2507 2511 + BseBI CCWGG 2508 2509 . . 2507 2511 + ScrFI CCNGG 2508 2509 . . 2507 2511 + EcoRII CCWGG 2506 2511 . . 2511 2516 + NspI RCATGY 2515 2511 . . 2512 2515 + FatI CATG 2511 2515 . . 2512 2515 + NlaIII CATG 2515 2511 . . 2512 2515 + CviAII CATG 2512 2514 . . 2519 2529 + FalI AAGNNNNNCTT 2510 2505 2542 2537 2522 2527 + MmeI TCCRAC 2547 2545 . . 2523 2533 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2529 2526 . . 2523 2533 + PflMI CCANNNNNTGG 2529 2526 . . 2519 2529 - FalI AAGNNNNNCTT 2542 2537 2510 2505 2536 2540 - BccI CCATC 2530 2531 . . 2550 2553 + CviJI RGCY 2551 2551 . . 2550 2553 + HaeIII GGCC 2551 2551 . . 2552 2563 + BstXI CCANNNNNNTGG 2559 2555 . . 2553 2558 - BsrDI GCAATG 2552 2550 . . 2568 2571 + TaiI ACGT 2571 2567 . . 2568 2571 + SetI ASST 2571 2567 . . 2568 2571 + MaeII ACGT 2568 2570 . . 2587 2591 + Hpy99I CGWCG 2591 2586 . . 2586 2590 - HgaI GACGC 2575 2580 . . 2591 2595 + MaeIII GTNAC 2590 2595 . . 2592 2597 + TsoI TARCCA 2608 2606 . . 2606 2609 + TaqI TCGA 2606 2608 . . 2608 2612 + MboII GAAGA 2620 2619 . . 2619 2622 + CviRI* TGCA 2620 2620 . . 2618 2623 - BsgI GTGCAG 2603 2601 . . 2625 2630 + ApoI RAATTY 2625 2629 . . 2626 2629 + TspEI AATT 2625 2629 . . 2644 2647 + SetI ASST 2647 2643 . . 2643 2646 - MnlI CCTC 2636 2635 . . 2653 2656 + MseI TTAA 2653 2655 . . 2662 2666 + BlsI GCNGC 2664 2663 . . 2662 2666 + BisI GCNGC 2663 2664 . . 2662 2666 + BbvI GCAGC 2674 2678 . . 2662 2666 + TseI GCWGC 2662 2665 . . 2663 2668 + PvuII CAGCTG 2665 2665 . . 2663 2668 + NspBII* CMGCKG 2665 2665 . . 2664 2667 + SetI ASST 2667 2663 . . 2664 2667 + CviJI RGCY 2665 2665 . . 2664 2667 + AluI AGCT 2665 2665 . . 2677 2682 + XhoII RGATCY 2677 2681 . . 2677 2681 + BinI* GGATC 2685 2686 . . 2678 2681 + DpnI GATC 2679 2679 . . 2678 2681 + BstKTI GATC 2680 2678 . . 2678 2681 + MboI GATC 2677 2681 . . 2689 2692 + TspEI AATT 2688 2692 . . 2705 2708 + Csp6I GTAC 2705 2707 . . 2705 2708 + RsaI GTAC 2706 2706 . . 2707 2711 + Tsp4CI* ACNGT 2709 2708 . . 2713 2718 + ApoI RAATTY 2713 2717 . . 2714 2717 + TspEI AATT 2713 2717 . . 2759 2762 + MseI TTAA 2759 2761 . . 2782 2786 - FokI GGATG 2768 2772 . . 2782 2786 - BseGI GGATG 2781 2779 . . 2800 2804 + MaeIII GTNAC 2799 2804 . . 2798 2803 - TsoI TARCCA 2788 2786 . . 2812 2820 + Tth111I GACNNNGTC 2815 2816 . . 2819 2822 + TaqI TCGA 2819 2821 . . 2825 2829 + FokI GGATG 2838 2842 . . 2825 2829 + BseGI GGATG 2831 2829 . . 2828 2833 + BclI TGATCA 2828 2832 . . 2829 2832 + DpnI GATC 2830 2830 . . 2829 2832 + BstKTI GATC 2831 2829 . . 2829 2832 + MboI GATC 2828 2832 . . 2831 2836 + Hpy178III* TCNNGA 2832 2834 . . 2839 2843 + TauI GCSGC 2842 2839 . . 2839 2843 + BlsI GCNGC 2841 2840 . . 2839 2843 + BisI GCNGC 2840 2841 . . 2840 2843 + AciI CCGC 2840 2842 . . 2842 2852 + MwoI GCNNNNNNNGC 2848 2845 . . 2850 2853 + CviRI* TGCA 2851 2851 . . 2848 2852 - SfaNI GCATC 2838 2842 . . 2853 2856 + SetI ASST 2856 2852 . . 2863 2867 + TfiI GAWTC 2863 2866 . . 2863 2867 + HinfI GANTC 2863 2866 . . 2873 2876 + SetI ASST 2876 2872 . . 2899 2902 - MnlI CCTC 2892 2891 . . 2904 2907 + TaiI ACGT 2907 2903 . . 2904 2907 + SetI ASST 2907 2903 . . 2904 2907 + MaeII ACGT 2904 2906 . . 2927 2938 + BdaI TGANNNNNNTCA 2916 2914 2950 2948 2928 2937 + XmnI GAANNNNTTC 2932 2932 . . 2931 2936 + ApoI RAATTY 2931 2935 . . 2932 2935 + TspEI AATT 2931 2935 . . 2936 2940 + Hpy188I TCNGA 2938 2937 . . 2927 2938 - BdaI TGANNNNNNTCA 2950 2948 2916 2914 2940 2943 + SetI ASST 2943 2939 . . 2941 2945 + Hin4II* CCTTC 2951 2950 . . 2941 2951 + EcoNI CCTNNNNNAGG 2945 2946 . . 2941 2951 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 2947 2944 . . 2947 2951 + BssKI CCNGG 2946 2951 . . 2947 2951 + BseBI CCWGG 2948 2949 . . 2947 2951 + ScrFI CCNGG 2948 2949 . . 2947 2951 + EcoRII CCWGG 2946 2951 . . 2949 2952 + SetI ASST 2952 2948 . . 2945 2950 - Eco57MI CTGRAG 2930 2928 . . 2945 2950 - GsuI CTGGAG 2930 2928 . . 2951 2956 + Hpy166II GTNNAC 2953 2953 . . 2960 2963 + TaqI TCGA 2960 2962 . . 2968 2973 + ApoI RAATTY 2968 2972 . . 2969 2972 + TspEI AATT 2968 2972 . . 2973 2978 + Hpy178III* TCNNGA 2974 2976 . . 2991 2996 - BciVI GTATCC 2985 2984 . . 3002 3005 + MseI TTAA 3002 3004 . . 2992 3002 - BaeI ACNNNNGTAYC 3017 3012 2984 2979 3009 3012 + SetI ASST 3012 3008 . . 3011 3014 + Csp6I GTAC 3011 3013 . . 3011 3014 + RsaI GTAC 3012 3012 . . 3016 3021 + SspI AATATT 3018 3018 . . 3024 3029 + Hpy178III* TCNNGA 3025 3027 . . 3034 3037 + DpnI GATC 3035 3035 . . 3034 3037 + BstKTI GATC 3036 3034 . . 3034 3037 + MboI GATC 3033 3037 . . 3036 3041 + MmeI TCCRAC 3061 3059 . . 3034 3038 - BinI* GGATC 3028 3029 . . 3044 3049 + BalI TGGCCA 3046 3046 . . 3044 3049 + CfrI YGGCCR 3044 3048 . . 3045 3048 + CviJI RGCY 3046 3046 . . 3045 3048 + HaeIII GGCC 3046 3046 . . 3051 3054 + TspEI AATT 3050 3054 . . 3061 3064 + FatI CATG 3060 3064 . . 3061 3064 + NlaIII CATG 3064 3060 . . 3061 3064 + CviAII CATG 3061 3063 . . 3059 3063 - TspDTI ATGAA 3049 3047 . . 3071 3075 + Tsp4CI* ACNGT 3073 3072 . . 3065 3076 - TstI CACNNNNNNTCC 3089 3084 3057 3052 3081 3084 + CviRI* TGCA 3082 3082 . . 3079 3083 - SfaNI GCATC 3069 3073 . . 3084 3087 + TspEI AATT 3083 3087 . . 3094 3097 + MseI TTAA 3094 3096 . . 3109 3113 + MboII GAAGA 3121 3120 . . 3121 3126 + Hpy166II GTNNAC 3123 3123 . . 3125 3129 + TspGWI ACGGA 3140 3138 . . 3127 3131 + FokI GGATG 3140 3144 . . 3127 3131 + BseGI GGATG 3133 3131 . . 3149 3152 + SetI ASST 3152 3148 . . 3151 3156 + Eco57MI CTGRAG 3172 3170 . . 3151 3156 + Eco57I CTGAAG 3172 3170 . . 3152 3163 + BdaI TGANNNNNNTCA 3141 3139 3175 3173 3152 3163 - BdaI TGANNNNNNTCA 3175 3173 3141 3139 3168 3174 + TspRI CASTGNN 3174 3165 . . 3167 3171 - BsrI ACTGG 3167 3165 . . 3227 3230 + CviJI RGCY 3228 3228 . . 3233 3236 + AciI CCGC 3233 3235 . . 3236 3240 + BccI CCATC 3244 3245 . . 3239 3242 + TaqI TCGA 3239 3241 . . 3243 3246 + TspEI AATT 3242 3246 . . 3253 3257 + BssKI CCNGG 3252 3257 . . 3253 3257 + ScrFI CCNGG 3254 3255 . . 3253 3257 + CauII* CCSGG 3254 3255 . . 3254 3257 + HpaII CCGG 3254 3256 . . 3257 3262 + Hpy166II GTNNAC 3259 3259 . . 3257 3262 + SduI GDGCHC 3261 3257 . . 3257 3262 + BseSI GKGCMC 3261 3257 . . 3257 3262 + ApaLI GTGCAC 3257 3261 . . 3257 3262 + HgiAI* GWGCWC 3261 3257 . . 3258 3261 + CviRI* TGCA 3259 3259 . . 3265 3270 + SpeI ACTAGT 3265 3269 . . 3266 3269 + MaeI CTAG 3266 3268 . . 3273 3278 + Hpy178III* TCNNGA 3274 3276 . . 3282 3287 + SecI* CCNNGG 3282 3286 . . 3283 3287 + BssKI CCNGG 3282 3287 . . 3283 3287 + ScrFI CCNGG 3284 3285 . . 3283 3287 + CauII* CCSGG 3284 3285 . . 3284 3287 + HpaII CCGG 3284 3286 . . 3297 3300 + Csp6I GTAC 3297 3299 . . 3297 3300 + RsaI GTAC 3298 3298 . . 3299 3303 + BsrI ACTGG 3304 3302 . . 3300 3305 + Eco57MI CTGRAG 3321 3319 . . 3300 3305 + GsuI CTGGAG 3321 3319 . . 3306 3309 + TspEI AATT 3305 3309 . . 3302 3312 - BsaXI ACNNNNNCTCC 3324 3321 3294 3291 3302 3313 - TstI CACNNNNNNTCC 3326 3321 3294 3289 3316 3326 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 3322 3319 . . 3316 3319 + AciI CCGC 3316 3318 . . 3320 3323 + MnlI CCTC 3330 3329 . . 3315 3320 - EciI GGCGGA 3305 3303 . . 3325 3329 + BmgT120I GGNCC 3326 3327 . . 3325 3329 + AvaII GGWCC 3325 3328 . . 3325 3329 + AsuI* GGNCC 3325 3328 . . 3334 3338 + HgaI GACGC 3343 3348 . . 3363 3366 + TspEI AATT 3362 3366 . . 3378 3383 + SfeI* CTRYAG 3378 3382 . . 3384 3388 + HinfI GANTC 3384 3387 . . 3384 3388 - PleI GAGTC 3378 3379 . . 3384 3388 - MlyI GAGTC 3378 3378 . . 3400 3404 + MaeIII GTNAC 3399 3404 . . 3402 3407 + AclI AACGTT 3403 3405 . . 3403 3406 + TaiI ACGT 3406 3402 . . 3403 3406 + SetI ASST 3406 3402 . . 3403 3406 + MaeII ACGT 3403 3405 . . 3405 3410 + Hpy166II GTNNAC 3407 3407 . . 3405 3410 + HindII GTYRAC 3407 3407 . . 3409 3413 + BsrI ACTGG 3414 3412 . . 3412 3416 + BmgT120I GGNCC 3413 3414 . . 3412 3416 + AvaII GGWCC 3412 3415 . . 3412 3416 + AsuI* GGNCC 3412 3415 . . 3415 3419 + BccI CCATC 3423 3424 . . 3419 3423 + BccI CCATC 3427 3428 . . 3416 3420 - FokI GGATG 3402 3406 . . 3416 3420 - BseGI GGATG 3415 3413 . . 3439 3443 + Tsp4CI* ACNGT 3441 3440 . . 3444 3449 - BsrDI GCAATG 3443 3441 . . 3454 3458 + BsrI ACTGG 3459 3457 . . 3460 3465 + KpnI GGTACC 3464 3460 . . 3460 3465 + NlaIV GGNNCC 3462 3462 . . 3460 3465 + HgiCI* GGYRCC 3460 3464 . . 3460 3465 + Acc65I GGTACC 3460 3464 . . 3461 3464 + Csp6I GTAC 3461 3463 . . 3461 3464 + RsaI GTAC 3462 3462 . . 3464 3467 + AciI CCGC 3464 3466 . . 3464 3469 + BsrBI CCGCTC 3466 3466 . . 3472 3477 + TatI WGTACW 3472 3476 . . 3472 3477 + Bsp1407I TGTACA 3472 3476 . . 3473 3476 + Csp6I GTAC 3473 3475 . . 3473 3476 + RsaI GTAC 3474 3474 . . 3482 3486 + BceAI ACGGC 3498 3500 . . 3483 3488 + CfrI YGGCCR 3483 3487 . . 3484 3487 + CviJI RGCY 3485 3485 . . 3484 3487 + HaeIII GGCC 3485 3485 . . 3491 3496 + ApoI RAATTY 3491 3495 . . 3492 3495 + TspEI AATT 3491 3495 . . 3507 3512 + Cfr10I RCCGGY 3507 3511 . . 3507 3512 + BetI* WCCGGW 3507 3511 . . 3507 3512 + AgeI ACCGGT 3507 3511 . . 3508 3511 + HpaII CCGG 3508 3510 . . 3509 3514 + McrI* CGRYCG 3512 3510 . . 3512 3515 + TaqI TCGA 3512 3514 . . 3518 3521 + MseI TTAA 3518 3520 . . 3522 3525 - MnlI CCTC 3515 3514 . . 3526 3531 + XhoII RGATCY 3526 3530 . . 3526 3530 + BinI* GGATC 3534 3535 . . 3527 3530 + DpnI GATC 3528 3528 . . 3527 3530 + BstKTI GATC 3529 3527 . . 3527 3530 + MboI GATC 3526 3530 . . 3549 3554 + Hpy166II GTNNAC 3551 3551 . . 3549 3554 + HindII GTYRAC 3551 3551 . . 3557 3561 + TauI GCSGC 3560 3557 . . 3557 3561 + BlsI GCNGC 3559 3558 . . 3557 3561 + BisI GCNGC 3558 3559 . . 3559 3562 + CviJI RGCY 3560 3560 . . 3557 3560 - AciI CCGC 3557 3559 . . 3561 3566 + SfeI* CTRYAG 3561 3565 . . 3572 3582 + BaeI ACNNNNGTAYC 3561 3556 3594 3589 3573 3577 + DdeI CTNAG 3573 3576 . . 3576 3579 + SetI ASST 3579 3575 . . 3590 3601 + AlfI GCANNNNNNTGC 3579 3577 3613 3611 3591 3600 + MslI CAYNNNNRTG 3595 3595 . . 3590 3601 - AlfI GCANNNNNNTGC 3613 3611 3579 3577 3612 3617 + SduI GDGCHC 3616 3612 . . 3612 3617 + HgiJII* GRGCYC 3616 3612 . . 3613 3616 + CviJI RGCY 3614 3614 . . 3634 3637 + MaeI CTAG 3634 3636 . . 3649 3654 - BciVI GTATCC 3643 3642 . . 3659 3663 - Hin4II* CCTTC 3653 3652 . . 3680 3683 + TaiI ACGT 3683 3679 . . 3680 3683 + SetI ASST 3683 3679 . . 3680 3683 + MaeII ACGT 3680 3682 . . 3677 3681 - BsmAI GTCTC 3671 3675 . . 3682 3685 + Csp6I GTAC 3682 3684 . . 3677 3682 - Esp3I CGTCTC 3671 3675 . . 3682 3685 + RsaI GTAC 3683 3683 . . 3698 3703 + BsrDI GCAATG 3705 3703 . . 3701 3705 + TspDTI ATGAA 3716 3714 . . 3703 3707 + MboII GAAGA 3715 3714 . . 3726 3730 + Hin4II* CCTTC 3736 3735 . . 3736 3741 + SspI AATATT 3738 3738 . . 3742 3745 + MnlI CCTC 3752 3751 . . 3750 3755 + VspI ATTAAT 3751 3753 . . 3751 3754 + MseI TTAA 3751 3753 . . 3753 3756 + TspEI AATT 3752 3756 . . 3757 3760 + MnlI CCTC 3767 3766 . . 3761 3766 + ApoI RAATTY 3761 3765 . . 3762 3765 + TspEI AATT 3761 3765 . . 3766 3770 + Hpy188I TCNGA 3768 3767 . . 3773 3777 + DdeI CTNAG 3773 3776 . . 3778 3791 + AjuI GAANNNNNNNTTGG 3770 3765 3802 3797 3786 3789 + TspEI AATT 3785 3789 . . 3782 3792 - BsaXI ACNNNNNCTCC 3804 3801 3774 3771 3782 3793 - TstI CACNNNNNNTCC 3806 3801 3774 3769 3793 3797 + MaeIII GTNAC 3792 3797 . . 3796 3801 + BspLU11I* ACATGT 3796 3800 . . 3796 3801 + NspI RCATGY 3800 3796 . . 3796 3801 + AflIII ACRYGT 3796 3800 . . 3797 3800 + FatI CATG 3796 3800 . . 3797 3800 + NlaIII CATG 3800 3796 . . 3797 3800 + CviAII CATG 3797 3799 . . 3802 3807 + NlaIV GGNNCC 3804 3804 . . 3802 3806 + BmgT120I GGNCC 3803 3804 . . 3802 3806 + AvaII GGWCC 3802 3805 . . 3802 3806 + AsuI* GGNCC 3802 3805 . . 3807 3812 + DsaI* CCRYGG 3807 3811 . . 3807 3812 + StyI CCWWGG 3807 3811 . . 3807 3812 + NcoI CCATGG 3807 3811 . . 3803 3807 - BslFI GGGAC 3788 3792 . . 3807 3812 + SecI* CCNNGG 3807 3811 . . 3808 3811 + FatI CATG 3807 3811 . . 3808 3811 + NlaIII CATG 3811 3807 . . 3808 3811 + CviAII CATG 3808 3810 . . 3812 3817 + Eco31I GGTCTC 3818 3822 . . 3813 3817 + BsmAI GTCTC 3818 3822 . . 3816 3821 + Hpy178III* TCNNGA 3817 3819 . . 3815 3820 - Eco57MI CTGRAG 3800 3798 . . 3815 3820 - GsuI CTGGAG 3800 3798 . . 3826 3831 + AhaIII* TTTAAA 3828 3828 . . 3827 3830 + MseI TTAA 3827 3829 . . 3831 3834 + SetI ASST 3834 3830 . . 3833 3837 + DdeI CTNAG 3833 3836 . . 3835 3839 + PleI GAGTC 3843 3844 . . 3835 3839 + MlyI GAGTC 3844 3844 . . 3835 3839 + HinfI GANTC 3835 3838 . . 3833 3837 - BspCNI CTCAG 3825 3823 . . 3833 3837 - BseMII CTCAG 3824 3822 . . 3839 3843 + BccI CCATC 3847 3848 . . 3842 3845 + TaqI TCGA 3842 3844 . . 3844 3848 + MboII GAAGA 3856 3855 . . 3847 3852 + ApoI RAATTY 3847 3851 . . 3848 3851 + TspEI AATT 3847 3851 . . 3855 3861 + TspRI CASTGNN 3861 3852 . . 3867 3879 + BarI GAAGNNNNNNTAC 3859 3854 3891 3886 3869 3872 + SetI ASST 3872 3868 . . 3867 3871 - Hin4II* CCTTC 3861 3860 . . 3872 3876 - TspDTI ATGAA 3862 3860 . . 3890 3900 + Hin4I GAYNNNNNVTC 3881 3876 3913 3908 3890 3900 - Hin4I GAYNNNNNVTC 3913 3908 3881 3876 3899 3903 - TspGWI ACGGA 3889 3887 . . 3910 3914 + BmgT120I GGNCC 3911 3912 . . 3910 3914 + AvaII GGWCC 3910 3913 . . 3910 3914 + AsuI* GGNCC 3910 3913 . . 3912 3915 + SetI ASST 3915 3911 . . 3918 3921 + SetI ASST 3921 3917 . . 3920 3924 + DdeI CTNAG 3920 3923 . . 3943 3947 + HphI GGTGA 3955 3954 . . 3948 3951 + SetI ASST 3951 3947 . . 3946 3950 - Hin4II* CCTTC 3940 3939 . . 3955 3960 + EcoT22I ATGCAT 3959 3955 . . 3956 3959 + CviRI* TGCA 3957 3957 . . 3957 3961 + SfaNI GCATC 3966 3970 . . 3961 3965 + Hin4II* CCTTC 3971 3970 . . 3958 3962 - FokI GGATG 3944 3948 . . 3958 3962 - BseGI GGATG 3957 3955 . . 3953 3965 - BarI GAAGNNNNNNTAC 3977 3972 3945 3940 3972 3977 + Hpy178III* TCNNGA 3973 3975 . . 3980 3983 + TaiI ACGT 3983 3979 . . 3980 3983 + SetI ASST 3983 3979 . . 3980 3983 + MaeII ACGT 3980 3982 . . 3996 3999 + CviRI* TGCA 3997 3997 . . 3992 3997 - TaqII CACCCA 3982 3980 . . 3999 4002 + TspEI AATT 3998 4002 . . 4000 4005 + VspI ATTAAT 4001 4003 . . 4001 4004 + MseI TTAA 4001 4003 . . 4003 4006 + TspEI AATT 4002 4006 . . 4012 4016 + HphI GGTGA 4024 4023 . . 4019 4022 + CviJI RGCY 4020 4020 . . 4021 4025 - BsrI ACTGG 4021 4019 . . 4037 4042 + BtgZI GCGATG 4052 4056 . . 4042 4046 + BmgT120I GGNCC 4043 4044 . . 4042 4046 + AvaII GGWCC 4042 4045 . . 4042 4046 + AsuI* GGNCC 4042 4045 . . 4039 4043 - BccI CCATC 4033 4034 . . 4045 4049 + Hin4II* CCTTC 4055 4054 . . 4045 4055 + EcoNI CCTNNNNNAGG 4049 4050 . . 4045 4055 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 4051 4048 . . 4049 4055 + SauI* CCTNAGG 4050 4053 . . 4050 4054 + DdeI CTNAG 4050 4053 . . 4053 4056 + SetI ASST 4056 4052 . . 4071 4074 + SetI ASST 4074 4070 . . 4071 4074 + CviJI RGCY 4072 4072 . . 4071 4074 + AluI AGCT 4072 4072 . . 4078 4082 - BslFI GGGAC 4063 4067 . . 4092 4096 + Tsp4CI* ACNGT 4094 4093 . . 4100 4103 + SetI ASST 4103 4099 . . 4098 4102 - Hin4II* CCTTC 4092 4091 . . 4102 4107 - MmeI TCCRAC 4083 4081 . . 4109 4112 + SetI ASST 4112 4108 . . 4112 4115 + MseI TTAA 4112 4114 . . 4117 4121 + BssKI CCNGG 4116 4121 . . 4117 4121 + ScrFI CCNGG 4118 4119 . . 4117 4121 + CauII* CCSGG 4118 4119 . . 4118 4121 + HpaII CCGG 4118 4120 . . 4120 4124 + HphI GGTGA 4132 4131 . . 4122 4133 + BdaI TGANNNNNNTCA 4111 4109 4145 4143 4123 4127 + TfiI GAWTC 4123 4126 . . 4123 4127 + HinfI GANTC 4123 4126 . . 4122 4133 - BdaI TGANNNNNNTCA 4145 4143 4111 4109 4156 4159 + SetI ASST 4159 4155 . . 4156 4159 + CviJI RGCY 4157 4157 . . 4156 4159 + AluI AGCT 4157 4157 . . 4158 4163 + SmlI CTYRAG 4158 4162 . . 4158 4163 + XhoI CTCGAG 4158 4162 . . 4158 4163 + BmeT110I CYCGRG 4159 4161 . . 4158 4163 + AvaI CYCGRG 4158 4162 . . 4159 4162 + TaqI TCGA 4159 4161 . . 4159 4164 + Hpy178III* TCNNGA 4160 4162 . . 4162 4167 + XhoII RGATCY 4162 4166 . . 4163 4166 + DpnI GATC 4164 4164 . . 4163 4166 + BstKTI GATC 4165 4163 . . 4163 4166 + MboI GATC 4162 4166 . . 4163 4167 - BinI* GGATC 4157 4158 . . 4168 4171 + MseI TTAA 4168 4170 . . 4174 4178 + TfiI GAWTC 4174 4177 . . 4174 4178 + HinfI GANTC 4174 4177 . . 4178 4182 + DdeI CTNAG 4178 4181 . . 4178 4182 + BspCNI CTCAG 4191 4189 . . 4178 4182 + BseMII CTCAG 4192 4190 . . 4179 4184 + Hpy178III* TCNNGA 4180 4182 . . 4182 4186 + FokI GGATG 4195 4199 . . 4182 4186 + BseGI GGATG 4188 4186 . . 4188 4191 + CviRI* TGCA 4189 4189 . . 4191 4194 + TspEI AATT 4190 4194 . . 4193 4196 + MseI TTAA 4193 4195 . . 4203 4207 + FokI GGATG 4216 4220 . . 4203 4207 + BseGI GGATG 4209 4207 . . 4208 4211 + Csp6I GTAC 4208 4210 . . 4204 4208 - BccI CCATC 4198 4199 . . 4208 4211 + RsaI GTAC 4209 4209 . . 4211 4215 + DdeI CTNAG 4211 4214 . . 4216 4219 + MseI TTAA 4216 4218 . . 4220 4225 + HaeII RGCGCY 4224 4220 . . 4221 4224 + Hin6I GCGC 4221 4223 . . 4221 4224 + GlaI GCGC 4222 4222 . . 4221 4224 + HhaI GCGC 4223 4221 . . 4224 4228 + DdeI CTNAG 4224 4227 . . 4228 4232 + HinfI GANTC 4228 4231 . . 4228 4232 - PleI GAGTC 4222 4223 . . 4228 4232 - MlyI GAGTC 4222 4222 . . 4239 4242 + TspEI AATT 4238 4242 . . 4246 4250 + BccI CCATC 4254 4255 . . 4252 4257 + AsuII TTCGAA 4253 4255 . . 4253 4256 + TaqI TCGA 4253 4255 . . 4269 4272 + CviRI* TGCA 4270 4270 . . 4292 4295 + SetI ASST 4295 4291 . . 4292 4295 + CviJI RGCY 4293 4293 . . 4292 4295 + AluI AGCT 4293 4293 . . 4297 4301 - HphI GGTGA 4289 4288 . . 4304 4307 + SetI ASST 4307 4303 . . 4309 4314 + Hpy166II GTNNAC 4311 4311 . . 4309 4314 + BssNAI GTATAC 4311 4311 . . 4309 4314 + AccI GTMKAC 4310 4312 . . 4323 4326 + SetI ASST 4326 4322 . . 4324 4328 + HphI GGTGA 4336 4335 . . 4321 4326 - BspMI ACCTGC 4312 4316 . . 4327 4330 + DpnI GATC 4328 4328 . . 4327 4330 + BstKTI GATC 4329 4327 . . 4327 4330 + MboI GATC 4326 4330 . . 4321 4327 - AarI CACCTGC 4312 4316 . . 4349 4353 + Tsp4CI* ACNGT 4351 4350 . . 4351 4355 + HphI GGTGA 4363 4362 . . 4358 4362 + TspDTI ATGAA 4373 4371 . . 4363 4367 + TspDTI ATGAA 4378 4376 . . 4365 4370 + ApoI RAATTY 4365 4369 . . 4366 4369 + TspEI AATT 4365 4369 . . 4370 4373 + MseI TTAA 4370 4372 . . 4372 4377 + SspI AATATT 4374 4374 . . 4380 4385 + SfeI* CTRYAG 4380 4384 . . 4386 4389 + TspEI AATT 4385 4389 . . 4390 4395 + BsmI GAATGC 4396 4394 . . 4398 4401 + DpnI GATC 4399 4399 . . 4398 4401 + BstKTI GATC 4400 4398 . . 4398 4401 + MboI GATC 4397 4401 . . 4446 4451 + StyI CCWWGG 4446 4450 . . 4446 4451 + SecI* CCNNGG 4446 4450 . . 4443 4447 - BslFI GGGAC 4428 4432 . . 4449 4452 + SetI ASST 4452 4448 . . 4456 4461 + XhoII RGATCY 4456 4460 . . 4456 4461 + BglII AGATCT 4456 4460 . . 4457 4460 + DpnI GATC 4458 4458 . . 4457 4460 + BstKTI GATC 4459 4457 . . 4457 4460 + MboI GATC 4456 4460 . . 4471 4476 + ApoI RAATTY 4471 4475 . . 4472 4475 + TspEI AATT 4471 4475 . . 4481 4485 + MaeIII GTNAC 4480 4485 . . 4477 4481 - BccI CCATC 4471 4472 . . 4479 4484 - TsoI TARCCA 4469 4467 . . 4489 4493 + Tsp45I GTSAC 4488 4493 . . 4489 4493 + MaeIII GTNAC 4488 4493 . . 4499 4509 + FalI AAGNNNNNCTT 4490 4485 4522 4517 4502 4505 + TspEI AATT 4501 4505 . . 4508 4511 + MseI TTAA 4508 4510 . . 4499 4509 - FalI AAGNNNNNCTT 4522 4517 4490 4485 4523 4528 + NdeI CATATG 4524 4526 . . 4526 4530 + TspDTI ATGAA 4541 4539 . . 4539 4543 - BsrI ACTGG 4539 4537 . . 4547 4551 + TspDTI ATGAA 4562 4560 . . 4552 4555 + TspEI AATT 4551 4555 . . 4557 4561 + MboII GAAGA 4569 4568 . . 4590 4593 + CviJI RGCY 4591 4591 . . 4587 4591 - BccI CCATC 4581 4582 . . 4594 4599 + AsuII TTCGAA 4595 4597 . . 4595 4598 + TaqI TCGA 4595 4597 . . 4597 4601 + MboII GAAGA 4609 4608 . . 4597 4602 + BbvII* GAAGAC 4604 4608 . . 4600 4604 + HinfI GANTC 4600 4603 . . 4603 4606 + TaqI TCGA 4603 4605 . . 4600 4604 - PleI GAGTC 4594 4595 . . 4600 4604 - MlyI GAGTC 4594 4594 . . 4605 4609 + MboII GAAGA 4617 4616 . . 4605 4610 + BbvII* GAAGAC 4612 4616 . . 4615 4620 + NspI RCATGY 4619 4615 . . 4616 4619 + FatI CATG 4615 4619 . . 4616 4619 + NlaIII CATG 4619 4615 . . 4616 4619 + CviAII CATG 4616 4618 . . 4627 4630 + SetI ASST 4630 4626 . . 4632 4637 + Hpy178III* TCNNGA 4633 4635 . . 4636 4645 + XmnI GAANNNNTTC 4640 4640 . . 4641 4644 + TspEI AATT 4640 4644 . . 4657 4662 + DsaI* CCRYGG 4657 4661 . . 4657 4662 + StyI CCWWGG 4657 4661 . . 4657 4662 + NcoI CCATGG 4657 4661 . . 4657 4662 + SecI* CCNNGG 4657 4661 . . 4658 4661 + FatI CATG 4657 4661 . . 4658 4661 + NlaIII CATG 4661 4657 . . 4658 4661 + CviAII CATG 4658 4660 . . 4672 4677 + AclI AACGTT 4673 4675 . . 4673 4676 + TaiI ACGT 4676 4672 . . 4673 4676 + SetI ASST 4676 4672 . . 4673 4676 + MaeII ACGT 4673 4675 . . 4681 4685 - TspDTI ATGAA 4671 4669 . . 4683 4688 - BsrDI GCAATG 4682 4680 . . 4700 4705 + ApoI RAATTY 4700 4704 . . 4701 4704 + TspEI AATT 4700 4704 . . 4712 4716 + TspDTI ATGAA 4727 4725 . . 4739 4750 + BstXI CCANNNNNNTGG 4746 4742 . . 4755 4758 + SetI ASST 4758 4754 . . 4761 4764 + SetI ASST 4764 4760 . . 4762 4766 + HphI GGTGA 4774 4773 . . 4769 4773 - MboII GAAGA 4761 4760 . . 4773 4778 + StyI CCWWGG 4773 4777 . . 4773 4778 + SecI* CCNNGG 4773 4777 . . 4768 4773 - BbvII* GAAGAC 4761 4765 . . 4773 4778 + AvrII CCTAGG 4773 4777 . . 4774 4777 + MaeI CTAG 4774 4776 . . 4800 4805 + XhoII RGATCY 4800 4804 . . 4801 4804 + DpnI GATC 4802 4802 . . 4801 4804 + BstKTI GATC 4803 4801 . . 4801 4804 + MboI GATC 4800 4804 . . 4804 4807 + MnlI CCTC 4814 4813 . . 4801 4805 - BinI* GGATC 4795 4796 . . 4808 4812 + Tsp45I GTSAC 4807 4812 . . 4808 4812 + MaeIII GTNAC 4807 4812 . . 4829 4834 + TatI WGTACW 4829 4833 . . 4830 4833 + Csp6I GTAC 4830 4832 . . 4830 4833 + RsaI GTAC 4831 4831 . . 4860 4863 + SetI ASST 4863 4859 . . 4859 4862 - MnlI CCTC 4852 4851 . . 4862 4867 + BsgI GTGCAG 4883 4881 . . 4863 4866 + CviRI* TGCA 4864 4864 . . 4859 4869 - Hin4I GAYNNNNNVTC 4882 4877 4850 4845 4877 4880 - AciI CCGC 4877 4879 . . 4891 4894 + CviRI* TGCA 4892 4892 . . 4900 4904 + BlsI GCNGC 4902 4901 . . 4900 4904 + BisI GCNGC 4901 4902 . . 4900 4904 + TseI GCWGC 4900 4903 . . 4900 4904 - BbvI GCAGC 4887 4891 . . 4907 4911 + Tsp4CI* ACNGT 4909 4908 . . 4912 4916 + BssKI CCNGG 4911 4916 . . 4912 4916 + BseBI CCWGG 4913 4914 . . 4912 4916 + ScrFI CCNGG 4913 4914 . . 4912 4916 + EcoRII CCWGG 4911 4916 . . 4919 4924 + KpnI GGTACC 4923 4919 . . 4919 4924 + NlaIV GGNNCC 4921 4921 . . 4919 4924 + HgiCI* GGYRCC 4919 4923 . . 4919 4924 + Acc65I GGTACC 4919 4923 . . 4920 4923 + Csp6I GTAC 4920 4922 . . 4920 4923 + RsaI GTAC 4921 4921 . . 4923 4933 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 4929 4926 . . 4923 4933 + PflMI CCANNNNNTGG 4929 4926 . . 4925 4928 + TspEI AATT 4924 4928 . . 4947 4950 + TspEI AATT 4946 4950 . . 4952 4956 + BslFI GGGAC 4966 4970 . . 4967 4972 + CfrI YGGCCR 4967 4971 . . 4968 4971 + CviJI RGCY 4969 4969 . . 4968 4971 + HaeIII GGCC 4969 4969 . . 4969 4973 + TauI GCSGC 4972 4969 . . 4969 4973 + BlsI GCNGC 4971 4970 . . 4969 4973 + BisI GCNGC 4970 4971 . . 4970 4973 + AciI CCGC 4970 4972 . . 4972 4976 + SfaNI GCATC 4981 4985 . . 4978 4982 + Hpy188I TCNGA 4980 4979 . . 4975 4979 - MboII GAAGA 4967 4966 . . 4979 4983 + DdeI CTNAG 4979 4982 . . 4982 4985 + SetI ASST 4985 4981 . . 4979 4983 - BspCNI CTCAG 4971 4969 . . 4979 4983 - BseMII CTCAG 4970 4968 . . 4983 4988 + NlaIV GGNNCC 4985 4985 . . 4981 4984 - MnlI CCTC 4974 4973 . . 4987 4992 + DsaI* CCRYGG 4987 4991 . . 4987 4992 + SecI* CCNNGG 4987 4991 . . 4986 4990 - TspGWI ACGGA 4976 4974 . . 4996 5000 + TspDTI ATGAA 5011 5009 . . 5008 5016 + Tth111I GACNNNGTC 5011 5012 . . 5015 5018 + TaqI TCGA 5015 5017 . . 5017 5022 + ApoI RAATTY 5017 5021 . . 5018 5021 + TspEI AATT 5017 5021 . . 5027 5035 + AlwNI CAGNNNCTG 5032 5029 . . 5026 5030 - BsrI ACTGG 5026 5024 . . 5025 5030 - BfiI ACTGGG 5020 5019 . . 5032 5036 + Hpy188I TCNGA 5034 5033 . . 5033 5038 + Eco57MI CTGRAG 5054 5052 . . 5033 5038 + Eco57I CTGAAG 5054 5052 . . 5035 5039 + MboII GAAGA 5047 5046 . . 5038 5042 + MboII GAAGA 5050 5049 . . 5057 5062 + Eco57MI CTGRAG 5078 5076 . . 5057 5062 + Eco57I CTGAAG 5078 5076 . . 5059 5063 + MboII GAAGA 5071 5070 . . 5079 5084 + PsiI TTATAA 5081 5081 . . 5093 5096 + TaqI TCGA 5093 5095 . . 5109 5114 + BclI TGATCA 5109 5113 . . 5110 5113 + DpnI GATC 5111 5111 . . 5110 5113 + BstKTI GATC 5112 5110 . . 5110 5113 + MboI GATC 5109 5113 . . 5115 5120 + Hpy178III* TCNNGA 5116 5118 . . 5124 5129 + SmlI CTYRAG 5124 5128 . . 5124 5129 + Bce83I* CTTGAG 5145 5143 . . 5126 5137 + BdaI TGANNNNNNTCA 5115 5113 5149 5147 5132 5136 + BinI* GGATC 5140 5141 . . 5133 5136 + DpnI GATC 5134 5134 . . 5133 5136 + BstKTI GATC 5135 5133 . . 5133 5136 + MboI GATC 5132 5136 . . 5129 5133 - BccI CCATC 5123 5124 . . 5126 5137 - BdaI TGANNNNNNTCA 5149 5147 5115 5113 5149 5153 + TfiI GAWTC 5149 5152 . . 5149 5153 + HinfI GANTC 5149 5152 . . 5153 5157 + BccI CCATC 5161 5162 . . 5165 5171 + PfoI TCCNGGA 5165 5170 . . 5166 5170 + BssKI CCNGG 5165 5170 . . 5166 5170 + BseBI CCWGG 5167 5168 . . 5161 5166 - BsmI GAATGC 5161 5159 . . 5166 5170 + ScrFI CCNGG 5167 5168 . . 5166 5170 + EcoRII CCWGG 5165 5170 . . 5172 5176 + BmgT120I GGNCC 5173 5174 . . 5172 5176 + AsuI* GGNCC 5172 5175 . . 5170 5173 - MnlI CCTC 5163 5162 . . 5173 5176 + CviJI RGCY 5174 5174 . . 5173 5176 + HaeIII GGCC 5174 5174 . . 5174 5179 + Cac8I GCNNGC 5176 5176 . . 5177 5180 + SetI ASST 5180 5176 . . 5177 5180 + CviJI RGCY 5178 5178 . . 5177 5180 + AluI AGCT 5178 5178 . . 5182 5186 + HphI GGTGA 5194 5193 . . 5194 5197 - MnlI CCTC 5187 5186 . . 5197 5202 + ApoI RAATTY 5197 5201 . . 5198 5201 + TspEI AATT 5197 5201 . . 5207 5210 + TspEI AATT 5206 5210 . . 5211 5215 + TfiI GAWTC 5211 5214 . . 5211 5215 + HinfI GANTC 5211 5214 . . 5220 5223 + CviRI* TGCA 5221 5221 . . 5227 5231 + Hpy188I TCNGA 5229 5228 . . 5245 5249 + Tsp45I GTSAC 5244 5249 . . 5245 5249 + MaeIII GTNAC 5244 5249 . . 5248 5252 + Tsp4CI* ACNGT 5250 5249 . . 5256 5259 + SetI ASST 5259 5255 . . 5263 5266 - MnlI CCTC 5256 5255 . . 5266 5270 + MboII GAAGA 5278 5277 . . 5269 5273 + MboII GAAGA 5281 5280 . . 5269 5274 + BbvII* GAAGAC 5276 5280 . . 5283 5286 + SetI ASST 5286 5282 . . 5281 5285 - Hin4II* CCTTC 5275 5274 . . 5285 5290 + BsgI GTGCAG 5306 5304 . . 5286 5289 + CviRI* TGCA 5287 5287 . . 5292 5295 + TspEI AATT 5291 5295 . . 5302 5306 + Hpy188I TCNGA 5304 5303 . . 5303 5307 + DdeI CTNAG 5303 5306 . . 5303 5307 - BspCNI CTCAG 5295 5293 . . 5303 5307 - BseMII CTCAG 5294 5292 . . 5335 5339 + SfaNI GCATC 5344 5348 . . 5341 5346 - MmeI TCCRAC 5322 5320 . . 5355 5366 + BdaI TGANNNNNNTCA 5344 5342 5378 5376 5361 5364 + SetI ASST 5364 5360 . . 5359 5364 - BspMI ACCTGC 5350 5354 . . 5355 5366 - BdaI TGANNNNNNTCA 5378 5376 5344 5342 5369 5372 + CviJI RGCY 5370 5370 . . 5376 5379 + TspEI AATT 5375 5379 . . 5385 5388 + CviJI RGCY 5386 5386 . . 5386 5396 + MwoI GCNNNNNNNGC 5392 5389 . . 5388 5391 + FatI CATG 5387 5391 . . 5388 5391 + NlaIII CATG 5391 5387 . . 5388 5391 + CviAII CATG 5388 5390 . . 5389 5393 + TspDTI ATGAA 5404 5402 . . 5395 5398 - AciI CCGC 5395 5397 . . 5411 5414 + AciI CCGC 5411 5413 . . 5411 5416 + BsrBI CCGCTC 5413 5413 . . 5416 5426 + BsiYI* CCNNNNNNNGG 5422 5419 . . 5435 5440 + Hpy178III* TCNNGA 5436 5438 . . 5445 5456 + BstXI CCANNNNNNTGG 5452 5448 . . 5445 5450 + DsaI* CCRYGG 5445 5449 . . 5445 5450 + StyI CCWWGG 5445 5449 . . 5445 5450 + NcoI CCATGG 5445 5449 . . 5445 5450 + SecI* CCNNGG 5445 5449 . . 5446 5455 + MslI CAYNNNNRTG 5450 5450 . . 5446 5449 + FatI CATG 5445 5449 . . 5446 5449 + NlaIII CATG 5449 5445 . . 5446 5449 + CviAII CATG 5446 5448 . . 5450 5455 + BsrDI GCAATG 5457 5455 . . 5455 5459 + HphI GGTGA 5467 5466 . . 5467 5471 + TfiI GAWTC 5467 5470 . . 5467 5471 + HinfI GANTC 5467 5470 . . 5473 5477 + HphI GGTGA 5485 5484 . . 5474 5478 + Tsp45I GTSAC 5473 5478 . . 5474 5478 + MaeIII GTNAC 5473 5478 . . 5483 5488 + CfrI YGGCCR 5483 5487 . . 5484 5487 + CviJI RGCY 5485 5485 . . 5484 5487 + HaeIII GGCC 5485 5485 . . 5485 5489 - BceAI ACGGC 5470 5472 . . 5498 5507 + MslI CAYNNNNRTG 5502 5502 . . 5494 5498 - BsmAI GTCTC 5488 5492 . . 5504 5507 + FatI CATG 5503 5507 . . 5504 5507 + NlaIII CATG 5507 5503 . . 5504 5507 + CviAII CATG 5504 5506 . . #--------------------------------------- # # # AarI: # [CACCTGC] # 352 1196 3960 # # Acc65I: # [GGTACC] # 589 1459 3460 # # AccI: # [GTMKAC] # 282 782 1198 3246 # # AciI: # [CCGC] # 16 42 43 59 66 67 # 83 84 85 88 93 93 # 97 148 177 192 293 393 # 425 462 484 698 1320 # # AclI: # [AACGTT] # 835 1270 3403 # # AcyI: # [GRCGYC] # 608 4900 # # AflII: # [CTTAAG] # 1504 4004 # # AflIII: # [ACRYGT] # 860 1153 1712 1783 # # AgeI: # [ACCGGT] # 2001 3507 # # AhaIII*: # [TTTAAA] # 203 456 960 1680 2209 # # AjuI: # [GAANNNNNNNTTGG] # 32 1706 3770 # # AlfI: # [GCANNNNNNTGC] # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 34 34 34 34 # 82 896 1049 1450 1895 # # AloI: # [GAACNNNNNNTCC] # 32 683 4793 # # AluI: # [AGCT] # 8 45 83 85 136 330 # 609 842 885 1078 1407 # # AlwNI: # [CAGNNNCTG] # 171 476 553 4308 # # ApaLI: # [GTGCAC] # 679 1082 1496 2251 # # ApoI: # [RAATTY] # 20 37 86 88 106 177 # 180 218 229 270 311 317 # 518 523 552 575 1301 # # AsuI*: # [GGNCC] # 29 87 108 132 159 336 # 390 393 407 594 621 1122 # 1130 # # AsuII: # [TTCGAA] # 342 913 4253 # # AvaI: # [CYCGRG] # 1350 4158 # # AvaII: # [GGWCC] # 87 108 132 159 390 393 # 436 594 621 1122 1466 # # AvrII: # [CCTAGG] # 735 4773 # # BaeI: # [ACNNNNGTAYC] # 33 33 33 544 935 1914 # 2016 # # BalI: # [TGGCCA] # 2462 3046 # # BarI: # [GAAGNNNNNNTAC] # 32 32 54 1531 3859 # # BbvI: # [GCAGC] # 273 282 330 400 585 621 # 804 2213 # # BbvII*: # [GAAGAC] # 8 149 232 515 4604 # # BccI: # [CCATC] # 4 38 56 110 165 179 # 186 191 217 312 347 358 # 420 542 612 714 1057 # # Bce83I*: # [CTTGAG] # 363 5145 # # BceAI: # [ACGGC] # 38 1580 1918 1972 # # BcgI: # [CGANNNNNNTGC] # 4 34 5470 # # BciVI: # [GTATCC] # 658 1865 2985 # # BclI: # [TGATCA] # 399 2281 2828 # # BdaI: # [TGANNNNNNTCA] # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 0 0 0 0 # 34 34 34 34 34 34 # 130 191 195 812 936 970 # 2070 # # BetI*: # [WCCGGW] # 2001 3507 # # BfiI: # [ACTGGG] # 488 2344 2676 # # BglII: # [AGATCT] # 1052 4456 # # BinI*: # [GGATC] # 343 345 368 506 623 638 # 715 908 1062 # # BisI: # [GCNGC] # 39 69 127 177 234 273 # 296 330 538 560 718 804 # 1343 # # BlsI: # [GCNGC] # 39 69 127 177 234 273 # 297 330 537 560 718 804 # 1343 # # BmeT110I: # [CYCGRG] # 1349 4159 # # BmgT120I: # [GGNCC] # 29 87 108 132 159 335 # 390 394 407 594 621 1122 # 1130 # # BsaXI: # [ACNNNNNCTCC] # 30 30 30 30 202 411 # 450 1704 2621 # # BseBI: # [CCWGG] # 88 156 220 254 341 440 # 507 1537 1965 # # BseGI: # [GGATG] # 21 50 231 282 302 304 # 542 890 1299 1587 # # BseMII: # [CTCAG] # 214 324 368 778 3824 # # BseSI: # [GKGCMC] # 349 679 1082 1151 2247 # # BseYI: # [CCCAGC] # 77 487 4944 # # BsgI: # [GTGCAG] # 169 202 423 910 1524 2280 # # BsiYI*: # [CCNNNNNNNGG] # 86 90 116 174 216 218 # 238 250 375 418 441 493 # 729 786 878 # # BslFI: # [GGGAC] # 229 275 318 365 400 538 # 542 916 1925 # # BsmAI: # [GTCTC] # 20 147 170 232 431 444 # 1151 1243 1670 # # BsmI: # [GAATGC] # 347 765 4396 # # Bsp1407I: # [TGTACA] # 118 1558 1796 2036 # # BspCNI: # [CTCAG] # 213 324 366 780 3825 # # BspLU11I*: # [ACATGT] # 1153 1712 2643 # # BspMI: # [ACCTGC] # 158 186 352 1038 3774 # # BsrBI: # [CCGCTC] # 95 1947 3466 # # BsrDI: # [GCAATG] # 51 262 775 789 867 891 # 896 977 # # BsrI: # [ACTGG] # 45 61 78 110 137 170 # 417 482 487 518 562 568 # 817 1056 # # BssKI: # [CCNGG] # 30 86 156 220 254 306 # 343 440 507 795 834 1537 # # BssNAI: # [GTATAC] # 1197 4311 # # BstAPI: # [GCANNNNNTGC] # 551 710 4247 # # BstKTI: # [GATC] # 23 59 71 115 151 164 # 203 205 309 332 344 373 # 493 590 636 717 723 # # BstXI: # [CCANNNNNNTGG] # 56 706 1077 1482 2187 # # BtgZI: # [GCGATG] # 1456 4052 # # Cac8I: # [GCNNGC] # 12 84 212 332 503 715 # 745 2905 # # CauII*: # [CCSGG] # 30 834 1390 3254 # # Cfr10I: # [RCCGGY] # 2001 3507 # # CfrI: # [YGGCCR] # 25 439 516 953 1484 2091 # # Csp6I: # [GTAC] # 12 16 90 103 118 137 # 156 164 209 224 286 305 # 306 459 520 526 588 622 # 667 # # CviAII: # [CATG] # 4 11 32 42 58 58 # 69 107 167 242 299 331 # 339 433 493 549 730 736 # 808 # # CviJI: # [RGCY] # 4 7 8 8 11 15 # 16 16 22 22 23 29 # 30 52 54 58 60 68 # 74 75 75 83 85 93 # 96 99 114 120 136 147 # 152 182 192 192 205 213 # 219 231 247 255 257 298 # 378 381 406 # # CviRI*: # [TGCA] # 15 28 40 44 45 48 # 48 61 66 72 81 83 # 90 112 134 141 168 177 # 186 192 221 226 231 231 # 322 329 390 435 594 698 # # DdeI: # [CTNAG] # 13 33 60 87 97 128 # 130 200 205 219 255 324 # 327 755 1252 1423 # # DpnI: # [GATC] # 23 59 71 115 151 164 # 203 205 309 332 344 374 # 493 590 636 717 722 # # DsaI*: # [CCRYGG] # 63 330 458 814 850 901 # 2092 # # EciI: # [GGCGGA] # 2203 3305 # # Eco31I: # [GGTCTC] # 431 1690 3387 # # Eco57I: # [CTGAAG] # 24 347 430 743 1026 1056 # 1882 # # Eco57MI: # [CTGRAG] # 24 149 242 347 430 479 # 501 1026 1056 1254 # # EcoNI: # [CCTNNNNNAGG] # 1104 1459 2945 # # EcoP15I: # [CAGCAG] # 575 1766 3167 # # EcoRII: # [CCWGG] # 86 156 220 254 343 440 # 507 1537 1965 # # EcoRV: # [GATATC] # 158 1666 3684 # # EcoT22I: # [ATGCAT] # 1549 3959 # # Esp3I: # [CGTCTC] # 170 444 663 1837 2394 # # EspI*: # [GCTNAGC] # 2102 3406 # # FalI: # [AAGNNNNNCTT] # 0 0 0 0 0 0 # 0 0 32 32 32 32 # 190 373 986 1883 1948 # # FatI: # [CATG] # 5 11 32 42 58 58 # 69 107 167 242 298 331 # 339 433 493 549 730 736 # 808 # # FauI: # [CCCGC] # 636 642 4230 # # FokI: # [GGATG] # 21 70 251 262 291 302 # 542 910 1292 1567 # # GlaI: # [GCGC] # 137 313 432 1286 3340 # # GsaI: # [CCCAGC] # 77 491 4940 # # GsuI: # [CTGGAG] # 391 479 1708 2930 # # HaeII: # [RGCGCY] # 884 1284 3340 # # HaeIII: # [GGCC] # 23 90 205 311 365 429 # 439 495 590 1077 1484 # # HgaI: # [GACGC] # 48 96 597 768 1834 2165 # # HgiAI*: # [GWGCWC] # 679 1082 1500 2247 # # HgiCI*: # [GGYRCC] # 589 1459 3460 # # HgiJII*: # [GRGCYC] # 1892 3616 # # HhaI: # [GCGC] # 138 313 432 1285 3340 # # Hin4I: # [GAYNNNNNVTC] # 0 0 0 0 8 24 # 24 32 32 32 32 32 # 32 157 407 431 454 603 # 626 937 1645 # # Hin4II*: # [CCTTC] # 31 37 43 79 83 84 # 99 125 163 233 332 602 # 692 702 1020 1183 # # Hin6I: # [GCGC] # 136 313 432 1287 3340 # # HindII: # [GTYRAC] # 144 1041 1127 1239 1957 # # HindIII: # [AAGCTT] # 1577 3931 # # HinfI: # [GANTC] # 12 36 41 51 54 62 # 84 109 120 172 210 229 # 256 274 288 372 451 459 # 521 528 549 630 # # HpaII: # [CCGG] # 30 224 610 1390 3254 # # HphI: # [GGTGA] # 15 18 23 27 47 69 # 94 108 157 162 273 411 # 420 434 835 939 1476 # # Hpy166II: # [GTNNAC] # 71 136 144 148 170 174 # 179 189 259 283 500 587 # 711 760 1197 # # Hpy178III*: # [TCNNGA] # 19 20 51 72 81 88 # 106 129 142 156 180 187 # 224 249 251 251 263 275 # 320 347 453 483 543 618 # # Hpy188I: # [TCNGA] # 15 18 54 55 75 159 # 185 195 204 529 710 830 # 1212 1267 # # Hpy99I: # [CGWCG] # 274 2317 2917 # # KpnI: # [GGTACC] # 585 1459 3464 # # Ksp632I*: # [CTCTTC] # 96 210 680 1419 3103 # # MaeI: # [CTAG] # 32 118 368 458 625 734 # 985 1048 1140 # # MaeII: # [ACGT] # 272 277 300 336 499 544 # 553 584 615 693 835 # # MaeIII: # [GTNAC] # 8 35 123 209 218 229 # 319 393 437 451 600 688 # 786 1012 # # MboI: # [GATC] # 23 59 71 115 151 164 # 203 205 309 332 344 376 # 493 590 636 717 720 # # MboII: # [GAAGA] # 3 3 3 8 21 21 # 40 77 80 96 141 144 # 155 198 206 207 227 237 # 427 501 594 713 1406 # # McrI*: # [CGRYCG] # 1996 3512 # # MfeI: # [CAATTG] # 524 1004 3980 # # MlyI: # [GAGTC] # 115 210 244 372 378 466 # 914 1316 1493 # # MmeI: # [TCCRAC] # 114 186 418 514 782 1022 # 1233 1239 # # MnlI: # [CCTC] # 13 15 22 24 29 38 # 69 70 96 104 122 185 # 189 221 230 237 242 252 # 256 303 389 415 438 502 # 1047 # # MseI: # [TTAA] # 23 25 45 55 56 76 # 92 106 111 113 138 150 # 154 174 193 202 233 243 # 282 291 416 417 424 489 # 1000 # # MslI: # [CAYNNNNRTG] # 6 52 896 1145 1554 1855 # # MwoI: # [GCNNNNNNNGC] # 9 9 9 38 116 208 # 455 542 582 996 2544 # # NcoI: # [CCATGG] # 63 788 814 850 901 2092 # # NdeI: # [CATATG] # 117 315 984 4092 # # NlaIII: # [CATG] # 1 11 32 42 58 58 # 69 107 167 242 302 331 # 339 433 493 549 730 736 # 808 # # NlaIV: # [GGNNCC] # 28 62 64 110 235 270 # 342 480 523 536 1117 1741 # # NmeAIII: # [GCCGAG] # 981 4527 # # NspBII*: # [CMGCKG] # 192 295 330 1848 2843 # # NspI: # [RCATGY] # 167 302 688 819 889 1285 # 1358 # # PflMI: # [CCANNNNNTGG] # 579 820 1709 2400 # # PfoI: # [TCCNGGA] # 343 5165 # # PleI: # [GAGTC] # 115 210 243 372 379 465 # 914 1316 1494 # # PsiI: # [TTATAA] # 427 5081 # # PsrI: # [GAACNNNNNNTAC] # 32 1386 4090 # # PvuII: # [CAGCTG] # 2665 2843 # # RsaI: # [GTAC] # 12 16 90 103 118 137 # 156 164 209 224 286 305 # 306 459 521 526 587 622 # 667 # # SauI*: # [CCTNAGG] # 1458 4050 # # ScrFI: # [CCNGG] # 30 88 156 220 254 306 # 341 440 507 795 834 1537 # # SduI: # [GDGCHC] # 349 355 679 1082 1151 1892 # # SecI*: # [CCNNGG] # 63 86 116 211 214 458 # 525 639 728 901 1567 # # SetI: # [ASST] # 6 6 7 8 9 9 # 12 18 18 19 20 20 # 27 27 29 30 31 32 # 32 32 36 36 37 37 # 38 40 41 42 43 43 # 43 46 47 53 60 60 # 67 69 72 73 76 78 # 79 81 82 84 92 99 # 104 111 117 117 122 126 # 136 140 144 149 151 173 # 178 179 189 195 210 225 # 254 442 # # SexAI: # [ACCWGGT] # 1623 3885 # # SfaNI: # [GCATC] # 38 72 75 164 170 231 # 363 393 505 678 897 907 # 1015 # # SfeI*: # [CTRYAG] # 183 819 1128 3378 # # SmlI: # [CTYRAG] # 384 966 1504 2654 # # SpeI: # [ACTAGT] # 2243 3265 # # SspI: # [AATATT] # 636 720 739 1013 1134 1266 # # StyI: # [CCWWGG] # 63 116 211 639 672 814 # 901 2092 # # TaiI: # [ACGT] # 275 277 300 336 499 544 # 553 584 615 693 832 # # TaqI: # [TCGA] # 8 9 18 78 78 94 # 108 126 141 143 213 264 # 273 279 317 330 342 412 # 415 531 591 738 # # TaqII: # [CACCCA] # 939 1526 3043 # # TatI: # [WGTACW] # 118 679 718 840 1357 1796 # # TauI: # [GCSGC] # 536 571 718 741 1412 1530 # # TfiI: # [GAWTC] # 36 41 51 62 109 120 # 172 256 459 612 630 725 # 975 1260 # # TseI: # [GCWGC] # 273 295 330 400 560 608 # 804 2238 # # TsoI: # [TARCCA] # 180 336 445 485 1039 1342 # 1681 # # Tsp45I: # [GTSAC] # 35 229 319 437 2021 2467 # # Tsp4CI*: # [ACNGT] # 6 15 16 32 34 53 # 87 121 146 184 217 235 # 257 258 279 330 341 364 # 368 420 534 558 653 # # TspDTI: # [ATGAA] # 5 21 56 60 104 109 # 146 163 284 393 456 511 # 667 749 830 954 # # TspEI: # [AATT] # 4 7 9 9 13 13 # 18 20 22 24 24 25 # 30 32 33 37 39 48 # 48 50 57 60 62 63 # 63 71 82 84 85 86 # 89 94 117 124 127 127 # 129 133 135 138 151 159 # 164 175 180 188 200 218 # 224 244 248 261 287 378 # # TspGWI: # [ACGGA] # 532 749 1087 3140 # # TspRI: # [CASTGNN] # 65 436 624 687 987 1062 # 1647 # # TstI: # [CACNNNNNNTCC] # 32 32 32 32 205 411 # 448 1702 2614 # # Tth111I: # [GACNNNGTC] # 497 655 2160 2196 # # VspI: # [ATTAAT] # 250 1507 3751 # # XbaI: # [TCTAGA] # 742 4766 # # XhoI: # [CTCGAG] # 1350 4158 # # XhoII: # [RGATCY] # 294 344 636 708 720 849 # 1957 # # XmnI: # [GAANNNNTTC] # 868 1192 1708 1740 # #--------------------------------------- #--------------------------------------- # Total_sequences: 1 # Total_length: 5508 # Reported_sequences: 1 # Reported_hitcount: 1306 #---------------------------------------